logo

Genes within 1Mb (chr1:63359062:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -234349 sc-eQTL 8.41e-02 0.169 0.0975 0.222 B L1
ENSG00000088035 ALG6 -8513 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00759 0.102 0.222 B L1
ENSG00000116641 DOCK7 670676 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0168 0.102 0.222 B L1
ENSG00000125703 ATG4C 574930 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0257 0.0707 0.222 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -234659 sc-eQTL 1.00e-15 0.839 0.0965 0.222 B L1
ENSG00000162607 USP1 922765 sc-eQTL 5.10e-01 0.0643 0.0975 0.222 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -164310 sc-eQTL 7.78e-02 0.203 0.114 0.222 B L1
ENSG00000079739 PGM1 -234349 sc-eQTL 5.46e-01 0.0502 0.0829 0.222 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 -8513 sc-eQTL 4.61e-02 -0.182 0.0907 0.222 CD4T L1
ENSG00000116641 DOCK7 670676 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00173 0.0927 0.222 CD4T L1
ENSG00000125703 ATG4C 574930 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0507 0.0748 0.222 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -234659 sc-eQTL 4.13e-16 0.802 0.0908 0.222 CD4T L1
ENSG00000162607 USP1 922765 sc-eQTL 6.92e-02 0.132 0.0721 0.222 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -164310 sc-eQTL 1.38e-02 0.234 0.094 0.222 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 -234349 sc-eQTL 8.61e-01 0.0161 0.0918 0.222 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 -8513 sc-eQTL 1.21e-01 0.157 0.101 0.222 CD8T L1
ENSG00000116641 DOCK7 670676 sc-eQTL 5.58e-02 -0.196 0.102 0.222 CD8T L1
ENSG00000125703 ATG4C 574930 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0443 0.0974 0.222 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -234659 sc-eQTL 5.14e-11 0.681 0.0984 0.222 CD8T L1
ENSG00000162607 USP1 922765 sc-eQTL 8.84e-01 0.0124 0.0849 0.222 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -164310 sc-eQTL 7.62e-03 0.288 0.107 0.222 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 -234349 sc-eQTL 3.80e-01 -0.0906 0.103 0.221 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 -8513 sc-eQTL 2.15e-01 -0.132 0.106 0.221 DC L1
ENSG00000116641 DOCK7 670676 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00647 0.109 0.221 DC L1
ENSG00000125703 ATG4C 574930 sc-eQTL 3.11e-01 0.0866 0.0853 0.221 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -234659 sc-eQTL 9.46e-03 0.308 0.117 0.221 DC L1
ENSG00000162607 USP1 922765 sc-eQTL 5.74e-01 0.0587 0.104 0.221 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -164310 sc-eQTL 1.64e-03 0.324 0.101 0.221 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 -234349 sc-eQTL 7.31e-01 0.0347 0.101 0.222 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 -8513 sc-eQTL 1.91e-04 -0.386 0.102 0.222 Mono L1
ENSG00000116641 DOCK7 670676 sc-eQTL 3.93e-01 0.0868 0.101 0.222 Mono L1
ENSG00000125703 ATG4C 574930 sc-eQTL 9.63e-01 0.00321 0.0686 0.222 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -234659 sc-eQTL 2.12e-10 0.658 0.0985 0.222 Mono L1
ENSG00000162607 USP1 922765 sc-eQTL 1.50e-01 0.128 0.0886 0.222 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 -234349 sc-eQTL 9.11e-01 0.00957 0.0857 0.223 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 -8513 sc-eQTL 8.58e-01 -0.018 0.1 0.223 NK L1
ENSG00000116641 DOCK7 670676 sc-eQTL 2.33e-01 -0.0987 0.0825 0.223 NK L1
ENSG00000125703 ATG4C 574930 sc-eQTL 9.97e-01 0.00031 0.0889 0.223 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -234659 sc-eQTL 1.04e-04 0.422 0.107 0.223 NK L1
ENSG00000162607 USP1 922765 sc-eQTL 7.31e-01 0.034 0.0987 0.223 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -164310 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0493 0.12 0.223 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 -234349 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0317 0.0964 0.222 Other_T L1
ENSG00000088035 ALG6 -8513 sc-eQTL 7.71e-01 0.0282 0.0968 0.222 Other_T L1
ENSG00000116641 DOCK7 670676 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0849 0.0987 0.222 Other_T L1
ENSG00000125703 ATG4C 574930 sc-eQTL 1.72e-01 -0.117 0.0852 0.222 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -234659 sc-eQTL 6.94e-02 0.137 0.0753 0.222 Other_T L1
ENSG00000162607 USP1 922765 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0516 0.0657 0.222 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -164310 sc-eQTL 6.24e-02 0.218 0.116 0.222 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -234349 sc-eQTL 9.15e-01 0.0139 0.13 0.209 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 -8513 sc-eQTL 2.99e-01 -0.129 0.124 0.209 B_Activated L2
ENSG00000116641 DOCK7 670676 sc-eQTL 9.94e-01 0.000834 0.116 0.209 B_Activated L2
ENSG00000125703 ATG4C 574930 sc-eQTL 5.34e-01 -0.076 0.122 0.209 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -234659 sc-eQTL 4.38e-05 0.476 0.114 0.209 B_Activated L2
ENSG00000162607 USP1 922765 sc-eQTL 4.02e-01 -0.108 0.129 0.209 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -164310 sc-eQTL 6.03e-01 0.0587 0.113 0.209 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 -234349 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0164 0.116 0.223 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 -8513 sc-eQTL 1.83e-01 0.156 0.117 0.223 B_Intermediate L2
ENSG00000116641 DOCK7 670676 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00164 0.112 0.223 B_Intermediate L2
ENSG00000125703 ATG4C 574930 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0705 0.0949 0.223 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -234659 sc-eQTL 8.10e-04 0.374 0.11 0.223 B_Intermediate L2
ENSG00000162607 USP1 922765 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0372 0.113 0.223 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -164310 sc-eQTL 8.17e-03 0.294 0.11 0.223 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 -234349 sc-eQTL 4.31e-01 0.0896 0.114 0.224 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 -8513 sc-eQTL 3.39e-01 0.111 0.115 0.224 B_Memory L2
ENSG00000116641 DOCK7 670676 sc-eQTL 3.09e-01 0.11 0.108 0.224 B_Memory L2
ENSG00000125703 ATG4C 574930 sc-eQTL 6.51e-01 0.0466 0.103 0.224 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -234659 sc-eQTL 9.21e-04 0.386 0.115 0.224 B_Memory L2
ENSG00000162607 USP1 922765 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0901 0.119 0.224 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -164310 sc-eQTL 2.03e-02 0.27 0.116 0.224 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 -234349 sc-eQTL 2.56e-01 0.131 0.115 0.222 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 -8513 sc-eQTL 5.70e-01 0.0661 0.116 0.222 B_Naive1 L2
ENSG00000116641 DOCK7 670676 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0439 0.111 0.222 B_Naive1 L2
ENSG00000125703 ATG4C 574930 sc-eQTL 3.43e-01 0.0813 0.0856 0.222 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -234659 sc-eQTL 1.38e-10 0.697 0.103 0.222 B_Naive1 L2
ENSG00000162607 USP1 922765 sc-eQTL 6.29e-01 0.0484 0.1 0.222 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -164310 sc-eQTL 5.27e-02 0.234 0.12 0.222 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 -234349 sc-eQTL 1.13e-01 0.179 0.112 0.223 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 -8513 sc-eQTL 3.45e-02 -0.248 0.116 0.223 B_Naive2 L2
ENSG00000116641 DOCK7 670676 sc-eQTL 7.79e-01 0.0318 0.113 0.223 B_Naive2 L2
ENSG00000125703 ATG4C 574930 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00639 0.109 0.223 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -234659 sc-eQTL 1.78e-11 0.754 0.106 0.223 B_Naive2 L2
ENSG00000162607 USP1 922765 sc-eQTL 7.53e-01 0.0354 0.112 0.223 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -164310 sc-eQTL 3.98e-03 -0.336 0.115 0.223 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 -234349 sc-eQTL 1.85e-01 -0.153 0.115 0.227 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -8513 sc-eQTL 4.87e-01 0.0847 0.122 0.227 CD4_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 670676 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0325 0.107 0.227 CD4_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 574930 sc-eQTL 3.66e-01 -0.0997 0.11 0.227 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -234659 sc-eQTL 1.97e-01 0.152 0.117 0.227 CD4_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 922765 sc-eQTL 4.79e-01 0.0794 0.112 0.227 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -164310 sc-eQTL 3.83e-01 0.0978 0.112 0.227 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -234349 sc-eQTL 9.76e-01 0.0028 0.0933 0.222 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -8513 sc-eQTL 1.28e-02 -0.251 0.0999 0.222 CD4_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 670676 sc-eQTL 7.37e-01 0.0335 0.0996 0.222 CD4_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 574930 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00655 0.0881 0.222 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -234659 sc-eQTL 1.97e-14 0.77 0.0936 0.222 CD4_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 922765 sc-eQTL 2.30e-01 0.0987 0.0819 0.222 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -164310 sc-eQTL 1.90e-01 0.14 0.106 0.222 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -234349 sc-eQTL 5.15e-02 0.189 0.0963 0.222 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -8513 sc-eQTL 8.45e-01 0.022 0.113 0.222 CD4_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 670676 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0137 0.1 0.222 CD4_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 574930 sc-eQTL 1.82e-01 0.13 0.097 0.222 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -234659 sc-eQTL 5.57e-08 0.603 0.107 0.222 CD4_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 922765 sc-eQTL 4.18e-01 0.0763 0.094 0.222 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -164310 sc-eQTL 3.06e-03 0.326 0.109 0.222 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -234349 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00908 0.114 0.222 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -8513 sc-eQTL 5.07e-01 -0.076 0.115 0.222 CD4_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 670676 sc-eQTL 5.97e-01 0.0591 0.112 0.222 CD4_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 574930 sc-eQTL 1.22e-01 -0.168 0.108 0.222 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -234659 sc-eQTL 1.32e-03 0.356 0.109 0.222 CD4_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 922765 sc-eQTL 3.46e-02 0.223 0.105 0.222 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -164310 sc-eQTL 5.34e-01 0.0722 0.116 0.222 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -234349 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0278 0.105 0.222 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -8513 sc-eQTL 3.26e-01 0.11 0.111 0.222 CD8_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 670676 sc-eQTL 1.07e-01 -0.17 0.105 0.222 CD8_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 574930 sc-eQTL 1.17e-01 -0.176 0.112 0.222 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -234659 sc-eQTL 5.32e-04 0.4 0.114 0.222 CD8_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 922765 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0268 0.105 0.222 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -164310 sc-eQTL 2.19e-01 0.147 0.119 0.222 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -234349 sc-eQTL 8.20e-01 0.0241 0.106 0.222 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -8513 sc-eQTL 4.66e-01 -0.08 0.11 0.222 CD8_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 670676 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0739 0.113 0.222 CD8_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 574930 sc-eQTL 8.44e-01 0.0214 0.109 0.222 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -234659 sc-eQTL 2.97e-09 0.628 0.101 0.222 CD8_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 922765 sc-eQTL 2.51e-01 0.107 0.0929 0.222 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -164310 sc-eQTL 1.27e-01 0.158 0.103 0.222 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -234349 sc-eQTL 3.33e-01 0.112 0.115 0.222 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -8513 sc-eQTL 6.50e-02 0.214 0.116 0.222 CD8_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 670676 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0313 0.114 0.222 CD8_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 574930 sc-eQTL 2.31e-01 0.139 0.116 0.222 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -234659 sc-eQTL 6.08e-04 0.382 0.11 0.222 CD8_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 922765 sc-eQTL 6.31e-01 0.0523 0.109 0.222 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -164310 sc-eQTL 1.35e-01 0.172 0.115 0.222 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -234349 sc-eQTL 3.75e-01 0.103 0.116 0.231 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -8513 sc-eQTL 5.25e-01 0.0745 0.117 0.231 CD8_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 670676 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0682 0.113 0.231 CD8_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 574930 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0221 0.109 0.231 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -234659 sc-eQTL 1.54e-01 0.168 0.117 0.231 CD8_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 922765 sc-eQTL 3.35e-01 -0.109 0.112 0.231 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -164310 sc-eQTL 6.81e-01 0.047 0.114 0.231 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -234349 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0124 0.113 0.225 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 -8513 sc-eQTL 5.04e-01 0.075 0.112 0.225 MAIT L2
ENSG00000116641 DOCK7 670676 sc-eQTL 3.10e-01 -0.109 0.107 0.225 MAIT L2
ENSG00000125703 ATG4C 574930 sc-eQTL 3.24e-01 -0.112 0.113 0.225 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -234659 sc-eQTL 1.53e-03 0.355 0.111 0.225 MAIT L2
ENSG00000162607 USP1 922765 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0437 0.112 0.225 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -164310 sc-eQTL 5.74e-01 0.0656 0.117 0.225 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 -234349 sc-eQTL 2.66e-01 0.125 0.112 0.218 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 -8513 sc-eQTL 5.38e-02 -0.222 0.114 0.218 NK_CD56bright L2
ENSG00000116641 DOCK7 670676 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0896 0.0998 0.218 NK_CD56bright L2
ENSG00000125703 ATG4C 574930 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0433 0.112 0.218 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -234659 sc-eQTL 2.55e-02 0.259 0.115 0.218 NK_CD56bright L2
ENSG00000162607 USP1 922765 sc-eQTL 9.02e-01 0.0148 0.12 0.218 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -164310 sc-eQTL 2.55e-01 0.13 0.114 0.218 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 -234349 sc-eQTL 2.26e-01 -0.109 0.0898 0.222 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 -8513 sc-eQTL 1.85e-01 0.151 0.114 0.222 NK_CD56dim L2
ENSG00000116641 DOCK7 670676 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0354 0.0994 0.222 NK_CD56dim L2
ENSG00000125703 ATG4C 574930 sc-eQTL 3.17e-01 0.101 0.101 0.222 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -234659 sc-eQTL 6.36e-02 0.213 0.114 0.222 NK_CD56dim L2
ENSG00000162607 USP1 922765 sc-eQTL 9.90e-01 0.00139 0.111 0.222 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -164310 sc-eQTL 4.03e-01 -0.104 0.124 0.222 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 -234349 sc-eQTL 7.51e-02 0.216 0.121 0.212 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 -8513 sc-eQTL 2.66e-01 -0.14 0.126 0.212 NK_HLA L2
ENSG00000116641 DOCK7 670676 sc-eQTL 3.64e-01 -0.0875 0.0962 0.212 NK_HLA L2
ENSG00000125703 ATG4C 574930 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0578 0.112 0.212 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -234659 sc-eQTL 1.26e-02 0.292 0.116 0.212 NK_HLA L2
ENSG00000162607 USP1 922765 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0169 0.123 0.212 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -164310 sc-eQTL 8.01e-01 0.0283 0.112 0.212 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 -234349 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0802 0.097 0.222 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 -8513 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0402 0.11 0.222 NK_cytokine L2
ENSG00000116641 DOCK7 670676 sc-eQTL 1.50e-01 -0.146 0.101 0.222 NK_cytokine L2
ENSG00000125703 ATG4C 574930 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0676 0.104 0.222 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -234659 sc-eQTL 1.58e-04 0.401 0.104 0.222 NK_cytokine L2
ENSG00000162607 USP1 922765 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0307 0.113 0.222 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -164310 sc-eQTL 2.30e-01 -0.138 0.114 0.222 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 -234349 sc-eQTL 1.80e-02 0.33 0.138 0.215 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 -8513 sc-eQTL 1.35e-01 -0.221 0.147 0.215 PB L2
ENSG00000116641 DOCK7 670676 sc-eQTL 5.75e-01 -0.089 0.158 0.215 PB L2
ENSG00000125703 ATG4C 574930 sc-eQTL 9.38e-02 -0.231 0.136 0.215 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -234659 sc-eQTL 9.73e-03 0.352 0.134 0.215 PB L2
ENSG00000162607 USP1 922765 sc-eQTL 2.39e-01 -0.161 0.137 0.215 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -164310 sc-eQTL 8.06e-02 0.263 0.149 0.215 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 -234349 sc-eQTL 4.12e-01 0.0849 0.103 0.224 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 -8513 sc-eQTL 2.78e-01 -0.114 0.105 0.224 Pro_T L2
ENSG00000116641 DOCK7 670676 sc-eQTL 6.87e-02 0.192 0.105 0.224 Pro_T L2
ENSG00000125703 ATG4C 574930 sc-eQTL 4.24e-02 0.187 0.0915 0.224 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -234659 sc-eQTL 4.45e-03 -0.261 0.0909 0.224 Pro_T L2
ENSG00000162607 USP1 922765 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0377 0.0637 0.224 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -164310 sc-eQTL 8.02e-01 -0.027 0.108 0.224 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 -234349 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0487 0.11 0.222 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 -8513 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0246 0.117 0.222 Treg L2
ENSG00000116641 DOCK7 670676 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0944 0.108 0.222 Treg L2
ENSG00000125703 ATG4C 574930 sc-eQTL 6.77e-02 -0.2 0.109 0.222 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -234659 sc-eQTL 3.53e-02 0.241 0.114 0.222 Treg L2
ENSG00000162607 USP1 922765 sc-eQTL 9.24e-01 -0.0107 0.111 0.222 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -164310 sc-eQTL 8.77e-02 0.188 0.109 0.222 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 -234349 sc-eQTL 9.27e-01 -0.0101 0.11 0.215 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -8513 sc-eQTL 9.21e-01 0.0111 0.111 0.215 cDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 670676 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0128 0.109 0.215 cDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 574930 sc-eQTL 6.35e-01 0.0451 0.0949 0.215 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -234659 sc-eQTL 5.32e-02 0.232 0.119 0.215 cDC L2
ENSG00000162607 USP1 922765 sc-eQTL 2.00e-01 0.137 0.107 0.215 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -164310 sc-eQTL 5.97e-02 0.182 0.0958 0.215 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 -234349 sc-eQTL 9.55e-01 0.00592 0.104 0.222 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 -8513 sc-eQTL 4.87e-02 -0.204 0.103 0.222 cMono_IL1B L2
ENSG00000116641 DOCK7 670676 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000283 0.109 0.222 cMono_IL1B L2
ENSG00000125703 ATG4C 574930 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0155 0.077 0.222 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -234659 sc-eQTL 2.18e-07 0.548 0.102 0.222 cMono_IL1B L2
ENSG00000162607 USP1 922765 sc-eQTL 3.49e-01 0.0901 0.096 0.222 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 -234349 sc-eQTL 9.68e-01 0.00462 0.116 0.222 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 -8513 sc-eQTL 1.51e-02 -0.284 0.116 0.222 cMono_S100A L2
ENSG00000116641 DOCK7 670676 sc-eQTL 7.67e-01 0.0323 0.109 0.222 cMono_S100A L2
ENSG00000125703 ATG4C 574930 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00494 0.0943 0.222 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -234659 sc-eQTL 4.78e-05 0.425 0.102 0.222 cMono_S100A L2
ENSG00000162607 USP1 922765 sc-eQTL 3.86e-01 0.095 0.109 0.222 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 -234349 sc-eQTL 2.26e-01 -0.158 0.13 0.212 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 -8513 sc-eQTL 4.46e-01 0.106 0.139 0.212 gdT L2
ENSG00000116641 DOCK7 670676 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0657 0.136 0.212 gdT L2
ENSG00000125703 ATG4C 574930 sc-eQTL 4.40e-01 -0.101 0.13 0.212 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -234659 sc-eQTL 5.25e-01 0.0881 0.138 0.212 gdT L2
ENSG00000162607 USP1 922765 sc-eQTL 3.67e-01 0.118 0.131 0.212 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -164310 sc-eQTL 7.65e-01 0.0407 0.136 0.212 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 -234349 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0874 0.118 0.218 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -8513 sc-eQTL 4.99e-01 0.0741 0.11 0.218 intMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 670676 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0136 0.112 0.218 intMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 574930 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000346 0.107 0.218 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -234659 sc-eQTL 6.08e-03 0.32 0.116 0.218 intMono L2
ENSG00000162607 USP1 922765 sc-eQTL 3.08e-01 0.122 0.119 0.218 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -234349 sc-eQTL 4.04e-01 0.0892 0.107 0.217 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -8513 sc-eQTL 3.44e-01 -0.111 0.117 0.217 ncMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 670676 sc-eQTL 6.53e-01 0.052 0.115 0.217 ncMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 574930 sc-eQTL 5.55e-01 0.0638 0.108 0.217 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -234659 sc-eQTL 7.86e-02 0.198 0.112 0.217 ncMono L2
ENSG00000162607 USP1 922765 sc-eQTL 5.69e-01 0.0658 0.115 0.217 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -234349 sc-eQTL 2.29e-01 -0.153 0.126 0.229 pDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -8513 sc-eQTL 2.47e-01 -0.143 0.123 0.229 pDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 670676 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0213 0.126 0.229 pDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 574930 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0452 0.113 0.229 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -234659 sc-eQTL 2.76e-01 0.138 0.127 0.229 pDC L2
ENSG00000162607 USP1 922765 sc-eQTL 1.30e-01 -0.196 0.129 0.229 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -164310 sc-eQTL 1.09e-01 0.18 0.112 0.229 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -234349 sc-eQTL 5.55e-01 0.0638 0.108 0.222 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -8513 sc-eQTL 2.92e-01 0.126 0.119 0.222 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 670676 sc-eQTL 6.57e-01 0.0459 0.103 0.222 B_Memory LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 574930 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00559 0.0837 0.222 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -234659 sc-eQTL 1.81e-07 0.556 0.103 0.222 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 922765 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0496 0.107 0.222 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -164310 sc-eQTL 3.83e-04 0.401 0.111 0.222 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -234349 sc-eQTL 3.91e-02 0.231 0.111 0.222 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -8513 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0658 0.116 0.222 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 670676 sc-eQTL 9.47e-01 0.00716 0.108 0.222 B_Naive LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 574930 sc-eQTL 4.94e-01 0.0565 0.0825 0.222 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -234659 sc-eQTL 7.03e-15 0.848 0.101 0.222 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 922765 sc-eQTL 7.77e-01 0.0284 0.1 0.222 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -164310 sc-eQTL 9.31e-01 0.0101 0.117 0.222 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -234349 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00556 0.106 0.222 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -8513 sc-eQTL 2.43e-03 -0.309 0.101 0.222 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 670676 sc-eQTL 7.23e-01 0.0367 0.103 0.222 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 574930 sc-eQTL 9.48e-01 0.0047 0.0716 0.222 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -234659 sc-eQTL 1.87e-09 0.611 0.0972 0.222 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 922765 sc-eQTL 9.74e-02 0.15 0.0899 0.222 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -234349 sc-eQTL 9.47e-01 0.00693 0.103 0.222 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -8513 sc-eQTL 2.42e-01 -0.137 0.117 0.222 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 670676 sc-eQTL 7.69e-01 0.0342 0.116 0.222 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 574930 sc-eQTL 8.55e-01 0.0182 0.0989 0.222 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -234659 sc-eQTL 2.04e-03 0.351 0.112 0.222 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 922765 sc-eQTL 3.46e-01 0.102 0.108 0.222 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -234349 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0273 0.0876 0.222 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -8513 sc-eQTL 6.27e-01 0.0512 0.105 0.222 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 670676 sc-eQTL 3.16e-01 -0.0946 0.0941 0.222 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 574930 sc-eQTL 6.74e-01 0.0397 0.0941 0.222 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -234659 sc-eQTL 1.46e-04 0.417 0.108 0.222 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 922765 sc-eQTL 6.27e-01 0.0493 0.101 0.222 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -164310 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0859 0.123 0.222 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000088035 ALG6 -8513 eQTL 1.06e-13 -0.115 0.0153 0.327 0.271 0.225
ENSG00000125703 ATG4C 574930 eQTL 0.025 -0.0447 0.0199 0.0 0.0 0.225
ENSG00000142856 ITGB3BP -234659 eQTL 5.6e-23 0.335 0.033 0.0 0.0 0.225
ENSG00000203965 EFCAB7 -164310 eQTL 7.37e-03 0.0763 0.0284 0.0 0.0 0.225
ENSG00000230798 FOXD3-AS1 34621 eQTL 0.00506 -0.0866 0.0308 0.00151 0.00137 0.225

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000088035 ALG6 -8513 1.98e-05 2.45e-05 6e-06 1.45e-05 5.33e-06 1.28e-05 3.71e-05 4.07e-06 2.37e-05 1.2e-05 3.08e-05 1.37e-05 4.23e-05 1.12e-05 6.08e-06 1.49e-05 1.51e-05 2.17e-05 7.92e-06 7.7e-06 1.41e-05 2.53e-05 2.57e-05 1.07e-05 3.84e-05 7.23e-06 1.09e-05 1.07e-05 2.8e-05 3.74e-05 1.59e-05 1.96e-06 3.61e-06 8.18e-06 1.12e-05 7.48e-06 3.99e-06 3.52e-06 6.08e-06 3.95e-06 1.92e-06 3.02e-05 2.99e-06 5.07e-07 2.73e-06 3.93e-06 4.04e-06 2.06e-06 1.46e-06
ENSG00000125703 ATG4C 574930 4.89e-07 2.3e-07 8.02e-08 2.53e-07 1.05e-07 1.28e-07 3.33e-07 7.52e-08 2.26e-07 1.39e-07 2.62e-07 2.04e-07 3.48e-07 8.26e-08 9.33e-08 1.17e-07 8.74e-08 2.75e-07 9.69e-08 7.4e-08 1.48e-07 2.24e-07 2.11e-07 5.6e-08 3.27e-07 1.9e-07 1.72e-07 1.68e-07 1.76e-07 2.01e-07 1.52e-07 8.14e-08 5.07e-08 1.01e-07 1.31e-07 5.14e-08 5.62e-08 6e-08 4.74e-08 8.16e-08 5.19e-08 2.19e-07 3.19e-08 7.2e-09 8.24e-08 8.94e-09 9.19e-08 2.99e-09 4.82e-08
ENSG00000142856 ITGB3BP -234659 1.41e-06 1.38e-06 2.29e-07 1.33e-06 4.25e-07 6.36e-07 1.46e-06 4.39e-07 1.74e-06 6.69e-07 2.04e-06 9.81e-07 2.56e-06 3.39e-07 4.48e-07 9.55e-07 9.94e-07 1.12e-06 5.81e-07 4.68e-07 7.74e-07 1.89e-06 1.17e-06 6.29e-07 2.44e-06 7.53e-07 1.03e-06 8.69e-07 1.63e-06 1.29e-06 8.1e-07 2.43e-07 3.44e-07 5.72e-07 5.66e-07 5.4e-07 7.3e-07 3.42e-07 5.15e-07 2.31e-07 2.88e-07 1.8e-06 2.9e-07 1.06e-07 3.7e-07 2.45e-07 2.59e-07 1.71e-07 2.6e-07
ENSG00000230798 FOXD3-AS1 34621 1e-05 1.18e-05 2.38e-06 6.69e-06 2.32e-06 5.26e-06 1.37e-05 2.21e-06 1.05e-05 5.43e-06 1.43e-05 6.06e-06 1.9e-05 4.17e-06 3.51e-06 6.92e-06 6.42e-06 9.82e-06 3.55e-06 3.3e-06 6.62e-06 1.08e-05 1.07e-05 4.28e-06 1.9e-05 4.72e-06 6.34e-06 4.97e-06 1.34e-05 1.36e-05 7e-06 1.07e-06 1.43e-06 3.85e-06 5.21e-06 3.35e-06 1.78e-06 2.25e-06 2.61e-06 1.54e-06 1.46e-06 1.4e-05 1.59e-06 2.86e-07 1.33e-06 2.08e-06 1.98e-06 8.65e-07 6.19e-07