logo

Genes within 1Mb (chr1:63349933:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -243478 sc-eQTL 3.03e-02 0.192 0.0879 0.261 B L1
ENSG00000088035 ALG6 -17642 sc-eQTL 7.25e-01 0.0325 0.0921 0.261 B L1
ENSG00000116641 DOCK7 661547 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0782 0.092 0.261 B L1
ENSG00000125703 ATG4C 565801 sc-eQTL 8.28e-01 0.014 0.064 0.261 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -243788 sc-eQTL 6.02e-10 0.604 0.093 0.261 B L1
ENSG00000162607 USP1 913636 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0429 0.0884 0.261 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -173439 sc-eQTL 1.02e-01 0.171 0.104 0.261 B L1
ENSG00000079739 PGM1 -243478 sc-eQTL 1.70e-01 0.103 0.0747 0.261 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 -17642 sc-eQTL 8.95e-02 -0.14 0.0823 0.261 CD4T L1
ENSG00000116641 DOCK7 661547 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0318 0.0839 0.261 CD4T L1
ENSG00000125703 ATG4C 565801 sc-eQTL 9.58e-01 0.00356 0.0677 0.261 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -243788 sc-eQTL 8.49e-11 0.595 0.087 0.261 CD4T L1
ENSG00000162607 USP1 913636 sc-eQTL 4.11e-01 0.0541 0.0656 0.261 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -173439 sc-eQTL 2.43e-03 0.259 0.0844 0.261 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 -243478 sc-eQTL 5.37e-02 0.159 0.0821 0.261 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 -17642 sc-eQTL 1.95e-01 0.118 0.0909 0.261 CD8T L1
ENSG00000116641 DOCK7 661547 sc-eQTL 1.85e-01 -0.122 0.0921 0.261 CD8T L1
ENSG00000125703 ATG4C 565801 sc-eQTL 8.85e-01 0.0127 0.0879 0.261 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -243788 sc-eQTL 3.27e-08 0.525 0.0914 0.261 CD8T L1
ENSG00000162607 USP1 913636 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0223 0.0765 0.261 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -173439 sc-eQTL 6.95e-03 0.262 0.0963 0.261 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 -243478 sc-eQTL 6.47e-01 0.0429 0.0934 0.257 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 -17642 sc-eQTL 1.47e-01 -0.14 0.0959 0.257 DC L1
ENSG00000116641 DOCK7 661547 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0557 0.0988 0.257 DC L1
ENSG00000125703 ATG4C 565801 sc-eQTL 2.73e-01 0.0848 0.0771 0.257 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -243788 sc-eQTL 5.78e-02 0.204 0.107 0.257 DC L1
ENSG00000162607 USP1 913636 sc-eQTL 2.41e-01 0.111 0.0941 0.257 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -173439 sc-eQTL 1.80e-02 0.221 0.0928 0.257 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 -243478 sc-eQTL 5.01e-01 0.0608 0.0903 0.261 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 -17642 sc-eQTL 1.95e-02 -0.219 0.0931 0.261 Mono L1
ENSG00000116641 DOCK7 661547 sc-eQTL 7.59e-01 0.028 0.0912 0.261 Mono L1
ENSG00000125703 ATG4C 565801 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0214 0.0616 0.261 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -243788 sc-eQTL 7.56e-08 0.507 0.0909 0.261 Mono L1
ENSG00000162607 USP1 913636 sc-eQTL 2.08e-02 0.184 0.079 0.261 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 -243478 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0366 0.0762 0.262 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 -17642 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0198 0.0893 0.262 NK L1
ENSG00000116641 DOCK7 661547 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0574 0.0735 0.262 NK L1
ENSG00000125703 ATG4C 565801 sc-eQTL 6.14e-01 0.0399 0.079 0.262 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -243788 sc-eQTL 2.81e-04 0.352 0.0952 0.262 NK L1
ENSG00000162607 USP1 913636 sc-eQTL 1.59e-01 0.124 0.0874 0.262 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -173439 sc-eQTL 6.78e-01 0.0443 0.107 0.262 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 -243478 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0379 0.0871 0.261 Other_T L1
ENSG00000088035 ALG6 -17642 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0324 0.0876 0.261 Other_T L1
ENSG00000116641 DOCK7 661547 sc-eQTL 7.21e-02 -0.16 0.0887 0.261 Other_T L1
ENSG00000125703 ATG4C 565801 sc-eQTL 9.15e-01 -0.00824 0.0774 0.261 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -243788 sc-eQTL 2.49e-01 0.0791 0.0684 0.261 Other_T L1
ENSG00000162607 USP1 913636 sc-eQTL 2.75e-01 -0.0649 0.0593 0.261 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -173439 sc-eQTL 9.06e-01 0.0125 0.106 0.261 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -243478 sc-eQTL 9.13e-01 0.0128 0.118 0.24 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 -17642 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0536 0.113 0.24 B_Activated L2
ENSG00000116641 DOCK7 661547 sc-eQTL 9.26e-01 -0.00977 0.105 0.24 B_Activated L2
ENSG00000125703 ATG4C 565801 sc-eQTL 3.13e-01 -0.111 0.11 0.24 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -243788 sc-eQTL 3.62e-03 0.311 0.105 0.24 B_Activated L2
ENSG00000162607 USP1 913636 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0569 0.117 0.24 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -173439 sc-eQTL 9.82e-01 0.00226 0.102 0.24 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 -243478 sc-eQTL 8.63e-01 0.0179 0.104 0.262 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 -17642 sc-eQTL 5.30e-01 0.0665 0.106 0.262 B_Intermediate L2
ENSG00000116641 DOCK7 661547 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000694 0.101 0.262 B_Intermediate L2
ENSG00000125703 ATG4C 565801 sc-eQTL 5.17e-01 0.0554 0.0855 0.262 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -243788 sc-eQTL 7.77e-03 0.269 0.1 0.262 B_Intermediate L2
ENSG00000162607 USP1 913636 sc-eQTL 6.44e-01 -0.047 0.102 0.262 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -173439 sc-eQTL 3.83e-02 0.208 0.0999 0.262 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 -243478 sc-eQTL 1.69e-01 0.141 0.102 0.263 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 -17642 sc-eQTL 6.64e-01 0.0452 0.104 0.263 B_Memory L2
ENSG00000116641 DOCK7 661547 sc-eQTL 3.96e-01 0.0829 0.0974 0.263 B_Memory L2
ENSG00000125703 ATG4C 565801 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0491 0.0927 0.263 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -243788 sc-eQTL 1.23e-02 0.264 0.105 0.263 B_Memory L2
ENSG00000162607 USP1 913636 sc-eQTL 3.63e-01 -0.0974 0.107 0.263 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -173439 sc-eQTL 4.07e-01 0.0874 0.105 0.263 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 -243478 sc-eQTL 6.87e-02 0.19 0.104 0.261 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 -17642 sc-eQTL 3.19e-01 0.105 0.105 0.261 B_Naive1 L2
ENSG00000116641 DOCK7 661547 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0283 0.101 0.261 B_Naive1 L2
ENSG00000125703 ATG4C 565801 sc-eQTL 1.41e-01 0.114 0.0772 0.261 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -243788 sc-eQTL 1.62e-07 0.523 0.0964 0.261 B_Naive1 L2
ENSG00000162607 USP1 913636 sc-eQTL 8.08e-01 -0.022 0.0905 0.261 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -173439 sc-eQTL 2.03e-02 0.254 0.108 0.261 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 -243478 sc-eQTL 1.63e-02 0.245 0.101 0.262 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 -17642 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0524 0.107 0.262 B_Naive2 L2
ENSG00000116641 DOCK7 661547 sc-eQTL 8.55e-01 0.0187 0.103 0.262 B_Naive2 L2
ENSG00000125703 ATG4C 565801 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0289 0.0988 0.262 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -243788 sc-eQTL 7.74e-07 0.515 0.101 0.262 B_Naive2 L2
ENSG00000162607 USP1 913636 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0782 0.102 0.262 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -173439 sc-eQTL 5.39e-02 -0.205 0.106 0.262 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 -243478 sc-eQTL 2.76e-01 -0.115 0.105 0.268 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -17642 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0414 0.112 0.268 CD4_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 661547 sc-eQTL 9.92e-01 -0.000987 0.0976 0.268 CD4_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 565801 sc-eQTL 1.69e-01 -0.139 0.1 0.268 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -243788 sc-eQTL 2.03e-01 0.137 0.108 0.268 CD4_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 913636 sc-eQTL 8.87e-02 0.175 0.102 0.268 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -173439 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0126 0.103 0.268 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -243478 sc-eQTL 2.99e-01 0.0876 0.0842 0.261 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -17642 sc-eQTL 3.66e-02 -0.191 0.0907 0.261 CD4_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 661547 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0487 0.09 0.261 CD4_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 565801 sc-eQTL 8.81e-01 0.0119 0.0796 0.261 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -243788 sc-eQTL 1.78e-09 0.562 0.0893 0.261 CD4_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 913636 sc-eQTL 9.24e-01 -0.00707 0.0743 0.261 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -173439 sc-eQTL 9.64e-02 0.16 0.096 0.261 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -243478 sc-eQTL 2.81e-01 0.0939 0.0869 0.261 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -17642 sc-eQTL 3.12e-01 0.102 0.101 0.261 CD4_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 661547 sc-eQTL 7.42e-01 0.0296 0.0897 0.261 CD4_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 565801 sc-eQTL 7.46e-02 0.155 0.0867 0.261 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -243788 sc-eQTL 1.07e-05 0.443 0.0983 0.261 CD4_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 913636 sc-eQTL 2.76e-01 0.0919 0.0842 0.261 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -173439 sc-eQTL 1.14e-04 0.378 0.0962 0.261 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -243478 sc-eQTL 3.89e-01 0.0882 0.102 0.261 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -17642 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0374 0.103 0.261 CD4_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 661547 sc-eQTL 7.53e-01 0.0316 0.1 0.261 CD4_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 565801 sc-eQTL 1.74e-01 -0.132 0.097 0.261 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -243788 sc-eQTL 4.63e-03 0.282 0.0986 0.261 CD4_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 913636 sc-eQTL 2.88e-01 0.101 0.095 0.261 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -173439 sc-eQTL 5.49e-01 0.0625 0.104 0.261 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -243478 sc-eQTL 6.14e-01 0.0479 0.0948 0.261 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -17642 sc-eQTL 9.68e-01 0.00408 0.101 0.261 CD8_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 661547 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0465 0.0957 0.261 CD8_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 565801 sc-eQTL 2.63e-01 -0.114 0.102 0.261 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -243788 sc-eQTL 2.78e-02 0.232 0.105 0.261 CD8_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 913636 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0331 0.0949 0.261 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -173439 sc-eQTL 3.35e-01 0.105 0.108 0.261 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -243478 sc-eQTL 2.02e-02 0.221 0.0945 0.261 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -17642 sc-eQTL 7.28e-01 0.0345 0.099 0.261 CD8_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 661547 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0364 0.102 0.261 CD8_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 565801 sc-eQTL 3.23e-01 0.0972 0.0981 0.261 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -243788 sc-eQTL 1.57e-06 0.466 0.0943 0.261 CD8_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 913636 sc-eQTL 9.81e-01 -0.002 0.0842 0.261 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -173439 sc-eQTL 3.67e-02 0.195 0.0929 0.261 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -243478 sc-eQTL 5.41e-01 0.0645 0.105 0.257 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -17642 sc-eQTL 6.68e-02 0.195 0.106 0.257 CD8_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 661547 sc-eQTL 3.14e-01 -0.105 0.104 0.257 CD8_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 565801 sc-eQTL 2.29e-01 0.128 0.106 0.257 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -243788 sc-eQTL 1.65e-03 0.321 0.101 0.257 CD8_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 913636 sc-eQTL 6.67e-01 0.0428 0.0994 0.257 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -173439 sc-eQTL 2.11e-01 0.132 0.105 0.257 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -243478 sc-eQTL 7.30e-01 0.0374 0.108 0.265 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -17642 sc-eQTL 7.47e-01 0.0351 0.109 0.265 CD8_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 661547 sc-eQTL 1.53e-01 -0.15 0.105 0.265 CD8_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 565801 sc-eQTL 6.11e-01 0.0515 0.101 0.265 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -243788 sc-eQTL 9.86e-02 0.181 0.109 0.265 CD8_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 913636 sc-eQTL 2.68e-01 -0.116 0.104 0.265 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -173439 sc-eQTL 7.87e-01 0.0287 0.106 0.265 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -243478 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0817 0.101 0.264 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 -17642 sc-eQTL 3.76e-01 0.0891 0.1 0.264 MAIT L2
ENSG00000116641 DOCK7 661547 sc-eQTL 9.87e-02 -0.159 0.0958 0.264 MAIT L2
ENSG00000125703 ATG4C 565801 sc-eQTL 9.92e-01 0.000995 0.102 0.264 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -243788 sc-eQTL 5.01e-03 0.283 0.0999 0.264 MAIT L2
ENSG00000162607 USP1 913636 sc-eQTL 7.15e-01 -0.037 0.101 0.264 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -173439 sc-eQTL 9.23e-01 -0.0102 0.105 0.264 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 -243478 sc-eQTL 3.75e-01 0.0899 0.101 0.26 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 -17642 sc-eQTL 3.41e-01 -0.0989 0.104 0.26 NK_CD56bright L2
ENSG00000116641 DOCK7 661547 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0247 0.09 0.26 NK_CD56bright L2
ENSG00000125703 ATG4C 565801 sc-eQTL 1.04e-01 0.163 0.0999 0.26 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -243788 sc-eQTL 6.27e-03 0.284 0.103 0.26 NK_CD56bright L2
ENSG00000162607 USP1 913636 sc-eQTL 2.64e-01 0.121 0.108 0.26 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -173439 sc-eQTL 7.16e-02 0.186 0.102 0.26 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 -243478 sc-eQTL 1.56e-01 -0.113 0.0792 0.261 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 -17642 sc-eQTL 8.18e-01 0.0232 0.101 0.261 NK_CD56dim L2
ENSG00000116641 DOCK7 661547 sc-eQTL 2.79e-01 -0.0951 0.0876 0.261 NK_CD56dim L2
ENSG00000125703 ATG4C 565801 sc-eQTL 7.42e-01 0.0294 0.0892 0.261 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -243788 sc-eQTL 1.65e-01 0.141 0.101 0.261 NK_CD56dim L2
ENSG00000162607 USP1 913636 sc-eQTL 3.40e-01 0.094 0.0982 0.261 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -173439 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0697 0.11 0.261 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 -243478 sc-eQTL 1.90e-02 0.262 0.111 0.251 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 -17642 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0503 0.117 0.251 NK_HLA L2
ENSG00000116641 DOCK7 661547 sc-eQTL 1.14e-01 -0.141 0.0887 0.251 NK_HLA L2
ENSG00000125703 ATG4C 565801 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0333 0.104 0.251 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -243788 sc-eQTL 1.87e-01 0.144 0.108 0.251 NK_HLA L2
ENSG00000162607 USP1 913636 sc-eQTL 6.74e-01 -0.048 0.114 0.251 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -173439 sc-eQTL 2.53e-01 0.119 0.103 0.251 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 -243478 sc-eQTL 1.90e-01 -0.114 0.0868 0.261 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 -17642 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0344 0.0985 0.261 NK_cytokine L2
ENSG00000116641 DOCK7 661547 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0525 0.0912 0.261 NK_cytokine L2
ENSG00000125703 ATG4C 565801 sc-eQTL 9.16e-01 0.00982 0.0934 0.261 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -243788 sc-eQTL 1.70e-04 0.358 0.0935 0.261 NK_cytokine L2
ENSG00000162607 USP1 913636 sc-eQTL 4.79e-01 0.072 0.102 0.261 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -173439 sc-eQTL 5.03e-01 -0.069 0.103 0.261 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 -243478 sc-eQTL 6.94e-02 0.236 0.129 0.233 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 -17642 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0981 0.137 0.233 PB L2
ENSG00000116641 DOCK7 661547 sc-eQTL 1.19e-01 -0.228 0.145 0.233 PB L2
ENSG00000125703 ATG4C 565801 sc-eQTL 2.92e-01 -0.135 0.127 0.233 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -243788 sc-eQTL 4.34e-01 0.1 0.128 0.233 PB L2
ENSG00000162607 USP1 913636 sc-eQTL 3.68e-01 -0.115 0.127 0.233 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -173439 sc-eQTL 1.84e-01 0.186 0.139 0.233 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 -243478 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0115 0.0948 0.263 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 -17642 sc-eQTL 3.68e-02 -0.201 0.0955 0.263 Pro_T L2
ENSG00000116641 DOCK7 661547 sc-eQTL 1.37e-01 0.144 0.0963 0.263 Pro_T L2
ENSG00000125703 ATG4C 565801 sc-eQTL 4.86e-02 0.167 0.0839 0.263 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -243788 sc-eQTL 3.05e-03 -0.25 0.0832 0.263 Pro_T L2
ENSG00000162607 USP1 913636 sc-eQTL 3.41e-01 -0.0557 0.0583 0.263 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -173439 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0541 0.0987 0.263 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 -243478 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0338 0.1 0.261 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 -17642 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0262 0.107 0.261 Treg L2
ENSG00000116641 DOCK7 661547 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0572 0.0981 0.261 Treg L2
ENSG00000125703 ATG4C 565801 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0724 0.1 0.261 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -243788 sc-eQTL 6.17e-03 0.285 0.103 0.261 Treg L2
ENSG00000162607 USP1 913636 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0469 0.102 0.261 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -173439 sc-eQTL 2.78e-02 0.22 0.0993 0.261 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 -243478 sc-eQTL 3.92e-01 0.0862 0.101 0.251 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -17642 sc-eQTL 9.30e-01 -0.00895 0.102 0.251 cDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 661547 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0313 0.1 0.251 cDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 565801 sc-eQTL 5.38e-01 0.0536 0.087 0.251 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -243788 sc-eQTL 2.61e-01 0.124 0.11 0.251 cDC L2
ENSG00000162607 USP1 913636 sc-eQTL 3.48e-01 0.0922 0.098 0.251 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -173439 sc-eQTL 8.17e-02 0.154 0.0879 0.251 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 -243478 sc-eQTL 2.90e-01 0.099 0.0934 0.261 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 -17642 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0624 0.0936 0.261 cMono_IL1B L2
ENSG00000116641 DOCK7 661547 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0145 0.0988 0.261 cMono_IL1B L2
ENSG00000125703 ATG4C 565801 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0189 0.0695 0.261 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -243788 sc-eQTL 3.12e-05 0.402 0.0945 0.261 cMono_IL1B L2
ENSG00000162607 USP1 913636 sc-eQTL 3.80e-01 0.0762 0.0867 0.261 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 -243478 sc-eQTL 3.30e-01 -0.101 0.104 0.261 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 -17642 sc-eQTL 6.53e-02 -0.194 0.104 0.261 cMono_S100A L2
ENSG00000116641 DOCK7 661547 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0399 0.0976 0.261 cMono_S100A L2
ENSG00000125703 ATG4C 565801 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0115 0.0845 0.261 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -243788 sc-eQTL 6.03e-05 0.376 0.0918 0.261 cMono_S100A L2
ENSG00000162607 USP1 913636 sc-eQTL 1.22e-01 0.152 0.0976 0.261 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 -243478 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0704 0.11 0.273 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 -17642 sc-eQTL 3.69e-01 0.106 0.117 0.273 gdT L2
ENSG00000116641 DOCK7 661547 sc-eQTL 3.51e-01 -0.108 0.115 0.273 gdT L2
ENSG00000125703 ATG4C 565801 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0419 0.11 0.273 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -243788 sc-eQTL 8.26e-01 0.0258 0.117 0.273 gdT L2
ENSG00000162607 USP1 913636 sc-eQTL 5.21e-01 0.0712 0.111 0.273 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -173439 sc-eQTL 9.84e-01 0.00235 0.115 0.273 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 -243478 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0618 0.105 0.256 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -17642 sc-eQTL 9.42e-01 0.0072 0.098 0.256 intMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 661547 sc-eQTL 7.75e-01 0.0287 0.1 0.256 intMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 565801 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0474 0.0955 0.256 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -243788 sc-eQTL 3.89e-02 0.217 0.104 0.256 intMono L2
ENSG00000162607 USP1 913636 sc-eQTL 1.14e-01 0.169 0.106 0.256 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -243478 sc-eQTL 2.06e-01 0.122 0.0961 0.26 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -17642 sc-eQTL 2.15e-02 -0.243 0.105 0.26 ncMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 661547 sc-eQTL 3.00e-01 0.108 0.104 0.26 ncMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 565801 sc-eQTL 6.49e-01 0.0444 0.0974 0.26 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -243788 sc-eQTL 3.16e-01 0.102 0.102 0.26 ncMono L2
ENSG00000162607 USP1 913636 sc-eQTL 2.92e-01 0.11 0.104 0.26 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -243478 sc-eQTL 3.31e-01 -0.114 0.117 0.263 pDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -17642 sc-eQTL 2.11e-01 -0.143 0.114 0.263 pDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 661547 sc-eQTL 2.98e-01 -0.122 0.116 0.263 pDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 565801 sc-eQTL 8.90e-01 0.0145 0.105 0.263 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -243788 sc-eQTL 1.07e-01 0.189 0.117 0.263 pDC L2
ENSG00000162607 USP1 913636 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0626 0.12 0.263 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -173439 sc-eQTL 3.54e-01 0.0965 0.104 0.263 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -243478 sc-eQTL 4.23e-01 0.0778 0.0969 0.261 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -17642 sc-eQTL 8.60e-01 0.0189 0.107 0.261 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 661547 sc-eQTL 8.26e-01 0.0205 0.0932 0.261 B_Memory LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 565801 sc-eQTL 7.34e-01 0.0256 0.0753 0.261 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -243788 sc-eQTL 6.41e-05 0.389 0.0953 0.261 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 913636 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0446 0.096 0.261 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -173439 sc-eQTL 3.12e-02 0.221 0.102 0.261 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -243478 sc-eQTL 3.03e-03 0.299 0.0996 0.261 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -17642 sc-eQTL 8.15e-01 0.0245 0.105 0.261 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 661547 sc-eQTL 9.53e-01 0.00578 0.0978 0.261 B_Naive LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 565801 sc-eQTL 4.70e-01 0.0539 0.0745 0.261 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -243788 sc-eQTL 3.86e-10 0.632 0.0961 0.261 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 913636 sc-eQTL 5.37e-01 -0.056 0.0906 0.261 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -173439 sc-eQTL 2.90e-01 0.112 0.106 0.261 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -243478 sc-eQTL 8.65e-01 0.0163 0.0955 0.261 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -17642 sc-eQTL 5.70e-02 -0.175 0.0917 0.261 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 661547 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0198 0.0931 0.261 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 565801 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0122 0.0644 0.261 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -243788 sc-eQTL 4.00e-07 0.469 0.0896 0.261 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 913636 sc-eQTL 4.66e-02 0.161 0.0806 0.261 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -243478 sc-eQTL 5.87e-01 0.05 0.0919 0.261 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -17642 sc-eQTL 1.14e-01 -0.165 0.104 0.261 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 661547 sc-eQTL 6.30e-01 0.0498 0.103 0.261 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 565801 sc-eQTL 9.81e-01 0.00207 0.0881 0.261 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -243788 sc-eQTL 3.25e-02 0.218 0.101 0.261 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 913636 sc-eQTL 4.73e-02 0.19 0.0952 0.261 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -243478 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0474 0.0774 0.261 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -17642 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0105 0.093 0.261 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 661547 sc-eQTL 2.04e-01 -0.106 0.083 0.261 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 565801 sc-eQTL 7.01e-01 0.032 0.0832 0.261 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -243788 sc-eQTL 9.40e-04 0.322 0.096 0.261 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 913636 sc-eQTL 2.04e-01 0.114 0.0892 0.261 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -173439 sc-eQTL 9.55e-01 0.00614 0.109 0.261 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000088035 ALG6 -17642 eQTL 1.43e-10 -0.0969 0.0149 0.0 0.00369 0.239
ENSG00000125703 ATG4C 565801 eQTL 0.0244 -0.0435 0.0193 0.0 0.0 0.239
ENSG00000142856 ITGB3BP -243788 eQTL 3.03e-20 0.304 0.0323 0.0 0.0 0.239
ENSG00000230798 FOXD3-AS1 25492 eQTL 0.0454 -0.06 0.03 0.0 0.0 0.239

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000088035 ALG6 -17642 1.72e-05 1.81e-05 4.04e-06 1.13e-05 3.78e-06 9.68e-06 2.6e-05 3.48e-06 1.81e-05 9.15e-06 2.33e-05 8.78e-06 3.39e-05 7.61e-06 5.22e-06 1.13e-05 1.02e-05 1.75e-05 6.32e-06 5.32e-06 9.67e-06 1.97e-05 1.98e-05 7.77e-06 2.99e-05 5.95e-06 8.05e-06 8.11e-06 2.1e-05 2.35e-05 1.25e-05 1.57e-06 2.38e-06 6.69e-06 8.41e-06 5.04e-06 2.98e-06 2.97e-06 4.43e-06 3.17e-06 1.7e-06 2.41e-05 2.7e-06 4.39e-07 2.23e-06 2.75e-06 3.38e-06 1.47e-06 1.52e-06
ENSG00000125703 ATG4C 565801 3.71e-07 1.78e-07 6.57e-08 2.25e-07 1.1e-07 8.4e-08 2.86e-07 6.57e-08 1.98e-07 1.11e-07 2.18e-07 1.57e-07 3.04e-07 8.55e-08 6.6e-08 1.1e-07 5.42e-08 2.33e-07 7.42e-08 5.61e-08 1.23e-07 1.9e-07 1.86e-07 4.15e-08 2.59e-07 1.65e-07 1.25e-07 1.42e-07 1.44e-07 1.46e-07 1.39e-07 4.32e-08 4.37e-08 1.02e-07 5.24e-08 3.18e-08 4.47e-08 8.57e-08 6.29e-08 6.43e-08 4.72e-08 2.15e-07 3.99e-08 1.1e-08 3.61e-08 8.31e-09 7.12e-08 1.96e-09 4.83e-08
ENSG00000142856 ITGB3BP -243788 1.29e-06 9.39e-07 3.45e-07 9.43e-07 3.36e-07 5.15e-07 1.6e-06 3.62e-07 1.49e-06 4.7e-07 1.79e-06 7e-07 2.25e-06 3e-07 5.28e-07 9.19e-07 8.37e-07 6.85e-07 7.73e-07 6.88e-07 6.17e-07 1.63e-06 8.9e-07 6.23e-07 2.26e-06 4.39e-07 8.73e-07 7.03e-07 1.33e-06 1.36e-06 6.73e-07 1.58e-07 2.15e-07 6.93e-07 5.41e-07 4.5e-07 5.12e-07 1.58e-07 3.78e-07 3.2e-07 2.88e-07 1.62e-06 5.73e-08 4.18e-08 2.49e-07 1.34e-07 2.35e-07 8.37e-08 1.14e-07