logo

Genes within 1Mb (chr1:63342659:C:CT):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -250752 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00922 0.125 0.105 B L1
ENSG00000088035 ALG6 -24916 sc-eQTL 1.04e-01 -0.21 0.129 0.105 B L1
ENSG00000116641 DOCK7 654273 sc-eQTL 7.51e-01 0.0412 0.13 0.105 B L1
ENSG00000125703 ATG4C 558527 sc-eQTL 5.57e-01 -0.053 0.09 0.105 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -251062 sc-eQTL 2.82e-01 -0.154 0.143 0.105 B L1
ENSG00000162607 USP1 906362 sc-eQTL 8.04e-01 0.0309 0.124 0.105 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -180713 sc-eQTL 7.86e-01 0.0399 0.147 0.105 B L1
ENSG00000079739 PGM1 -250752 sc-eQTL 1.28e-01 -0.162 0.106 0.105 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 -24916 sc-eQTL 2.39e-01 0.139 0.118 0.105 CD4T L1
ENSG00000116641 DOCK7 654273 sc-eQTL 5.12e-01 0.0784 0.119 0.105 CD4T L1
ENSG00000125703 ATG4C 558527 sc-eQTL 8.19e-01 0.0221 0.0964 0.105 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -251062 sc-eQTL 3.77e-03 -0.393 0.134 0.105 CD4T L1
ENSG00000162607 USP1 906362 sc-eQTL 1.08e-01 0.15 0.093 0.105 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -180713 sc-eQTL 6.60e-01 0.054 0.123 0.105 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 -250752 sc-eQTL 2.71e-01 0.132 0.119 0.105 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 -24916 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0357 0.132 0.105 CD8T L1
ENSG00000116641 DOCK7 654273 sc-eQTL 3.27e-01 0.131 0.133 0.105 CD8T L1
ENSG00000125703 ATG4C 558527 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00803 0.127 0.105 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -251062 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0188 0.142 0.105 CD8T L1
ENSG00000162607 USP1 906362 sc-eQTL 4.13e-01 0.0908 0.111 0.105 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -180713 sc-eQTL 1.55e-01 -0.201 0.141 0.105 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 -250752 sc-eQTL 9.54e-01 0.0077 0.132 0.108 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 -24916 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00196 0.136 0.108 DC L1
ENSG00000116641 DOCK7 654273 sc-eQTL 1.54e-01 0.198 0.139 0.108 DC L1
ENSG00000125703 ATG4C 558527 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0501 0.109 0.108 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -251062 sc-eQTL 2.45e-01 0.177 0.152 0.108 DC L1
ENSG00000162607 USP1 906362 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0179 0.133 0.108 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -180713 sc-eQTL 7.36e-01 0.0448 0.133 0.108 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 -250752 sc-eQTL 7.93e-02 0.223 0.127 0.105 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 -24916 sc-eQTL 7.25e-01 0.0468 0.133 0.105 Mono L1
ENSG00000116641 DOCK7 654273 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0228 0.129 0.105 Mono L1
ENSG00000125703 ATG4C 558527 sc-eQTL 3.09e-01 -0.0885 0.0868 0.105 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -251062 sc-eQTL 1.31e-01 -0.208 0.137 0.105 Mono L1
ENSG00000162607 USP1 906362 sc-eQTL 1.84e-01 -0.15 0.113 0.105 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 -250752 sc-eQTL 1.26e-01 0.167 0.109 0.105 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 -24916 sc-eQTL 8.08e-02 -0.224 0.128 0.105 NK L1
ENSG00000116641 DOCK7 654273 sc-eQTL 7.16e-01 0.0385 0.106 0.105 NK L1
ENSG00000125703 ATG4C 558527 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0605 0.114 0.105 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -251062 sc-eQTL 2.10e-01 -0.177 0.141 0.105 NK L1
ENSG00000162607 USP1 906362 sc-eQTL 9.50e-01 0.00796 0.126 0.105 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -180713 sc-eQTL 2.28e-01 0.185 0.153 0.105 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 -250752 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0186 0.126 0.105 Other_T L1
ENSG00000088035 ALG6 -24916 sc-eQTL 5.04e-01 0.0849 0.127 0.105 Other_T L1
ENSG00000116641 DOCK7 654273 sc-eQTL 1.69e-01 -0.178 0.129 0.105 Other_T L1
ENSG00000125703 ATG4C 558527 sc-eQTL 2.58e-01 0.127 0.112 0.105 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -251062 sc-eQTL 2.58e-01 -0.113 0.0993 0.105 Other_T L1
ENSG00000162607 USP1 906362 sc-eQTL 1.38e-01 0.128 0.0859 0.105 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -180713 sc-eQTL 5.95e-02 -0.289 0.152 0.105 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -250752 sc-eQTL 8.05e-01 0.0402 0.163 0.107 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 -24916 sc-eQTL 3.61e-01 -0.143 0.156 0.107 B_Activated L2
ENSG00000116641 DOCK7 654273 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0579 0.145 0.107 B_Activated L2
ENSG00000125703 ATG4C 558527 sc-eQTL 7.89e-01 0.0411 0.153 0.107 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -251062 sc-eQTL 4.05e-01 -0.125 0.149 0.107 B_Activated L2
ENSG00000162607 USP1 906362 sc-eQTL 4.88e-01 0.113 0.162 0.107 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -180713 sc-eQTL 4.97e-01 0.0963 0.141 0.107 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 -250752 sc-eQTL 8.06e-01 0.0368 0.149 0.105 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 -24916 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0955 0.152 0.105 B_Intermediate L2
ENSG00000116641 DOCK7 654273 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0212 0.145 0.105 B_Intermediate L2
ENSG00000125703 ATG4C 558527 sc-eQTL 6.65e-01 0.0532 0.123 0.105 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -251062 sc-eQTL 5.68e-01 0.0835 0.146 0.105 B_Intermediate L2
ENSG00000162607 USP1 906362 sc-eQTL 6.04e-01 0.0757 0.146 0.105 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -180713 sc-eQTL 4.51e-01 -0.109 0.145 0.105 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 -250752 sc-eQTL 7.95e-01 0.0381 0.147 0.103 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 -24916 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0963 0.149 0.103 B_Memory L2
ENSG00000116641 DOCK7 654273 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0868 0.14 0.103 B_Memory L2
ENSG00000125703 ATG4C 558527 sc-eQTL 2.17e-01 -0.164 0.133 0.103 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -251062 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0606 0.152 0.103 B_Memory L2
ENSG00000162607 USP1 906362 sc-eQTL 9.32e-02 0.257 0.153 0.103 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -180713 sc-eQTL 1.60e-01 -0.212 0.15 0.103 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 -250752 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0572 0.149 0.105 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 -24916 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0858 0.15 0.105 B_Naive1 L2
ENSG00000116641 DOCK7 654273 sc-eQTL 8.85e-01 0.0208 0.143 0.105 B_Naive1 L2
ENSG00000125703 ATG4C 558527 sc-eQTL 2.09e-01 -0.139 0.11 0.105 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -251062 sc-eQTL 2.55e-01 -0.167 0.146 0.105 B_Naive1 L2
ENSG00000162607 USP1 906362 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0478 0.129 0.105 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -180713 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0407 0.156 0.105 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 -250752 sc-eQTL 3.56e-01 -0.134 0.144 0.105 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 -24916 sc-eQTL 7.62e-01 0.0458 0.151 0.105 B_Naive2 L2
ENSG00000116641 DOCK7 654273 sc-eQTL 7.37e-01 0.0487 0.145 0.105 B_Naive2 L2
ENSG00000125703 ATG4C 558527 sc-eQTL 6.33e-01 0.0668 0.14 0.105 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -251062 sc-eQTL 6.62e-02 -0.278 0.15 0.105 B_Naive2 L2
ENSG00000162607 USP1 906362 sc-eQTL 4.06e-01 0.12 0.144 0.105 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -180713 sc-eQTL 1.77e-01 0.203 0.15 0.105 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 -250752 sc-eQTL 4.43e-01 0.113 0.147 0.105 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -24916 sc-eQTL 1.36e-01 0.231 0.154 0.105 CD4_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 654273 sc-eQTL 7.27e-02 -0.243 0.135 0.105 CD4_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 558527 sc-eQTL 2.76e-03 0.416 0.137 0.105 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -251062 sc-eQTL 8.58e-01 -0.027 0.15 0.105 CD4_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 906362 sc-eQTL 6.92e-02 0.259 0.142 0.105 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -180713 sc-eQTL 7.68e-01 0.0421 0.143 0.105 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -250752 sc-eQTL 2.11e-01 -0.15 0.119 0.105 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -24916 sc-eQTL 4.92e-02 0.255 0.129 0.105 CD4_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 654273 sc-eQTL 9.42e-01 0.00938 0.128 0.105 CD4_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 558527 sc-eQTL 7.62e-01 0.0343 0.113 0.105 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -251062 sc-eQTL 5.49e-04 -0.472 0.134 0.105 CD4_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 906362 sc-eQTL 1.61e-01 0.148 0.105 0.105 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -180713 sc-eQTL 3.01e-01 0.142 0.137 0.105 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -250752 sc-eQTL 3.99e-01 -0.105 0.124 0.105 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -24916 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0198 0.145 0.105 CD4_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 654273 sc-eQTL 2.52e-01 0.147 0.128 0.105 CD4_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 558527 sc-eQTL 6.71e-01 -0.053 0.125 0.105 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -251062 sc-eQTL 1.56e-01 -0.208 0.146 0.105 CD4_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 906362 sc-eQTL 2.06e-01 0.152 0.12 0.105 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -180713 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0827 0.142 0.105 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -250752 sc-eQTL 3.48e-01 0.138 0.147 0.105 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -24916 sc-eQTL 4.76e-01 0.105 0.148 0.105 CD4_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 654273 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0489 0.144 0.105 CD4_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 558527 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0969 0.14 0.105 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -251062 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00679 0.144 0.105 CD4_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 906362 sc-eQTL 5.08e-02 0.266 0.136 0.105 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -180713 sc-eQTL 2.84e-01 -0.16 0.149 0.105 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -250752 sc-eQTL 6.76e-02 0.244 0.133 0.105 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -24916 sc-eQTL 2.30e-01 0.171 0.142 0.105 CD8_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 654273 sc-eQTL 5.65e-01 0.0778 0.135 0.105 CD8_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 558527 sc-eQTL 6.20e-01 0.0715 0.144 0.105 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -251062 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0425 0.15 0.105 CD8_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 906362 sc-eQTL 2.13e-01 0.167 0.133 0.105 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -180713 sc-eQTL 3.06e-01 -0.157 0.153 0.105 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -250752 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00551 0.137 0.105 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -24916 sc-eQTL 3.64e-01 -0.129 0.142 0.105 CD8_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 654273 sc-eQTL 1.62e-01 0.205 0.146 0.105 CD8_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 558527 sc-eQTL 1.79e-01 -0.189 0.14 0.105 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -251062 sc-eQTL 9.36e-01 0.0115 0.143 0.105 CD8_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 906362 sc-eQTL 8.98e-01 0.0155 0.121 0.105 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -180713 sc-eQTL 4.45e-01 -0.103 0.134 0.105 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -250752 sc-eQTL 4.97e-01 -0.103 0.152 0.106 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -24916 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0421 0.154 0.106 CD8_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 654273 sc-eQTL 6.96e-02 -0.271 0.149 0.106 CD8_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 558527 sc-eQTL 1.78e-01 -0.206 0.153 0.106 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -251062 sc-eQTL 5.46e-03 -0.411 0.146 0.106 CD8_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 906362 sc-eQTL 9.47e-01 0.00958 0.144 0.106 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -180713 sc-eQTL 2.24e-01 -0.185 0.151 0.106 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -250752 sc-eQTL 7.16e-01 0.0559 0.154 0.105 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -24916 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0584 0.154 0.105 CD8_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 654273 sc-eQTL 9.28e-01 0.0136 0.15 0.105 CD8_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 558527 sc-eQTL 3.83e-01 0.125 0.143 0.105 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -251062 sc-eQTL 8.68e-01 0.026 0.156 0.105 CD8_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 906362 sc-eQTL 4.46e-01 0.113 0.148 0.105 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -180713 sc-eQTL 5.79e-01 0.0837 0.151 0.105 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -250752 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0532 0.142 0.104 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 -24916 sc-eQTL 3.31e-01 0.136 0.14 0.104 MAIT L2
ENSG00000116641 DOCK7 654273 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0723 0.134 0.104 MAIT L2
ENSG00000125703 ATG4C 558527 sc-eQTL 7.12e-01 0.0524 0.142 0.104 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -251062 sc-eQTL 3.60e-02 -0.296 0.14 0.104 MAIT L2
ENSG00000162607 USP1 906362 sc-eQTL 3.60e-01 0.129 0.141 0.104 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -180713 sc-eQTL 7.14e-02 -0.263 0.145 0.104 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 -250752 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0692 0.147 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 -24916 sc-eQTL 2.68e-01 0.167 0.15 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000116641 DOCK7 654273 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0308 0.13 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000125703 ATG4C 558527 sc-eQTL 2.10e-01 -0.182 0.145 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -251062 sc-eQTL 2.14e-01 -0.189 0.151 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000162607 USP1 906362 sc-eQTL 7.96e-01 0.0406 0.156 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -180713 sc-eQTL 2.63e-01 -0.168 0.149 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 -250752 sc-eQTL 5.63e-01 0.0663 0.114 0.103 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 -24916 sc-eQTL 2.13e-01 -0.181 0.145 0.103 NK_CD56dim L2
ENSG00000116641 DOCK7 654273 sc-eQTL 6.24e-01 0.062 0.126 0.103 NK_CD56dim L2
ENSG00000125703 ATG4C 558527 sc-eQTL 1.85e-01 -0.17 0.128 0.103 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -251062 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0255 0.146 0.103 NK_CD56dim L2
ENSG00000162607 USP1 906362 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0828 0.142 0.103 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -180713 sc-eQTL 1.90e-02 0.368 0.156 0.103 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 -250752 sc-eQTL 6.63e-01 -0.069 0.158 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 -24916 sc-eQTL 4.02e-01 -0.138 0.164 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000116641 DOCK7 654273 sc-eQTL 3.09e-01 0.128 0.125 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000125703 ATG4C 558527 sc-eQTL 1.73e-01 0.199 0.145 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -251062 sc-eQTL 5.80e-01 0.0849 0.153 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000162607 USP1 906362 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0773 0.16 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -180713 sc-eQTL 2.94e-01 -0.153 0.146 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 -250752 sc-eQTL 7.46e-02 0.221 0.124 0.103 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 -24916 sc-eQTL 1.31e-01 -0.212 0.14 0.103 NK_cytokine L2
ENSG00000116641 DOCK7 654273 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0574 0.13 0.103 NK_cytokine L2
ENSG00000125703 ATG4C 558527 sc-eQTL 9.58e-01 0.00695 0.133 0.103 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -251062 sc-eQTL 4.02e-02 -0.282 0.137 0.103 NK_cytokine L2
ENSG00000162607 USP1 906362 sc-eQTL 3.16e-01 0.146 0.145 0.103 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -180713 sc-eQTL 3.96e-01 0.125 0.147 0.103 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 -250752 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0263 0.172 0.104 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 -24916 sc-eQTL 4.01e-02 -0.368 0.177 0.104 PB L2
ENSG00000116641 DOCK7 654273 sc-eQTL 9.87e-01 0.00321 0.193 0.104 PB L2
ENSG00000125703 ATG4C 558527 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0762 0.168 0.104 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -251062 sc-eQTL 4.48e-01 -0.128 0.168 0.104 PB L2
ENSG00000162607 USP1 906362 sc-eQTL 1.77e-01 -0.226 0.166 0.104 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -180713 sc-eQTL 2.96e-01 -0.193 0.184 0.104 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 -250752 sc-eQTL 5.15e-01 0.0908 0.139 0.1 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 -24916 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0609 0.142 0.1 Pro_T L2
ENSG00000116641 DOCK7 654273 sc-eQTL 2.65e-01 -0.158 0.142 0.1 Pro_T L2
ENSG00000125703 ATG4C 558527 sc-eQTL 1.46e-01 -0.181 0.124 0.1 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -251062 sc-eQTL 6.77e-01 0.052 0.125 0.1 Pro_T L2
ENSG00000162607 USP1 906362 sc-eQTL 2.46e-01 0.0996 0.0856 0.1 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -180713 sc-eQTL 2.00e-01 -0.186 0.145 0.1 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 -250752 sc-eQTL 4.09e-01 0.117 0.141 0.105 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 -24916 sc-eQTL 1.96e-01 -0.195 0.15 0.105 Treg L2
ENSG00000116641 DOCK7 654273 sc-eQTL 5.92e-01 0.0742 0.138 0.105 Treg L2
ENSG00000125703 ATG4C 558527 sc-eQTL 3.19e-01 -0.141 0.141 0.105 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -251062 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0165 0.148 0.105 Treg L2
ENSG00000162607 USP1 906362 sc-eQTL 1.56e-01 0.203 0.143 0.105 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -180713 sc-eQTL 4.97e-01 0.0963 0.142 0.105 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 -250752 sc-eQTL 6.85e-01 0.0562 0.138 0.112 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -24916 sc-eQTL 7.49e-01 0.0448 0.14 0.112 cDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 654273 sc-eQTL 5.56e-01 0.0811 0.137 0.112 cDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 558527 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0655 0.119 0.112 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -251062 sc-eQTL 8.81e-01 0.0226 0.151 0.112 cDC L2
ENSG00000162607 USP1 906362 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0755 0.135 0.112 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -180713 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00877 0.122 0.112 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 -250752 sc-eQTL 1.94e-01 0.171 0.132 0.105 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 -24916 sc-eQTL 7.87e-01 0.0359 0.132 0.105 cMono_IL1B L2
ENSG00000116641 DOCK7 654273 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0843 0.139 0.105 cMono_IL1B L2
ENSG00000125703 ATG4C 558527 sc-eQTL 3.43e-01 -0.093 0.0979 0.105 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -251062 sc-eQTL 1.88e-01 -0.183 0.138 0.105 cMono_IL1B L2
ENSG00000162607 USP1 906362 sc-eQTL 3.12e-01 -0.124 0.122 0.105 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 -250752 sc-eQTL 6.08e-02 0.276 0.146 0.105 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 -24916 sc-eQTL 8.13e-01 0.0354 0.149 0.105 cMono_S100A L2
ENSG00000116641 DOCK7 654273 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0907 0.138 0.105 cMono_S100A L2
ENSG00000125703 ATG4C 558527 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0552 0.12 0.105 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -251062 sc-eQTL 2.85e-01 -0.145 0.135 0.105 cMono_S100A L2
ENSG00000162607 USP1 906362 sc-eQTL 3.62e-01 -0.127 0.139 0.105 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 -250752 sc-eQTL 4.72e-01 0.113 0.157 0.106 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 -24916 sc-eQTL 9.85e-01 0.0031 0.168 0.106 gdT L2
ENSG00000116641 DOCK7 654273 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0927 0.164 0.106 gdT L2
ENSG00000125703 ATG4C 558527 sc-eQTL 9.42e-02 0.262 0.156 0.106 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -251062 sc-eQTL 9.37e-01 -0.0133 0.167 0.106 gdT L2
ENSG00000162607 USP1 906362 sc-eQTL 1.30e-02 0.389 0.155 0.106 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -180713 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0349 0.164 0.106 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 -250752 sc-eQTL 8.40e-02 0.254 0.146 0.107 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -24916 sc-eQTL 4.78e-01 0.0973 0.137 0.107 intMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 654273 sc-eQTL 8.49e-01 0.0267 0.14 0.107 intMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 558527 sc-eQTL 7.75e-01 0.0382 0.134 0.107 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -251062 sc-eQTL 5.38e-01 0.0908 0.147 0.107 intMono L2
ENSG00000162607 USP1 906362 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0301 0.15 0.107 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -250752 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00152 0.133 0.109 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -24916 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0909 0.146 0.109 ncMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 654273 sc-eQTL 5.41e-01 0.0879 0.144 0.109 ncMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 558527 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0784 0.134 0.109 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -251062 sc-eQTL 8.32e-01 0.0298 0.14 0.109 ncMono L2
ENSG00000162607 USP1 906362 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0634 0.143 0.109 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -250752 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0198 0.156 0.113 pDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -24916 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0854 0.151 0.113 pDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 654273 sc-eQTL 2.87e-01 0.165 0.154 0.113 pDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 558527 sc-eQTL 6.16e-01 0.0697 0.139 0.113 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -251062 sc-eQTL 3.51e-01 0.146 0.156 0.113 pDC L2
ENSG00000162607 USP1 906362 sc-eQTL 8.76e-01 0.0248 0.159 0.113 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -180713 sc-eQTL 8.92e-01 0.0188 0.138 0.113 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -250752 sc-eQTL 8.54e-01 0.0254 0.138 0.105 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -24916 sc-eQTL 4.16e-01 -0.124 0.152 0.105 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 654273 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0861 0.132 0.105 B_Memory LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 558527 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0141 0.107 0.105 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -251062 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0223 0.141 0.105 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 906362 sc-eQTL 3.92e-01 0.117 0.136 0.105 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -180713 sc-eQTL 2.63e-01 -0.164 0.146 0.105 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -250752 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0726 0.146 0.105 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -24916 sc-eQTL 4.54e-01 -0.113 0.15 0.105 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 654273 sc-eQTL 9.36e-01 0.0113 0.14 0.105 B_Naive LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 558527 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0653 0.107 0.105 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -251062 sc-eQTL 1.20e-01 -0.235 0.15 0.105 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 906362 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0315 0.13 0.105 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -180713 sc-eQTL 3.88e-01 0.131 0.152 0.105 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -250752 sc-eQTL 9.84e-02 0.224 0.135 0.105 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -24916 sc-eQTL 7.43e-01 0.0432 0.132 0.105 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 654273 sc-eQTL 4.30e-01 -0.105 0.133 0.105 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 558527 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0764 0.0916 0.105 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -251062 sc-eQTL 9.64e-02 -0.225 0.135 0.105 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 906362 sc-eQTL 1.65e-01 -0.161 0.115 0.105 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -250752 sc-eQTL 3.79e-01 0.114 0.129 0.106 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -24916 sc-eQTL 8.34e-01 0.0308 0.147 0.106 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 654273 sc-eQTL 6.27e-01 0.0706 0.145 0.106 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 558527 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0556 0.124 0.106 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -251062 sc-eQTL 7.52e-01 0.0455 0.144 0.106 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 906362 sc-eQTL 3.77e-01 -0.119 0.135 0.106 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -250752 sc-eQTL 1.51e-01 0.159 0.111 0.103 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -24916 sc-eQTL 3.30e-02 -0.284 0.132 0.103 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 654273 sc-eQTL 5.01e-01 0.0806 0.12 0.103 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 558527 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0508 0.119 0.103 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -251062 sc-eQTL 1.98e-01 -0.182 0.141 0.103 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 906362 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0792 0.128 0.103 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -180713 sc-eQTL 1.29e-01 0.237 0.155 0.103 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000088035 ALG6 -24916 eQTL 0.00216 0.0661 0.0215 0.00123 0.0 0.101
ENSG00000116641 DOCK7 654291 eQTL 0.0483 -0.0712 0.036 0.0 0.0 0.101
ENSG00000132855 ANGPTL3 745172 pQTL 0.017 -0.114 0.0475 0.00124 0.0 0.104
ENSG00000185483 ROR1 -431358 pQTL 0.00954 0.0567 0.0218 0.00351 0.00126 0.104
ENSG00000203965 EFCAB7 -180713 eQTL 2.06e-02 -0.0905 0.039 0.0 0.0 0.101

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina