logo

Genes within 1Mb (chr1:63339979:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -253432 sc-eQTL 9.02e-01 0.0149 0.12 0.109 B L1
ENSG00000088035 ALG6 -27596 sc-eQTL 5.06e-02 -0.243 0.123 0.109 B L1
ENSG00000116641 DOCK7 651593 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00402 0.125 0.109 B L1
ENSG00000125703 ATG4C 555847 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0618 0.0865 0.109 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -253742 sc-eQTL 4.42e-01 -0.106 0.138 0.109 B L1
ENSG00000162607 USP1 903682 sc-eQTL 9.00e-01 0.0151 0.12 0.109 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -183393 sc-eQTL 7.35e-01 0.0478 0.141 0.109 B L1
ENSG00000079739 PGM1 -253432 sc-eQTL 2.52e-01 -0.118 0.103 0.109 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 -27596 sc-eQTL 2.99e-01 0.118 0.113 0.109 CD4T L1
ENSG00000116641 DOCK7 651593 sc-eQTL 6.51e-01 0.0522 0.115 0.109 CD4T L1
ENSG00000125703 ATG4C 555847 sc-eQTL 9.59e-01 0.00483 0.0929 0.109 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -253742 sc-eQTL 1.59e-02 -0.316 0.13 0.109 CD4T L1
ENSG00000162607 USP1 903682 sc-eQTL 2.66e-01 0.1 0.0899 0.109 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -183393 sc-eQTL 7.58e-01 0.0365 0.118 0.109 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 -253432 sc-eQTL 2.58e-01 0.13 0.115 0.109 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 -27596 sc-eQTL 4.37e-01 -0.099 0.127 0.109 CD8T L1
ENSG00000116641 DOCK7 651593 sc-eQTL 4.70e-01 0.0932 0.129 0.109 CD8T L1
ENSG00000125703 ATG4C 555847 sc-eQTL 8.64e-01 0.021 0.122 0.109 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -253742 sc-eQTL 5.99e-01 0.072 0.137 0.109 CD8T L1
ENSG00000162607 USP1 903682 sc-eQTL 6.03e-01 0.0555 0.107 0.109 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -183393 sc-eQTL 1.76e-01 -0.184 0.136 0.109 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 -253432 sc-eQTL 7.29e-01 0.0438 0.126 0.113 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 -27596 sc-eQTL 7.23e-01 0.0462 0.13 0.113 DC L1
ENSG00000116641 DOCK7 651593 sc-eQTL 3.25e-01 0.131 0.133 0.113 DC L1
ENSG00000125703 ATG4C 555847 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0668 0.104 0.113 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -253742 sc-eQTL 2.88e-01 0.155 0.145 0.113 DC L1
ENSG00000162607 USP1 903682 sc-eQTL 7.31e-01 0.0438 0.127 0.113 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -183393 sc-eQTL 5.58e-01 0.0745 0.127 0.113 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 -253432 sc-eQTL 4.87e-02 0.243 0.122 0.109 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 -27596 sc-eQTL 8.70e-01 0.021 0.129 0.109 Mono L1
ENSG00000116641 DOCK7 651593 sc-eQTL 8.69e-01 0.0206 0.125 0.109 Mono L1
ENSG00000125703 ATG4C 555847 sc-eQTL 3.15e-01 -0.0845 0.084 0.109 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -253742 sc-eQTL 1.57e-01 -0.188 0.132 0.109 Mono L1
ENSG00000162607 USP1 903682 sc-eQTL 1.46e-01 -0.159 0.109 0.109 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 -253432 sc-eQTL 1.34e-01 0.157 0.105 0.109 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 -27596 sc-eQTL 1.85e-01 -0.163 0.123 0.109 NK L1
ENSG00000116641 DOCK7 651593 sc-eQTL 8.60e-01 0.0179 0.102 0.109 NK L1
ENSG00000125703 ATG4C 555847 sc-eQTL 4.09e-01 -0.09 0.109 0.109 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -253742 sc-eQTL 3.43e-01 -0.129 0.135 0.109 NK L1
ENSG00000162607 USP1 903682 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0397 0.121 0.109 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -183393 sc-eQTL 1.43e-01 0.215 0.146 0.109 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 -253432 sc-eQTL 8.18e-01 -0.028 0.121 0.109 Other_T L1
ENSG00000088035 ALG6 -27596 sc-eQTL 2.87e-01 0.13 0.122 0.109 Other_T L1
ENSG00000116641 DOCK7 651593 sc-eQTL 1.96e-01 -0.161 0.124 0.109 Other_T L1
ENSG00000125703 ATG4C 555847 sc-eQTL 5.71e-01 0.0611 0.108 0.109 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -253742 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0739 0.0955 0.109 Other_T L1
ENSG00000162607 USP1 903682 sc-eQTL 3.62e-01 0.0756 0.0828 0.109 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -183393 sc-eQTL 1.41e-02 -0.36 0.146 0.109 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -253432 sc-eQTL 6.86e-01 0.0642 0.158 0.112 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 -27596 sc-eQTL 1.98e-01 -0.195 0.151 0.112 B_Activated L2
ENSG00000116641 DOCK7 651593 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0964 0.141 0.112 B_Activated L2
ENSG00000125703 ATG4C 555847 sc-eQTL 6.93e-01 0.0588 0.149 0.112 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -253742 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0174 0.145 0.112 B_Activated L2
ENSG00000162607 USP1 903682 sc-eQTL 4.11e-01 0.13 0.157 0.112 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -183393 sc-eQTL 2.41e-01 0.161 0.137 0.112 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 -253432 sc-eQTL 6.13e-01 0.0728 0.144 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 -27596 sc-eQTL 4.00e-01 -0.123 0.146 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000116641 DOCK7 651593 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0797 0.139 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000125703 ATG4C 555847 sc-eQTL 7.85e-01 0.0323 0.118 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -253742 sc-eQTL 4.28e-01 0.112 0.141 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000162607 USP1 903682 sc-eQTL 3.54e-01 0.13 0.14 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -183393 sc-eQTL 2.26e-01 -0.169 0.139 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 -253432 sc-eQTL 5.36e-01 0.0871 0.141 0.108 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 -27596 sc-eQTL 3.24e-01 -0.141 0.143 0.108 B_Memory L2
ENSG00000116641 DOCK7 651593 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0555 0.134 0.108 B_Memory L2
ENSG00000125703 ATG4C 555847 sc-eQTL 2.52e-01 -0.146 0.127 0.108 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -253742 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0435 0.146 0.108 B_Memory L2
ENSG00000162607 USP1 903682 sc-eQTL 2.93e-01 0.155 0.147 0.108 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -183393 sc-eQTL 2.20e-01 -0.178 0.144 0.108 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 -253432 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0466 0.143 0.109 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 -27596 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0925 0.143 0.109 B_Naive1 L2
ENSG00000116641 DOCK7 651593 sc-eQTL 9.77e-01 0.00401 0.138 0.109 B_Naive1 L2
ENSG00000125703 ATG4C 555847 sc-eQTL 2.50e-01 -0.122 0.106 0.109 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -253742 sc-eQTL 4.09e-01 -0.116 0.14 0.109 B_Naive1 L2
ENSG00000162607 USP1 903682 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0653 0.124 0.109 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -183393 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0181 0.15 0.109 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 -253432 sc-eQTL 3.39e-01 -0.133 0.139 0.109 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 -27596 sc-eQTL 7.95e-01 0.0378 0.145 0.109 B_Naive2 L2
ENSG00000116641 DOCK7 651593 sc-eQTL 8.92e-01 0.0189 0.139 0.109 B_Naive2 L2
ENSG00000125703 ATG4C 555847 sc-eQTL 7.95e-01 0.0349 0.134 0.109 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -253742 sc-eQTL 1.00e-01 -0.239 0.144 0.109 B_Naive2 L2
ENSG00000162607 USP1 903682 sc-eQTL 3.85e-01 0.12 0.138 0.109 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -183393 sc-eQTL 2.37e-01 0.171 0.144 0.109 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 -253432 sc-eQTL 2.95e-01 0.148 0.141 0.109 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -27596 sc-eQTL 3.10e-02 0.322 0.148 0.109 CD4_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 651593 sc-eQTL 6.43e-02 -0.242 0.13 0.109 CD4_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 555847 sc-eQTL 2.46e-03 0.406 0.132 0.109 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -253742 sc-eQTL 9.39e-01 -0.0112 0.145 0.109 CD4_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 903682 sc-eQTL 1.70e-01 0.189 0.137 0.109 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -183393 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00412 0.138 0.109 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -253432 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0991 0.115 0.109 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -27596 sc-eQTL 7.76e-02 0.221 0.125 0.109 CD4_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 651593 sc-eQTL 9.16e-01 -0.013 0.123 0.109 CD4_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 555847 sc-eQTL 9.47e-01 0.00726 0.109 0.109 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -253742 sc-eQTL 2.74e-03 -0.395 0.13 0.109 CD4_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 903682 sc-eQTL 3.03e-01 0.105 0.102 0.109 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -183393 sc-eQTL 4.20e-01 0.107 0.132 0.109 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -253432 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0626 0.119 0.109 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -27596 sc-eQTL 8.98e-01 0.0177 0.139 0.109 CD4_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 651593 sc-eQTL 2.43e-01 0.144 0.123 0.109 CD4_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 555847 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0387 0.12 0.109 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -253742 sc-eQTL 2.93e-01 -0.148 0.141 0.109 CD4_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 903682 sc-eQTL 2.42e-01 0.135 0.115 0.109 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -183393 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0426 0.137 0.109 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -253432 sc-eQTL 4.89e-01 0.0976 0.141 0.109 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -27596 sc-eQTL 5.11e-01 0.0933 0.142 0.109 CD4_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 651593 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0375 0.138 0.109 CD4_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 555847 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0819 0.134 0.109 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -253742 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0328 0.139 0.109 CD4_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 903682 sc-eQTL 6.79e-02 0.239 0.13 0.109 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -183393 sc-eQTL 5.27e-01 -0.091 0.144 0.109 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -253432 sc-eQTL 1.45e-02 0.316 0.128 0.109 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -27596 sc-eQTL 6.69e-01 0.0592 0.138 0.109 CD8_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 651593 sc-eQTL 9.23e-01 0.0128 0.131 0.109 CD8_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 555847 sc-eQTL 3.80e-01 0.123 0.139 0.109 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -253742 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0725 0.145 0.109 CD8_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 903682 sc-eQTL 9.17e-02 0.219 0.129 0.109 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -183393 sc-eQTL 2.99e-01 -0.154 0.148 0.109 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -253432 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00614 0.132 0.109 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -27596 sc-eQTL 2.21e-01 -0.167 0.136 0.109 CD8_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 651593 sc-eQTL 2.78e-01 0.153 0.141 0.109 CD8_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 555847 sc-eQTL 2.82e-01 -0.146 0.135 0.109 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -253742 sc-eQTL 5.81e-01 0.0757 0.137 0.109 CD8_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 903682 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0163 0.116 0.109 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -183393 sc-eQTL 3.28e-01 -0.126 0.129 0.109 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -253432 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0581 0.146 0.111 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -27596 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0175 0.148 0.111 CD8_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 651593 sc-eQTL 2.38e-01 -0.17 0.144 0.111 CD8_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 555847 sc-eQTL 2.70e-01 -0.163 0.147 0.111 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -253742 sc-eQTL 8.19e-02 -0.249 0.142 0.111 CD8_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 903682 sc-eQTL 4.37e-01 -0.107 0.138 0.111 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -183393 sc-eQTL 3.42e-01 -0.139 0.146 0.111 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -253432 sc-eQTL 4.76e-01 0.105 0.147 0.11 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -27596 sc-eQTL 3.47e-01 -0.139 0.147 0.11 CD8_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 651593 sc-eQTL 6.44e-01 0.0664 0.143 0.11 CD8_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 555847 sc-eQTL 3.13e-01 0.139 0.137 0.11 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -253742 sc-eQTL 5.16e-01 0.097 0.149 0.11 CD8_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 903682 sc-eQTL 5.07e-01 0.0946 0.142 0.11 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -183393 sc-eQTL 4.55e-01 0.108 0.144 0.11 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -253432 sc-eQTL 3.85e-01 -0.119 0.136 0.108 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 -27596 sc-eQTL 4.43e-01 0.104 0.135 0.108 MAIT L2
ENSG00000116641 DOCK7 651593 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0908 0.129 0.108 MAIT L2
ENSG00000125703 ATG4C 555847 sc-eQTL 9.95e-01 0.000851 0.137 0.108 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -253742 sc-eQTL 1.50e-01 -0.197 0.136 0.108 MAIT L2
ENSG00000162607 USP1 903682 sc-eQTL 2.41e-01 0.159 0.135 0.108 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -183393 sc-eQTL 2.38e-02 -0.317 0.139 0.108 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 -253432 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0503 0.14 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 -27596 sc-eQTL 2.31e-01 0.172 0.143 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000116641 DOCK7 651593 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0611 0.125 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000125703 ATG4C 555847 sc-eQTL 2.55e-01 -0.159 0.139 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -253742 sc-eQTL 2.65e-01 -0.162 0.145 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000162607 USP1 903682 sc-eQTL 9.42e-01 0.011 0.15 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -183393 sc-eQTL 3.23e-01 -0.142 0.143 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 -253432 sc-eQTL 6.19e-01 0.0548 0.11 0.108 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 -27596 sc-eQTL 4.05e-01 -0.116 0.139 0.108 NK_CD56dim L2
ENSG00000116641 DOCK7 651593 sc-eQTL 7.99e-01 0.031 0.121 0.108 NK_CD56dim L2
ENSG00000125703 ATG4C 555847 sc-eQTL 1.38e-01 -0.183 0.123 0.108 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -253742 sc-eQTL 7.82e-01 0.0389 0.14 0.108 NK_CD56dim L2
ENSG00000162607 USP1 903682 sc-eQTL 3.96e-01 -0.115 0.136 0.108 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -183393 sc-eQTL 9.60e-03 0.39 0.149 0.108 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 -253432 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0374 0.15 0.11 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 -27596 sc-eQTL 4.96e-01 -0.106 0.156 0.11 NK_HLA L2
ENSG00000116641 DOCK7 651593 sc-eQTL 4.89e-01 0.0827 0.119 0.11 NK_HLA L2
ENSG00000125703 ATG4C 555847 sc-eQTL 1.58e-01 0.196 0.138 0.11 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -253742 sc-eQTL 4.80e-01 0.103 0.146 0.11 NK_HLA L2
ENSG00000162607 USP1 903682 sc-eQTL 5.02e-01 -0.102 0.152 0.11 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -183393 sc-eQTL 2.60e-01 -0.156 0.138 0.11 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 -253432 sc-eQTL 1.18e-01 0.186 0.119 0.108 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 -27596 sc-eQTL 1.90e-01 -0.177 0.134 0.108 NK_cytokine L2
ENSG00000116641 DOCK7 651593 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0833 0.125 0.108 NK_cytokine L2
ENSG00000125703 ATG4C 555847 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0218 0.128 0.108 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -253742 sc-eQTL 4.28e-02 -0.267 0.131 0.108 NK_cytokine L2
ENSG00000162607 USP1 903682 sc-eQTL 4.27e-01 0.111 0.139 0.108 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -183393 sc-eQTL 2.90e-01 0.149 0.141 0.108 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 -253432 sc-eQTL 9.39e-01 0.0126 0.163 0.111 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 -27596 sc-eQTL 1.31e-02 -0.419 0.166 0.111 PB L2
ENSG00000116641 DOCK7 651593 sc-eQTL 7.22e-01 0.065 0.182 0.111 PB L2
ENSG00000125703 ATG4C 555847 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00446 0.159 0.111 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -253742 sc-eQTL 6.92e-01 0.0631 0.159 0.111 PB L2
ENSG00000162607 USP1 903682 sc-eQTL 3.77e-01 -0.14 0.158 0.111 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -183393 sc-eQTL 4.51e-01 -0.132 0.174 0.111 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 -253432 sc-eQTL 3.84e-01 0.116 0.133 0.104 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 -27596 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0455 0.136 0.104 Pro_T L2
ENSG00000116641 DOCK7 651593 sc-eQTL 1.71e-01 -0.186 0.136 0.104 Pro_T L2
ENSG00000125703 ATG4C 555847 sc-eQTL 1.87e-01 -0.157 0.119 0.104 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -253742 sc-eQTL 7.88e-01 0.0322 0.12 0.104 Pro_T L2
ENSG00000162607 USP1 903682 sc-eQTL 2.30e-01 0.0987 0.0819 0.104 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -183393 sc-eQTL 1.30e-01 -0.21 0.138 0.104 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 -253432 sc-eQTL 4.69e-01 0.0982 0.135 0.109 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 -27596 sc-eQTL 2.07e-01 -0.183 0.144 0.109 Treg L2
ENSG00000116641 DOCK7 651593 sc-eQTL 5.83e-01 0.0731 0.133 0.109 Treg L2
ENSG00000125703 ATG4C 555847 sc-eQTL 3.64e-01 -0.123 0.136 0.109 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -253742 sc-eQTL 9.54e-01 0.00822 0.142 0.109 Treg L2
ENSG00000162607 USP1 903682 sc-eQTL 1.57e-01 0.194 0.137 0.109 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -183393 sc-eQTL 5.23e-01 0.087 0.136 0.109 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 -253432 sc-eQTL 1.67e-01 0.186 0.134 0.117 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -27596 sc-eQTL 9.99e-01 0.000219 0.137 0.117 cDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 651593 sc-eQTL 5.75e-01 0.0754 0.134 0.117 cDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 555847 sc-eQTL 3.76e-01 -0.103 0.116 0.117 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -253742 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0193 0.148 0.117 cDC L2
ENSG00000162607 USP1 903682 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0513 0.132 0.117 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -183393 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0235 0.119 0.117 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 -253432 sc-eQTL 4.84e-02 0.251 0.126 0.109 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 -27596 sc-eQTL 6.40e-01 0.0597 0.128 0.109 cMono_IL1B L2
ENSG00000116641 DOCK7 651593 sc-eQTL 9.95e-01 0.000798 0.135 0.109 cMono_IL1B L2
ENSG00000125703 ATG4C 555847 sc-eQTL 3.82e-01 -0.0828 0.0944 0.109 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -253742 sc-eQTL 5.93e-02 -0.252 0.133 0.109 cMono_IL1B L2
ENSG00000162607 USP1 903682 sc-eQTL 3.04e-01 -0.122 0.118 0.109 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 -253432 sc-eQTL 1.08e-01 0.229 0.142 0.109 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 -27596 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0273 0.145 0.109 cMono_S100A L2
ENSG00000116641 DOCK7 651593 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0561 0.134 0.109 cMono_S100A L2
ENSG00000125703 ATG4C 555847 sc-eQTL 3.10e-01 -0.118 0.116 0.109 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -253742 sc-eQTL 2.95e-01 -0.137 0.131 0.109 cMono_S100A L2
ENSG00000162607 USP1 903682 sc-eQTL 3.29e-01 -0.132 0.135 0.109 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 -253432 sc-eQTL 4.40e-01 0.116 0.15 0.112 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 -27596 sc-eQTL 6.49e-01 0.073 0.16 0.112 gdT L2
ENSG00000116641 DOCK7 651593 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0728 0.157 0.112 gdT L2
ENSG00000125703 ATG4C 555847 sc-eQTL 2.02e-01 0.191 0.149 0.112 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -253742 sc-eQTL 9.59e-01 0.00822 0.16 0.112 gdT L2
ENSG00000162607 USP1 903682 sc-eQTL 4.84e-02 0.297 0.149 0.112 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -183393 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0905 0.157 0.112 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 -253432 sc-eQTL 1.88e-01 0.186 0.141 0.111 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -27596 sc-eQTL 7.30e-01 0.0455 0.132 0.111 intMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 651593 sc-eQTL 9.02e-01 0.0166 0.134 0.111 intMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 555847 sc-eQTL 4.59e-01 0.0952 0.128 0.111 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -253742 sc-eQTL 3.07e-01 0.145 0.141 0.111 intMono L2
ENSG00000162607 USP1 903682 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0654 0.144 0.111 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -253432 sc-eQTL 9.67e-01 0.00523 0.127 0.113 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -27596 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0784 0.14 0.113 ncMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 651593 sc-eQTL 7.36e-01 0.0465 0.138 0.113 ncMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 555847 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0236 0.129 0.113 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -253742 sc-eQTL 5.58e-01 0.079 0.135 0.113 ncMono L2
ENSG00000162607 USP1 903682 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0492 0.138 0.113 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -253432 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0823 0.147 0.119 pDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -27596 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00506 0.143 0.119 pDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 651593 sc-eQTL 5.65e-01 0.0845 0.146 0.119 pDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 555847 sc-eQTL 9.01e-01 0.0164 0.131 0.119 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -253742 sc-eQTL 4.76e-01 0.105 0.147 0.119 pDC L2
ENSG00000162607 USP1 903682 sc-eQTL 6.31e-01 0.0722 0.15 0.119 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -183393 sc-eQTL 6.83e-01 0.0534 0.13 0.119 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -253432 sc-eQTL 5.28e-01 0.0839 0.133 0.109 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -27596 sc-eQTL 2.34e-01 -0.175 0.146 0.109 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 651593 sc-eQTL 3.47e-01 -0.12 0.127 0.109 B_Memory LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 555847 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00317 0.103 0.109 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -253742 sc-eQTL 8.19e-01 0.031 0.135 0.109 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 903682 sc-eQTL 4.16e-01 0.107 0.131 0.109 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -183393 sc-eQTL 2.29e-01 -0.169 0.14 0.109 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -253432 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0704 0.14 0.109 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -27596 sc-eQTL 4.17e-01 -0.117 0.144 0.109 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 651593 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0303 0.135 0.109 B_Naive LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 555847 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0616 0.103 0.109 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -253742 sc-eQTL 2.22e-01 -0.177 0.145 0.109 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 903682 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0373 0.125 0.109 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -183393 sc-eQTL 3.56e-01 0.135 0.146 0.109 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -253432 sc-eQTL 5.98e-02 0.247 0.131 0.109 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -27596 sc-eQTL 7.69e-01 0.0376 0.128 0.109 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 651593 sc-eQTL 8.77e-01 -0.02 0.129 0.109 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 555847 sc-eQTL 2.72e-01 -0.0977 0.0886 0.109 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -253742 sc-eQTL 4.73e-02 -0.26 0.13 0.109 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 903682 sc-eQTL 1.18e-01 -0.175 0.112 0.109 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -253432 sc-eQTL 4.09e-01 0.103 0.124 0.11 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -27596 sc-eQTL 9.24e-01 0.0135 0.141 0.11 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 651593 sc-eQTL 8.20e-01 0.0318 0.14 0.11 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 555847 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00247 0.119 0.11 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -253742 sc-eQTL 4.33e-01 0.109 0.138 0.11 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 903682 sc-eQTL 3.77e-01 -0.115 0.13 0.11 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -253432 sc-eQTL 1.60e-01 0.15 0.106 0.108 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -27596 sc-eQTL 8.61e-02 -0.22 0.127 0.108 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 651593 sc-eQTL 6.36e-01 0.0545 0.115 0.108 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 555847 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0842 0.115 0.108 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -253742 sc-eQTL 3.37e-01 -0.131 0.136 0.108 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 903682 sc-eQTL 3.35e-01 -0.119 0.123 0.108 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -183393 sc-eQTL 7.42e-02 0.267 0.149 0.108 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000088035 ALG6 -27596 eQTL 0.0026 0.0648 0.0215 0.00109 0.0 0.102
ENSG00000116652 DLEU2L -207103 eQTL 0.0421 -0.0857 0.0421 0.0 0.0 0.102
ENSG00000132855 ANGPTL3 742492 pQTL 0.0189 -0.112 0.0475 0.00116 0.0 0.105
ENSG00000185483 ROR1 -434038 pQTL 0.0153 0.053 0.0218 0.00214 0.0 0.105
ENSG00000203965 EFCAB7 -183393 eQTL 1.96e-02 -0.0911 0.039 0.0 0.0 0.102

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina