logo

Genes within 1Mb (chr1:63332790:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -260621 sc-eQTL 2.38e-01 0.149 0.126 0.098 B L1
ENSG00000088035 ALG6 -34785 sc-eQTL 3.96e-01 -0.111 0.131 0.098 B L1
ENSG00000116641 DOCK7 644404 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0383 0.131 0.098 B L1
ENSG00000125703 ATG4C 548658 sc-eQTL 1.28e-01 -0.138 0.0905 0.098 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -260931 sc-eQTL 1.81e-01 -0.194 0.144 0.098 B L1
ENSG00000162607 USP1 896493 sc-eQTL 5.46e-01 0.076 0.126 0.098 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -190582 sc-eQTL 6.09e-01 -0.076 0.148 0.098 B L1
ENSG00000079739 PGM1 -260621 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0762 0.108 0.098 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 -34785 sc-eQTL 5.58e-01 0.07 0.119 0.098 CD4T L1
ENSG00000116641 DOCK7 644404 sc-eQTL 1.35e-01 0.181 0.12 0.098 CD4T L1
ENSG00000125703 ATG4C 548658 sc-eQTL 8.35e-01 0.0203 0.0976 0.098 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -260931 sc-eQTL 1.31e-02 -0.342 0.137 0.098 CD4T L1
ENSG00000162607 USP1 896493 sc-eQTL 3.39e-02 0.2 0.0937 0.098 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -190582 sc-eQTL 3.92e-01 0.107 0.124 0.098 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 -260621 sc-eQTL 3.32e-02 0.255 0.119 0.098 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 -34785 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0807 0.133 0.098 CD8T L1
ENSG00000116641 DOCK7 644404 sc-eQTL 5.45e-01 0.0813 0.134 0.098 CD8T L1
ENSG00000125703 ATG4C 548658 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0379 0.128 0.098 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -260931 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0869 0.143 0.098 CD8T L1
ENSG00000162607 USP1 896493 sc-eQTL 3.51e-01 0.104 0.111 0.098 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -190582 sc-eQTL 2.97e-02 -0.308 0.141 0.098 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 -260621 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0448 0.135 0.099 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 -34785 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0801 0.139 0.099 DC L1
ENSG00000116641 DOCK7 644404 sc-eQTL 1.26e-01 0.218 0.142 0.099 DC L1
ENSG00000125703 ATG4C 548658 sc-eQTL 5.31e-01 -0.07 0.112 0.099 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -260931 sc-eQTL 3.11e-01 0.158 0.156 0.099 DC L1
ENSG00000162607 USP1 896493 sc-eQTL 8.50e-01 0.0258 0.136 0.099 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -190582 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0459 0.136 0.099 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 -260621 sc-eQTL 1.84e-01 0.173 0.13 0.098 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 -34785 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0474 0.136 0.098 Mono L1
ENSG00000116641 DOCK7 644404 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0456 0.132 0.098 Mono L1
ENSG00000125703 ATG4C 548658 sc-eQTL 3.63e-01 -0.081 0.0889 0.098 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -260931 sc-eQTL 1.77e-01 -0.19 0.14 0.098 Mono L1
ENSG00000162607 USP1 896493 sc-eQTL 9.19e-01 0.0118 0.116 0.098 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 -260621 sc-eQTL 8.50e-03 0.289 0.109 0.099 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 -34785 sc-eQTL 8.30e-02 -0.224 0.129 0.099 NK L1
ENSG00000116641 DOCK7 644404 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0675 0.107 0.099 NK L1
ENSG00000125703 ATG4C 548658 sc-eQTL 3.70e-01 -0.103 0.114 0.099 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -260931 sc-eQTL 9.39e-02 -0.238 0.141 0.099 NK L1
ENSG00000162607 USP1 896493 sc-eQTL 4.43e-01 0.0977 0.127 0.099 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -190582 sc-eQTL 6.62e-02 0.283 0.153 0.099 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 -260621 sc-eQTL 2.35e-01 -0.152 0.127 0.098 Other_T L1
ENSG00000088035 ALG6 -34785 sc-eQTL 6.84e-01 0.0523 0.128 0.098 Other_T L1
ENSG00000116641 DOCK7 644404 sc-eQTL 1.67e-01 -0.181 0.13 0.098 Other_T L1
ENSG00000125703 ATG4C 548658 sc-eQTL 7.61e-02 0.201 0.113 0.098 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -260931 sc-eQTL 5.49e-02 -0.192 0.0997 0.098 Other_T L1
ENSG00000162607 USP1 896493 sc-eQTL 2.31e-01 0.104 0.0869 0.098 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -190582 sc-eQTL 4.97e-01 -0.106 0.155 0.098 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -260621 sc-eQTL 9.26e-01 0.0154 0.166 0.099 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 -34785 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0227 0.159 0.099 B_Activated L2
ENSG00000116641 DOCK7 644404 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0622 0.148 0.099 B_Activated L2
ENSG00000125703 ATG4C 548658 sc-eQTL 4.77e-01 0.111 0.156 0.099 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -260931 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0344 0.152 0.099 B_Activated L2
ENSG00000162607 USP1 896493 sc-eQTL 9.10e-01 0.0187 0.165 0.099 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -190582 sc-eQTL 4.56e-01 0.108 0.144 0.099 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 -260621 sc-eQTL 5.54e-01 0.0891 0.15 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 -34785 sc-eQTL 4.14e-01 0.125 0.153 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000116641 DOCK7 644404 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0465 0.146 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000125703 ATG4C 548658 sc-eQTL 7.30e-01 0.0427 0.123 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -260931 sc-eQTL 7.79e-01 0.0413 0.147 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000162607 USP1 896493 sc-eQTL 3.53e-01 0.137 0.147 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -190582 sc-eQTL 2.13e-01 -0.181 0.145 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 -260621 sc-eQTL 4.22e-01 0.119 0.147 0.099 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 -34785 sc-eQTL 4.03e-01 -0.125 0.15 0.099 B_Memory L2
ENSG00000116641 DOCK7 644404 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0742 0.141 0.099 B_Memory L2
ENSG00000125703 ATG4C 548658 sc-eQTL 1.04e-02 -0.341 0.132 0.099 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -260931 sc-eQTL 9.04e-01 0.0185 0.153 0.099 B_Memory L2
ENSG00000162607 USP1 896493 sc-eQTL 9.68e-02 0.256 0.153 0.099 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -190582 sc-eQTL 1.40e-01 -0.224 0.151 0.099 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 -260621 sc-eQTL 5.79e-01 0.0827 0.149 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 -34785 sc-eQTL 8.10e-01 0.036 0.15 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000116641 DOCK7 644404 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0221 0.143 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000125703 ATG4C 548658 sc-eQTL 2.75e-01 -0.12 0.11 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -260931 sc-eQTL 4.24e-01 -0.117 0.146 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000162607 USP1 896493 sc-eQTL 5.87e-01 -0.07 0.129 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -190582 sc-eQTL 5.56e-01 0.0922 0.156 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 -260621 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0895 0.148 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 -34785 sc-eQTL 8.54e-01 0.0284 0.154 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000116641 DOCK7 644404 sc-eQTL 4.84e-01 -0.104 0.148 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000125703 ATG4C 548658 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0284 0.143 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -260931 sc-eQTL 4.76e-03 -0.433 0.152 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000162607 USP1 896493 sc-eQTL 1.88e-01 0.193 0.147 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -190582 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0675 0.154 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 -260621 sc-eQTL 4.00e-01 0.125 0.148 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -34785 sc-eQTL 1.12e-01 0.249 0.156 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 644404 sc-eQTL 2.57e-01 -0.156 0.137 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 548658 sc-eQTL 1.81e-04 0.524 0.137 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -260931 sc-eQTL 7.14e-01 0.0557 0.152 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 896493 sc-eQTL 3.27e-03 0.422 0.142 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -190582 sc-eQTL 8.42e-01 0.0289 0.145 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -260621 sc-eQTL 2.10e-01 -0.152 0.121 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -34785 sc-eQTL 1.95e-01 0.171 0.132 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 644404 sc-eQTL 1.62e-01 0.181 0.129 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 548658 sc-eQTL 7.53e-01 0.0362 0.115 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -260931 sc-eQTL 8.68e-03 -0.366 0.138 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 896493 sc-eQTL 2.10e-01 0.134 0.107 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -190582 sc-eQTL 3.66e-01 0.126 0.139 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -260621 sc-eQTL 6.43e-01 0.0581 0.125 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -34785 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0221 0.146 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 644404 sc-eQTL 3.41e-01 0.123 0.129 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 548658 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0898 0.125 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -260931 sc-eQTL 5.79e-02 -0.28 0.147 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 896493 sc-eQTL 2.41e-01 0.142 0.121 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -190582 sc-eQTL 4.43e-01 0.11 0.143 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -260621 sc-eQTL 6.05e-01 0.0765 0.147 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -34785 sc-eQTL 2.87e-01 0.158 0.148 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 644404 sc-eQTL 9.36e-01 -0.0116 0.145 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 548658 sc-eQTL 9.65e-01 0.00613 0.14 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -260931 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0736 0.145 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 896493 sc-eQTL 1.46e-01 0.2 0.137 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -190582 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0962 0.15 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -260621 sc-eQTL 2.76e-02 0.296 0.133 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -34785 sc-eQTL 4.09e-01 0.118 0.143 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 644404 sc-eQTL 7.66e-01 0.0406 0.136 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 548658 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0776 0.145 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -260931 sc-eQTL 9.51e-01 0.00927 0.151 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 896493 sc-eQTL 3.94e-01 0.115 0.135 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -190582 sc-eQTL 1.94e-01 -0.2 0.154 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -260621 sc-eQTL 9.13e-01 0.0149 0.137 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -34785 sc-eQTL 1.73e-01 -0.193 0.141 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 644404 sc-eQTL 4.35e-01 0.115 0.146 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 548658 sc-eQTL 3.22e-01 -0.139 0.14 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -260931 sc-eQTL 9.81e-01 0.00347 0.143 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 896493 sc-eQTL 8.69e-01 0.0199 0.121 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -190582 sc-eQTL 1.47e-01 -0.194 0.134 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -260621 sc-eQTL 3.58e-01 0.139 0.151 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -34785 sc-eQTL 3.03e-01 -0.158 0.153 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 644404 sc-eQTL 3.97e-02 -0.307 0.148 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 548658 sc-eQTL 4.25e-01 -0.122 0.153 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -260931 sc-eQTL 3.33e-02 -0.315 0.147 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 896493 sc-eQTL 3.08e-01 0.146 0.143 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -190582 sc-eQTL 2.63e-01 -0.17 0.151 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -260621 sc-eQTL 6.94e-01 0.0618 0.157 0.098 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -34785 sc-eQTL 2.97e-01 -0.164 0.157 0.098 CD8_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 644404 sc-eQTL 5.72e-01 0.0864 0.152 0.098 CD8_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 548658 sc-eQTL 1.77e-01 0.198 0.146 0.098 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -260931 sc-eQTL 8.35e-01 0.0332 0.159 0.098 CD8_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 896493 sc-eQTL 2.86e-01 0.162 0.151 0.098 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -190582 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0883 0.154 0.098 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -260621 sc-eQTL 2.72e-01 -0.158 0.144 0.1 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 -34785 sc-eQTL 4.07e-01 0.118 0.142 0.1 MAIT L2
ENSG00000116641 DOCK7 644404 sc-eQTL 3.81e-01 -0.12 0.136 0.1 MAIT L2
ENSG00000125703 ATG4C 548658 sc-eQTL 2.07e-01 0.182 0.144 0.1 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -260931 sc-eQTL 7.49e-03 -0.383 0.142 0.1 MAIT L2
ENSG00000162607 USP1 896493 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0546 0.143 0.1 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -190582 sc-eQTL 1.73e-01 -0.203 0.148 0.1 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 -260621 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0485 0.146 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 -34785 sc-eQTL 7.60e-01 0.0458 0.15 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000116641 DOCK7 644404 sc-eQTL 2.81e-01 -0.14 0.129 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000125703 ATG4C 548658 sc-eQTL 1.26e-01 -0.221 0.144 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -260931 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00269 0.151 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000162607 USP1 896493 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0683 0.156 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -190582 sc-eQTL 6.42e-01 0.0692 0.149 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 -260621 sc-eQTL 1.14e-01 0.183 0.115 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 -34785 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0714 0.147 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000116641 DOCK7 644404 sc-eQTL 7.43e-01 0.0421 0.128 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000125703 ATG4C 548658 sc-eQTL 1.27e-01 -0.198 0.129 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -260931 sc-eQTL 4.78e-01 -0.105 0.148 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000162607 USP1 896493 sc-eQTL 4.35e-01 0.112 0.143 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -190582 sc-eQTL 5.80e-02 0.302 0.159 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 -260621 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0207 0.162 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 -34785 sc-eQTL 2.53e-01 -0.192 0.167 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000116641 DOCK7 644404 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00934 0.128 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000125703 ATG4C 548658 sc-eQTL 2.63e-01 0.167 0.149 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -260931 sc-eQTL 6.64e-01 0.0681 0.156 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000162607 USP1 896493 sc-eQTL 6.30e-01 -0.079 0.164 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -190582 sc-eQTL 8.51e-01 -0.028 0.149 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 -260621 sc-eQTL 2.07e-02 0.293 0.126 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 -34785 sc-eQTL 1.27e-01 -0.219 0.143 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000116641 DOCK7 644404 sc-eQTL 3.53e-01 -0.124 0.133 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000125703 ATG4C 548658 sc-eQTL 9.34e-01 0.0113 0.136 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -260931 sc-eQTL 7.38e-02 -0.252 0.14 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000162607 USP1 896493 sc-eQTL 3.81e-01 0.13 0.148 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -190582 sc-eQTL 4.74e-01 0.108 0.15 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 -260621 sc-eQTL 4.44e-01 0.136 0.177 0.089 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 -34785 sc-eQTL 4.58e-01 -0.139 0.186 0.089 PB L2
ENSG00000116641 DOCK7 644404 sc-eQTL 8.96e-01 0.0261 0.2 0.089 PB L2
ENSG00000125703 ATG4C 548658 sc-eQTL 4.73e-01 -0.125 0.174 0.089 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -260931 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0982 0.173 0.089 PB L2
ENSG00000162607 USP1 896493 sc-eQTL 7.91e-02 -0.302 0.171 0.089 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -190582 sc-eQTL 5.94e-01 -0.102 0.191 0.089 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 -260621 sc-eQTL 7.30e-01 0.0482 0.139 0.098 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 -34785 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0974 0.142 0.098 Pro_T L2
ENSG00000116641 DOCK7 644404 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0208 0.142 0.098 Pro_T L2
ENSG00000125703 ATG4C 548658 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0905 0.124 0.098 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -260931 sc-eQTL 4.96e-01 0.0852 0.125 0.098 Pro_T L2
ENSG00000162607 USP1 896493 sc-eQTL 2.67e-01 0.0953 0.0856 0.098 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -190582 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0628 0.145 0.098 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 -260621 sc-eQTL 8.02e-02 0.25 0.142 0.098 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 -34785 sc-eQTL 3.58e-01 -0.141 0.153 0.098 Treg L2
ENSG00000116641 DOCK7 644404 sc-eQTL 1.45e-01 0.205 0.14 0.098 Treg L2
ENSG00000125703 ATG4C 548658 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0846 0.144 0.098 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -260931 sc-eQTL 6.97e-01 0.0586 0.15 0.098 Treg L2
ENSG00000162607 USP1 896493 sc-eQTL 8.08e-03 0.383 0.143 0.098 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -190582 sc-eQTL 2.85e-01 0.154 0.144 0.098 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 -260621 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0315 0.143 0.1 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -34785 sc-eQTL 7.42e-01 0.048 0.145 0.1 cDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 644404 sc-eQTL 8.62e-01 0.0249 0.143 0.1 cDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 548658 sc-eQTL 4.15e-01 -0.101 0.124 0.1 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -260931 sc-eQTL 1.00e+00 2.47e-05 0.157 0.1 cDC L2
ENSG00000162607 USP1 896493 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0769 0.14 0.1 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -190582 sc-eQTL 9.11e-01 0.0142 0.126 0.1 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 -260621 sc-eQTL 3.96e-01 0.114 0.134 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 -34785 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0637 0.134 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000116641 DOCK7 644404 sc-eQTL 4.33e-01 -0.111 0.141 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000125703 ATG4C 548658 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0229 0.0994 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -260931 sc-eQTL 1.39e-01 -0.208 0.14 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000162607 USP1 896493 sc-eQTL 7.56e-01 0.0386 0.124 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 -260621 sc-eQTL 4.32e-02 0.301 0.148 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 -34785 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0191 0.152 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000116641 DOCK7 644404 sc-eQTL 3.70e-01 -0.126 0.14 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000125703 ATG4C 548658 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0933 0.122 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -260931 sc-eQTL 4.52e-01 -0.103 0.137 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000162607 USP1 896493 sc-eQTL 3.68e-01 -0.127 0.141 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 -260621 sc-eQTL 5.18e-01 0.102 0.157 0.103 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 -34785 sc-eQTL 9.81e-01 0.0039 0.168 0.103 gdT L2
ENSG00000116641 DOCK7 644404 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0479 0.165 0.103 gdT L2
ENSG00000125703 ATG4C 548658 sc-eQTL 8.30e-02 0.272 0.156 0.103 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -260931 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0755 0.167 0.103 gdT L2
ENSG00000162607 USP1 896493 sc-eQTL 3.96e-02 0.324 0.156 0.103 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -190582 sc-eQTL 8.79e-01 0.0251 0.164 0.103 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 -260621 sc-eQTL 2.49e-01 0.173 0.149 0.098 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -34785 sc-eQTL 7.31e-01 0.0481 0.14 0.098 intMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 644404 sc-eQTL 7.42e-01 -0.047 0.143 0.098 intMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 548658 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0136 0.136 0.098 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -260931 sc-eQTL 8.01e-01 0.0379 0.15 0.098 intMono L2
ENSG00000162607 USP1 896493 sc-eQTL 5.70e-01 0.0868 0.152 0.098 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -260621 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0219 0.136 0.1 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -34785 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0379 0.149 0.1 ncMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 644404 sc-eQTL 3.61e-01 0.134 0.147 0.1 ncMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 548658 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0464 0.137 0.1 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -260931 sc-eQTL 5.54e-01 0.0851 0.144 0.1 ncMono L2
ENSG00000162607 USP1 896493 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0402 0.147 0.1 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -260621 sc-eQTL 8.14e-01 0.0374 0.159 0.102 pDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -34785 sc-eQTL 3.12e-01 -0.156 0.154 0.102 pDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 644404 sc-eQTL 7.21e-02 0.283 0.156 0.102 pDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 548658 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00505 0.141 0.102 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -260931 sc-eQTL 4.33e-01 0.125 0.159 0.102 pDC L2
ENSG00000162607 USP1 896493 sc-eQTL 6.86e-01 0.0655 0.162 0.102 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -190582 sc-eQTL 9.43e-02 -0.235 0.139 0.102 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -260621 sc-eQTL 4.65e-01 0.102 0.139 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -34785 sc-eQTL 8.98e-01 0.0198 0.154 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 644404 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0797 0.134 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 548658 sc-eQTL 3.83e-01 -0.0943 0.108 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -260931 sc-eQTL 9.58e-01 0.00743 0.142 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 896493 sc-eQTL 1.83e-01 0.184 0.137 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -190582 sc-eQTL 9.35e-02 -0.248 0.147 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -260621 sc-eQTL 7.38e-01 0.0494 0.148 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -34785 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0195 0.152 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 644404 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0998 0.142 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 548658 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0849 0.108 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -260931 sc-eQTL 4.85e-02 -0.301 0.152 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 896493 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0171 0.131 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -190582 sc-eQTL 4.28e-01 0.122 0.154 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -260621 sc-eQTL 1.64e-01 0.192 0.138 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -34785 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0862 0.134 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 644404 sc-eQTL 2.70e-01 -0.149 0.135 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 548658 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0527 0.0932 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -260931 sc-eQTL 1.48e-01 -0.2 0.137 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 896493 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0342 0.118 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -260621 sc-eQTL 6.88e-01 0.0532 0.132 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -34785 sc-eQTL 6.95e-01 0.059 0.15 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 644404 sc-eQTL 7.14e-01 0.0546 0.149 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 548658 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0755 0.127 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -260931 sc-eQTL 5.69e-01 0.0839 0.147 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 896493 sc-eQTL 9.81e-01 0.00336 0.138 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -260621 sc-eQTL 3.21e-02 0.241 0.112 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -34785 sc-eQTL 8.68e-02 -0.232 0.135 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 644404 sc-eQTL 8.46e-01 0.0236 0.121 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 548658 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0344 0.121 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -260931 sc-eQTL 9.84e-02 -0.237 0.143 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 896493 sc-eQTL 4.41e-01 0.101 0.13 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -190582 sc-eQTL 1.18e-01 0.248 0.158 0.097 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000088035 ALG6 -34785 eQTL 0.0188 0.0538 0.0229 0.0 0.0 0.0868
ENSG00000132855 ANGPTL3 735303 pQTL 0.0422 -0.101 0.0498 0.0 0.0 0.091
ENSG00000185483 ROR1 -441227 pQTL 0.0371 0.0478 0.0229 0.0 0.0 0.091

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000116652 \N -214292 1.94e-06 2.34e-06 2.59e-07 1.48e-06 4.82e-07 7.16e-07 1.33e-06 5.78e-07 1.63e-06 7.42e-07 1.97e-06 1.43e-06 3.23e-06 8.78e-07 4.72e-07 1.15e-06 1.04e-06 1.68e-06 6.25e-07 8.15e-07 8.12e-07 2.18e-06 1.88e-06 1.04e-06 2.61e-06 1.22e-06 1.13e-06 1.32e-06 1.89e-06 1.63e-06 1.06e-06 2.46e-07 4.55e-07 1.22e-06 9.1e-07 8.7e-07 7.69e-07 3.47e-07 7.29e-07 3.46e-07 1.83e-07 2.75e-06 4.24e-07 1.99e-07 3.42e-07 2.93e-07 4.95e-07 2.71e-07 2.13e-07