logo

Genes within 1Mb (chr1:63332306:T:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -261105 sc-eQTL 2.38e-01 0.149 0.126 0.098 B L1
ENSG00000088035 ALG6 -35269 sc-eQTL 3.96e-01 -0.111 0.131 0.098 B L1
ENSG00000116641 DOCK7 643920 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0383 0.131 0.098 B L1
ENSG00000125703 ATG4C 548174 sc-eQTL 1.28e-01 -0.138 0.0905 0.098 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -261415 sc-eQTL 1.81e-01 -0.194 0.144 0.098 B L1
ENSG00000162607 USP1 896009 sc-eQTL 5.46e-01 0.076 0.126 0.098 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -191066 sc-eQTL 6.09e-01 -0.076 0.148 0.098 B L1
ENSG00000079739 PGM1 -261105 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0762 0.108 0.098 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 -35269 sc-eQTL 5.58e-01 0.07 0.119 0.098 CD4T L1
ENSG00000116641 DOCK7 643920 sc-eQTL 1.35e-01 0.181 0.12 0.098 CD4T L1
ENSG00000125703 ATG4C 548174 sc-eQTL 8.35e-01 0.0203 0.0976 0.098 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -261415 sc-eQTL 1.31e-02 -0.342 0.137 0.098 CD4T L1
ENSG00000162607 USP1 896009 sc-eQTL 3.39e-02 0.2 0.0937 0.098 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -191066 sc-eQTL 3.92e-01 0.107 0.124 0.098 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 -261105 sc-eQTL 3.32e-02 0.255 0.119 0.098 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 -35269 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0807 0.133 0.098 CD8T L1
ENSG00000116641 DOCK7 643920 sc-eQTL 5.45e-01 0.0813 0.134 0.098 CD8T L1
ENSG00000125703 ATG4C 548174 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0379 0.128 0.098 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -261415 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0869 0.143 0.098 CD8T L1
ENSG00000162607 USP1 896009 sc-eQTL 3.51e-01 0.104 0.111 0.098 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -191066 sc-eQTL 2.97e-02 -0.308 0.141 0.098 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 -261105 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0448 0.135 0.099 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 -35269 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0801 0.139 0.099 DC L1
ENSG00000116641 DOCK7 643920 sc-eQTL 1.26e-01 0.218 0.142 0.099 DC L1
ENSG00000125703 ATG4C 548174 sc-eQTL 5.31e-01 -0.07 0.112 0.099 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -261415 sc-eQTL 3.11e-01 0.158 0.156 0.099 DC L1
ENSG00000162607 USP1 896009 sc-eQTL 8.50e-01 0.0258 0.136 0.099 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -191066 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0459 0.136 0.099 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 -261105 sc-eQTL 1.84e-01 0.173 0.13 0.098 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 -35269 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0474 0.136 0.098 Mono L1
ENSG00000116641 DOCK7 643920 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0456 0.132 0.098 Mono L1
ENSG00000125703 ATG4C 548174 sc-eQTL 3.63e-01 -0.081 0.0889 0.098 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -261415 sc-eQTL 1.77e-01 -0.19 0.14 0.098 Mono L1
ENSG00000162607 USP1 896009 sc-eQTL 9.19e-01 0.0118 0.116 0.098 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 -261105 sc-eQTL 8.50e-03 0.289 0.109 0.099 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 -35269 sc-eQTL 8.30e-02 -0.224 0.129 0.099 NK L1
ENSG00000116641 DOCK7 643920 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0675 0.107 0.099 NK L1
ENSG00000125703 ATG4C 548174 sc-eQTL 3.70e-01 -0.103 0.114 0.099 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -261415 sc-eQTL 9.39e-02 -0.238 0.141 0.099 NK L1
ENSG00000162607 USP1 896009 sc-eQTL 4.43e-01 0.0977 0.127 0.099 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -191066 sc-eQTL 6.62e-02 0.283 0.153 0.099 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 -261105 sc-eQTL 2.35e-01 -0.152 0.127 0.098 Other_T L1
ENSG00000088035 ALG6 -35269 sc-eQTL 6.84e-01 0.0523 0.128 0.098 Other_T L1
ENSG00000116641 DOCK7 643920 sc-eQTL 1.67e-01 -0.181 0.13 0.098 Other_T L1
ENSG00000125703 ATG4C 548174 sc-eQTL 7.61e-02 0.201 0.113 0.098 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -261415 sc-eQTL 5.49e-02 -0.192 0.0997 0.098 Other_T L1
ENSG00000162607 USP1 896009 sc-eQTL 2.31e-01 0.104 0.0869 0.098 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -191066 sc-eQTL 4.97e-01 -0.106 0.155 0.098 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -261105 sc-eQTL 9.26e-01 0.0154 0.166 0.099 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 -35269 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0227 0.159 0.099 B_Activated L2
ENSG00000116641 DOCK7 643920 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0622 0.148 0.099 B_Activated L2
ENSG00000125703 ATG4C 548174 sc-eQTL 4.77e-01 0.111 0.156 0.099 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -261415 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0344 0.152 0.099 B_Activated L2
ENSG00000162607 USP1 896009 sc-eQTL 9.10e-01 0.0187 0.165 0.099 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -191066 sc-eQTL 4.56e-01 0.108 0.144 0.099 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 -261105 sc-eQTL 5.54e-01 0.0891 0.15 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 -35269 sc-eQTL 4.14e-01 0.125 0.153 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000116641 DOCK7 643920 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0465 0.146 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000125703 ATG4C 548174 sc-eQTL 7.30e-01 0.0427 0.123 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -261415 sc-eQTL 7.79e-01 0.0413 0.147 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000162607 USP1 896009 sc-eQTL 3.53e-01 0.137 0.147 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -191066 sc-eQTL 2.13e-01 -0.181 0.145 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 -261105 sc-eQTL 4.22e-01 0.119 0.147 0.099 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 -35269 sc-eQTL 4.03e-01 -0.125 0.15 0.099 B_Memory L2
ENSG00000116641 DOCK7 643920 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0742 0.141 0.099 B_Memory L2
ENSG00000125703 ATG4C 548174 sc-eQTL 1.04e-02 -0.341 0.132 0.099 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -261415 sc-eQTL 9.04e-01 0.0185 0.153 0.099 B_Memory L2
ENSG00000162607 USP1 896009 sc-eQTL 9.68e-02 0.256 0.153 0.099 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -191066 sc-eQTL 1.40e-01 -0.224 0.151 0.099 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 -261105 sc-eQTL 5.79e-01 0.0827 0.149 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 -35269 sc-eQTL 8.10e-01 0.036 0.15 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000116641 DOCK7 643920 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0221 0.143 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000125703 ATG4C 548174 sc-eQTL 2.75e-01 -0.12 0.11 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -261415 sc-eQTL 4.24e-01 -0.117 0.146 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000162607 USP1 896009 sc-eQTL 5.87e-01 -0.07 0.129 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -191066 sc-eQTL 5.56e-01 0.0922 0.156 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 -261105 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0895 0.148 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 -35269 sc-eQTL 8.54e-01 0.0284 0.154 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000116641 DOCK7 643920 sc-eQTL 4.84e-01 -0.104 0.148 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000125703 ATG4C 548174 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0284 0.143 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -261415 sc-eQTL 4.76e-03 -0.433 0.152 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000162607 USP1 896009 sc-eQTL 1.88e-01 0.193 0.147 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -191066 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0675 0.154 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 -261105 sc-eQTL 4.00e-01 0.125 0.148 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -35269 sc-eQTL 1.12e-01 0.249 0.156 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 643920 sc-eQTL 2.57e-01 -0.156 0.137 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 548174 sc-eQTL 1.81e-04 0.524 0.137 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -261415 sc-eQTL 7.14e-01 0.0557 0.152 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 896009 sc-eQTL 3.27e-03 0.422 0.142 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -191066 sc-eQTL 8.42e-01 0.0289 0.145 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -261105 sc-eQTL 2.10e-01 -0.152 0.121 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -35269 sc-eQTL 1.95e-01 0.171 0.132 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 643920 sc-eQTL 1.62e-01 0.181 0.129 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 548174 sc-eQTL 7.53e-01 0.0362 0.115 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -261415 sc-eQTL 8.68e-03 -0.366 0.138 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 896009 sc-eQTL 2.10e-01 0.134 0.107 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -191066 sc-eQTL 3.66e-01 0.126 0.139 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -261105 sc-eQTL 6.43e-01 0.0581 0.125 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -35269 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0221 0.146 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 643920 sc-eQTL 3.41e-01 0.123 0.129 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 548174 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0898 0.125 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -261415 sc-eQTL 5.79e-02 -0.28 0.147 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 896009 sc-eQTL 2.41e-01 0.142 0.121 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -191066 sc-eQTL 4.43e-01 0.11 0.143 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -261105 sc-eQTL 6.05e-01 0.0765 0.147 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -35269 sc-eQTL 2.87e-01 0.158 0.148 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 643920 sc-eQTL 9.36e-01 -0.0116 0.145 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 548174 sc-eQTL 9.65e-01 0.00613 0.14 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -261415 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0736 0.145 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 896009 sc-eQTL 1.46e-01 0.2 0.137 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -191066 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0962 0.15 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -261105 sc-eQTL 2.76e-02 0.296 0.133 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -35269 sc-eQTL 4.09e-01 0.118 0.143 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 643920 sc-eQTL 7.66e-01 0.0406 0.136 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 548174 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0776 0.145 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -261415 sc-eQTL 9.51e-01 0.00927 0.151 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 896009 sc-eQTL 3.94e-01 0.115 0.135 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -191066 sc-eQTL 1.94e-01 -0.2 0.154 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -261105 sc-eQTL 9.13e-01 0.0149 0.137 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -35269 sc-eQTL 1.73e-01 -0.193 0.141 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 643920 sc-eQTL 4.35e-01 0.115 0.146 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 548174 sc-eQTL 3.22e-01 -0.139 0.14 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -261415 sc-eQTL 9.81e-01 0.00347 0.143 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 896009 sc-eQTL 8.69e-01 0.0199 0.121 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -191066 sc-eQTL 1.47e-01 -0.194 0.134 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -261105 sc-eQTL 3.58e-01 0.139 0.151 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -35269 sc-eQTL 3.03e-01 -0.158 0.153 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 643920 sc-eQTL 3.97e-02 -0.307 0.148 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 548174 sc-eQTL 4.25e-01 -0.122 0.153 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -261415 sc-eQTL 3.33e-02 -0.315 0.147 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 896009 sc-eQTL 3.08e-01 0.146 0.143 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -191066 sc-eQTL 2.63e-01 -0.17 0.151 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -261105 sc-eQTL 6.94e-01 0.0618 0.157 0.098 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -35269 sc-eQTL 2.97e-01 -0.164 0.157 0.098 CD8_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 643920 sc-eQTL 5.72e-01 0.0864 0.152 0.098 CD8_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 548174 sc-eQTL 1.77e-01 0.198 0.146 0.098 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -261415 sc-eQTL 8.35e-01 0.0332 0.159 0.098 CD8_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 896009 sc-eQTL 2.86e-01 0.162 0.151 0.098 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -191066 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0883 0.154 0.098 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -261105 sc-eQTL 2.72e-01 -0.158 0.144 0.1 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 -35269 sc-eQTL 4.07e-01 0.118 0.142 0.1 MAIT L2
ENSG00000116641 DOCK7 643920 sc-eQTL 3.81e-01 -0.12 0.136 0.1 MAIT L2
ENSG00000125703 ATG4C 548174 sc-eQTL 2.07e-01 0.182 0.144 0.1 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -261415 sc-eQTL 7.49e-03 -0.383 0.142 0.1 MAIT L2
ENSG00000162607 USP1 896009 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0546 0.143 0.1 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -191066 sc-eQTL 1.73e-01 -0.203 0.148 0.1 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 -261105 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0485 0.146 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 -35269 sc-eQTL 7.60e-01 0.0458 0.15 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000116641 DOCK7 643920 sc-eQTL 2.81e-01 -0.14 0.129 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000125703 ATG4C 548174 sc-eQTL 1.26e-01 -0.221 0.144 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -261415 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00269 0.151 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000162607 USP1 896009 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0683 0.156 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -191066 sc-eQTL 6.42e-01 0.0692 0.149 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 -261105 sc-eQTL 1.14e-01 0.183 0.115 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 -35269 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0714 0.147 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000116641 DOCK7 643920 sc-eQTL 7.43e-01 0.0421 0.128 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000125703 ATG4C 548174 sc-eQTL 1.27e-01 -0.198 0.129 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -261415 sc-eQTL 4.78e-01 -0.105 0.148 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000162607 USP1 896009 sc-eQTL 4.35e-01 0.112 0.143 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -191066 sc-eQTL 5.80e-02 0.302 0.159 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 -261105 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0207 0.162 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 -35269 sc-eQTL 2.53e-01 -0.192 0.167 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000116641 DOCK7 643920 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00934 0.128 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000125703 ATG4C 548174 sc-eQTL 2.63e-01 0.167 0.149 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -261415 sc-eQTL 6.64e-01 0.0681 0.156 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000162607 USP1 896009 sc-eQTL 6.30e-01 -0.079 0.164 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -191066 sc-eQTL 8.51e-01 -0.028 0.149 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 -261105 sc-eQTL 2.07e-02 0.293 0.126 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 -35269 sc-eQTL 1.27e-01 -0.219 0.143 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000116641 DOCK7 643920 sc-eQTL 3.53e-01 -0.124 0.133 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000125703 ATG4C 548174 sc-eQTL 9.34e-01 0.0113 0.136 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -261415 sc-eQTL 7.38e-02 -0.252 0.14 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000162607 USP1 896009 sc-eQTL 3.81e-01 0.13 0.148 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -191066 sc-eQTL 4.74e-01 0.108 0.15 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 -261105 sc-eQTL 4.44e-01 0.136 0.177 0.089 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 -35269 sc-eQTL 4.58e-01 -0.139 0.186 0.089 PB L2
ENSG00000116641 DOCK7 643920 sc-eQTL 8.96e-01 0.0261 0.2 0.089 PB L2
ENSG00000125703 ATG4C 548174 sc-eQTL 4.73e-01 -0.125 0.174 0.089 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -261415 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0982 0.173 0.089 PB L2
ENSG00000162607 USP1 896009 sc-eQTL 7.91e-02 -0.302 0.171 0.089 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -191066 sc-eQTL 5.94e-01 -0.102 0.191 0.089 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 -261105 sc-eQTL 7.30e-01 0.0482 0.139 0.098 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 -35269 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0974 0.142 0.098 Pro_T L2
ENSG00000116641 DOCK7 643920 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0208 0.142 0.098 Pro_T L2
ENSG00000125703 ATG4C 548174 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0905 0.124 0.098 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -261415 sc-eQTL 4.96e-01 0.0852 0.125 0.098 Pro_T L2
ENSG00000162607 USP1 896009 sc-eQTL 2.67e-01 0.0953 0.0856 0.098 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -191066 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0628 0.145 0.098 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 -261105 sc-eQTL 8.02e-02 0.25 0.142 0.098 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 -35269 sc-eQTL 3.58e-01 -0.141 0.153 0.098 Treg L2
ENSG00000116641 DOCK7 643920 sc-eQTL 1.45e-01 0.205 0.14 0.098 Treg L2
ENSG00000125703 ATG4C 548174 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0846 0.144 0.098 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -261415 sc-eQTL 6.97e-01 0.0586 0.15 0.098 Treg L2
ENSG00000162607 USP1 896009 sc-eQTL 8.08e-03 0.383 0.143 0.098 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -191066 sc-eQTL 2.85e-01 0.154 0.144 0.098 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 -261105 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0315 0.143 0.1 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -35269 sc-eQTL 7.42e-01 0.048 0.145 0.1 cDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 643920 sc-eQTL 8.62e-01 0.0249 0.143 0.1 cDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 548174 sc-eQTL 4.15e-01 -0.101 0.124 0.1 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -261415 sc-eQTL 1.00e+00 2.47e-05 0.157 0.1 cDC L2
ENSG00000162607 USP1 896009 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0769 0.14 0.1 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -191066 sc-eQTL 9.11e-01 0.0142 0.126 0.1 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 -261105 sc-eQTL 3.96e-01 0.114 0.134 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 -35269 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0637 0.134 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000116641 DOCK7 643920 sc-eQTL 4.33e-01 -0.111 0.141 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000125703 ATG4C 548174 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0229 0.0994 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -261415 sc-eQTL 1.39e-01 -0.208 0.14 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000162607 USP1 896009 sc-eQTL 7.56e-01 0.0386 0.124 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 -261105 sc-eQTL 4.32e-02 0.301 0.148 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 -35269 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0191 0.152 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000116641 DOCK7 643920 sc-eQTL 3.70e-01 -0.126 0.14 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000125703 ATG4C 548174 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0933 0.122 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -261415 sc-eQTL 4.52e-01 -0.103 0.137 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000162607 USP1 896009 sc-eQTL 3.68e-01 -0.127 0.141 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 -261105 sc-eQTL 5.18e-01 0.102 0.157 0.103 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 -35269 sc-eQTL 9.81e-01 0.0039 0.168 0.103 gdT L2
ENSG00000116641 DOCK7 643920 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0479 0.165 0.103 gdT L2
ENSG00000125703 ATG4C 548174 sc-eQTL 8.30e-02 0.272 0.156 0.103 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -261415 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0755 0.167 0.103 gdT L2
ENSG00000162607 USP1 896009 sc-eQTL 3.96e-02 0.324 0.156 0.103 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -191066 sc-eQTL 8.79e-01 0.0251 0.164 0.103 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 -261105 sc-eQTL 2.49e-01 0.173 0.149 0.098 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -35269 sc-eQTL 7.31e-01 0.0481 0.14 0.098 intMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 643920 sc-eQTL 7.42e-01 -0.047 0.143 0.098 intMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 548174 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0136 0.136 0.098 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -261415 sc-eQTL 8.01e-01 0.0379 0.15 0.098 intMono L2
ENSG00000162607 USP1 896009 sc-eQTL 5.70e-01 0.0868 0.152 0.098 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -261105 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0219 0.136 0.1 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -35269 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0379 0.149 0.1 ncMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 643920 sc-eQTL 3.61e-01 0.134 0.147 0.1 ncMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 548174 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0464 0.137 0.1 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -261415 sc-eQTL 5.54e-01 0.0851 0.144 0.1 ncMono L2
ENSG00000162607 USP1 896009 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0402 0.147 0.1 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -261105 sc-eQTL 8.14e-01 0.0374 0.159 0.102 pDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -35269 sc-eQTL 3.12e-01 -0.156 0.154 0.102 pDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 643920 sc-eQTL 7.21e-02 0.283 0.156 0.102 pDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 548174 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00505 0.141 0.102 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -261415 sc-eQTL 4.33e-01 0.125 0.159 0.102 pDC L2
ENSG00000162607 USP1 896009 sc-eQTL 6.86e-01 0.0655 0.162 0.102 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -191066 sc-eQTL 9.43e-02 -0.235 0.139 0.102 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -261105 sc-eQTL 4.65e-01 0.102 0.139 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -35269 sc-eQTL 8.98e-01 0.0198 0.154 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 643920 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0797 0.134 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 548174 sc-eQTL 3.83e-01 -0.0943 0.108 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -261415 sc-eQTL 9.58e-01 0.00743 0.142 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 896009 sc-eQTL 1.83e-01 0.184 0.137 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -191066 sc-eQTL 9.35e-02 -0.248 0.147 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -261105 sc-eQTL 7.38e-01 0.0494 0.148 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -35269 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0195 0.152 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 643920 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0998 0.142 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 548174 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0849 0.108 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -261415 sc-eQTL 4.85e-02 -0.301 0.152 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 896009 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0171 0.131 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -191066 sc-eQTL 4.28e-01 0.122 0.154 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -261105 sc-eQTL 1.64e-01 0.192 0.138 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -35269 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0862 0.134 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 643920 sc-eQTL 2.70e-01 -0.149 0.135 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 548174 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0527 0.0932 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -261415 sc-eQTL 1.48e-01 -0.2 0.137 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 896009 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0342 0.118 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -261105 sc-eQTL 6.88e-01 0.0532 0.132 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -35269 sc-eQTL 6.95e-01 0.059 0.15 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 643920 sc-eQTL 7.14e-01 0.0546 0.149 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 548174 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0755 0.127 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -261415 sc-eQTL 5.69e-01 0.0839 0.147 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 896009 sc-eQTL 9.81e-01 0.00336 0.138 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -261105 sc-eQTL 3.21e-02 0.241 0.112 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -35269 sc-eQTL 8.68e-02 -0.232 0.135 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 643920 sc-eQTL 8.46e-01 0.0236 0.121 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 548174 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0344 0.121 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -261415 sc-eQTL 9.84e-02 -0.237 0.143 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 896009 sc-eQTL 4.41e-01 0.101 0.13 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -191066 sc-eQTL 1.18e-01 0.248 0.158 0.097 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000088035 ALG6 -35269 eQTL 0.0176 0.0547 0.023 0.0 0.0 0.0868
ENSG00000132855 ANGPTL3 734819 pQTL 0.0393 -0.103 0.05 0.0 0.0 0.091
ENSG00000185483 ROR1 -441711 pQTL 0.0373 0.048 0.023 0.0 0.0 0.091

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000116652 \N -214776 1.37e-06 1.13e-06 2.28e-07 1.18e-06 3.83e-07 5.91e-07 1.5e-06 4.13e-07 1.57e-06 6.05e-07 1.95e-06 7.92e-07 2.45e-06 2.86e-07 5.32e-07 9.92e-07 9.64e-07 1.02e-06 8.15e-07 5.75e-07 7.96e-07 1.82e-06 1.11e-06 5.3e-07 2.32e-06 7.53e-07 9.36e-07 9.09e-07 1.62e-06 1.19e-06 8.06e-07 2.52e-07 2.65e-07 5.71e-07 5.31e-07 4.32e-07 7.15e-07 2.78e-07 4.75e-07 3.34e-07 3.35e-07 1.66e-06 1.66e-07 1.38e-07 3e-07 1.72e-07 2.56e-07 3.77e-08 1.58e-07