logo

Genes within 1Mb (chr1:63332228:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -261183 sc-eQTL 3.89e-01 0.106 0.123 0.1 B L1
ENSG00000088035 ALG6 -35347 sc-eQTL 4.07e-01 -0.106 0.127 0.1 B L1
ENSG00000116641 DOCK7 643842 sc-eQTL 9.51e-01 0.00785 0.127 0.1 B L1
ENSG00000125703 ATG4C 548096 sc-eQTL 2.65e-01 -0.0986 0.0882 0.1 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -261493 sc-eQTL 2.08e-01 -0.177 0.14 0.1 B L1
ENSG00000162607 USP1 895931 sc-eQTL 4.69e-01 0.0885 0.122 0.1 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -191144 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0691 0.144 0.1 B L1
ENSG00000079739 PGM1 -261183 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0709 0.105 0.1 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 -35347 sc-eQTL 4.83e-01 0.0814 0.116 0.1 CD4T L1
ENSG00000116641 DOCK7 643842 sc-eQTL 9.54e-02 0.195 0.117 0.1 CD4T L1
ENSG00000125703 ATG4C 548096 sc-eQTL 9.73e-01 0.00326 0.0948 0.1 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -261493 sc-eQTL 1.55e-02 -0.324 0.133 0.1 CD4T L1
ENSG00000162607 USP1 895931 sc-eQTL 2.54e-02 0.205 0.0909 0.1 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -191144 sc-eQTL 5.87e-01 0.0656 0.121 0.1 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 -261183 sc-eQTL 3.79e-02 0.241 0.116 0.1 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 -35347 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0667 0.129 0.1 CD8T L1
ENSG00000116641 DOCK7 643842 sc-eQTL 4.88e-01 0.0906 0.13 0.1 CD8T L1
ENSG00000125703 ATG4C 548096 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0566 0.124 0.1 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -261493 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0567 0.138 0.1 CD8T L1
ENSG00000162607 USP1 895931 sc-eQTL 3.00e-01 0.112 0.108 0.1 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -191144 sc-eQTL 2.48e-02 -0.309 0.136 0.1 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 -261183 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00499 0.131 0.101 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 -35347 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0723 0.135 0.101 DC L1
ENSG00000116641 DOCK7 643842 sc-eQTL 1.13e-01 0.218 0.137 0.101 DC L1
ENSG00000125703 ATG4C 548096 sc-eQTL 3.88e-01 -0.0934 0.108 0.101 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -261493 sc-eQTL 2.51e-01 0.174 0.151 0.101 DC L1
ENSG00000162607 USP1 895931 sc-eQTL 7.53e-01 0.0416 0.132 0.101 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -191144 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0694 0.131 0.101 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 -261183 sc-eQTL 1.89e-01 0.167 0.126 0.1 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 -35347 sc-eQTL 8.38e-01 -0.027 0.132 0.1 Mono L1
ENSG00000116641 DOCK7 643842 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0513 0.128 0.1 Mono L1
ENSG00000125703 ATG4C 548096 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0532 0.0864 0.1 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -261493 sc-eQTL 1.46e-01 -0.198 0.136 0.1 Mono L1
ENSG00000162607 USP1 895931 sc-eQTL 9.74e-01 0.00367 0.112 0.1 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 -261183 sc-eQTL 1.42e-02 0.261 0.106 0.101 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 -35347 sc-eQTL 9.03e-02 -0.212 0.125 0.101 NK L1
ENSG00000116641 DOCK7 643842 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0578 0.103 0.101 NK L1
ENSG00000125703 ATG4C 548096 sc-eQTL 3.88e-01 -0.0959 0.111 0.101 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -261493 sc-eQTL 1.20e-01 -0.215 0.137 0.101 NK L1
ENSG00000162607 USP1 895931 sc-eQTL 4.31e-01 0.0972 0.123 0.101 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -191144 sc-eQTL 6.00e-02 0.281 0.149 0.101 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 -261183 sc-eQTL 1.15e-01 -0.195 0.123 0.1 Other_T L1
ENSG00000088035 ALG6 -35347 sc-eQTL 6.15e-01 0.0626 0.124 0.1 Other_T L1
ENSG00000116641 DOCK7 643842 sc-eQTL 1.42e-01 -0.186 0.126 0.1 Other_T L1
ENSG00000125703 ATG4C 548096 sc-eQTL 7.57e-02 0.195 0.109 0.1 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -261493 sc-eQTL 8.10e-02 -0.17 0.0968 0.1 Other_T L1
ENSG00000162607 USP1 895931 sc-eQTL 1.95e-01 0.109 0.0842 0.1 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -191144 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0915 0.15 0.1 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -261183 sc-eQTL 9.56e-01 -0.009 0.162 0.102 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 -35347 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0467 0.155 0.102 B_Activated L2
ENSG00000116641 DOCK7 643842 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0688 0.144 0.102 B_Activated L2
ENSG00000125703 ATG4C 548096 sc-eQTL 4.50e-01 0.115 0.151 0.102 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -261493 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0508 0.148 0.102 B_Activated L2
ENSG00000162607 USP1 895931 sc-eQTL 7.35e-01 0.0545 0.161 0.102 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -191144 sc-eQTL 2.29e-01 0.169 0.14 0.102 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 -261183 sc-eQTL 4.28e-01 0.116 0.146 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 -35347 sc-eQTL 3.48e-01 0.139 0.148 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000116641 DOCK7 643842 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0474 0.141 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000125703 ATG4C 548096 sc-eQTL 6.11e-01 0.061 0.12 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -261493 sc-eQTL 5.79e-01 0.0792 0.143 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000162607 USP1 895931 sc-eQTL 2.39e-01 0.168 0.142 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -191144 sc-eQTL 1.65e-01 -0.196 0.141 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 -261183 sc-eQTL 6.17e-01 0.0717 0.143 0.101 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 -35347 sc-eQTL 3.87e-01 -0.126 0.145 0.101 B_Memory L2
ENSG00000116641 DOCK7 643842 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0587 0.136 0.101 B_Memory L2
ENSG00000125703 ATG4C 548096 sc-eQTL 1.54e-02 -0.312 0.128 0.101 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -261493 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0239 0.148 0.101 B_Memory L2
ENSG00000162607 USP1 895931 sc-eQTL 7.96e-02 0.262 0.149 0.101 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -191144 sc-eQTL 1.50e-01 -0.212 0.147 0.101 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 -261183 sc-eQTL 7.43e-01 0.0475 0.145 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 -35347 sc-eQTL 7.86e-01 0.0394 0.145 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000116641 DOCK7 643842 sc-eQTL 9.14e-01 0.0151 0.139 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000125703 ATG4C 548096 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0959 0.107 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -261493 sc-eQTL 4.72e-01 -0.102 0.142 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000162607 USP1 895931 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0455 0.125 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -191144 sc-eQTL 6.10e-01 0.0775 0.152 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 -261183 sc-eQTL 4.33e-01 -0.113 0.143 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 -35347 sc-eQTL 8.28e-01 0.0325 0.149 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000116641 DOCK7 643842 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0756 0.144 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000125703 ATG4C 548096 sc-eQTL 9.68e-01 0.00551 0.138 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -261493 sc-eQTL 6.22e-03 -0.407 0.147 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000162607 USP1 895931 sc-eQTL 2.09e-01 0.179 0.142 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -191144 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0537 0.149 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 -261183 sc-eQTL 4.35e-01 0.113 0.144 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -35347 sc-eQTL 1.10e-01 0.243 0.151 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 643842 sc-eQTL 2.96e-01 -0.139 0.133 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 548096 sc-eQTL 3.77e-04 0.482 0.133 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -261493 sc-eQTL 6.95e-01 0.0577 0.147 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 895931 sc-eQTL 3.09e-03 0.411 0.137 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -191144 sc-eQTL 8.66e-01 0.0237 0.14 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -261183 sc-eQTL 1.25e-01 -0.181 0.117 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -35347 sc-eQTL 1.33e-01 0.192 0.127 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 643842 sc-eQTL 1.25e-01 0.193 0.125 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 548096 sc-eQTL 7.81e-01 0.0309 0.111 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -261493 sc-eQTL 1.12e-02 -0.343 0.134 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 895931 sc-eQTL 1.73e-01 0.141 0.103 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -191144 sc-eQTL 3.80e-01 0.119 0.135 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -261183 sc-eQTL 6.38e-01 0.0573 0.122 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -35347 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0308 0.141 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 643842 sc-eQTL 2.97e-01 0.131 0.125 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 548096 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0949 0.122 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -261493 sc-eQTL 5.91e-02 -0.271 0.143 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 895931 sc-eQTL 2.21e-01 0.144 0.117 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -191144 sc-eQTL 5.88e-01 0.0755 0.139 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -261183 sc-eQTL 4.89e-01 0.0992 0.143 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -35347 sc-eQTL 2.64e-01 0.161 0.144 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 643842 sc-eQTL 8.75e-01 0.022 0.14 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 548096 sc-eQTL 9.30e-01 -0.0121 0.136 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -261493 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0706 0.141 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 895931 sc-eQTL 1.34e-01 0.2 0.133 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -191144 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0983 0.146 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -261183 sc-eQTL 3.42e-02 0.276 0.129 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -35347 sc-eQTL 4.12e-01 0.114 0.139 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 643842 sc-eQTL 7.71e-01 0.0384 0.132 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 548096 sc-eQTL 6.48e-01 -0.064 0.14 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -261493 sc-eQTL 8.14e-01 0.0344 0.146 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 895931 sc-eQTL 3.64e-01 0.119 0.13 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -191144 sc-eQTL 2.00e-01 -0.191 0.149 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -261183 sc-eQTL 9.40e-01 0.0101 0.133 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -35347 sc-eQTL 2.12e-01 -0.171 0.137 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 643842 sc-eQTL 5.33e-01 0.0887 0.142 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 548096 sc-eQTL 2.05e-01 -0.173 0.136 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -261493 sc-eQTL 7.82e-01 0.0382 0.138 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 895931 sc-eQTL 8.82e-01 0.0174 0.117 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -191144 sc-eQTL 1.38e-01 -0.193 0.13 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -261183 sc-eQTL 4.33e-01 0.115 0.146 0.106 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -35347 sc-eQTL 3.72e-01 -0.132 0.148 0.106 CD8_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 643842 sc-eQTL 4.55e-02 -0.288 0.143 0.106 CD8_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 548096 sc-eQTL 4.15e-01 -0.121 0.148 0.106 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -261493 sc-eQTL 2.35e-02 -0.324 0.142 0.106 CD8_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 895931 sc-eQTL 2.11e-01 0.173 0.138 0.106 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -191144 sc-eQTL 2.54e-01 -0.167 0.146 0.106 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -261183 sc-eQTL 6.95e-01 0.0595 0.151 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -35347 sc-eQTL 3.36e-01 -0.146 0.152 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 643842 sc-eQTL 5.38e-01 0.0908 0.147 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 548096 sc-eQTL 1.86e-01 0.187 0.141 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -261493 sc-eQTL 8.34e-01 0.0322 0.153 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 895931 sc-eQTL 2.19e-01 0.18 0.146 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -191144 sc-eQTL 5.82e-01 -0.082 0.149 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -261183 sc-eQTL 2.05e-01 -0.177 0.139 0.102 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 -35347 sc-eQTL 3.65e-01 0.125 0.138 0.102 MAIT L2
ENSG00000116641 DOCK7 643842 sc-eQTL 3.51e-01 -0.124 0.132 0.102 MAIT L2
ENSG00000125703 ATG4C 548096 sc-eQTL 1.82e-01 0.187 0.139 0.102 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -261493 sc-eQTL 8.81e-03 -0.365 0.138 0.102 MAIT L2
ENSG00000162607 USP1 895931 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0519 0.139 0.102 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -191144 sc-eQTL 2.01e-01 -0.184 0.144 0.102 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 -261183 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0345 0.141 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 -35347 sc-eQTL 7.14e-01 0.0531 0.145 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000116641 DOCK7 643842 sc-eQTL 2.65e-01 -0.14 0.125 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000125703 ATG4C 548096 sc-eQTL 1.41e-01 -0.206 0.14 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -261493 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00528 0.146 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000162607 USP1 895931 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0753 0.151 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -191144 sc-eQTL 7.61e-01 0.0439 0.144 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 -261183 sc-eQTL 1.59e-01 0.158 0.112 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 -35347 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0676 0.143 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000116641 DOCK7 643842 sc-eQTL 7.65e-01 0.0371 0.124 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000125703 ATG4C 548096 sc-eQTL 1.28e-01 -0.192 0.125 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -261493 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0952 0.143 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000162607 USP1 895931 sc-eQTL 4.13e-01 0.114 0.139 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -191144 sc-eQTL 5.04e-02 0.302 0.154 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 -261183 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0329 0.156 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 -35347 sc-eQTL 2.50e-01 -0.186 0.161 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000116641 DOCK7 643842 sc-eQTL 9.95e-01 -0.00072 0.124 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000125703 ATG4C 548096 sc-eQTL 2.78e-01 0.156 0.143 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -261493 sc-eQTL 6.12e-01 0.0766 0.151 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000162607 USP1 895931 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0766 0.158 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -191144 sc-eQTL 9.18e-01 -0.0148 0.144 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 -261183 sc-eQTL 2.52e-02 0.275 0.122 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 -35347 sc-eQTL 1.58e-01 -0.197 0.139 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000116641 DOCK7 643842 sc-eQTL 4.35e-01 -0.101 0.129 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000125703 ATG4C 548096 sc-eQTL 8.06e-01 0.0324 0.132 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -261493 sc-eQTL 8.67e-02 -0.234 0.136 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000162607 USP1 895931 sc-eQTL 3.85e-01 0.125 0.144 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -191144 sc-eQTL 4.90e-01 0.101 0.146 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 -261183 sc-eQTL 4.44e-01 0.136 0.177 0.089 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 -35347 sc-eQTL 4.58e-01 -0.139 0.186 0.089 PB L2
ENSG00000116641 DOCK7 643842 sc-eQTL 8.96e-01 0.0261 0.2 0.089 PB L2
ENSG00000125703 ATG4C 548096 sc-eQTL 4.73e-01 -0.125 0.174 0.089 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -261493 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0982 0.173 0.089 PB L2
ENSG00000162607 USP1 895931 sc-eQTL 7.91e-02 -0.302 0.171 0.089 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -191144 sc-eQTL 5.94e-01 -0.102 0.191 0.089 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 -261183 sc-eQTL 9.85e-01 0.00249 0.135 0.1 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 -35347 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0824 0.137 0.1 Pro_T L2
ENSG00000116641 DOCK7 643842 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0265 0.137 0.1 Pro_T L2
ENSG00000125703 ATG4C 548096 sc-eQTL 3.95e-01 -0.102 0.12 0.1 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -261493 sc-eQTL 4.55e-01 0.0902 0.121 0.1 Pro_T L2
ENSG00000162607 USP1 895931 sc-eQTL 2.63e-01 0.0928 0.0827 0.1 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -191144 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0758 0.14 0.1 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 -261183 sc-eQTL 6.90e-02 0.252 0.138 0.1 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 -35347 sc-eQTL 3.33e-01 -0.144 0.148 0.1 Treg L2
ENSG00000116641 DOCK7 643842 sc-eQTL 2.02e-01 0.174 0.136 0.1 Treg L2
ENSG00000125703 ATG4C 548096 sc-eQTL 6.26e-01 -0.068 0.139 0.1 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -261493 sc-eQTL 7.55e-01 0.0455 0.146 0.1 Treg L2
ENSG00000162607 USP1 895931 sc-eQTL 5.79e-03 0.386 0.138 0.1 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -191144 sc-eQTL 3.97e-01 0.118 0.139 0.1 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 -261183 sc-eQTL 8.76e-01 0.0217 0.139 0.102 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -35347 sc-eQTL 5.62e-01 0.0819 0.141 0.102 cDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 643842 sc-eQTL 9.31e-01 -0.0121 0.138 0.102 cDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 548096 sc-eQTL 4.07e-01 -0.0997 0.12 0.102 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -261493 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0466 0.152 0.102 cDC L2
ENSG00000162607 USP1 895931 sc-eQTL 3.37e-01 -0.13 0.135 0.102 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -191144 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00331 0.122 0.102 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 -261183 sc-eQTL 4.04e-01 0.109 0.13 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 -35347 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0616 0.13 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000116641 DOCK7 643842 sc-eQTL 4.62e-01 -0.101 0.137 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000125703 ATG4C 548096 sc-eQTL 9.53e-01 0.00568 0.0965 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -261493 sc-eQTL 1.36e-01 -0.204 0.136 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000162607 USP1 895931 sc-eQTL 9.26e-01 0.0112 0.121 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 -261183 sc-eQTL 4.70e-02 0.287 0.144 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 -35347 sc-eQTL 9.85e-01 0.00271 0.147 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000116641 DOCK7 643842 sc-eQTL 2.89e-01 -0.145 0.136 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000125703 ATG4C 548096 sc-eQTL 5.54e-01 -0.07 0.118 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -261493 sc-eQTL 3.72e-01 -0.119 0.133 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000162607 USP1 895931 sc-eQTL 3.78e-01 -0.121 0.137 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 -261183 sc-eQTL 6.81e-01 0.0624 0.151 0.106 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 -35347 sc-eQTL 9.09e-01 0.0185 0.162 0.106 gdT L2
ENSG00000116641 DOCK7 643842 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0515 0.158 0.106 gdT L2
ENSG00000125703 ATG4C 548096 sc-eQTL 1.06e-01 0.244 0.15 0.106 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -261493 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00654 0.161 0.106 gdT L2
ENSG00000162607 USP1 895931 sc-eQTL 1.87e-02 0.355 0.149 0.106 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -191144 sc-eQTL 8.63e-01 0.0273 0.158 0.106 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 -261183 sc-eQTL 1.70e-01 0.2 0.145 0.1 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -35347 sc-eQTL 5.55e-01 0.0801 0.135 0.1 intMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 643842 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0651 0.138 0.1 intMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 548096 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0225 0.132 0.1 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -261493 sc-eQTL 8.26e-01 0.032 0.146 0.1 intMono L2
ENSG00000162607 USP1 895931 sc-eQTL 4.34e-01 0.116 0.148 0.1 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -261183 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0362 0.132 0.102 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -35347 sc-eQTL 9.32e-01 -0.0124 0.145 0.102 ncMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 643842 sc-eQTL 3.51e-01 0.133 0.142 0.102 ncMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 548096 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00754 0.133 0.102 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -261493 sc-eQTL 5.93e-01 0.0744 0.139 0.102 ncMono L2
ENSG00000162607 USP1 895931 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0507 0.142 0.102 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -261183 sc-eQTL 7.30e-01 0.0527 0.152 0.105 pDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -35347 sc-eQTL 2.28e-01 -0.179 0.148 0.105 pDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 643842 sc-eQTL 3.53e-02 0.317 0.149 0.105 pDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 548096 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0639 0.136 0.105 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -261493 sc-eQTL 3.01e-01 0.158 0.152 0.105 pDC L2
ENSG00000162607 USP1 895931 sc-eQTL 4.54e-01 0.117 0.155 0.105 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -191144 sc-eQTL 7.80e-02 -0.237 0.134 0.105 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -261183 sc-eQTL 4.74e-01 0.0969 0.135 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -35347 sc-eQTL 8.45e-01 0.0293 0.15 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 643842 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0737 0.13 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 548096 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0697 0.105 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -261493 sc-eQTL 9.41e-01 0.0101 0.138 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 895931 sc-eQTL 1.15e-01 0.211 0.133 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -191144 sc-eQTL 1.14e-01 -0.227 0.143 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -261183 sc-eQTL 9.85e-01 0.00277 0.143 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -35347 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0168 0.148 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 643842 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0567 0.138 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 548096 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0497 0.105 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -261493 sc-eQTL 6.13e-02 -0.278 0.147 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 895931 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00645 0.128 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -191144 sc-eQTL 4.47e-01 0.114 0.149 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -261183 sc-eQTL 1.69e-01 0.185 0.134 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -35347 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0713 0.13 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 643842 sc-eQTL 2.59e-01 -0.148 0.131 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 548096 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0267 0.0906 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -261493 sc-eQTL 1.22e-01 -0.207 0.133 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 895931 sc-eQTL 6.50e-01 -0.052 0.114 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -261183 sc-eQTL 6.44e-01 0.0595 0.128 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -35347 sc-eQTL 5.59e-01 0.0852 0.146 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 643842 sc-eQTL 7.68e-01 0.0425 0.144 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 548096 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0523 0.123 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -261493 sc-eQTL 6.04e-01 0.0742 0.143 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 895931 sc-eQTL 8.64e-01 0.023 0.134 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -261183 sc-eQTL 4.94e-02 0.214 0.108 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -35347 sc-eQTL 9.53e-02 -0.219 0.131 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 643842 sc-eQTL 7.96e-01 0.0305 0.118 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 548096 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0302 0.118 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -261493 sc-eQTL 1.26e-01 -0.213 0.139 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 895931 sc-eQTL 4.32e-01 0.0993 0.126 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -191144 sc-eQTL 1.04e-01 0.249 0.153 0.099 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000088035 ALG6 -35347 eQTL 0.0188 0.0538 0.0229 0.0 0.0 0.0868
ENSG00000132855 ANGPTL3 734741 pQTL 0.0422 -0.101 0.0498 0.0 0.0 0.091
ENSG00000185483 ROR1 -441789 pQTL 0.0371 0.0478 0.0229 0.0 0.0 0.091

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000116652 \N -214854 1.35e-06 1.42e-06 2.4e-07 1.23e-06 4.41e-07 6.68e-07 1.43e-06 4.01e-07 1.72e-06 7.04e-07 2.07e-06 1.15e-06 2.61e-06 3.43e-07 4.14e-07 9.91e-07 9.71e-07 1.08e-06 5.81e-07 5.49e-07 7e-07 1.91e-06 1.25e-06 6.86e-07 2.34e-06 8.9e-07 1.06e-06 8.75e-07 1.63e-06 1.24e-06 8.3e-07 2.81e-07 2.82e-07 5.72e-07 6.46e-07 5.99e-07 7.14e-07 3.07e-07 5.05e-07 2.11e-07 3.03e-07 2.13e-06 3.51e-07 1.14e-07 3.75e-07 2.88e-07 3.01e-07 1.57e-07 2.79e-07