logo

Genes within 1Mb (chr1:63325322:A:AT):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -268089 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0755 0.102 0.15 B L1
ENSG00000088035 ALG6 -42253 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0294 0.106 0.15 B L1
ENSG00000116641 DOCK7 636936 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0317 0.106 0.15 B L1
ENSG00000125703 ATG4C 541190 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0489 0.0737 0.15 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -268399 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0219 0.117 0.15 B L1
ENSG00000162607 USP1 889025 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00688 0.102 0.15 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -198050 sc-eQTL 6.20e-01 0.0597 0.12 0.15 B L1
ENSG00000079739 PGM1 -268089 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0555 0.0858 0.15 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 -42253 sc-eQTL 9.08e-01 -0.011 0.0948 0.15 CD4T L1
ENSG00000116641 DOCK7 636936 sc-eQTL 9.27e-01 0.00881 0.0959 0.15 CD4T L1
ENSG00000125703 ATG4C 541190 sc-eQTL 1.72e-01 -0.106 0.0771 0.15 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -268399 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0251 0.11 0.15 CD4T L1
ENSG00000162607 USP1 889025 sc-eQTL 8.19e-01 0.0172 0.0751 0.15 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -198050 sc-eQTL 5.03e-01 0.0662 0.0986 0.15 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 -268089 sc-eQTL 3.82e-02 0.197 0.0945 0.15 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 -42253 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0737 0.105 0.15 CD8T L1
ENSG00000116641 DOCK7 636936 sc-eQTL 7.68e-01 0.0314 0.107 0.15 CD8T L1
ENSG00000125703 ATG4C 541190 sc-eQTL 1.82e-01 -0.135 0.101 0.15 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -268399 sc-eQTL 7.56e-01 0.0352 0.113 0.15 CD8T L1
ENSG00000162607 USP1 889025 sc-eQTL 4.49e-01 0.0669 0.0881 0.15 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -198050 sc-eQTL 6.49e-01 0.0514 0.113 0.15 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 -268089 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0454 0.107 0.153 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 -42253 sc-eQTL 1.51e-01 -0.159 0.11 0.153 DC L1
ENSG00000116641 DOCK7 636936 sc-eQTL 8.59e-02 0.194 0.113 0.153 DC L1
ENSG00000125703 ATG4C 541190 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0563 0.0886 0.153 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -268399 sc-eQTL 8.32e-01 0.0264 0.124 0.153 DC L1
ENSG00000162607 USP1 889025 sc-eQTL 7.84e-01 0.0297 0.108 0.153 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -198050 sc-eQTL 1.66e-01 -0.149 0.107 0.153 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 -268089 sc-eQTL 6.60e-01 0.0451 0.102 0.15 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 -42253 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0508 0.107 0.15 Mono L1
ENSG00000116641 DOCK7 636936 sc-eQTL 2.85e-01 0.111 0.103 0.15 Mono L1
ENSG00000125703 ATG4C 541190 sc-eQTL 5.15e-01 0.0456 0.0699 0.15 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -268399 sc-eQTL 4.00e-01 0.0931 0.11 0.15 Mono L1
ENSG00000162607 USP1 889025 sc-eQTL 5.51e-01 0.0541 0.0907 0.15 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 -268089 sc-eQTL 2.06e-02 0.207 0.0885 0.15 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 -42253 sc-eQTL 8.70e-01 0.0173 0.105 0.15 NK L1
ENSG00000116641 DOCK7 636936 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0456 0.0865 0.15 NK L1
ENSG00000125703 ATG4C 541190 sc-eQTL 2.72e-01 -0.102 0.0927 0.15 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -268399 sc-eQTL 3.45e-01 -0.109 0.115 0.15 NK L1
ENSG00000162607 USP1 889025 sc-eQTL 7.59e-01 0.0318 0.103 0.15 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -198050 sc-eQTL 5.32e-01 0.0785 0.125 0.15 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 -268089 sc-eQTL 2.32e-01 -0.12 0.0999 0.15 Other_T L1
ENSG00000088035 ALG6 -42253 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0411 0.101 0.15 Other_T L1
ENSG00000116641 DOCK7 636936 sc-eQTL 5.71e-01 0.0583 0.103 0.15 Other_T L1
ENSG00000125703 ATG4C 541190 sc-eQTL 4.54e-01 0.0666 0.0889 0.15 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -268399 sc-eQTL 3.33e-01 -0.0764 0.0787 0.15 Other_T L1
ENSG00000162607 USP1 889025 sc-eQTL 5.13e-01 0.0448 0.0683 0.15 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -198050 sc-eQTL 5.90e-01 0.0657 0.122 0.15 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -268089 sc-eQTL 5.34e-01 0.087 0.14 0.148 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 -42253 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0181 0.134 0.148 B_Activated L2
ENSG00000116641 DOCK7 636936 sc-eQTL 1.91e-01 0.163 0.124 0.148 B_Activated L2
ENSG00000125703 ATG4C 541190 sc-eQTL 8.38e-01 0.0268 0.131 0.148 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -268399 sc-eQTL 5.66e-02 0.243 0.127 0.148 B_Activated L2
ENSG00000162607 USP1 889025 sc-eQTL 4.79e-01 0.0985 0.139 0.148 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -198050 sc-eQTL 6.98e-03 0.324 0.119 0.148 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 -268089 sc-eQTL 2.28e-01 -0.144 0.119 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 -42253 sc-eQTL 1.80e-01 0.163 0.121 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000116641 DOCK7 636936 sc-eQTL 1.58e-01 -0.164 0.115 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000125703 ATG4C 541190 sc-eQTL 5.83e-01 0.0539 0.0982 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -268399 sc-eQTL 9.48e-02 0.195 0.116 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000162607 USP1 889025 sc-eQTL 3.03e-01 0.12 0.117 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -198050 sc-eQTL 4.80e-01 -0.082 0.116 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 -268089 sc-eQTL 1.27e-01 0.183 0.119 0.151 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 -42253 sc-eQTL 9.55e-01 0.00688 0.122 0.151 B_Memory L2
ENSG00000116641 DOCK7 636936 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0595 0.114 0.151 B_Memory L2
ENSG00000125703 ATG4C 541190 sc-eQTL 6.46e-01 0.0501 0.109 0.151 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -268399 sc-eQTL 1.97e-01 0.161 0.124 0.151 B_Memory L2
ENSG00000162607 USP1 889025 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0312 0.126 0.151 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -198050 sc-eQTL 5.47e-02 0.237 0.123 0.151 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 -268089 sc-eQTL 9.30e-02 -0.201 0.119 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 -42253 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0225 0.12 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000116641 DOCK7 636936 sc-eQTL 4.70e-01 0.0833 0.115 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000125703 ATG4C 541190 sc-eQTL 7.76e-01 0.0252 0.0887 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -268399 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0983 0.118 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000162607 USP1 889025 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0278 0.103 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -198050 sc-eQTL 5.27e-01 0.0795 0.125 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 -268089 sc-eQTL 3.66e-01 -0.107 0.118 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 -42253 sc-eQTL 3.98e-01 -0.105 0.124 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000116641 DOCK7 636936 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0135 0.119 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000125703 ATG4C 541190 sc-eQTL 1.74e-01 -0.156 0.114 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -268399 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0955 0.124 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000162607 USP1 889025 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0282 0.118 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -198050 sc-eQTL 9.77e-02 -0.204 0.123 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 -268089 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0878 0.124 0.148 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -42253 sc-eQTL 1.13e-01 0.207 0.13 0.148 CD4_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 636936 sc-eQTL 6.59e-02 -0.21 0.113 0.148 CD4_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 541190 sc-eQTL 1.20e-01 0.183 0.118 0.148 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -268399 sc-eQTL 6.04e-01 0.0656 0.126 0.148 CD4_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 889025 sc-eQTL 9.21e-01 -0.012 0.12 0.148 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -198050 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0299 0.12 0.148 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -268089 sc-eQTL 2.11e-01 -0.122 0.0974 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -42253 sc-eQTL 8.69e-01 0.0175 0.106 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 636936 sc-eQTL 4.23e-01 0.0837 0.104 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 541190 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00557 0.0922 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -268399 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00497 0.113 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 889025 sc-eQTL 6.28e-01 0.0418 0.0861 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -198050 sc-eQTL 1.62e-01 0.156 0.111 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -268089 sc-eQTL 2.10e-01 0.126 0.1 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -42253 sc-eQTL 4.95e-01 0.0798 0.117 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 636936 sc-eQTL 3.45e-01 0.0979 0.103 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 541190 sc-eQTL 3.05e-02 -0.217 0.0998 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -268399 sc-eQTL 3.92e-01 -0.102 0.119 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 889025 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0265 0.0975 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -198050 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0206 0.115 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -268089 sc-eQTL 5.72e-01 0.0673 0.119 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -42253 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00942 0.12 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 636936 sc-eQTL 7.25e-01 -0.041 0.117 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 541190 sc-eQTL 7.66e-01 0.0337 0.113 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -268399 sc-eQTL 9.91e-01 0.00128 0.117 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 889025 sc-eQTL 6.45e-01 0.0511 0.111 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -198050 sc-eQTL 7.33e-01 0.0413 0.121 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -268089 sc-eQTL 3.06e-02 0.232 0.106 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -42253 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00582 0.114 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 636936 sc-eQTL 3.74e-01 0.0966 0.108 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 541190 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0401 0.116 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -268399 sc-eQTL 7.90e-01 0.032 0.12 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 889025 sc-eQTL 9.63e-01 0.005 0.108 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -198050 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0183 0.123 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -268089 sc-eQTL 6.05e-01 0.0563 0.108 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -42253 sc-eQTL 8.67e-02 -0.192 0.112 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 636936 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0286 0.116 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 541190 sc-eQTL 3.55e-01 -0.103 0.111 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -268399 sc-eQTL 4.19e-01 0.0913 0.113 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 889025 sc-eQTL 7.05e-01 0.0362 0.0954 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -198050 sc-eQTL 8.54e-01 0.0196 0.106 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -268089 sc-eQTL 8.38e-01 0.0253 0.123 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -42253 sc-eQTL 3.46e-01 0.118 0.125 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 636936 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0695 0.122 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 541190 sc-eQTL 1.13e-01 -0.197 0.124 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -268399 sc-eQTL 8.16e-01 0.0282 0.121 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 889025 sc-eQTL 1.71e-02 0.276 0.115 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -198050 sc-eQTL 6.35e-01 0.0587 0.123 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -268089 sc-eQTL 1.60e-01 0.17 0.12 0.148 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -42253 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0857 0.121 0.148 CD8_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 636936 sc-eQTL 5.82e-01 0.0649 0.118 0.148 CD8_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 541190 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0449 0.113 0.148 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -268399 sc-eQTL 7.60e-01 0.0374 0.123 0.148 CD8_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 889025 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0248 0.117 0.148 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -198050 sc-eQTL 9.62e-01 0.00573 0.119 0.148 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -268089 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0211 0.117 0.149 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 -42253 sc-eQTL 2.68e-01 0.128 0.115 0.149 MAIT L2
ENSG00000116641 DOCK7 636936 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0314 0.111 0.149 MAIT L2
ENSG00000125703 ATG4C 541190 sc-eQTL 9.04e-01 0.0141 0.117 0.149 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -268399 sc-eQTL 7.45e-02 -0.208 0.116 0.149 MAIT L2
ENSG00000162607 USP1 889025 sc-eQTL 7.85e-02 -0.204 0.115 0.149 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -198050 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0336 0.12 0.149 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 -268089 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0198 0.118 0.144 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 -42253 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0425 0.121 0.144 NK_CD56bright L2
ENSG00000116641 DOCK7 636936 sc-eQTL 4.13e-01 -0.0858 0.105 0.144 NK_CD56bright L2
ENSG00000125703 ATG4C 541190 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0208 0.117 0.144 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -268399 sc-eQTL 9.48e-01 0.00796 0.122 0.144 NK_CD56bright L2
ENSG00000162607 USP1 889025 sc-eQTL 3.91e-01 -0.108 0.126 0.144 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -198050 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0209 0.12 0.144 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 -268089 sc-eQTL 3.58e-02 0.194 0.0916 0.147 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 -42253 sc-eQTL 7.81e-02 0.206 0.117 0.147 NK_CD56dim L2
ENSG00000116641 DOCK7 636936 sc-eQTL 7.54e-01 0.0321 0.102 0.147 NK_CD56dim L2
ENSG00000125703 ATG4C 541190 sc-eQTL 1.18e-01 -0.162 0.103 0.147 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -268399 sc-eQTL 2.07e-01 -0.149 0.118 0.147 NK_CD56dim L2
ENSG00000162607 USP1 889025 sc-eQTL 3.09e-01 0.117 0.114 0.147 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -198050 sc-eQTL 9.72e-01 0.00455 0.128 0.147 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 -268089 sc-eQTL 9.78e-01 0.00349 0.128 0.153 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 -42253 sc-eQTL 2.05e-01 -0.168 0.132 0.153 NK_HLA L2
ENSG00000116641 DOCK7 636936 sc-eQTL 8.33e-01 0.0214 0.102 0.153 NK_HLA L2
ENSG00000125703 ATG4C 541190 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0271 0.118 0.153 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -268399 sc-eQTL 7.30e-01 0.043 0.124 0.153 NK_HLA L2
ENSG00000162607 USP1 889025 sc-eQTL 5.96e-01 0.069 0.13 0.153 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -198050 sc-eQTL 6.77e-01 0.0493 0.118 0.153 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 -268089 sc-eQTL 4.08e-01 0.0841 0.101 0.147 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 -42253 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00868 0.115 0.147 NK_cytokine L2
ENSG00000116641 DOCK7 636936 sc-eQTL 9.17e-01 -0.0111 0.106 0.147 NK_cytokine L2
ENSG00000125703 ATG4C 541190 sc-eQTL 9.30e-01 -0.00957 0.109 0.147 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -268399 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0212 0.113 0.147 NK_cytokine L2
ENSG00000162607 USP1 889025 sc-eQTL 2.37e-01 -0.14 0.118 0.147 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -198050 sc-eQTL 2.96e-01 0.126 0.12 0.147 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 -268089 sc-eQTL 4.40e-01 0.118 0.152 0.141 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 -42253 sc-eQTL 4.38e-01 -0.125 0.16 0.141 PB L2
ENSG00000116641 DOCK7 636936 sc-eQTL 3.92e-01 -0.147 0.171 0.141 PB L2
ENSG00000125703 ATG4C 541190 sc-eQTL 9.91e-01 0.00161 0.15 0.141 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -268399 sc-eQTL 9.20e-01 0.015 0.149 0.141 PB L2
ENSG00000162607 USP1 889025 sc-eQTL 1.20e-01 -0.23 0.147 0.141 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -198050 sc-eQTL 7.11e-01 0.0609 0.164 0.141 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 -268089 sc-eQTL 6.22e-01 0.0529 0.107 0.15 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 -42253 sc-eQTL 1.86e-01 -0.144 0.108 0.15 Pro_T L2
ENSG00000116641 DOCK7 636936 sc-eQTL 3.12e-01 0.11 0.109 0.15 Pro_T L2
ENSG00000125703 ATG4C 541190 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0313 0.0957 0.15 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -268399 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0332 0.096 0.15 Pro_T L2
ENSG00000162607 USP1 889025 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0135 0.066 0.15 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -198050 sc-eQTL 7.93e-01 0.0292 0.111 0.15 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 -268089 sc-eQTL 1.30e-01 0.174 0.114 0.15 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 -42253 sc-eQTL 9.69e-02 -0.204 0.122 0.15 Treg L2
ENSG00000116641 DOCK7 636936 sc-eQTL 5.88e-01 0.0612 0.113 0.15 Treg L2
ENSG00000125703 ATG4C 541190 sc-eQTL 2.96e-01 -0.121 0.115 0.15 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -268399 sc-eQTL 3.11e-01 0.122 0.12 0.15 Treg L2
ENSG00000162607 USP1 889025 sc-eQTL 1.31e-01 0.176 0.116 0.15 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -198050 sc-eQTL 4.70e-01 0.0834 0.115 0.15 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 -268089 sc-eQTL 1.97e-01 -0.151 0.117 0.149 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -42253 sc-eQTL 9.13e-02 -0.2 0.118 0.149 cDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 636936 sc-eQTL 7.56e-02 0.206 0.116 0.149 cDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 541190 sc-eQTL 2.27e-01 -0.122 0.101 0.149 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -268399 sc-eQTL 4.22e-01 -0.103 0.128 0.149 cDC L2
ENSG00000162607 USP1 889025 sc-eQTL 8.78e-01 0.0176 0.114 0.149 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -198050 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0771 0.103 0.149 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 -268089 sc-eQTL 5.41e-01 0.0649 0.106 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 -42253 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0656 0.106 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000116641 DOCK7 636936 sc-eQTL 6.69e-01 0.0479 0.112 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000125703 ATG4C 541190 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0333 0.0787 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -268399 sc-eQTL 9.48e-01 0.00722 0.111 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000162607 USP1 889025 sc-eQTL 2.78e-01 0.107 0.0981 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 -268089 sc-eQTL 4.02e-01 0.0989 0.118 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 -42253 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0165 0.12 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000116641 DOCK7 636936 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0179 0.111 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000125703 ATG4C 541190 sc-eQTL 3.14e-01 0.0967 0.0958 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -268399 sc-eQTL 5.60e-02 0.206 0.107 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000162607 USP1 889025 sc-eQTL 9.78e-01 0.00306 0.112 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 -268089 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0855 0.131 0.145 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 -42253 sc-eQTL 2.06e-02 -0.322 0.138 0.145 gdT L2
ENSG00000116641 DOCK7 636936 sc-eQTL 1.14e-01 0.217 0.136 0.145 gdT L2
ENSG00000125703 ATG4C 541190 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0797 0.131 0.145 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -268399 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0958 0.139 0.145 gdT L2
ENSG00000162607 USP1 889025 sc-eQTL 1.76e-01 0.178 0.131 0.145 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -198050 sc-eQTL 2.99e-01 0.142 0.137 0.145 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 -268089 sc-eQTL 3.55e-01 -0.11 0.118 0.151 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -42253 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0256 0.111 0.151 intMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 636936 sc-eQTL 4.62e-01 0.0831 0.113 0.151 intMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 541190 sc-eQTL 8.46e-01 0.0209 0.108 0.151 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -268399 sc-eQTL 6.36e-01 0.0563 0.119 0.151 intMono L2
ENSG00000162607 USP1 889025 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0304 0.121 0.151 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -268089 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0339 0.109 0.152 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -42253 sc-eQTL 8.87e-01 -0.017 0.12 0.152 ncMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 636936 sc-eQTL 2.98e-01 -0.123 0.118 0.152 ncMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 541190 sc-eQTL 4.47e-02 0.22 0.109 0.152 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -268399 sc-eQTL 2.18e-01 0.142 0.115 0.152 ncMono L2
ENSG00000162607 USP1 889025 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0889 0.118 0.152 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -268089 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0218 0.132 0.153 pDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -42253 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0512 0.128 0.153 pDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 636936 sc-eQTL 6.03e-01 0.0683 0.131 0.153 pDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 541190 sc-eQTL 8.79e-01 -0.018 0.117 0.153 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -268399 sc-eQTL 9.46e-01 0.00893 0.132 0.153 pDC L2
ENSG00000162607 USP1 889025 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0263 0.134 0.153 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -198050 sc-eQTL 1.26e-01 -0.178 0.116 0.153 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -268089 sc-eQTL 7.41e-01 0.0376 0.113 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -42253 sc-eQTL 2.71e-01 0.138 0.125 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 636936 sc-eQTL 3.27e-01 -0.107 0.109 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 541190 sc-eQTL 5.12e-01 0.0578 0.0879 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -268399 sc-eQTL 4.02e-02 0.236 0.115 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 889025 sc-eQTL 7.85e-01 0.0306 0.112 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -198050 sc-eQTL 1.46e-01 0.175 0.12 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -268089 sc-eQTL 7.46e-02 -0.209 0.117 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -42253 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0767 0.121 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 636936 sc-eQTL 5.14e-01 0.0739 0.113 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 541190 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0559 0.0863 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -268399 sc-eQTL 1.98e-01 -0.157 0.122 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 889025 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0458 0.105 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -198050 sc-eQTL 7.14e-01 -0.045 0.123 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -268089 sc-eQTL 5.22e-01 0.0697 0.109 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -42253 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0653 0.105 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 636936 sc-eQTL 6.00e-01 0.0557 0.106 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 541190 sc-eQTL 6.80e-01 0.0303 0.0733 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -268399 sc-eQTL 2.82e-01 0.117 0.108 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 889025 sc-eQTL 4.35e-01 0.0724 0.0926 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -268089 sc-eQTL 2.62e-01 -0.117 0.104 0.149 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -42253 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0707 0.119 0.149 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 636936 sc-eQTL 9.80e-01 0.00299 0.118 0.149 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 541190 sc-eQTL 3.22e-01 0.0995 0.1 0.149 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -268399 sc-eQTL 3.05e-01 0.12 0.116 0.149 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 889025 sc-eQTL 3.96e-01 -0.093 0.109 0.149 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -268089 sc-eQTL 3.22e-02 0.194 0.0902 0.147 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -42253 sc-eQTL 6.01e-01 0.0574 0.109 0.147 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 636936 sc-eQTL 8.45e-01 0.0192 0.0981 0.147 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 541190 sc-eQTL 2.79e-01 -0.106 0.0976 0.147 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -268399 sc-eQTL 4.53e-01 -0.087 0.116 0.147 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 889025 sc-eQTL 7.70e-01 0.0308 0.105 0.147 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -198050 sc-eQTL 4.21e-01 0.103 0.128 0.147 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000116652 \N -221760 4.33e-06 3.99e-06 6.27e-07 1.97e-06 6.67e-07 8.22e-07 3.02e-06 6.39e-07 1.89e-06 1.47e-06 3.01e-06 1.27e-06 5e-06 6.9e-07 1e-06 1.98e-06 1.59e-06 2.24e-06 1.32e-06 1.18e-06 1.43e-06 4.47e-06 3.42e-06 1.86e-06 4.02e-06 1.22e-06 2.21e-06 1.69e-06 3.41e-06 2.55e-06 1.08e-06 2.81e-07 5.88e-07 1.75e-06 1.35e-06 8.71e-07 6.87e-07 3.46e-07 6.97e-07 3.8e-07 3.03e-07 4.09e-06 5.43e-07 1.59e-07 3.35e-07 8.35e-07 8.39e-07 4.82e-08 1.08e-07
ENSG00000162607 \N 889025 7.57e-07 1.92e-07 1.59e-07 3.48e-07 1.11e-07 1.26e-07 5.9e-07 7.12e-08 1.98e-07 1.28e-07 3.97e-07 1.19e-07 4.27e-07 8.54e-08 6.27e-08 9.35e-08 2.11e-07 2.93e-07 9.71e-08 7.29e-08 1.35e-07 4.31e-07 3.7e-07 1.21e-07 4.54e-07 1.39e-07 2.52e-07 1.26e-07 1.76e-07 3.71e-07 1.26e-07 7.4e-08 4.28e-08 1.54e-07 1.22e-07 5.05e-08 5.31e-08 8.76e-08 6.62e-08 1.56e-08 4.88e-08 1.62e-07 4.12e-08 1.04e-08 5.84e-08 1.25e-07 1.29e-07 2.13e-09 4.81e-08