logo

Genes within 1Mb (chr1:63322686:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -270725 sc-eQTL 3.61e-01 -0.111 0.121 0.111 B L1
ENSG00000088035 ALG6 -44889 sc-eQTL 3.47e-03 -0.365 0.124 0.111 B L1
ENSG00000116641 DOCK7 634300 sc-eQTL 3.55e-01 -0.117 0.126 0.111 B L1
ENSG00000125703 ATG4C 538554 sc-eQTL 1.23e-01 0.135 0.0871 0.111 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -271035 sc-eQTL 4.11e-01 -0.115 0.139 0.111 B L1
ENSG00000162607 USP1 886389 sc-eQTL 1.13e-01 -0.191 0.12 0.111 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -200686 sc-eQTL 5.30e-01 0.0898 0.143 0.111 B L1
ENSG00000079739 PGM1 -270725 sc-eQTL 1.11e-01 -0.167 0.104 0.111 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 -44889 sc-eQTL 9.27e-01 0.0106 0.116 0.111 CD4T L1
ENSG00000116641 DOCK7 634300 sc-eQTL 3.50e-01 0.11 0.117 0.111 CD4T L1
ENSG00000125703 ATG4C 538554 sc-eQTL 4.47e-01 0.072 0.0946 0.111 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -271035 sc-eQTL 8.22e-01 0.0302 0.134 0.111 CD4T L1
ENSG00000162607 USP1 886389 sc-eQTL 6.03e-01 0.0478 0.0918 0.111 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -200686 sc-eQTL 3.63e-01 -0.11 0.12 0.111 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 -270725 sc-eQTL 1.02e-01 -0.189 0.115 0.111 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 -44889 sc-eQTL 8.66e-02 0.219 0.127 0.111 CD8T L1
ENSG00000116641 DOCK7 634300 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00605 0.13 0.111 CD8T L1
ENSG00000125703 ATG4C 538554 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0535 0.123 0.111 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -271035 sc-eQTL 2.15e-02 0.315 0.136 0.111 CD8T L1
ENSG00000162607 USP1 886389 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0174 0.107 0.111 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -200686 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0275 0.137 0.111 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 -270725 sc-eQTL 7.50e-01 0.0412 0.129 0.108 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 -44889 sc-eQTL 2.49e-01 0.154 0.133 0.108 DC L1
ENSG00000116641 DOCK7 634300 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0163 0.136 0.108 DC L1
ENSG00000125703 ATG4C 538554 sc-eQTL 2.36e-01 0.126 0.106 0.108 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -271035 sc-eQTL 7.89e-01 0.0401 0.149 0.108 DC L1
ENSG00000162607 USP1 886389 sc-eQTL 9.79e-01 0.00348 0.13 0.108 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -200686 sc-eQTL 3.46e-01 0.122 0.13 0.108 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 -270725 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0567 0.127 0.111 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 -44889 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0314 0.132 0.111 Mono L1
ENSG00000116641 DOCK7 634300 sc-eQTL 9.63e-01 0.00598 0.128 0.111 Mono L1
ENSG00000125703 ATG4C 538554 sc-eQTL 9.72e-01 0.00302 0.0863 0.111 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -271035 sc-eQTL 3.05e-01 0.14 0.136 0.111 Mono L1
ENSG00000162607 USP1 886389 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0459 0.112 0.111 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 -270725 sc-eQTL 9.58e-01 0.00566 0.108 0.112 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 -44889 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0616 0.126 0.112 NK L1
ENSG00000116641 DOCK7 634300 sc-eQTL 8.36e-01 0.0215 0.104 0.112 NK L1
ENSG00000125703 ATG4C 538554 sc-eQTL 1.25e-01 -0.171 0.111 0.112 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -271035 sc-eQTL 4.11e-01 0.114 0.138 0.112 NK L1
ENSG00000162607 USP1 886389 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0842 0.124 0.112 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -200686 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00302 0.151 0.112 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 -270725 sc-eQTL 6.90e-01 0.0486 0.122 0.111 Other_T L1
ENSG00000088035 ALG6 -44889 sc-eQTL 1.93e-01 -0.159 0.122 0.111 Other_T L1
ENSG00000116641 DOCK7 634300 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00732 0.125 0.111 Other_T L1
ENSG00000125703 ATG4C 538554 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0865 0.108 0.111 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -271035 sc-eQTL 4.91e-02 0.188 0.0949 0.111 Other_T L1
ENSG00000162607 USP1 886389 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0173 0.083 0.111 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -200686 sc-eQTL 5.78e-02 -0.28 0.147 0.111 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -270725 sc-eQTL 2.82e-01 -0.179 0.166 0.11 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 -44889 sc-eQTL 7.40e-01 0.0531 0.159 0.11 B_Activated L2
ENSG00000116641 DOCK7 634300 sc-eQTL 8.93e-01 0.0199 0.148 0.11 B_Activated L2
ENSG00000125703 ATG4C 538554 sc-eQTL 6.20e-01 0.0775 0.156 0.11 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -271035 sc-eQTL 2.58e-01 0.172 0.152 0.11 B_Activated L2
ENSG00000162607 USP1 886389 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00983 0.165 0.11 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -200686 sc-eQTL 1.77e-01 -0.195 0.144 0.11 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 -270725 sc-eQTL 6.85e-01 0.0595 0.147 0.112 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 -44889 sc-eQTL 3.75e-01 -0.132 0.149 0.112 B_Intermediate L2
ENSG00000116641 DOCK7 634300 sc-eQTL 1.75e-01 -0.193 0.142 0.112 B_Intermediate L2
ENSG00000125703 ATG4C 538554 sc-eQTL 7.04e-01 0.0458 0.121 0.112 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -271035 sc-eQTL 2.68e-01 0.159 0.143 0.112 B_Intermediate L2
ENSG00000162607 USP1 886389 sc-eQTL 3.88e-01 -0.124 0.143 0.112 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -200686 sc-eQTL 4.99e-01 0.0963 0.142 0.112 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 -270725 sc-eQTL 6.64e-01 -0.063 0.145 0.11 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 -44889 sc-eQTL 1.21e-02 -0.368 0.145 0.11 B_Memory L2
ENSG00000116641 DOCK7 634300 sc-eQTL 5.99e-01 0.0727 0.138 0.11 B_Memory L2
ENSG00000125703 ATG4C 538554 sc-eQTL 7.33e-01 0.0449 0.131 0.11 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -271035 sc-eQTL 3.51e-01 -0.14 0.15 0.11 B_Memory L2
ENSG00000162607 USP1 886389 sc-eQTL 1.92e-01 -0.198 0.151 0.11 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -200686 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0181 0.149 0.11 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 -270725 sc-eQTL 4.07e-01 0.118 0.142 0.111 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 -44889 sc-eQTL 6.67e-03 -0.384 0.14 0.111 B_Naive1 L2
ENSG00000116641 DOCK7 634300 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0911 0.136 0.111 B_Naive1 L2
ENSG00000125703 ATG4C 538554 sc-eQTL 7.43e-01 0.0345 0.105 0.111 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -271035 sc-eQTL 2.27e-01 -0.168 0.139 0.111 B_Naive1 L2
ENSG00000162607 USP1 886389 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0967 0.122 0.111 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -200686 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00942 0.149 0.111 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 -270725 sc-eQTL 1.48e-02 -0.341 0.139 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 -44889 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0678 0.147 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000116641 DOCK7 634300 sc-eQTL 5.18e-01 0.0913 0.141 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000125703 ATG4C 538554 sc-eQTL 6.16e-03 0.369 0.133 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -271035 sc-eQTL 6.10e-01 0.0753 0.147 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000162607 USP1 886389 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00373 0.14 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -200686 sc-eQTL 3.92e-02 0.301 0.145 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 -270725 sc-eQTL 3.56e-01 0.135 0.146 0.111 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -44889 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0808 0.154 0.111 CD4_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 634300 sc-eQTL 9.07e-01 0.0158 0.135 0.111 CD4_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 538554 sc-eQTL 1.49e-01 0.202 0.139 0.111 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -271035 sc-eQTL 7.93e-01 0.0392 0.15 0.111 CD4_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 886389 sc-eQTL 2.17e-01 0.176 0.142 0.111 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -200686 sc-eQTL 7.31e-01 0.049 0.142 0.111 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -270725 sc-eQTL 2.46e-01 -0.137 0.117 0.111 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -44889 sc-eQTL 7.29e-01 0.0444 0.128 0.111 CD4_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 634300 sc-eQTL 4.84e-01 0.0882 0.126 0.111 CD4_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 538554 sc-eQTL 5.34e-01 0.0692 0.111 0.111 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -271035 sc-eQTL 9.96e-01 0.000765 0.136 0.111 CD4_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 886389 sc-eQTL 4.71e-01 0.0749 0.104 0.111 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -200686 sc-eQTL 1.19e-01 -0.21 0.134 0.111 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -270725 sc-eQTL 2.71e-01 -0.135 0.122 0.111 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -44889 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0327 0.142 0.111 CD4_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 634300 sc-eQTL 6.28e-01 -0.061 0.126 0.111 CD4_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 538554 sc-eQTL 1.17e-01 0.192 0.122 0.111 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -271035 sc-eQTL 6.62e-01 0.0632 0.144 0.111 CD4_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 886389 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0843 0.118 0.111 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -200686 sc-eQTL 7.87e-02 0.245 0.139 0.111 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -270725 sc-eQTL 1.56e-01 -0.205 0.144 0.111 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -44889 sc-eQTL 8.53e-01 0.027 0.146 0.111 CD4_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 634300 sc-eQTL 3.61e-01 0.13 0.142 0.111 CD4_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 538554 sc-eQTL 8.12e-01 0.0328 0.138 0.111 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -271035 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0884 0.142 0.111 CD4_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 886389 sc-eQTL 6.98e-01 0.0524 0.135 0.111 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -200686 sc-eQTL 3.00e-01 -0.153 0.147 0.111 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -270725 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0243 0.132 0.111 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -44889 sc-eQTL 4.26e-02 0.284 0.139 0.111 CD8_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 634300 sc-eQTL 9.25e-01 0.0126 0.133 0.111 CD8_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 538554 sc-eQTL 4.53e-01 0.107 0.142 0.111 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -271035 sc-eQTL 9.21e-01 0.0147 0.148 0.111 CD8_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 886389 sc-eQTL 6.39e-01 0.0621 0.132 0.111 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -200686 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0458 0.151 0.111 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -270725 sc-eQTL 3.16e-01 -0.135 0.134 0.111 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -44889 sc-eQTL 4.83e-01 0.0975 0.139 0.111 CD8_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 634300 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0712 0.144 0.111 CD8_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 538554 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0693 0.138 0.111 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -271035 sc-eQTL 1.86e-01 0.185 0.139 0.111 CD8_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 886389 sc-eQTL 9.53e-01 0.00696 0.118 0.111 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -200686 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0435 0.132 0.111 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -270725 sc-eQTL 9.23e-01 -0.0148 0.154 0.106 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -44889 sc-eQTL 6.39e-02 0.289 0.155 0.106 CD8_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 634300 sc-eQTL 2.15e-01 0.189 0.152 0.106 CD8_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 538554 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0616 0.156 0.106 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -271035 sc-eQTL 1.20e-01 0.235 0.151 0.106 CD8_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 886389 sc-eQTL 3.06e-01 -0.149 0.145 0.106 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -200686 sc-eQTL 3.94e-01 -0.132 0.154 0.106 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -270725 sc-eQTL 1.97e-01 -0.188 0.145 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -44889 sc-eQTL 7.93e-01 0.0386 0.147 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 634300 sc-eQTL 1.94e-01 0.185 0.142 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 538554 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00713 0.137 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -271035 sc-eQTL 7.23e-01 0.0524 0.148 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 886389 sc-eQTL 5.93e-01 0.0755 0.141 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -200686 sc-eQTL 1.84e-01 -0.19 0.143 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -270725 sc-eQTL 4.57e-01 -0.104 0.14 0.11 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 -44889 sc-eQTL 7.08e-02 -0.249 0.137 0.11 MAIT L2
ENSG00000116641 DOCK7 634300 sc-eQTL 6.23e-01 0.0652 0.133 0.11 MAIT L2
ENSG00000125703 ATG4C 538554 sc-eQTL 8.19e-01 0.032 0.14 0.11 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -271035 sc-eQTL 2.89e-01 0.149 0.14 0.11 MAIT L2
ENSG00000162607 USP1 886389 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0304 0.139 0.11 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -200686 sc-eQTL 1.25e-01 -0.221 0.143 0.11 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 -270725 sc-eQTL 3.49e-01 0.131 0.14 0.113 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 -44889 sc-eQTL 4.39e-01 -0.111 0.143 0.113 NK_CD56bright L2
ENSG00000116641 DOCK7 634300 sc-eQTL 9.00e-01 0.0157 0.125 0.113 NK_CD56bright L2
ENSG00000125703 ATG4C 538554 sc-eQTL 1.50e-01 -0.2 0.138 0.113 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -271035 sc-eQTL 1.24e-02 -0.36 0.143 0.113 NK_CD56bright L2
ENSG00000162607 USP1 886389 sc-eQTL 5.16e-01 0.097 0.149 0.113 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -200686 sc-eQTL 9.65e-01 0.00629 0.143 0.113 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 -270725 sc-eQTL 5.96e-01 0.0601 0.113 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 -44889 sc-eQTL 1.43e-01 -0.21 0.143 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000116641 DOCK7 634300 sc-eQTL 4.04e-01 0.104 0.125 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000125703 ATG4C 538554 sc-eQTL 8.96e-01 0.0166 0.127 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -271035 sc-eQTL 7.78e-02 0.254 0.144 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000162607 USP1 886389 sc-eQTL 1.94e-01 -0.182 0.14 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -200686 sc-eQTL 9.35e-01 -0.0127 0.156 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 -270725 sc-eQTL 4.43e-01 -0.115 0.15 0.114 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 -44889 sc-eQTL 2.38e-01 0.184 0.155 0.114 NK_HLA L2
ENSG00000116641 DOCK7 634300 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0811 0.119 0.114 NK_HLA L2
ENSG00000125703 ATG4C 538554 sc-eQTL 9.63e-01 0.00648 0.138 0.114 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -271035 sc-eQTL 3.33e-01 0.141 0.145 0.114 NK_HLA L2
ENSG00000162607 USP1 886389 sc-eQTL 4.25e-01 -0.121 0.152 0.114 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -200686 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0955 0.138 0.114 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 -270725 sc-eQTL 3.90e-01 -0.106 0.123 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 -44889 sc-eQTL 4.76e-01 0.0995 0.139 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000116641 DOCK7 634300 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0733 0.129 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000125703 ATG4C 538554 sc-eQTL 9.87e-02 -0.218 0.131 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -271035 sc-eQTL 8.79e-01 0.0209 0.137 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000162607 USP1 886389 sc-eQTL 9.43e-01 0.0102 0.144 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -200686 sc-eQTL 4.74e-01 0.105 0.146 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 -270725 sc-eQTL 2.25e-01 -0.214 0.175 0.115 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 -44889 sc-eQTL 5.59e-01 -0.108 0.185 0.115 PB L2
ENSG00000116641 DOCK7 634300 sc-eQTL 2.75e-01 -0.216 0.197 0.115 PB L2
ENSG00000125703 ATG4C 538554 sc-eQTL 1.96e-02 0.399 0.169 0.115 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -271035 sc-eQTL 6.11e-01 0.0877 0.172 0.115 PB L2
ENSG00000162607 USP1 886389 sc-eQTL 8.12e-01 0.0409 0.172 0.115 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -200686 sc-eQTL 3.29e-01 -0.185 0.188 0.115 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 -270725 sc-eQTL 2.12e-01 0.165 0.132 0.111 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 -44889 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0364 0.135 0.111 Pro_T L2
ENSG00000116641 DOCK7 634300 sc-eQTL 3.19e-02 -0.288 0.133 0.111 Pro_T L2
ENSG00000125703 ATG4C 538554 sc-eQTL 9.13e-01 0.013 0.118 0.111 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -271035 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00211 0.119 0.111 Pro_T L2
ENSG00000162607 USP1 886389 sc-eQTL 1.33e-01 0.122 0.0811 0.111 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -200686 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00637 0.138 0.111 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 -270725 sc-eQTL 7.42e-01 0.0456 0.139 0.111 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 -44889 sc-eQTL 8.05e-01 0.0367 0.148 0.111 Treg L2
ENSG00000116641 DOCK7 634300 sc-eQTL 9.15e-01 0.0145 0.136 0.111 Treg L2
ENSG00000125703 ATG4C 538554 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0867 0.139 0.111 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -271035 sc-eQTL 9.86e-01 0.0025 0.146 0.111 Treg L2
ENSG00000162607 USP1 886389 sc-eQTL 4.38e-01 0.109 0.141 0.111 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -200686 sc-eQTL 8.06e-01 0.0342 0.139 0.111 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 -270725 sc-eQTL 7.99e-02 0.244 0.138 0.112 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -44889 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0152 0.142 0.112 cDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 634300 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0546 0.139 0.112 cDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 538554 sc-eQTL 1.43e-01 0.176 0.12 0.112 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -271035 sc-eQTL 9.64e-01 -0.007 0.153 0.112 cDC L2
ENSG00000162607 USP1 886389 sc-eQTL 4.13e-01 0.111 0.136 0.112 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -200686 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0384 0.123 0.112 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 -270725 sc-eQTL 2.22e-01 -0.16 0.13 0.111 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 -44889 sc-eQTL 2.97e-01 -0.137 0.131 0.111 cMono_IL1B L2
ENSG00000116641 DOCK7 634300 sc-eQTL 6.14e-01 0.0698 0.138 0.111 cMono_IL1B L2
ENSG00000125703 ATG4C 538554 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0312 0.0971 0.111 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -271035 sc-eQTL 1.32e-01 0.207 0.137 0.111 cMono_IL1B L2
ENSG00000162607 USP1 886389 sc-eQTL 2.15e-01 -0.15 0.121 0.111 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 -270725 sc-eQTL 5.26e-01 0.0917 0.144 0.111 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 -44889 sc-eQTL 7.31e-01 0.0505 0.147 0.111 cMono_S100A L2
ENSG00000116641 DOCK7 634300 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0768 0.136 0.111 cMono_S100A L2
ENSG00000125703 ATG4C 538554 sc-eQTL 3.30e-01 0.115 0.117 0.111 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -271035 sc-eQTL 4.60e-01 -0.098 0.133 0.111 cMono_S100A L2
ENSG00000162607 USP1 886389 sc-eQTL 8.41e-01 0.0275 0.137 0.111 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 -270725 sc-eQTL 3.23e-01 -0.159 0.16 0.115 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 -44889 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0866 0.171 0.115 gdT L2
ENSG00000116641 DOCK7 634300 sc-eQTL 2.95e-01 -0.176 0.167 0.115 gdT L2
ENSG00000125703 ATG4C 538554 sc-eQTL 2.39e-03 -0.481 0.155 0.115 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -271035 sc-eQTL 3.82e-01 0.149 0.17 0.115 gdT L2
ENSG00000162607 USP1 886389 sc-eQTL 5.62e-01 0.0937 0.161 0.115 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -200686 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0424 0.168 0.115 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 -270725 sc-eQTL 9.69e-01 0.00569 0.145 0.116 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -44889 sc-eQTL 8.35e-01 0.0282 0.135 0.116 intMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 634300 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0214 0.138 0.116 intMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 538554 sc-eQTL 7.16e-01 -0.048 0.132 0.116 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -271035 sc-eQTL 3.82e-01 0.127 0.145 0.116 intMono L2
ENSG00000162607 USP1 886389 sc-eQTL 8.42e-01 0.0295 0.148 0.116 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -270725 sc-eQTL 5.48e-01 -0.078 0.13 0.115 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -44889 sc-eQTL 4.55e-01 0.107 0.142 0.115 ncMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 634300 sc-eQTL 1.28e-01 0.213 0.139 0.115 ncMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 538554 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0472 0.131 0.115 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -271035 sc-eQTL 7.58e-01 0.0422 0.137 0.115 ncMono L2
ENSG00000162607 USP1 886389 sc-eQTL 9.94e-01 0.00103 0.14 0.115 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -270725 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0721 0.15 0.124 pDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -44889 sc-eQTL 2.90e-01 0.155 0.146 0.124 pDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 634300 sc-eQTL 5.40e-01 0.0916 0.149 0.124 pDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 538554 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0589 0.134 0.124 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -271035 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0341 0.15 0.124 pDC L2
ENSG00000162607 USP1 886389 sc-eQTL 7.32e-01 0.0525 0.153 0.124 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -200686 sc-eQTL 5.80e-02 0.251 0.132 0.124 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -270725 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0636 0.136 0.111 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -44889 sc-eQTL 1.14e-02 -0.377 0.148 0.111 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 634300 sc-eQTL 3.67e-01 -0.118 0.13 0.111 B_Memory LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 538554 sc-eQTL 5.23e-01 0.0674 0.105 0.111 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -271035 sc-eQTL 9.19e-01 0.0142 0.138 0.111 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 886389 sc-eQTL 1.52e-01 -0.192 0.134 0.111 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -200686 sc-eQTL 9.22e-01 0.0141 0.144 0.111 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -270725 sc-eQTL 3.63e-01 -0.127 0.139 0.111 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -44889 sc-eQTL 2.05e-02 -0.331 0.142 0.111 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 634300 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0189 0.134 0.111 B_Naive LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 538554 sc-eQTL 9.31e-02 0.171 0.102 0.111 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -271035 sc-eQTL 3.54e-01 -0.134 0.144 0.111 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 886389 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0959 0.124 0.111 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -200686 sc-eQTL 4.61e-01 0.107 0.145 0.111 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -270725 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0624 0.135 0.111 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -44889 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0629 0.13 0.111 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 634300 sc-eQTL 9.97e-01 0.000504 0.131 0.111 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 538554 sc-eQTL 6.70e-01 0.0387 0.0907 0.111 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -271035 sc-eQTL 6.65e-01 0.0581 0.134 0.111 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 886389 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0654 0.115 0.111 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -270725 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0463 0.127 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -44889 sc-eQTL 5.68e-01 0.0825 0.144 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 634300 sc-eQTL 2.31e-01 0.171 0.142 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 538554 sc-eQTL 3.37e-01 -0.117 0.121 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -271035 sc-eQTL 2.28e-01 0.17 0.141 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 886389 sc-eQTL 7.84e-01 0.0365 0.133 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -270725 sc-eQTL 9.00e-01 0.0138 0.11 0.112 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -44889 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0367 0.132 0.112 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 634300 sc-eQTL 8.64e-01 0.0204 0.119 0.112 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 538554 sc-eQTL 1.61e-01 -0.166 0.118 0.112 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -271035 sc-eQTL 1.58e-01 0.198 0.14 0.112 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 886389 sc-eQTL 2.83e-01 -0.137 0.127 0.112 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -200686 sc-eQTL 9.75e-01 0.00485 0.155 0.112 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079739 PGM1 -270725 eQTL 2.47e-06 -0.132 0.0279 0.0 0.0 0.105
ENSG00000142856 ITGB3BP -271035 eQTL 0.0208 -0.107 0.0463 0.0 0.0 0.105
ENSG00000203965 EFCAB7 -200686 eQTL 4.69e-02 -0.0755 0.0379 0.00159 0.0 0.105

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000079739 PGM1 -270725 1.26e-06 9.53e-07 3.08e-07 1.22e-06 3.46e-07 6.27e-07 1.6e-06 3.2e-07 1.38e-06 4.66e-07 1.39e-06 7.84e-07 2.33e-06 3.07e-07 5.34e-07 9.51e-07 8.26e-07 7.08e-07 6.6e-07 6.79e-07 7.58e-07 1.3e-06 9.21e-07 5.57e-07 2.18e-06 5.53e-07 8.99e-07 7.74e-07 1.25e-06 1.24e-06 7.03e-07 2.48e-07 2.54e-07 7.03e-07 5.25e-07 6.4e-07 5.03e-07 4.1e-07 4.12e-07 8.76e-08 2.83e-07 1.51e-06 3.92e-07 2.71e-08 3.27e-07 2.45e-07 2.21e-07 2e-07 2.23e-07