logo

Genes within 1Mb (chr1:63315628:GTAAA:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -277783 sc-eQTL 2.47e-01 -0.112 0.0963 0.175 B L1
ENSG00000088035 ALG6 -51947 sc-eQTL 1.49e-04 -0.374 0.0968 0.175 B L1
ENSG00000116641 DOCK7 627242 sc-eQTL 8.48e-01 0.0192 0.1 0.175 B L1
ENSG00000125703 ATG4C 531496 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0545 0.0695 0.175 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -278093 sc-eQTL 1.89e-01 -0.145 0.11 0.175 B L1
ENSG00000162607 USP1 879331 sc-eQTL 2.85e-01 -0.103 0.0959 0.175 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -207744 sc-eQTL 7.62e-01 0.0344 0.113 0.175 B L1
ENSG00000079739 PGM1 -277783 sc-eQTL 2.47e-01 -0.0952 0.082 0.175 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 -51947 sc-eQTL 2.58e-01 0.103 0.0906 0.175 CD4T L1
ENSG00000116641 DOCK7 627242 sc-eQTL 2.06e-01 0.116 0.0916 0.175 CD4T L1
ENSG00000125703 ATG4C 531496 sc-eQTL 2.70e-01 0.082 0.074 0.175 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -278093 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0658 0.105 0.175 CD4T L1
ENSG00000162607 USP1 879331 sc-eQTL 5.56e-01 0.0424 0.072 0.175 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -207744 sc-eQTL 8.37e-01 0.0195 0.0946 0.175 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 -277783 sc-eQTL 3.11e-01 -0.0924 0.091 0.175 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 -51947 sc-eQTL 1.31e-01 0.152 0.1 0.175 CD8T L1
ENSG00000116641 DOCK7 627242 sc-eQTL 3.10e-01 0.103 0.102 0.175 CD8T L1
ENSG00000125703 ATG4C 531496 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0617 0.0967 0.175 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -278093 sc-eQTL 5.71e-01 0.0613 0.108 0.175 CD8T L1
ENSG00000162607 USP1 879331 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0654 0.0842 0.175 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -207744 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0279 0.108 0.175 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 -277783 sc-eQTL 9.11e-01 0.0114 0.102 0.173 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 -51947 sc-eQTL 4.49e-01 0.0799 0.105 0.173 DC L1
ENSG00000116641 DOCK7 627242 sc-eQTL 9.06e-02 0.182 0.107 0.173 DC L1
ENSG00000125703 ATG4C 531496 sc-eQTL 1.27e-01 0.129 0.0841 0.173 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -278093 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0865 0.118 0.173 DC L1
ENSG00000162607 USP1 879331 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0277 0.103 0.173 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -207744 sc-eQTL 2.78e-01 0.112 0.103 0.173 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 -277783 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0694 0.0991 0.175 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 -51947 sc-eQTL 2.38e-01 -0.122 0.103 0.175 Mono L1
ENSG00000116641 DOCK7 627242 sc-eQTL 6.06e-01 0.0517 0.1 0.175 Mono L1
ENSG00000125703 ATG4C 531496 sc-eQTL 3.13e-01 0.0682 0.0675 0.175 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -278093 sc-eQTL 4.12e-01 0.0877 0.107 0.175 Mono L1
ENSG00000162607 USP1 879331 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0744 0.0877 0.175 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 -277783 sc-eQTL 9.23e-01 0.00819 0.0844 0.176 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 -51947 sc-eQTL 9.85e-01 -0.0019 0.099 0.176 NK L1
ENSG00000116641 DOCK7 627242 sc-eQTL 6.43e-01 0.0378 0.0815 0.176 NK L1
ENSG00000125703 ATG4C 531496 sc-eQTL 3.11e-01 -0.0886 0.0873 0.176 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -278093 sc-eQTL 9.85e-01 0.00202 0.109 0.176 NK L1
ENSG00000162607 USP1 879331 sc-eQTL 3.95e-01 0.0827 0.0971 0.176 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -207744 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0942 0.118 0.176 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 -277783 sc-eQTL 8.85e-01 0.014 0.0964 0.175 Other_T L1
ENSG00000088035 ALG6 -51947 sc-eQTL 1.51e-01 -0.139 0.0964 0.175 Other_T L1
ENSG00000116641 DOCK7 627242 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0101 0.0989 0.175 Other_T L1
ENSG00000125703 ATG4C 531496 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0223 0.0856 0.175 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -278093 sc-eQTL 6.79e-01 0.0315 0.0759 0.175 Other_T L1
ENSG00000162607 USP1 879331 sc-eQTL 9.36e-01 0.0053 0.0658 0.175 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -207744 sc-eQTL 1.67e-01 -0.162 0.117 0.175 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -277783 sc-eQTL 9.55e-01 0.00733 0.131 0.176 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 -51947 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0169 0.125 0.176 B_Activated L2
ENSG00000116641 DOCK7 627242 sc-eQTL 6.62e-02 0.214 0.116 0.176 B_Activated L2
ENSG00000125703 ATG4C 531496 sc-eQTL 1.32e-01 0.184 0.122 0.176 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -278093 sc-eQTL 1.05e-01 0.194 0.119 0.176 B_Activated L2
ENSG00000162607 USP1 879331 sc-eQTL 1.16e-01 0.204 0.129 0.176 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -207744 sc-eQTL 3.89e-01 -0.0978 0.113 0.176 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 -277783 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00648 0.116 0.176 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 -51947 sc-eQTL 1.23e-01 -0.181 0.117 0.176 B_Intermediate L2
ENSG00000116641 DOCK7 627242 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00402 0.112 0.176 B_Intermediate L2
ENSG00000125703 ATG4C 531496 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00468 0.0952 0.176 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -278093 sc-eQTL 7.11e-01 -0.042 0.113 0.176 B_Intermediate L2
ENSG00000162607 USP1 879331 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0375 0.113 0.176 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -207744 sc-eQTL 9.56e-01 0.00618 0.112 0.176 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 -277783 sc-eQTL 2.43e-01 -0.133 0.114 0.175 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 -51947 sc-eQTL 4.67e-04 -0.402 0.113 0.175 B_Memory L2
ENSG00000116641 DOCK7 627242 sc-eQTL 7.58e-01 0.0337 0.109 0.175 B_Memory L2
ENSG00000125703 ATG4C 531496 sc-eQTL 6.08e-01 0.0532 0.104 0.175 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -278093 sc-eQTL 1.32e-01 -0.178 0.118 0.175 B_Memory L2
ENSG00000162607 USP1 879331 sc-eQTL 8.23e-02 -0.207 0.119 0.175 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -207744 sc-eQTL 3.79e-01 0.104 0.118 0.175 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 -277783 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0412 0.114 0.175 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 -51947 sc-eQTL 8.91e-04 -0.375 0.111 0.175 B_Naive1 L2
ENSG00000116641 DOCK7 627242 sc-eQTL 2.78e-01 0.119 0.109 0.175 B_Naive1 L2
ENSG00000125703 ATG4C 531496 sc-eQTL 8.53e-01 0.0157 0.0843 0.175 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -278093 sc-eQTL 4.01e-01 -0.094 0.112 0.175 B_Naive1 L2
ENSG00000162607 USP1 879331 sc-eQTL 7.60e-01 -0.03 0.0983 0.175 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -207744 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00737 0.119 0.175 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 -277783 sc-eQTL 2.58e-01 -0.127 0.112 0.176 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 -51947 sc-eQTL 8.98e-01 0.015 0.117 0.176 B_Naive2 L2
ENSG00000116641 DOCK7 627242 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0111 0.112 0.176 B_Naive2 L2
ENSG00000125703 ATG4C 531496 sc-eQTL 4.59e-01 0.0801 0.108 0.176 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -278093 sc-eQTL 3.28e-01 -0.115 0.117 0.176 B_Naive2 L2
ENSG00000162607 USP1 879331 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0175 0.112 0.176 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -207744 sc-eQTL 9.26e-01 0.0108 0.117 0.176 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 -277783 sc-eQTL 2.14e-01 0.139 0.112 0.177 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -51947 sc-eQTL 9.51e-02 -0.198 0.118 0.177 CD4_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 627242 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0651 0.104 0.177 CD4_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 531496 sc-eQTL 1.59e-01 0.151 0.107 0.177 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -278093 sc-eQTL 4.93e-01 0.0788 0.115 0.177 CD4_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 879331 sc-eQTL 7.26e-01 0.0383 0.109 0.177 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -207744 sc-eQTL 3.97e-02 0.223 0.108 0.177 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -277783 sc-eQTL 2.77e-01 -0.101 0.0925 0.175 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -51947 sc-eQTL 8.02e-02 0.176 0.1 0.175 CD4_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 627242 sc-eQTL 3.54e-01 0.0918 0.0989 0.175 CD4_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 531496 sc-eQTL 5.90e-01 0.0472 0.0875 0.175 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -278093 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0767 0.107 0.175 CD4_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 879331 sc-eQTL 5.21e-01 0.0526 0.0817 0.175 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -207744 sc-eQTL 9.31e-01 0.00919 0.106 0.175 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -277783 sc-eQTL 8.60e-02 -0.165 0.0956 0.175 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -51947 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0408 0.112 0.175 CD4_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 627242 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0318 0.099 0.175 CD4_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 531496 sc-eQTL 2.76e-01 0.105 0.0961 0.175 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -278093 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0148 0.114 0.175 CD4_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 879331 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0357 0.0932 0.175 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -207744 sc-eQTL 2.92e-01 0.116 0.11 0.175 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -277783 sc-eQTL 6.98e-01 0.0438 0.113 0.175 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -51947 sc-eQTL 4.58e-01 -0.084 0.113 0.175 CD4_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 627242 sc-eQTL 2.44e-01 0.129 0.11 0.175 CD4_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 531496 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0959 0.107 0.175 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -278093 sc-eQTL 1.69e-01 -0.152 0.11 0.175 CD4_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 879331 sc-eQTL 3.73e-01 0.0935 0.105 0.175 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -207744 sc-eQTL 9.88e-01 0.00176 0.115 0.175 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -277783 sc-eQTL 4.69e-01 0.0746 0.103 0.175 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -51947 sc-eQTL 8.01e-01 0.0276 0.109 0.175 CD8_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 627242 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0114 0.104 0.175 CD8_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 531496 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0353 0.111 0.175 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -278093 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0404 0.115 0.175 CD8_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 879331 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0572 0.103 0.175 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -207744 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0626 0.118 0.175 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -277783 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00518 0.105 0.175 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -51947 sc-eQTL 2.56e-01 0.124 0.109 0.175 CD8_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 627242 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0551 0.113 0.175 CD8_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 531496 sc-eQTL 5.95e-01 0.0575 0.108 0.175 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -278093 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00557 0.109 0.175 CD8_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 879331 sc-eQTL 6.60e-01 0.0408 0.0925 0.175 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -207744 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0727 0.103 0.175 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -277783 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0573 0.116 0.171 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -51947 sc-eQTL 1.12e-02 0.296 0.116 0.171 CD8_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 627242 sc-eQTL 2.84e-01 0.123 0.114 0.171 CD8_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 531496 sc-eQTL 5.75e-01 0.0659 0.117 0.171 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -278093 sc-eQTL 8.44e-01 0.0224 0.114 0.171 CD8_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 879331 sc-eQTL 5.06e-01 -0.073 0.11 0.171 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -207744 sc-eQTL 3.77e-01 -0.103 0.116 0.171 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -277783 sc-eQTL 9.72e-02 -0.193 0.116 0.18 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -51947 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00113 0.117 0.18 CD8_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 627242 sc-eQTL 2.90e-01 0.12 0.113 0.18 CD8_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 531496 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0155 0.109 0.18 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -278093 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000222 0.118 0.18 CD8_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 879331 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0258 0.113 0.18 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -207744 sc-eQTL 1.55e-01 -0.163 0.114 0.18 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -277783 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0744 0.11 0.175 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 -51947 sc-eQTL 5.57e-02 -0.207 0.108 0.175 MAIT L2
ENSG00000116641 DOCK7 627242 sc-eQTL 7.59e-01 0.0319 0.104 0.175 MAIT L2
ENSG00000125703 ATG4C 531496 sc-eQTL 1.98e-01 0.141 0.109 0.175 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -278093 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0256 0.11 0.175 MAIT L2
ENSG00000162607 USP1 879331 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0778 0.109 0.175 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -207744 sc-eQTL 5.51e-02 -0.217 0.112 0.175 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 -277783 sc-eQTL 9.98e-01 0.000254 0.111 0.178 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 -51947 sc-eQTL 7.70e-01 0.0332 0.113 0.178 NK_CD56bright L2
ENSG00000116641 DOCK7 627242 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0295 0.0983 0.178 NK_CD56bright L2
ENSG00000125703 ATG4C 531496 sc-eQTL 1.39e-01 -0.162 0.109 0.178 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -278093 sc-eQTL 3.17e-01 -0.114 0.114 0.178 NK_CD56bright L2
ENSG00000162607 USP1 879331 sc-eQTL 2.29e-03 0.356 0.115 0.178 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -207744 sc-eQTL 4.00e-01 -0.095 0.113 0.178 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 -277783 sc-eQTL 6.52e-01 0.04 0.0884 0.177 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 -51947 sc-eQTL 2.76e-01 -0.122 0.112 0.177 NK_CD56dim L2
ENSG00000116641 DOCK7 627242 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0175 0.0976 0.177 NK_CD56dim L2
ENSG00000125703 ATG4C 531496 sc-eQTL 8.70e-01 0.0163 0.0992 0.177 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -278093 sc-eQTL 9.50e-01 0.00702 0.113 0.177 NK_CD56dim L2
ENSG00000162607 USP1 879331 sc-eQTL 9.30e-01 -0.0096 0.109 0.177 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -207744 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0356 0.122 0.177 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 -277783 sc-eQTL 3.38e-01 -0.114 0.119 0.178 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 -51947 sc-eQTL 2.36e-01 0.146 0.123 0.178 NK_HLA L2
ENSG00000116641 DOCK7 627242 sc-eQTL 4.71e-01 -0.068 0.0942 0.178 NK_HLA L2
ENSG00000125703 ATG4C 531496 sc-eQTL 2.02e-01 0.14 0.109 0.178 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -278093 sc-eQTL 2.55e-01 0.131 0.115 0.178 NK_HLA L2
ENSG00000162607 USP1 879331 sc-eQTL 2.27e-01 0.145 0.12 0.178 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -207744 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0646 0.11 0.178 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 -277783 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0213 0.096 0.177 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 -51947 sc-eQTL 9.12e-01 -0.012 0.109 0.177 NK_cytokine L2
ENSG00000116641 DOCK7 627242 sc-eQTL 5.53e-01 0.0597 0.1 0.177 NK_cytokine L2
ENSG00000125703 ATG4C 531496 sc-eQTL 1.10e-01 -0.164 0.102 0.177 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -278093 sc-eQTL 7.68e-01 0.0315 0.107 0.177 NK_cytokine L2
ENSG00000162607 USP1 879331 sc-eQTL 7.92e-01 0.0295 0.112 0.177 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -207744 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0461 0.113 0.177 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 -277783 sc-eQTL 1.02e-01 -0.234 0.142 0.174 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 -51947 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0688 0.151 0.174 PB L2
ENSG00000116641 DOCK7 627242 sc-eQTL 1.60e-01 -0.226 0.16 0.174 PB L2
ENSG00000125703 ATG4C 531496 sc-eQTL 8.23e-02 0.243 0.139 0.174 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -278093 sc-eQTL 3.23e-01 0.139 0.14 0.174 PB L2
ENSG00000162607 USP1 879331 sc-eQTL 4.34e-01 0.109 0.139 0.174 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -207744 sc-eQTL 6.43e-02 -0.283 0.152 0.174 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 -277783 sc-eQTL 4.39e-01 0.0809 0.104 0.174 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 -51947 sc-eQTL 1.03e-01 -0.173 0.106 0.174 Pro_T L2
ENSG00000116641 DOCK7 627242 sc-eQTL 1.31e-01 -0.161 0.106 0.174 Pro_T L2
ENSG00000125703 ATG4C 531496 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0342 0.0934 0.174 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -278093 sc-eQTL 8.34e-01 0.0197 0.0937 0.174 Pro_T L2
ENSG00000162607 USP1 879331 sc-eQTL 3.75e-02 0.134 0.0638 0.174 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -207744 sc-eQTL 3.51e-01 0.102 0.109 0.174 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 -277783 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0125 0.109 0.175 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 -51947 sc-eQTL 3.00e-01 0.121 0.116 0.175 Treg L2
ENSG00000116641 DOCK7 627242 sc-eQTL 5.65e-01 0.0617 0.107 0.175 Treg L2
ENSG00000125703 ATG4C 531496 sc-eQTL 5.35e-01 0.0679 0.109 0.175 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -278093 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0495 0.114 0.175 Treg L2
ENSG00000162607 USP1 879331 sc-eQTL 4.42e-01 0.0852 0.111 0.175 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -207744 sc-eQTL 6.42e-01 0.051 0.11 0.175 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 -277783 sc-eQTL 3.01e-01 0.112 0.108 0.18 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -51947 sc-eQTL 6.87e-01 0.0445 0.11 0.18 cDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 627242 sc-eQTL 1.45e-01 0.158 0.108 0.18 cDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 531496 sc-eQTL 1.64e-01 0.131 0.0935 0.18 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -278093 sc-eQTL 1.87e-01 -0.157 0.119 0.18 cDC L2
ENSG00000162607 USP1 879331 sc-eQTL 7.40e-01 0.0353 0.106 0.18 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -207744 sc-eQTL 7.70e-01 -0.028 0.0957 0.18 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 -277783 sc-eQTL 2.61e-01 -0.116 0.103 0.175 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 -51947 sc-eQTL 9.67e-02 -0.171 0.102 0.175 cMono_IL1B L2
ENSG00000116641 DOCK7 627242 sc-eQTL 1.47e-01 0.157 0.108 0.175 cMono_IL1B L2
ENSG00000125703 ATG4C 531496 sc-eQTL 7.39e-01 0.0255 0.0764 0.175 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -278093 sc-eQTL 8.08e-01 0.0264 0.108 0.175 cMono_IL1B L2
ENSG00000162607 USP1 879331 sc-eQTL 2.33e-01 -0.114 0.0951 0.175 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 -277783 sc-eQTL 9.12e-01 0.0126 0.113 0.175 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 -51947 sc-eQTL 8.75e-01 0.018 0.115 0.175 cMono_S100A L2
ENSG00000116641 DOCK7 627242 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0615 0.106 0.175 cMono_S100A L2
ENSG00000125703 ATG4C 531496 sc-eQTL 1.79e-01 0.124 0.0918 0.175 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -278093 sc-eQTL 9.22e-01 0.0102 0.104 0.175 cMono_S100A L2
ENSG00000162607 USP1 879331 sc-eQTL 5.23e-01 0.0684 0.107 0.175 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 -277783 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0568 0.122 0.188 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 -51947 sc-eQTL 4.12e-01 -0.107 0.13 0.188 gdT L2
ENSG00000116641 DOCK7 627242 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0595 0.128 0.188 gdT L2
ENSG00000125703 ATG4C 531496 sc-eQTL 6.47e-05 -0.475 0.115 0.188 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -278093 sc-eQTL 9.32e-01 -0.0112 0.13 0.188 gdT L2
ENSG00000162607 USP1 879331 sc-eQTL 8.32e-01 0.0261 0.123 0.188 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -207744 sc-eQTL 2.04e-01 -0.162 0.127 0.188 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 -277783 sc-eQTL 9.87e-01 0.00191 0.114 0.18 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -51947 sc-eQTL 5.57e-01 0.0624 0.106 0.18 intMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 627242 sc-eQTL 5.68e-01 -0.062 0.108 0.18 intMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 531496 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0257 0.103 0.18 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -278093 sc-eQTL 6.23e-01 0.056 0.114 0.18 intMono L2
ENSG00000162607 USP1 879331 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0612 0.116 0.18 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -277783 sc-eQTL 6.19e-01 0.0513 0.103 0.179 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -51947 sc-eQTL 3.40e-01 -0.108 0.113 0.179 ncMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 627242 sc-eQTL 3.49e-01 0.104 0.111 0.179 ncMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 531496 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00406 0.104 0.179 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -278093 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0153 0.109 0.179 ncMono L2
ENSG00000162607 USP1 879331 sc-eQTL 2.41e-01 -0.13 0.111 0.179 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -277783 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0325 0.118 0.195 pDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -51947 sc-eQTL 2.66e-01 0.128 0.114 0.195 pDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 627242 sc-eQTL 1.07e-01 0.188 0.116 0.195 pDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 531496 sc-eQTL 9.02e-01 0.013 0.105 0.195 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -278093 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0516 0.118 0.195 pDC L2
ENSG00000162607 USP1 879331 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0227 0.12 0.195 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -207744 sc-eQTL 1.91e-02 0.243 0.103 0.195 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -277783 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0438 0.108 0.175 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -51947 sc-eQTL 1.19e-03 -0.383 0.116 0.175 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 627242 sc-eQTL 7.21e-01 0.0371 0.104 0.175 B_Memory LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 531496 sc-eQTL 4.97e-01 0.0569 0.0836 0.175 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -278093 sc-eQTL 2.37e-01 -0.13 0.11 0.175 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 879331 sc-eQTL 3.53e-01 -0.0993 0.107 0.175 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -207744 sc-eQTL 8.41e-01 0.0231 0.115 0.175 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -277783 sc-eQTL 2.50e-01 -0.128 0.111 0.175 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -51947 sc-eQTL 1.24e-02 -0.285 0.113 0.175 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 627242 sc-eQTL 3.12e-01 0.108 0.107 0.175 B_Naive LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 531496 sc-eQTL 9.93e-01 -0.00075 0.0817 0.175 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -278093 sc-eQTL 1.84e-01 -0.153 0.115 0.175 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 879331 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0771 0.0991 0.175 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -207744 sc-eQTL 9.62e-01 0.00553 0.116 0.175 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -277783 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0713 0.105 0.175 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -51947 sc-eQTL 2.33e-01 -0.122 0.102 0.175 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 627242 sc-eQTL 4.53e-01 0.0773 0.103 0.175 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 531496 sc-eQTL 2.36e-01 0.0842 0.0709 0.175 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -278093 sc-eQTL 6.91e-01 0.0418 0.105 0.175 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 879331 sc-eQTL 8.50e-01 -0.017 0.0899 0.175 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -277783 sc-eQTL 9.85e-01 0.0019 0.101 0.175 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -51947 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0562 0.114 0.175 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 627242 sc-eQTL 7.75e-01 0.0323 0.113 0.175 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 531496 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0241 0.0963 0.175 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -278093 sc-eQTL 3.83e-01 0.0977 0.112 0.175 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 879331 sc-eQTL 3.38e-01 -0.101 0.105 0.175 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -277783 sc-eQTL 6.34e-01 0.041 0.086 0.177 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -51947 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0239 0.103 0.177 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 627242 sc-eQTL 6.75e-01 0.0388 0.0925 0.177 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 531496 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0692 0.0922 0.177 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -278093 sc-eQTL 8.30e-01 0.0236 0.109 0.177 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 879331 sc-eQTL 9.79e-01 0.00266 0.0994 0.177 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -207744 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0314 0.121 0.177 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079739 PGM1 -277783 eQTL 0.000265 -0.0867 0.0237 0.0 0.0 0.173
ENSG00000142856 ITGB3BP -278093 eQTL 0.0015 -0.124 0.0389 0.0 0.0 0.173
ENSG00000230798 FOXD3-AS1 -8813 eQTL 0.0378 0.0723 0.0347 0.0 0.0 0.173

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000079739 PGM1 -277783 3.31e-06 2.47e-06 6.4e-07 1.9e-06 4.27e-07 8.45e-07 2.54e-06 2.03e-07 1.4e-06 5.99e-07 1.97e-06 5.93e-07 3.64e-06 5.86e-07 5.31e-07 9.17e-07 1.59e-06 7.02e-07 5.99e-07 6.52e-07 7.69e-07 1.72e-06 2.13e-06 5.39e-07 2.37e-06 1.16e-06 1.03e-06 7.14e-07 3.79e-06 1.66e-06 7.67e-07 3.84e-08 9.26e-08 1.14e-06 1.88e-06 5.26e-07 8.1e-07 1.51e-07 2.78e-07 2.56e-08 9.77e-08 3.33e-06 4e-07 5.02e-07 3.34e-07 1.99e-07 2.34e-07 1.11e-08 4.67e-08
ENSG00000142856 ITGB3BP -278093 3.31e-06 2.56e-06 6.4e-07 1.9e-06 4.27e-07 8.45e-07 2.55e-06 2.03e-07 1.4e-06 6.05e-07 1.97e-06 5.93e-07 3.64e-06 5.83e-07 5.31e-07 8.79e-07 1.59e-06 6.96e-07 5.99e-07 6.52e-07 7.69e-07 1.74e-06 2.11e-06 5.39e-07 2.39e-06 1.16e-06 1.03e-06 7.14e-07 3.79e-06 1.66e-06 7.49e-07 3.84e-08 9.26e-08 1.14e-06 1.88e-06 5.24e-07 8.1e-07 1.51e-07 2.78e-07 2.53e-08 9.77e-08 3.33e-06 4e-07 5.02e-07 3.34e-07 1.99e-07 2.34e-07 1.11e-08 4.67e-08
ENSG00000162607 \N 879331 9.47e-07 3.35e-07 1.31e-07 2.66e-07 1.03e-07 1.97e-07 5.2e-07 5.33e-08 1.5e-07 6.4e-08 1.96e-07 8.68e-08 4.54e-07 8.15e-08 6.02e-08 7.74e-08 9.3e-08 1.44e-07 7.39e-08 4.23e-08 1.27e-07 1.39e-07 2.11e-07 4.13e-08 2.99e-07 1.9e-07 1.31e-07 1.01e-07 3.56e-07 3.39e-07 1.59e-07 3.41e-08 2.92e-08 9.3e-08 3.52e-07 3.65e-08 5.11e-08 9.22e-08 7.23e-08 3.59e-08 3.7e-08 2.19e-07 2.71e-08 1.67e-07 5.19e-08 1.8e-08 1.25e-07 4.5e-09 4.61e-08