logo

Genes within 1Mb (chr1:63300214:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -293197 sc-eQTL 6.08e-01 0.0414 0.0805 0.259 B L1
ENSG00000088035 ALG6 -67361 sc-eQTL 2.74e-01 0.0913 0.0832 0.259 B L1
ENSG00000116641 DOCK7 611828 sc-eQTL 7.75e-01 0.0238 0.0834 0.259 B L1
ENSG00000125703 ATG4C 516082 sc-eQTL 3.27e-01 0.0568 0.0579 0.259 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -293507 sc-eQTL 2.13e-01 0.115 0.092 0.259 B L1
ENSG00000162607 USP1 863917 sc-eQTL 2.44e-01 0.0933 0.0799 0.259 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -223158 sc-eQTL 1.73e-01 0.129 0.0942 0.259 B L1
ENSG00000079739 PGM1 -293197 sc-eQTL 3.68e-01 -0.0623 0.069 0.259 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 -67361 sc-eQTL 3.57e-01 -0.0704 0.0762 0.259 CD4T L1
ENSG00000116641 DOCK7 611828 sc-eQTL 4.78e-01 0.0549 0.0772 0.259 CD4T L1
ENSG00000125703 ATG4C 516082 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0337 0.0624 0.259 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -293507 sc-eQTL 9.14e-02 0.149 0.088 0.259 CD4T L1
ENSG00000162607 USP1 863917 sc-eQTL 5.95e-01 0.0322 0.0605 0.259 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -223158 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0457 0.0795 0.259 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 -293197 sc-eQTL 1.70e-01 0.105 0.0764 0.259 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 -67361 sc-eQTL 3.43e-01 -0.0802 0.0844 0.259 CD8T L1
ENSG00000116641 DOCK7 611828 sc-eQTL 8.94e-01 0.0114 0.0857 0.259 CD8T L1
ENSG00000125703 ATG4C 516082 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0246 0.0814 0.259 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -293507 sc-eQTL 2.60e-01 0.103 0.0908 0.259 CD8T L1
ENSG00000162607 USP1 863917 sc-eQTL 1.98e-01 0.0912 0.0706 0.259 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -223158 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0614 0.0907 0.259 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 -293197 sc-eQTL 2.93e-01 0.0878 0.0832 0.264 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 -67361 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0619 0.086 0.264 DC L1
ENSG00000116641 DOCK7 611828 sc-eQTL 6.33e-02 0.163 0.0875 0.264 DC L1
ENSG00000125703 ATG4C 516082 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0155 0.0691 0.264 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -293507 sc-eQTL 1.45e-01 0.14 0.0961 0.264 DC L1
ENSG00000162607 USP1 863917 sc-eQTL 3.66e-01 0.0762 0.0841 0.264 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -223158 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0191 0.084 0.264 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 -293197 sc-eQTL 4.49e-01 0.064 0.0844 0.259 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 -67361 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0738 0.088 0.259 Mono L1
ENSG00000116641 DOCK7 611828 sc-eQTL 9.86e-01 0.00153 0.0853 0.259 Mono L1
ENSG00000125703 ATG4C 516082 sc-eQTL 3.53e-01 0.0536 0.0575 0.259 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -293507 sc-eQTL 2.61e-02 0.202 0.09 0.259 Mono L1
ENSG00000162607 USP1 863917 sc-eQTL 2.89e-01 0.0793 0.0746 0.259 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 -293197 sc-eQTL 1.35e-01 0.106 0.0708 0.26 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 -67361 sc-eQTL 9.21e-01 0.00827 0.0834 0.26 NK L1
ENSG00000116641 DOCK7 611828 sc-eQTL 2.91e-01 -0.0725 0.0685 0.26 NK L1
ENSG00000125703 ATG4C 516082 sc-eQTL 7.80e-01 0.0206 0.0738 0.26 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -293507 sc-eQTL 5.00e-01 0.0618 0.0916 0.26 NK L1
ENSG00000162607 USP1 863917 sc-eQTL 3.84e-01 0.0714 0.0818 0.26 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -223158 sc-eQTL 3.48e-01 0.0934 0.0993 0.26 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 -293197 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0565 0.0813 0.259 Other_T L1
ENSG00000088035 ALG6 -67361 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0563 0.0817 0.259 Other_T L1
ENSG00000116641 DOCK7 611828 sc-eQTL 6.15e-01 -0.042 0.0834 0.259 Other_T L1
ENSG00000125703 ATG4C 516082 sc-eQTL 5.77e-01 0.0404 0.0722 0.259 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -293507 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00445 0.0641 0.259 Other_T L1
ENSG00000162607 USP1 863917 sc-eQTL 9.10e-01 -0.00627 0.0555 0.259 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -223158 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00321 0.0989 0.259 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -293197 sc-eQTL 7.53e-01 0.0343 0.109 0.25 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 -67361 sc-eQTL 7.50e-01 0.0333 0.104 0.25 B_Activated L2
ENSG00000116641 DOCK7 611828 sc-eQTL 2.27e-01 -0.117 0.0967 0.25 B_Activated L2
ENSG00000125703 ATG4C 516082 sc-eQTL 4.13e-01 0.0836 0.102 0.25 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -293507 sc-eQTL 3.23e-01 0.0986 0.0995 0.25 B_Activated L2
ENSG00000162607 USP1 863917 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0604 0.108 0.25 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -223158 sc-eQTL 1.52e-01 0.135 0.0939 0.25 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 -293197 sc-eQTL 8.09e-01 0.0234 0.0967 0.26 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 -67361 sc-eQTL 2.56e-01 0.112 0.0979 0.26 B_Intermediate L2
ENSG00000116641 DOCK7 611828 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0611 0.0937 0.26 B_Intermediate L2
ENSG00000125703 ATG4C 516082 sc-eQTL 4.30e-01 0.0627 0.0793 0.26 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -293507 sc-eQTL 3.78e-01 0.0834 0.0944 0.26 B_Intermediate L2
ENSG00000162607 USP1 863917 sc-eQTL 2.05e-01 0.12 0.0941 0.26 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -223158 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0181 0.0937 0.26 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 -293197 sc-eQTL 4.83e-01 0.0668 0.0951 0.261 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 -67361 sc-eQTL 6.60e-01 0.0425 0.0967 0.261 B_Memory L2
ENSG00000116641 DOCK7 611828 sc-eQTL 8.55e-01 0.0167 0.0907 0.261 B_Memory L2
ENSG00000125703 ATG4C 516082 sc-eQTL 8.47e-01 0.0166 0.0862 0.261 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -293507 sc-eQTL 3.21e-03 0.288 0.0967 0.261 B_Memory L2
ENSG00000162607 USP1 863917 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0378 0.0995 0.261 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -223158 sc-eQTL 2.77e-01 0.106 0.0977 0.261 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 -293197 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0149 0.0963 0.259 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 -67361 sc-eQTL 2.46e-01 0.112 0.0964 0.259 B_Naive1 L2
ENSG00000116641 DOCK7 611828 sc-eQTL 8.09e-01 0.0225 0.0927 0.259 B_Naive1 L2
ENSG00000125703 ATG4C 516082 sc-eQTL 4.37e-01 0.0555 0.0713 0.259 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -293507 sc-eQTL 4.84e-01 0.0664 0.0946 0.259 B_Naive1 L2
ENSG00000162607 USP1 863917 sc-eQTL 8.06e-01 0.0205 0.0833 0.259 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -223158 sc-eQTL 4.86e-01 0.0704 0.101 0.259 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 -293197 sc-eQTL 9.14e-01 0.0102 0.0943 0.26 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 -67361 sc-eQTL 2.20e-01 -0.121 0.098 0.26 B_Naive2 L2
ENSG00000116641 DOCK7 611828 sc-eQTL 8.41e-01 0.019 0.0946 0.26 B_Naive2 L2
ENSG00000125703 ATG4C 516082 sc-eQTL 7.47e-01 0.0294 0.091 0.26 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -293507 sc-eQTL 2.73e-01 0.108 0.0984 0.26 B_Naive2 L2
ENSG00000162607 USP1 863917 sc-eQTL 1.98e-01 0.121 0.0936 0.26 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -223158 sc-eQTL 5.81e-01 0.0543 0.0982 0.26 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 -293197 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0372 0.0969 0.255 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -67361 sc-eQTL 1.76e-02 0.242 0.101 0.255 CD4_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 611828 sc-eQTL 3.01e-01 -0.0926 0.0893 0.255 CD4_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 516082 sc-eQTL 4.66e-01 0.0676 0.0925 0.255 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -293507 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0517 0.099 0.255 CD4_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 863917 sc-eQTL 4.23e-01 0.0756 0.0942 0.255 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -223158 sc-eQTL 3.04e-01 -0.0968 0.0939 0.255 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -293197 sc-eQTL 1.48e-01 -0.113 0.0781 0.259 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -67361 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0628 0.0851 0.259 CD4_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 611828 sc-eQTL 2.40e-01 0.0983 0.0835 0.259 CD4_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 516082 sc-eQTL 6.71e-01 0.0315 0.074 0.259 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -293507 sc-eQTL 6.28e-02 0.168 0.0897 0.259 CD4_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 863917 sc-eQTL 4.77e-01 0.0492 0.069 0.259 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -223158 sc-eQTL 7.27e-01 0.0314 0.0898 0.259 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -293197 sc-eQTL 5.03e-01 0.0541 0.0807 0.259 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -67361 sc-eQTL 5.87e-01 0.051 0.0937 0.259 CD4_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 611828 sc-eQTL 9.19e-01 0.00848 0.0831 0.259 CD4_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 516082 sc-eQTL 1.74e-01 -0.11 0.0806 0.259 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -293507 sc-eQTL 3.54e-01 0.0884 0.0952 0.259 CD4_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 863917 sc-eQTL 4.61e-01 0.0577 0.0781 0.259 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -223158 sc-eQTL 8.36e-01 0.0192 0.0923 0.259 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -293197 sc-eQTL 3.28e-01 0.0926 0.0945 0.259 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -67361 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0834 0.095 0.259 CD4_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 611828 sc-eQTL 5.93e-01 0.0496 0.0927 0.259 CD4_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 516082 sc-eQTL 8.33e-01 -0.019 0.0901 0.259 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -293507 sc-eQTL 8.45e-01 0.0182 0.093 0.259 CD4_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 863917 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0473 0.0881 0.259 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -223158 sc-eQTL 1.77e-01 -0.13 0.096 0.259 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -293197 sc-eQTL 3.11e-01 0.0884 0.087 0.259 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -67361 sc-eQTL 9.55e-01 0.00527 0.0928 0.259 CD8_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 611828 sc-eQTL 8.21e-01 0.0199 0.088 0.259 CD8_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 516082 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000816 0.0937 0.259 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -293507 sc-eQTL 9.23e-01 -0.00939 0.0974 0.259 CD8_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 863917 sc-eQTL 8.54e-01 0.016 0.0873 0.259 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -223158 sc-eQTL 2.70e-01 -0.11 0.0995 0.259 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -293197 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0173 0.0876 0.259 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -67361 sc-eQTL 1.16e-01 -0.143 0.0902 0.259 CD8_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 611828 sc-eQTL 2.89e-01 0.0995 0.0935 0.259 CD8_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 516082 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0285 0.09 0.259 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -293507 sc-eQTL 1.52e-01 0.13 0.0907 0.259 CD8_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 863917 sc-eQTL 1.61e-01 0.108 0.0767 0.259 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -223158 sc-eQTL 2.68e-01 0.0951 0.0857 0.259 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -293197 sc-eQTL 6.91e-01 0.0387 0.0975 0.266 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -67361 sc-eQTL 7.83e-01 0.0272 0.0987 0.266 CD8_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 611828 sc-eQTL 1.19e-01 -0.15 0.0957 0.266 CD8_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 516082 sc-eQTL 2.31e-02 -0.223 0.0972 0.266 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -293507 sc-eQTL 1.02e-01 0.156 0.0951 0.266 CD8_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 863917 sc-eQTL 1.66e-01 0.128 0.0917 0.266 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -223158 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0632 0.0975 0.266 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -293197 sc-eQTL 6.28e-03 0.269 0.0972 0.256 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -67361 sc-eQTL 6.73e-01 0.042 0.0994 0.256 CD8_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 611828 sc-eQTL 9.39e-01 0.00741 0.0964 0.256 CD8_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 516082 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00357 0.0927 0.256 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -293507 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0216 0.1 0.256 CD8_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 863917 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0313 0.0957 0.256 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -223158 sc-eQTL 4.43e-01 0.0747 0.0971 0.256 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -293197 sc-eQTL 2.25e-01 0.113 0.0928 0.26 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 -67361 sc-eQTL 4.87e-01 0.0642 0.0921 0.26 MAIT L2
ENSG00000116641 DOCK7 611828 sc-eQTL 9.25e-01 0.00837 0.0884 0.26 MAIT L2
ENSG00000125703 ATG4C 516082 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0248 0.0932 0.26 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -293507 sc-eQTL 2.47e-01 -0.108 0.093 0.26 MAIT L2
ENSG00000162607 USP1 863917 sc-eQTL 3.25e-01 -0.0912 0.0924 0.26 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -223158 sc-eQTL 4.05e-01 -0.08 0.096 0.26 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 -293197 sc-eQTL 8.45e-01 0.0187 0.0958 0.251 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 -67361 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0144 0.0982 0.251 NK_CD56bright L2
ENSG00000116641 DOCK7 611828 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0676 0.085 0.251 NK_CD56bright L2
ENSG00000125703 ATG4C 516082 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0385 0.095 0.251 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -293507 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0265 0.099 0.251 NK_CD56bright L2
ENSG00000162607 USP1 863917 sc-eQTL 2.86e-01 -0.109 0.102 0.251 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -223158 sc-eQTL 3.58e-01 0.0897 0.0975 0.251 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 -293197 sc-eQTL 5.54e-01 0.0435 0.0735 0.256 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 -67361 sc-eQTL 1.68e-01 0.129 0.0929 0.256 NK_CD56dim L2
ENSG00000116641 DOCK7 611828 sc-eQTL 4.19e-01 0.0656 0.0811 0.256 NK_CD56dim L2
ENSG00000125703 ATG4C 516082 sc-eQTL 1.43e-01 -0.121 0.0821 0.256 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -293507 sc-eQTL 6.91e-01 0.0373 0.0939 0.256 NK_CD56dim L2
ENSG00000162607 USP1 863917 sc-eQTL 3.24e-01 0.0899 0.0909 0.256 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -223158 sc-eQTL 4.56e-01 0.0757 0.101 0.256 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 -293197 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0291 0.103 0.26 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 -67361 sc-eQTL 8.36e-02 -0.184 0.106 0.26 NK_HLA L2
ENSG00000116641 DOCK7 611828 sc-eQTL 6.93e-01 0.0321 0.0813 0.26 NK_HLA L2
ENSG00000125703 ATG4C 516082 sc-eQTL 9.66e-01 -0.004 0.0946 0.26 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -293507 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0422 0.0993 0.26 NK_HLA L2
ENSG00000162607 USP1 863917 sc-eQTL 6.36e-01 0.0492 0.104 0.26 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -223158 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0213 0.0946 0.26 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 -293197 sc-eQTL 4.75e-01 0.0579 0.0809 0.256 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 -67361 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00391 0.0915 0.256 NK_cytokine L2
ENSG00000116641 DOCK7 611828 sc-eQTL 1.58e-01 -0.12 0.0844 0.256 NK_cytokine L2
ENSG00000125703 ATG4C 516082 sc-eQTL 7.59e-02 0.154 0.0861 0.256 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -293507 sc-eQTL 4.27e-01 0.0714 0.0897 0.256 NK_cytokine L2
ENSG00000162607 USP1 863917 sc-eQTL 2.90e-01 -0.0999 0.0942 0.256 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -223158 sc-eQTL 7.50e-01 0.0305 0.0957 0.256 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 -293197 sc-eQTL 8.24e-01 0.0256 0.115 0.256 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 -67361 sc-eQTL 3.38e-01 -0.116 0.12 0.256 PB L2
ENSG00000116641 DOCK7 611828 sc-eQTL 4.01e-01 0.109 0.129 0.256 PB L2
ENSG00000125703 ATG4C 516082 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0324 0.113 0.256 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -293507 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0526 0.112 0.256 PB L2
ENSG00000162607 USP1 863917 sc-eQTL 8.64e-03 -0.29 0.109 0.256 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -223158 sc-eQTL 9.07e-01 0.0145 0.123 0.256 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 -293197 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0711 0.0884 0.261 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 -67361 sc-eQTL 3.30e-01 -0.0878 0.0899 0.261 Pro_T L2
ENSG00000116641 DOCK7 611828 sc-eQTL 3.82e-01 0.079 0.0902 0.261 Pro_T L2
ENSG00000125703 ATG4C 516082 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00455 0.0791 0.261 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -293507 sc-eQTL 6.72e-01 0.0337 0.0794 0.261 Pro_T L2
ENSG00000162607 USP1 863917 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0469 0.0545 0.261 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -223158 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0476 0.0922 0.261 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 -293197 sc-eQTL 1.75e-01 0.125 0.092 0.259 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 -67361 sc-eQTL 2.57e-02 -0.219 0.0976 0.259 Treg L2
ENSG00000116641 DOCK7 611828 sc-eQTL 8.62e-01 0.0158 0.0907 0.259 Treg L2
ENSG00000125703 ATG4C 516082 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0679 0.0925 0.259 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -293507 sc-eQTL 2.10e-01 0.122 0.0966 0.259 Treg L2
ENSG00000162607 USP1 863917 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0642 0.0937 0.259 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -223158 sc-eQTL 1.65e-01 -0.129 0.0923 0.259 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 -293197 sc-eQTL 3.36e-01 -0.0915 0.095 0.251 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -67361 sc-eQTL 3.15e-01 0.097 0.0963 0.251 cDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 611828 sc-eQTL 3.36e-01 0.0911 0.0945 0.251 cDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 516082 sc-eQTL 2.35e-01 -0.0976 0.0819 0.251 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -293507 sc-eQTL 9.35e-01 0.00853 0.104 0.251 cDC L2
ENSG00000162607 USP1 863917 sc-eQTL 3.75e-01 0.0824 0.0926 0.251 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -223158 sc-eQTL 5.53e-01 0.0498 0.0837 0.251 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 -293197 sc-eQTL 3.42e-01 0.0828 0.087 0.259 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 -67361 sc-eQTL 3.82e-01 -0.0763 0.0871 0.259 cMono_IL1B L2
ENSG00000116641 DOCK7 611828 sc-eQTL 2.28e-01 -0.111 0.0917 0.259 cMono_IL1B L2
ENSG00000125703 ATG4C 516082 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0378 0.0646 0.259 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -293507 sc-eQTL 2.85e-01 0.0978 0.0914 0.259 cMono_IL1B L2
ENSG00000162607 USP1 863917 sc-eQTL 1.28e-01 0.123 0.0804 0.259 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 -293197 sc-eQTL 7.10e-01 0.0361 0.0972 0.259 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 -67361 sc-eQTL 5.23e-01 -0.063 0.0985 0.259 cMono_S100A L2
ENSG00000116641 DOCK7 611828 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0227 0.0914 0.259 cMono_S100A L2
ENSG00000125703 ATG4C 516082 sc-eQTL 1.93e-01 0.103 0.0788 0.259 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -293507 sc-eQTL 1.94e-02 0.208 0.0881 0.259 cMono_S100A L2
ENSG00000162607 USP1 863917 sc-eQTL 4.25e-01 0.0734 0.0917 0.259 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 -293197 sc-eQTL 7.03e-01 0.0402 0.105 0.267 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 -67361 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0846 0.112 0.267 gdT L2
ENSG00000116641 DOCK7 611828 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0267 0.11 0.267 gdT L2
ENSG00000125703 ATG4C 516082 sc-eQTL 5.52e-01 0.0628 0.105 0.267 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -293507 sc-eQTL 1.38e-01 -0.166 0.111 0.267 gdT L2
ENSG00000162607 USP1 863917 sc-eQTL 7.34e-01 0.0361 0.106 0.267 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -223158 sc-eQTL 1.00e-01 0.18 0.109 0.267 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 -293197 sc-eQTL 2.72e-01 0.106 0.096 0.262 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -67361 sc-eQTL 7.47e-01 -0.029 0.0896 0.262 intMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 611828 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00295 0.0916 0.262 intMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 516082 sc-eQTL 6.93e-01 0.0346 0.0874 0.262 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -293507 sc-eQTL 1.84e-01 0.128 0.0959 0.262 intMono L2
ENSG00000162607 USP1 863917 sc-eQTL 8.89e-01 0.0137 0.0979 0.262 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -293197 sc-eQTL 3.07e-01 -0.0903 0.0882 0.253 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -67361 sc-eQTL 9.40e-01 0.00736 0.0971 0.253 ncMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 611828 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0808 0.0954 0.253 ncMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 516082 sc-eQTL 3.98e-01 0.0756 0.0891 0.253 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -293507 sc-eQTL 1.06e-01 0.15 0.0928 0.253 ncMono L2
ENSG00000162607 USP1 863917 sc-eQTL 2.53e-01 -0.109 0.0951 0.253 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -293197 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00474 0.104 0.266 pDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -67361 sc-eQTL 1.80e-01 -0.135 0.101 0.266 pDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 611828 sc-eQTL 5.03e-01 0.0694 0.103 0.266 pDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 516082 sc-eQTL 6.40e-01 0.0435 0.0927 0.266 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -293507 sc-eQTL 2.48e-02 0.232 0.102 0.266 pDC L2
ENSG00000162607 USP1 863917 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0603 0.106 0.266 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -223158 sc-eQTL 3.35e-02 -0.195 0.0908 0.266 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -293197 sc-eQTL 5.36e-01 0.0554 0.0894 0.259 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -67361 sc-eQTL 9.01e-02 0.167 0.0983 0.259 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 611828 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0766 0.0857 0.259 B_Memory LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 516082 sc-eQTL 3.60e-01 0.0635 0.0693 0.259 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -293507 sc-eQTL 7.78e-03 0.241 0.0897 0.259 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 863917 sc-eQTL 6.85e-01 0.036 0.0886 0.259 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -223158 sc-eQTL 2.73e-01 0.104 0.0948 0.259 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -293197 sc-eQTL 9.86e-01 0.00165 0.0937 0.259 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -67361 sc-eQTL 8.46e-01 0.0188 0.0965 0.259 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 611828 sc-eQTL 6.73e-01 0.0381 0.0901 0.259 B_Naive LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 516082 sc-eQTL 5.21e-01 0.0442 0.0687 0.259 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -293507 sc-eQTL 3.08e-01 0.099 0.097 0.259 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 863917 sc-eQTL 5.19e-01 0.0539 0.0835 0.259 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -223158 sc-eQTL 4.08e-01 0.0808 0.0976 0.259 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -293197 sc-eQTL 5.39e-01 0.0551 0.0895 0.259 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -67361 sc-eQTL 2.65e-01 -0.0967 0.0865 0.259 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 611828 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0696 0.0872 0.259 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 516082 sc-eQTL 4.77e-01 0.043 0.0603 0.259 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -293507 sc-eQTL 3.89e-02 0.184 0.0885 0.259 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 863917 sc-eQTL 1.57e-01 0.108 0.076 0.259 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -293197 sc-eQTL 9.30e-01 0.00745 0.0851 0.261 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -67361 sc-eQTL 9.22e-01 0.00951 0.0966 0.261 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 611828 sc-eQTL 9.81e-01 0.00227 0.0956 0.261 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 516082 sc-eQTL 3.46e-01 0.0768 0.0813 0.261 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -293507 sc-eQTL 1.71e-01 0.129 0.0942 0.261 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 863917 sc-eQTL 3.00e-01 -0.0921 0.0887 0.261 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -293197 sc-eQTL 2.59e-01 0.0816 0.0721 0.256 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -67361 sc-eQTL 8.23e-01 0.0195 0.0869 0.256 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 611828 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0448 0.0778 0.256 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 516082 sc-eQTL 8.20e-01 0.0177 0.0777 0.256 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -293507 sc-eQTL 3.87e-01 0.0796 0.0919 0.256 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 863917 sc-eQTL 5.26e-01 0.053 0.0835 0.256 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -223158 sc-eQTL 3.37e-01 0.0976 0.101 0.256 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000142856 ITGB3BP -293507 eQTL 2.89e-05 0.144 0.0343 0.0 0.0 0.227
ENSG00000185483 ROR1 -473803 pQTL 0.0483 0.031 0.0157 0.0 0.0 0.228

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000142856 ITGB3BP -293507 1.27e-06 1.07e-06 2.18e-07 1.14e-06 3.95e-07 6.05e-07 1.5e-06 4.22e-07 1.74e-06 6.61e-07 2.03e-06 9.21e-07 2.5e-06 2.86e-07 5.06e-07 1.01e-06 9.41e-07 1.06e-06 5.78e-07 4.38e-07 7.69e-07 1.91e-06 1.1e-06 5.76e-07 2.25e-06 8.55e-07 1.06e-06 9.6e-07 1.57e-06 1.22e-06 7.84e-07 2.81e-07 2.76e-07 5.59e-07 5.38e-07 5.4e-07 7.24e-07 3.25e-07 5.13e-07 2.11e-07 3.55e-07 1.6e-06 1.68e-07 8.06e-08 3.17e-07 2.13e-07 2.74e-07 1.41e-07 2.79e-07
ENSG00000230798 \N -24227 1.33e-05 1.45e-05 3.89e-06 1.01e-05 3.92e-06 7.99e-06 2.21e-05 3.48e-06 1.65e-05 8.14e-06 1.99e-05 8.01e-06 2.89e-05 6.39e-06 5.1e-06 1.03e-05 9.2e-06 1.53e-05 6.52e-06 5.37e-06 9.16e-06 1.62e-05 1.74e-05 8.06e-06 2.73e-05 5.99e-06 8.04e-06 7.64e-06 1.91e-05 2.19e-05 1.05e-05 1.63e-06 2.5e-06 7.37e-06 7.59e-06 5.47e-06 3.59e-06 2.99e-06 4.95e-06 3.36e-06 1.86e-06 1.88e-05 2.63e-06 5.25e-07 2.66e-06 2.95e-06 3.43e-06 1.69e-06 1.52e-06