logo

Genes within 1Mb (chr1:63292054:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -301357 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0713 0.108 0.147 B L1
ENSG00000088035 ALG6 -75521 sc-eQTL 4.59e-01 0.0833 0.112 0.147 B L1
ENSG00000116641 DOCK7 603668 sc-eQTL 3.74e-01 -0.0999 0.112 0.147 B L1
ENSG00000125703 ATG4C 507922 sc-eQTL 1.08e-01 -0.125 0.0776 0.147 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -301667 sc-eQTL 5.14e-01 0.0811 0.124 0.147 B L1
ENSG00000162607 USP1 855757 sc-eQTL 9.41e-01 0.00801 0.108 0.147 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -231318 sc-eQTL 5.20e-01 -0.082 0.127 0.147 B L1
ENSG00000079739 PGM1 -301357 sc-eQTL 9.16e-01 -0.01 0.0946 0.147 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 -75521 sc-eQTL 9.07e-01 0.0122 0.104 0.147 CD4T L1
ENSG00000116641 DOCK7 603668 sc-eQTL 2.94e-01 -0.111 0.105 0.147 CD4T L1
ENSG00000125703 ATG4C 507922 sc-eQTL 4.09e-01 0.0705 0.0852 0.147 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -301667 sc-eQTL 4.33e-01 0.095 0.121 0.147 CD4T L1
ENSG00000162607 USP1 855757 sc-eQTL 2.50e-01 0.0952 0.0826 0.147 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -231318 sc-eQTL 6.24e-01 0.0534 0.109 0.147 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 -301357 sc-eQTL 1.47e-01 -0.152 0.104 0.147 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 -75521 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0505 0.116 0.147 CD8T L1
ENSG00000116641 DOCK7 603668 sc-eQTL 6.30e-01 0.0566 0.117 0.147 CD8T L1
ENSG00000125703 ATG4C 507922 sc-eQTL 7.74e-01 -0.032 0.111 0.147 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -301667 sc-eQTL 6.69e-02 0.228 0.124 0.147 CD8T L1
ENSG00000162607 USP1 855757 sc-eQTL 1.76e-01 0.131 0.0966 0.147 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -231318 sc-eQTL 7.76e-01 0.0353 0.124 0.147 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 -301357 sc-eQTL 2.03e-01 -0.151 0.118 0.144 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 -75521 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0733 0.122 0.144 DC L1
ENSG00000116641 DOCK7 603668 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0569 0.126 0.144 DC L1
ENSG00000125703 ATG4C 507922 sc-eQTL 1.77e-01 0.133 0.0978 0.144 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -301667 sc-eQTL 1.84e-01 0.182 0.137 0.144 DC L1
ENSG00000162607 USP1 855757 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0813 0.12 0.144 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -231318 sc-eQTL 6.34e-01 -0.057 0.119 0.144 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 -301357 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0374 0.116 0.147 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 -75521 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00455 0.121 0.147 Mono L1
ENSG00000116641 DOCK7 603668 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0188 0.117 0.147 Mono L1
ENSG00000125703 ATG4C 507922 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0247 0.079 0.147 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -301667 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00716 0.125 0.147 Mono L1
ENSG00000162607 USP1 855757 sc-eQTL 9.37e-01 0.00812 0.103 0.147 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 -301357 sc-eQTL 5.58e-01 -0.058 0.0987 0.144 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 -75521 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0396 0.116 0.144 NK L1
ENSG00000116641 DOCK7 603668 sc-eQTL 2.65e-02 0.211 0.0943 0.144 NK L1
ENSG00000125703 ATG4C 507922 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00182 0.102 0.144 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -301667 sc-eQTL 2.61e-03 0.38 0.125 0.144 NK L1
ENSG00000162607 USP1 855757 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0652 0.114 0.144 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -231318 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00714 0.138 0.144 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 -301357 sc-eQTL 2.69e-01 -0.12 0.108 0.147 Other_T L1
ENSG00000088035 ALG6 -75521 sc-eQTL 6.88e-02 -0.198 0.108 0.147 Other_T L1
ENSG00000116641 DOCK7 603668 sc-eQTL 7.59e-01 0.0341 0.111 0.147 Other_T L1
ENSG00000125703 ATG4C 507922 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0854 0.0962 0.147 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -301667 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0684 0.0853 0.147 Other_T L1
ENSG00000162607 USP1 855757 sc-eQTL 1.64e-01 -0.103 0.0737 0.147 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -231318 sc-eQTL 1.98e-01 0.17 0.131 0.147 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -301357 sc-eQTL 3.07e-01 -0.147 0.143 0.158 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 -75521 sc-eQTL 7.98e-01 0.0354 0.138 0.158 B_Activated L2
ENSG00000116641 DOCK7 603668 sc-eQTL 7.93e-01 0.0338 0.128 0.158 B_Activated L2
ENSG00000125703 ATG4C 507922 sc-eQTL 7.88e-02 -0.237 0.134 0.158 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -301667 sc-eQTL 7.51e-01 0.042 0.132 0.158 B_Activated L2
ENSG00000162607 USP1 855757 sc-eQTL 9.23e-02 0.24 0.142 0.158 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -231318 sc-eQTL 4.42e-01 -0.096 0.125 0.158 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 -301357 sc-eQTL 4.93e-01 -0.089 0.13 0.148 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 -75521 sc-eQTL 4.60e-01 0.0975 0.132 0.148 B_Intermediate L2
ENSG00000116641 DOCK7 603668 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0868 0.126 0.148 B_Intermediate L2
ENSG00000125703 ATG4C 507922 sc-eQTL 3.74e-01 -0.0949 0.106 0.148 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -301667 sc-eQTL 7.84e-01 0.0348 0.127 0.148 B_Intermediate L2
ENSG00000162607 USP1 855757 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0447 0.127 0.148 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -231318 sc-eQTL 5.56e-01 0.0741 0.126 0.148 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 -301357 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0303 0.127 0.149 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 -75521 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0794 0.129 0.149 B_Memory L2
ENSG00000116641 DOCK7 603668 sc-eQTL 4.37e-01 -0.094 0.121 0.149 B_Memory L2
ENSG00000125703 ATG4C 507922 sc-eQTL 3.17e-01 0.115 0.115 0.149 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -301667 sc-eQTL 2.61e-01 -0.148 0.131 0.149 B_Memory L2
ENSG00000162607 USP1 855757 sc-eQTL 3.83e-01 0.116 0.132 0.149 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -231318 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0381 0.13 0.149 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 -301357 sc-eQTL 1.38e-01 -0.191 0.128 0.147 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 -75521 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0683 0.129 0.147 B_Naive1 L2
ENSG00000116641 DOCK7 603668 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0977 0.124 0.147 B_Naive1 L2
ENSG00000125703 ATG4C 507922 sc-eQTL 2.58e-01 -0.108 0.0951 0.147 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -301667 sc-eQTL 1.48e-01 0.183 0.126 0.147 B_Naive1 L2
ENSG00000162607 USP1 855757 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0732 0.111 0.147 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -231318 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0888 0.135 0.147 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 -301357 sc-eQTL 6.99e-01 0.0487 0.126 0.148 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 -75521 sc-eQTL 5.58e-02 0.251 0.13 0.148 B_Naive2 L2
ENSG00000116641 DOCK7 603668 sc-eQTL 5.68e-01 0.0722 0.126 0.148 B_Naive2 L2
ENSG00000125703 ATG4C 507922 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0369 0.122 0.148 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -301667 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0692 0.132 0.148 B_Naive2 L2
ENSG00000162607 USP1 855757 sc-eQTL 9.91e-01 0.00138 0.126 0.148 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -231318 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0693 0.131 0.148 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 -301357 sc-eQTL 6.31e-01 0.063 0.131 0.152 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -75521 sc-eQTL 1.64e-01 -0.192 0.138 0.152 CD4_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 603668 sc-eQTL 2.04e-01 0.154 0.12 0.152 CD4_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 507922 sc-eQTL 5.99e-01 -0.066 0.125 0.152 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -301667 sc-eQTL 6.44e-01 0.0619 0.134 0.152 CD4_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 855757 sc-eQTL 2.99e-01 0.132 0.127 0.152 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -231318 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0192 0.127 0.152 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -301357 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00819 0.106 0.147 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -75521 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0776 0.115 0.147 CD4_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 603668 sc-eQTL 2.39e-02 -0.254 0.112 0.147 CD4_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 507922 sc-eQTL 5.83e-01 0.055 0.1 0.147 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -301667 sc-eQTL 9.08e-01 0.0141 0.122 0.147 CD4_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 855757 sc-eQTL 2.72e-01 0.103 0.0931 0.147 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -231318 sc-eQTL 7.58e-01 0.0375 0.121 0.147 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -301357 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0323 0.11 0.147 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -75521 sc-eQTL 2.06e-01 0.161 0.127 0.147 CD4_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 603668 sc-eQTL 6.11e-01 0.0576 0.113 0.147 CD4_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 507922 sc-eQTL 1.30e-01 0.167 0.11 0.147 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -301667 sc-eQTL 2.68e-01 0.144 0.13 0.147 CD4_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 855757 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00838 0.106 0.147 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -231318 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0695 0.126 0.147 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -301357 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0604 0.133 0.147 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -75521 sc-eQTL 6.83e-01 0.0545 0.133 0.147 CD4_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 603668 sc-eQTL 9.27e-01 -0.0118 0.13 0.147 CD4_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 507922 sc-eQTL 6.14e-01 0.0637 0.126 0.147 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -301667 sc-eQTL 6.71e-02 0.238 0.129 0.147 CD4_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 855757 sc-eQTL 3.11e-01 0.125 0.123 0.147 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -231318 sc-eQTL 9.24e-01 -0.0129 0.135 0.147 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -301357 sc-eQTL 9.43e-02 -0.197 0.117 0.147 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -75521 sc-eQTL 4.16e-01 -0.102 0.125 0.147 CD8_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 603668 sc-eQTL 3.97e-01 0.101 0.119 0.147 CD8_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 507922 sc-eQTL 4.24e-01 -0.101 0.126 0.147 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -301667 sc-eQTL 3.53e-01 0.122 0.131 0.147 CD8_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 855757 sc-eQTL 6.73e-01 0.0497 0.118 0.147 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -231318 sc-eQTL 1.62e-01 0.188 0.134 0.147 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -301357 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0325 0.123 0.147 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -75521 sc-eQTL 7.15e-01 0.0466 0.127 0.147 CD8_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 603668 sc-eQTL 6.47e-01 0.0603 0.132 0.147 CD8_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 507922 sc-eQTL 9.08e-01 0.0146 0.127 0.147 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -301667 sc-eQTL 4.40e-02 0.257 0.127 0.147 CD8_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 855757 sc-eQTL 3.43e-01 0.103 0.108 0.147 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -231318 sc-eQTL 2.06e-01 0.153 0.12 0.147 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -301357 sc-eQTL 5.88e-01 0.0722 0.133 0.148 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -75521 sc-eQTL 3.11e-01 -0.136 0.134 0.148 CD8_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 603668 sc-eQTL 5.41e-01 0.0804 0.131 0.148 CD8_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 507922 sc-eQTL 1.75e-01 0.182 0.134 0.148 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -301667 sc-eQTL 2.60e-01 0.147 0.13 0.148 CD8_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 855757 sc-eQTL 3.21e-01 -0.125 0.125 0.148 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -231318 sc-eQTL 4.57e-01 0.0991 0.133 0.148 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -301357 sc-eQTL 1.53e-01 -0.187 0.13 0.153 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -75521 sc-eQTL 3.42e-01 -0.125 0.131 0.153 CD8_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 603668 sc-eQTL 2.11e-01 -0.159 0.127 0.153 CD8_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 507922 sc-eQTL 4.67e-01 0.0891 0.122 0.153 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -301667 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00223 0.133 0.153 CD8_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 855757 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00238 0.127 0.153 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -231318 sc-eQTL 2.28e-01 -0.155 0.128 0.153 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -301357 sc-eQTL 4.74e-02 -0.254 0.128 0.149 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 -75521 sc-eQTL 2.76e-01 -0.139 0.127 0.149 MAIT L2
ENSG00000116641 DOCK7 603668 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0341 0.122 0.149 MAIT L2
ENSG00000125703 ATG4C 507922 sc-eQTL 2.20e-01 -0.158 0.128 0.149 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -301667 sc-eQTL 5.66e-01 0.0742 0.129 0.149 MAIT L2
ENSG00000162607 USP1 855757 sc-eQTL 8.88e-01 -0.018 0.128 0.149 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -231318 sc-eQTL 1.01e-01 0.218 0.132 0.149 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 -301357 sc-eQTL 3.83e-01 -0.112 0.129 0.149 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 -75521 sc-eQTL 1.56e-01 -0.187 0.131 0.149 NK_CD56bright L2
ENSG00000116641 DOCK7 603668 sc-eQTL 3.60e-01 0.105 0.114 0.149 NK_CD56bright L2
ENSG00000125703 ATG4C 507922 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00886 0.128 0.149 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -301667 sc-eQTL 8.95e-03 0.345 0.131 0.149 NK_CD56bright L2
ENSG00000162607 USP1 855757 sc-eQTL 8.41e-01 0.0276 0.137 0.149 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -231318 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0124 0.131 0.149 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 -301357 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0146 0.102 0.144 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 -75521 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0631 0.13 0.144 NK_CD56dim L2
ENSG00000116641 DOCK7 603668 sc-eQTL 8.38e-01 0.0231 0.113 0.144 NK_CD56dim L2
ENSG00000125703 ATG4C 507922 sc-eQTL 7.01e-01 0.0441 0.115 0.144 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -301667 sc-eQTL 8.14e-03 0.343 0.128 0.144 NK_CD56dim L2
ENSG00000162607 USP1 855757 sc-eQTL 9.28e-01 0.0115 0.127 0.144 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -231318 sc-eQTL 2.30e-01 0.169 0.14 0.144 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 -301357 sc-eQTL 3.46e-01 -0.133 0.141 0.146 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 -75521 sc-eQTL 9.39e-01 0.0112 0.147 0.146 NK_HLA L2
ENSG00000116641 DOCK7 603668 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0307 0.112 0.146 NK_HLA L2
ENSG00000125703 ATG4C 507922 sc-eQTL 2.33e-01 -0.156 0.13 0.146 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -301667 sc-eQTL 1.70e-01 0.188 0.136 0.146 NK_HLA L2
ENSG00000162607 USP1 855757 sc-eQTL 2.51e-01 -0.164 0.143 0.146 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -231318 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0475 0.13 0.146 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 -301357 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0581 0.112 0.144 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 -75521 sc-eQTL 6.51e-01 0.0575 0.127 0.144 NK_cytokine L2
ENSG00000116641 DOCK7 603668 sc-eQTL 5.28e-03 0.326 0.116 0.144 NK_cytokine L2
ENSG00000125703 ATG4C 507922 sc-eQTL 8.60e-01 0.0213 0.12 0.144 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -301667 sc-eQTL 6.19e-01 0.0621 0.125 0.144 NK_cytokine L2
ENSG00000162607 USP1 855757 sc-eQTL 9.81e-01 -0.0031 0.131 0.144 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -231318 sc-eQTL 2.30e-01 -0.159 0.132 0.144 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 -301357 sc-eQTL 3.97e-01 0.138 0.162 0.141 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 -75521 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0605 0.171 0.141 PB L2
ENSG00000116641 DOCK7 603668 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0841 0.183 0.141 PB L2
ENSG00000125703 ATG4C 507922 sc-eQTL 2.25e-02 -0.361 0.156 0.141 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -301667 sc-eQTL 2.23e-01 0.194 0.158 0.141 PB L2
ENSG00000162607 USP1 855757 sc-eQTL 9.17e-01 0.0166 0.159 0.141 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -231318 sc-eQTL 4.13e-01 0.143 0.174 0.141 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 -301357 sc-eQTL 2.78e-01 0.129 0.118 0.146 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 -75521 sc-eQTL 5.82e-01 0.0666 0.121 0.146 Pro_T L2
ENSG00000116641 DOCK7 603668 sc-eQTL 7.32e-01 0.0415 0.121 0.146 Pro_T L2
ENSG00000125703 ATG4C 507922 sc-eQTL 3.80e-01 0.0932 0.106 0.146 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -301667 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0702 0.106 0.146 Pro_T L2
ENSG00000162607 USP1 855757 sc-eQTL 4.19e-01 0.0591 0.0731 0.146 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -231318 sc-eQTL 6.07e-01 0.0637 0.124 0.146 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 -301357 sc-eQTL 6.10e-01 0.0649 0.127 0.147 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 -75521 sc-eQTL 4.86e-01 0.0949 0.136 0.147 Treg L2
ENSG00000116641 DOCK7 603668 sc-eQTL 5.52e-02 0.239 0.124 0.147 Treg L2
ENSG00000125703 ATG4C 507922 sc-eQTL 3.91e-01 -0.11 0.127 0.147 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -301667 sc-eQTL 7.36e-01 0.0451 0.134 0.147 Treg L2
ENSG00000162607 USP1 855757 sc-eQTL 7.30e-01 0.0446 0.129 0.147 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -231318 sc-eQTL 9.58e-02 0.212 0.127 0.147 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 -301357 sc-eQTL 1.51e-01 -0.184 0.128 0.149 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -75521 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0941 0.13 0.149 cDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 603668 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0451 0.128 0.149 cDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 507922 sc-eQTL 6.95e-02 0.201 0.11 0.149 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -301667 sc-eQTL 2.50e-01 0.162 0.14 0.149 cDC L2
ENSG00000162607 USP1 855757 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0327 0.125 0.149 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -231318 sc-eQTL 3.09e-01 0.115 0.113 0.149 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 -301357 sc-eQTL 2.92e-01 -0.128 0.121 0.147 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 -75521 sc-eQTL 7.41e-01 0.0402 0.121 0.147 cMono_IL1B L2
ENSG00000116641 DOCK7 603668 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00735 0.128 0.147 cMono_IL1B L2
ENSG00000125703 ATG4C 507922 sc-eQTL 8.53e-01 0.0167 0.09 0.147 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -301667 sc-eQTL 5.83e-01 0.07 0.127 0.147 cMono_IL1B L2
ENSG00000162607 USP1 855757 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0575 0.112 0.147 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 -301357 sc-eQTL 4.57e-01 0.0998 0.134 0.147 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 -75521 sc-eQTL 2.92e-01 0.143 0.136 0.147 cMono_S100A L2
ENSG00000116641 DOCK7 603668 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00735 0.126 0.147 cMono_S100A L2
ENSG00000125703 ATG4C 507922 sc-eQTL 8.96e-01 0.0142 0.109 0.147 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -301667 sc-eQTL 5.27e-01 0.0779 0.123 0.147 cMono_S100A L2
ENSG00000162607 USP1 855757 sc-eQTL 3.19e-01 0.126 0.126 0.147 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 -301357 sc-eQTL 2.60e-01 -0.164 0.145 0.158 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 -75521 sc-eQTL 5.47e-02 -0.297 0.153 0.158 gdT L2
ENSG00000116641 DOCK7 603668 sc-eQTL 3.75e-01 0.135 0.152 0.158 gdT L2
ENSG00000125703 ATG4C 507922 sc-eQTL 7.74e-01 0.0418 0.145 0.158 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -301667 sc-eQTL 3.79e-01 -0.136 0.154 0.158 gdT L2
ENSG00000162607 USP1 855757 sc-eQTL 3.67e-01 -0.132 0.146 0.158 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -231318 sc-eQTL 8.84e-01 0.0222 0.152 0.158 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 -301357 sc-eQTL 9.31e-02 -0.233 0.138 0.138 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -75521 sc-eQTL 1.53e-01 -0.185 0.129 0.138 intMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 603668 sc-eQTL 9.36e-01 0.0107 0.132 0.138 intMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 507922 sc-eQTL 2.37e-01 -0.149 0.126 0.138 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -301667 sc-eQTL 8.78e-01 0.0214 0.139 0.138 intMono L2
ENSG00000162607 USP1 855757 sc-eQTL 8.38e-02 0.244 0.14 0.138 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -301357 sc-eQTL 3.18e-01 0.125 0.125 0.14 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -75521 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0623 0.137 0.14 ncMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 603668 sc-eQTL 3.80e-01 0.119 0.135 0.14 ncMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 507922 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0337 0.126 0.14 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -301667 sc-eQTL 1.64e-01 -0.184 0.132 0.14 ncMono L2
ENSG00000162607 USP1 855757 sc-eQTL 6.12e-01 0.0685 0.135 0.14 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -301357 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0421 0.149 0.144 pDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -75521 sc-eQTL 3.96e-01 -0.123 0.145 0.144 pDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 603668 sc-eQTL 7.77e-01 -0.042 0.148 0.144 pDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 507922 sc-eQTL 6.52e-01 -0.06 0.133 0.144 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -301667 sc-eQTL 4.68e-01 0.108 0.149 0.144 pDC L2
ENSG00000162607 USP1 855757 sc-eQTL 4.81e-01 0.107 0.152 0.144 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -231318 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0351 0.132 0.144 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -301357 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0754 0.12 0.147 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -75521 sc-eQTL 9.02e-01 0.0164 0.133 0.147 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 603668 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0963 0.115 0.147 B_Memory LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 507922 sc-eQTL 2.95e-01 -0.0976 0.0931 0.147 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -301667 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0437 0.123 0.147 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 855757 sc-eQTL 7.01e-01 0.0457 0.119 0.147 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -231318 sc-eQTL 8.02e-01 0.0321 0.128 0.147 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -301357 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0476 0.125 0.147 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -75521 sc-eQTL 7.17e-01 0.0467 0.129 0.147 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 603668 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00265 0.12 0.147 B_Naive LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 507922 sc-eQTL 4.13e-01 -0.0752 0.0916 0.147 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -301667 sc-eQTL 5.28e-01 0.082 0.13 0.147 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 855757 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0724 0.111 0.147 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -231318 sc-eQTL 4.10e-01 -0.107 0.13 0.147 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -301357 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00967 0.124 0.147 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -75521 sc-eQTL 4.88e-01 0.0832 0.12 0.147 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 603668 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0712 0.121 0.147 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 507922 sc-eQTL 9.80e-01 0.00212 0.0834 0.147 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -301667 sc-eQTL 6.50e-01 0.0561 0.123 0.147 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 855757 sc-eQTL 8.19e-01 0.0241 0.105 0.147 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -301357 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0768 0.12 0.142 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -75521 sc-eQTL 8.55e-02 -0.235 0.136 0.142 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 603668 sc-eQTL 5.41e-01 0.0827 0.135 0.142 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 507922 sc-eQTL 3.28e-01 -0.113 0.115 0.142 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -301667 sc-eQTL 2.77e-01 -0.146 0.134 0.142 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 855757 sc-eQTL 4.31e-01 0.0993 0.126 0.142 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -301357 sc-eQTL 6.99e-01 -0.039 0.101 0.144 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -75521 sc-eQTL 8.35e-01 0.0252 0.121 0.144 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 603668 sc-eQTL 1.34e-01 0.162 0.108 0.144 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 507922 sc-eQTL 9.30e-01 -0.0095 0.108 0.144 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -301667 sc-eQTL 3.61e-02 0.268 0.127 0.144 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 855757 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0885 0.116 0.144 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -231318 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0168 0.142 0.144 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079739 PGM1 -301357 eQTL 0.00965 -0.0564 0.0217 0.0 0.0 0.192
ENSG00000142856 ITGB3BP -301667 eQTL 0.0245 0.0804 0.0357 0.0 0.0 0.192

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000079739 PGM1 -301357 1.3e-06 9.1e-07 3.28e-07 6.38e-07 3.36e-07 4.53e-07 1.32e-06 3.56e-07 1.39e-06 4.32e-07 1.48e-06 6.57e-07 1.99e-06 2.83e-07 5.72e-07 8.62e-07 8e-07 6.56e-07 7.52e-07 6.33e-07 5.61e-07 1.35e-06 9.26e-07 6.44e-07 1.97e-06 4.79e-07 8.36e-07 7.59e-07 1.29e-06 1.22e-06 6.02e-07 1.72e-07 2e-07 6.78e-07 4.63e-07 4.37e-07 5.17e-07 1.54e-07 3.87e-07 3.21e-07 2.87e-07 1.59e-06 6.65e-08 2.66e-08 2.16e-07 1.34e-07 2.27e-07 8.93e-08 1.36e-07