logo

Genes within 1Mb (chr1:63236307:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -357104 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0325 0.0938 0.179 B L1
ENSG00000088035 ALG6 -131268 sc-eQTL 1.87e-04 -0.358 0.094 0.179 B L1
ENSG00000116641 DOCK7 547921 sc-eQTL 8.31e-01 0.0208 0.0972 0.179 B L1
ENSG00000125703 ATG4C 452175 sc-eQTL 8.45e-01 0.0132 0.0676 0.179 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -357414 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0661 0.107 0.179 B L1
ENSG00000162607 USP1 800010 sc-eQTL 2.24e-01 -0.114 0.093 0.179 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -287065 sc-eQTL 5.96e-01 0.0585 0.11 0.179 B L1
ENSG00000079739 PGM1 -357104 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0206 0.0795 0.179 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 -131268 sc-eQTL 2.53e-01 0.1 0.0875 0.179 CD4T L1
ENSG00000116641 DOCK7 547921 sc-eQTL 2.87e-01 0.0946 0.0887 0.179 CD4T L1
ENSG00000125703 ATG4C 452175 sc-eQTL 1.40e-01 0.106 0.0714 0.179 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -357414 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0632 0.102 0.179 CD4T L1
ENSG00000162607 USP1 800010 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0171 0.0696 0.179 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -287065 sc-eQTL 4.22e-01 0.0735 0.0913 0.179 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 -357104 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0218 0.0879 0.179 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 -131268 sc-eQTL 2.34e-01 0.115 0.0966 0.179 CD8T L1
ENSG00000116641 DOCK7 547921 sc-eQTL 2.02e-01 0.125 0.0978 0.179 CD8T L1
ENSG00000125703 ATG4C 452175 sc-eQTL 5.14e-01 -0.061 0.0932 0.179 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -357414 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0253 0.104 0.179 CD8T L1
ENSG00000162607 USP1 800010 sc-eQTL 2.43e-01 -0.0948 0.081 0.179 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -287065 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00696 0.104 0.179 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 -357104 sc-eQTL 5.60e-01 0.0575 0.0985 0.178 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 -131268 sc-eQTL 6.35e-01 0.0483 0.102 0.178 DC L1
ENSG00000116641 DOCK7 547921 sc-eQTL 7.27e-02 0.187 0.103 0.178 DC L1
ENSG00000125703 ATG4C 452175 sc-eQTL 1.71e-01 0.112 0.0812 0.178 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -357414 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0968 0.114 0.178 DC L1
ENSG00000162607 USP1 800010 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0361 0.0995 0.178 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -287065 sc-eQTL 1.74e-01 0.135 0.0988 0.178 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 -357104 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00574 0.0955 0.179 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 -131268 sc-eQTL 3.07e-01 -0.102 0.0994 0.179 Mono L1
ENSG00000116641 DOCK7 547921 sc-eQTL 2.85e-01 0.103 0.0962 0.179 Mono L1
ENSG00000125703 ATG4C 452175 sc-eQTL 9.00e-01 0.00822 0.0652 0.179 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -357414 sc-eQTL 1.25e-01 0.158 0.102 0.179 Mono L1
ENSG00000162607 USP1 800010 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0557 0.0845 0.179 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 -357104 sc-eQTL 3.96e-01 0.0692 0.0815 0.18 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 -131268 sc-eQTL 6.56e-01 0.0427 0.0957 0.18 NK L1
ENSG00000116641 DOCK7 547921 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00221 0.0788 0.18 NK L1
ENSG00000125703 ATG4C 452175 sc-eQTL 4.64e-01 -0.062 0.0845 0.18 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -357414 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0773 0.105 0.18 NK L1
ENSG00000162607 USP1 800010 sc-eQTL 6.66e-01 0.0406 0.094 0.18 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -287065 sc-eQTL 3.29e-01 -0.111 0.114 0.18 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 -357104 sc-eQTL 3.89e-01 0.0818 0.0947 0.179 Other_T L1
ENSG00000088035 ALG6 -131268 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0818 0.0952 0.179 Other_T L1
ENSG00000116641 DOCK7 547921 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0513 0.0973 0.179 Other_T L1
ENSG00000125703 ATG4C 452175 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0121 0.0843 0.179 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -357414 sc-eQTL 8.79e-01 0.0114 0.0747 0.179 Other_T L1
ENSG00000162607 USP1 800010 sc-eQTL 7.62e-01 0.0196 0.0648 0.179 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -287065 sc-eQTL 1.40e-01 -0.17 0.115 0.179 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -357104 sc-eQTL 6.00e-01 0.0654 0.125 0.181 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 -131268 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0674 0.119 0.181 B_Activated L2
ENSG00000116641 DOCK7 547921 sc-eQTL 1.92e-01 0.145 0.111 0.181 B_Activated L2
ENSG00000125703 ATG4C 452175 sc-eQTL 5.18e-01 0.0756 0.117 0.181 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -357414 sc-eQTL 1.42e-01 0.168 0.114 0.181 B_Activated L2
ENSG00000162607 USP1 800010 sc-eQTL 1.47e-01 0.18 0.123 0.181 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -287065 sc-eQTL 3.29e-01 -0.106 0.108 0.181 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 -357104 sc-eQTL 6.27e-01 -0.055 0.113 0.18 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 -131268 sc-eQTL 6.46e-02 -0.211 0.114 0.18 B_Intermediate L2
ENSG00000116641 DOCK7 547921 sc-eQTL 9.58e-01 0.00574 0.11 0.18 B_Intermediate L2
ENSG00000125703 ATG4C 452175 sc-eQTL 3.04e-01 0.0953 0.0925 0.18 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -357414 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0348 0.11 0.18 B_Intermediate L2
ENSG00000162607 USP1 800010 sc-eQTL 2.29e-01 -0.133 0.11 0.18 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -287065 sc-eQTL 9.64e-01 0.00492 0.109 0.18 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 -357104 sc-eQTL 3.83e-01 -0.0965 0.11 0.181 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 -131268 sc-eQTL 6.14e-04 -0.38 0.109 0.181 B_Memory L2
ENSG00000116641 DOCK7 547921 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0247 0.105 0.181 B_Memory L2
ENSG00000125703 ATG4C 452175 sc-eQTL 6.99e-01 0.0388 0.1 0.181 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -357414 sc-eQTL 2.09e-01 -0.144 0.114 0.181 B_Memory L2
ENSG00000162607 USP1 800010 sc-eQTL 6.89e-02 -0.21 0.115 0.181 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -287065 sc-eQTL 7.83e-01 0.0314 0.114 0.181 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 -357104 sc-eQTL 7.25e-01 0.0388 0.11 0.179 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 -131268 sc-eQTL 2.18e-03 -0.336 0.108 0.179 B_Naive1 L2
ENSG00000116641 DOCK7 547921 sc-eQTL 2.90e-01 0.112 0.106 0.179 B_Naive1 L2
ENSG00000125703 ATG4C 452175 sc-eQTL 1.78e-01 0.11 0.0813 0.179 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -357414 sc-eQTL 9.73e-01 0.00373 0.108 0.179 B_Naive1 L2
ENSG00000162607 USP1 800010 sc-eQTL 8.59e-01 -0.017 0.0952 0.179 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -287065 sc-eQTL 5.65e-01 0.0665 0.115 0.179 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 -357104 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0495 0.109 0.18 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 -131268 sc-eQTL 6.73e-01 0.048 0.114 0.18 B_Naive2 L2
ENSG00000116641 DOCK7 547921 sc-eQTL 4.17e-01 -0.0887 0.109 0.18 B_Naive2 L2
ENSG00000125703 ATG4C 452175 sc-eQTL 8.73e-01 0.0169 0.105 0.18 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -357414 sc-eQTL 3.23e-01 -0.113 0.114 0.18 B_Naive2 L2
ENSG00000162607 USP1 800010 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0151 0.109 0.18 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -287065 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0409 0.114 0.18 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 -357104 sc-eQTL 7.98e-02 0.191 0.109 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -131268 sc-eQTL 1.31e-01 -0.175 0.115 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 547921 sc-eQTL 8.84e-01 0.0147 0.101 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 452175 sc-eQTL 1.66e-01 0.145 0.104 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -357414 sc-eQTL 6.61e-01 0.0491 0.112 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 800010 sc-eQTL 3.22e-01 0.106 0.106 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -287065 sc-eQTL 5.48e-02 0.204 0.105 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -357104 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0342 0.0898 0.179 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -131268 sc-eQTL 3.98e-02 0.2 0.0966 0.179 CD4_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 547921 sc-eQTL 4.03e-01 0.0803 0.0957 0.179 CD4_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 452175 sc-eQTL 4.99e-01 0.0573 0.0847 0.179 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -357414 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0443 0.104 0.179 CD4_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 800010 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0255 0.0791 0.179 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -287065 sc-eQTL 5.92e-01 0.0551 0.103 0.179 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -357104 sc-eQTL 1.63e-01 -0.129 0.0924 0.179 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -131268 sc-eQTL 3.34e-01 -0.104 0.108 0.179 CD4_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 547921 sc-eQTL 9.80e-01 0.00238 0.0955 0.179 CD4_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 452175 sc-eQTL 3.88e-01 0.0803 0.0928 0.179 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -357414 sc-eQTL 8.61e-01 0.0191 0.11 0.179 CD4_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 800010 sc-eQTL 3.31e-01 -0.0874 0.0897 0.179 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -287065 sc-eQTL 2.44e-01 0.124 0.106 0.179 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -357104 sc-eQTL 4.00e-01 0.0939 0.111 0.179 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -131268 sc-eQTL 2.91e-01 -0.118 0.112 0.179 CD4_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 547921 sc-eQTL 8.25e-01 0.0241 0.109 0.179 CD4_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 452175 sc-eQTL 3.03e-01 -0.109 0.106 0.179 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -357414 sc-eQTL 8.44e-02 -0.188 0.109 0.179 CD4_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 800010 sc-eQTL 2.63e-01 0.116 0.103 0.179 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -287065 sc-eQTL 6.32e-01 0.0543 0.113 0.179 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -357104 sc-eQTL 1.47e-01 0.144 0.0988 0.179 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -131268 sc-eQTL 9.25e-01 -0.00999 0.106 0.179 CD8_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 547921 sc-eQTL 9.19e-01 0.0102 0.1 0.179 CD8_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 452175 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0788 0.107 0.179 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -357414 sc-eQTL 7.94e-01 -0.029 0.111 0.179 CD8_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 800010 sc-eQTL 1.35e-01 -0.148 0.0988 0.179 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -287065 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0521 0.114 0.179 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -357104 sc-eQTL 4.90e-01 0.0698 0.101 0.179 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -131268 sc-eQTL 2.37e-01 0.124 0.104 0.179 CD8_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 547921 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00586 0.108 0.179 CD8_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 452175 sc-eQTL 3.25e-01 0.102 0.104 0.179 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -357414 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0618 0.105 0.179 CD8_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 800010 sc-eQTL 7.21e-01 0.0317 0.0889 0.179 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -287065 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0557 0.0991 0.179 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -357104 sc-eQTL 9.95e-01 0.000718 0.114 0.176 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -131268 sc-eQTL 1.49e-02 0.28 0.114 0.176 CD8_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 547921 sc-eQTL 5.54e-01 0.0669 0.113 0.176 CD8_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 452175 sc-eQTL 3.95e-01 0.0983 0.115 0.176 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -357414 sc-eQTL 7.72e-01 0.0325 0.112 0.176 CD8_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 800010 sc-eQTL 8.39e-01 -0.022 0.108 0.176 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -287065 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0664 0.114 0.176 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -357104 sc-eQTL 7.41e-02 -0.201 0.112 0.18 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -131268 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0379 0.113 0.18 CD8_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 547921 sc-eQTL 6.01e-01 0.0575 0.11 0.18 CD8_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 452175 sc-eQTL 3.75e-01 -0.0938 0.105 0.18 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -357414 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0335 0.114 0.18 CD8_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 800010 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0133 0.109 0.18 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -287065 sc-eQTL 1.77e-01 -0.149 0.11 0.18 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -357104 sc-eQTL 6.44e-01 -0.049 0.106 0.18 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 -131268 sc-eQTL 1.60e-01 -0.147 0.104 0.18 MAIT L2
ENSG00000116641 DOCK7 547921 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0265 0.101 0.18 MAIT L2
ENSG00000125703 ATG4C 452175 sc-eQTL 8.29e-02 0.183 0.105 0.18 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -357414 sc-eQTL 4.24e-01 -0.085 0.106 0.18 MAIT L2
ENSG00000162607 USP1 800010 sc-eQTL 2.36e-01 -0.125 0.105 0.18 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -287065 sc-eQTL 2.68e-02 -0.241 0.108 0.18 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 -357104 sc-eQTL 4.74e-01 0.0771 0.107 0.182 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 -131268 sc-eQTL 6.67e-01 0.0476 0.11 0.182 NK_CD56bright L2
ENSG00000116641 DOCK7 547921 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0542 0.0955 0.182 NK_CD56bright L2
ENSG00000125703 ATG4C 452175 sc-eQTL 1.23e-01 -0.165 0.106 0.182 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -357414 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0506 0.111 0.182 NK_CD56bright L2
ENSG00000162607 USP1 800010 sc-eQTL 3.30e-03 0.334 0.112 0.182 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -287065 sc-eQTL 2.28e-01 -0.132 0.109 0.182 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 -357104 sc-eQTL 5.06e-01 0.0567 0.085 0.181 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 -131268 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0737 0.108 0.181 NK_CD56dim L2
ENSG00000116641 DOCK7 547921 sc-eQTL 3.64e-01 -0.0854 0.0938 0.181 NK_CD56dim L2
ENSG00000125703 ATG4C 452175 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0267 0.0954 0.181 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -357414 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0798 0.108 0.181 NK_CD56dim L2
ENSG00000162607 USP1 800010 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0603 0.105 0.181 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -287065 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0778 0.117 0.181 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 -357104 sc-eQTL 9.94e-01 0.000889 0.116 0.183 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 -131268 sc-eQTL 2.82e-01 0.13 0.12 0.183 NK_HLA L2
ENSG00000116641 DOCK7 547921 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0696 0.0919 0.183 NK_HLA L2
ENSG00000125703 ATG4C 452175 sc-eQTL 2.58e-01 0.121 0.107 0.183 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -357414 sc-eQTL 6.53e-01 0.0507 0.112 0.183 NK_HLA L2
ENSG00000162607 USP1 800010 sc-eQTL 1.67e-01 0.162 0.117 0.183 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -287065 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0205 0.107 0.183 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 -357104 sc-eQTL 4.58e-01 0.0688 0.0926 0.181 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 -131268 sc-eQTL 8.46e-01 0.0204 0.105 0.181 NK_cytokine L2
ENSG00000116641 DOCK7 547921 sc-eQTL 7.30e-01 0.0335 0.097 0.181 NK_cytokine L2
ENSG00000125703 ATG4C 452175 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0454 0.0992 0.181 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -357414 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00811 0.103 0.181 NK_cytokine L2
ENSG00000162607 USP1 800010 sc-eQTL 7.56e-01 0.0337 0.108 0.181 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -287065 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0565 0.109 0.181 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 -357104 sc-eQTL 1.47e-01 -0.202 0.139 0.167 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 -131268 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0761 0.147 0.167 PB L2
ENSG00000116641 DOCK7 547921 sc-eQTL 3.91e-01 -0.135 0.157 0.167 PB L2
ENSG00000125703 ATG4C 452175 sc-eQTL 2.94e-02 0.296 0.134 0.167 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -357414 sc-eQTL 2.94e-01 0.143 0.136 0.167 PB L2
ENSG00000162607 USP1 800010 sc-eQTL 2.70e-01 0.15 0.135 0.167 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -287065 sc-eQTL 2.99e-01 -0.156 0.149 0.167 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 -357104 sc-eQTL 7.21e-01 0.0362 0.101 0.178 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 -131268 sc-eQTL 8.07e-02 -0.179 0.102 0.178 Pro_T L2
ENSG00000116641 DOCK7 547921 sc-eQTL 7.01e-02 -0.186 0.102 0.178 Pro_T L2
ENSG00000125703 ATG4C 452175 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0339 0.0903 0.178 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -357414 sc-eQTL 4.42e-01 0.0697 0.0905 0.178 Pro_T L2
ENSG00000162607 USP1 800010 sc-eQTL 3.06e-01 0.0638 0.0621 0.178 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -287065 sc-eQTL 4.88e-01 0.073 0.105 0.178 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 -357104 sc-eQTL 9.27e-01 0.00969 0.105 0.179 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 -131268 sc-eQTL 2.59e-01 0.127 0.112 0.179 Treg L2
ENSG00000116641 DOCK7 547921 sc-eQTL 8.53e-01 0.0192 0.103 0.179 Treg L2
ENSG00000125703 ATG4C 452175 sc-eQTL 4.80e-01 0.0745 0.105 0.179 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -357414 sc-eQTL 2.95e-01 -0.116 0.11 0.179 Treg L2
ENSG00000162607 USP1 800010 sc-eQTL 6.55e-01 0.0478 0.107 0.179 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -287065 sc-eQTL 6.74e-01 0.0445 0.106 0.179 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 -357104 sc-eQTL 1.87e-01 0.137 0.104 0.188 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -131268 sc-eQTL 4.21e-01 0.085 0.105 0.188 cDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 547921 sc-eQTL 7.05e-02 0.187 0.103 0.188 cDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 452175 sc-eQTL 3.84e-01 0.0784 0.0898 0.188 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -357414 sc-eQTL 3.63e-01 -0.104 0.114 0.188 cDC L2
ENSG00000162607 USP1 800010 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0194 0.102 0.188 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -287065 sc-eQTL 8.02e-01 -0.023 0.0916 0.188 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 -357104 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0609 0.0992 0.179 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 -131268 sc-eQTL 9.57e-02 -0.165 0.0988 0.179 cMono_IL1B L2
ENSG00000116641 DOCK7 547921 sc-eQTL 8.36e-02 0.181 0.104 0.179 cMono_IL1B L2
ENSG00000125703 ATG4C 452175 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0132 0.0737 0.179 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -357414 sc-eQTL 5.62e-01 0.0606 0.104 0.179 cMono_IL1B L2
ENSG00000162607 USP1 800010 sc-eQTL 1.64e-01 -0.128 0.0917 0.179 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 -357104 sc-eQTL 7.63e-01 0.033 0.109 0.179 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 -131268 sc-eQTL 7.18e-01 0.0401 0.111 0.179 cMono_S100A L2
ENSG00000116641 DOCK7 547921 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0397 0.103 0.179 cMono_S100A L2
ENSG00000125703 ATG4C 452175 sc-eQTL 3.76e-01 0.0787 0.0888 0.179 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -357414 sc-eQTL 1.60e-01 0.141 0.0999 0.179 cMono_S100A L2
ENSG00000162607 USP1 800010 sc-eQTL 3.17e-01 0.103 0.103 0.179 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 -357104 sc-eQTL 8.96e-01 0.0156 0.119 0.197 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 -131268 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0646 0.127 0.197 gdT L2
ENSG00000116641 DOCK7 547921 sc-eQTL 5.69e-01 -0.071 0.124 0.197 gdT L2
ENSG00000125703 ATG4C 452175 sc-eQTL 2.01e-03 -0.362 0.115 0.197 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -357414 sc-eQTL 6.69e-01 0.0541 0.126 0.197 gdT L2
ENSG00000162607 USP1 800010 sc-eQTL 6.45e-01 0.0552 0.12 0.197 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -287065 sc-eQTL 1.48e-01 -0.18 0.123 0.197 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 -357104 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0334 0.11 0.182 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -131268 sc-eQTL 4.71e-01 0.0736 0.102 0.182 intMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 547921 sc-eQTL 9.29e-01 -0.00929 0.104 0.182 intMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 452175 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0202 0.0996 0.182 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -357414 sc-eQTL 8.46e-01 0.0213 0.11 0.182 intMono L2
ENSG00000162607 USP1 800010 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0885 0.111 0.182 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -357104 sc-eQTL 1.45e-01 0.144 0.0985 0.183 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -131268 sc-eQTL 2.15e-01 -0.135 0.108 0.183 ncMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 547921 sc-eQTL 1.81e-01 0.143 0.107 0.183 ncMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 452175 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0311 0.0999 0.183 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -357414 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00531 0.105 0.183 ncMono L2
ENSG00000162607 USP1 800010 sc-eQTL 2.22e-01 -0.131 0.106 0.183 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -357104 sc-eQTL 9.35e-01 -0.00935 0.115 0.201 pDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -131268 sc-eQTL 9.03e-01 0.0136 0.112 0.201 pDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 547921 sc-eQTL 1.76e-01 0.155 0.114 0.201 pDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 452175 sc-eQTL 6.40e-01 0.0481 0.103 0.201 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -357414 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0834 0.115 0.201 pDC L2
ENSG00000162607 USP1 800010 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0604 0.117 0.201 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -287065 sc-eQTL 1.03e-02 0.259 0.0998 0.201 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -357104 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0329 0.104 0.179 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -131268 sc-eQTL 5.28e-04 -0.392 0.111 0.179 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 547921 sc-eQTL 9.18e-01 -0.0102 0.0994 0.179 B_Memory LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 452175 sc-eQTL 3.13e-01 0.081 0.0802 0.179 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -357414 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0747 0.105 0.179 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 800010 sc-eQTL 2.25e-01 -0.124 0.102 0.179 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -287065 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0278 0.11 0.179 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -357104 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0432 0.108 0.179 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -131268 sc-eQTL 3.17e-02 -0.238 0.11 0.179 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 547921 sc-eQTL 4.55e-01 0.0777 0.104 0.179 B_Naive LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 452175 sc-eQTL 5.19e-01 0.0511 0.0792 0.179 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -357414 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0679 0.112 0.179 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 800010 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0603 0.0963 0.179 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -287065 sc-eQTL 7.32e-01 0.0386 0.113 0.179 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -357104 sc-eQTL 9.77e-01 0.00289 0.101 0.179 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -131268 sc-eQTL 1.68e-01 -0.135 0.0978 0.179 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 547921 sc-eQTL 2.31e-01 0.118 0.0986 0.179 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 452175 sc-eQTL 6.59e-01 0.0302 0.0684 0.179 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -357414 sc-eQTL 2.11e-01 0.127 0.101 0.179 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 800010 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0132 0.0864 0.179 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -357104 sc-eQTL 8.58e-01 0.0173 0.0965 0.179 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -131268 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0321 0.11 0.179 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 547921 sc-eQTL 5.48e-01 0.0651 0.108 0.179 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 452175 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00392 0.0924 0.179 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -357414 sc-eQTL 4.45e-01 0.082 0.107 0.179 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 800010 sc-eQTL 2.33e-01 -0.12 0.1 0.179 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -357104 sc-eQTL 2.57e-01 0.0938 0.0826 0.181 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -131268 sc-eQTL 9.60e-01 0.00504 0.0995 0.181 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 547921 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00353 0.0891 0.181 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 452175 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0387 0.0889 0.181 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -357414 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0741 0.105 0.181 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 800010 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0261 0.0957 0.181 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -287065 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0439 0.116 0.181 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000142856 ITGB3BP -357414 eQTL 0.0154 -0.09 0.0371 0.0 0.0 0.202

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000162607 \N 800010 2.91e-07 1.36e-07 5.82e-08 1.97e-07 9.82e-08 8.45e-08 1.81e-07 5.62e-08 1.5e-07 6.75e-08 1.59e-07 1.15e-07 1.71e-07 7.64e-08 5.82e-08 7.89e-08 4.31e-08 1.64e-07 6.92e-08 5.04e-08 1.27e-07 1.31e-07 1.58e-07 2.68e-08 1.68e-07 1.26e-07 1.17e-07 1.06e-07 1.31e-07 1e-07 1.07e-07 3.93e-08 3.59e-08 9.3e-08 3.4e-08 2.69e-08 5.7e-08 8.76e-08 6.71e-08 3.6e-08 5.05e-08 1.46e-07 5.08e-08 1.27e-08 3.2e-08 1.77e-08 9.96e-08 1.9e-09 4.8e-08