logo

Genes within 1Mb (chr1:63198371:C:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -395040 sc-eQTL 1.44e-01 0.173 0.118 0.109 B L1
ENSG00000088035 ALG6 -169204 sc-eQTL 8.22e-02 0.213 0.122 0.109 B L1
ENSG00000116641 DOCK7 509985 sc-eQTL 5.85e-01 0.0672 0.123 0.109 B L1
ENSG00000125703 ATG4C 414239 sc-eQTL 1.28e-01 0.13 0.0849 0.109 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -395350 sc-eQTL 8.23e-02 0.236 0.135 0.109 B L1
ENSG00000162607 USP1 762074 sc-eQTL 2.46e-01 0.137 0.118 0.109 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -325001 sc-eQTL 7.31e-01 0.048 0.139 0.109 B L1
ENSG00000079739 PGM1 -395040 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0488 0.101 0.109 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 -169204 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0453 0.112 0.109 CD4T L1
ENSG00000116641 DOCK7 509985 sc-eQTL 3.90e-01 0.0972 0.113 0.109 CD4T L1
ENSG00000125703 ATG4C 414239 sc-eQTL 3.90e-01 0.0785 0.0911 0.109 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -395350 sc-eQTL 2.57e-02 0.288 0.128 0.109 CD4T L1
ENSG00000162607 USP1 762074 sc-eQTL 3.70e-01 0.0793 0.0884 0.109 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -325001 sc-eQTL 7.16e-01 0.0423 0.116 0.109 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 -395040 sc-eQTL 7.96e-02 0.195 0.111 0.109 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 -169204 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0787 0.123 0.109 CD8T L1
ENSG00000116641 DOCK7 509985 sc-eQTL 5.16e-01 -0.081 0.124 0.109 CD8T L1
ENSG00000125703 ATG4C 414239 sc-eQTL 3.26e-01 0.116 0.118 0.109 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -395350 sc-eQTL 9.27e-02 0.222 0.131 0.109 CD8T L1
ENSG00000162607 USP1 762074 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0111 0.103 0.109 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -325001 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0943 0.132 0.109 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 -395040 sc-eQTL 3.29e-03 0.363 0.122 0.11 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 -169204 sc-eQTL 4.82e-01 0.0904 0.128 0.11 DC L1
ENSG00000116641 DOCK7 509985 sc-eQTL 2.62e-01 0.148 0.131 0.11 DC L1
ENSG00000125703 ATG4C 414239 sc-eQTL 2.92e-01 0.109 0.103 0.11 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -395350 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0236 0.144 0.11 DC L1
ENSG00000162607 USP1 762074 sc-eQTL 5.01e-01 0.0848 0.126 0.11 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -325001 sc-eQTL 3.30e-01 0.122 0.125 0.11 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 -395040 sc-eQTL 3.42e-01 0.118 0.124 0.109 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 -169204 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0989 0.13 0.109 Mono L1
ENSG00000116641 DOCK7 509985 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0607 0.125 0.109 Mono L1
ENSG00000125703 ATG4C 414239 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0301 0.0848 0.109 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -395350 sc-eQTL 1.04e-02 0.341 0.132 0.109 Mono L1
ENSG00000162607 USP1 762074 sc-eQTL 1.98e-01 0.142 0.11 0.109 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 -395040 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0494 0.105 0.109 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 -169204 sc-eQTL 8.68e-01 0.0206 0.123 0.109 NK L1
ENSG00000116641 DOCK7 509985 sc-eQTL 7.47e-02 -0.181 0.101 0.109 NK L1
ENSG00000125703 ATG4C 414239 sc-eQTL 4.06e-01 0.0907 0.109 0.109 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -395350 sc-eQTL 1.12e-02 0.341 0.134 0.109 NK L1
ENSG00000162607 USP1 762074 sc-eQTL 8.29e-01 0.0262 0.121 0.109 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -325001 sc-eQTL 1.25e-01 0.225 0.146 0.109 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 -395040 sc-eQTL 7.61e-01 0.0359 0.118 0.109 Other_T L1
ENSG00000088035 ALG6 -169204 sc-eQTL 3.20e-01 -0.118 0.118 0.109 Other_T L1
ENSG00000116641 DOCK7 509985 sc-eQTL 3.61e-01 -0.111 0.121 0.109 Other_T L1
ENSG00000125703 ATG4C 414239 sc-eQTL 1.14e-01 0.165 0.104 0.109 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -395350 sc-eQTL 2.30e-01 0.111 0.0926 0.109 Other_T L1
ENSG00000162607 USP1 762074 sc-eQTL 2.21e-01 -0.0985 0.0803 0.109 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -325001 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0768 0.143 0.109 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -395040 sc-eQTL 3.94e-01 0.141 0.165 0.097 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 -169204 sc-eQTL 6.60e-01 0.0697 0.158 0.097 B_Activated L2
ENSG00000116641 DOCK7 509985 sc-eQTL 1.04e-01 -0.239 0.146 0.097 B_Activated L2
ENSG00000125703 ATG4C 414239 sc-eQTL 5.56e-01 0.0913 0.155 0.097 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -395350 sc-eQTL 5.63e-01 0.0876 0.151 0.097 B_Activated L2
ENSG00000162607 USP1 762074 sc-eQTL 5.92e-01 0.0881 0.164 0.097 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -325001 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0301 0.143 0.097 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 -395040 sc-eQTL 5.03e-01 0.0949 0.141 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 -169204 sc-eQTL 5.30e-01 0.0904 0.144 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000116641 DOCK7 509985 sc-eQTL 8.21e-01 0.0311 0.137 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000125703 ATG4C 414239 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0187 0.116 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -395350 sc-eQTL 3.90e-01 0.119 0.138 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000162607 USP1 762074 sc-eQTL 8.10e-02 0.241 0.137 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -325001 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0654 0.137 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 -395040 sc-eQTL 7.96e-01 0.0359 0.138 0.11 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 -169204 sc-eQTL 6.23e-01 0.0692 0.141 0.11 B_Memory L2
ENSG00000116641 DOCK7 509985 sc-eQTL 1.21e-01 0.204 0.131 0.11 B_Memory L2
ENSG00000125703 ATG4C 414239 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0856 0.125 0.11 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -395350 sc-eQTL 3.21e-02 0.307 0.142 0.11 B_Memory L2
ENSG00000162607 USP1 762074 sc-eQTL 9.41e-01 0.0108 0.145 0.11 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -325001 sc-eQTL 1.50e-01 0.205 0.142 0.11 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 -395040 sc-eQTL 5.96e-01 0.0745 0.14 0.109 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 -169204 sc-eQTL 8.69e-02 0.241 0.14 0.109 B_Naive1 L2
ENSG00000116641 DOCK7 509985 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0814 0.135 0.109 B_Naive1 L2
ENSG00000125703 ATG4C 414239 sc-eQTL 1.58e-01 0.147 0.104 0.109 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -395350 sc-eQTL 2.03e-01 0.176 0.137 0.109 B_Naive1 L2
ENSG00000162607 USP1 762074 sc-eQTL 5.45e-01 0.0735 0.121 0.109 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -325001 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0292 0.147 0.109 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 -395040 sc-eQTL 1.27e-02 0.345 0.137 0.109 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 -169204 sc-eQTL 3.25e-01 -0.143 0.145 0.109 B_Naive2 L2
ENSG00000116641 DOCK7 509985 sc-eQTL 4.51e-01 0.105 0.139 0.109 B_Naive2 L2
ENSG00000125703 ATG4C 414239 sc-eQTL 1.10e-01 0.214 0.133 0.109 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -395350 sc-eQTL 2.17e-01 0.18 0.145 0.109 B_Naive2 L2
ENSG00000162607 USP1 762074 sc-eQTL 7.11e-01 0.0515 0.139 0.109 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -325001 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0675 0.145 0.109 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 -395040 sc-eQTL 8.51e-01 0.0276 0.146 0.111 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -169204 sc-eQTL 1.20e-01 0.24 0.154 0.111 CD4_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 509985 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0647 0.135 0.111 CD4_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 414239 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0622 0.14 0.111 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -395350 sc-eQTL 7.98e-02 -0.261 0.148 0.111 CD4_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 762074 sc-eQTL 7.72e-02 0.251 0.141 0.111 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -325001 sc-eQTL 4.16e-01 -0.116 0.142 0.111 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -395040 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0481 0.114 0.109 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -169204 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0643 0.124 0.109 CD4_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 509985 sc-eQTL 1.56e-01 0.172 0.121 0.109 CD4_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 414239 sc-eQTL 7.19e-01 0.0388 0.107 0.109 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -395350 sc-eQTL 5.48e-02 0.251 0.13 0.109 CD4_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 762074 sc-eQTL 6.59e-01 0.0443 0.1 0.109 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -325001 sc-eQTL 8.73e-01 0.0209 0.13 0.109 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -395040 sc-eQTL 5.17e-01 -0.076 0.117 0.109 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -169204 sc-eQTL 7.71e-01 0.0397 0.136 0.109 CD4_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 509985 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0222 0.121 0.109 CD4_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 414239 sc-eQTL 1.44e-01 0.172 0.117 0.109 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -395350 sc-eQTL 6.56e-02 0.254 0.137 0.109 CD4_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 762074 sc-eQTL 1.85e-01 0.151 0.113 0.109 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -325001 sc-eQTL 2.58e-01 0.152 0.134 0.109 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -395040 sc-eQTL 5.15e-01 0.0902 0.138 0.109 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -169204 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00167 0.139 0.109 CD4_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 509985 sc-eQTL 6.44e-01 0.0628 0.136 0.109 CD4_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 414239 sc-eQTL 8.07e-01 0.0323 0.132 0.109 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -395350 sc-eQTL 4.34e-01 0.107 0.136 0.109 CD4_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 762074 sc-eQTL 7.28e-01 -0.045 0.129 0.109 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -325001 sc-eQTL 4.69e-01 -0.102 0.141 0.109 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -395040 sc-eQTL 7.75e-01 0.0364 0.127 0.109 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -169204 sc-eQTL 7.71e-01 0.0395 0.135 0.109 CD8_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 509985 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0164 0.129 0.109 CD8_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 414239 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0306 0.137 0.109 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -395350 sc-eQTL 6.19e-01 0.0708 0.142 0.109 CD8_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 762074 sc-eQTL 4.18e-01 -0.103 0.127 0.109 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -325001 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0222 0.146 0.109 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -395040 sc-eQTL 7.23e-01 0.046 0.13 0.109 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -169204 sc-eQTL 4.70e-01 0.0971 0.134 0.109 CD8_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 509985 sc-eQTL 1.41e-01 0.204 0.138 0.109 CD8_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 414239 sc-eQTL 3.27e-01 0.131 0.133 0.109 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -395350 sc-eQTL 1.20e-01 0.209 0.134 0.109 CD8_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 762074 sc-eQTL 9.70e-01 0.00428 0.114 0.109 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -325001 sc-eQTL 2.67e-01 0.141 0.127 0.109 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -395040 sc-eQTL 1.94e-01 0.185 0.142 0.111 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -169204 sc-eQTL 9.91e-01 0.00157 0.145 0.111 CD8_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 509985 sc-eQTL 4.44e-02 -0.283 0.14 0.111 CD8_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 414239 sc-eQTL 1.58e-01 -0.204 0.144 0.111 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -395350 sc-eQTL 1.68e-01 0.193 0.14 0.111 CD8_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 762074 sc-eQTL 2.99e-01 0.14 0.135 0.111 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -325001 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0616 0.143 0.111 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -395040 sc-eQTL 2.17e-02 0.341 0.147 0.107 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -169204 sc-eQTL 5.70e-01 0.0854 0.15 0.107 CD8_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 509985 sc-eQTL 9.94e-01 0.00102 0.145 0.107 CD8_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 414239 sc-eQTL 5.76e-01 0.0783 0.14 0.107 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -395350 sc-eQTL 3.86e-01 -0.131 0.151 0.107 CD8_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 762074 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0757 0.144 0.107 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -325001 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0524 0.147 0.107 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -395040 sc-eQTL 2.09e-01 0.171 0.136 0.11 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 -169204 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0264 0.135 0.11 MAIT L2
ENSG00000116641 DOCK7 509985 sc-eQTL 8.43e-01 0.0257 0.129 0.11 MAIT L2
ENSG00000125703 ATG4C 414239 sc-eQTL 3.13e-01 0.137 0.136 0.11 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -395350 sc-eQTL 5.62e-01 0.0791 0.136 0.11 MAIT L2
ENSG00000162607 USP1 762074 sc-eQTL 9.86e-01 0.00233 0.135 0.11 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -325001 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0531 0.14 0.11 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 -395040 sc-eQTL 3.43e-01 0.139 0.146 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 -169204 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0459 0.15 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000116641 DOCK7 509985 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0971 0.13 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000125703 ATG4C 414239 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0412 0.145 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -395350 sc-eQTL 2.71e-01 0.166 0.151 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000162607 USP1 762074 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0378 0.156 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -325001 sc-eQTL 3.85e-01 0.13 0.149 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 -395040 sc-eQTL 2.85e-01 -0.118 0.11 0.11 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 -169204 sc-eQTL 7.87e-01 0.0378 0.14 0.11 NK_CD56dim L2
ENSG00000116641 DOCK7 509985 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00896 0.121 0.11 NK_CD56dim L2
ENSG00000125703 ATG4C 414239 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0372 0.123 0.11 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -395350 sc-eQTL 1.02e-01 0.229 0.139 0.11 NK_CD56dim L2
ENSG00000162607 USP1 762074 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0219 0.136 0.11 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -325001 sc-eQTL 9.83e-02 0.25 0.151 0.11 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 -395040 sc-eQTL 4.65e-01 -0.115 0.157 0.107 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 -169204 sc-eQTL 3.54e-01 -0.151 0.163 0.107 NK_HLA L2
ENSG00000116641 DOCK7 509985 sc-eQTL 9.79e-01 0.00334 0.125 0.107 NK_HLA L2
ENSG00000125703 ATG4C 414239 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0349 0.145 0.107 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -395350 sc-eQTL 6.85e-01 0.0619 0.152 0.107 NK_HLA L2
ENSG00000162607 USP1 762074 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0236 0.159 0.107 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -325001 sc-eQTL 6.92e-01 0.0576 0.145 0.107 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 -395040 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0166 0.121 0.11 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 -169204 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0398 0.136 0.11 NK_cytokine L2
ENSG00000116641 DOCK7 509985 sc-eQTL 1.51e-01 -0.182 0.126 0.11 NK_cytokine L2
ENSG00000125703 ATG4C 414239 sc-eQTL 1.37e-01 0.192 0.129 0.11 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -395350 sc-eQTL 1.04e-02 0.341 0.132 0.11 NK_cytokine L2
ENSG00000162607 USP1 762074 sc-eQTL 9.30e-01 -0.0124 0.141 0.11 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -325001 sc-eQTL 5.76e-01 0.0799 0.143 0.11 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 -395040 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0581 0.164 0.111 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 -169204 sc-eQTL 3.03e-01 -0.178 0.172 0.111 PB L2
ENSG00000116641 DOCK7 509985 sc-eQTL 7.20e-01 0.0662 0.185 0.111 PB L2
ENSG00000125703 ATG4C 414239 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0798 0.161 0.111 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -395350 sc-eQTL 8.82e-01 0.024 0.161 0.111 PB L2
ENSG00000162607 USP1 762074 sc-eQTL 2.52e-01 -0.183 0.159 0.111 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -325001 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0598 0.176 0.111 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 -395040 sc-eQTL 6.36e-02 -0.239 0.128 0.111 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 -169204 sc-eQTL 5.44e-01 -0.08 0.132 0.111 Pro_T L2
ENSG00000116641 DOCK7 509985 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0422 0.132 0.111 Pro_T L2
ENSG00000125703 ATG4C 414239 sc-eQTL 8.53e-01 0.0214 0.116 0.111 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -395350 sc-eQTL 3.50e-01 0.108 0.116 0.111 Pro_T L2
ENSG00000162607 USP1 762074 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0366 0.0798 0.111 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -325001 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0217 0.135 0.111 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 -395040 sc-eQTL 4.22e-01 0.108 0.134 0.109 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 -169204 sc-eQTL 5.97e-02 -0.27 0.143 0.109 Treg L2
ENSG00000116641 DOCK7 509985 sc-eQTL 1.70e-01 -0.181 0.131 0.109 Treg L2
ENSG00000125703 ATG4C 414239 sc-eQTL 3.33e-01 -0.131 0.135 0.109 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -395350 sc-eQTL 3.27e-01 0.138 0.141 0.109 Treg L2
ENSG00000162607 USP1 762074 sc-eQTL 2.84e-02 -0.298 0.135 0.109 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -325001 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0225 0.135 0.109 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 -395040 sc-eQTL 5.10e-01 0.0936 0.142 0.102 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -169204 sc-eQTL 2.68e-03 0.427 0.14 0.102 cDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 509985 sc-eQTL 9.66e-01 0.00605 0.141 0.102 cDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 414239 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0676 0.122 0.102 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -395350 sc-eQTL 9.57e-01 0.00832 0.155 0.102 cDC L2
ENSG00000162607 USP1 762074 sc-eQTL 2.62e-01 0.155 0.138 0.102 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -325001 sc-eQTL 3.96e-01 0.106 0.125 0.102 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 -395040 sc-eQTL 4.40e-01 0.0993 0.128 0.109 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 -169204 sc-eQTL 9.55e-02 -0.214 0.128 0.109 cMono_IL1B L2
ENSG00000116641 DOCK7 509985 sc-eQTL 1.79e-01 -0.182 0.135 0.109 cMono_IL1B L2
ENSG00000125703 ATG4C 414239 sc-eQTL 3.86e-01 -0.0827 0.0953 0.109 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -395350 sc-eQTL 3.17e-02 0.289 0.134 0.109 cMono_IL1B L2
ENSG00000162607 USP1 762074 sc-eQTL 3.23e-01 0.118 0.119 0.109 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 -395040 sc-eQTL 4.95e-01 0.0968 0.142 0.109 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 -169204 sc-eQTL 9.62e-01 0.00682 0.144 0.109 cMono_S100A L2
ENSG00000116641 DOCK7 509985 sc-eQTL 9.88e-01 0.00195 0.133 0.109 cMono_S100A L2
ENSG00000125703 ATG4C 414239 sc-eQTL 9.11e-01 0.013 0.115 0.109 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -395350 sc-eQTL 1.79e-01 0.175 0.13 0.109 cMono_S100A L2
ENSG00000162607 USP1 762074 sc-eQTL 5.70e-01 0.0762 0.134 0.109 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 -395040 sc-eQTL 4.21e-01 0.125 0.154 0.115 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 -169204 sc-eQTL 8.44e-02 0.283 0.163 0.115 gdT L2
ENSG00000116641 DOCK7 509985 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0804 0.162 0.115 gdT L2
ENSG00000125703 ATG4C 414239 sc-eQTL 2.13e-01 0.192 0.154 0.115 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -395350 sc-eQTL 2.82e-01 -0.176 0.163 0.115 gdT L2
ENSG00000162607 USP1 762074 sc-eQTL 2.53e-01 -0.177 0.155 0.115 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -325001 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0943 0.161 0.115 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 -395040 sc-eQTL 1.87e-01 0.192 0.145 0.111 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -169204 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0893 0.136 0.111 intMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 509985 sc-eQTL 9.92e-01 0.00131 0.139 0.111 intMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 414239 sc-eQTL 9.22e-01 -0.013 0.133 0.111 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -395350 sc-eQTL 2.42e-01 0.171 0.145 0.111 intMono L2
ENSG00000162607 USP1 762074 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0533 0.148 0.111 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -395040 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0923 0.139 0.1 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -169204 sc-eQTL 7.08e-01 0.0574 0.153 0.1 ncMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 509985 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0372 0.151 0.1 ncMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 414239 sc-eQTL 2.31e-01 -0.168 0.14 0.1 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -395350 sc-eQTL 2.76e-01 0.16 0.147 0.1 ncMono L2
ENSG00000162607 USP1 762074 sc-eQTL 8.94e-01 0.02 0.15 0.1 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -395040 sc-eQTL 5.53e-01 0.0939 0.158 0.105 pDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -169204 sc-eQTL 2.14e-01 -0.191 0.153 0.105 pDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 509985 sc-eQTL 4.82e-01 0.111 0.157 0.105 pDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 414239 sc-eQTL 3.97e-02 0.289 0.139 0.105 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -395350 sc-eQTL 2.87e-01 0.169 0.158 0.105 pDC L2
ENSG00000162607 USP1 762074 sc-eQTL 1.12e-01 -0.256 0.16 0.105 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -325001 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0673 0.14 0.105 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -395040 sc-eQTL 3.83e-01 0.115 0.131 0.109 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -169204 sc-eQTL 1.35e-01 0.217 0.145 0.109 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 509985 sc-eQTL 8.86e-01 0.018 0.126 0.109 B_Memory LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 414239 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0596 0.102 0.109 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -395350 sc-eQTL 5.67e-02 0.255 0.133 0.109 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 762074 sc-eQTL 1.37e-01 0.193 0.129 0.109 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -325001 sc-eQTL 5.15e-01 0.0911 0.14 0.109 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -395040 sc-eQTL 6.68e-02 0.251 0.136 0.109 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -169204 sc-eQTL 3.32e-01 0.137 0.141 0.109 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 509985 sc-eQTL 9.89e-01 0.00178 0.132 0.109 B_Naive LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 414239 sc-eQTL 6.74e-02 0.183 0.0998 0.109 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -395350 sc-eQTL 9.07e-02 0.24 0.141 0.109 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 762074 sc-eQTL 6.47e-01 0.056 0.122 0.109 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -325001 sc-eQTL 8.67e-01 -0.024 0.143 0.109 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -395040 sc-eQTL 4.27e-01 0.104 0.131 0.109 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -169204 sc-eQTL 2.00e-01 -0.162 0.126 0.109 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 509985 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0977 0.128 0.109 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 414239 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0175 0.0883 0.109 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -395350 sc-eQTL 9.03e-03 0.339 0.129 0.109 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 762074 sc-eQTL 3.50e-01 0.104 0.111 0.109 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -395040 sc-eQTL 3.39e-01 0.123 0.129 0.11 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -169204 sc-eQTL 3.75e-01 0.13 0.146 0.11 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 509985 sc-eQTL 6.60e-01 0.0637 0.145 0.11 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 414239 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0441 0.123 0.11 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -395350 sc-eQTL 3.04e-01 0.147 0.143 0.11 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 762074 sc-eQTL 9.83e-01 -0.0028 0.135 0.11 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -395040 sc-eQTL 4.27e-01 -0.085 0.107 0.11 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -169204 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00973 0.128 0.11 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 509985 sc-eQTL 1.24e-01 -0.177 0.114 0.11 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 414239 sc-eQTL 3.59e-01 0.105 0.115 0.11 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -395350 sc-eQTL 2.15e-02 0.312 0.134 0.11 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 762074 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0239 0.124 0.11 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -325001 sc-eQTL 9.86e-02 0.248 0.149 0.11 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000088035 ALG6 -169204 eQTL 0.000101 -0.0864 0.0221 0.00135 0.0 0.0976
ENSG00000142856 ITGB3BP -395350 eQTL 1.78e-07 0.256 0.0486 0.00109 0.0 0.0976

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000142856 ITGB3BP -395350 1.05e-06 7.58e-07 1.76e-07 3.25e-07 9.77e-08 3.32e-07 6.33e-07 2.28e-07 6.53e-07 3.1e-07 9.73e-07 4.62e-07 1.05e-06 1.72e-07 3.15e-07 3.4e-07 6.15e-07 4.16e-07 3.01e-07 2.78e-07 2.26e-07 5.11e-07 4.59e-07 2.95e-07 1.2e-06 2.52e-07 4.37e-07 3.78e-07 6.33e-07 7.71e-07 3.81e-07 4.44e-08 9.46e-08 2.22e-07 3.23e-07 2.78e-07 2.57e-07 1.32e-07 8.45e-08 1.84e-08 1.67e-07 7.54e-07 6.3e-08 1.21e-08 1.89e-07 3.54e-08 1.21e-07 5.86e-08 5.4e-08