logo

Genes within 1Mb (chr1:63197698:C:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -395713 sc-eQTL 1.44e-01 0.173 0.118 0.109 B L1
ENSG00000088035 ALG6 -169877 sc-eQTL 8.22e-02 0.213 0.122 0.109 B L1
ENSG00000116641 DOCK7 509312 sc-eQTL 5.85e-01 0.0672 0.123 0.109 B L1
ENSG00000125703 ATG4C 413566 sc-eQTL 1.28e-01 0.13 0.0849 0.109 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -396023 sc-eQTL 8.23e-02 0.236 0.135 0.109 B L1
ENSG00000162607 USP1 761401 sc-eQTL 2.46e-01 0.137 0.118 0.109 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -325674 sc-eQTL 7.31e-01 0.048 0.139 0.109 B L1
ENSG00000079739 PGM1 -395713 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0488 0.101 0.109 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 -169877 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0453 0.112 0.109 CD4T L1
ENSG00000116641 DOCK7 509312 sc-eQTL 3.90e-01 0.0972 0.113 0.109 CD4T L1
ENSG00000125703 ATG4C 413566 sc-eQTL 3.90e-01 0.0785 0.0911 0.109 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -396023 sc-eQTL 2.57e-02 0.288 0.128 0.109 CD4T L1
ENSG00000162607 USP1 761401 sc-eQTL 3.70e-01 0.0793 0.0884 0.109 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -325674 sc-eQTL 7.16e-01 0.0423 0.116 0.109 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 -395713 sc-eQTL 7.96e-02 0.195 0.111 0.109 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 -169877 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0787 0.123 0.109 CD8T L1
ENSG00000116641 DOCK7 509312 sc-eQTL 5.16e-01 -0.081 0.124 0.109 CD8T L1
ENSG00000125703 ATG4C 413566 sc-eQTL 3.26e-01 0.116 0.118 0.109 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -396023 sc-eQTL 9.27e-02 0.222 0.131 0.109 CD8T L1
ENSG00000162607 USP1 761401 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0111 0.103 0.109 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -325674 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0943 0.132 0.109 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 -395713 sc-eQTL 3.29e-03 0.363 0.122 0.11 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 -169877 sc-eQTL 4.82e-01 0.0904 0.128 0.11 DC L1
ENSG00000116641 DOCK7 509312 sc-eQTL 2.62e-01 0.148 0.131 0.11 DC L1
ENSG00000125703 ATG4C 413566 sc-eQTL 2.92e-01 0.109 0.103 0.11 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -396023 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0236 0.144 0.11 DC L1
ENSG00000162607 USP1 761401 sc-eQTL 5.01e-01 0.0848 0.126 0.11 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -325674 sc-eQTL 3.30e-01 0.122 0.125 0.11 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 -395713 sc-eQTL 3.42e-01 0.118 0.124 0.109 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 -169877 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0989 0.13 0.109 Mono L1
ENSG00000116641 DOCK7 509312 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0607 0.125 0.109 Mono L1
ENSG00000125703 ATG4C 413566 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0301 0.0848 0.109 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -396023 sc-eQTL 1.04e-02 0.341 0.132 0.109 Mono L1
ENSG00000162607 USP1 761401 sc-eQTL 1.98e-01 0.142 0.11 0.109 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 -395713 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0494 0.105 0.109 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 -169877 sc-eQTL 8.68e-01 0.0206 0.123 0.109 NK L1
ENSG00000116641 DOCK7 509312 sc-eQTL 7.47e-02 -0.181 0.101 0.109 NK L1
ENSG00000125703 ATG4C 413566 sc-eQTL 4.06e-01 0.0907 0.109 0.109 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -396023 sc-eQTL 1.12e-02 0.341 0.134 0.109 NK L1
ENSG00000162607 USP1 761401 sc-eQTL 8.29e-01 0.0262 0.121 0.109 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -325674 sc-eQTL 1.25e-01 0.225 0.146 0.109 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 -395713 sc-eQTL 7.61e-01 0.0359 0.118 0.109 Other_T L1
ENSG00000088035 ALG6 -169877 sc-eQTL 3.20e-01 -0.118 0.118 0.109 Other_T L1
ENSG00000116641 DOCK7 509312 sc-eQTL 3.61e-01 -0.111 0.121 0.109 Other_T L1
ENSG00000125703 ATG4C 413566 sc-eQTL 1.14e-01 0.165 0.104 0.109 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -396023 sc-eQTL 2.30e-01 0.111 0.0926 0.109 Other_T L1
ENSG00000162607 USP1 761401 sc-eQTL 2.21e-01 -0.0985 0.0803 0.109 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -325674 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0768 0.143 0.109 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -395713 sc-eQTL 3.94e-01 0.141 0.165 0.097 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 -169877 sc-eQTL 6.60e-01 0.0697 0.158 0.097 B_Activated L2
ENSG00000116641 DOCK7 509312 sc-eQTL 1.04e-01 -0.239 0.146 0.097 B_Activated L2
ENSG00000125703 ATG4C 413566 sc-eQTL 5.56e-01 0.0913 0.155 0.097 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -396023 sc-eQTL 5.63e-01 0.0876 0.151 0.097 B_Activated L2
ENSG00000162607 USP1 761401 sc-eQTL 5.92e-01 0.0881 0.164 0.097 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -325674 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0301 0.143 0.097 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 -395713 sc-eQTL 5.03e-01 0.0949 0.141 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 -169877 sc-eQTL 5.30e-01 0.0904 0.144 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000116641 DOCK7 509312 sc-eQTL 8.21e-01 0.0311 0.137 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000125703 ATG4C 413566 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0187 0.116 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -396023 sc-eQTL 3.90e-01 0.119 0.138 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000162607 USP1 761401 sc-eQTL 8.10e-02 0.241 0.137 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -325674 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0654 0.137 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 -395713 sc-eQTL 7.96e-01 0.0359 0.138 0.11 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 -169877 sc-eQTL 6.23e-01 0.0692 0.141 0.11 B_Memory L2
ENSG00000116641 DOCK7 509312 sc-eQTL 1.21e-01 0.204 0.131 0.11 B_Memory L2
ENSG00000125703 ATG4C 413566 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0856 0.125 0.11 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -396023 sc-eQTL 3.21e-02 0.307 0.142 0.11 B_Memory L2
ENSG00000162607 USP1 761401 sc-eQTL 9.41e-01 0.0108 0.145 0.11 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -325674 sc-eQTL 1.50e-01 0.205 0.142 0.11 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 -395713 sc-eQTL 5.96e-01 0.0745 0.14 0.109 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 -169877 sc-eQTL 8.69e-02 0.241 0.14 0.109 B_Naive1 L2
ENSG00000116641 DOCK7 509312 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0814 0.135 0.109 B_Naive1 L2
ENSG00000125703 ATG4C 413566 sc-eQTL 1.58e-01 0.147 0.104 0.109 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -396023 sc-eQTL 2.03e-01 0.176 0.137 0.109 B_Naive1 L2
ENSG00000162607 USP1 761401 sc-eQTL 5.45e-01 0.0735 0.121 0.109 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -325674 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0292 0.147 0.109 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 -395713 sc-eQTL 1.27e-02 0.345 0.137 0.109 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 -169877 sc-eQTL 3.25e-01 -0.143 0.145 0.109 B_Naive2 L2
ENSG00000116641 DOCK7 509312 sc-eQTL 4.51e-01 0.105 0.139 0.109 B_Naive2 L2
ENSG00000125703 ATG4C 413566 sc-eQTL 1.10e-01 0.214 0.133 0.109 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -396023 sc-eQTL 2.17e-01 0.18 0.145 0.109 B_Naive2 L2
ENSG00000162607 USP1 761401 sc-eQTL 7.11e-01 0.0515 0.139 0.109 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -325674 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0675 0.145 0.109 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 -395713 sc-eQTL 8.51e-01 0.0276 0.146 0.111 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -169877 sc-eQTL 1.20e-01 0.24 0.154 0.111 CD4_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 509312 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0647 0.135 0.111 CD4_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 413566 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0622 0.14 0.111 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -396023 sc-eQTL 7.98e-02 -0.261 0.148 0.111 CD4_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 761401 sc-eQTL 7.72e-02 0.251 0.141 0.111 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -325674 sc-eQTL 4.16e-01 -0.116 0.142 0.111 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -395713 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0481 0.114 0.109 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -169877 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0643 0.124 0.109 CD4_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 509312 sc-eQTL 1.56e-01 0.172 0.121 0.109 CD4_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 413566 sc-eQTL 7.19e-01 0.0388 0.107 0.109 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -396023 sc-eQTL 5.48e-02 0.251 0.13 0.109 CD4_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 761401 sc-eQTL 6.59e-01 0.0443 0.1 0.109 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -325674 sc-eQTL 8.73e-01 0.0209 0.13 0.109 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -395713 sc-eQTL 5.17e-01 -0.076 0.117 0.109 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -169877 sc-eQTL 7.71e-01 0.0397 0.136 0.109 CD4_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 509312 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0222 0.121 0.109 CD4_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 413566 sc-eQTL 1.44e-01 0.172 0.117 0.109 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -396023 sc-eQTL 6.56e-02 0.254 0.137 0.109 CD4_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 761401 sc-eQTL 1.85e-01 0.151 0.113 0.109 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -325674 sc-eQTL 2.58e-01 0.152 0.134 0.109 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -395713 sc-eQTL 5.15e-01 0.0902 0.138 0.109 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -169877 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00167 0.139 0.109 CD4_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 509312 sc-eQTL 6.44e-01 0.0628 0.136 0.109 CD4_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 413566 sc-eQTL 8.07e-01 0.0323 0.132 0.109 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -396023 sc-eQTL 4.34e-01 0.107 0.136 0.109 CD4_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 761401 sc-eQTL 7.28e-01 -0.045 0.129 0.109 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -325674 sc-eQTL 4.69e-01 -0.102 0.141 0.109 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -395713 sc-eQTL 7.75e-01 0.0364 0.127 0.109 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -169877 sc-eQTL 7.71e-01 0.0395 0.135 0.109 CD8_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 509312 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0164 0.129 0.109 CD8_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 413566 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0306 0.137 0.109 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -396023 sc-eQTL 6.19e-01 0.0708 0.142 0.109 CD8_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 761401 sc-eQTL 4.18e-01 -0.103 0.127 0.109 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -325674 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0222 0.146 0.109 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -395713 sc-eQTL 7.23e-01 0.046 0.13 0.109 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -169877 sc-eQTL 4.70e-01 0.0971 0.134 0.109 CD8_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 509312 sc-eQTL 1.41e-01 0.204 0.138 0.109 CD8_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 413566 sc-eQTL 3.27e-01 0.131 0.133 0.109 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -396023 sc-eQTL 1.20e-01 0.209 0.134 0.109 CD8_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 761401 sc-eQTL 9.70e-01 0.00428 0.114 0.109 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -325674 sc-eQTL 2.67e-01 0.141 0.127 0.109 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -395713 sc-eQTL 1.94e-01 0.185 0.142 0.111 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -169877 sc-eQTL 9.91e-01 0.00157 0.145 0.111 CD8_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 509312 sc-eQTL 4.44e-02 -0.283 0.14 0.111 CD8_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 413566 sc-eQTL 1.58e-01 -0.204 0.144 0.111 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -396023 sc-eQTL 1.68e-01 0.193 0.14 0.111 CD8_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 761401 sc-eQTL 2.99e-01 0.14 0.135 0.111 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -325674 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0616 0.143 0.111 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -395713 sc-eQTL 2.17e-02 0.341 0.147 0.107 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -169877 sc-eQTL 5.70e-01 0.0854 0.15 0.107 CD8_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 509312 sc-eQTL 9.94e-01 0.00102 0.145 0.107 CD8_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 413566 sc-eQTL 5.76e-01 0.0783 0.14 0.107 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -396023 sc-eQTL 3.86e-01 -0.131 0.151 0.107 CD8_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 761401 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0757 0.144 0.107 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -325674 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0524 0.147 0.107 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -395713 sc-eQTL 2.09e-01 0.171 0.136 0.11 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 -169877 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0264 0.135 0.11 MAIT L2
ENSG00000116641 DOCK7 509312 sc-eQTL 8.43e-01 0.0257 0.129 0.11 MAIT L2
ENSG00000125703 ATG4C 413566 sc-eQTL 3.13e-01 0.137 0.136 0.11 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -396023 sc-eQTL 5.62e-01 0.0791 0.136 0.11 MAIT L2
ENSG00000162607 USP1 761401 sc-eQTL 9.86e-01 0.00233 0.135 0.11 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -325674 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0531 0.14 0.11 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 -395713 sc-eQTL 3.43e-01 0.139 0.146 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 -169877 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0459 0.15 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000116641 DOCK7 509312 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0971 0.13 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000125703 ATG4C 413566 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0412 0.145 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -396023 sc-eQTL 2.71e-01 0.166 0.151 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000162607 USP1 761401 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0378 0.156 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -325674 sc-eQTL 3.85e-01 0.13 0.149 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 -395713 sc-eQTL 2.85e-01 -0.118 0.11 0.11 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 -169877 sc-eQTL 7.87e-01 0.0378 0.14 0.11 NK_CD56dim L2
ENSG00000116641 DOCK7 509312 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00896 0.121 0.11 NK_CD56dim L2
ENSG00000125703 ATG4C 413566 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0372 0.123 0.11 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -396023 sc-eQTL 1.02e-01 0.229 0.139 0.11 NK_CD56dim L2
ENSG00000162607 USP1 761401 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0219 0.136 0.11 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -325674 sc-eQTL 9.83e-02 0.25 0.151 0.11 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 -395713 sc-eQTL 4.65e-01 -0.115 0.157 0.107 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 -169877 sc-eQTL 3.54e-01 -0.151 0.163 0.107 NK_HLA L2
ENSG00000116641 DOCK7 509312 sc-eQTL 9.79e-01 0.00334 0.125 0.107 NK_HLA L2
ENSG00000125703 ATG4C 413566 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0349 0.145 0.107 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -396023 sc-eQTL 6.85e-01 0.0619 0.152 0.107 NK_HLA L2
ENSG00000162607 USP1 761401 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0236 0.159 0.107 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -325674 sc-eQTL 6.92e-01 0.0576 0.145 0.107 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 -395713 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0166 0.121 0.11 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 -169877 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0398 0.136 0.11 NK_cytokine L2
ENSG00000116641 DOCK7 509312 sc-eQTL 1.51e-01 -0.182 0.126 0.11 NK_cytokine L2
ENSG00000125703 ATG4C 413566 sc-eQTL 1.37e-01 0.192 0.129 0.11 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -396023 sc-eQTL 1.04e-02 0.341 0.132 0.11 NK_cytokine L2
ENSG00000162607 USP1 761401 sc-eQTL 9.30e-01 -0.0124 0.141 0.11 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -325674 sc-eQTL 5.76e-01 0.0799 0.143 0.11 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 -395713 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0581 0.164 0.111 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 -169877 sc-eQTL 3.03e-01 -0.178 0.172 0.111 PB L2
ENSG00000116641 DOCK7 509312 sc-eQTL 7.20e-01 0.0662 0.185 0.111 PB L2
ENSG00000125703 ATG4C 413566 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0798 0.161 0.111 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -396023 sc-eQTL 8.82e-01 0.024 0.161 0.111 PB L2
ENSG00000162607 USP1 761401 sc-eQTL 2.52e-01 -0.183 0.159 0.111 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -325674 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0598 0.176 0.111 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 -395713 sc-eQTL 6.36e-02 -0.239 0.128 0.111 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 -169877 sc-eQTL 5.44e-01 -0.08 0.132 0.111 Pro_T L2
ENSG00000116641 DOCK7 509312 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0422 0.132 0.111 Pro_T L2
ENSG00000125703 ATG4C 413566 sc-eQTL 8.53e-01 0.0214 0.116 0.111 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -396023 sc-eQTL 3.50e-01 0.108 0.116 0.111 Pro_T L2
ENSG00000162607 USP1 761401 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0366 0.0798 0.111 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -325674 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0217 0.135 0.111 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 -395713 sc-eQTL 4.22e-01 0.108 0.134 0.109 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 -169877 sc-eQTL 5.97e-02 -0.27 0.143 0.109 Treg L2
ENSG00000116641 DOCK7 509312 sc-eQTL 1.70e-01 -0.181 0.131 0.109 Treg L2
ENSG00000125703 ATG4C 413566 sc-eQTL 3.33e-01 -0.131 0.135 0.109 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -396023 sc-eQTL 3.27e-01 0.138 0.141 0.109 Treg L2
ENSG00000162607 USP1 761401 sc-eQTL 2.84e-02 -0.298 0.135 0.109 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -325674 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0225 0.135 0.109 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 -395713 sc-eQTL 5.10e-01 0.0936 0.142 0.102 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -169877 sc-eQTL 2.68e-03 0.427 0.14 0.102 cDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 509312 sc-eQTL 9.66e-01 0.00605 0.141 0.102 cDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 413566 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0676 0.122 0.102 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -396023 sc-eQTL 9.57e-01 0.00832 0.155 0.102 cDC L2
ENSG00000162607 USP1 761401 sc-eQTL 2.62e-01 0.155 0.138 0.102 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -325674 sc-eQTL 3.96e-01 0.106 0.125 0.102 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 -395713 sc-eQTL 4.40e-01 0.0993 0.128 0.109 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 -169877 sc-eQTL 9.55e-02 -0.214 0.128 0.109 cMono_IL1B L2
ENSG00000116641 DOCK7 509312 sc-eQTL 1.79e-01 -0.182 0.135 0.109 cMono_IL1B L2
ENSG00000125703 ATG4C 413566 sc-eQTL 3.86e-01 -0.0827 0.0953 0.109 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -396023 sc-eQTL 3.17e-02 0.289 0.134 0.109 cMono_IL1B L2
ENSG00000162607 USP1 761401 sc-eQTL 3.23e-01 0.118 0.119 0.109 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 -395713 sc-eQTL 4.95e-01 0.0968 0.142 0.109 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 -169877 sc-eQTL 9.62e-01 0.00682 0.144 0.109 cMono_S100A L2
ENSG00000116641 DOCK7 509312 sc-eQTL 9.88e-01 0.00195 0.133 0.109 cMono_S100A L2
ENSG00000125703 ATG4C 413566 sc-eQTL 9.11e-01 0.013 0.115 0.109 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -396023 sc-eQTL 1.79e-01 0.175 0.13 0.109 cMono_S100A L2
ENSG00000162607 USP1 761401 sc-eQTL 5.70e-01 0.0762 0.134 0.109 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 -395713 sc-eQTL 4.21e-01 0.125 0.154 0.115 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 -169877 sc-eQTL 8.44e-02 0.283 0.163 0.115 gdT L2
ENSG00000116641 DOCK7 509312 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0804 0.162 0.115 gdT L2
ENSG00000125703 ATG4C 413566 sc-eQTL 2.13e-01 0.192 0.154 0.115 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -396023 sc-eQTL 2.82e-01 -0.176 0.163 0.115 gdT L2
ENSG00000162607 USP1 761401 sc-eQTL 2.53e-01 -0.177 0.155 0.115 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -325674 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0943 0.161 0.115 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 -395713 sc-eQTL 1.87e-01 0.192 0.145 0.111 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -169877 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0893 0.136 0.111 intMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 509312 sc-eQTL 9.92e-01 0.00131 0.139 0.111 intMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 413566 sc-eQTL 9.22e-01 -0.013 0.133 0.111 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -396023 sc-eQTL 2.42e-01 0.171 0.145 0.111 intMono L2
ENSG00000162607 USP1 761401 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0533 0.148 0.111 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -395713 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0923 0.139 0.1 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -169877 sc-eQTL 7.08e-01 0.0574 0.153 0.1 ncMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 509312 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0372 0.151 0.1 ncMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 413566 sc-eQTL 2.31e-01 -0.168 0.14 0.1 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -396023 sc-eQTL 2.76e-01 0.16 0.147 0.1 ncMono L2
ENSG00000162607 USP1 761401 sc-eQTL 8.94e-01 0.02 0.15 0.1 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -395713 sc-eQTL 5.53e-01 0.0939 0.158 0.105 pDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -169877 sc-eQTL 2.14e-01 -0.191 0.153 0.105 pDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 509312 sc-eQTL 4.82e-01 0.111 0.157 0.105 pDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 413566 sc-eQTL 3.97e-02 0.289 0.139 0.105 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -396023 sc-eQTL 2.87e-01 0.169 0.158 0.105 pDC L2
ENSG00000162607 USP1 761401 sc-eQTL 1.12e-01 -0.256 0.16 0.105 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -325674 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0673 0.14 0.105 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -395713 sc-eQTL 3.83e-01 0.115 0.131 0.109 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -169877 sc-eQTL 1.35e-01 0.217 0.145 0.109 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 509312 sc-eQTL 8.86e-01 0.018 0.126 0.109 B_Memory LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 413566 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0596 0.102 0.109 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -396023 sc-eQTL 5.67e-02 0.255 0.133 0.109 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 761401 sc-eQTL 1.37e-01 0.193 0.129 0.109 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -325674 sc-eQTL 5.15e-01 0.0911 0.14 0.109 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -395713 sc-eQTL 6.68e-02 0.251 0.136 0.109 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -169877 sc-eQTL 3.32e-01 0.137 0.141 0.109 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 509312 sc-eQTL 9.89e-01 0.00178 0.132 0.109 B_Naive LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 413566 sc-eQTL 6.74e-02 0.183 0.0998 0.109 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -396023 sc-eQTL 9.07e-02 0.24 0.141 0.109 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 761401 sc-eQTL 6.47e-01 0.056 0.122 0.109 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -325674 sc-eQTL 8.67e-01 -0.024 0.143 0.109 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -395713 sc-eQTL 4.27e-01 0.104 0.131 0.109 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -169877 sc-eQTL 2.00e-01 -0.162 0.126 0.109 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 509312 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0977 0.128 0.109 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 413566 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0175 0.0883 0.109 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -396023 sc-eQTL 9.03e-03 0.339 0.129 0.109 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 761401 sc-eQTL 3.50e-01 0.104 0.111 0.109 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -395713 sc-eQTL 3.39e-01 0.123 0.129 0.11 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -169877 sc-eQTL 3.75e-01 0.13 0.146 0.11 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 509312 sc-eQTL 6.60e-01 0.0637 0.145 0.11 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 413566 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0441 0.123 0.11 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -396023 sc-eQTL 3.04e-01 0.147 0.143 0.11 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 761401 sc-eQTL 9.83e-01 -0.0028 0.135 0.11 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -395713 sc-eQTL 4.27e-01 -0.085 0.107 0.11 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -169877 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00973 0.128 0.11 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 509312 sc-eQTL 1.24e-01 -0.177 0.114 0.11 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 413566 sc-eQTL 3.59e-01 0.105 0.115 0.11 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -396023 sc-eQTL 2.15e-02 0.312 0.134 0.11 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 761401 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0239 0.124 0.11 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -325674 sc-eQTL 9.86e-02 0.248 0.149 0.11 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000088035 ALG6 -169877 eQTL 0.000103 -0.086 0.0221 0.00134 0.0 0.0976
ENSG00000142856 ITGB3BP -396023 eQTL 1.83e-07 0.255 0.0485 0.00109 0.0 0.0976

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000142856 ITGB3BP -396023 3.07e-07 1.56e-07 6.57e-08 2.24e-07 9.25e-08 8.45e-08 1.73e-07 5.43e-08 1.59e-07 8.53e-08 1.61e-07 1.05e-07 2.29e-07 8.07e-08 6.27e-08 7.98e-08 5.73e-08 1.64e-07 7.29e-08 6.03e-08 1.18e-07 1.89e-07 1.58e-07 3.58e-08 2.09e-07 1.26e-07 1.17e-07 1.48e-07 1.22e-07 1.05e-07 1.22e-07 5.3e-08 5.09e-08 8.7e-08 4.04e-08 3.07e-08 6.48e-08 8.93e-08 6.42e-08 8.16e-08 5.42e-08 1.46e-07 3.55e-08 1.43e-08 3.36e-08 9.86e-09 1e-07 1.95e-09 4.67e-08