logo

Genes within 1Mb (chr1:63196863:A:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -396548 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0447 0.0919 0.226 B L1
ENSG00000088035 ALG6 -170712 sc-eQTL 1.17e-02 0.239 0.0939 0.226 B L1
ENSG00000116641 DOCK7 508477 sc-eQTL 7.36e-01 0.0321 0.0953 0.226 B L1
ENSG00000125703 ATG4C 412731 sc-eQTL 5.00e-01 0.0447 0.0662 0.226 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -396858 sc-eQTL 2.42e-01 0.123 0.105 0.226 B L1
ENSG00000162607 USP1 760566 sc-eQTL 2.86e-01 0.0975 0.0913 0.226 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -326509 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0531 0.108 0.226 B L1
ENSG00000079739 PGM1 -396548 sc-eQTL 3.58e-01 -0.0729 0.0792 0.226 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 -170712 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00208 0.0876 0.226 CD4T L1
ENSG00000116641 DOCK7 508477 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0423 0.0886 0.226 CD4T L1
ENSG00000125703 ATG4C 412731 sc-eQTL 8.59e-01 0.0127 0.0716 0.226 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -396858 sc-eQTL 7.56e-01 0.0317 0.102 0.226 CD4T L1
ENSG00000162607 USP1 760566 sc-eQTL 1.23e-01 0.107 0.069 0.226 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -326509 sc-eQTL 9.57e-01 0.00492 0.0912 0.226 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 -396548 sc-eQTL 5.04e-01 0.0584 0.0871 0.226 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 -170712 sc-eQTL 3.14e-01 -0.0969 0.0959 0.226 CD8T L1
ENSG00000116641 DOCK7 508477 sc-eQTL 7.66e-01 0.029 0.0974 0.226 CD8T L1
ENSG00000125703 ATG4C 412731 sc-eQTL 1.72e-01 0.126 0.0921 0.226 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -396858 sc-eQTL 8.41e-02 0.178 0.103 0.226 CD8T L1
ENSG00000162607 USP1 760566 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0445 0.0806 0.226 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -326509 sc-eQTL 5.35e-01 -0.064 0.103 0.226 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 -396548 sc-eQTL 3.75e-02 0.205 0.0981 0.223 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 -170712 sc-eQTL 5.69e-01 0.0583 0.102 0.223 DC L1
ENSG00000116641 DOCK7 508477 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00264 0.105 0.223 DC L1
ENSG00000125703 ATG4C 412731 sc-eQTL 4.66e-02 0.163 0.0812 0.223 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -396858 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0542 0.115 0.223 DC L1
ENSG00000162607 USP1 760566 sc-eQTL 6.41e-01 0.0468 0.1 0.223 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -326509 sc-eQTL 9.31e-01 0.00868 0.0998 0.223 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 -396548 sc-eQTL 7.01e-01 0.0371 0.0964 0.226 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 -170712 sc-eQTL 2.19e-01 0.124 0.1 0.226 Mono L1
ENSG00000116641 DOCK7 508477 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0183 0.0973 0.226 Mono L1
ENSG00000125703 ATG4C 412731 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0113 0.0657 0.226 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -396858 sc-eQTL 4.89e-01 0.072 0.104 0.226 Mono L1
ENSG00000162607 USP1 760566 sc-eQTL 1.74e-01 0.116 0.085 0.226 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 -396548 sc-eQTL 1.43e-01 -0.12 0.0813 0.225 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 -170712 sc-eQTL 9.62e-01 0.0046 0.0958 0.225 NK L1
ENSG00000116641 DOCK7 508477 sc-eQTL 3.93e-01 -0.0674 0.0788 0.225 NK L1
ENSG00000125703 ATG4C 412731 sc-eQTL 6.06e-01 0.0438 0.0847 0.225 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -396858 sc-eQTL 3.46e-03 0.305 0.103 0.225 NK L1
ENSG00000162607 USP1 760566 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0332 0.0941 0.225 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -326509 sc-eQTL 1.64e-01 0.159 0.114 0.225 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 -396548 sc-eQTL 1.74e-01 -0.125 0.0918 0.226 Other_T L1
ENSG00000088035 ALG6 -170712 sc-eQTL 1.37e-01 -0.138 0.0922 0.226 Other_T L1
ENSG00000116641 DOCK7 508477 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0215 0.0946 0.226 Other_T L1
ENSG00000125703 ATG4C 412731 sc-eQTL 7.43e-01 0.0268 0.0819 0.226 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -396858 sc-eQTL 1.66e-01 0.1 0.0723 0.226 Other_T L1
ENSG00000162607 USP1 760566 sc-eQTL 1.54e-01 -0.0897 0.0627 0.226 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -326509 sc-eQTL 2.81e-01 -0.121 0.112 0.226 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -396548 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00558 0.123 0.219 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 -170712 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00255 0.118 0.219 B_Activated L2
ENSG00000116641 DOCK7 508477 sc-eQTL 3.10e-01 -0.111 0.109 0.219 B_Activated L2
ENSG00000125703 ATG4C 412731 sc-eQTL 2.12e-01 -0.144 0.115 0.219 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -396858 sc-eQTL 6.81e-01 0.0463 0.112 0.219 B_Activated L2
ENSG00000162607 USP1 760566 sc-eQTL 1.19e-01 0.189 0.121 0.219 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -326509 sc-eQTL 7.20e-01 0.0382 0.106 0.219 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 -396548 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0364 0.111 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 -170712 sc-eQTL 3.85e-02 0.233 0.112 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000116641 DOCK7 508477 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0383 0.108 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000125703 ATG4C 412731 sc-eQTL 8.04e-01 0.0227 0.0914 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -396858 sc-eQTL 3.84e-01 0.0948 0.109 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000162607 USP1 760566 sc-eQTL 1.31e-01 0.164 0.108 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -326509 sc-eQTL 2.41e-01 -0.127 0.108 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 -396548 sc-eQTL 2.10e-01 -0.134 0.107 0.228 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 -170712 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0292 0.109 0.228 B_Memory L2
ENSG00000116641 DOCK7 508477 sc-eQTL 2.46e-01 0.119 0.102 0.228 B_Memory L2
ENSG00000125703 ATG4C 412731 sc-eQTL 9.22e-01 0.00948 0.0972 0.228 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -396858 sc-eQTL 2.38e-01 0.131 0.111 0.228 B_Memory L2
ENSG00000162607 USP1 760566 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0167 0.112 0.228 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -326509 sc-eQTL 1.62e-01 0.154 0.11 0.228 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 -396548 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0549 0.11 0.226 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 -170712 sc-eQTL 2.56e-02 0.245 0.109 0.226 B_Naive1 L2
ENSG00000116641 DOCK7 508477 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0226 0.106 0.226 B_Naive1 L2
ENSG00000125703 ATG4C 412731 sc-eQTL 2.29e-01 0.0979 0.0812 0.226 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -396858 sc-eQTL 2.26e-01 0.131 0.108 0.226 B_Naive1 L2
ENSG00000162607 USP1 760566 sc-eQTL 5.37e-01 0.0588 0.0949 0.226 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -326509 sc-eQTL 1.76e-01 -0.156 0.115 0.226 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 -396548 sc-eQTL 1.23e-01 0.168 0.108 0.227 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 -170712 sc-eQTL 7.19e-01 0.0409 0.114 0.227 B_Naive2 L2
ENSG00000116641 DOCK7 508477 sc-eQTL 2.61e-01 0.123 0.109 0.227 B_Naive2 L2
ENSG00000125703 ATG4C 412731 sc-eQTL 1.12e-01 0.167 0.105 0.227 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -396858 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0211 0.114 0.227 B_Naive2 L2
ENSG00000162607 USP1 760566 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0741 0.109 0.227 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -326509 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0914 0.113 0.227 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 -396548 sc-eQTL 5.91e-01 0.0594 0.11 0.232 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -170712 sc-eQTL 8.32e-01 0.0247 0.117 0.232 CD4_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 508477 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0232 0.102 0.232 CD4_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 412731 sc-eQTL 1.44e-01 -0.154 0.105 0.232 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -396858 sc-eQTL 7.89e-02 -0.198 0.112 0.232 CD4_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 760566 sc-eQTL 2.79e-01 0.116 0.107 0.232 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -326509 sc-eQTL 2.54e-01 -0.122 0.107 0.232 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -396548 sc-eQTL 4.13e-01 -0.073 0.0891 0.226 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -170712 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0359 0.0969 0.226 CD4_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 508477 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0233 0.0952 0.226 CD4_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 412731 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00417 0.0842 0.226 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -396858 sc-eQTL 9.18e-01 -0.0107 0.103 0.226 CD4_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 760566 sc-eQTL 1.72e-01 0.107 0.0783 0.226 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -326509 sc-eQTL 8.37e-01 0.021 0.102 0.226 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -396548 sc-eQTL 2.73e-01 -0.101 0.0915 0.226 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -170712 sc-eQTL 1.18e-01 0.166 0.106 0.226 CD4_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 508477 sc-eQTL 1.00e+00 -4.72e-05 0.0944 0.226 CD4_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 412731 sc-eQTL 3.01e-02 0.199 0.0909 0.226 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -396858 sc-eQTL 6.88e-01 0.0435 0.108 0.226 CD4_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 760566 sc-eQTL 2.50e-01 0.102 0.0886 0.226 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -326509 sc-eQTL 9.10e-01 0.0118 0.105 0.226 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -396548 sc-eQTL 8.27e-01 0.0241 0.11 0.226 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -170712 sc-eQTL 5.56e-01 0.0653 0.111 0.226 CD4_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 508477 sc-eQTL 4.10e-01 0.0889 0.108 0.226 CD4_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 412731 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0207 0.105 0.226 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -396858 sc-eQTL 2.25e-01 0.131 0.108 0.226 CD4_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 760566 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0386 0.102 0.226 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -326509 sc-eQTL 8.58e-01 -0.02 0.112 0.226 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -396548 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0452 0.0998 0.226 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -170712 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0161 0.106 0.226 CD8_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 508477 sc-eQTL 4.79e-01 0.0714 0.101 0.226 CD8_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 412731 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0358 0.107 0.226 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -396858 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00119 0.112 0.226 CD8_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 760566 sc-eQTL 3.92e-01 -0.0855 0.0997 0.226 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -326509 sc-eQTL 5.70e-01 0.0649 0.114 0.226 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -396548 sc-eQTL 6.14e-01 0.0517 0.102 0.226 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -170712 sc-eQTL 5.68e-01 0.0606 0.106 0.226 CD8_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 508477 sc-eQTL 3.91e-02 0.225 0.109 0.226 CD8_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 412731 sc-eQTL 1.48e-01 0.152 0.105 0.226 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -396858 sc-eQTL 9.13e-02 0.18 0.106 0.226 CD8_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 760566 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0226 0.0901 0.226 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -326509 sc-eQTL 1.22e-01 0.155 0.0999 0.226 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -396548 sc-eQTL 1.56e-01 0.16 0.112 0.231 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -170712 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0285 0.114 0.231 CD8_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 508477 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0532 0.111 0.231 CD8_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 412731 sc-eQTL 3.26e-01 -0.112 0.114 0.231 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -396858 sc-eQTL 5.51e-01 0.0661 0.111 0.231 CD8_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 760566 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00541 0.107 0.231 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -326509 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0612 0.113 0.231 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -396548 sc-eQTL 5.57e-01 0.0667 0.113 0.226 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -170712 sc-eQTL 7.57e-01 0.0353 0.114 0.226 CD8_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 508477 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0434 0.11 0.226 CD8_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 412731 sc-eQTL 1.06e-01 0.171 0.105 0.226 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -396858 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0835 0.115 0.226 CD8_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 760566 sc-eQTL 4.33e-01 -0.086 0.109 0.226 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -326509 sc-eQTL 3.32e-01 -0.108 0.111 0.226 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -396548 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0168 0.108 0.229 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 -170712 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0395 0.107 0.229 MAIT L2
ENSG00000116641 DOCK7 508477 sc-eQTL 8.90e-01 0.0142 0.102 0.229 MAIT L2
ENSG00000125703 ATG4C 412731 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0782 0.108 0.229 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -396858 sc-eQTL 9.59e-01 0.00562 0.108 0.229 MAIT L2
ENSG00000162607 USP1 760566 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00982 0.107 0.229 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -326509 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0515 0.111 0.229 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 -396548 sc-eQTL 4.67e-01 0.0803 0.11 0.224 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 -170712 sc-eQTL 2.43e-01 -0.132 0.113 0.224 NK_CD56bright L2
ENSG00000116641 DOCK7 508477 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0208 0.098 0.224 NK_CD56bright L2
ENSG00000125703 ATG4C 412731 sc-eQTL 4.04e-01 0.0914 0.109 0.224 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -396858 sc-eQTL 4.08e-02 0.232 0.113 0.224 NK_CD56bright L2
ENSG00000162607 USP1 760566 sc-eQTL 8.33e-01 0.0248 0.118 0.224 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -326509 sc-eQTL 5.60e-01 0.0655 0.112 0.224 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 -396548 sc-eQTL 2.78e-01 -0.0924 0.0849 0.226 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 -170712 sc-eQTL 9.01e-01 0.0135 0.108 0.226 NK_CD56dim L2
ENSG00000116641 DOCK7 508477 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0286 0.094 0.226 NK_CD56dim L2
ENSG00000125703 ATG4C 412731 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0279 0.0954 0.226 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -396858 sc-eQTL 6.28e-02 0.202 0.108 0.226 NK_CD56dim L2
ENSG00000162607 USP1 760566 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00735 0.105 0.226 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -326509 sc-eQTL 1.32e-02 0.289 0.116 0.226 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 -396548 sc-eQTL 8.00e-02 -0.207 0.118 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 -170712 sc-eQTL 2.08e-01 -0.155 0.123 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000116641 DOCK7 508477 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0228 0.0941 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000125703 ATG4C 412731 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0803 0.109 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -396858 sc-eQTL 6.73e-01 0.0486 0.115 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000162607 USP1 760566 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0922 0.12 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -326509 sc-eQTL 5.73e-01 0.0618 0.109 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 -396548 sc-eQTL 1.76e-02 -0.22 0.0919 0.226 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 -170712 sc-eQTL 4.31e-01 0.0829 0.105 0.226 NK_cytokine L2
ENSG00000116641 DOCK7 508477 sc-eQTL 6.70e-01 0.0415 0.0975 0.226 NK_cytokine L2
ENSG00000125703 ATG4C 412731 sc-eQTL 3.00e-01 0.103 0.0995 0.226 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -396858 sc-eQTL 7.23e-02 0.185 0.102 0.226 NK_cytokine L2
ENSG00000162607 USP1 760566 sc-eQTL 2.51e-01 -0.125 0.108 0.226 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -326509 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0846 0.11 0.226 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 -396548 sc-eQTL 7.51e-01 0.0412 0.129 0.23 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 -170712 sc-eQTL 1.00e-01 -0.223 0.134 0.23 PB L2
ENSG00000116641 DOCK7 508477 sc-eQTL 4.90e-01 -0.101 0.145 0.23 PB L2
ENSG00000125703 ATG4C 412731 sc-eQTL 4.81e-02 -0.249 0.125 0.23 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -396858 sc-eQTL 5.32e-01 0.0793 0.126 0.23 PB L2
ENSG00000162607 USP1 760566 sc-eQTL 1.43e-01 -0.184 0.125 0.23 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -326509 sc-eQTL 6.67e-01 0.0598 0.139 0.23 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 -396548 sc-eQTL 1.06e-01 -0.165 0.102 0.226 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 -170712 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0324 0.104 0.226 Pro_T L2
ENSG00000116641 DOCK7 508477 sc-eQTL 9.51e-01 0.00642 0.105 0.226 Pro_T L2
ENSG00000125703 ATG4C 412731 sc-eQTL 3.86e-01 0.0796 0.0916 0.226 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -396858 sc-eQTL 8.28e-02 0.159 0.0914 0.226 Pro_T L2
ENSG00000162607 USP1 760566 sc-eQTL 4.91e-01 0.0436 0.0632 0.226 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -326509 sc-eQTL 8.11e-01 0.0256 0.107 0.226 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 -396548 sc-eQTL 2.27e-01 0.129 0.107 0.226 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 -170712 sc-eQTL 1.32e-01 -0.172 0.114 0.226 Treg L2
ENSG00000116641 DOCK7 508477 sc-eQTL 5.43e-01 -0.064 0.105 0.226 Treg L2
ENSG00000125703 ATG4C 412731 sc-eQTL 2.19e-01 -0.132 0.107 0.226 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -396858 sc-eQTL 8.99e-01 0.0143 0.112 0.226 Treg L2
ENSG00000162607 USP1 760566 sc-eQTL 2.05e-01 -0.138 0.108 0.226 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -326509 sc-eQTL 2.52e-01 0.123 0.107 0.226 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 -396548 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0102 0.108 0.22 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -170712 sc-eQTL 5.83e-02 0.207 0.109 0.22 cDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 508477 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0481 0.108 0.22 cDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 412731 sc-eQTL 1.15e-01 0.147 0.0928 0.22 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -396858 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0829 0.118 0.22 cDC L2
ENSG00000162607 USP1 760566 sc-eQTL 2.27e-01 0.127 0.105 0.22 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -326509 sc-eQTL 2.02e-01 0.121 0.0947 0.22 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 -396548 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00247 0.1 0.226 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 -170712 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0158 0.1 0.226 cMono_IL1B L2
ENSG00000116641 DOCK7 508477 sc-eQTL 2.96e-01 -0.11 0.105 0.226 cMono_IL1B L2
ENSG00000125703 ATG4C 412731 sc-eQTL 7.54e-01 0.0233 0.0743 0.226 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -396858 sc-eQTL 3.13e-01 0.106 0.105 0.226 cMono_IL1B L2
ENSG00000162607 USP1 760566 sc-eQTL 5.05e-01 0.062 0.0928 0.226 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 -396548 sc-eQTL 4.50e-01 0.0834 0.11 0.226 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 -170712 sc-eQTL 1.50e-02 0.271 0.11 0.226 cMono_S100A L2
ENSG00000116641 DOCK7 508477 sc-eQTL 6.44e-01 0.048 0.104 0.226 cMono_S100A L2
ENSG00000125703 ATG4C 412731 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0517 0.0898 0.226 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -396858 sc-eQTL 3.68e-01 0.0912 0.101 0.226 cMono_S100A L2
ENSG00000162607 USP1 760566 sc-eQTL 2.10e-01 0.131 0.104 0.226 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 -396548 sc-eQTL 2.39e-01 -0.144 0.122 0.242 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 -170712 sc-eQTL 7.70e-01 0.0383 0.131 0.242 gdT L2
ENSG00000116641 DOCK7 508477 sc-eQTL 6.67e-01 0.0553 0.128 0.242 gdT L2
ENSG00000125703 ATG4C 412731 sc-eQTL 2.16e-01 0.151 0.122 0.242 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -396858 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0737 0.13 0.242 gdT L2
ENSG00000162607 USP1 760566 sc-eQTL 1.21e-01 -0.191 0.122 0.242 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -326509 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0565 0.128 0.242 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 -396548 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0544 0.114 0.227 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -170712 sc-eQTL 7.57e-02 -0.188 0.105 0.227 intMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 508477 sc-eQTL 7.94e-01 0.0283 0.108 0.227 intMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 412731 sc-eQTL 1.59e-01 -0.146 0.103 0.227 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -396858 sc-eQTL 2.14e-01 0.142 0.114 0.227 intMono L2
ENSG00000162607 USP1 760566 sc-eQTL 3.96e-01 0.0986 0.116 0.227 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -396548 sc-eQTL 2.74e-01 -0.115 0.105 0.213 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -170712 sc-eQTL 5.48e-01 0.0693 0.115 0.213 ncMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 508477 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000303 0.113 0.213 ncMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 412731 sc-eQTL 5.99e-01 0.0558 0.106 0.213 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -396858 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0645 0.111 0.213 ncMono L2
ENSG00000162607 USP1 760566 sc-eQTL 6.87e-01 0.0457 0.113 0.213 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -396548 sc-eQTL 7.11e-01 0.045 0.121 0.22 pDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -170712 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0541 0.118 0.22 pDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 508477 sc-eQTL 9.14e-01 0.0131 0.121 0.22 pDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 412731 sc-eQTL 3.38e-01 0.104 0.108 0.22 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -396858 sc-eQTL 2.33e-01 0.145 0.121 0.22 pDC L2
ENSG00000162607 USP1 760566 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0729 0.124 0.22 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -326509 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0841 0.107 0.22 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -396548 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0417 0.103 0.226 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -170712 sc-eQTL 6.19e-02 0.212 0.113 0.226 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 508477 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0252 0.0986 0.226 B_Memory LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 412731 sc-eQTL 3.57e-01 -0.0734 0.0796 0.226 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -396858 sc-eQTL 1.40e-01 0.154 0.104 0.226 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 760566 sc-eQTL 1.50e-01 0.146 0.101 0.226 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -326509 sc-eQTL 3.93e-01 0.0933 0.109 0.226 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -396548 sc-eQTL 5.23e-01 0.0681 0.107 0.226 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -170712 sc-eQTL 6.32e-02 0.203 0.109 0.226 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 508477 sc-eQTL 5.13e-01 0.0671 0.102 0.226 B_Naive LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 412731 sc-eQTL 9.35e-02 0.131 0.0778 0.226 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -396858 sc-eQTL 2.32e-01 0.132 0.11 0.226 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 760566 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0157 0.0951 0.226 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -326509 sc-eQTL 2.32e-01 -0.133 0.111 0.226 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -396548 sc-eQTL 6.41e-01 0.0477 0.102 0.226 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -170712 sc-eQTL 2.49e-01 0.114 0.0987 0.226 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 508477 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0499 0.0997 0.226 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 412731 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00223 0.0689 0.226 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -396858 sc-eQTL 2.14e-01 0.127 0.102 0.226 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 760566 sc-eQTL 3.06e-01 0.0891 0.0869 0.226 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -396548 sc-eQTL 2.13e-01 -0.123 0.0987 0.224 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -170712 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00705 0.113 0.224 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 508477 sc-eQTL 6.07e-01 0.0574 0.111 0.224 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 412731 sc-eQTL 9.95e-01 0.000626 0.0949 0.224 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -396858 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00116 0.11 0.224 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 760566 sc-eQTL 8.32e-01 0.0219 0.104 0.224 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -396548 sc-eQTL 5.55e-02 -0.158 0.0822 0.226 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -170712 sc-eQTL 6.56e-01 0.0443 0.0995 0.226 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 508477 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0375 0.0892 0.226 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 412731 sc-eQTL 7.08e-01 0.0334 0.089 0.226 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -396858 sc-eQTL 2.61e-02 0.234 0.104 0.226 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 760566 sc-eQTL 2.84e-01 -0.103 0.0955 0.226 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -326509 sc-eQTL 1.90e-01 0.153 0.116 0.226 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000088035 ALG6 -170712 eQTL 0.0075 -0.0404 0.0151 0.0 0.0 0.249
ENSG00000142856 ITGB3BP -396858 eQTL 0.000728 0.113 0.0332 0.0 0.0 0.249

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000079739 \N -396548 9.36e-07 5.67e-07 9.71e-08 3.99e-07 1.13e-07 1.77e-07 5.54e-07 1.11e-07 4.18e-07 2.28e-07 6.88e-07 3.36e-07 7.93e-07 1.17e-07 1.68e-07 2.18e-07 3.35e-07 3.73e-07 1.77e-07 1.39e-07 1.92e-07 3.76e-07 3.7e-07 1.29e-07 8.33e-07 2.4e-07 2.57e-07 2.65e-07 3.86e-07 4.9e-07 3.32e-07 7.33e-08 5.19e-08 1.4e-07 3e-07 7.98e-08 1.02e-07 7.86e-08 6.29e-08 3.05e-08 1.02e-07 5.96e-07 1.67e-08 1.06e-08 1.33e-07 1.61e-08 8.01e-08 1.11e-08 5.54e-08