logo

Genes within 1Mb (chr1:63194582:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -398829 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0187 0.0893 0.226 B L1
ENSG00000088035 ALG6 -172993 sc-eQTL 2.84e-03 -0.273 0.0905 0.226 B L1
ENSG00000116641 DOCK7 506196 sc-eQTL 7.35e-01 0.0313 0.0925 0.226 B L1
ENSG00000125703 ATG4C 410450 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0119 0.0643 0.226 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -399139 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0828 0.102 0.226 B L1
ENSG00000162607 USP1 758285 sc-eQTL 8.44e-02 -0.153 0.0882 0.226 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -328790 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0127 0.105 0.226 B L1
ENSG00000079739 PGM1 -398829 sc-eQTL 6.04e-01 0.0391 0.0752 0.226 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 -172993 sc-eQTL 7.31e-01 0.0286 0.083 0.226 CD4T L1
ENSG00000116641 DOCK7 506196 sc-eQTL 3.00e-01 0.0871 0.0838 0.226 CD4T L1
ENSG00000125703 ATG4C 410450 sc-eQTL 8.50e-01 0.0128 0.0679 0.226 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -399139 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0554 0.0963 0.226 CD4T L1
ENSG00000162607 USP1 758285 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0402 0.0658 0.226 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -328790 sc-eQTL 1.51e-01 0.124 0.0861 0.226 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 -398829 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0334 0.0834 0.226 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 -172993 sc-eQTL 4.42e-01 0.0707 0.0918 0.226 CD8T L1
ENSG00000116641 DOCK7 506196 sc-eQTL 7.20e-01 0.0335 0.0931 0.226 CD8T L1
ENSG00000125703 ATG4C 410450 sc-eQTL 3.75e-01 -0.0785 0.0883 0.226 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -399139 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000907 0.0989 0.226 CD8T L1
ENSG00000162607 USP1 758285 sc-eQTL 4.17e-01 -0.0625 0.077 0.226 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -328790 sc-eQTL 8.23e-01 -0.022 0.0986 0.226 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 -398829 sc-eQTL 4.99e-01 0.0632 0.0932 0.221 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 -172993 sc-eQTL 6.20e-01 0.0477 0.0962 0.221 DC L1
ENSG00000116641 DOCK7 506196 sc-eQTL 2.12e-01 0.123 0.0983 0.221 DC L1
ENSG00000125703 ATG4C 410450 sc-eQTL 3.30e-01 0.0753 0.077 0.221 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -399139 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0561 0.108 0.221 DC L1
ENSG00000162607 USP1 758285 sc-eQTL 2.88e-01 -0.1 0.0939 0.221 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -328790 sc-eQTL 3.12e-01 0.095 0.0937 0.221 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 -398829 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0548 0.0895 0.226 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 -172993 sc-eQTL 4.90e-02 -0.183 0.0926 0.226 Mono L1
ENSG00000116641 DOCK7 506196 sc-eQTL 9.44e-02 0.151 0.0898 0.226 Mono L1
ENSG00000125703 ATG4C 410450 sc-eQTL 5.81e-01 0.0338 0.0611 0.226 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -399139 sc-eQTL 2.60e-01 0.109 0.0963 0.226 Mono L1
ENSG00000162607 USP1 758285 sc-eQTL 3.66e-01 -0.0717 0.0791 0.226 Mono L1
ENSG00000240563 L1TD1 999733 sc-eQTL 9.19e-01 0.00749 0.074 0.226 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 -398829 sc-eQTL 3.68e-01 0.0694 0.077 0.227 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 -172993 sc-eQTL 4.77e-01 0.0644 0.0903 0.227 NK L1
ENSG00000116641 DOCK7 506196 sc-eQTL 7.97e-01 0.0191 0.0745 0.227 NK L1
ENSG00000125703 ATG4C 410450 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0359 0.08 0.227 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -399139 sc-eQTL 7.95e-01 0.0259 0.0994 0.227 NK L1
ENSG00000162607 USP1 758285 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0675 0.0887 0.227 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -328790 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0914 0.108 0.227 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 -398829 sc-eQTL 5.14e-01 0.0583 0.0891 0.226 Other_T L1
ENSG00000088035 ALG6 -172993 sc-eQTL 2.52e-01 -0.103 0.0894 0.226 Other_T L1
ENSG00000116641 DOCK7 506196 sc-eQTL 9.29e-01 -0.00819 0.0915 0.226 Other_T L1
ENSG00000125703 ATG4C 410450 sc-eQTL 9.53e-01 0.00468 0.0792 0.226 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -399139 sc-eQTL 8.94e-01 -0.00936 0.0702 0.226 Other_T L1
ENSG00000162607 USP1 758285 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0439 0.0608 0.226 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -328790 sc-eQTL 6.14e-02 -0.202 0.107 0.226 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -398829 sc-eQTL 9.23e-01 0.0116 0.121 0.222 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 -172993 sc-eQTL 6.52e-01 0.0523 0.116 0.222 B_Activated L2
ENSG00000116641 DOCK7 506196 sc-eQTL 2.87e-01 0.115 0.107 0.222 B_Activated L2
ENSG00000125703 ATG4C 410450 sc-eQTL 8.42e-01 0.0227 0.113 0.222 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -399139 sc-eQTL 3.99e-01 0.0934 0.111 0.222 B_Activated L2
ENSG00000162607 USP1 758285 sc-eQTL 3.48e-01 0.113 0.12 0.222 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -328790 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0556 0.105 0.222 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 -398829 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0821 0.107 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 -172993 sc-eQTL 2.86e-02 -0.237 0.107 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000116641 DOCK7 506196 sc-eQTL 8.39e-01 0.0211 0.104 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000125703 ATG4C 410450 sc-eQTL 2.54e-01 0.1 0.0876 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -399139 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0232 0.105 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000162607 USP1 758285 sc-eQTL 1.93e-01 -0.136 0.104 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -328790 sc-eQTL 8.85e-01 -0.015 0.104 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 -398829 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00898 0.105 0.226 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 -172993 sc-eQTL 2.51e-02 -0.238 0.106 0.226 B_Memory L2
ENSG00000116641 DOCK7 506196 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0797 0.1 0.226 B_Memory L2
ENSG00000125703 ATG4C 410450 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0335 0.0953 0.226 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -399139 sc-eQTL 2.75e-01 -0.119 0.109 0.226 B_Memory L2
ENSG00000162607 USP1 758285 sc-eQTL 6.59e-03 -0.297 0.108 0.226 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -328790 sc-eQTL 5.74e-01 0.0609 0.108 0.226 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 -398829 sc-eQTL 5.40e-01 0.0644 0.105 0.226 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 -172993 sc-eQTL 2.27e-02 -0.239 0.104 0.226 B_Naive1 L2
ENSG00000116641 DOCK7 506196 sc-eQTL 3.82e-01 0.0884 0.101 0.226 B_Naive1 L2
ENSG00000125703 ATG4C 410450 sc-eQTL 8.05e-01 0.0193 0.0778 0.226 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -399139 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0531 0.103 0.226 B_Naive1 L2
ENSG00000162607 USP1 758285 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0103 0.0908 0.226 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -328790 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0871 0.11 0.226 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 -398829 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0272 0.103 0.227 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 -172993 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0205 0.108 0.227 B_Naive2 L2
ENSG00000116641 DOCK7 506196 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0393 0.104 0.227 B_Naive2 L2
ENSG00000125703 ATG4C 410450 sc-eQTL 7.59e-01 0.0306 0.0996 0.227 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -399139 sc-eQTL 4.77e-01 -0.077 0.108 0.227 B_Naive2 L2
ENSG00000162607 USP1 758285 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0575 0.103 0.227 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -328790 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0363 0.108 0.227 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 -398829 sc-eQTL 3.17e-01 0.104 0.104 0.232 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -172993 sc-eQTL 1.25e-01 -0.169 0.11 0.232 CD4_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 506196 sc-eQTL 4.13e-01 0.079 0.0963 0.232 CD4_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 410450 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0422 0.0997 0.232 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -399139 sc-eQTL 6.75e-01 0.0448 0.107 0.232 CD4_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 758285 sc-eQTL 7.28e-01 0.0353 0.102 0.232 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -328790 sc-eQTL 8.72e-03 0.264 0.0996 0.232 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -398829 sc-eQTL 6.09e-01 0.0435 0.0849 0.226 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -172993 sc-eQTL 1.57e-01 0.131 0.0918 0.226 CD4_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 506196 sc-eQTL 5.01e-01 0.0611 0.0905 0.226 CD4_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 410450 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0159 0.0801 0.226 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -399139 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0706 0.0978 0.226 CD4_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 758285 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0402 0.0748 0.226 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -328790 sc-eQTL 2.97e-01 0.101 0.097 0.226 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -398829 sc-eQTL 2.43e-01 -0.103 0.0879 0.226 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -172993 sc-eQTL 9.13e-02 -0.172 0.102 0.226 CD4_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 506196 sc-eQTL 9.60e-01 0.0046 0.0907 0.226 CD4_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 410450 sc-eQTL 9.22e-01 -0.00866 0.0883 0.226 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -399139 sc-eQTL 9.60e-01 0.00526 0.104 0.226 CD4_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 758285 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0723 0.0852 0.226 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -328790 sc-eQTL 3.78e-01 0.0889 0.101 0.226 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -398829 sc-eQTL 1.98e-01 0.136 0.106 0.226 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -172993 sc-eQTL 7.43e-01 -0.035 0.107 0.226 CD4_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 506196 sc-eQTL 9.17e-01 0.0108 0.104 0.226 CD4_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 410450 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0542 0.101 0.226 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -399139 sc-eQTL 1.42e-01 -0.153 0.104 0.226 CD4_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 758285 sc-eQTL 2.31e-01 0.118 0.0983 0.226 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -328790 sc-eQTL 1.52e-01 0.154 0.107 0.226 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -398829 sc-eQTL 8.43e-02 0.162 0.0934 0.226 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -172993 sc-eQTL 9.50e-01 0.00627 0.1 0.226 CD8_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 506196 sc-eQTL 7.75e-01 0.0272 0.0949 0.226 CD8_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 410450 sc-eQTL 3.62e-01 -0.092 0.101 0.226 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -399139 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0164 0.105 0.226 CD8_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 758285 sc-eQTL 2.94e-01 -0.0988 0.0938 0.226 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -328790 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0755 0.107 0.226 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -398829 sc-eQTL 9.17e-01 0.01 0.0962 0.226 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -172993 sc-eQTL 4.21e-01 0.0802 0.0994 0.226 CD8_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 506196 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0795 0.103 0.226 CD8_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 410450 sc-eQTL 6.77e-01 0.0412 0.0988 0.226 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -399139 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0474 0.1 0.226 CD8_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 758285 sc-eQTL 7.77e-01 0.024 0.0846 0.226 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -328790 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0746 0.0942 0.226 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -398829 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0282 0.108 0.222 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -172993 sc-eQTL 1.37e-01 0.163 0.109 0.222 CD8_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 506196 sc-eQTL 4.62e-01 0.0788 0.107 0.222 CD8_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 410450 sc-eQTL 7.15e-01 0.0401 0.11 0.222 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -399139 sc-eQTL 6.89e-01 0.0427 0.107 0.222 CD8_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 758285 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0286 0.103 0.222 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -328790 sc-eQTL 8.23e-01 0.0243 0.109 0.222 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -398829 sc-eQTL 6.37e-02 -0.196 0.105 0.228 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -172993 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0859 0.106 0.228 CD8_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 506196 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0353 0.103 0.228 CD8_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 410450 sc-eQTL 3.55e-01 -0.0919 0.0992 0.228 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -399139 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0212 0.108 0.228 CD8_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 758285 sc-eQTL 5.11e-01 0.0675 0.103 0.228 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -328790 sc-eQTL 1.51e-01 -0.15 0.104 0.228 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -398829 sc-eQTL 3.19e-01 -0.0996 0.0997 0.227 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 -172993 sc-eQTL 1.39e-01 -0.146 0.0985 0.227 MAIT L2
ENSG00000116641 DOCK7 506196 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0182 0.0948 0.227 MAIT L2
ENSG00000125703 ATG4C 410450 sc-eQTL 2.09e-01 0.126 0.0996 0.227 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -399139 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0616 0.1 0.227 MAIT L2
ENSG00000162607 USP1 758285 sc-eQTL 8.94e-02 -0.168 0.0987 0.227 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -328790 sc-eQTL 1.07e-01 -0.166 0.103 0.227 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 -398829 sc-eQTL 8.76e-01 0.0158 0.101 0.231 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 -172993 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00816 0.104 0.231 NK_CD56bright L2
ENSG00000116641 DOCK7 506196 sc-eQTL 8.94e-01 0.012 0.0901 0.231 NK_CD56bright L2
ENSG00000125703 ATG4C 410450 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0236 0.101 0.231 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -399139 sc-eQTL 1.33e-01 -0.157 0.104 0.231 NK_CD56bright L2
ENSG00000162607 USP1 758285 sc-eQTL 4.16e-02 0.219 0.107 0.231 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -328790 sc-eQTL 2.70e-01 -0.114 0.103 0.231 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 -398829 sc-eQTL 4.85e-01 0.0561 0.0803 0.228 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 -172993 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0723 0.102 0.228 NK_CD56dim L2
ENSG00000116641 DOCK7 506196 sc-eQTL 9.98e-01 0.000214 0.0887 0.228 NK_CD56dim L2
ENSG00000125703 ATG4C 410450 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00669 0.0901 0.228 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -399139 sc-eQTL 8.33e-01 0.0217 0.103 0.228 NK_CD56dim L2
ENSG00000162607 USP1 758285 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0441 0.0994 0.228 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -328790 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0664 0.111 0.228 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 -398829 sc-eQTL 3.59e-01 0.0996 0.108 0.233 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 -172993 sc-eQTL 2.32e-02 0.254 0.111 0.233 NK_HLA L2
ENSG00000116641 DOCK7 506196 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0148 0.086 0.233 NK_HLA L2
ENSG00000125703 ATG4C 410450 sc-eQTL 2.19e-01 0.123 0.0996 0.233 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -399139 sc-eQTL 1.81e-01 0.14 0.105 0.233 NK_HLA L2
ENSG00000162607 USP1 758285 sc-eQTL 6.49e-01 0.05 0.11 0.233 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -328790 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0496 0.1 0.233 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 -398829 sc-eQTL 7.94e-01 0.0229 0.0876 0.228 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 -172993 sc-eQTL 6.80e-01 0.0409 0.0989 0.228 NK_cytokine L2
ENSG00000116641 DOCK7 506196 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0493 0.0916 0.228 NK_cytokine L2
ENSG00000125703 ATG4C 410450 sc-eQTL 2.81e-01 -0.101 0.0935 0.228 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -399139 sc-eQTL 4.93e-01 0.0666 0.097 0.228 NK_cytokine L2
ENSG00000162607 USP1 758285 sc-eQTL 3.13e-01 -0.103 0.102 0.228 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -328790 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0118 0.103 0.228 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 -398829 sc-eQTL 9.37e-02 -0.224 0.132 0.189 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 -172993 sc-eQTL 2.79e-01 -0.152 0.14 0.189 PB L2
ENSG00000116641 DOCK7 506196 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0654 0.15 0.189 PB L2
ENSG00000125703 ATG4C 410450 sc-eQTL 5.61e-04 0.442 0.124 0.189 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -399139 sc-eQTL 3.57e-01 0.121 0.13 0.189 PB L2
ENSG00000162607 USP1 758285 sc-eQTL 3.85e-01 0.113 0.13 0.189 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -328790 sc-eQTL 3.20e-01 -0.143 0.143 0.189 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 -398829 sc-eQTL 7.73e-01 0.0275 0.0952 0.226 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 -172993 sc-eQTL 3.10e-01 -0.0983 0.0966 0.226 Pro_T L2
ENSG00000116641 DOCK7 506196 sc-eQTL 2.83e-01 -0.104 0.097 0.226 Pro_T L2
ENSG00000125703 ATG4C 410450 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0153 0.0851 0.226 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -399139 sc-eQTL 6.78e-01 0.0355 0.0853 0.226 Pro_T L2
ENSG00000162607 USP1 758285 sc-eQTL 4.04e-01 0.049 0.0586 0.226 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -328790 sc-eQTL 7.86e-01 0.027 0.0992 0.226 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 -398829 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0386 0.101 0.226 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 -172993 sc-eQTL 3.53e-01 0.0999 0.107 0.226 Treg L2
ENSG00000116641 DOCK7 506196 sc-eQTL 8.05e-01 0.0244 0.0988 0.226 Treg L2
ENSG00000125703 ATG4C 410450 sc-eQTL 9.57e-01 0.00551 0.101 0.226 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -399139 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0364 0.106 0.226 Treg L2
ENSG00000162607 USP1 758285 sc-eQTL 8.94e-01 0.0136 0.102 0.226 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -328790 sc-eQTL 4.62e-01 0.0744 0.101 0.226 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 -398829 sc-eQTL 8.53e-02 0.169 0.0976 0.234 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -172993 sc-eQTL 9.77e-01 0.00288 0.0998 0.234 cDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 506196 sc-eQTL 5.32e-02 0.189 0.0969 0.234 cDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 410450 sc-eQTL 6.75e-01 0.0357 0.085 0.234 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -399139 sc-eQTL 3.01e-01 -0.111 0.107 0.234 cDC L2
ENSG00000162607 USP1 758285 sc-eQTL 3.50e-01 -0.0897 0.0957 0.234 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -328790 sc-eQTL 3.72e-01 -0.0774 0.0864 0.234 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 -398829 sc-eQTL 3.19e-01 -0.0929 0.0931 0.226 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 -172993 sc-eQTL 6.01e-02 -0.175 0.0927 0.226 cMono_IL1B L2
ENSG00000116641 DOCK7 506196 sc-eQTL 2.12e-02 0.226 0.0973 0.226 cMono_IL1B L2
ENSG00000125703 ATG4C 410450 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0373 0.0692 0.226 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -399139 sc-eQTL 4.24e-01 0.0785 0.098 0.226 cMono_IL1B L2
ENSG00000162607 USP1 758285 sc-eQTL 1.61e-01 -0.121 0.0862 0.226 cMono_IL1B L2
ENSG00000240563 L1TD1 999733 sc-eQTL 1.16e-01 0.137 0.0864 0.226 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 -398829 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0171 0.103 0.226 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 -172993 sc-eQTL 2.23e-01 -0.127 0.104 0.226 cMono_S100A L2
ENSG00000116641 DOCK7 506196 sc-eQTL 9.75e-01 0.00303 0.0969 0.226 cMono_S100A L2
ENSG00000125703 ATG4C 410450 sc-eQTL 1.66e-01 0.116 0.0835 0.226 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -399139 sc-eQTL 3.79e-01 0.0832 0.0944 0.226 cMono_S100A L2
ENSG00000162607 USP1 758285 sc-eQTL 7.55e-01 0.0304 0.0974 0.226 cMono_S100A L2
ENSG00000240563 L1TD1 999733 sc-eQTL 8.82e-01 -0.012 0.081 0.226 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 -398829 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0313 0.113 0.245 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 -172993 sc-eQTL 7.66e-01 -0.036 0.121 0.245 gdT L2
ENSG00000116641 DOCK7 506196 sc-eQTL 8.71e-01 0.0192 0.118 0.245 gdT L2
ENSG00000125703 ATG4C 410450 sc-eQTL 9.00e-03 -0.292 0.11 0.245 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -399139 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0575 0.12 0.245 gdT L2
ENSG00000162607 USP1 758285 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0756 0.113 0.245 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -328790 sc-eQTL 1.15e-01 -0.186 0.117 0.245 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 -398829 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0685 0.103 0.229 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -172993 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0449 0.0956 0.229 intMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 506196 sc-eQTL 1.94e-01 0.127 0.0973 0.229 intMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 410450 sc-eQTL 5.32e-01 0.0583 0.0931 0.229 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -399139 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0424 0.103 0.229 intMono L2
ENSG00000162607 USP1 758285 sc-eQTL 2.01e-01 -0.133 0.104 0.229 intMono L2
ENSG00000240563 L1TD1 999733 sc-eQTL 6.19e-01 0.0382 0.0768 0.229 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -398829 sc-eQTL 4.21e-01 0.0748 0.0928 0.231 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -172993 sc-eQTL 2.41e-01 -0.12 0.102 0.231 ncMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 506196 sc-eQTL 4.07e-01 0.0834 0.1 0.231 ncMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 410450 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0612 0.0937 0.231 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -399139 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0808 0.098 0.231 ncMono L2
ENSG00000162607 USP1 758285 sc-eQTL 2.73e-01 -0.11 0.1 0.231 ncMono L2
ENSG00000240563 L1TD1 999733 sc-eQTL 4.12e-01 -0.0584 0.071 0.231 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -398829 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0296 0.111 0.251 pDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -172993 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0119 0.108 0.251 pDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 506196 sc-eQTL 5.72e-01 0.0623 0.11 0.251 pDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 410450 sc-eQTL 8.19e-01 0.0226 0.0988 0.251 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -399139 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0701 0.111 0.251 pDC L2
ENSG00000162607 USP1 758285 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00516 0.113 0.251 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -328790 sc-eQTL 4.66e-02 0.194 0.0969 0.251 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -398829 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0539 0.0978 0.226 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -172993 sc-eQTL 3.99e-03 -0.309 0.106 0.226 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 506196 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0361 0.0939 0.226 B_Memory LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 410450 sc-eQTL 3.56e-01 0.07 0.0758 0.226 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -399139 sc-eQTL 4.02e-01 -0.0837 0.0996 0.226 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 758285 sc-eQTL 2.66e-02 -0.214 0.0957 0.226 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -328790 sc-eQTL 7.42e-01 0.0342 0.104 0.226 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -398829 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0128 0.102 0.226 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -172993 sc-eQTL 7.41e-02 -0.188 0.105 0.226 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 506196 sc-eQTL 3.72e-01 0.0879 0.0982 0.226 B_Naive LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 410450 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0104 0.0751 0.226 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -399139 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0828 0.106 0.226 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 758285 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0743 0.0911 0.226 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -328790 sc-eQTL 4.10e-01 -0.088 0.107 0.226 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -398829 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0461 0.0956 0.226 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -172993 sc-eQTL 1.25e-02 -0.23 0.0913 0.226 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 506196 sc-eQTL 6.84e-02 0.17 0.0925 0.226 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 410450 sc-eQTL 3.36e-01 0.0621 0.0643 0.226 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -399139 sc-eQTL 1.65e-01 0.132 0.0949 0.226 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 758285 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0498 0.0814 0.226 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000240563 L1TD1 999733 sc-eQTL 2.06e-01 0.112 0.088 0.226 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -398829 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00571 0.0902 0.226 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -172993 sc-eQTL 4.24e-01 -0.082 0.102 0.226 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 506196 sc-eQTL 2.66e-01 0.113 0.101 0.226 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 410450 sc-eQTL 7.98e-01 0.0221 0.0864 0.226 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -399139 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0132 0.1 0.226 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 758285 sc-eQTL 1.64e-01 -0.131 0.0939 0.226 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000240563 L1TD1 999733 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0477 0.0642 0.226 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -398829 sc-eQTL 2.45e-01 0.0909 0.0779 0.228 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -172993 sc-eQTL 7.68e-01 0.0278 0.0938 0.228 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 506196 sc-eQTL 9.20e-01 0.00846 0.0841 0.228 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 410450 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0376 0.0839 0.228 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -399139 sc-eQTL 6.24e-01 0.0488 0.0994 0.228 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 758285 sc-eQTL 2.06e-01 -0.114 0.0899 0.228 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -328790 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0264 0.11 0.228 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000142856 ITGB3BP -399139 eQTL 0.00625 -0.0948 0.0346 0.0 0.0 0.249
ENSG00000162607 USP1 758285 eQTL 0.0331 -0.0325 0.0152 0.0 0.0 0.249

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000088035 \N -172993 2.66e-06 2.44e-06 4.43e-07 1.76e-06 7.62e-07 8.34e-07 1.87e-06 8.2e-07 1.91e-06 1.01e-06 2.48e-06 1.41e-06 3.25e-06 1.43e-06 8.88e-07 1.7e-06 1.26e-06 2.31e-06 1.37e-06 1.47e-06 1.32e-06 3.02e-06 2.46e-06 1.46e-06 3.48e-06 1.05e-06 1.36e-06 1.8e-06 2.57e-06 1.95e-06 1.73e-06 3.79e-07 5.8e-07 1.33e-06 1.27e-06 1.02e-06 7.18e-07 4.58e-07 1.18e-06 3.46e-07 2.92e-07 3.26e-06 4.98e-07 1.9e-07 3.64e-07 3.14e-07 8.22e-07 1.95e-07 1.74e-07