logo

Genes within 1Mb (chr1:63194577:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -398834 sc-eQTL 9.99e-01 6.92e-05 0.0915 0.199 B L1
ENSG00000088035 ALG6 -172998 sc-eQTL 1.04e-03 -0.307 0.0924 0.199 B L1
ENSG00000116641 DOCK7 506191 sc-eQTL 5.77e-01 0.0528 0.0947 0.199 B L1
ENSG00000125703 ATG4C 410445 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0367 0.0658 0.199 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -399144 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0119 0.105 0.199 B L1
ENSG00000162607 USP1 758280 sc-eQTL 3.00e-01 -0.0944 0.0908 0.199 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -328795 sc-eQTL 7.38e-01 0.0359 0.107 0.199 B L1
ENSG00000079739 PGM1 -398834 sc-eQTL 6.93e-01 0.0306 0.0773 0.199 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 -172998 sc-eQTL 8.01e-01 0.0216 0.0853 0.199 CD4T L1
ENSG00000116641 DOCK7 506191 sc-eQTL 2.98e-01 0.0899 0.0862 0.199 CD4T L1
ENSG00000125703 ATG4C 410445 sc-eQTL 4.61e-01 0.0515 0.0697 0.199 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -399144 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0323 0.099 0.199 CD4T L1
ENSG00000162607 USP1 758280 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0163 0.0677 0.199 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -328795 sc-eQTL 3.58e-01 0.0818 0.0887 0.199 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 -398834 sc-eQTL 9.69e-01 0.00335 0.0854 0.199 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 -172998 sc-eQTL 4.15e-01 0.0768 0.094 0.199 CD8T L1
ENSG00000116641 DOCK7 506191 sc-eQTL 1.98e-01 0.123 0.095 0.199 CD8T L1
ENSG00000125703 ATG4C 410445 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0616 0.0905 0.199 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -399144 sc-eQTL 7.47e-01 0.0327 0.101 0.199 CD8T L1
ENSG00000162607 USP1 758280 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0577 0.0788 0.199 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -328795 sc-eQTL 7.53e-01 0.0318 0.101 0.199 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 -398834 sc-eQTL 5.82e-01 0.0521 0.0946 0.198 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 -172998 sc-eQTL 7.17e-01 0.0354 0.0977 0.198 DC L1
ENSG00000116641 DOCK7 506191 sc-eQTL 2.02e-01 0.128 0.0997 0.198 DC L1
ENSG00000125703 ATG4C 410445 sc-eQTL 1.12e-01 0.124 0.0779 0.198 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -399144 sc-eQTL 2.87e-01 -0.117 0.109 0.198 DC L1
ENSG00000162607 USP1 758280 sc-eQTL 3.19e-01 -0.0953 0.0954 0.198 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -328795 sc-eQTL 2.20e-01 0.117 0.095 0.198 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 -398834 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0223 0.0924 0.199 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 -172998 sc-eQTL 5.65e-02 -0.183 0.0956 0.199 Mono L1
ENSG00000116641 DOCK7 506191 sc-eQTL 2.03e-01 0.119 0.0929 0.199 Mono L1
ENSG00000125703 ATG4C 410445 sc-eQTL 6.60e-01 0.0278 0.063 0.199 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -399144 sc-eQTL 8.53e-02 0.171 0.0989 0.199 Mono L1
ENSG00000162607 USP1 758280 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0619 0.0817 0.199 Mono L1
ENSG00000240563 L1TD1 999728 sc-eQTL 8.36e-01 0.0158 0.0763 0.199 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 -398834 sc-eQTL 2.80e-01 0.0856 0.079 0.2 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 -172998 sc-eQTL 5.88e-01 0.0503 0.0928 0.2 NK L1
ENSG00000116641 DOCK7 506191 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0131 0.0765 0.2 NK L1
ENSG00000125703 ATG4C 410445 sc-eQTL 6.35e-01 -0.039 0.0821 0.2 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -399144 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0133 0.102 0.2 NK L1
ENSG00000162607 USP1 758280 sc-eQTL 9.02e-01 0.0113 0.0912 0.2 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -328795 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0745 0.111 0.2 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 -398834 sc-eQTL 6.51e-01 0.0416 0.0917 0.199 Other_T L1
ENSG00000088035 ALG6 -172998 sc-eQTL 2.53e-01 -0.105 0.0919 0.199 Other_T L1
ENSG00000116641 DOCK7 506191 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0377 0.094 0.199 Other_T L1
ENSG00000125703 ATG4C 410445 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0297 0.0814 0.199 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -399144 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0191 0.0722 0.199 Other_T L1
ENSG00000162607 USP1 758280 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0175 0.0626 0.199 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -328795 sc-eQTL 7.22e-02 -0.2 0.111 0.199 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -398834 sc-eQTL 7.28e-01 0.0425 0.122 0.199 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 -172998 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0463 0.117 0.199 B_Activated L2
ENSG00000116641 DOCK7 506191 sc-eQTL 4.15e-01 0.0887 0.109 0.199 B_Activated L2
ENSG00000125703 ATG4C 410445 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00502 0.115 0.199 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -399144 sc-eQTL 1.70e-01 0.153 0.111 0.199 B_Activated L2
ENSG00000162607 USP1 758280 sc-eQTL 2.38e-01 0.143 0.121 0.199 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -328795 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0652 0.106 0.199 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 -398834 sc-eQTL 4.79e-01 -0.078 0.11 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 -172998 sc-eQTL 6.16e-02 -0.208 0.111 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000116641 DOCK7 506191 sc-eQTL 9.38e-01 0.00829 0.107 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000125703 ATG4C 410445 sc-eQTL 4.52e-01 0.068 0.0903 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -399144 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0139 0.108 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000162607 USP1 758280 sc-eQTL 2.66e-01 -0.119 0.107 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -328795 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0198 0.107 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 -398834 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0174 0.107 0.2 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 -172998 sc-eQTL 4.49e-03 -0.308 0.107 0.2 B_Memory L2
ENSG00000116641 DOCK7 506191 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0292 0.102 0.2 B_Memory L2
ENSG00000125703 ATG4C 410445 sc-eQTL 7.51e-01 0.0309 0.0973 0.2 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -399144 sc-eQTL 5.79e-01 -0.062 0.111 0.2 B_Memory L2
ENSG00000162607 USP1 758280 sc-eQTL 8.94e-03 -0.292 0.111 0.2 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -328795 sc-eQTL 4.02e-01 0.0927 0.11 0.2 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 -398834 sc-eQTL 5.20e-01 0.069 0.107 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 -172998 sc-eQTL 9.55e-03 -0.277 0.106 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000116641 DOCK7 506191 sc-eQTL 3.08e-01 0.105 0.103 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000125703 ATG4C 410445 sc-eQTL 4.55e-01 0.0594 0.0794 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -399144 sc-eQTL 6.13e-01 0.0534 0.105 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000162607 USP1 758280 sc-eQTL 9.32e-01 0.00787 0.0927 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -328795 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0401 0.112 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 -398834 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0144 0.106 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 -172998 sc-eQTL 9.26e-01 0.0103 0.11 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000116641 DOCK7 506191 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0448 0.106 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000125703 ATG4C 410445 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0501 0.102 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -399144 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0672 0.111 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000162607 USP1 758280 sc-eQTL 6.34e-01 0.0503 0.105 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -328795 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0248 0.11 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 -398834 sc-eQTL 1.58e-01 0.149 0.105 0.202 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -172998 sc-eQTL 1.45e-01 -0.163 0.111 0.202 CD4_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 506191 sc-eQTL 3.20e-01 0.0971 0.0974 0.202 CD4_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 410445 sc-eQTL 8.04e-01 0.0251 0.101 0.202 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -399144 sc-eQTL 8.86e-01 0.0156 0.108 0.202 CD4_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 758280 sc-eQTL 4.00e-01 0.0866 0.103 0.202 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -328795 sc-eQTL 1.15e-02 0.258 0.101 0.202 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -398834 sc-eQTL 6.00e-01 0.0459 0.0874 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -172998 sc-eQTL 1.46e-01 0.138 0.0946 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 506191 sc-eQTL 4.12e-01 0.0767 0.0933 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 410445 sc-eQTL 8.76e-01 0.0129 0.0826 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -399144 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0124 0.101 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 758280 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0141 0.0771 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -328795 sc-eQTL 5.68e-01 0.0573 0.1 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -398834 sc-eQTL 1.71e-01 -0.123 0.0896 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -172998 sc-eQTL 1.03e-01 -0.17 0.104 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 506191 sc-eQTL 9.16e-01 0.00983 0.0926 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 410445 sc-eQTL 7.41e-01 0.0299 0.0902 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -399144 sc-eQTL 7.93e-01 0.0279 0.106 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 758280 sc-eQTL 1.95e-01 -0.113 0.0868 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -328795 sc-eQTL 4.05e-01 0.0856 0.103 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -398834 sc-eQTL 2.62e-01 0.121 0.108 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -172998 sc-eQTL 2.22e-01 -0.133 0.108 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 506191 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00153 0.106 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 410445 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0623 0.103 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -399144 sc-eQTL 9.37e-02 -0.178 0.106 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 758280 sc-eQTL 9.69e-02 0.167 0.1 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -328795 sc-eQTL 2.04e-01 0.14 0.11 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -398834 sc-eQTL 1.21e-01 0.149 0.0957 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -172998 sc-eQTL 9.83e-01 0.00223 0.102 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 506191 sc-eQTL 3.43e-01 0.0921 0.0969 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 410445 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0764 0.103 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -399144 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00514 0.108 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 758280 sc-eQTL 2.78e-01 -0.104 0.096 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -328795 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0297 0.11 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -398834 sc-eQTL 6.86e-01 0.0399 0.0984 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -172998 sc-eQTL 2.92e-01 0.107 0.102 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 506191 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0286 0.105 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 410445 sc-eQTL 6.30e-01 0.0487 0.101 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -399144 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0205 0.102 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 758280 sc-eQTL 6.61e-01 0.0381 0.0866 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -328795 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00225 0.0966 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -398834 sc-eQTL 6.99e-01 0.043 0.111 0.194 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -172998 sc-eQTL 1.42e-02 0.275 0.111 0.194 CD8_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 506191 sc-eQTL 4.42e-01 0.0847 0.11 0.194 CD8_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 410445 sc-eQTL 5.47e-01 0.0678 0.112 0.194 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -399144 sc-eQTL 3.87e-01 0.0945 0.109 0.194 CD8_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 758280 sc-eQTL 9.93e-01 0.000931 0.105 0.194 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -328795 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0747 0.111 0.194 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -398834 sc-eQTL 1.34e-01 -0.162 0.108 0.201 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -172998 sc-eQTL 2.65e-01 -0.121 0.109 0.201 CD8_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 506191 sc-eQTL 9.58e-01 0.00561 0.106 0.201 CD8_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 410445 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0839 0.101 0.201 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -399144 sc-eQTL 9.97e-01 0.000376 0.11 0.201 CD8_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 758280 sc-eQTL 4.29e-01 0.0829 0.105 0.201 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -328795 sc-eQTL 1.87e-01 -0.14 0.106 0.201 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -398834 sc-eQTL 3.01e-01 -0.106 0.102 0.199 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 -172998 sc-eQTL 9.77e-02 -0.168 0.101 0.199 MAIT L2
ENSG00000116641 DOCK7 506191 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0343 0.0974 0.199 MAIT L2
ENSG00000125703 ATG4C 410445 sc-eQTL 2.32e-01 0.123 0.102 0.199 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -399144 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0846 0.103 0.199 MAIT L2
ENSG00000162607 USP1 758280 sc-eQTL 1.39e-01 -0.151 0.102 0.199 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -328795 sc-eQTL 9.58e-02 -0.176 0.105 0.199 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 -398834 sc-eQTL 5.38e-01 0.0642 0.104 0.202 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 -172998 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0168 0.107 0.202 NK_CD56bright L2
ENSG00000116641 DOCK7 506191 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0566 0.0924 0.202 NK_CD56bright L2
ENSG00000125703 ATG4C 410445 sc-eQTL 2.35e-01 -0.123 0.103 0.202 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -399144 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0855 0.107 0.202 NK_CD56bright L2
ENSG00000162607 USP1 758280 sc-eQTL 1.19e-02 0.277 0.109 0.202 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -328795 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0625 0.106 0.202 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 -398834 sc-eQTL 3.29e-01 0.0805 0.0822 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 -172998 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0693 0.104 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000116641 DOCK7 506191 sc-eQTL 2.94e-01 -0.0954 0.0907 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000125703 ATG4C 410445 sc-eQTL 8.67e-01 0.0155 0.0924 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -399144 sc-eQTL 9.29e-01 -0.00936 0.105 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000162607 USP1 758280 sc-eQTL 1.00e+00 -2.55e-05 0.102 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -328795 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0688 0.113 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 -398834 sc-eQTL 3.99e-01 0.0953 0.113 0.203 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 -172998 sc-eQTL 1.01e-01 0.192 0.116 0.203 NK_HLA L2
ENSG00000116641 DOCK7 506191 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0107 0.0896 0.203 NK_HLA L2
ENSG00000125703 ATG4C 410445 sc-eQTL 1.77e-01 0.14 0.104 0.203 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -399144 sc-eQTL 2.30e-01 0.131 0.109 0.203 NK_HLA L2
ENSG00000162607 USP1 758280 sc-eQTL 4.47e-01 0.0872 0.114 0.203 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -328795 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0139 0.104 0.203 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 -398834 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00132 0.0896 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 -172998 sc-eQTL 8.30e-01 0.0218 0.101 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000116641 DOCK7 506191 sc-eQTL 8.96e-01 0.0123 0.0938 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000125703 ATG4C 410445 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0387 0.0959 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -399144 sc-eQTL 8.59e-01 0.0177 0.0994 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000162607 USP1 758280 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0443 0.104 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -328795 sc-eQTL 7.48e-01 -0.034 0.106 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 -398834 sc-eQTL 1.57e-01 -0.194 0.136 0.17 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 -172998 sc-eQTL 4.54e-01 -0.108 0.144 0.17 PB L2
ENSG00000116641 DOCK7 506191 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00976 0.155 0.17 PB L2
ENSG00000125703 ATG4C 410445 sc-eQTL 6.30e-03 0.363 0.13 0.17 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -399144 sc-eQTL 3.34e-01 0.13 0.134 0.17 PB L2
ENSG00000162607 USP1 758280 sc-eQTL 1.67e-01 0.185 0.133 0.17 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -328795 sc-eQTL 4.14e-01 -0.121 0.147 0.17 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 -398834 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00344 0.0978 0.198 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 -172998 sc-eQTL 2.86e-01 -0.106 0.0992 0.198 Pro_T L2
ENSG00000116641 DOCK7 506191 sc-eQTL 2.47e-01 -0.115 0.0995 0.198 Pro_T L2
ENSG00000125703 ATG4C 410445 sc-eQTL 9.27e-01 0.00804 0.0874 0.198 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -399144 sc-eQTL 5.40e-01 0.0538 0.0876 0.198 Pro_T L2
ENSG00000162607 USP1 758280 sc-eQTL 2.93e-01 0.0633 0.0601 0.198 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -328795 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0204 0.102 0.198 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 -398834 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0244 0.102 0.199 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 -172998 sc-eQTL 2.23e-01 0.133 0.109 0.199 Treg L2
ENSG00000116641 DOCK7 506191 sc-eQTL 9.86e-01 0.00171 0.101 0.199 Treg L2
ENSG00000125703 ATG4C 410445 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00212 0.103 0.199 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -399144 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0442 0.107 0.199 Treg L2
ENSG00000162607 USP1 758280 sc-eQTL 6.93e-01 0.0411 0.104 0.199 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -328795 sc-eQTL 7.16e-01 0.0375 0.103 0.199 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 -398834 sc-eQTL 2.25e-01 0.121 0.0994 0.21 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -172998 sc-eQTL 5.53e-01 0.0602 0.101 0.21 cDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 506191 sc-eQTL 5.69e-02 0.189 0.0984 0.21 cDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 410445 sc-eQTL 3.68e-01 0.0777 0.0861 0.21 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -399144 sc-eQTL 2.02e-01 -0.139 0.109 0.21 cDC L2
ENSG00000162607 USP1 758280 sc-eQTL 3.80e-01 -0.0855 0.0972 0.21 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -328795 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0682 0.0877 0.21 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 -398834 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0516 0.0957 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 -172998 sc-eQTL 1.01e-01 -0.157 0.0953 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000116641 DOCK7 506191 sc-eQTL 6.11e-02 0.189 0.1 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000125703 ATG4C 410445 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00171 0.0711 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -399144 sc-eQTL 2.86e-01 0.107 0.1 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000162607 USP1 758280 sc-eQTL 8.62e-02 -0.152 0.0882 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000240563 L1TD1 999728 sc-eQTL 1.01e-01 0.146 0.0887 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 -398834 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0158 0.106 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 -172998 sc-eQTL 3.00e-01 -0.111 0.107 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000116641 DOCK7 506191 sc-eQTL 6.66e-01 -0.043 0.0995 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000125703 ATG4C 410445 sc-eQTL 3.37e-01 0.0828 0.086 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -399144 sc-eQTL 1.01e-01 0.159 0.0967 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000162607 USP1 758280 sc-eQTL 1.79e-01 0.134 0.0997 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000240563 L1TD1 999728 sc-eQTL 9.14e-01 0.009 0.0833 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 -398834 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0446 0.113 0.221 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 -172998 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0597 0.12 0.221 gdT L2
ENSG00000116641 DOCK7 506191 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00142 0.118 0.221 gdT L2
ENSG00000125703 ATG4C 410445 sc-eQTL 7.57e-03 -0.298 0.11 0.221 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -399144 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00413 0.12 0.221 gdT L2
ENSG00000162607 USP1 758280 sc-eQTL 9.26e-01 -0.0106 0.114 0.221 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -328795 sc-eQTL 1.28e-01 -0.179 0.117 0.221 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 -398834 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0659 0.106 0.202 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -172998 sc-eQTL 7.54e-01 0.0309 0.0985 0.202 intMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 506191 sc-eQTL 7.98e-01 0.0259 0.101 0.202 intMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 410445 sc-eQTL 7.14e-01 0.0352 0.0961 0.202 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -399144 sc-eQTL 9.34e-01 -0.00882 0.106 0.202 intMono L2
ENSG00000162607 USP1 758280 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0751 0.108 0.202 intMono L2
ENSG00000240563 L1TD1 999728 sc-eQTL 6.52e-01 0.0357 0.0792 0.202 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -398834 sc-eQTL 9.94e-02 0.157 0.0949 0.204 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -172998 sc-eQTL 4.77e-02 -0.207 0.104 0.204 ncMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 506191 sc-eQTL 2.78e-01 0.112 0.103 0.204 ncMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 410445 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0754 0.0963 0.204 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -399144 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00929 0.101 0.204 ncMono L2
ENSG00000162607 USP1 758280 sc-eQTL 2.81e-01 -0.111 0.103 0.204 ncMono L2
ENSG00000240563 L1TD1 999728 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0512 0.073 0.204 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -398834 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0278 0.113 0.229 pDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -172998 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0568 0.11 0.229 pDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 506191 sc-eQTL 4.84e-01 0.0785 0.112 0.229 pDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 410445 sc-eQTL 5.30e-01 0.0632 0.1 0.229 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -399144 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0872 0.113 0.229 pDC L2
ENSG00000162607 USP1 758280 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0428 0.115 0.229 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -328795 sc-eQTL 1.21e-02 0.248 0.0978 0.229 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -398834 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0185 0.101 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -172998 sc-eQTL 2.49e-03 -0.334 0.109 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 506191 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0368 0.0966 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 410445 sc-eQTL 5.03e-01 0.0523 0.078 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -399144 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0244 0.103 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 758280 sc-eQTL 6.12e-02 -0.186 0.0989 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -328795 sc-eQTL 7.87e-01 0.0289 0.107 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -398834 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00799 0.105 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -172998 sc-eQTL 5.74e-02 -0.205 0.107 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 506191 sc-eQTL 3.53e-01 0.0938 0.101 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 410445 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0109 0.0771 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -399144 sc-eQTL 9.63e-01 -0.0051 0.109 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 758280 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00602 0.0936 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -328795 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0334 0.11 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -398834 sc-eQTL 9.18e-01 -0.0101 0.0981 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -172998 sc-eQTL 3.57e-02 -0.199 0.094 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 506191 sc-eQTL 1.88e-01 0.126 0.0952 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 410445 sc-eQTL 4.23e-01 0.053 0.066 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -399144 sc-eQTL 8.44e-02 0.168 0.0971 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 758280 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0207 0.0835 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000240563 L1TD1 999728 sc-eQTL 1.57e-01 0.128 0.0901 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -398834 sc-eQTL 6.88e-01 0.0375 0.0932 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -172998 sc-eQTL 2.89e-01 -0.112 0.106 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 506191 sc-eQTL 5.20e-01 0.0675 0.105 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 410445 sc-eQTL 8.52e-01 0.0167 0.0893 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -399144 sc-eQTL 6.40e-01 0.0486 0.104 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 758280 sc-eQTL 2.44e-01 -0.113 0.0971 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000240563 L1TD1 999728 sc-eQTL 6.52e-01 -0.03 0.0664 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -398834 sc-eQTL 2.07e-01 0.101 0.0799 0.2 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -172998 sc-eQTL 8.38e-01 0.0198 0.0963 0.2 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 506191 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0247 0.0863 0.2 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 410445 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0152 0.0861 0.2 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -399144 sc-eQTL 9.93e-01 0.000912 0.102 0.2 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 758280 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0452 0.0926 0.2 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -328795 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0162 0.113 0.2 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000162607 USP1 758280 eQTL 0.0355 -0.0336 0.0159 0.0 0.0 0.213

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina