logo

Genes within 1Mb (chr1:63191896:C:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -401515 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00269 0.0941 0.188 B L1
ENSG00000088035 ALG6 -175679 sc-eQTL 3.99e-04 -0.34 0.0946 0.188 B L1
ENSG00000116641 DOCK7 503510 sc-eQTL 8.77e-01 0.0151 0.0975 0.188 B L1
ENSG00000125703 ATG4C 407764 sc-eQTL 8.33e-01 0.0143 0.0677 0.188 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -401825 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00541 0.108 0.188 B L1
ENSG00000162607 USP1 755599 sc-eQTL 1.02e-01 -0.153 0.093 0.188 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -331476 sc-eQTL 4.12e-01 0.0907 0.11 0.188 B L1
ENSG00000079739 PGM1 -401515 sc-eQTL 8.09e-01 0.0193 0.0799 0.188 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 -175679 sc-eQTL 7.11e-01 0.0327 0.0882 0.188 CD4T L1
ENSG00000116641 DOCK7 503510 sc-eQTL 3.41e-01 0.085 0.0891 0.188 CD4T L1
ENSG00000125703 ATG4C 407764 sc-eQTL 2.78e-01 0.0783 0.0719 0.188 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -401825 sc-eQTL 7.33e-01 -0.035 0.102 0.188 CD4T L1
ENSG00000162607 USP1 755599 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0476 0.0699 0.188 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -331476 sc-eQTL 4.66e-01 0.0671 0.0918 0.188 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 -401515 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0162 0.088 0.188 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 -175679 sc-eQTL 3.44e-01 0.0919 0.0969 0.188 CD8T L1
ENSG00000116641 DOCK7 503510 sc-eQTL 2.57e-01 0.111 0.098 0.188 CD8T L1
ENSG00000125703 ATG4C 407764 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0742 0.0933 0.188 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -401825 sc-eQTL 8.08e-01 0.0255 0.104 0.188 CD8T L1
ENSG00000162607 USP1 755599 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0635 0.0813 0.188 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -331476 sc-eQTL 9.65e-01 0.00457 0.104 0.188 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 -401515 sc-eQTL 3.57e-01 0.0902 0.0977 0.187 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 -175679 sc-eQTL 9.31e-01 0.0088 0.101 0.187 DC L1
ENSG00000116641 DOCK7 503510 sc-eQTL 9.03e-02 0.175 0.103 0.187 DC L1
ENSG00000125703 ATG4C 407764 sc-eQTL 1.14e-01 0.128 0.0805 0.187 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -401825 sc-eQTL 2.54e-01 -0.129 0.113 0.187 DC L1
ENSG00000162607 USP1 755599 sc-eQTL 3.28e-01 -0.0968 0.0986 0.187 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -331476 sc-eQTL 1.81e-01 0.132 0.0981 0.187 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 -401515 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0257 0.0956 0.188 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 -175679 sc-eQTL 1.66e-01 -0.138 0.0994 0.188 Mono L1
ENSG00000116641 DOCK7 503510 sc-eQTL 2.25e-01 0.117 0.0962 0.188 Mono L1
ENSG00000125703 ATG4C 407764 sc-eQTL 7.72e-01 0.0189 0.0652 0.188 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -401825 sc-eQTL 1.07e-01 0.166 0.102 0.188 Mono L1
ENSG00000162607 USP1 755599 sc-eQTL 3.32e-01 -0.0821 0.0845 0.188 Mono L1
ENSG00000240563 L1TD1 997047 sc-eQTL 6.43e-01 0.0367 0.079 0.188 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 -401515 sc-eQTL 2.54e-01 0.093 0.0814 0.189 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 -175679 sc-eQTL 6.53e-01 0.043 0.0956 0.189 NK L1
ENSG00000116641 DOCK7 503510 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00535 0.0788 0.189 NK L1
ENSG00000125703 ATG4C 407764 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0396 0.0846 0.189 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -401825 sc-eQTL 8.50e-01 -0.02 0.105 0.189 NK L1
ENSG00000162607 USP1 755599 sc-eQTL 8.55e-01 0.0172 0.094 0.189 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -331476 sc-eQTL 4.00e-01 -0.0962 0.114 0.189 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 -401515 sc-eQTL 5.60e-01 0.0553 0.0947 0.188 Other_T L1
ENSG00000088035 ALG6 -175679 sc-eQTL 2.58e-01 -0.108 0.0949 0.188 Other_T L1
ENSG00000116641 DOCK7 503510 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0188 0.0972 0.188 Other_T L1
ENSG00000125703 ATG4C 407764 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0199 0.0841 0.188 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -401825 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0246 0.0746 0.188 Other_T L1
ENSG00000162607 USP1 755599 sc-eQTL 8.87e-01 0.00917 0.0647 0.188 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -331476 sc-eQTL 8.21e-02 -0.2 0.114 0.188 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -401515 sc-eQTL 7.25e-01 0.0439 0.125 0.189 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 -175679 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0142 0.12 0.189 B_Activated L2
ENSG00000116641 DOCK7 503510 sc-eQTL 2.28e-01 0.134 0.111 0.189 B_Activated L2
ENSG00000125703 ATG4C 407764 sc-eQTL 8.32e-01 0.0249 0.117 0.189 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -401825 sc-eQTL 1.01e-01 0.187 0.113 0.189 B_Activated L2
ENSG00000162607 USP1 755599 sc-eQTL 2.77e-01 0.135 0.124 0.189 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -331476 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0805 0.108 0.189 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 -401515 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0238 0.113 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 -175679 sc-eQTL 4.90e-02 -0.226 0.114 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000116641 DOCK7 503510 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0235 0.11 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000125703 ATG4C 407764 sc-eQTL 3.39e-01 0.089 0.0928 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -401825 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0265 0.111 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000162607 USP1 755599 sc-eQTL 2.52e-01 -0.127 0.11 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -331476 sc-eQTL 9.37e-01 0.00864 0.11 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 -401515 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0509 0.111 0.19 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 -175679 sc-eQTL 2.61e-03 -0.336 0.11 0.19 B_Memory L2
ENSG00000116641 DOCK7 503510 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0528 0.105 0.19 B_Memory L2
ENSG00000125703 ATG4C 407764 sc-eQTL 8.35e-01 0.0209 0.1 0.19 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -401825 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0503 0.115 0.19 B_Memory L2
ENSG00000162607 USP1 755599 sc-eQTL 1.37e-02 -0.284 0.114 0.19 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -331476 sc-eQTL 3.50e-01 0.106 0.114 0.19 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 -401515 sc-eQTL 5.80e-01 0.0611 0.11 0.188 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 -175679 sc-eQTL 1.82e-03 -0.342 0.108 0.188 B_Naive1 L2
ENSG00000116641 DOCK7 503510 sc-eQTL 3.63e-01 0.0966 0.106 0.188 B_Naive1 L2
ENSG00000125703 ATG4C 407764 sc-eQTL 2.05e-01 0.104 0.0814 0.188 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -401825 sc-eQTL 7.49e-01 0.0348 0.108 0.188 B_Naive1 L2
ENSG00000162607 USP1 755599 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0487 0.0953 0.188 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -331476 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00289 0.116 0.188 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 -401515 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0307 0.109 0.189 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 -175679 sc-eQTL 6.14e-01 0.0573 0.113 0.189 B_Naive2 L2
ENSG00000116641 DOCK7 503510 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0405 0.109 0.189 B_Naive2 L2
ENSG00000125703 ATG4C 407764 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0277 0.105 0.189 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -401825 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0412 0.114 0.189 B_Naive2 L2
ENSG00000162607 USP1 755599 sc-eQTL 8.06e-01 0.0267 0.108 0.189 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -331476 sc-eQTL 8.71e-01 0.0184 0.113 0.189 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 -401515 sc-eQTL 1.92e-01 0.142 0.108 0.191 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -175679 sc-eQTL 1.91e-01 -0.151 0.115 0.191 CD4_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 503510 sc-eQTL 6.68e-01 0.0432 0.101 0.191 CD4_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 407764 sc-eQTL 4.50e-01 0.0787 0.104 0.191 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -401825 sc-eQTL 7.57e-01 0.0346 0.111 0.191 CD4_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 755599 sc-eQTL 4.50e-01 0.0802 0.106 0.191 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -331476 sc-eQTL 2.15e-02 0.242 0.104 0.191 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -401515 sc-eQTL 6.67e-01 0.0389 0.0904 0.188 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -175679 sc-eQTL 1.23e-01 0.151 0.0977 0.188 CD4_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 503510 sc-eQTL 4.52e-01 0.0727 0.0964 0.188 CD4_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 407764 sc-eQTL 6.99e-01 0.033 0.0853 0.188 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -401825 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0181 0.104 0.188 CD4_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 755599 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0557 0.0796 0.188 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -331476 sc-eQTL 6.74e-01 0.0436 0.104 0.188 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -401515 sc-eQTL 1.24e-01 -0.143 0.0924 0.188 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -175679 sc-eQTL 1.09e-01 -0.173 0.107 0.188 CD4_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 503510 sc-eQTL 9.80e-01 0.00234 0.0956 0.188 CD4_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 407764 sc-eQTL 5.54e-01 0.0552 0.093 0.188 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -401825 sc-eQTL 7.50e-01 0.0349 0.11 0.188 CD4_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 755599 sc-eQTL 1.58e-01 -0.127 0.0895 0.188 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -331476 sc-eQTL 2.35e-01 0.126 0.106 0.188 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -401515 sc-eQTL 3.93e-01 0.0955 0.112 0.188 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -175679 sc-eQTL 1.30e-01 -0.17 0.112 0.188 CD4_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 503510 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0308 0.11 0.188 CD4_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 407764 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0689 0.106 0.188 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -401825 sc-eQTL 8.03e-02 -0.192 0.109 0.188 CD4_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 755599 sc-eQTL 2.42e-01 0.122 0.104 0.188 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -331476 sc-eQTL 3.74e-01 0.101 0.114 0.188 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -401515 sc-eQTL 1.73e-01 0.135 0.0988 0.188 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -175679 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0339 0.105 0.188 CD8_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 503510 sc-eQTL 6.35e-01 0.0476 0.1 0.188 CD8_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 407764 sc-eQTL 3.92e-01 -0.0913 0.106 0.188 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -401825 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0445 0.111 0.188 CD8_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 755599 sc-eQTL 3.01e-01 -0.103 0.099 0.188 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -331476 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0905 0.113 0.188 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -401515 sc-eQTL 6.78e-01 0.0421 0.101 0.188 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -175679 sc-eQTL 1.65e-01 0.145 0.104 0.188 CD8_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 503510 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0348 0.108 0.188 CD8_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 407764 sc-eQTL 6.18e-01 0.0519 0.104 0.188 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -401825 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0176 0.105 0.188 CD8_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 755599 sc-eQTL 7.09e-01 0.0333 0.0891 0.188 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -331476 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0158 0.0994 0.188 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -401515 sc-eQTL 8.41e-01 0.0231 0.115 0.183 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -175679 sc-eQTL 2.52e-02 0.259 0.115 0.183 CD8_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 503510 sc-eQTL 5.74e-01 0.0638 0.113 0.183 CD8_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 407764 sc-eQTL 4.94e-01 0.0793 0.116 0.183 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -401825 sc-eQTL 2.56e-01 0.128 0.112 0.183 CD8_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 755599 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00613 0.109 0.183 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -331476 sc-eQTL 3.93e-01 -0.0983 0.115 0.183 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -401515 sc-eQTL 5.67e-02 -0.213 0.111 0.189 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -175679 sc-eQTL 3.33e-01 -0.109 0.112 0.189 CD8_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 503510 sc-eQTL 9.43e-01 0.0078 0.109 0.189 CD8_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 407764 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0899 0.105 0.189 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -401825 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0294 0.113 0.189 CD8_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 755599 sc-eQTL 6.52e-01 0.0488 0.108 0.189 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -331476 sc-eQTL 9.16e-02 -0.185 0.109 0.189 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -401515 sc-eQTL 3.35e-01 -0.102 0.105 0.188 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 -175679 sc-eQTL 1.32e-01 -0.158 0.104 0.188 MAIT L2
ENSG00000116641 DOCK7 503510 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0277 0.1 0.188 MAIT L2
ENSG00000125703 ATG4C 407764 sc-eQTL 1.17e-01 0.165 0.105 0.188 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -401825 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0695 0.106 0.188 MAIT L2
ENSG00000162607 USP1 755599 sc-eQTL 1.35e-01 -0.157 0.105 0.188 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -331476 sc-eQTL 9.24e-02 -0.183 0.108 0.188 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 -401515 sc-eQTL 4.92e-01 0.0738 0.107 0.191 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 -175679 sc-eQTL 8.16e-01 0.0256 0.11 0.191 NK_CD56bright L2
ENSG00000116641 DOCK7 503510 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0463 0.0953 0.191 NK_CD56bright L2
ENSG00000125703 ATG4C 407764 sc-eQTL 2.74e-01 -0.117 0.106 0.191 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -401825 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0527 0.111 0.191 NK_CD56bright L2
ENSG00000162607 USP1 755599 sc-eQTL 5.04e-03 0.318 0.112 0.191 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -331476 sc-eQTL 3.42e-01 -0.104 0.109 0.191 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 -401515 sc-eQTL 2.47e-01 0.0982 0.0845 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 -175679 sc-eQTL 2.87e-01 -0.114 0.107 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000116641 DOCK7 503510 sc-eQTL 3.03e-01 -0.0964 0.0934 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000125703 ATG4C 407764 sc-eQTL 9.60e-01 0.00481 0.0951 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -401825 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0132 0.108 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000162607 USP1 755599 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0284 0.105 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -331476 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0785 0.117 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 -401515 sc-eQTL 5.14e-01 0.0761 0.116 0.192 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 -175679 sc-eQTL 1.23e-01 0.186 0.12 0.192 NK_HLA L2
ENSG00000116641 DOCK7 503510 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0393 0.0924 0.192 NK_HLA L2
ENSG00000125703 ATG4C 407764 sc-eQTL 2.26e-01 0.13 0.107 0.192 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -401825 sc-eQTL 4.09e-01 0.0933 0.113 0.192 NK_HLA L2
ENSG00000162607 USP1 755599 sc-eQTL 4.20e-01 0.0952 0.118 0.192 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -331476 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0114 0.107 0.192 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 -401515 sc-eQTL 8.65e-01 0.0157 0.0925 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 -175679 sc-eQTL 6.61e-01 0.0459 0.105 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000116641 DOCK7 503510 sc-eQTL 8.41e-01 0.0195 0.0969 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000125703 ATG4C 407764 sc-eQTL 8.01e-01 -0.025 0.0991 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -401825 sc-eQTL 9.33e-01 0.00866 0.103 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000162607 USP1 755599 sc-eQTL 7.04e-01 -0.041 0.108 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -331476 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0279 0.109 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 -401515 sc-eQTL 1.34e-01 -0.211 0.14 0.167 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 -175679 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0911 0.148 0.167 PB L2
ENSG00000116641 DOCK7 503510 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0711 0.158 0.167 PB L2
ENSG00000125703 ATG4C 407764 sc-eQTL 8.73e-03 0.357 0.134 0.167 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -401825 sc-eQTL 4.67e-01 0.1 0.138 0.167 PB L2
ENSG00000162607 USP1 755599 sc-eQTL 1.84e-01 0.182 0.136 0.167 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -331476 sc-eQTL 5.06e-01 -0.101 0.151 0.167 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 -401515 sc-eQTL 8.52e-01 0.0188 0.101 0.187 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 -175679 sc-eQTL 1.52e-01 -0.147 0.102 0.187 Pro_T L2
ENSG00000116641 DOCK7 503510 sc-eQTL 2.34e-01 -0.122 0.102 0.187 Pro_T L2
ENSG00000125703 ATG4C 407764 sc-eQTL 9.57e-01 0.00491 0.09 0.187 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -401825 sc-eQTL 6.43e-01 0.0418 0.0902 0.187 Pro_T L2
ENSG00000162607 USP1 755599 sc-eQTL 3.53e-01 0.0577 0.0619 0.187 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -331476 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00902 0.105 0.187 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 -401515 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0205 0.105 0.188 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 -175679 sc-eQTL 2.04e-01 0.143 0.112 0.188 Treg L2
ENSG00000116641 DOCK7 503510 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0129 0.103 0.188 Treg L2
ENSG00000125703 ATG4C 407764 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00805 0.106 0.188 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -401825 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0423 0.111 0.188 Treg L2
ENSG00000162607 USP1 755599 sc-eQTL 5.16e-01 0.0695 0.107 0.188 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -331476 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00553 0.106 0.188 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 -401515 sc-eQTL 7.61e-02 0.182 0.102 0.198 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -175679 sc-eQTL 7.90e-01 0.0279 0.105 0.198 cDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 503510 sc-eQTL 2.90e-02 0.223 0.101 0.198 cDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 407764 sc-eQTL 3.92e-01 0.0762 0.0889 0.198 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -401825 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0928 0.113 0.198 cDC L2
ENSG00000162607 USP1 755599 sc-eQTL 3.15e-01 -0.101 0.1 0.198 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -331476 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0435 0.0907 0.198 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 -401515 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0696 0.099 0.188 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 -175679 sc-eQTL 1.27e-01 -0.151 0.0987 0.188 cMono_IL1B L2
ENSG00000116641 DOCK7 503510 sc-eQTL 5.38e-02 0.201 0.104 0.188 cMono_IL1B L2
ENSG00000125703 ATG4C 407764 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0193 0.0736 0.188 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -401825 sc-eQTL 3.03e-01 0.107 0.104 0.188 cMono_IL1B L2
ENSG00000162607 USP1 755599 sc-eQTL 4.53e-02 -0.183 0.091 0.188 cMono_IL1B L2
ENSG00000240563 L1TD1 997047 sc-eQTL 7.20e-02 0.166 0.0916 0.188 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 -401515 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00452 0.109 0.188 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 -175679 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0617 0.111 0.188 cMono_S100A L2
ENSG00000116641 DOCK7 503510 sc-eQTL 4.77e-01 -0.0731 0.103 0.188 cMono_S100A L2
ENSG00000125703 ATG4C 407764 sc-eQTL 4.12e-01 0.0731 0.0889 0.188 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -401825 sc-eQTL 1.58e-01 0.142 0.1 0.188 cMono_S100A L2
ENSG00000162607 USP1 755599 sc-eQTL 2.16e-01 0.128 0.103 0.188 cMono_S100A L2
ENSG00000240563 L1TD1 997047 sc-eQTL 6.51e-01 0.0389 0.086 0.188 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 -401515 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0133 0.118 0.206 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 -175679 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0537 0.126 0.206 gdT L2
ENSG00000116641 DOCK7 503510 sc-eQTL 8.41e-01 0.0249 0.123 0.206 gdT L2
ENSG00000125703 ATG4C 407764 sc-eQTL 1.22e-03 -0.375 0.114 0.206 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -401825 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0317 0.125 0.206 gdT L2
ENSG00000162607 USP1 755599 sc-eQTL 7.84e-01 0.0326 0.119 0.206 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -331476 sc-eQTL 1.17e-01 -0.193 0.122 0.206 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 -401515 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0719 0.109 0.191 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -175679 sc-eQTL 7.32e-01 0.0349 0.102 0.191 intMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 503510 sc-eQTL 7.66e-01 0.0309 0.104 0.191 intMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 407764 sc-eQTL 8.14e-01 0.0233 0.0992 0.191 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -401825 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0109 0.109 0.191 intMono L2
ENSG00000162607 USP1 755599 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0521 0.111 0.191 intMono L2
ENSG00000240563 L1TD1 997047 sc-eQTL 5.54e-01 0.0484 0.0817 0.191 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -401515 sc-eQTL 6.59e-02 0.181 0.0978 0.192 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -175679 sc-eQTL 1.16e-01 -0.17 0.108 0.192 ncMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 503510 sc-eQTL 1.79e-01 0.143 0.106 0.192 ncMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 407764 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0243 0.0996 0.192 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -401825 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00618 0.104 0.192 ncMono L2
ENSG00000162607 USP1 755599 sc-eQTL 1.81e-01 -0.142 0.106 0.192 ncMono L2
ENSG00000240563 L1TD1 997047 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0238 0.0755 0.192 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -401515 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0286 0.115 0.215 pDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -175679 sc-eQTL 8.72e-01 -0.018 0.112 0.215 pDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 503510 sc-eQTL 3.19e-01 0.114 0.114 0.215 pDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 407764 sc-eQTL 4.63e-01 0.0753 0.102 0.215 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -401825 sc-eQTL 2.23e-01 -0.14 0.114 0.215 pDC L2
ENSG00000162607 USP1 755599 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0477 0.117 0.215 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -331476 sc-eQTL 1.44e-02 0.247 0.0998 0.215 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -401515 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00609 0.104 0.188 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -175679 sc-eQTL 1.56e-03 -0.359 0.112 0.188 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 503510 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0657 0.0994 0.188 B_Memory LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 407764 sc-eQTL 4.19e-01 0.065 0.0803 0.188 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -401825 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0208 0.106 0.188 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 755599 sc-eQTL 6.79e-02 -0.187 0.102 0.188 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -331476 sc-eQTL 6.76e-01 0.0461 0.11 0.188 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -401515 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0285 0.108 0.188 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -175679 sc-eQTL 3.31e-02 -0.236 0.11 0.188 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 503510 sc-eQTL 4.24e-01 0.0831 0.104 0.188 B_Naive LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 407764 sc-eQTL 6.45e-01 0.0366 0.0793 0.188 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -401825 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0173 0.112 0.188 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 755599 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0571 0.0963 0.188 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -331476 sc-eQTL 8.68e-01 0.0188 0.113 0.188 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -401515 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0164 0.101 0.188 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -175679 sc-eQTL 8.47e-02 -0.169 0.0976 0.188 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 503510 sc-eQTL 2.16e-01 0.122 0.0986 0.188 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 407764 sc-eQTL 6.01e-01 0.0358 0.0683 0.188 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -401825 sc-eQTL 1.19e-01 0.158 0.101 0.188 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 755599 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0443 0.0864 0.188 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000240563 L1TD1 997047 sc-eQTL 9.40e-02 0.157 0.0931 0.188 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -401515 sc-eQTL 6.66e-01 0.0416 0.0963 0.188 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -175679 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0758 0.109 0.188 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 503510 sc-eQTL 3.97e-01 0.0917 0.108 0.188 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 407764 sc-eQTL 6.52e-01 0.0416 0.0922 0.188 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -401825 sc-eQTL 6.19e-01 0.0533 0.107 0.188 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 755599 sc-eQTL 2.10e-01 -0.126 0.1 0.188 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000240563 L1TD1 997047 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0118 0.0687 0.188 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -401515 sc-eQTL 1.61e-01 0.116 0.0823 0.19 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -175679 sc-eQTL 9.99e-01 0.000169 0.0993 0.19 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 503510 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0256 0.0889 0.19 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 407764 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0214 0.0888 0.19 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -401825 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0162 0.105 0.19 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 755599 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0466 0.0955 0.19 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -331476 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0238 0.116 0.19 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000142856 ITGB3BP -401825 eQTL 0.0396 -0.0782 0.038 0.0 0.0 0.189

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina