logo

Genes within 1Mb (chr1:63183987:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -409424 sc-eQTL 5.75e-01 0.0479 0.0853 0.269 B L1
ENSG00000088035 ALG6 -183588 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0349 0.0884 0.269 B L1
ENSG00000116641 DOCK7 495601 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0709 0.0883 0.269 B L1
ENSG00000125703 ATG4C 399855 sc-eQTL 7.12e-02 -0.111 0.061 0.269 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -409734 sc-eQTL 2.40e-01 0.115 0.0975 0.269 B L1
ENSG00000162607 USP1 747690 sc-eQTL 1.69e-01 0.117 0.0845 0.269 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -339385 sc-eQTL 8.50e-02 0.172 0.0995 0.269 B L1
ENSG00000079739 PGM1 -409424 sc-eQTL 8.35e-01 0.015 0.072 0.269 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 -183588 sc-eQTL 5.80e-01 -0.044 0.0795 0.269 CD4T L1
ENSG00000116641 DOCK7 495601 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0671 0.0804 0.269 CD4T L1
ENSG00000125703 ATG4C 399855 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0524 0.0649 0.269 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -409734 sc-eQTL 4.94e-02 0.181 0.0914 0.269 CD4T L1
ENSG00000162607 USP1 747690 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0361 0.063 0.269 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -339385 sc-eQTL 9.56e-01 0.00462 0.0828 0.269 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 -409424 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0106 0.0795 0.269 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 -183588 sc-eQTL 8.53e-01 0.0163 0.0876 0.269 CD8T L1
ENSG00000116641 DOCK7 495601 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00206 0.0888 0.269 CD8T L1
ENSG00000125703 ATG4C 399855 sc-eQTL 7.68e-02 -0.149 0.0837 0.269 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -409734 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0124 0.0943 0.269 CD8T L1
ENSG00000162607 USP1 747690 sc-eQTL 6.30e-02 0.136 0.0729 0.269 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -339385 sc-eQTL 4.59e-02 0.187 0.0931 0.269 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 -409424 sc-eQTL 1.66e-01 -0.122 0.0878 0.27 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 -183588 sc-eQTL 2.80e-01 -0.0984 0.0908 0.27 DC L1
ENSG00000116641 DOCK7 495601 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0242 0.0933 0.27 DC L1
ENSG00000125703 ATG4C 399855 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00175 0.073 0.27 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -409734 sc-eQTL 1.21e-01 0.158 0.101 0.27 DC L1
ENSG00000162607 USP1 747690 sc-eQTL 7.14e-03 0.238 0.0875 0.27 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -339385 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0399 0.0888 0.27 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 -409424 sc-eQTL 8.24e-01 0.0193 0.0871 0.269 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 -183588 sc-eQTL 4.75e-02 -0.18 0.0901 0.269 Mono L1
ENSG00000116641 DOCK7 495601 sc-eQTL 5.29e-01 0.0554 0.0878 0.269 Mono L1
ENSG00000125703 ATG4C 399855 sc-eQTL 9.65e-01 0.00259 0.0594 0.269 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -409734 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00533 0.0939 0.269 Mono L1
ENSG00000162607 USP1 747690 sc-eQTL 6.35e-01 0.0367 0.0771 0.269 Mono L1
ENSG00000240563 L1TD1 989138 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0562 0.0719 0.269 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 -409424 sc-eQTL 9.05e-01 0.00901 0.075 0.268 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 -183588 sc-eQTL 6.85e-01 0.0357 0.0879 0.268 NK L1
ENSG00000116641 DOCK7 495601 sc-eQTL 1.35e-01 0.108 0.072 0.268 NK L1
ENSG00000125703 ATG4C 399855 sc-eQTL 8.85e-01 0.0112 0.0778 0.268 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -409734 sc-eQTL 2.18e-01 -0.119 0.0963 0.268 NK L1
ENSG00000162607 USP1 747690 sc-eQTL 8.20e-01 0.0197 0.0864 0.268 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -339385 sc-eQTL 5.21e-01 0.0673 0.105 0.268 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 -409424 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0341 0.0847 0.269 Other_T L1
ENSG00000088035 ALG6 -183588 sc-eQTL 7.33e-01 0.0291 0.0852 0.269 Other_T L1
ENSG00000116641 DOCK7 495601 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0504 0.0869 0.269 Other_T L1
ENSG00000125703 ATG4C 399855 sc-eQTL 8.54e-02 -0.129 0.0748 0.269 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -409734 sc-eQTL 1.36e-01 -0.0994 0.0664 0.269 Other_T L1
ENSG00000162607 USP1 747690 sc-eQTL 5.83e-01 0.0318 0.0578 0.269 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -339385 sc-eQTL 2.28e-01 0.124 0.103 0.269 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -409424 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0196 0.111 0.281 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 -183588 sc-eQTL 5.67e-01 0.0609 0.106 0.281 B_Activated L2
ENSG00000116641 DOCK7 495601 sc-eQTL 5.26e-01 0.0628 0.0989 0.281 B_Activated L2
ENSG00000125703 ATG4C 399855 sc-eQTL 6.92e-01 0.0413 0.104 0.281 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -409734 sc-eQTL 2.19e-01 0.125 0.101 0.281 B_Activated L2
ENSG00000162607 USP1 747690 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0977 0.11 0.281 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -339385 sc-eQTL 4.89e-01 0.0667 0.0962 0.281 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 -409424 sc-eQTL 2.96e-01 0.105 0.101 0.27 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 -183588 sc-eQTL 2.05e-01 0.13 0.102 0.27 B_Intermediate L2
ENSG00000116641 DOCK7 495601 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0613 0.0979 0.27 B_Intermediate L2
ENSG00000125703 ATG4C 399855 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0158 0.083 0.27 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -409734 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0302 0.0988 0.27 B_Intermediate L2
ENSG00000162607 USP1 747690 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00165 0.0987 0.27 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -339385 sc-eQTL 2.79e-01 0.106 0.0976 0.27 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 -409424 sc-eQTL 5.60e-01 0.0593 0.102 0.265 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 -183588 sc-eQTL 9.22e-01 0.0101 0.103 0.265 B_Memory L2
ENSG00000116641 DOCK7 495601 sc-eQTL 2.61e-01 -0.109 0.0966 0.265 B_Memory L2
ENSG00000125703 ATG4C 399855 sc-eQTL 8.55e-01 0.0168 0.0921 0.265 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -409734 sc-eQTL 1.25e-01 0.161 0.105 0.265 B_Memory L2
ENSG00000162607 USP1 747690 sc-eQTL 2.26e-01 0.129 0.106 0.265 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -339385 sc-eQTL 3.52e-01 -0.0975 0.104 0.265 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 -409424 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0804 0.102 0.269 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 -183588 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0304 0.102 0.269 B_Naive1 L2
ENSG00000116641 DOCK7 495601 sc-eQTL 8.82e-01 0.0146 0.0981 0.269 B_Naive1 L2
ENSG00000125703 ATG4C 399855 sc-eQTL 3.67e-02 -0.157 0.0748 0.269 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -409734 sc-eQTL 4.25e-01 0.0801 0.1 0.269 B_Naive1 L2
ENSG00000162607 USP1 747690 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0249 0.0882 0.269 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -339385 sc-eQTL 1.47e-02 0.259 0.105 0.269 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 -409424 sc-eQTL 9.85e-01 0.00184 0.101 0.266 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 -183588 sc-eQTL 3.20e-01 -0.104 0.105 0.266 B_Naive2 L2
ENSG00000116641 DOCK7 495601 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0495 0.101 0.266 B_Naive2 L2
ENSG00000125703 ATG4C 399855 sc-eQTL 2.66e-01 -0.108 0.0968 0.266 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -409734 sc-eQTL 2.56e-01 0.12 0.105 0.266 B_Naive2 L2
ENSG00000162607 USP1 747690 sc-eQTL 2.02e-02 0.232 0.0989 0.266 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -339385 sc-eQTL 9.50e-01 0.00656 0.105 0.266 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 -409424 sc-eQTL 7.02e-02 -0.185 0.102 0.266 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -183588 sc-eQTL 5.52e-01 0.0646 0.108 0.266 CD4_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 495601 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00812 0.0948 0.266 CD4_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 399855 sc-eQTL 1.45e-01 0.143 0.0975 0.266 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -409734 sc-eQTL 1.10e-02 0.265 0.103 0.266 CD4_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 747690 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0262 0.0998 0.266 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -339385 sc-eQTL 1.87e-01 -0.131 0.0992 0.266 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -409424 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0181 0.0805 0.269 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -183588 sc-eQTL 2.73e-01 -0.0958 0.0872 0.269 CD4_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 495601 sc-eQTL 8.52e-02 -0.148 0.0854 0.269 CD4_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 399855 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0397 0.076 0.269 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -409734 sc-eQTL 1.81e-01 0.124 0.0925 0.269 CD4_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 747690 sc-eQTL 3.83e-01 -0.0619 0.0708 0.269 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -339385 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0585 0.0921 0.269 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -409424 sc-eQTL 1.96e-01 0.109 0.0836 0.269 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -183588 sc-eQTL 8.02e-01 0.0245 0.0975 0.269 CD4_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 495601 sc-eQTL 3.57e-01 0.0796 0.0862 0.269 CD4_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 399855 sc-eQTL 8.66e-02 -0.144 0.0835 0.269 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -409734 sc-eQTL 1.30e-01 0.15 0.0986 0.269 CD4_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 747690 sc-eQTL 2.47e-01 0.0941 0.081 0.269 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -339385 sc-eQTL 2.39e-01 0.113 0.0956 0.269 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -409424 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0127 0.0991 0.269 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -183588 sc-eQTL 1.47e-01 -0.144 0.0991 0.269 CD4_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 495601 sc-eQTL 9.38e-01 0.00759 0.0971 0.269 CD4_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 399855 sc-eQTL 4.46e-01 -0.072 0.0942 0.269 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -409734 sc-eQTL 3.18e-02 0.208 0.0963 0.269 CD4_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 747690 sc-eQTL 9.28e-01 -0.00836 0.0922 0.269 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -339385 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0835 0.101 0.269 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -409424 sc-eQTL 3.20e-01 -0.0919 0.0922 0.269 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -183588 sc-eQTL 4.28e-01 0.0779 0.0981 0.269 CD8_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 495601 sc-eQTL 9.93e-01 0.000805 0.0932 0.269 CD8_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 399855 sc-eQTL 6.30e-01 0.0478 0.0992 0.269 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -409734 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00611 0.103 0.269 CD8_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 747690 sc-eQTL 2.28e-01 0.111 0.0921 0.269 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -339385 sc-eQTL 3.28e-01 0.103 0.105 0.269 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -409424 sc-eQTL 4.87e-01 0.064 0.092 0.269 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -183588 sc-eQTL 3.90e-02 -0.196 0.0943 0.269 CD8_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 495601 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0149 0.0985 0.269 CD8_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 399855 sc-eQTL 2.20e-01 -0.116 0.0942 0.269 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -409734 sc-eQTL 2.54e-01 0.109 0.0955 0.269 CD8_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 747690 sc-eQTL 3.82e-01 0.0708 0.0808 0.269 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -339385 sc-eQTL 5.48e-01 0.0543 0.0902 0.269 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -409424 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00774 0.101 0.273 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -183588 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0696 0.102 0.273 CD8_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 495601 sc-eQTL 3.44e-01 -0.094 0.0991 0.273 CD8_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 399855 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0397 0.102 0.273 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -409734 sc-eQTL 8.56e-01 0.0179 0.0987 0.273 CD8_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 747690 sc-eQTL 3.84e-01 0.0827 0.0948 0.273 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -339385 sc-eQTL 1.04e-01 0.163 0.0999 0.273 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -409424 sc-eQTL 1.33e-01 0.157 0.104 0.272 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -183588 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0137 0.105 0.272 CD8_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 495601 sc-eQTL 9.30e-01 0.00893 0.102 0.272 CD8_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 399855 sc-eQTL 4.01e-01 -0.0824 0.0979 0.272 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -409734 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0186 0.106 0.272 CD8_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 747690 sc-eQTL 3.58e-01 0.093 0.101 0.272 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -339385 sc-eQTL 2.31e-01 0.123 0.103 0.272 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -409424 sc-eQTL 7.11e-01 0.0363 0.0977 0.268 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 -183588 sc-eQTL 9.45e-01 0.00663 0.0967 0.268 MAIT L2
ENSG00000116641 DOCK7 495601 sc-eQTL 2.01e-01 -0.119 0.0923 0.268 MAIT L2
ENSG00000125703 ATG4C 399855 sc-eQTL 2.10e-02 -0.224 0.0965 0.268 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -409734 sc-eQTL 6.22e-01 0.0483 0.0978 0.268 MAIT L2
ENSG00000162607 USP1 747690 sc-eQTL 1.83e-01 0.129 0.0967 0.268 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -339385 sc-eQTL 3.85e-01 -0.0877 0.101 0.268 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 -409424 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0534 0.0988 0.264 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 -183588 sc-eQTL 2.96e-01 0.106 0.101 0.264 NK_CD56bright L2
ENSG00000116641 DOCK7 495601 sc-eQTL 4.66e-01 0.064 0.0877 0.264 NK_CD56bright L2
ENSG00000125703 ATG4C 399855 sc-eQTL 7.92e-01 -0.026 0.0981 0.264 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -409734 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0517 0.102 0.264 NK_CD56bright L2
ENSG00000162607 USP1 747690 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0609 0.105 0.264 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -339385 sc-eQTL 2.85e-01 0.108 0.1 0.264 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 -409424 sc-eQTL 2.45e-01 -0.0912 0.0783 0.265 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 -183588 sc-eQTL 2.78e-01 0.108 0.0993 0.265 NK_CD56dim L2
ENSG00000116641 DOCK7 495601 sc-eQTL 1.07e-01 0.139 0.0861 0.265 NK_CD56dim L2
ENSG00000125703 ATG4C 399855 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0649 0.0879 0.265 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -409734 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0861 0.1 0.265 NK_CD56dim L2
ENSG00000162607 USP1 747690 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00383 0.0972 0.265 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -339385 sc-eQTL 8.51e-01 0.0204 0.108 0.265 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 -409424 sc-eQTL 4.07e-02 0.222 0.108 0.26 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 -183588 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0489 0.113 0.26 NK_HLA L2
ENSG00000116641 DOCK7 495601 sc-eQTL 8.22e-01 0.0194 0.0864 0.26 NK_HLA L2
ENSG00000125703 ATG4C 399855 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0517 0.1 0.26 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -409734 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0201 0.106 0.26 NK_HLA L2
ENSG00000162607 USP1 747690 sc-eQTL 3.68e-01 -0.0994 0.11 0.26 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -339385 sc-eQTL 8.87e-01 0.0144 0.101 0.26 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 -409424 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0238 0.0862 0.265 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 -183588 sc-eQTL 8.29e-01 -0.021 0.0974 0.265 NK_cytokine L2
ENSG00000116641 DOCK7 495601 sc-eQTL 6.50e-01 -0.041 0.0902 0.265 NK_cytokine L2
ENSG00000125703 ATG4C 399855 sc-eQTL 3.20e-01 -0.0917 0.0921 0.265 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -409734 sc-eQTL 8.05e-01 0.0236 0.0956 0.265 NK_cytokine L2
ENSG00000162607 USP1 747690 sc-eQTL 6.54e-01 0.0451 0.1 0.265 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -339385 sc-eQTL 8.72e-01 0.0164 0.102 0.265 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 -409424 sc-eQTL 4.11e-02 0.23 0.111 0.285 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 -183588 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0849 0.119 0.285 PB L2
ENSG00000116641 DOCK7 495601 sc-eQTL 2.08e-01 0.16 0.126 0.285 PB L2
ENSG00000125703 ATG4C 399855 sc-eQTL 1.26e-02 -0.274 0.108 0.285 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -409734 sc-eQTL 1.87e-01 -0.146 0.11 0.285 PB L2
ENSG00000162607 USP1 747690 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0105 0.11 0.285 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -339385 sc-eQTL 1.49e-01 0.175 0.121 0.285 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 -409424 sc-eQTL 5.07e-01 0.0607 0.0913 0.272 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 -183588 sc-eQTL 5.77e-01 0.0519 0.0929 0.272 Pro_T L2
ENSG00000116641 DOCK7 495601 sc-eQTL 2.02e-01 0.119 0.093 0.272 Pro_T L2
ENSG00000125703 ATG4C 399855 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0191 0.0817 0.272 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -409734 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0579 0.0819 0.272 Pro_T L2
ENSG00000162607 USP1 747690 sc-eQTL 4.02e-01 -0.0472 0.0562 0.272 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -339385 sc-eQTL 9.83e-01 0.00207 0.0952 0.272 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 -409424 sc-eQTL 1.54e-01 0.137 0.0955 0.269 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 -183588 sc-eQTL 4.95e-01 0.07 0.103 0.269 Treg L2
ENSG00000116641 DOCK7 495601 sc-eQTL 2.15e-01 0.117 0.0939 0.269 Treg L2
ENSG00000125703 ATG4C 399855 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0202 0.0963 0.269 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -409734 sc-eQTL 2.89e-01 0.107 0.1 0.269 Treg L2
ENSG00000162607 USP1 747690 sc-eQTL 2.44e-01 0.114 0.0971 0.269 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -339385 sc-eQTL 2.22e-01 0.118 0.096 0.269 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 -409424 sc-eQTL 1.21e-01 -0.152 0.0974 0.261 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -183588 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0502 0.0994 0.261 cDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 495601 sc-eQTL 6.91e-01 0.0389 0.0975 0.261 cDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 399855 sc-eQTL 9.76e-01 0.00254 0.0847 0.261 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -409734 sc-eQTL 6.79e-01 0.0445 0.107 0.261 cDC L2
ENSG00000162607 USP1 747690 sc-eQTL 3.13e-01 0.0964 0.0953 0.261 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -339385 sc-eQTL 9.38e-01 0.00668 0.0863 0.261 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 -409424 sc-eQTL 4.78e-01 0.0642 0.0904 0.269 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 -183588 sc-eQTL 9.76e-01 0.00273 0.0906 0.269 cMono_IL1B L2
ENSG00000116641 DOCK7 495601 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0548 0.0955 0.269 cMono_IL1B L2
ENSG00000125703 ATG4C 399855 sc-eQTL 3.24e-01 -0.0663 0.067 0.269 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -409734 sc-eQTL 3.31e-01 -0.0925 0.095 0.269 cMono_IL1B L2
ENSG00000162607 USP1 747690 sc-eQTL 3.47e-02 0.177 0.0831 0.269 cMono_IL1B L2
ENSG00000240563 L1TD1 989138 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0571 0.0842 0.269 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 -409424 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0465 0.1 0.269 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 -183588 sc-eQTL 7.10e-03 -0.272 0.1 0.269 cMono_S100A L2
ENSG00000116641 DOCK7 495601 sc-eQTL 3.42e-01 0.0896 0.0941 0.269 cMono_S100A L2
ENSG00000125703 ATG4C 399855 sc-eQTL 4.21e-01 0.0658 0.0815 0.269 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -409734 sc-eQTL 4.73e-01 0.0662 0.092 0.269 cMono_S100A L2
ENSG00000162607 USP1 747690 sc-eQTL 8.91e-01 -0.013 0.0948 0.269 cMono_S100A L2
ENSG00000240563 L1TD1 989138 sc-eQTL 2.19e-01 -0.097 0.0786 0.269 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 -409424 sc-eQTL 3.70e-01 0.102 0.113 0.255 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 -183588 sc-eQTL 1.37e-01 -0.18 0.12 0.255 gdT L2
ENSG00000116641 DOCK7 495601 sc-eQTL 2.25e-01 -0.144 0.118 0.255 gdT L2
ENSG00000125703 ATG4C 399855 sc-eQTL 8.03e-01 0.0283 0.113 0.255 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -409734 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0743 0.12 0.255 gdT L2
ENSG00000162607 USP1 747690 sc-eQTL 3.48e-01 0.107 0.114 0.255 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -339385 sc-eQTL 2.00e-03 0.361 0.115 0.255 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 -409424 sc-eQTL 2.58e-01 0.116 0.102 0.262 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -183588 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00217 0.0953 0.262 intMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 495601 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0621 0.0972 0.262 intMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 399855 sc-eQTL 4.65e-01 0.0679 0.0928 0.262 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -409734 sc-eQTL 6.26e-01 0.0499 0.102 0.262 intMono L2
ENSG00000162607 USP1 747690 sc-eQTL 7.33e-02 0.186 0.103 0.262 intMono L2
ENSG00000240563 L1TD1 989138 sc-eQTL 6.72e-01 0.0324 0.0765 0.262 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -409424 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00526 0.091 0.271 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -183588 sc-eQTL 7.79e-01 0.0281 0.1 0.271 ncMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 495601 sc-eQTL 8.11e-01 0.0236 0.0984 0.271 ncMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 399855 sc-eQTL 9.40e-01 0.00688 0.0919 0.271 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -409734 sc-eQTL 6.19e-01 0.0478 0.0961 0.271 ncMono L2
ENSG00000162607 USP1 747690 sc-eQTL 4.34e-01 -0.077 0.0981 0.271 ncMono L2
ENSG00000240563 L1TD1 989138 sc-eQTL 3.84e-01 0.0606 0.0696 0.271 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -409424 sc-eQTL 3.47e-01 -0.108 0.114 0.271 pDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -183588 sc-eQTL 9.28e-01 -0.0101 0.111 0.271 pDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 495601 sc-eQTL 1.14e-01 -0.179 0.113 0.271 pDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 399855 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0645 0.102 0.271 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -409734 sc-eQTL 6.25e-01 0.056 0.115 0.271 pDC L2
ENSG00000162607 USP1 747690 sc-eQTL 2.62e-01 0.131 0.116 0.271 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -339385 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0244 0.101 0.271 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -409424 sc-eQTL 2.28e-01 0.114 0.0944 0.269 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -183588 sc-eQTL 3.18e-01 0.105 0.104 0.269 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 495601 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0153 0.0908 0.269 B_Memory LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 399855 sc-eQTL 3.87e-01 0.0636 0.0733 0.269 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -409734 sc-eQTL 3.48e-01 0.0906 0.0963 0.269 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 747690 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0169 0.0937 0.269 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -339385 sc-eQTL 9.83e-01 0.0021 0.101 0.269 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -409424 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0141 0.0996 0.269 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -183588 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0869 0.102 0.269 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 495601 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0356 0.0958 0.269 B_Naive LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 399855 sc-eQTL 4.03e-02 -0.149 0.0724 0.269 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -409734 sc-eQTL 3.00e-01 0.107 0.103 0.269 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 747690 sc-eQTL 4.10e-01 0.0731 0.0887 0.269 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -339385 sc-eQTL 7.35e-02 0.185 0.103 0.269 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -409424 sc-eQTL 9.24e-01 -0.00888 0.0928 0.269 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -183588 sc-eQTL 1.46e-01 -0.131 0.0894 0.269 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 495601 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00551 0.0905 0.269 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 399855 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0165 0.0626 0.269 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -409734 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0329 0.0925 0.269 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 747690 sc-eQTL 1.89e-01 0.104 0.0788 0.269 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000240563 L1TD1 989138 sc-eQTL 2.14e-01 -0.106 0.0854 0.269 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -409424 sc-eQTL 1.42e-01 0.129 0.0877 0.269 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -183588 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0108 0.1 0.269 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 495601 sc-eQTL 9.33e-01 -0.00836 0.099 0.269 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 399855 sc-eQTL 9.54e-01 0.00488 0.0844 0.269 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -409734 sc-eQTL 7.77e-01 0.0278 0.098 0.269 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 747690 sc-eQTL 7.69e-01 0.0271 0.0921 0.269 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000240563 L1TD1 989138 sc-eQTL 7.92e-01 0.0166 0.0628 0.269 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -409424 sc-eQTL 8.37e-01 0.0158 0.0765 0.265 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -183588 sc-eQTL 8.23e-01 0.0206 0.0919 0.265 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 495601 sc-eQTL 3.33e-01 0.0796 0.0821 0.265 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 399855 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0181 0.0821 0.265 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -409734 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0662 0.0973 0.265 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 747690 sc-eQTL 5.79e-01 0.0491 0.0883 0.265 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -339385 sc-eQTL 6.83e-01 0.0439 0.107 0.265 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000116652 DLEU2L -363095 eQTL 0.0225 -0.0677 0.0296 0.00156 0.0 0.248

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000116652 DLEU2L -363095 1.25e-06 8.97e-07 2.89e-07 3.22e-07 2.31e-07 3.22e-07 7.99e-07 3.45e-07 1.09e-06 3.24e-07 1.15e-06 5.73e-07 1.43e-06 2.05e-07 4.43e-07 5.87e-07 7.78e-07 5.53e-07 3.56e-07 4.25e-07 3.07e-07 8.19e-07 6.11e-07 4.83e-07 1.57e-06 3.02e-07 6.03e-07 4.92e-07 8.4e-07 9.25e-07 4.61e-07 3.77e-08 1.5e-07 3.82e-07 3.4e-07 3.35e-07 2.94e-07 1.37e-07 1.56e-07 4.07e-08 2.84e-07 1.06e-06 6.68e-08 1.25e-08 1.7e-07 5.38e-08 1.71e-07 8.41e-08 8.09e-08
ENSG00000230798 \N -140454 3.97e-06 3.66e-06 7.43e-07 1.99e-06 1.3e-06 8.89e-07 2.52e-06 1.01e-06 3.4e-06 1.73e-06 3.74e-06 2.55e-06 6.2e-06 1.3e-06 1.26e-06 2.56e-06 1.82e-06 2.87e-06 1.36e-06 9.5e-07 2.35e-06 3.92e-06 3.53e-06 1.62e-06 4.66e-06 1.39e-06 2.1e-06 1.46e-06 4.13e-06 3.42e-06 2e-06 5.42e-07 6.52e-07 1.87e-06 1.98e-06 9.79e-07 9.05e-07 4.91e-07 1.04e-06 3.57e-07 6.91e-07 4.29e-06 4.6e-07 1.82e-07 5.79e-07 3.75e-07 8.08e-07 3.03e-07 3.43e-07