logo

Genes within 1Mb (chr1:63177041:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -416370 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00548 0.0941 0.184 B L1
ENSG00000088035 ALG6 -190534 sc-eQTL 1.27e-03 -0.311 0.0951 0.184 B L1
ENSG00000116641 DOCK7 488655 sc-eQTL 6.02e-01 0.0509 0.0975 0.184 B L1
ENSG00000125703 ATG4C 392909 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00246 0.0678 0.184 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -416680 sc-eQTL 9.80e-01 0.00269 0.108 0.184 B L1
ENSG00000162607 USP1 740744 sc-eQTL 1.46e-01 -0.136 0.0932 0.184 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -346331 sc-eQTL 4.08e-01 0.0915 0.11 0.184 B L1
ENSG00000079739 PGM1 -416370 sc-eQTL 7.81e-01 0.0223 0.0802 0.184 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 -190534 sc-eQTL 7.91e-01 0.0235 0.0885 0.184 CD4T L1
ENSG00000116641 DOCK7 488655 sc-eQTL 2.81e-01 0.0967 0.0893 0.184 CD4T L1
ENSG00000125703 ATG4C 392909 sc-eQTL 4.06e-01 0.0601 0.0722 0.184 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -416680 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0423 0.103 0.184 CD4T L1
ENSG00000162607 USP1 740744 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0485 0.0701 0.184 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -346331 sc-eQTL 5.60e-01 0.0537 0.0921 0.184 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 -416370 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0119 0.0883 0.184 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 -190534 sc-eQTL 3.29e-01 0.095 0.0971 0.184 CD8T L1
ENSG00000116641 DOCK7 488655 sc-eQTL 2.35e-01 0.117 0.0982 0.184 CD8T L1
ENSG00000125703 ATG4C 392909 sc-eQTL 2.67e-01 -0.104 0.0934 0.184 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -416680 sc-eQTL 8.07e-01 0.0257 0.105 0.184 CD8T L1
ENSG00000162607 USP1 740744 sc-eQTL 3.19e-01 -0.0814 0.0814 0.184 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -346331 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00183 0.104 0.184 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 -416370 sc-eQTL 3.13e-01 0.0992 0.0981 0.182 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 -190534 sc-eQTL 7.75e-01 -0.029 0.101 0.182 DC L1
ENSG00000116641 DOCK7 488655 sc-eQTL 1.25e-01 0.159 0.103 0.182 DC L1
ENSG00000125703 ATG4C 392909 sc-eQTL 2.19e-01 0.1 0.0811 0.182 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -416680 sc-eQTL 1.78e-01 -0.153 0.113 0.182 DC L1
ENSG00000162607 USP1 740744 sc-eQTL 2.60e-01 -0.112 0.099 0.182 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -346331 sc-eQTL 1.42e-01 0.145 0.0985 0.182 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 -416370 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0328 0.0959 0.184 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 -190534 sc-eQTL 2.29e-01 -0.12 0.0998 0.184 Mono L1
ENSG00000116641 DOCK7 488655 sc-eQTL 2.94e-01 0.102 0.0966 0.184 Mono L1
ENSG00000125703 ATG4C 392909 sc-eQTL 6.22e-01 0.0323 0.0654 0.184 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -416680 sc-eQTL 1.23e-01 0.159 0.103 0.184 Mono L1
ENSG00000162607 USP1 740744 sc-eQTL 3.50e-01 -0.0794 0.0848 0.184 Mono L1
ENSG00000240563 L1TD1 982192 sc-eQTL 6.69e-01 0.034 0.0793 0.184 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 -416370 sc-eQTL 2.40e-01 0.0964 0.0818 0.185 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 -190534 sc-eQTL 6.59e-01 0.0425 0.0962 0.185 NK L1
ENSG00000116641 DOCK7 488655 sc-eQTL 9.46e-01 0.00541 0.0793 0.185 NK L1
ENSG00000125703 ATG4C 392909 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0429 0.0851 0.185 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -416680 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0177 0.106 0.185 NK L1
ENSG00000162607 USP1 740744 sc-eQTL 8.40e-01 0.0192 0.0946 0.185 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -346331 sc-eQTL 3.42e-01 -0.109 0.115 0.185 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 -416370 sc-eQTL 5.95e-01 0.0505 0.0948 0.184 Other_T L1
ENSG00000088035 ALG6 -190534 sc-eQTL 2.35e-01 -0.113 0.095 0.184 Other_T L1
ENSG00000116641 DOCK7 488655 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00715 0.0973 0.184 Other_T L1
ENSG00000125703 ATG4C 392909 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0312 0.0842 0.184 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -416680 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0252 0.0747 0.184 Other_T L1
ENSG00000162607 USP1 740744 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00101 0.0648 0.184 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -346331 sc-eQTL 8.24e-02 -0.2 0.114 0.184 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -416370 sc-eQTL 6.95e-01 0.0489 0.124 0.184 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 -190534 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0126 0.119 0.184 B_Activated L2
ENSG00000116641 DOCK7 488655 sc-eQTL 1.56e-01 0.157 0.11 0.184 B_Activated L2
ENSG00000125703 ATG4C 392909 sc-eQTL 9.76e-01 0.00353 0.117 0.184 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -416680 sc-eQTL 1.17e-01 0.178 0.113 0.184 B_Activated L2
ENSG00000162607 USP1 740744 sc-eQTL 2.21e-01 0.151 0.123 0.184 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -346331 sc-eQTL 4.00e-01 -0.091 0.108 0.184 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 -416370 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0299 0.113 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 -190534 sc-eQTL 6.01e-02 -0.216 0.114 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000116641 DOCK7 488655 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000154 0.11 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000125703 ATG4C 392909 sc-eQTL 3.69e-01 0.0837 0.0929 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -416680 sc-eQTL 7.60e-01 -0.034 0.111 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000162607 USP1 740744 sc-eQTL 2.81e-01 -0.119 0.11 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -346331 sc-eQTL 9.73e-01 0.00374 0.11 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 -416370 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0548 0.111 0.185 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 -190534 sc-eQTL 5.76e-03 -0.309 0.111 0.185 B_Memory L2
ENSG00000116641 DOCK7 488655 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0344 0.106 0.185 B_Memory L2
ENSG00000125703 ATG4C 392909 sc-eQTL 8.35e-01 0.0209 0.101 0.185 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -416680 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0384 0.115 0.185 B_Memory L2
ENSG00000162607 USP1 740744 sc-eQTL 1.93e-02 -0.27 0.115 0.185 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -346331 sc-eQTL 3.61e-01 0.104 0.114 0.185 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 -416370 sc-eQTL 5.09e-01 0.073 0.11 0.184 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 -190534 sc-eQTL 5.55e-03 -0.306 0.109 0.184 B_Naive1 L2
ENSG00000116641 DOCK7 488655 sc-eQTL 2.29e-01 0.128 0.106 0.184 B_Naive1 L2
ENSG00000125703 ATG4C 392909 sc-eQTL 3.15e-01 0.0823 0.0818 0.184 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -416680 sc-eQTL 5.84e-01 0.0596 0.109 0.184 B_Naive1 L2
ENSG00000162607 USP1 740744 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0348 0.0956 0.184 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -346331 sc-eQTL 9.34e-01 0.00955 0.116 0.184 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 -416370 sc-eQTL 8.55e-01 -0.02 0.109 0.185 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 -190534 sc-eQTL 6.14e-01 0.0575 0.114 0.185 B_Naive2 L2
ENSG00000116641 DOCK7 488655 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0233 0.11 0.185 B_Naive2 L2
ENSG00000125703 ATG4C 392909 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0399 0.105 0.185 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -416680 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0458 0.114 0.185 B_Naive2 L2
ENSG00000162607 USP1 740744 sc-eQTL 9.43e-01 0.00773 0.109 0.185 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -346331 sc-eQTL 9.62e-01 0.00544 0.114 0.185 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 -416370 sc-eQTL 1.46e-01 0.158 0.109 0.186 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -190534 sc-eQTL 1.81e-01 -0.154 0.115 0.186 CD4_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 488655 sc-eQTL 6.70e-01 0.043 0.101 0.186 CD4_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 392909 sc-eQTL 4.51e-01 0.0787 0.104 0.186 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -416680 sc-eQTL 7.40e-01 0.0371 0.112 0.186 CD4_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 740744 sc-eQTL 5.40e-01 0.0652 0.106 0.186 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -346331 sc-eQTL 3.62e-02 0.221 0.105 0.186 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -416370 sc-eQTL 6.02e-01 0.0474 0.0906 0.184 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -190534 sc-eQTL 1.59e-01 0.139 0.0981 0.184 CD4_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 488655 sc-eQTL 4.27e-01 0.077 0.0967 0.184 CD4_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 392909 sc-eQTL 8.63e-01 0.0148 0.0856 0.184 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -416680 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0235 0.105 0.184 CD4_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 740744 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0603 0.0798 0.184 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -346331 sc-eQTL 6.97e-01 0.0404 0.104 0.184 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -416370 sc-eQTL 1.43e-01 -0.136 0.0926 0.184 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -190534 sc-eQTL 1.29e-01 -0.164 0.107 0.184 CD4_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 488655 sc-eQTL 8.64e-01 0.0164 0.0958 0.184 CD4_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 392909 sc-eQTL 7.72e-01 0.0271 0.0932 0.184 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -416680 sc-eQTL 9.11e-01 0.0122 0.11 0.184 CD4_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 740744 sc-eQTL 1.61e-01 -0.126 0.0897 0.184 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -346331 sc-eQTL 3.30e-01 0.104 0.106 0.184 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -416370 sc-eQTL 4.16e-01 0.0912 0.112 0.184 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -190534 sc-eQTL 1.23e-01 -0.173 0.112 0.184 CD4_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 488655 sc-eQTL 6.49e-01 -0.05 0.11 0.184 CD4_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 392909 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0828 0.106 0.184 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -416680 sc-eQTL 1.35e-01 -0.164 0.109 0.184 CD4_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 740744 sc-eQTL 1.80e-01 0.14 0.104 0.184 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -346331 sc-eQTL 3.44e-01 0.108 0.114 0.184 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -416370 sc-eQTL 1.36e-01 0.148 0.0989 0.184 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -190534 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0393 0.106 0.184 CD8_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 488655 sc-eQTL 6.71e-01 0.0427 0.1 0.184 CD8_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 392909 sc-eQTL 2.91e-01 -0.113 0.106 0.184 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -416680 sc-eQTL 6.14e-01 -0.056 0.111 0.184 CD8_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 740744 sc-eQTL 3.46e-01 -0.0938 0.0992 0.184 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -346331 sc-eQTL 3.41e-01 -0.108 0.113 0.184 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -416370 sc-eQTL 5.87e-01 0.0551 0.101 0.184 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -190534 sc-eQTL 1.79e-01 0.141 0.105 0.184 CD8_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 488655 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0343 0.109 0.184 CD8_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 392909 sc-eQTL 7.97e-01 0.0269 0.104 0.184 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -416680 sc-eQTL 8.64e-01 -0.018 0.106 0.184 CD8_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 740744 sc-eQTL 9.74e-01 0.00297 0.0893 0.184 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -346331 sc-eQTL 9.60e-01 0.00496 0.0996 0.184 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -416370 sc-eQTL 9.61e-01 0.00563 0.115 0.178 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -190534 sc-eQTL 3.36e-02 0.246 0.115 0.178 CD8_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 488655 sc-eQTL 5.27e-01 0.072 0.113 0.178 CD8_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 392909 sc-eQTL 6.65e-01 0.0504 0.116 0.178 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -416680 sc-eQTL 1.55e-01 0.16 0.112 0.178 CD8_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 740744 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00295 0.109 0.178 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -346331 sc-eQTL 3.36e-01 -0.111 0.115 0.178 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -416370 sc-eQTL 2.64e-02 -0.248 0.111 0.185 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -190534 sc-eQTL 3.05e-01 -0.116 0.112 0.185 CD8_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 488655 sc-eQTL 8.36e-01 0.0226 0.109 0.185 CD8_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 392909 sc-eQTL 2.99e-01 -0.109 0.105 0.185 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -416680 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0406 0.114 0.185 CD8_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 740744 sc-eQTL 7.79e-01 0.0305 0.108 0.185 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -346331 sc-eQTL 1.16e-01 -0.173 0.11 0.185 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -416370 sc-eQTL 3.37e-01 -0.102 0.106 0.184 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 -190534 sc-eQTL 1.24e-01 -0.161 0.104 0.184 MAIT L2
ENSG00000116641 DOCK7 488655 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0236 0.101 0.184 MAIT L2
ENSG00000125703 ATG4C 392909 sc-eQTL 1.35e-01 0.158 0.106 0.184 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -416680 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0495 0.106 0.184 MAIT L2
ENSG00000162607 USP1 740744 sc-eQTL 1.69e-01 -0.145 0.105 0.184 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -346331 sc-eQTL 9.62e-02 -0.182 0.109 0.184 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 -416370 sc-eQTL 4.39e-01 0.0835 0.108 0.187 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 -190534 sc-eQTL 7.34e-01 0.0376 0.111 0.187 NK_CD56bright L2
ENSG00000116641 DOCK7 488655 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0426 0.0958 0.187 NK_CD56bright L2
ENSG00000125703 ATG4C 392909 sc-eQTL 3.30e-01 -0.104 0.107 0.187 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -416680 sc-eQTL 8.23e-01 -0.025 0.111 0.187 NK_CD56bright L2
ENSG00000162607 USP1 740744 sc-eQTL 4.83e-03 0.321 0.113 0.187 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -346331 sc-eQTL 2.02e-01 -0.14 0.109 0.187 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 -416370 sc-eQTL 3.32e-01 0.0827 0.085 0.185 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 -190534 sc-eQTL 3.45e-01 -0.102 0.108 0.185 NK_CD56dim L2
ENSG00000116641 DOCK7 488655 sc-eQTL 3.00e-01 -0.0975 0.0938 0.185 NK_CD56dim L2
ENSG00000125703 ATG4C 392909 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0134 0.0955 0.185 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -416680 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0264 0.109 0.185 NK_CD56dim L2
ENSG00000162607 USP1 740744 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0175 0.105 0.185 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -346331 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0672 0.117 0.185 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 -416370 sc-eQTL 3.42e-01 0.111 0.117 0.187 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 -190534 sc-eQTL 1.03e-01 0.197 0.12 0.187 NK_HLA L2
ENSG00000116641 DOCK7 488655 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0329 0.0927 0.187 NK_HLA L2
ENSG00000125703 ATG4C 392909 sc-eQTL 1.89e-01 0.142 0.107 0.187 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -416680 sc-eQTL 4.90e-01 0.0783 0.113 0.187 NK_HLA L2
ENSG00000162607 USP1 740744 sc-eQTL 3.72e-01 0.106 0.118 0.187 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -346331 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00124 0.108 0.187 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 -416370 sc-eQTL 9.20e-01 0.00935 0.093 0.185 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 -190534 sc-eQTL 8.53e-01 0.0195 0.105 0.185 NK_cytokine L2
ENSG00000116641 DOCK7 488655 sc-eQTL 6.83e-01 0.0398 0.0974 0.185 NK_cytokine L2
ENSG00000125703 ATG4C 392909 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0196 0.0996 0.185 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -416680 sc-eQTL 7.59e-01 0.0316 0.103 0.185 NK_cytokine L2
ENSG00000162607 USP1 740744 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0374 0.108 0.185 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -346331 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0375 0.11 0.185 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 -416370 sc-eQTL 1.26e-01 -0.217 0.141 0.159 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 -190534 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0504 0.149 0.159 PB L2
ENSG00000116641 DOCK7 488655 sc-eQTL 4.69e-01 -0.116 0.159 0.159 PB L2
ENSG00000125703 ATG4C 392909 sc-eQTL 1.62e-02 0.331 0.136 0.159 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -416680 sc-eQTL 6.48e-01 0.0635 0.139 0.159 PB L2
ENSG00000162607 USP1 740744 sc-eQTL 1.77e-01 0.186 0.137 0.159 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -346331 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0839 0.152 0.159 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 -416370 sc-eQTL 8.65e-01 0.0172 0.101 0.183 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 -190534 sc-eQTL 5.44e-02 -0.197 0.102 0.183 Pro_T L2
ENSG00000116641 DOCK7 488655 sc-eQTL 2.34e-01 -0.122 0.103 0.183 Pro_T L2
ENSG00000125703 ATG4C 392909 sc-eQTL 9.24e-01 -0.00863 0.0901 0.183 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -416680 sc-eQTL 8.78e-01 0.0139 0.0903 0.183 Pro_T L2
ENSG00000162607 USP1 740744 sc-eQTL 5.50e-01 0.0372 0.0621 0.183 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -346331 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0338 0.105 0.183 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 -416370 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0161 0.106 0.184 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 -190534 sc-eQTL 1.99e-01 0.145 0.113 0.184 Treg L2
ENSG00000116641 DOCK7 488655 sc-eQTL 8.47e-01 0.0201 0.104 0.184 Treg L2
ENSG00000125703 ATG4C 392909 sc-eQTL 9.87e-01 0.00171 0.106 0.184 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -416680 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0381 0.111 0.184 Treg L2
ENSG00000162607 USP1 740744 sc-eQTL 3.76e-01 0.0951 0.107 0.184 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -346331 sc-eQTL 9.96e-01 0.000504 0.106 0.184 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 -416370 sc-eQTL 8.87e-02 0.175 0.102 0.195 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -190534 sc-eQTL 8.55e-01 0.0192 0.105 0.195 cDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 488655 sc-eQTL 3.35e-02 0.218 0.102 0.195 cDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 392909 sc-eQTL 4.35e-01 0.0697 0.0891 0.195 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -416680 sc-eQTL 3.50e-01 -0.106 0.113 0.195 cDC L2
ENSG00000162607 USP1 740744 sc-eQTL 3.11e-01 -0.102 0.1 0.195 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -346331 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0527 0.0908 0.195 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 -416370 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0652 0.0993 0.184 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 -190534 sc-eQTL 1.70e-01 -0.136 0.0991 0.184 cMono_IL1B L2
ENSG00000116641 DOCK7 488655 sc-eQTL 9.40e-02 0.175 0.104 0.184 cMono_IL1B L2
ENSG00000125703 ATG4C 392909 sc-eQTL 8.94e-01 -0.00988 0.0738 0.184 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -416680 sc-eQTL 3.10e-01 0.106 0.104 0.184 cMono_IL1B L2
ENSG00000162607 USP1 740744 sc-eQTL 5.01e-02 -0.18 0.0914 0.184 cMono_IL1B L2
ENSG00000240563 L1TD1 982192 sc-eQTL 7.68e-02 0.163 0.0919 0.184 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 -416370 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0251 0.11 0.184 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 -190534 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0479 0.111 0.184 cMono_S100A L2
ENSG00000116641 DOCK7 488655 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0593 0.103 0.184 cMono_S100A L2
ENSG00000125703 ATG4C 392909 sc-eQTL 3.96e-01 0.0757 0.089 0.184 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -416680 sc-eQTL 2.53e-01 0.115 0.1 0.184 cMono_S100A L2
ENSG00000162607 USP1 740744 sc-eQTL 2.46e-01 0.12 0.103 0.184 cMono_S100A L2
ENSG00000240563 L1TD1 982192 sc-eQTL 5.19e-01 0.0556 0.086 0.184 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 -416370 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0202 0.118 0.2 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 -190534 sc-eQTL 9.34e-01 -0.0104 0.126 0.2 gdT L2
ENSG00000116641 DOCK7 488655 sc-eQTL 6.81e-01 0.0509 0.124 0.2 gdT L2
ENSG00000125703 ATG4C 392909 sc-eQTL 7.55e-04 -0.391 0.113 0.2 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -416680 sc-eQTL 5.50e-01 -0.075 0.125 0.2 gdT L2
ENSG00000162607 USP1 740744 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00491 0.119 0.2 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -346331 sc-eQTL 8.65e-02 -0.211 0.122 0.2 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 -416370 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0862 0.109 0.187 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -190534 sc-eQTL 7.78e-01 0.0287 0.102 0.187 intMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 488655 sc-eQTL 8.18e-01 0.0239 0.104 0.187 intMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 392909 sc-eQTL 8.09e-01 0.024 0.0992 0.187 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -416680 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0266 0.109 0.187 intMono L2
ENSG00000162607 USP1 740744 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0466 0.111 0.187 intMono L2
ENSG00000240563 L1TD1 982192 sc-eQTL 6.17e-01 0.0409 0.0817 0.187 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -416370 sc-eQTL 8.57e-02 0.17 0.0983 0.188 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -190534 sc-eQTL 1.37e-01 -0.162 0.108 0.188 ncMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 488655 sc-eQTL 1.90e-01 0.14 0.107 0.188 ncMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 392909 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0243 0.1 0.188 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -416680 sc-eQTL 9.25e-01 -0.00989 0.105 0.188 ncMono L2
ENSG00000162607 USP1 740744 sc-eQTL 2.11e-01 -0.134 0.107 0.188 ncMono L2
ENSG00000240563 L1TD1 982192 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0176 0.0758 0.188 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -416370 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0341 0.115 0.209 pDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -190534 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0573 0.112 0.209 pDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 488655 sc-eQTL 5.01e-01 0.0773 0.115 0.209 pDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 392909 sc-eQTL 6.46e-01 0.0473 0.103 0.209 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -416680 sc-eQTL 1.85e-01 -0.153 0.115 0.209 pDC L2
ENSG00000162607 USP1 740744 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0406 0.118 0.209 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -346331 sc-eQTL 8.08e-03 0.268 0.1 0.209 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -416370 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0136 0.104 0.184 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -190534 sc-eQTL 3.03e-03 -0.337 0.112 0.184 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 488655 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0377 0.0995 0.184 B_Memory LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 392909 sc-eQTL 4.81e-01 0.0568 0.0804 0.184 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -416680 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0169 0.106 0.184 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 740744 sc-eQTL 9.84e-02 -0.169 0.102 0.184 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -346331 sc-eQTL 7.15e-01 0.0403 0.11 0.184 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -416370 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0153 0.108 0.184 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -190534 sc-eQTL 6.26e-02 -0.207 0.111 0.184 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 488655 sc-eQTL 2.66e-01 0.116 0.104 0.184 B_Naive LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 392909 sc-eQTL 8.31e-01 0.017 0.0795 0.184 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -416680 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00415 0.112 0.184 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 740744 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0527 0.0965 0.184 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -346331 sc-eQTL 8.44e-01 0.0222 0.113 0.184 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -416370 sc-eQTL 8.29e-01 -0.022 0.102 0.184 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -190534 sc-eQTL 1.22e-01 -0.152 0.0979 0.184 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 488655 sc-eQTL 2.84e-01 0.106 0.0988 0.184 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 392909 sc-eQTL 4.76e-01 0.0488 0.0684 0.184 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -416680 sc-eQTL 1.47e-01 0.147 0.101 0.184 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 740744 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0436 0.0865 0.184 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000240563 L1TD1 982192 sc-eQTL 8.30e-02 0.162 0.0932 0.184 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -416370 sc-eQTL 7.50e-01 0.0309 0.0968 0.183 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -190534 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0734 0.11 0.183 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 488655 sc-eQTL 4.36e-01 0.0847 0.109 0.183 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 392909 sc-eQTL 6.53e-01 0.0418 0.0927 0.183 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -416680 sc-eQTL 6.64e-01 0.0468 0.108 0.183 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 740744 sc-eQTL 2.43e-01 -0.118 0.101 0.183 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000240563 L1TD1 982192 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0124 0.069 0.183 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -416370 sc-eQTL 1.52e-01 0.119 0.0828 0.185 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -190534 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00267 0.0999 0.185 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 488655 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0162 0.0895 0.185 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 392909 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0251 0.0893 0.185 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -416680 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0182 0.106 0.185 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 740744 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0393 0.096 0.185 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -346331 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0246 0.117 0.185 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000142856 ITGB3BP -416680 eQTL 0.0227 -0.0882 0.0387 0.0 0.0 0.184

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina