logo

Genes within 1Mb (chr1:63174130:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -419281 sc-eQTL 5.75e-01 0.0479 0.0853 0.269 B L1
ENSG00000088035 ALG6 -193445 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0349 0.0884 0.269 B L1
ENSG00000116641 DOCK7 485744 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0709 0.0883 0.269 B L1
ENSG00000125703 ATG4C 389998 sc-eQTL 7.12e-02 -0.111 0.061 0.269 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -419591 sc-eQTL 2.40e-01 0.115 0.0975 0.269 B L1
ENSG00000162607 USP1 737833 sc-eQTL 1.69e-01 0.117 0.0845 0.269 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -349242 sc-eQTL 8.50e-02 0.172 0.0995 0.269 B L1
ENSG00000079739 PGM1 -419281 sc-eQTL 8.35e-01 0.015 0.072 0.269 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 -193445 sc-eQTL 5.80e-01 -0.044 0.0795 0.269 CD4T L1
ENSG00000116641 DOCK7 485744 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0671 0.0804 0.269 CD4T L1
ENSG00000125703 ATG4C 389998 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0524 0.0649 0.269 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -419591 sc-eQTL 4.94e-02 0.181 0.0914 0.269 CD4T L1
ENSG00000162607 USP1 737833 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0361 0.063 0.269 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -349242 sc-eQTL 9.56e-01 0.00462 0.0828 0.269 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 -419281 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0106 0.0795 0.269 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 -193445 sc-eQTL 8.53e-01 0.0163 0.0876 0.269 CD8T L1
ENSG00000116641 DOCK7 485744 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00206 0.0888 0.269 CD8T L1
ENSG00000125703 ATG4C 389998 sc-eQTL 7.68e-02 -0.149 0.0837 0.269 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -419591 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0124 0.0943 0.269 CD8T L1
ENSG00000162607 USP1 737833 sc-eQTL 6.30e-02 0.136 0.0729 0.269 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -349242 sc-eQTL 4.59e-02 0.187 0.0931 0.269 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 -419281 sc-eQTL 1.66e-01 -0.122 0.0878 0.27 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 -193445 sc-eQTL 2.80e-01 -0.0984 0.0908 0.27 DC L1
ENSG00000116641 DOCK7 485744 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0242 0.0933 0.27 DC L1
ENSG00000125703 ATG4C 389998 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00175 0.073 0.27 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -419591 sc-eQTL 1.21e-01 0.158 0.101 0.27 DC L1
ENSG00000162607 USP1 737833 sc-eQTL 7.14e-03 0.238 0.0875 0.27 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -349242 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0399 0.0888 0.27 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 -419281 sc-eQTL 8.24e-01 0.0193 0.0871 0.269 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 -193445 sc-eQTL 4.75e-02 -0.18 0.0901 0.269 Mono L1
ENSG00000116641 DOCK7 485744 sc-eQTL 5.29e-01 0.0554 0.0878 0.269 Mono L1
ENSG00000125703 ATG4C 389998 sc-eQTL 9.65e-01 0.00259 0.0594 0.269 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -419591 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00533 0.0939 0.269 Mono L1
ENSG00000162607 USP1 737833 sc-eQTL 6.35e-01 0.0367 0.0771 0.269 Mono L1
ENSG00000240563 L1TD1 979281 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0562 0.0719 0.269 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 -419281 sc-eQTL 9.05e-01 0.00901 0.075 0.268 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 -193445 sc-eQTL 6.85e-01 0.0357 0.0879 0.268 NK L1
ENSG00000116641 DOCK7 485744 sc-eQTL 1.35e-01 0.108 0.072 0.268 NK L1
ENSG00000125703 ATG4C 389998 sc-eQTL 8.85e-01 0.0112 0.0778 0.268 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -419591 sc-eQTL 2.18e-01 -0.119 0.0963 0.268 NK L1
ENSG00000162607 USP1 737833 sc-eQTL 8.20e-01 0.0197 0.0864 0.268 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -349242 sc-eQTL 5.21e-01 0.0673 0.105 0.268 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 -419281 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0341 0.0847 0.269 Other_T L1
ENSG00000088035 ALG6 -193445 sc-eQTL 7.33e-01 0.0291 0.0852 0.269 Other_T L1
ENSG00000116641 DOCK7 485744 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0504 0.0869 0.269 Other_T L1
ENSG00000125703 ATG4C 389998 sc-eQTL 8.54e-02 -0.129 0.0748 0.269 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -419591 sc-eQTL 1.36e-01 -0.0994 0.0664 0.269 Other_T L1
ENSG00000162607 USP1 737833 sc-eQTL 5.83e-01 0.0318 0.0578 0.269 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -349242 sc-eQTL 2.28e-01 0.124 0.103 0.269 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -419281 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0196 0.111 0.281 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 -193445 sc-eQTL 5.67e-01 0.0609 0.106 0.281 B_Activated L2
ENSG00000116641 DOCK7 485744 sc-eQTL 5.26e-01 0.0628 0.0989 0.281 B_Activated L2
ENSG00000125703 ATG4C 389998 sc-eQTL 6.92e-01 0.0413 0.104 0.281 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -419591 sc-eQTL 2.19e-01 0.125 0.101 0.281 B_Activated L2
ENSG00000162607 USP1 737833 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0977 0.11 0.281 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -349242 sc-eQTL 4.89e-01 0.0667 0.0962 0.281 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 -419281 sc-eQTL 2.96e-01 0.105 0.101 0.27 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 -193445 sc-eQTL 2.05e-01 0.13 0.102 0.27 B_Intermediate L2
ENSG00000116641 DOCK7 485744 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0613 0.0979 0.27 B_Intermediate L2
ENSG00000125703 ATG4C 389998 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0158 0.083 0.27 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -419591 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0302 0.0988 0.27 B_Intermediate L2
ENSG00000162607 USP1 737833 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00165 0.0987 0.27 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -349242 sc-eQTL 2.79e-01 0.106 0.0976 0.27 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 -419281 sc-eQTL 5.60e-01 0.0593 0.102 0.265 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 -193445 sc-eQTL 9.22e-01 0.0101 0.103 0.265 B_Memory L2
ENSG00000116641 DOCK7 485744 sc-eQTL 2.61e-01 -0.109 0.0966 0.265 B_Memory L2
ENSG00000125703 ATG4C 389998 sc-eQTL 8.55e-01 0.0168 0.0921 0.265 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -419591 sc-eQTL 1.25e-01 0.161 0.105 0.265 B_Memory L2
ENSG00000162607 USP1 737833 sc-eQTL 2.26e-01 0.129 0.106 0.265 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -349242 sc-eQTL 3.52e-01 -0.0975 0.104 0.265 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 -419281 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0804 0.102 0.269 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 -193445 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0304 0.102 0.269 B_Naive1 L2
ENSG00000116641 DOCK7 485744 sc-eQTL 8.82e-01 0.0146 0.0981 0.269 B_Naive1 L2
ENSG00000125703 ATG4C 389998 sc-eQTL 3.67e-02 -0.157 0.0748 0.269 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -419591 sc-eQTL 4.25e-01 0.0801 0.1 0.269 B_Naive1 L2
ENSG00000162607 USP1 737833 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0249 0.0882 0.269 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -349242 sc-eQTL 1.47e-02 0.259 0.105 0.269 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 -419281 sc-eQTL 9.85e-01 0.00184 0.101 0.266 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 -193445 sc-eQTL 3.20e-01 -0.104 0.105 0.266 B_Naive2 L2
ENSG00000116641 DOCK7 485744 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0495 0.101 0.266 B_Naive2 L2
ENSG00000125703 ATG4C 389998 sc-eQTL 2.66e-01 -0.108 0.0968 0.266 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -419591 sc-eQTL 2.56e-01 0.12 0.105 0.266 B_Naive2 L2
ENSG00000162607 USP1 737833 sc-eQTL 2.02e-02 0.232 0.0989 0.266 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -349242 sc-eQTL 9.50e-01 0.00656 0.105 0.266 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 -419281 sc-eQTL 7.02e-02 -0.185 0.102 0.266 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -193445 sc-eQTL 5.52e-01 0.0646 0.108 0.266 CD4_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 485744 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00812 0.0948 0.266 CD4_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 389998 sc-eQTL 1.45e-01 0.143 0.0975 0.266 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -419591 sc-eQTL 1.10e-02 0.265 0.103 0.266 CD4_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 737833 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0262 0.0998 0.266 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -349242 sc-eQTL 1.87e-01 -0.131 0.0992 0.266 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -419281 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0181 0.0805 0.269 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -193445 sc-eQTL 2.73e-01 -0.0958 0.0872 0.269 CD4_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 485744 sc-eQTL 8.52e-02 -0.148 0.0854 0.269 CD4_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 389998 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0397 0.076 0.269 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -419591 sc-eQTL 1.81e-01 0.124 0.0925 0.269 CD4_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 737833 sc-eQTL 3.83e-01 -0.0619 0.0708 0.269 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -349242 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0585 0.0921 0.269 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -419281 sc-eQTL 1.96e-01 0.109 0.0836 0.269 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -193445 sc-eQTL 8.02e-01 0.0245 0.0975 0.269 CD4_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 485744 sc-eQTL 3.57e-01 0.0796 0.0862 0.269 CD4_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 389998 sc-eQTL 8.66e-02 -0.144 0.0835 0.269 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -419591 sc-eQTL 1.30e-01 0.15 0.0986 0.269 CD4_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 737833 sc-eQTL 2.47e-01 0.0941 0.081 0.269 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -349242 sc-eQTL 2.39e-01 0.113 0.0956 0.269 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -419281 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0127 0.0991 0.269 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -193445 sc-eQTL 1.47e-01 -0.144 0.0991 0.269 CD4_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 485744 sc-eQTL 9.38e-01 0.00759 0.0971 0.269 CD4_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 389998 sc-eQTL 4.46e-01 -0.072 0.0942 0.269 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -419591 sc-eQTL 3.18e-02 0.208 0.0963 0.269 CD4_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 737833 sc-eQTL 9.28e-01 -0.00836 0.0922 0.269 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -349242 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0835 0.101 0.269 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -419281 sc-eQTL 3.20e-01 -0.0919 0.0922 0.269 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -193445 sc-eQTL 4.28e-01 0.0779 0.0981 0.269 CD8_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 485744 sc-eQTL 9.93e-01 0.000805 0.0932 0.269 CD8_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 389998 sc-eQTL 6.30e-01 0.0478 0.0992 0.269 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -419591 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00611 0.103 0.269 CD8_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 737833 sc-eQTL 2.28e-01 0.111 0.0921 0.269 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -349242 sc-eQTL 3.28e-01 0.103 0.105 0.269 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -419281 sc-eQTL 4.87e-01 0.064 0.092 0.269 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -193445 sc-eQTL 3.90e-02 -0.196 0.0943 0.269 CD8_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 485744 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0149 0.0985 0.269 CD8_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 389998 sc-eQTL 2.20e-01 -0.116 0.0942 0.269 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -419591 sc-eQTL 2.54e-01 0.109 0.0955 0.269 CD8_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 737833 sc-eQTL 3.82e-01 0.0708 0.0808 0.269 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -349242 sc-eQTL 5.48e-01 0.0543 0.0902 0.269 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -419281 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00774 0.101 0.273 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -193445 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0696 0.102 0.273 CD8_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 485744 sc-eQTL 3.44e-01 -0.094 0.0991 0.273 CD8_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 389998 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0397 0.102 0.273 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -419591 sc-eQTL 8.56e-01 0.0179 0.0987 0.273 CD8_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 737833 sc-eQTL 3.84e-01 0.0827 0.0948 0.273 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -349242 sc-eQTL 1.04e-01 0.163 0.0999 0.273 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -419281 sc-eQTL 1.33e-01 0.157 0.104 0.272 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -193445 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0137 0.105 0.272 CD8_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 485744 sc-eQTL 9.30e-01 0.00893 0.102 0.272 CD8_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 389998 sc-eQTL 4.01e-01 -0.0824 0.0979 0.272 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -419591 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0186 0.106 0.272 CD8_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 737833 sc-eQTL 3.58e-01 0.093 0.101 0.272 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -349242 sc-eQTL 2.31e-01 0.123 0.103 0.272 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -419281 sc-eQTL 7.11e-01 0.0363 0.0977 0.268 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 -193445 sc-eQTL 9.45e-01 0.00663 0.0967 0.268 MAIT L2
ENSG00000116641 DOCK7 485744 sc-eQTL 2.01e-01 -0.119 0.0923 0.268 MAIT L2
ENSG00000125703 ATG4C 389998 sc-eQTL 2.10e-02 -0.224 0.0965 0.268 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -419591 sc-eQTL 6.22e-01 0.0483 0.0978 0.268 MAIT L2
ENSG00000162607 USP1 737833 sc-eQTL 1.83e-01 0.129 0.0967 0.268 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -349242 sc-eQTL 3.85e-01 -0.0877 0.101 0.268 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 -419281 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0534 0.0988 0.264 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 -193445 sc-eQTL 2.96e-01 0.106 0.101 0.264 NK_CD56bright L2
ENSG00000116641 DOCK7 485744 sc-eQTL 4.66e-01 0.064 0.0877 0.264 NK_CD56bright L2
ENSG00000125703 ATG4C 389998 sc-eQTL 7.92e-01 -0.026 0.0981 0.264 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -419591 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0517 0.102 0.264 NK_CD56bright L2
ENSG00000162607 USP1 737833 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0609 0.105 0.264 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -349242 sc-eQTL 2.85e-01 0.108 0.1 0.264 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 -419281 sc-eQTL 2.45e-01 -0.0912 0.0783 0.265 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 -193445 sc-eQTL 2.78e-01 0.108 0.0993 0.265 NK_CD56dim L2
ENSG00000116641 DOCK7 485744 sc-eQTL 1.07e-01 0.139 0.0861 0.265 NK_CD56dim L2
ENSG00000125703 ATG4C 389998 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0649 0.0879 0.265 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -419591 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0861 0.1 0.265 NK_CD56dim L2
ENSG00000162607 USP1 737833 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00383 0.0972 0.265 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -349242 sc-eQTL 8.51e-01 0.0204 0.108 0.265 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 -419281 sc-eQTL 4.07e-02 0.222 0.108 0.26 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 -193445 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0489 0.113 0.26 NK_HLA L2
ENSG00000116641 DOCK7 485744 sc-eQTL 8.22e-01 0.0194 0.0864 0.26 NK_HLA L2
ENSG00000125703 ATG4C 389998 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0517 0.1 0.26 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -419591 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0201 0.106 0.26 NK_HLA L2
ENSG00000162607 USP1 737833 sc-eQTL 3.68e-01 -0.0994 0.11 0.26 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -349242 sc-eQTL 8.87e-01 0.0144 0.101 0.26 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 -419281 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0238 0.0862 0.265 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 -193445 sc-eQTL 8.29e-01 -0.021 0.0974 0.265 NK_cytokine L2
ENSG00000116641 DOCK7 485744 sc-eQTL 6.50e-01 -0.041 0.0902 0.265 NK_cytokine L2
ENSG00000125703 ATG4C 389998 sc-eQTL 3.20e-01 -0.0917 0.0921 0.265 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -419591 sc-eQTL 8.05e-01 0.0236 0.0956 0.265 NK_cytokine L2
ENSG00000162607 USP1 737833 sc-eQTL 6.54e-01 0.0451 0.1 0.265 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -349242 sc-eQTL 8.72e-01 0.0164 0.102 0.265 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 -419281 sc-eQTL 4.11e-02 0.23 0.111 0.285 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 -193445 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0849 0.119 0.285 PB L2
ENSG00000116641 DOCK7 485744 sc-eQTL 2.08e-01 0.16 0.126 0.285 PB L2
ENSG00000125703 ATG4C 389998 sc-eQTL 1.26e-02 -0.274 0.108 0.285 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -419591 sc-eQTL 1.87e-01 -0.146 0.11 0.285 PB L2
ENSG00000162607 USP1 737833 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0105 0.11 0.285 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -349242 sc-eQTL 1.49e-01 0.175 0.121 0.285 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 -419281 sc-eQTL 5.07e-01 0.0607 0.0913 0.272 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 -193445 sc-eQTL 5.77e-01 0.0519 0.0929 0.272 Pro_T L2
ENSG00000116641 DOCK7 485744 sc-eQTL 2.02e-01 0.119 0.093 0.272 Pro_T L2
ENSG00000125703 ATG4C 389998 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0191 0.0817 0.272 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -419591 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0579 0.0819 0.272 Pro_T L2
ENSG00000162607 USP1 737833 sc-eQTL 4.02e-01 -0.0472 0.0562 0.272 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -349242 sc-eQTL 9.83e-01 0.00207 0.0952 0.272 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 -419281 sc-eQTL 1.54e-01 0.137 0.0955 0.269 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 -193445 sc-eQTL 4.95e-01 0.07 0.103 0.269 Treg L2
ENSG00000116641 DOCK7 485744 sc-eQTL 2.15e-01 0.117 0.0939 0.269 Treg L2
ENSG00000125703 ATG4C 389998 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0202 0.0963 0.269 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -419591 sc-eQTL 2.89e-01 0.107 0.1 0.269 Treg L2
ENSG00000162607 USP1 737833 sc-eQTL 2.44e-01 0.114 0.0971 0.269 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -349242 sc-eQTL 2.22e-01 0.118 0.096 0.269 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 -419281 sc-eQTL 1.21e-01 -0.152 0.0974 0.261 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -193445 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0502 0.0994 0.261 cDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 485744 sc-eQTL 6.91e-01 0.0389 0.0975 0.261 cDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 389998 sc-eQTL 9.76e-01 0.00254 0.0847 0.261 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -419591 sc-eQTL 6.79e-01 0.0445 0.107 0.261 cDC L2
ENSG00000162607 USP1 737833 sc-eQTL 3.13e-01 0.0964 0.0953 0.261 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -349242 sc-eQTL 9.38e-01 0.00668 0.0863 0.261 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 -419281 sc-eQTL 4.78e-01 0.0642 0.0904 0.269 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 -193445 sc-eQTL 9.76e-01 0.00273 0.0906 0.269 cMono_IL1B L2
ENSG00000116641 DOCK7 485744 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0548 0.0955 0.269 cMono_IL1B L2
ENSG00000125703 ATG4C 389998 sc-eQTL 3.24e-01 -0.0663 0.067 0.269 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -419591 sc-eQTL 3.31e-01 -0.0925 0.095 0.269 cMono_IL1B L2
ENSG00000162607 USP1 737833 sc-eQTL 3.47e-02 0.177 0.0831 0.269 cMono_IL1B L2
ENSG00000240563 L1TD1 979281 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0571 0.0842 0.269 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 -419281 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0465 0.1 0.269 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 -193445 sc-eQTL 7.10e-03 -0.272 0.1 0.269 cMono_S100A L2
ENSG00000116641 DOCK7 485744 sc-eQTL 3.42e-01 0.0896 0.0941 0.269 cMono_S100A L2
ENSG00000125703 ATG4C 389998 sc-eQTL 4.21e-01 0.0658 0.0815 0.269 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -419591 sc-eQTL 4.73e-01 0.0662 0.092 0.269 cMono_S100A L2
ENSG00000162607 USP1 737833 sc-eQTL 8.91e-01 -0.013 0.0948 0.269 cMono_S100A L2
ENSG00000240563 L1TD1 979281 sc-eQTL 2.19e-01 -0.097 0.0786 0.269 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 -419281 sc-eQTL 3.70e-01 0.102 0.113 0.255 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 -193445 sc-eQTL 1.37e-01 -0.18 0.12 0.255 gdT L2
ENSG00000116641 DOCK7 485744 sc-eQTL 2.25e-01 -0.144 0.118 0.255 gdT L2
ENSG00000125703 ATG4C 389998 sc-eQTL 8.03e-01 0.0283 0.113 0.255 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -419591 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0743 0.12 0.255 gdT L2
ENSG00000162607 USP1 737833 sc-eQTL 3.48e-01 0.107 0.114 0.255 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -349242 sc-eQTL 2.00e-03 0.361 0.115 0.255 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 -419281 sc-eQTL 2.58e-01 0.116 0.102 0.262 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -193445 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00217 0.0953 0.262 intMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 485744 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0621 0.0972 0.262 intMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 389998 sc-eQTL 4.65e-01 0.0679 0.0928 0.262 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -419591 sc-eQTL 6.26e-01 0.0499 0.102 0.262 intMono L2
ENSG00000162607 USP1 737833 sc-eQTL 7.33e-02 0.186 0.103 0.262 intMono L2
ENSG00000240563 L1TD1 979281 sc-eQTL 6.72e-01 0.0324 0.0765 0.262 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -419281 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00526 0.091 0.271 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -193445 sc-eQTL 7.79e-01 0.0281 0.1 0.271 ncMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 485744 sc-eQTL 8.11e-01 0.0236 0.0984 0.271 ncMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 389998 sc-eQTL 9.40e-01 0.00688 0.0919 0.271 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -419591 sc-eQTL 6.19e-01 0.0478 0.0961 0.271 ncMono L2
ENSG00000162607 USP1 737833 sc-eQTL 4.34e-01 -0.077 0.0981 0.271 ncMono L2
ENSG00000240563 L1TD1 979281 sc-eQTL 3.84e-01 0.0606 0.0696 0.271 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -419281 sc-eQTL 3.47e-01 -0.108 0.114 0.271 pDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -193445 sc-eQTL 9.28e-01 -0.0101 0.111 0.271 pDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 485744 sc-eQTL 1.14e-01 -0.179 0.113 0.271 pDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 389998 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0645 0.102 0.271 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -419591 sc-eQTL 6.25e-01 0.056 0.115 0.271 pDC L2
ENSG00000162607 USP1 737833 sc-eQTL 2.62e-01 0.131 0.116 0.271 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -349242 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0244 0.101 0.271 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -419281 sc-eQTL 2.28e-01 0.114 0.0944 0.269 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -193445 sc-eQTL 3.18e-01 0.105 0.104 0.269 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 485744 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0153 0.0908 0.269 B_Memory LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 389998 sc-eQTL 3.87e-01 0.0636 0.0733 0.269 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -419591 sc-eQTL 3.48e-01 0.0906 0.0963 0.269 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 737833 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0169 0.0937 0.269 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -349242 sc-eQTL 9.83e-01 0.0021 0.101 0.269 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -419281 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0141 0.0996 0.269 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -193445 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0869 0.102 0.269 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 485744 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0356 0.0958 0.269 B_Naive LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 389998 sc-eQTL 4.03e-02 -0.149 0.0724 0.269 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -419591 sc-eQTL 3.00e-01 0.107 0.103 0.269 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 737833 sc-eQTL 4.10e-01 0.0731 0.0887 0.269 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -349242 sc-eQTL 7.35e-02 0.185 0.103 0.269 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -419281 sc-eQTL 9.24e-01 -0.00888 0.0928 0.269 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -193445 sc-eQTL 1.46e-01 -0.131 0.0894 0.269 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 485744 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00551 0.0905 0.269 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 389998 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0165 0.0626 0.269 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -419591 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0329 0.0925 0.269 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 737833 sc-eQTL 1.89e-01 0.104 0.0788 0.269 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000240563 L1TD1 979281 sc-eQTL 2.14e-01 -0.106 0.0854 0.269 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -419281 sc-eQTL 1.42e-01 0.129 0.0877 0.269 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -193445 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0108 0.1 0.269 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 485744 sc-eQTL 9.33e-01 -0.00836 0.099 0.269 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 389998 sc-eQTL 9.54e-01 0.00488 0.0844 0.269 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -419591 sc-eQTL 7.77e-01 0.0278 0.098 0.269 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 737833 sc-eQTL 7.69e-01 0.0271 0.0921 0.269 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000240563 L1TD1 979281 sc-eQTL 7.92e-01 0.0166 0.0628 0.269 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -419281 sc-eQTL 8.37e-01 0.0158 0.0765 0.265 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -193445 sc-eQTL 8.23e-01 0.0206 0.0919 0.265 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 485744 sc-eQTL 3.33e-01 0.0796 0.0821 0.265 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 389998 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0181 0.0821 0.265 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -419591 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0662 0.0973 0.265 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 737833 sc-eQTL 5.79e-01 0.0491 0.0883 0.265 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -349242 sc-eQTL 6.83e-01 0.0439 0.107 0.265 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000116652 DLEU2L -372952 eQTL 0.0221 -0.0679 0.0296 0.00157 0.0 0.249

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000116652 DLEU2L -372952 1.07e-06 7.46e-07 1.59e-07 4.39e-07 1.16e-07 3.15e-07 6.33e-07 2.28e-07 6.92e-07 3.12e-07 1.04e-06 5.15e-07 1.05e-06 1.56e-07 3.16e-07 3.96e-07 5.64e-07 4.4e-07 3.3e-07 2.63e-07 2.39e-07 5.34e-07 4.74e-07 3.24e-07 1.28e-06 2.41e-07 4.55e-07 3.95e-07 6.19e-07 8.48e-07 3.95e-07 4.06e-08 9.26e-08 2.06e-07 3.71e-07 2.13e-07 1.86e-07 1.21e-07 8.61e-08 8.66e-09 1.38e-07 7.45e-07 5.91e-08 1.29e-08 1.85e-07 3.92e-08 1.43e-07 3.84e-08 5.25e-08
ENSG00000230798 \N -150311 2.96e-06 2.81e-06 5.11e-07 2.01e-06 7.94e-07 7.26e-07 2.25e-06 8.47e-07 2.27e-06 1.24e-06 2.77e-06 1.63e-06 4.01e-06 1.4e-06 9.35e-07 1.98e-06 1.58e-06 2.15e-06 1.61e-06 1.28e-06 1.4e-06 3.2e-06 2.69e-06 1.62e-06 4.08e-06 1.28e-06 1.45e-06 1.79e-06 2.99e-06 2.79e-06 2.08e-06 3.8e-07 6.45e-07 1.35e-06 1.31e-06 9.62e-07 9.09e-07 3.79e-07 1.27e-06 3.46e-07 2.66e-07 4.09e-06 5.91e-07 1.8e-07 3.51e-07 3.72e-07 8.93e-07 2.02e-07 1.74e-07