logo

Genes within 1Mb (chr1:63172967:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -420444 sc-eQTL 9.53e-01 0.00573 0.0975 0.19 B L1
ENSG00000088035 ALG6 -194608 sc-eQTL 5.47e-01 -0.061 0.101 0.19 B L1
ENSG00000116641 DOCK7 484581 sc-eQTL 9.94e-01 0.000802 0.101 0.19 B L1
ENSG00000125703 ATG4C 388835 sc-eQTL 2.11e-01 0.0878 0.07 0.19 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -420754 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0235 0.112 0.19 B L1
ENSG00000162607 USP1 736670 sc-eQTL 1.85e-01 -0.129 0.0966 0.19 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -350405 sc-eQTL 3.01e-01 -0.118 0.114 0.19 B L1
ENSG00000079739 PGM1 -420444 sc-eQTL 1.35e-01 0.125 0.0832 0.19 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 -194608 sc-eQTL 7.70e-01 -0.027 0.0923 0.19 CD4T L1
ENSG00000116641 DOCK7 484581 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0739 0.0933 0.19 CD4T L1
ENSG00000125703 ATG4C 388835 sc-eQTL 8.32e-01 -0.016 0.0754 0.19 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -420754 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00118 0.107 0.19 CD4T L1
ENSG00000162607 USP1 736670 sc-eQTL 2.76e-01 -0.0797 0.073 0.19 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -350405 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0203 0.0961 0.19 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 -420444 sc-eQTL 8.51e-01 0.0173 0.0921 0.19 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 -194608 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0197 0.102 0.19 CD8T L1
ENSG00000116641 DOCK7 484581 sc-eQTL 9.71e-01 0.00381 0.103 0.19 CD8T L1
ENSG00000125703 ATG4C 388835 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0354 0.0977 0.19 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -420754 sc-eQTL 3.91e-02 -0.225 0.108 0.19 CD8T L1
ENSG00000162607 USP1 736670 sc-eQTL 7.96e-01 -0.022 0.0851 0.19 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -350405 sc-eQTL 9.15e-01 0.0117 0.109 0.19 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 -420444 sc-eQTL 3.88e-01 -0.0899 0.104 0.189 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 -194608 sc-eQTL 5.26e-01 0.0682 0.107 0.189 DC L1
ENSG00000116641 DOCK7 484581 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0381 0.11 0.189 DC L1
ENSG00000125703 ATG4C 388835 sc-eQTL 2.33e-03 -0.259 0.0841 0.189 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -420754 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0658 0.12 0.189 DC L1
ENSG00000162607 USP1 736670 sc-eQTL 3.37e-03 -0.305 0.103 0.189 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -350405 sc-eQTL 3.17e-01 0.105 0.105 0.189 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 -420444 sc-eQTL 1.44e-01 -0.146 0.0996 0.19 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 -194608 sc-eQTL 3.27e-01 0.102 0.104 0.19 Mono L1
ENSG00000116641 DOCK7 484581 sc-eQTL 7.20e-03 -0.27 0.0993 0.19 Mono L1
ENSG00000125703 ATG4C 388835 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00158 0.0683 0.19 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -420754 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0149 0.108 0.19 Mono L1
ENSG00000162607 USP1 736670 sc-eQTL 9.76e-01 0.00272 0.0886 0.19 Mono L1
ENSG00000240563 L1TD1 978118 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0553 0.0826 0.19 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 -420444 sc-eQTL 3.33e-01 -0.0829 0.0853 0.191 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 -194608 sc-eQTL 2.43e-01 -0.117 0.1 0.191 NK L1
ENSG00000116641 DOCK7 484581 sc-eQTL 5.90e-01 0.0446 0.0825 0.191 NK L1
ENSG00000125703 ATG4C 388835 sc-eQTL 3.30e-01 0.0864 0.0885 0.191 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -420754 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00854 0.11 0.191 NK L1
ENSG00000162607 USP1 736670 sc-eQTL 1.34e-01 -0.147 0.098 0.191 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -350405 sc-eQTL 1.97e-01 -0.154 0.119 0.191 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 -420444 sc-eQTL 7.78e-01 0.0279 0.0991 0.19 Other_T L1
ENSG00000088035 ALG6 -194608 sc-eQTL 1.35e-01 0.148 0.099 0.19 Other_T L1
ENSG00000116641 DOCK7 484581 sc-eQTL 6.28e-01 0.0493 0.102 0.19 Other_T L1
ENSG00000125703 ATG4C 388835 sc-eQTL 2.81e-01 0.0949 0.0877 0.19 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -420754 sc-eQTL 9.93e-01 0.000732 0.078 0.19 Other_T L1
ENSG00000162607 USP1 736670 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0164 0.0676 0.19 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -350405 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00804 0.12 0.19 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -420444 sc-eQTL 9.53e-01 0.00778 0.132 0.184 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 -194608 sc-eQTL 3.03e-01 -0.13 0.126 0.184 B_Activated L2
ENSG00000116641 DOCK7 484581 sc-eQTL 9.33e-01 -0.00998 0.118 0.184 B_Activated L2
ENSG00000125703 ATG4C 388835 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000484 0.124 0.184 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -420754 sc-eQTL 1.00e-02 -0.309 0.119 0.184 B_Activated L2
ENSG00000162607 USP1 736670 sc-eQTL 2.42e-01 -0.153 0.131 0.184 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -350405 sc-eQTL 2.72e-01 -0.126 0.114 0.184 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 -420444 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0253 0.117 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 -194608 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0132 0.119 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000116641 DOCK7 484581 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0462 0.114 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000125703 ATG4C 388835 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0562 0.0963 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -420754 sc-eQTL 5.12e-01 0.0754 0.115 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000162607 USP1 736670 sc-eQTL 1.40e-01 -0.169 0.114 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -350405 sc-eQTL 6.93e-01 -0.045 0.114 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 -420444 sc-eQTL 1.08e-01 0.187 0.116 0.192 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 -194608 sc-eQTL 5.53e-02 0.226 0.117 0.192 B_Memory L2
ENSG00000116641 DOCK7 484581 sc-eQTL 1.39e-01 0.164 0.111 0.192 B_Memory L2
ENSG00000125703 ATG4C 388835 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0283 0.106 0.192 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -420754 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0753 0.121 0.192 B_Memory L2
ENSG00000162607 USP1 736670 sc-eQTL 9.21e-01 0.0121 0.122 0.192 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -350405 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0396 0.12 0.192 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 -420444 sc-eQTL 8.76e-01 0.018 0.115 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 -194608 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0526 0.116 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000116641 DOCK7 484581 sc-eQTL 1.89e-01 -0.146 0.11 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000125703 ATG4C 388835 sc-eQTL 7.21e-01 0.0306 0.0854 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -420754 sc-eQTL 4.07e-01 -0.0941 0.113 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000162607 USP1 736670 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0184 0.0997 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -350405 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0241 0.121 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 -420444 sc-eQTL 6.61e-01 0.05 0.114 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 -194608 sc-eQTL 1.43e-01 -0.174 0.118 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000116641 DOCK7 484581 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0716 0.114 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000125703 ATG4C 388835 sc-eQTL 7.17e-01 0.0399 0.11 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -420754 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0162 0.119 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000162607 USP1 736670 sc-eQTL 2.92e-01 -0.12 0.113 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -350405 sc-eQTL 6.57e-01 0.0527 0.119 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 -420444 sc-eQTL 6.01e-01 0.0613 0.117 0.184 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -194608 sc-eQTL 6.08e-01 0.0636 0.124 0.184 CD4_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 484581 sc-eQTL 3.78e-01 -0.0954 0.108 0.184 CD4_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 388835 sc-eQTL 6.83e-02 -0.204 0.111 0.184 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -420754 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0716 0.12 0.184 CD4_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 736670 sc-eQTL 2.17e-01 -0.141 0.114 0.184 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -350405 sc-eQTL 2.11e-01 -0.142 0.113 0.184 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -420444 sc-eQTL 3.20e-01 0.094 0.0943 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -194608 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0462 0.103 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 484581 sc-eQTL 7.89e-01 -0.027 0.101 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 388835 sc-eQTL 9.46e-01 0.00609 0.0892 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -420754 sc-eQTL 9.95e-01 0.000751 0.109 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 736670 sc-eQTL 9.26e-01 -0.00777 0.0833 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -350405 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0309 0.108 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -420444 sc-eQTL 1.43e-02 0.237 0.0958 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -194608 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0204 0.113 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 484581 sc-eQTL 1.18e-01 -0.156 0.0994 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 388835 sc-eQTL 3.41e-01 -0.0927 0.0972 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -420754 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0336 0.115 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 736670 sc-eQTL 2.35e-01 -0.112 0.0938 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -350405 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0523 0.111 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -420444 sc-eQTL 2.42e-01 -0.135 0.115 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -194608 sc-eQTL 5.85e-02 0.219 0.115 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 484581 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0179 0.113 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 388835 sc-eQTL 7.56e-02 0.195 0.109 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -420754 sc-eQTL 9.83e-01 -0.0024 0.114 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 736670 sc-eQTL 3.70e-01 -0.0965 0.107 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -350405 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0192 0.118 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -420444 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0682 0.105 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -194608 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0211 0.112 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 484581 sc-eQTL 4.11e-01 0.0875 0.106 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 388835 sc-eQTL 2.98e-01 -0.118 0.113 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -420754 sc-eQTL 3.26e-01 -0.116 0.117 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 736670 sc-eQTL 9.84e-01 -0.0021 0.105 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -350405 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00692 0.121 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -420444 sc-eQTL 5.29e-01 0.0679 0.108 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -194608 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00185 0.112 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 484581 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0513 0.115 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 388835 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0122 0.111 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -420754 sc-eQTL 9.25e-02 -0.188 0.111 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 736670 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0262 0.0948 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -350405 sc-eQTL 2.89e-01 -0.112 0.105 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -420444 sc-eQTL 2.23e-01 -0.147 0.12 0.19 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -194608 sc-eQTL 6.18e-01 -0.061 0.122 0.19 CD8_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 484581 sc-eQTL 3.05e-01 0.122 0.119 0.19 CD8_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 388835 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0788 0.122 0.19 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -420754 sc-eQTL 8.27e-02 -0.205 0.117 0.19 CD8_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 736670 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0443 0.114 0.19 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -350405 sc-eQTL 8.56e-01 -0.022 0.121 0.19 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -420444 sc-eQTL 2.33e-01 0.143 0.119 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -194608 sc-eQTL 8.86e-01 0.0172 0.12 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 484581 sc-eQTL 8.99e-01 0.0148 0.116 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 388835 sc-eQTL 3.99e-01 0.0945 0.112 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -420754 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0435 0.121 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 736670 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0518 0.115 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -350405 sc-eQTL 1.91e-01 0.154 0.117 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -420444 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0194 0.115 0.186 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 -194608 sc-eQTL 4.96e-03 0.317 0.112 0.186 MAIT L2
ENSG00000116641 DOCK7 484581 sc-eQTL 4.60e-01 0.0805 0.109 0.186 MAIT L2
ENSG00000125703 ATG4C 388835 sc-eQTL 2.09e-01 0.144 0.115 0.186 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -420754 sc-eQTL 7.28e-01 -0.04 0.115 0.186 MAIT L2
ENSG00000162607 USP1 736670 sc-eQTL 4.60e-01 0.0844 0.114 0.186 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -350405 sc-eQTL 2.80e-01 0.128 0.118 0.186 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 -420444 sc-eQTL 3.75e-01 0.0992 0.112 0.196 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 -194608 sc-eQTL 2.55e-01 -0.131 0.114 0.196 NK_CD56bright L2
ENSG00000116641 DOCK7 484581 sc-eQTL 9.37e-02 0.166 0.0987 0.196 NK_CD56bright L2
ENSG00000125703 ATG4C 388835 sc-eQTL 3.71e-01 0.0994 0.111 0.196 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -420754 sc-eQTL 1.83e-02 -0.271 0.114 0.196 NK_CD56bright L2
ENSG00000162607 USP1 736670 sc-eQTL 1.14e-01 -0.188 0.119 0.196 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -350405 sc-eQTL 8.20e-01 -0.026 0.114 0.196 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 -420444 sc-eQTL 3.89e-01 -0.0765 0.0885 0.192 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 -194608 sc-eQTL 2.81e-01 -0.121 0.112 0.192 NK_CD56dim L2
ENSG00000116641 DOCK7 484581 sc-eQTL 9.05e-01 0.0117 0.0979 0.192 NK_CD56dim L2
ENSG00000125703 ATG4C 388835 sc-eQTL 3.31e-01 0.0967 0.0992 0.192 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -420754 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0358 0.113 0.192 NK_CD56dim L2
ENSG00000162607 USP1 736670 sc-eQTL 5.78e-01 -0.061 0.11 0.192 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -350405 sc-eQTL 4.67e-02 -0.242 0.121 0.192 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 -420444 sc-eQTL 1.38e-01 -0.177 0.119 0.196 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 -194608 sc-eQTL 6.09e-01 0.0633 0.124 0.196 NK_HLA L2
ENSG00000116641 DOCK7 484581 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0126 0.0946 0.196 NK_HLA L2
ENSG00000125703 ATG4C 388835 sc-eQTL 9.95e-01 0.00075 0.11 0.196 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -420754 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0388 0.116 0.196 NK_HLA L2
ENSG00000162607 USP1 736670 sc-eQTL 1.19e-01 0.188 0.12 0.196 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -350405 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0517 0.11 0.196 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 -420444 sc-eQTL 5.53e-01 0.0577 0.097 0.192 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 -194608 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0156 0.11 0.192 NK_cytokine L2
ENSG00000116641 DOCK7 484581 sc-eQTL 6.04e-01 0.0528 0.102 0.192 NK_cytokine L2
ENSG00000125703 ATG4C 388835 sc-eQTL 6.42e-01 0.0485 0.104 0.192 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -420754 sc-eQTL 6.99e-01 0.0417 0.108 0.192 NK_cytokine L2
ENSG00000162607 USP1 736670 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0563 0.113 0.192 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -350405 sc-eQTL 9.36e-01 -0.00922 0.115 0.192 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 -420444 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0194 0.131 0.196 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 -194608 sc-eQTL 8.34e-02 0.236 0.135 0.196 PB L2
ENSG00000116641 DOCK7 484581 sc-eQTL 8.92e-01 -0.02 0.147 0.196 PB L2
ENSG00000125703 ATG4C 388835 sc-eQTL 1.43e-01 0.187 0.127 0.196 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -420754 sc-eQTL 7.24e-01 0.0452 0.128 0.196 PB L2
ENSG00000162607 USP1 736670 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0443 0.127 0.196 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -350405 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0731 0.14 0.196 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 -420444 sc-eQTL 6.50e-01 0.0481 0.106 0.189 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 -194608 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0671 0.108 0.189 Pro_T L2
ENSG00000116641 DOCK7 484581 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0843 0.108 0.189 Pro_T L2
ENSG00000125703 ATG4C 388835 sc-eQTL 9.88e-01 0.00139 0.0948 0.189 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -420754 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0221 0.0951 0.189 Pro_T L2
ENSG00000162607 USP1 736670 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0292 0.0653 0.189 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -350405 sc-eQTL 8.90e-01 0.0153 0.11 0.189 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 -420444 sc-eQTL 9.71e-01 0.00409 0.112 0.19 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 -194608 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0924 0.119 0.19 Treg L2
ENSG00000116641 DOCK7 484581 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0147 0.11 0.19 Treg L2
ENSG00000125703 ATG4C 388835 sc-eQTL 2.58e-01 0.127 0.112 0.19 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -420754 sc-eQTL 6.45e-01 0.054 0.117 0.19 Treg L2
ENSG00000162607 USP1 736670 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0919 0.113 0.19 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -350405 sc-eQTL 5.33e-01 -0.07 0.112 0.19 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 -420444 sc-eQTL 9.80e-01 0.00293 0.114 0.185 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -194608 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0471 0.116 0.185 cDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 484581 sc-eQTL 1.56e-01 -0.162 0.113 0.185 cDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 388835 sc-eQTL 1.01e-01 -0.162 0.0982 0.185 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -420754 sc-eQTL 4.32e-01 0.0987 0.125 0.185 cDC L2
ENSG00000162607 USP1 736670 sc-eQTL 2.93e-01 -0.117 0.111 0.185 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -350405 sc-eQTL 5.56e-01 0.0594 0.101 0.185 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 -420444 sc-eQTL 2.78e-01 -0.113 0.104 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 -194608 sc-eQTL 8.98e-01 0.0134 0.104 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000116641 DOCK7 484581 sc-eQTL 2.57e-01 -0.125 0.11 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000125703 ATG4C 388835 sc-eQTL 2.20e-01 0.0949 0.0771 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -420754 sc-eQTL 6.78e-01 0.0456 0.11 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000162607 USP1 736670 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0358 0.0967 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000240563 L1TD1 978118 sc-eQTL 3.77e-01 -0.0859 0.097 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 -420444 sc-eQTL 2.61e-01 -0.131 0.116 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 -194608 sc-eQTL 5.54e-01 0.0698 0.118 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000116641 DOCK7 484581 sc-eQTL 9.96e-02 -0.18 0.109 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000125703 ATG4C 388835 sc-eQTL 8.33e-02 -0.163 0.0939 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -420754 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0825 0.107 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000162607 USP1 736670 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0721 0.11 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000240563 L1TD1 978118 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0593 0.0913 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 -420444 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0655 0.128 0.194 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 -194608 sc-eQTL 3.34e-01 0.132 0.136 0.194 gdT L2
ENSG00000116641 DOCK7 484581 sc-eQTL 9.83e-01 0.00293 0.134 0.194 gdT L2
ENSG00000125703 ATG4C 388835 sc-eQTL 9.29e-01 -0.0113 0.128 0.194 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -420754 sc-eQTL 2.96e-01 0.142 0.135 0.194 gdT L2
ENSG00000162607 USP1 736670 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0698 0.128 0.194 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -350405 sc-eQTL 1.59e-03 -0.415 0.129 0.194 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 -420444 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0799 0.119 0.191 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -194608 sc-eQTL 9.26e-01 -0.0103 0.111 0.191 intMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 484581 sc-eQTL 5.96e-01 -0.06 0.113 0.191 intMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 388835 sc-eQTL 7.74e-01 -0.031 0.108 0.191 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -420754 sc-eQTL 1.84e-01 -0.158 0.118 0.191 intMono L2
ENSG00000162607 USP1 736670 sc-eQTL 1.03e-01 -0.197 0.12 0.191 intMono L2
ENSG00000240563 L1TD1 978118 sc-eQTL 2.00e-01 0.114 0.0886 0.191 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -420444 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0349 0.105 0.192 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -194608 sc-eQTL 8.97e-02 0.195 0.115 0.192 ncMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 484581 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0895 0.113 0.192 ncMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 388835 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0513 0.106 0.192 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -420754 sc-eQTL 4.00e-01 -0.0934 0.111 0.192 ncMono L2
ENSG00000162607 USP1 736670 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000203 0.113 0.192 ncMono L2
ENSG00000240563 L1TD1 978118 sc-eQTL 9.08e-01 -0.00935 0.0804 0.192 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -420444 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0386 0.138 0.169 pDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -194608 sc-eQTL 2.90e-01 0.142 0.134 0.169 pDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 484581 sc-eQTL 5.97e-01 0.0726 0.137 0.169 pDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 388835 sc-eQTL 1.16e-01 -0.193 0.122 0.169 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -420754 sc-eQTL 6.61e-01 0.0606 0.138 0.169 pDC L2
ENSG00000162607 USP1 736670 sc-eQTL 5.59e-02 -0.268 0.139 0.169 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -350405 sc-eQTL 6.79e-01 0.0507 0.122 0.169 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -420444 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0239 0.11 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -194608 sc-eQTL 6.93e-01 0.048 0.121 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 484581 sc-eQTL 5.31e-01 0.066 0.105 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 388835 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00626 0.0851 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -420754 sc-eQTL 5.92e-01 -0.06 0.112 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 736670 sc-eQTL 2.53e-01 -0.124 0.108 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -350405 sc-eQTL 3.86e-01 -0.101 0.116 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -420444 sc-eQTL 8.35e-01 0.0237 0.113 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -194608 sc-eQTL 2.34e-01 -0.139 0.116 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 484581 sc-eQTL 2.21e-01 -0.133 0.109 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 388835 sc-eQTL 7.10e-01 0.031 0.0832 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -420754 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0475 0.118 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 736670 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0501 0.101 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -350405 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0268 0.118 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -420444 sc-eQTL 1.96e-01 -0.138 0.106 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -194608 sc-eQTL 5.54e-01 0.0612 0.103 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 484581 sc-eQTL 9.93e-02 -0.171 0.103 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 388835 sc-eQTL 9.08e-01 -0.00829 0.0719 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -420754 sc-eQTL 8.41e-01 0.0214 0.106 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 736670 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0435 0.0908 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000240563 L1TD1 978118 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0647 0.0984 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -420444 sc-eQTL 7.22e-01 -0.036 0.101 0.192 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -194608 sc-eQTL 5.97e-01 0.0608 0.115 0.192 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 484581 sc-eQTL 2.33e-01 -0.136 0.113 0.192 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 388835 sc-eQTL 3.77e-01 -0.0856 0.0967 0.192 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -420754 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0917 0.112 0.192 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 736670 sc-eQTL 7.98e-01 0.0271 0.106 0.192 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000240563 L1TD1 978118 sc-eQTL 8.73e-01 0.0116 0.0721 0.192 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -420444 sc-eQTL 2.78e-01 -0.094 0.0865 0.192 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -194608 sc-eQTL 3.82e-01 -0.0911 0.104 0.192 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 484581 sc-eQTL 9.17e-01 -0.00968 0.0933 0.192 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 388835 sc-eQTL 2.53e-01 0.106 0.0928 0.192 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -420754 sc-eQTL 8.19e-01 0.0254 0.11 0.192 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 736670 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0519 0.1 0.192 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -350405 sc-eQTL 8.92e-02 -0.207 0.121 0.192 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079739 PGM1 -420444 eQTL 0.0124 0.0589 0.0235 0.0 0.0 0.173

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000079739 PGM1 -420444 8.85e-07 6.09e-07 1.46e-07 3.95e-07 9.93e-08 2.42e-07 5.82e-07 1.73e-07 5.3e-07 2.8e-07 8.08e-07 4.28e-07 8.34e-07 1.52e-07 2.96e-07 2.85e-07 4.29e-07 4.22e-07 2.65e-07 1.9e-07 2.48e-07 4.38e-07 3.87e-07 2.29e-07 8.62e-07 2.71e-07 3.68e-07 2.98e-07 4.63e-07 6.47e-07 3.32e-07 5.88e-08 4.92e-08 1.69e-07 3.38e-07 1.48e-07 8.43e-08 1.07e-07 6.49e-08 1.57e-08 1.15e-07 5.79e-07 4.59e-08 1.1e-08 1.96e-07 1.5e-08 1.08e-07 2.48e-08 6.32e-08
ENSG00000230798 \N -151474 3.24e-06 3.09e-06 5.8e-07 1.99e-06 8.48e-07 7.6e-07 2.47e-06 9.82e-07 2.35e-06 1.4e-06 3e-06 1.74e-06 4.11e-06 1.38e-06 8.74e-07 2.03e-06 1.64e-06 2.17e-06 1.54e-06 1.22e-06 1.67e-06 3.37e-06 3.09e-06 1.8e-06 4.06e-06 1.21e-06 1.57e-06 1.74e-06 3.52e-06 2.75e-06 2.02e-06 4.71e-07 7.33e-07 1.45e-06 1.62e-06 9.52e-07 9.07e-07 4.49e-07 1.26e-06 3.82e-07 4.52e-07 4.08e-06 5.97e-07 1.81e-07 3.7e-07 3.31e-07 8.3e-07 2.23e-07 2.87e-07