logo

Genes within 1Mb (chr1:63165127:G:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -428284 sc-eQTL 9.53e-01 0.00573 0.0975 0.19 B L1
ENSG00000088035 ALG6 -202448 sc-eQTL 5.47e-01 -0.061 0.101 0.19 B L1
ENSG00000116641 DOCK7 476741 sc-eQTL 9.94e-01 0.000802 0.101 0.19 B L1
ENSG00000125703 ATG4C 380995 sc-eQTL 2.11e-01 0.0878 0.07 0.19 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -428594 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0235 0.112 0.19 B L1
ENSG00000162607 USP1 728830 sc-eQTL 1.85e-01 -0.129 0.0966 0.19 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -358245 sc-eQTL 3.01e-01 -0.118 0.114 0.19 B L1
ENSG00000079739 PGM1 -428284 sc-eQTL 1.35e-01 0.125 0.0832 0.19 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 -202448 sc-eQTL 7.70e-01 -0.027 0.0923 0.19 CD4T L1
ENSG00000116641 DOCK7 476741 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0739 0.0933 0.19 CD4T L1
ENSG00000125703 ATG4C 380995 sc-eQTL 8.32e-01 -0.016 0.0754 0.19 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -428594 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00118 0.107 0.19 CD4T L1
ENSG00000162607 USP1 728830 sc-eQTL 2.76e-01 -0.0797 0.073 0.19 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -358245 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0203 0.0961 0.19 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 -428284 sc-eQTL 8.51e-01 0.0173 0.0921 0.19 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 -202448 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0197 0.102 0.19 CD8T L1
ENSG00000116641 DOCK7 476741 sc-eQTL 9.71e-01 0.00381 0.103 0.19 CD8T L1
ENSG00000125703 ATG4C 380995 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0354 0.0977 0.19 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -428594 sc-eQTL 3.91e-02 -0.225 0.108 0.19 CD8T L1
ENSG00000162607 USP1 728830 sc-eQTL 7.96e-01 -0.022 0.0851 0.19 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -358245 sc-eQTL 9.15e-01 0.0117 0.109 0.19 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 -428284 sc-eQTL 3.88e-01 -0.0899 0.104 0.189 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 -202448 sc-eQTL 5.26e-01 0.0682 0.107 0.189 DC L1
ENSG00000116641 DOCK7 476741 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0381 0.11 0.189 DC L1
ENSG00000125703 ATG4C 380995 sc-eQTL 2.33e-03 -0.259 0.0841 0.189 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -428594 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0658 0.12 0.189 DC L1
ENSG00000162607 USP1 728830 sc-eQTL 3.37e-03 -0.305 0.103 0.189 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -358245 sc-eQTL 3.17e-01 0.105 0.105 0.189 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 -428284 sc-eQTL 1.44e-01 -0.146 0.0996 0.19 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 -202448 sc-eQTL 3.27e-01 0.102 0.104 0.19 Mono L1
ENSG00000116641 DOCK7 476741 sc-eQTL 7.20e-03 -0.27 0.0993 0.19 Mono L1
ENSG00000125703 ATG4C 380995 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00158 0.0683 0.19 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -428594 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0149 0.108 0.19 Mono L1
ENSG00000162607 USP1 728830 sc-eQTL 9.76e-01 0.00272 0.0886 0.19 Mono L1
ENSG00000240563 L1TD1 970278 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0553 0.0826 0.19 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 -428284 sc-eQTL 3.33e-01 -0.0829 0.0853 0.191 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 -202448 sc-eQTL 2.43e-01 -0.117 0.1 0.191 NK L1
ENSG00000116641 DOCK7 476741 sc-eQTL 5.90e-01 0.0446 0.0825 0.191 NK L1
ENSG00000125703 ATG4C 380995 sc-eQTL 3.30e-01 0.0864 0.0885 0.191 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -428594 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00854 0.11 0.191 NK L1
ENSG00000162607 USP1 728830 sc-eQTL 1.34e-01 -0.147 0.098 0.191 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -358245 sc-eQTL 1.97e-01 -0.154 0.119 0.191 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 -428284 sc-eQTL 7.78e-01 0.0279 0.0991 0.19 Other_T L1
ENSG00000088035 ALG6 -202448 sc-eQTL 1.35e-01 0.148 0.099 0.19 Other_T L1
ENSG00000116641 DOCK7 476741 sc-eQTL 6.28e-01 0.0493 0.102 0.19 Other_T L1
ENSG00000125703 ATG4C 380995 sc-eQTL 2.81e-01 0.0949 0.0877 0.19 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -428594 sc-eQTL 9.93e-01 0.000732 0.078 0.19 Other_T L1
ENSG00000162607 USP1 728830 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0164 0.0676 0.19 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -358245 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00804 0.12 0.19 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -428284 sc-eQTL 9.53e-01 0.00778 0.132 0.184 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 -202448 sc-eQTL 3.03e-01 -0.13 0.126 0.184 B_Activated L2
ENSG00000116641 DOCK7 476741 sc-eQTL 9.33e-01 -0.00998 0.118 0.184 B_Activated L2
ENSG00000125703 ATG4C 380995 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000484 0.124 0.184 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -428594 sc-eQTL 1.00e-02 -0.309 0.119 0.184 B_Activated L2
ENSG00000162607 USP1 728830 sc-eQTL 2.42e-01 -0.153 0.131 0.184 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -358245 sc-eQTL 2.72e-01 -0.126 0.114 0.184 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 -428284 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0253 0.117 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 -202448 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0132 0.119 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000116641 DOCK7 476741 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0462 0.114 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000125703 ATG4C 380995 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0562 0.0963 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -428594 sc-eQTL 5.12e-01 0.0754 0.115 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000162607 USP1 728830 sc-eQTL 1.40e-01 -0.169 0.114 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -358245 sc-eQTL 6.93e-01 -0.045 0.114 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 -428284 sc-eQTL 1.08e-01 0.187 0.116 0.192 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 -202448 sc-eQTL 5.53e-02 0.226 0.117 0.192 B_Memory L2
ENSG00000116641 DOCK7 476741 sc-eQTL 1.39e-01 0.164 0.111 0.192 B_Memory L2
ENSG00000125703 ATG4C 380995 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0283 0.106 0.192 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -428594 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0753 0.121 0.192 B_Memory L2
ENSG00000162607 USP1 728830 sc-eQTL 9.21e-01 0.0121 0.122 0.192 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -358245 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0396 0.12 0.192 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 -428284 sc-eQTL 8.76e-01 0.018 0.115 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 -202448 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0526 0.116 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000116641 DOCK7 476741 sc-eQTL 1.89e-01 -0.146 0.11 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000125703 ATG4C 380995 sc-eQTL 7.21e-01 0.0306 0.0854 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -428594 sc-eQTL 4.07e-01 -0.0941 0.113 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000162607 USP1 728830 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0184 0.0997 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -358245 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0241 0.121 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 -428284 sc-eQTL 6.61e-01 0.05 0.114 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 -202448 sc-eQTL 1.43e-01 -0.174 0.118 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000116641 DOCK7 476741 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0716 0.114 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000125703 ATG4C 380995 sc-eQTL 7.17e-01 0.0399 0.11 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -428594 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0162 0.119 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000162607 USP1 728830 sc-eQTL 2.92e-01 -0.12 0.113 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -358245 sc-eQTL 6.57e-01 0.0527 0.119 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 -428284 sc-eQTL 6.01e-01 0.0613 0.117 0.184 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -202448 sc-eQTL 6.08e-01 0.0636 0.124 0.184 CD4_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 476741 sc-eQTL 3.78e-01 -0.0954 0.108 0.184 CD4_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 380995 sc-eQTL 6.83e-02 -0.204 0.111 0.184 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -428594 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0716 0.12 0.184 CD4_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 728830 sc-eQTL 2.17e-01 -0.141 0.114 0.184 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -358245 sc-eQTL 2.11e-01 -0.142 0.113 0.184 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -428284 sc-eQTL 3.20e-01 0.094 0.0943 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -202448 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0462 0.103 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 476741 sc-eQTL 7.89e-01 -0.027 0.101 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 380995 sc-eQTL 9.46e-01 0.00609 0.0892 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -428594 sc-eQTL 9.95e-01 0.000751 0.109 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 728830 sc-eQTL 9.26e-01 -0.00777 0.0833 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -358245 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0309 0.108 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -428284 sc-eQTL 1.43e-02 0.237 0.0958 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -202448 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0204 0.113 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 476741 sc-eQTL 1.18e-01 -0.156 0.0994 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 380995 sc-eQTL 3.41e-01 -0.0927 0.0972 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -428594 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0336 0.115 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 728830 sc-eQTL 2.35e-01 -0.112 0.0938 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -358245 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0523 0.111 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -428284 sc-eQTL 2.42e-01 -0.135 0.115 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -202448 sc-eQTL 5.85e-02 0.219 0.115 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 476741 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0179 0.113 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 380995 sc-eQTL 7.56e-02 0.195 0.109 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -428594 sc-eQTL 9.83e-01 -0.0024 0.114 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 728830 sc-eQTL 3.70e-01 -0.0965 0.107 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -358245 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0192 0.118 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -428284 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0682 0.105 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -202448 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0211 0.112 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 476741 sc-eQTL 4.11e-01 0.0875 0.106 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 380995 sc-eQTL 2.98e-01 -0.118 0.113 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -428594 sc-eQTL 3.26e-01 -0.116 0.117 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 728830 sc-eQTL 9.84e-01 -0.0021 0.105 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -358245 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00692 0.121 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -428284 sc-eQTL 5.29e-01 0.0679 0.108 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -202448 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00185 0.112 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 476741 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0513 0.115 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 380995 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0122 0.111 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -428594 sc-eQTL 9.25e-02 -0.188 0.111 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 728830 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0262 0.0948 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -358245 sc-eQTL 2.89e-01 -0.112 0.105 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -428284 sc-eQTL 2.23e-01 -0.147 0.12 0.19 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -202448 sc-eQTL 6.18e-01 -0.061 0.122 0.19 CD8_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 476741 sc-eQTL 3.05e-01 0.122 0.119 0.19 CD8_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 380995 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0788 0.122 0.19 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -428594 sc-eQTL 8.27e-02 -0.205 0.117 0.19 CD8_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 728830 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0443 0.114 0.19 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -358245 sc-eQTL 8.56e-01 -0.022 0.121 0.19 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -428284 sc-eQTL 2.33e-01 0.143 0.119 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -202448 sc-eQTL 8.86e-01 0.0172 0.12 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 476741 sc-eQTL 8.99e-01 0.0148 0.116 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 380995 sc-eQTL 3.99e-01 0.0945 0.112 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -428594 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0435 0.121 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 728830 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0518 0.115 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -358245 sc-eQTL 1.91e-01 0.154 0.117 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -428284 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0194 0.115 0.186 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 -202448 sc-eQTL 4.96e-03 0.317 0.112 0.186 MAIT L2
ENSG00000116641 DOCK7 476741 sc-eQTL 4.60e-01 0.0805 0.109 0.186 MAIT L2
ENSG00000125703 ATG4C 380995 sc-eQTL 2.09e-01 0.144 0.115 0.186 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -428594 sc-eQTL 7.28e-01 -0.04 0.115 0.186 MAIT L2
ENSG00000162607 USP1 728830 sc-eQTL 4.60e-01 0.0844 0.114 0.186 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -358245 sc-eQTL 2.80e-01 0.128 0.118 0.186 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 -428284 sc-eQTL 3.75e-01 0.0992 0.112 0.196 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 -202448 sc-eQTL 2.55e-01 -0.131 0.114 0.196 NK_CD56bright L2
ENSG00000116641 DOCK7 476741 sc-eQTL 9.37e-02 0.166 0.0987 0.196 NK_CD56bright L2
ENSG00000125703 ATG4C 380995 sc-eQTL 3.71e-01 0.0994 0.111 0.196 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -428594 sc-eQTL 1.83e-02 -0.271 0.114 0.196 NK_CD56bright L2
ENSG00000162607 USP1 728830 sc-eQTL 1.14e-01 -0.188 0.119 0.196 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -358245 sc-eQTL 8.20e-01 -0.026 0.114 0.196 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 -428284 sc-eQTL 3.89e-01 -0.0765 0.0885 0.192 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 -202448 sc-eQTL 2.81e-01 -0.121 0.112 0.192 NK_CD56dim L2
ENSG00000116641 DOCK7 476741 sc-eQTL 9.05e-01 0.0117 0.0979 0.192 NK_CD56dim L2
ENSG00000125703 ATG4C 380995 sc-eQTL 3.31e-01 0.0967 0.0992 0.192 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -428594 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0358 0.113 0.192 NK_CD56dim L2
ENSG00000162607 USP1 728830 sc-eQTL 5.78e-01 -0.061 0.11 0.192 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -358245 sc-eQTL 4.67e-02 -0.242 0.121 0.192 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 -428284 sc-eQTL 1.38e-01 -0.177 0.119 0.196 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 -202448 sc-eQTL 6.09e-01 0.0633 0.124 0.196 NK_HLA L2
ENSG00000116641 DOCK7 476741 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0126 0.0946 0.196 NK_HLA L2
ENSG00000125703 ATG4C 380995 sc-eQTL 9.95e-01 0.00075 0.11 0.196 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -428594 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0388 0.116 0.196 NK_HLA L2
ENSG00000162607 USP1 728830 sc-eQTL 1.19e-01 0.188 0.12 0.196 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -358245 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0517 0.11 0.196 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 -428284 sc-eQTL 5.53e-01 0.0577 0.097 0.192 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 -202448 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0156 0.11 0.192 NK_cytokine L2
ENSG00000116641 DOCK7 476741 sc-eQTL 6.04e-01 0.0528 0.102 0.192 NK_cytokine L2
ENSG00000125703 ATG4C 380995 sc-eQTL 6.42e-01 0.0485 0.104 0.192 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -428594 sc-eQTL 6.99e-01 0.0417 0.108 0.192 NK_cytokine L2
ENSG00000162607 USP1 728830 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0563 0.113 0.192 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -358245 sc-eQTL 9.36e-01 -0.00922 0.115 0.192 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 -428284 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0194 0.131 0.196 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 -202448 sc-eQTL 8.34e-02 0.236 0.135 0.196 PB L2
ENSG00000116641 DOCK7 476741 sc-eQTL 8.92e-01 -0.02 0.147 0.196 PB L2
ENSG00000125703 ATG4C 380995 sc-eQTL 1.43e-01 0.187 0.127 0.196 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -428594 sc-eQTL 7.24e-01 0.0452 0.128 0.196 PB L2
ENSG00000162607 USP1 728830 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0443 0.127 0.196 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -358245 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0731 0.14 0.196 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 -428284 sc-eQTL 6.50e-01 0.0481 0.106 0.189 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 -202448 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0671 0.108 0.189 Pro_T L2
ENSG00000116641 DOCK7 476741 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0843 0.108 0.189 Pro_T L2
ENSG00000125703 ATG4C 380995 sc-eQTL 9.88e-01 0.00139 0.0948 0.189 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -428594 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0221 0.0951 0.189 Pro_T L2
ENSG00000162607 USP1 728830 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0292 0.0653 0.189 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -358245 sc-eQTL 8.90e-01 0.0153 0.11 0.189 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 -428284 sc-eQTL 9.71e-01 0.00409 0.112 0.19 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 -202448 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0924 0.119 0.19 Treg L2
ENSG00000116641 DOCK7 476741 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0147 0.11 0.19 Treg L2
ENSG00000125703 ATG4C 380995 sc-eQTL 2.58e-01 0.127 0.112 0.19 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -428594 sc-eQTL 6.45e-01 0.054 0.117 0.19 Treg L2
ENSG00000162607 USP1 728830 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0919 0.113 0.19 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -358245 sc-eQTL 5.33e-01 -0.07 0.112 0.19 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 -428284 sc-eQTL 9.80e-01 0.00293 0.114 0.185 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -202448 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0471 0.116 0.185 cDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 476741 sc-eQTL 1.56e-01 -0.162 0.113 0.185 cDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 380995 sc-eQTL 1.01e-01 -0.162 0.0982 0.185 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -428594 sc-eQTL 4.32e-01 0.0987 0.125 0.185 cDC L2
ENSG00000162607 USP1 728830 sc-eQTL 2.93e-01 -0.117 0.111 0.185 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -358245 sc-eQTL 5.56e-01 0.0594 0.101 0.185 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 -428284 sc-eQTL 2.78e-01 -0.113 0.104 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 -202448 sc-eQTL 8.98e-01 0.0134 0.104 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000116641 DOCK7 476741 sc-eQTL 2.57e-01 -0.125 0.11 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000125703 ATG4C 380995 sc-eQTL 2.20e-01 0.0949 0.0771 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -428594 sc-eQTL 6.78e-01 0.0456 0.11 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000162607 USP1 728830 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0358 0.0967 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000240563 L1TD1 970278 sc-eQTL 3.77e-01 -0.0859 0.097 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 -428284 sc-eQTL 2.61e-01 -0.131 0.116 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 -202448 sc-eQTL 5.54e-01 0.0698 0.118 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000116641 DOCK7 476741 sc-eQTL 9.96e-02 -0.18 0.109 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000125703 ATG4C 380995 sc-eQTL 8.33e-02 -0.163 0.0939 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -428594 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0825 0.107 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000162607 USP1 728830 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0721 0.11 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000240563 L1TD1 970278 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0593 0.0913 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 -428284 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0655 0.128 0.194 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 -202448 sc-eQTL 3.34e-01 0.132 0.136 0.194 gdT L2
ENSG00000116641 DOCK7 476741 sc-eQTL 9.83e-01 0.00293 0.134 0.194 gdT L2
ENSG00000125703 ATG4C 380995 sc-eQTL 9.29e-01 -0.0113 0.128 0.194 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -428594 sc-eQTL 2.96e-01 0.142 0.135 0.194 gdT L2
ENSG00000162607 USP1 728830 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0698 0.128 0.194 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -358245 sc-eQTL 1.59e-03 -0.415 0.129 0.194 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 -428284 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0799 0.119 0.191 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -202448 sc-eQTL 9.26e-01 -0.0103 0.111 0.191 intMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 476741 sc-eQTL 5.96e-01 -0.06 0.113 0.191 intMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 380995 sc-eQTL 7.74e-01 -0.031 0.108 0.191 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -428594 sc-eQTL 1.84e-01 -0.158 0.118 0.191 intMono L2
ENSG00000162607 USP1 728830 sc-eQTL 1.03e-01 -0.197 0.12 0.191 intMono L2
ENSG00000240563 L1TD1 970278 sc-eQTL 2.00e-01 0.114 0.0886 0.191 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -428284 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0349 0.105 0.192 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -202448 sc-eQTL 8.97e-02 0.195 0.115 0.192 ncMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 476741 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0895 0.113 0.192 ncMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 380995 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0513 0.106 0.192 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -428594 sc-eQTL 4.00e-01 -0.0934 0.111 0.192 ncMono L2
ENSG00000162607 USP1 728830 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000203 0.113 0.192 ncMono L2
ENSG00000240563 L1TD1 970278 sc-eQTL 9.08e-01 -0.00935 0.0804 0.192 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -428284 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0386 0.138 0.169 pDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -202448 sc-eQTL 2.90e-01 0.142 0.134 0.169 pDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 476741 sc-eQTL 5.97e-01 0.0726 0.137 0.169 pDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 380995 sc-eQTL 1.16e-01 -0.193 0.122 0.169 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -428594 sc-eQTL 6.61e-01 0.0606 0.138 0.169 pDC L2
ENSG00000162607 USP1 728830 sc-eQTL 5.59e-02 -0.268 0.139 0.169 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -358245 sc-eQTL 6.79e-01 0.0507 0.122 0.169 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -428284 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0239 0.11 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -202448 sc-eQTL 6.93e-01 0.048 0.121 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 476741 sc-eQTL 5.31e-01 0.066 0.105 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 380995 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00626 0.0851 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -428594 sc-eQTL 5.92e-01 -0.06 0.112 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 728830 sc-eQTL 2.53e-01 -0.124 0.108 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -358245 sc-eQTL 3.86e-01 -0.101 0.116 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -428284 sc-eQTL 8.35e-01 0.0237 0.113 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -202448 sc-eQTL 2.34e-01 -0.139 0.116 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 476741 sc-eQTL 2.21e-01 -0.133 0.109 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 380995 sc-eQTL 7.10e-01 0.031 0.0832 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -428594 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0475 0.118 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 728830 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0501 0.101 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -358245 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0268 0.118 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -428284 sc-eQTL 1.96e-01 -0.138 0.106 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -202448 sc-eQTL 5.54e-01 0.0612 0.103 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 476741 sc-eQTL 9.93e-02 -0.171 0.103 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 380995 sc-eQTL 9.08e-01 -0.00829 0.0719 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -428594 sc-eQTL 8.41e-01 0.0214 0.106 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 728830 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0435 0.0908 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000240563 L1TD1 970278 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0647 0.0984 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -428284 sc-eQTL 7.22e-01 -0.036 0.101 0.192 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -202448 sc-eQTL 5.97e-01 0.0608 0.115 0.192 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 476741 sc-eQTL 2.33e-01 -0.136 0.113 0.192 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 380995 sc-eQTL 3.77e-01 -0.0856 0.0967 0.192 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -428594 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0917 0.112 0.192 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 728830 sc-eQTL 7.98e-01 0.0271 0.106 0.192 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000240563 L1TD1 970278 sc-eQTL 8.73e-01 0.0116 0.0721 0.192 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -428284 sc-eQTL 2.78e-01 -0.094 0.0865 0.192 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -202448 sc-eQTL 3.82e-01 -0.0911 0.104 0.192 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 476741 sc-eQTL 9.17e-01 -0.00968 0.0933 0.192 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 380995 sc-eQTL 2.53e-01 0.106 0.0928 0.192 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -428594 sc-eQTL 8.19e-01 0.0254 0.11 0.192 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 728830 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0519 0.1 0.192 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -358245 sc-eQTL 8.92e-02 -0.207 0.121 0.192 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079739 PGM1 -428284 eQTL 0.0196 0.0552 0.0236 0.0 0.0 0.174

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000079739 PGM1 -428284 1.23e-06 1.33e-06 2.4e-07 1.25e-06 3.46e-07 6.47e-07 1.53e-06 3.37e-07 1.49e-06 6.23e-07 1.85e-06 8.32e-07 2.51e-06 3.24e-07 5.01e-07 9.27e-07 9e-07 7.08e-07 6.6e-07 6.16e-07 4.57e-07 1.72e-06 8.92e-07 5.77e-07 2.41e-06 4.23e-07 9.77e-07 7.09e-07 1.32e-06 1.3e-06 8.06e-07 7.37e-08 1.98e-07 6.08e-07 5.46e-07 4.12e-07 6.19e-07 2.24e-07 4.53e-07 2.01e-07 1.97e-07 1.47e-06 1.22e-07 1.96e-07 1.81e-07 3.06e-07 2.24e-07 3.7e-08 1.05e-07
ENSG00000116652 \N -381955 1.38e-06 2.13e-06 2.62e-07 1.64e-06 3.81e-07 6.96e-07 1.21e-06 3.97e-07 1.73e-06 7.2e-07 1.99e-06 1.3e-06 2.67e-06 6.67e-07 3.18e-07 1.01e-06 1.16e-06 1.12e-06 5.66e-07 5.11e-07 7.96e-07 1.92e-06 1.25e-06 6.2e-07 2.65e-06 7.59e-07 1.04e-06 8.48e-07 1.53e-06 1.64e-06 7.6e-07 2.38e-07 2.64e-07 6.25e-07 8.57e-07 4.63e-07 7.36e-07 3.37e-07 4.83e-07 2.57e-07 2.89e-07 1.71e-06 3.53e-07 1.8e-07 2.5e-07 3.1e-07 2.71e-07 1.42e-07 1.71e-07
ENSG00000230798 \N -159314 6.46e-06 9.23e-06 1.21e-06 5.09e-06 1.76e-06 3.71e-06 9.72e-06 1.25e-06 5.83e-06 4.26e-06 9.71e-06 4.6e-06 1.16e-05 3.89e-06 2.11e-06 5.71e-06 3.8e-06 3.89e-06 2.63e-06 2.53e-06 2.92e-06 7.51e-06 6.05e-06 2.15e-06 1.24e-05 2.26e-06 4.48e-06 2.43e-06 7.05e-06 7.65e-06 4.48e-06 5.62e-07 7.99e-07 2.78e-06 3.58e-06 1.39e-06 1.31e-06 1.08e-06 1.42e-06 9.71e-07 7.52e-07 8.35e-06 1.22e-06 1.92e-07 7.84e-07 1.68e-06 8.95e-07 6.87e-07 5.92e-07