logo

Genes within 1Mb (chr1:63163233:T:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -430178 sc-eQTL 6.03e-01 0.0467 0.0897 0.224 B L1
ENSG00000088035 ALG6 -204342 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0617 0.0929 0.224 B L1
ENSG00000116641 DOCK7 474847 sc-eQTL 7.96e-02 -0.163 0.0923 0.224 B L1
ENSG00000125703 ATG4C 379101 sc-eQTL 1.97e-01 0.0833 0.0644 0.224 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -430488 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0245 0.103 0.224 B L1
ENSG00000162607 USP1 726936 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0356 0.0892 0.224 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -360139 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0127 0.105 0.224 B L1
ENSG00000079739 PGM1 -430178 sc-eQTL 8.00e-02 0.137 0.0778 0.224 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 -204342 sc-eQTL 9.01e-01 0.0108 0.0865 0.224 CD4T L1
ENSG00000116641 DOCK7 474847 sc-eQTL 4.81e-02 -0.172 0.0867 0.224 CD4T L1
ENSG00000125703 ATG4C 379101 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0205 0.0707 0.224 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -430488 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0205 0.1 0.224 CD4T L1
ENSG00000162607 USP1 726936 sc-eQTL 1.83e-02 -0.161 0.0677 0.224 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -360139 sc-eQTL 1.82e-01 0.12 0.0897 0.224 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 -430178 sc-eQTL 3.32e-01 -0.0841 0.0864 0.224 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 -204342 sc-eQTL 4.79e-02 0.188 0.0946 0.224 CD8T L1
ENSG00000116641 DOCK7 474847 sc-eQTL 5.08e-01 -0.064 0.0966 0.224 CD8T L1
ENSG00000125703 ATG4C 379101 sc-eQTL 1.03e-01 -0.15 0.0913 0.224 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -430488 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0859 0.103 0.224 CD8T L1
ENSG00000162607 USP1 726936 sc-eQTL 1.08e-01 -0.128 0.0796 0.224 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -360139 sc-eQTL 2.95e-01 0.107 0.102 0.224 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 -430178 sc-eQTL 1.17e-01 -0.147 0.0935 0.225 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 -204342 sc-eQTL 3.85e-01 0.0844 0.0969 0.225 DC L1
ENSG00000116641 DOCK7 474847 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0757 0.0994 0.225 DC L1
ENSG00000125703 ATG4C 379101 sc-eQTL 1.15e-01 -0.122 0.0774 0.225 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -430488 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0449 0.109 0.225 DC L1
ENSG00000162607 USP1 726936 sc-eQTL 2.13e-01 -0.118 0.0947 0.225 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -360139 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0246 0.0947 0.225 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 -430178 sc-eQTL 7.11e-01 0.0349 0.0939 0.224 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 -204342 sc-eQTL 5.58e-02 0.187 0.0971 0.224 Mono L1
ENSG00000116641 DOCK7 474847 sc-eQTL 1.51e-01 -0.136 0.0943 0.224 Mono L1
ENSG00000125703 ATG4C 379101 sc-eQTL 2.28e-01 -0.0771 0.0638 0.224 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -430488 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0141 0.101 0.224 Mono L1
ENSG00000162607 USP1 726936 sc-eQTL 7.15e-01 0.0304 0.0831 0.224 Mono L1
ENSG00000240563 L1TD1 968384 sc-eQTL 6.40e-01 0.0363 0.0775 0.224 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 -430178 sc-eQTL 2.74e-01 -0.0881 0.0802 0.223 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 -204342 sc-eQTL 9.76e-02 -0.156 0.0937 0.223 NK L1
ENSG00000116641 DOCK7 474847 sc-eQTL 4.82e-01 0.0547 0.0776 0.223 NK L1
ENSG00000125703 ATG4C 379101 sc-eQTL 9.57e-01 0.00446 0.0834 0.223 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -430488 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0346 0.104 0.223 NK L1
ENSG00000162607 USP1 726936 sc-eQTL 1.89e-01 -0.122 0.0923 0.223 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -360139 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0756 0.112 0.223 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 -430178 sc-eQTL 9.60e-01 0.00454 0.0912 0.224 Other_T L1
ENSG00000088035 ALG6 -204342 sc-eQTL 2.61e-01 0.103 0.0913 0.224 Other_T L1
ENSG00000116641 DOCK7 474847 sc-eQTL 5.95e-01 0.0498 0.0935 0.224 Other_T L1
ENSG00000125703 ATG4C 379101 sc-eQTL 4.33e-01 0.0635 0.0809 0.224 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -430488 sc-eQTL 4.12e-01 0.059 0.0717 0.224 Other_T L1
ENSG00000162607 USP1 726936 sc-eQTL 3.25e-01 -0.0612 0.0621 0.224 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -360139 sc-eQTL 7.09e-01 0.0414 0.111 0.224 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -430178 sc-eQTL 8.30e-01 0.0255 0.119 0.224 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 -204342 sc-eQTL 5.08e-01 0.0755 0.114 0.224 B_Activated L2
ENSG00000116641 DOCK7 474847 sc-eQTL 6.04e-01 -0.055 0.106 0.224 B_Activated L2
ENSG00000125703 ATG4C 379101 sc-eQTL 1.72e-01 -0.152 0.111 0.224 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -430488 sc-eQTL 1.76e-02 -0.257 0.107 0.224 B_Activated L2
ENSG00000162607 USP1 726936 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0669 0.118 0.224 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -360139 sc-eQTL 2.14e-01 -0.128 0.103 0.224 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 -430178 sc-eQTL 7.72e-01 0.0308 0.106 0.225 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 -204342 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0399 0.108 0.225 B_Intermediate L2
ENSG00000116641 DOCK7 474847 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0532 0.103 0.225 B_Intermediate L2
ENSG00000125703 ATG4C 379101 sc-eQTL 6.48e-01 0.0399 0.0871 0.225 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -430488 sc-eQTL 6.67e-01 0.0447 0.104 0.225 B_Intermediate L2
ENSG00000162607 USP1 726936 sc-eQTL 2.10e-02 -0.238 0.102 0.225 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -360139 sc-eQTL 5.21e-01 0.0661 0.103 0.225 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 -430178 sc-eQTL 9.81e-01 0.00254 0.106 0.226 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 -204342 sc-eQTL 1.74e-01 0.146 0.107 0.226 B_Memory L2
ENSG00000116641 DOCK7 474847 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0192 0.101 0.226 B_Memory L2
ENSG00000125703 ATG4C 379101 sc-eQTL 9.10e-01 0.0109 0.0958 0.226 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -430488 sc-eQTL 3.61e-01 -0.1 0.109 0.226 B_Memory L2
ENSG00000162607 USP1 726936 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0722 0.11 0.226 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -360139 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0506 0.109 0.226 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 -430178 sc-eQTL 9.19e-01 0.0108 0.107 0.224 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 -204342 sc-eQTL 9.54e-01 0.00619 0.107 0.224 B_Naive1 L2
ENSG00000116641 DOCK7 474847 sc-eQTL 6.30e-02 -0.19 0.102 0.224 B_Naive1 L2
ENSG00000125703 ATG4C 379101 sc-eQTL 4.54e-01 0.0592 0.0789 0.224 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -430488 sc-eQTL 2.79e-01 -0.113 0.104 0.224 B_Naive1 L2
ENSG00000162607 USP1 726936 sc-eQTL 6.33e-01 -0.044 0.0921 0.224 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -360139 sc-eQTL 9.17e-01 0.0117 0.112 0.224 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 -430178 sc-eQTL 3.17e-01 0.103 0.103 0.225 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 -204342 sc-eQTL 3.44e-01 -0.102 0.107 0.225 B_Naive2 L2
ENSG00000116641 DOCK7 474847 sc-eQTL 3.72e-01 -0.0925 0.103 0.225 B_Naive2 L2
ENSG00000125703 ATG4C 379101 sc-eQTL 6.61e-01 0.0437 0.0996 0.225 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -430488 sc-eQTL 3.84e-01 0.0942 0.108 0.225 B_Naive2 L2
ENSG00000162607 USP1 726936 sc-eQTL 2.91e-01 0.109 0.103 0.225 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -360139 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0581 0.108 0.225 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 -430178 sc-eQTL 3.85e-01 0.0929 0.107 0.23 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -204342 sc-eQTL 1.32e-01 0.17 0.112 0.23 CD4_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 474847 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0138 0.0988 0.23 CD4_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 379101 sc-eQTL 3.43e-01 -0.0969 0.102 0.23 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -430488 sc-eQTL 7.22e-01 -0.039 0.109 0.23 CD4_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 726936 sc-eQTL 6.88e-01 0.0419 0.104 0.23 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -360139 sc-eQTL 1.57e-02 -0.25 0.102 0.23 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -430178 sc-eQTL 2.82e-01 0.096 0.089 0.224 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -204342 sc-eQTL 3.28e-01 -0.0948 0.0967 0.224 CD4_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 474847 sc-eQTL 3.00e-02 -0.206 0.0942 0.224 CD4_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 379101 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0177 0.0842 0.224 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -430488 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0682 0.103 0.224 CD4_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 726936 sc-eQTL 2.31e-01 -0.0942 0.0784 0.224 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -360139 sc-eQTL 4.05e-01 0.0851 0.102 0.224 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -430178 sc-eQTL 1.53e-03 0.283 0.0883 0.224 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -204342 sc-eQTL 2.83e-01 0.113 0.105 0.224 CD4_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 474847 sc-eQTL 1.40e-01 -0.137 0.0925 0.224 CD4_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 379101 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0507 0.0905 0.224 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -430488 sc-eQTL 7.87e-01 0.0289 0.107 0.224 CD4_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 726936 sc-eQTL 1.83e-01 -0.116 0.0872 0.224 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -360139 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0298 0.103 0.224 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -430178 sc-eQTL 2.43e-01 -0.121 0.104 0.224 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -204342 sc-eQTL 3.10e-01 0.106 0.104 0.224 CD4_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 474847 sc-eQTL 8.76e-02 0.174 0.101 0.224 CD4_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 379101 sc-eQTL 1.52e-01 0.142 0.0985 0.224 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -430488 sc-eQTL 9.73e-01 0.00346 0.102 0.224 CD4_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 726936 sc-eQTL 1.33e-01 -0.145 0.0963 0.224 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -360139 sc-eQTL 3.02e-01 0.109 0.106 0.224 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -430178 sc-eQTL 1.03e-01 -0.158 0.0966 0.224 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -204342 sc-eQTL 6.18e-02 0.192 0.102 0.224 CD8_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 474847 sc-eQTL 2.71e-01 0.108 0.0978 0.224 CD8_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 379101 sc-eQTL 2.90e-01 -0.11 0.104 0.224 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -430488 sc-eQTL 8.46e-01 0.021 0.108 0.224 CD8_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 726936 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0637 0.0971 0.224 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -360139 sc-eQTL 8.20e-02 0.193 0.11 0.224 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -430178 sc-eQTL 9.77e-01 0.00287 0.101 0.224 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -204342 sc-eQTL 6.60e-01 0.0458 0.104 0.224 CD8_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 474847 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0205 0.108 0.224 CD8_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 379101 sc-eQTL 3.35e-01 -0.0998 0.103 0.224 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -430488 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0403 0.105 0.224 CD8_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 726936 sc-eQTL 3.47e-01 -0.0834 0.0884 0.224 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -360139 sc-eQTL 3.22e-01 -0.0978 0.0985 0.224 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -430178 sc-eQTL 8.41e-01 0.0228 0.114 0.22 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -204342 sc-eQTL 3.54e-01 0.107 0.115 0.22 CD8_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 474847 sc-eQTL 1.49e-01 0.162 0.112 0.22 CD8_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 379101 sc-eQTL 9.81e-01 0.00271 0.115 0.22 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -430488 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0818 0.112 0.22 CD8_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 726936 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0674 0.107 0.22 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -360139 sc-eQTL 1.79e-01 0.153 0.113 0.22 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -430178 sc-eQTL 4.40e-01 0.0852 0.11 0.224 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -204342 sc-eQTL 7.25e-01 0.039 0.111 0.224 CD8_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 474847 sc-eQTL 3.65e-01 -0.0974 0.107 0.224 CD8_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 379101 sc-eQTL 6.85e-01 0.0419 0.103 0.224 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -430488 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0428 0.112 0.224 CD8_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 726936 sc-eQTL 3.34e-01 -0.103 0.106 0.224 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -360139 sc-eQTL 6.48e-02 0.2 0.107 0.224 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -430178 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0697 0.103 0.223 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 -204342 sc-eQTL 2.46e-01 0.119 0.102 0.223 MAIT L2
ENSG00000116641 DOCK7 474847 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0125 0.0982 0.223 MAIT L2
ENSG00000125703 ATG4C 379101 sc-eQTL 3.09e-01 0.105 0.103 0.223 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -430488 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0775 0.104 0.223 MAIT L2
ENSG00000162607 USP1 726936 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0167 0.103 0.223 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -360139 sc-eQTL 2.68e-01 0.118 0.107 0.223 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 -430178 sc-eQTL 5.66e-01 0.0602 0.105 0.229 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 -204342 sc-eQTL 1.49e-01 -0.155 0.107 0.229 NK_CD56bright L2
ENSG00000116641 DOCK7 474847 sc-eQTL 2.83e-01 0.1 0.093 0.229 NK_CD56bright L2
ENSG00000125703 ATG4C 379101 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0783 0.104 0.229 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -430488 sc-eQTL 8.86e-02 -0.184 0.108 0.229 NK_CD56bright L2
ENSG00000162607 USP1 726936 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0178 0.112 0.229 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -360139 sc-eQTL 4.13e-01 -0.0877 0.107 0.229 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 -430178 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0105 0.083 0.224 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 -204342 sc-eQTL 1.48e-02 -0.255 0.104 0.224 NK_CD56dim L2
ENSG00000116641 DOCK7 474847 sc-eQTL 3.94e-01 -0.0782 0.0915 0.224 NK_CD56dim L2
ENSG00000125703 ATG4C 379101 sc-eQTL 7.86e-01 0.0253 0.0931 0.224 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -430488 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0478 0.106 0.224 NK_CD56dim L2
ENSG00000162607 USP1 726936 sc-eQTL 8.83e-02 -0.175 0.102 0.224 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -360139 sc-eQTL 1.40e-01 -0.169 0.114 0.224 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 -430178 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0889 0.11 0.233 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 -204342 sc-eQTL 2.69e-01 0.127 0.114 0.233 NK_HLA L2
ENSG00000116641 DOCK7 474847 sc-eQTL 7.10e-01 0.0326 0.0876 0.233 NK_HLA L2
ENSG00000125703 ATG4C 379101 sc-eQTL 3.30e-01 -0.0994 0.102 0.233 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -430488 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0316 0.107 0.233 NK_HLA L2
ENSG00000162607 USP1 726936 sc-eQTL 8.37e-01 0.023 0.112 0.233 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -360139 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00106 0.102 0.233 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 -430178 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00108 0.0908 0.224 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 -204342 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0127 0.103 0.224 NK_cytokine L2
ENSG00000116641 DOCK7 474847 sc-eQTL 2.75e-01 0.104 0.0948 0.224 NK_cytokine L2
ENSG00000125703 ATG4C 379101 sc-eQTL 2.39e-01 0.115 0.097 0.224 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -430488 sc-eQTL 7.26e-01 0.0354 0.101 0.224 NK_cytokine L2
ENSG00000162607 USP1 726936 sc-eQTL 5.96e-01 0.0562 0.106 0.224 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -360139 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0503 0.107 0.224 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 -430178 sc-eQTL 4.54e-01 0.0931 0.124 0.219 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 -204342 sc-eQTL 6.19e-01 0.065 0.13 0.219 PB L2
ENSG00000116641 DOCK7 474847 sc-eQTL 9.41e-01 0.0104 0.14 0.219 PB L2
ENSG00000125703 ATG4C 379101 sc-eQTL 6.28e-01 0.0591 0.122 0.219 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -430488 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0502 0.121 0.219 PB L2
ENSG00000162607 USP1 726936 sc-eQTL 7.89e-01 0.0325 0.121 0.219 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -360139 sc-eQTL 6.39e-01 0.0627 0.133 0.219 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 -430178 sc-eQTL 1.67e-01 0.14 0.101 0.22 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 -204342 sc-eQTL 2.09e-01 0.129 0.103 0.22 Pro_T L2
ENSG00000116641 DOCK7 474847 sc-eQTL 1.96e-02 -0.24 0.102 0.22 Pro_T L2
ENSG00000125703 ATG4C 379101 sc-eQTL 3.51e-01 0.0845 0.0904 0.22 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -430488 sc-eQTL 1.93e-01 0.118 0.0905 0.22 Pro_T L2
ENSG00000162607 USP1 726936 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00248 0.0625 0.22 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -360139 sc-eQTL 6.21e-01 0.0522 0.106 0.22 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 -430178 sc-eQTL 8.60e-01 0.0181 0.102 0.224 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 -204342 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0387 0.11 0.224 Treg L2
ENSG00000116641 DOCK7 474847 sc-eQTL 3.82e-01 -0.0881 0.1 0.224 Treg L2
ENSG00000125703 ATG4C 379101 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0227 0.103 0.224 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -430488 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0136 0.108 0.224 Treg L2
ENSG00000162607 USP1 726936 sc-eQTL 1.13e-01 -0.165 0.103 0.224 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -360139 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00561 0.103 0.224 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 -430178 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0478 0.101 0.229 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -204342 sc-eQTL 2.44e-01 -0.119 0.102 0.229 cDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 474847 sc-eQTL 2.15e-01 -0.124 0.1 0.229 cDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 379101 sc-eQTL 9.87e-01 0.00141 0.0872 0.229 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -430488 sc-eQTL 4.06e-01 0.0918 0.11 0.229 cDC L2
ENSG00000162607 USP1 726936 sc-eQTL 2.20e-01 -0.121 0.098 0.229 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -360139 sc-eQTL 3.84e-01 0.0774 0.0887 0.229 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 -430178 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0352 0.0968 0.224 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 -204342 sc-eQTL 1.78e-01 0.13 0.0965 0.224 cMono_IL1B L2
ENSG00000116641 DOCK7 474847 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0705 0.102 0.224 cMono_IL1B L2
ENSG00000125703 ATG4C 379101 sc-eQTL 8.99e-01 -0.00917 0.0719 0.224 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -430488 sc-eQTL 5.15e-01 0.0663 0.102 0.224 cMono_IL1B L2
ENSG00000162607 USP1 726936 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0366 0.0898 0.224 cMono_IL1B L2
ENSG00000240563 L1TD1 968384 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0163 0.0902 0.224 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 -430178 sc-eQTL 4.35e-01 0.085 0.109 0.224 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 -204342 sc-eQTL 1.52e-01 0.158 0.11 0.224 cMono_S100A L2
ENSG00000116641 DOCK7 474847 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0112 0.102 0.224 cMono_S100A L2
ENSG00000125703 ATG4C 379101 sc-eQTL 2.70e-01 -0.0975 0.0882 0.224 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -430488 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0769 0.0997 0.224 cMono_S100A L2
ENSG00000162607 USP1 726936 sc-eQTL 8.45e-01 0.0201 0.103 0.224 cMono_S100A L2
ENSG00000240563 L1TD1 968384 sc-eQTL 6.96e-01 0.0335 0.0854 0.224 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 -430178 sc-eQTL 4.01e-01 -0.0989 0.118 0.23 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 -204342 sc-eQTL 2.97e-01 0.131 0.125 0.23 gdT L2
ENSG00000116641 DOCK7 474847 sc-eQTL 4.53e-01 0.0925 0.123 0.23 gdT L2
ENSG00000125703 ATG4C 379101 sc-eQTL 4.53e-01 0.0884 0.118 0.23 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -430488 sc-eQTL 1.86e-02 0.292 0.123 0.23 gdT L2
ENSG00000162607 USP1 726936 sc-eQTL 1.61e-01 -0.165 0.118 0.23 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -360139 sc-eQTL 2.17e-02 -0.28 0.121 0.23 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 -430178 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0201 0.109 0.222 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -204342 sc-eQTL 1.01e-02 -0.26 0.1 0.222 intMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 474847 sc-eQTL 5.98e-01 0.0549 0.104 0.222 intMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 379101 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00631 0.0993 0.222 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -430488 sc-eQTL 1.21e-01 -0.17 0.109 0.222 intMono L2
ENSG00000162607 USP1 726936 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0421 0.111 0.222 intMono L2
ENSG00000240563 L1TD1 968384 sc-eQTL 1.32e-01 0.123 0.0814 0.222 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -430178 sc-eQTL 1.84e-01 0.13 0.0975 0.226 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -204342 sc-eQTL 1.55e-01 0.153 0.107 0.226 ncMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 474847 sc-eQTL 9.81e-01 -0.0025 0.106 0.226 ncMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 379101 sc-eQTL 2.57e-01 -0.112 0.0986 0.226 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -430488 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0312 0.103 0.226 ncMono L2
ENSG00000162607 USP1 726936 sc-eQTL 6.11e-01 0.0538 0.106 0.226 ncMono L2
ENSG00000240563 L1TD1 968384 sc-eQTL 4.32e-01 0.059 0.0749 0.226 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -430178 sc-eQTL 5.15e-01 -0.075 0.115 0.209 pDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -204342 sc-eQTL 1.71e-01 0.154 0.112 0.209 pDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 474847 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0484 0.115 0.209 pDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 379101 sc-eQTL 2.76e-01 -0.112 0.102 0.209 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -430488 sc-eQTL 9.67e-01 0.00478 0.115 0.209 pDC L2
ENSG00000162607 USP1 726936 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0346 0.118 0.209 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -360139 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0385 0.102 0.209 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -430178 sc-eQTL 6.44e-01 -0.046 0.0994 0.224 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -204342 sc-eQTL 7.73e-01 0.0318 0.11 0.224 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 474847 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0728 0.0953 0.224 B_Memory LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 379101 sc-eQTL 9.92e-01 0.000821 0.0772 0.224 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -430488 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0526 0.101 0.224 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 726936 sc-eQTL 5.95e-02 -0.185 0.0976 0.224 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -360139 sc-eQTL 8.32e-01 0.0225 0.106 0.224 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -430178 sc-eQTL 6.60e-01 0.0456 0.104 0.224 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -204342 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0518 0.107 0.224 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 474847 sc-eQTL 5.11e-02 -0.194 0.0987 0.224 B_Naive LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 379101 sc-eQTL 4.99e-01 0.0514 0.0759 0.224 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -430488 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0458 0.107 0.224 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 726936 sc-eQTL 3.76e-01 0.0817 0.0922 0.224 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -360139 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0316 0.108 0.224 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -430178 sc-eQTL 6.24e-01 0.0488 0.0994 0.224 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -204342 sc-eQTL 7.26e-02 0.172 0.0955 0.224 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 474847 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0526 0.0969 0.224 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 379101 sc-eQTL 3.07e-01 -0.0685 0.0668 0.224 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -430488 sc-eQTL 9.86e-01 0.00178 0.0991 0.224 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 726936 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00598 0.0847 0.224 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000240563 L1TD1 968384 sc-eQTL 8.86e-01 0.0132 0.0918 0.224 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -430178 sc-eQTL 4.03e-01 0.0783 0.0934 0.224 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -204342 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0456 0.106 0.224 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 474847 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0324 0.105 0.224 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 379101 sc-eQTL 3.74e-01 -0.0797 0.0895 0.224 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -430488 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0628 0.104 0.224 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 726936 sc-eQTL 3.27e-01 0.0959 0.0975 0.224 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000240563 L1TD1 968384 sc-eQTL 3.98e-01 0.0564 0.0666 0.224 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -430178 sc-eQTL 2.29e-01 -0.0985 0.0816 0.224 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -204342 sc-eQTL 9.68e-02 -0.163 0.0977 0.224 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 474847 sc-eQTL 7.73e-01 0.0255 0.0881 0.224 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 379101 sc-eQTL 6.27e-01 0.0428 0.0879 0.224 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -430488 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0577 0.104 0.224 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 726936 sc-eQTL 2.21e-01 -0.116 0.0943 0.224 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -360139 sc-eQTL 3.69e-01 -0.104 0.115 0.224 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000116641 DOCK7 474865 eQTL 0.0452 -0.0527 0.0263 0.0 0.0 0.224
ENSG00000116652 DLEU2L -383849 eQTL 0.0148 0.0752 0.0308 0.00228 0.0 0.224
ENSG00000185483 ROR1 -610784 pQTL 0.0405 -0.0322 0.0157 0.0 0.0 0.224

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000116652 DLEU2L -383849 1.26e-06 8.81e-07 3e-07 3.43e-07 1.56e-07 4.06e-07 7.96e-07 2.88e-07 9.42e-07 3.82e-07 1.16e-06 5.73e-07 1.43e-06 2.33e-07 4.49e-07 5.29e-07 7.39e-07 5.27e-07 3.66e-07 4.38e-07 2.93e-07 8.19e-07 5.81e-07 4.38e-07 1.57e-06 2.44e-07 6.16e-07 5.33e-07 7.07e-07 9.21e-07 4.48e-07 3.86e-08 1.75e-07 3.03e-07 3.6e-07 2.96e-07 3.1e-07 1.54e-07 1.34e-07 1.98e-08 2.37e-07 9.76e-07 5.29e-08 5.89e-09 1.59e-07 8.9e-08 1.91e-07 8.96e-08 8.09e-08