logo

Genes within 1Mb (chr1:63095037:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -498374 sc-eQTL 2.58e-01 0.123 0.109 0.156 B L1
ENSG00000088035 ALG6 -272538 sc-eQTL 4.67e-01 0.0821 0.113 0.156 B L1
ENSG00000116641 DOCK7 406651 sc-eQTL 1.33e-01 -0.169 0.112 0.156 B L1
ENSG00000125703 ATG4C 310905 sc-eQTL 4.80e-01 0.0555 0.0783 0.156 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -498684 sc-eQTL 3.53e-01 0.116 0.125 0.156 B L1
ENSG00000162607 USP1 658740 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0585 0.108 0.156 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -428335 sc-eQTL 9.78e-01 0.00345 0.128 0.156 B L1
ENSG00000079739 PGM1 -498374 sc-eQTL 4.14e-01 0.0763 0.0932 0.156 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 -272538 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0349 0.103 0.156 CD4T L1
ENSG00000116641 DOCK7 406651 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0703 0.104 0.156 CD4T L1
ENSG00000125703 ATG4C 310905 sc-eQTL 7.57e-01 0.0261 0.0842 0.156 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -498684 sc-eQTL 5.27e-01 0.0756 0.119 0.156 CD4T L1
ENSG00000162607 USP1 658740 sc-eQTL 1.88e-01 0.107 0.0813 0.156 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -428335 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0101 0.107 0.156 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 -498374 sc-eQTL 4.83e-01 0.0726 0.103 0.156 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 -272538 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0683 0.114 0.156 CD8T L1
ENSG00000116641 DOCK7 406651 sc-eQTL 2.73e-01 -0.127 0.115 0.156 CD8T L1
ENSG00000125703 ATG4C 310905 sc-eQTL 9.36e-01 -0.00877 0.11 0.156 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -498684 sc-eQTL 2.26e-01 0.148 0.122 0.156 CD8T L1
ENSG00000162607 USP1 658740 sc-eQTL 3.29e-02 0.203 0.0945 0.156 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -428335 sc-eQTL 8.38e-01 0.025 0.122 0.156 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 -498374 sc-eQTL 2.23e-01 0.142 0.116 0.153 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 -272538 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0664 0.12 0.153 DC L1
ENSG00000116641 DOCK7 406651 sc-eQTL 6.96e-02 0.224 0.123 0.153 DC L1
ENSG00000125703 ATG4C 310905 sc-eQTL 1.94e-01 -0.125 0.0963 0.153 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -498684 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00694 0.135 0.153 DC L1
ENSG00000162607 USP1 658740 sc-eQTL 6.17e-01 -0.059 0.118 0.153 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -428335 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0452 0.118 0.153 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 -498374 sc-eQTL 4.05e-01 -0.094 0.113 0.156 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 -272538 sc-eQTL 3.66e-01 -0.107 0.118 0.156 Mono L1
ENSG00000116641 DOCK7 406651 sc-eQTL 9.88e-01 0.00165 0.114 0.156 Mono L1
ENSG00000125703 ATG4C 310905 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000458 0.077 0.156 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -498684 sc-eQTL 1.79e-02 0.287 0.12 0.156 Mono L1
ENSG00000162607 USP1 658740 sc-eQTL 3.94e-01 0.0853 0.0998 0.156 Mono L1
ENSG00000240563 L1TD1 900188 sc-eQTL 1.96e-01 -0.121 0.0929 0.156 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 -498374 sc-eQTL 9.25e-01 0.00905 0.0959 0.155 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 -272538 sc-eQTL 1.25e-01 -0.172 0.112 0.155 NK L1
ENSG00000116641 DOCK7 406651 sc-eQTL 5.46e-01 0.0559 0.0925 0.155 NK L1
ENSG00000125703 ATG4C 310905 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0536 0.0994 0.155 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -498684 sc-eQTL 2.16e-01 0.153 0.123 0.155 NK L1
ENSG00000162607 USP1 658740 sc-eQTL 4.26e-01 0.088 0.11 0.155 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -428335 sc-eQTL 6.28e-01 -0.065 0.134 0.155 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 -498374 sc-eQTL 1.57e-01 -0.154 0.109 0.156 Other_T L1
ENSG00000088035 ALG6 -272538 sc-eQTL 2.93e-01 -0.115 0.109 0.156 Other_T L1
ENSG00000116641 DOCK7 406651 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0783 0.112 0.156 Other_T L1
ENSG00000125703 ATG4C 310905 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0489 0.0969 0.156 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -498684 sc-eQTL 8.22e-03 -0.226 0.0846 0.156 Other_T L1
ENSG00000162607 USP1 658740 sc-eQTL 6.37e-01 0.0352 0.0745 0.156 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -428335 sc-eQTL 1.01e-01 0.217 0.132 0.156 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -498374 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0453 0.141 0.166 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 -272538 sc-eQTL 1.06e-01 0.218 0.134 0.166 B_Activated L2
ENSG00000116641 DOCK7 406651 sc-eQTL 6.48e-01 0.0574 0.125 0.166 B_Activated L2
ENSG00000125703 ATG4C 310905 sc-eQTL 1.61e-01 0.185 0.131 0.166 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -498684 sc-eQTL 2.09e-01 -0.162 0.128 0.166 B_Activated L2
ENSG00000162607 USP1 658740 sc-eQTL 3.67e-01 -0.126 0.14 0.166 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -428335 sc-eQTL 6.26e-01 0.0596 0.122 0.166 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 -498374 sc-eQTL 6.44e-01 0.0595 0.129 0.157 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 -272538 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0226 0.131 0.157 B_Intermediate L2
ENSG00000116641 DOCK7 406651 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0484 0.125 0.157 B_Intermediate L2
ENSG00000125703 ATG4C 310905 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0821 0.105 0.157 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -498684 sc-eQTL 9.76e-02 0.208 0.125 0.157 B_Intermediate L2
ENSG00000162607 USP1 658740 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0386 0.126 0.157 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -428335 sc-eQTL 9.26e-01 -0.0116 0.125 0.157 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 -498374 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0202 0.127 0.157 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 -272538 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0253 0.129 0.157 B_Memory L2
ENSG00000116641 DOCK7 406651 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0356 0.121 0.157 B_Memory L2
ENSG00000125703 ATG4C 310905 sc-eQTL 3.06e-01 0.118 0.115 0.157 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -498684 sc-eQTL 3.18e-01 -0.131 0.131 0.157 B_Memory L2
ENSG00000162607 USP1 658740 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0794 0.133 0.157 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -428335 sc-eQTL 4.01e-01 0.11 0.13 0.157 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 -498374 sc-eQTL 4.32e-01 -0.102 0.13 0.156 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 -272538 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0202 0.13 0.156 B_Naive1 L2
ENSG00000116641 DOCK7 406651 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0993 0.125 0.156 B_Naive1 L2
ENSG00000125703 ATG4C 310905 sc-eQTL 3.34e-01 0.0929 0.096 0.156 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -498684 sc-eQTL 3.41e-01 0.122 0.127 0.156 B_Naive1 L2
ENSG00000162607 USP1 658740 sc-eQTL 4.25e-02 -0.227 0.111 0.156 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -428335 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0552 0.136 0.156 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 -498374 sc-eQTL 2.67e-02 0.281 0.126 0.157 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 -272538 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0419 0.133 0.157 B_Naive2 L2
ENSG00000116641 DOCK7 406651 sc-eQTL 2.80e-01 -0.138 0.128 0.157 B_Naive2 L2
ENSG00000125703 ATG4C 310905 sc-eQTL 4.02e-01 0.103 0.123 0.157 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -498684 sc-eQTL 7.74e-01 0.0383 0.133 0.157 B_Naive2 L2
ENSG00000162607 USP1 658740 sc-eQTL 7.81e-01 0.0354 0.127 0.157 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -428335 sc-eQTL 3.10e-01 -0.135 0.133 0.157 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 -498374 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0866 0.13 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -272538 sc-eQTL 1.04e-01 -0.223 0.136 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 406651 sc-eQTL 1.80e-01 -0.161 0.119 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 310905 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0502 0.124 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -498684 sc-eQTL 8.36e-02 0.229 0.132 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 658740 sc-eQTL 4.98e-01 0.0857 0.126 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -428335 sc-eQTL 7.75e-01 0.0361 0.126 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -498374 sc-eQTL 6.41e-01 -0.049 0.105 0.156 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -272538 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00861 0.114 0.156 CD4_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 406651 sc-eQTL 3.06e-01 -0.115 0.112 0.156 CD4_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 310905 sc-eQTL 4.99e-01 0.0671 0.0991 0.156 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -498684 sc-eQTL 9.67e-01 0.00501 0.121 0.156 CD4_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 658740 sc-eQTL 1.83e-01 0.123 0.0922 0.156 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -428335 sc-eQTL 8.27e-01 0.0264 0.12 0.156 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -498374 sc-eQTL 1.56e-01 0.153 0.108 0.156 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -272538 sc-eQTL 7.61e-01 0.0384 0.126 0.156 CD4_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 406651 sc-eQTL 9.91e-01 -0.0013 0.112 0.156 CD4_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 310905 sc-eQTL 2.39e-01 0.128 0.108 0.156 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -498684 sc-eQTL 9.23e-01 0.0123 0.128 0.156 CD4_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 658740 sc-eQTL 5.09e-01 0.0694 0.105 0.156 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -428335 sc-eQTL 4.31e-01 0.0977 0.124 0.156 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -498374 sc-eQTL 1.27e-01 0.196 0.128 0.156 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -272538 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0406 0.129 0.156 CD4_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 406651 sc-eQTL 3.63e-01 0.114 0.126 0.156 CD4_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 310905 sc-eQTL 2.46e-01 -0.142 0.122 0.156 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -498684 sc-eQTL 1.65e-01 -0.175 0.126 0.156 CD4_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 658740 sc-eQTL 4.58e-01 0.0886 0.119 0.156 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -428335 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0978 0.13 0.156 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -498374 sc-eQTL 2.94e-01 0.122 0.116 0.156 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -272538 sc-eQTL 2.37e-01 -0.146 0.123 0.156 CD8_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 406651 sc-eQTL 5.69e-01 0.0667 0.117 0.156 CD8_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 310905 sc-eQTL 2.74e-01 -0.136 0.124 0.156 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -498684 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00894 0.13 0.156 CD8_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 658740 sc-eQTL 1.03e-01 0.189 0.115 0.156 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -428335 sc-eQTL 7.35e-01 -0.045 0.133 0.156 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -498374 sc-eQTL 6.40e-01 0.0568 0.121 0.156 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -272538 sc-eQTL 1.84e-01 -0.167 0.125 0.156 CD8_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 406651 sc-eQTL 3.20e-02 -0.277 0.128 0.156 CD8_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 310905 sc-eQTL 9.71e-01 0.00455 0.125 0.156 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -498684 sc-eQTL 1.19e-01 0.196 0.126 0.156 CD8_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 658740 sc-eQTL 2.93e-01 0.112 0.106 0.156 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -428335 sc-eQTL 5.16e-01 0.0773 0.119 0.156 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -498374 sc-eQTL 8.44e-01 0.0259 0.131 0.146 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -272538 sc-eQTL 4.97e-01 0.09 0.132 0.146 CD8_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 406651 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0747 0.129 0.146 CD8_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 310905 sc-eQTL 4.64e-01 0.0969 0.132 0.146 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -498684 sc-eQTL 2.69e-01 0.142 0.128 0.146 CD8_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 658740 sc-eQTL 1.63e-01 0.173 0.123 0.146 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -428335 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0195 0.131 0.146 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -498374 sc-eQTL 8.16e-01 0.0305 0.131 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -272538 sc-eQTL 4.51e-01 0.0991 0.131 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 406651 sc-eQTL 8.58e-03 -0.332 0.125 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 310905 sc-eQTL 1.37e-01 0.182 0.122 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -498684 sc-eQTL 6.71e-01 0.0563 0.133 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 658740 sc-eQTL 7.44e-01 0.0414 0.127 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -428335 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0843 0.128 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -498374 sc-eQTL 1.77e-02 -0.296 0.124 0.156 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 -272538 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00398 0.124 0.156 MAIT L2
ENSG00000116641 DOCK7 406651 sc-eQTL 5.35e-02 -0.229 0.118 0.156 MAIT L2
ENSG00000125703 ATG4C 310905 sc-eQTL 8.49e-01 0.0239 0.126 0.156 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -498684 sc-eQTL 3.55e-01 -0.116 0.126 0.156 MAIT L2
ENSG00000162607 USP1 658740 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0133 0.125 0.156 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -428335 sc-eQTL 9.68e-01 0.00513 0.13 0.156 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 -498374 sc-eQTL 5.46e-02 -0.238 0.123 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 -272538 sc-eQTL 9.88e-01 0.00186 0.127 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000116641 DOCK7 406651 sc-eQTL 9.57e-01 0.00589 0.11 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000125703 ATG4C 310905 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0791 0.123 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -498684 sc-eQTL 3.61e-01 0.117 0.128 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000162607 USP1 658740 sc-eQTL 1.89e-02 0.309 0.131 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -428335 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0483 0.127 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 -498374 sc-eQTL 8.02e-01 -0.025 0.0994 0.155 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 -272538 sc-eQTL 2.01e-01 -0.161 0.126 0.155 NK_CD56dim L2
ENSG00000116641 DOCK7 406651 sc-eQTL 1.31e-01 -0.166 0.109 0.155 NK_CD56dim L2
ENSG00000125703 ATG4C 310905 sc-eQTL 7.34e-01 0.038 0.111 0.155 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -498684 sc-eQTL 1.26e-01 0.194 0.126 0.155 NK_CD56dim L2
ENSG00000162607 USP1 658740 sc-eQTL 9.88e-01 0.00179 0.123 0.155 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -428335 sc-eQTL 8.13e-01 0.0324 0.137 0.155 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 -498374 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0397 0.135 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 -272538 sc-eQTL 9.16e-01 0.0147 0.14 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000116641 DOCK7 406651 sc-eQTL 1.25e-01 0.163 0.106 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000125703 ATG4C 310905 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0664 0.124 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -498684 sc-eQTL 6.81e-01 0.0536 0.13 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000162607 USP1 658740 sc-eQTL 6.12e-01 0.0693 0.136 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -428335 sc-eQTL 6.62e-01 0.0543 0.124 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 -498374 sc-eQTL 2.29e-01 0.132 0.109 0.155 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 -272538 sc-eQTL 3.39e-02 -0.262 0.123 0.155 NK_cytokine L2
ENSG00000116641 DOCK7 406651 sc-eQTL 2.06e-01 0.145 0.115 0.155 NK_cytokine L2
ENSG00000125703 ATG4C 310905 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0982 0.117 0.155 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -498684 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0888 0.122 0.155 NK_cytokine L2
ENSG00000162607 USP1 658740 sc-eQTL 2.86e-01 0.137 0.128 0.155 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -428335 sc-eQTL 2.16e-01 -0.16 0.129 0.155 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 -498374 sc-eQTL 9.76e-01 0.005 0.164 0.148 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 -272538 sc-eQTL 6.23e-01 0.0848 0.172 0.148 PB L2
ENSG00000116641 DOCK7 406651 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0901 0.184 0.148 PB L2
ENSG00000125703 ATG4C 310905 sc-eQTL 2.82e-01 0.173 0.16 0.148 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -498684 sc-eQTL 5.62e-01 0.0932 0.16 0.148 PB L2
ENSG00000162607 USP1 658740 sc-eQTL 4.39e-01 0.124 0.159 0.148 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -428335 sc-eQTL 4.78e-01 0.125 0.176 0.148 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 -498374 sc-eQTL 6.57e-01 0.0528 0.119 0.154 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 -272538 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0944 0.121 0.154 Pro_T L2
ENSG00000116641 DOCK7 406651 sc-eQTL 7.76e-01 0.0345 0.121 0.154 Pro_T L2
ENSG00000125703 ATG4C 310905 sc-eQTL 2.45e-01 0.123 0.106 0.154 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -498684 sc-eQTL 3.89e-04 -0.372 0.103 0.154 Pro_T L2
ENSG00000162607 USP1 658740 sc-eQTL 7.80e-01 0.0205 0.0731 0.154 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -428335 sc-eQTL 8.84e-02 0.21 0.123 0.154 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 -498374 sc-eQTL 1.29e-01 -0.189 0.124 0.156 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 -272538 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0747 0.133 0.156 Treg L2
ENSG00000116641 DOCK7 406651 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0511 0.122 0.156 Treg L2
ENSG00000125703 ATG4C 310905 sc-eQTL 3.89e-01 -0.108 0.125 0.156 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -498684 sc-eQTL 2.84e-02 0.286 0.129 0.156 Treg L2
ENSG00000162607 USP1 658740 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0461 0.127 0.156 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -428335 sc-eQTL 9.80e-01 0.00321 0.125 0.156 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 -498374 sc-eQTL 4.80e-02 0.25 0.125 0.159 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -272538 sc-eQTL 2.80e-02 -0.281 0.127 0.159 cDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 406651 sc-eQTL 1.16e-01 0.198 0.125 0.159 cDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 310905 sc-eQTL 3.51e-01 -0.102 0.109 0.159 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -498684 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0621 0.139 0.159 cDC L2
ENSG00000162607 USP1 658740 sc-eQTL 9.44e-01 -0.0087 0.124 0.159 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -428335 sc-eQTL 7.63e-01 0.0337 0.112 0.159 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 -498374 sc-eQTL 1.20e-01 -0.182 0.117 0.156 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 -272538 sc-eQTL 4.02e-01 -0.0985 0.117 0.156 cMono_IL1B L2
ENSG00000116641 DOCK7 406651 sc-eQTL 9.68e-01 -0.0049 0.124 0.156 cMono_IL1B L2
ENSG00000125703 ATG4C 310905 sc-eQTL 2.81e-01 -0.0938 0.0868 0.156 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -498684 sc-eQTL 8.89e-02 0.209 0.122 0.156 cMono_IL1B L2
ENSG00000162607 USP1 658740 sc-eQTL 5.63e-01 -0.063 0.109 0.156 cMono_IL1B L2
ENSG00000240563 L1TD1 900188 sc-eQTL 6.22e-01 0.0539 0.109 0.156 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 -498374 sc-eQTL 6.11e-01 0.0666 0.131 0.156 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 -272538 sc-eQTL 7.93e-01 0.0348 0.133 0.156 cMono_S100A L2
ENSG00000116641 DOCK7 406651 sc-eQTL 6.55e-01 -0.055 0.123 0.156 cMono_S100A L2
ENSG00000125703 ATG4C 310905 sc-eQTL 3.70e-01 0.0955 0.106 0.156 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -498684 sc-eQTL 1.07e-01 0.193 0.119 0.156 cMono_S100A L2
ENSG00000162607 USP1 658740 sc-eQTL 1.82e-01 0.165 0.123 0.156 cMono_S100A L2
ENSG00000240563 L1TD1 900188 sc-eQTL 1.60e-01 -0.144 0.102 0.156 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 -498374 sc-eQTL 4.26e-01 -0.116 0.145 0.155 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 -272538 sc-eQTL 4.42e-01 -0.119 0.154 0.155 gdT L2
ENSG00000116641 DOCK7 406651 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0304 0.152 0.155 gdT L2
ENSG00000125703 ATG4C 310905 sc-eQTL 3.86e-01 -0.126 0.145 0.155 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -498684 sc-eQTL 8.59e-01 0.0274 0.154 0.155 gdT L2
ENSG00000162607 USP1 658740 sc-eQTL 2.06e-01 0.184 0.145 0.155 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -428335 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0947 0.151 0.155 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 -498374 sc-eQTL 2.66e-01 -0.148 0.133 0.151 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -272538 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0156 0.124 0.151 intMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 406651 sc-eQTL 2.28e-01 0.152 0.126 0.151 intMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 310905 sc-eQTL 2.75e-01 0.132 0.12 0.151 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -498684 sc-eQTL 4.87e-02 0.261 0.132 0.151 intMono L2
ENSG00000162607 USP1 658740 sc-eQTL 4.51e-01 0.102 0.135 0.151 intMono L2
ENSG00000240563 L1TD1 900188 sc-eQTL 6.65e-02 0.182 0.0987 0.151 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -498374 sc-eQTL 1.79e-02 0.275 0.115 0.158 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -272538 sc-eQTL 7.05e-01 0.0487 0.128 0.158 ncMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 406651 sc-eQTL 8.90e-01 0.0175 0.126 0.158 ncMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 310905 sc-eQTL 2.40e-01 0.139 0.118 0.158 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -498684 sc-eQTL 1.24e-01 -0.19 0.123 0.158 ncMono L2
ENSG00000162607 USP1 658740 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00183 0.126 0.158 ncMono L2
ENSG00000240563 L1TD1 900188 sc-eQTL 3.20e-02 -0.191 0.0885 0.158 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -498374 sc-eQTL 8.07e-01 0.0339 0.138 0.169 pDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -272538 sc-eQTL 3.03e-01 0.139 0.134 0.169 pDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 406651 sc-eQTL 1.59e-01 0.194 0.137 0.169 pDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 310905 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0908 0.123 0.169 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -498684 sc-eQTL 7.93e-01 0.0364 0.139 0.169 pDC L2
ENSG00000162607 USP1 658740 sc-eQTL 1.01e-01 -0.231 0.14 0.169 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -428335 sc-eQTL 9.77e-01 0.00353 0.123 0.169 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -498374 sc-eQTL 3.87e-01 0.104 0.12 0.156 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -272538 sc-eQTL 8.84e-01 0.0194 0.133 0.156 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 406651 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0506 0.115 0.156 B_Memory LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 310905 sc-eQTL 5.25e-01 0.0593 0.0931 0.156 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -498684 sc-eQTL 7.85e-01 0.0335 0.122 0.156 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 658740 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0146 0.119 0.156 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -428335 sc-eQTL 5.22e-01 0.0818 0.128 0.156 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -498374 sc-eQTL 4.71e-01 0.0912 0.126 0.156 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -272538 sc-eQTL 8.74e-01 0.0207 0.13 0.156 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 406651 sc-eQTL 2.28e-01 -0.146 0.121 0.156 B_Naive LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 310905 sc-eQTL 2.89e-01 0.0982 0.0925 0.156 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -498684 sc-eQTL 7.02e-01 0.0502 0.131 0.156 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 658740 sc-eQTL 1.93e-01 -0.147 0.112 0.156 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -428335 sc-eQTL 4.09e-01 -0.109 0.132 0.156 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -498374 sc-eQTL 3.80e-01 -0.105 0.12 0.156 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -272538 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0641 0.116 0.156 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 406651 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0341 0.117 0.156 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 310905 sc-eQTL 9.03e-01 -0.00983 0.0808 0.156 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -498684 sc-eQTL 1.77e-02 0.282 0.118 0.156 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 658740 sc-eQTL 3.10e-01 0.104 0.102 0.156 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000240563 L1TD1 900188 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0694 0.111 0.156 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -498374 sc-eQTL 7.23e-01 0.0405 0.114 0.155 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -272538 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0816 0.13 0.155 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 406651 sc-eQTL 4.49e-01 0.0972 0.128 0.155 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 310905 sc-eQTL 3.11e-01 0.111 0.109 0.155 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -498684 sc-eQTL 7.21e-01 0.0455 0.127 0.155 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 658740 sc-eQTL 6.01e-01 0.0624 0.119 0.155 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000240563 L1TD1 900188 sc-eQTL 3.17e-01 -0.0815 0.0812 0.155 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -498374 sc-eQTL 4.81e-01 0.0689 0.0975 0.155 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -272538 sc-eQTL 1.08e-01 -0.188 0.117 0.155 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 406651 sc-eQTL 9.30e-01 0.00921 0.105 0.155 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 310905 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0586 0.105 0.155 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -498684 sc-eQTL 3.87e-01 0.107 0.124 0.155 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 658740 sc-eQTL 8.75e-01 0.0177 0.113 0.155 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -428335 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00238 0.137 0.155 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079739 PGM1 -498374 eQTL 0.0198 -0.0581 0.0249 0.0 0.0 0.147
ENSG00000116652 DLEU2L -452045 eQTL 0.00979 0.0934 0.0361 0.00216 0.0 0.147

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000079739 PGM1 -498374 1.05e-06 6.42e-07 1.54e-07 4.04e-07 1.05e-07 2.64e-07 6.09e-07 2.62e-07 7.85e-07 3.22e-07 9.73e-07 5.22e-07 9.79e-07 1.54e-07 2.96e-07 3.57e-07 5.34e-07 4.31e-07 3.01e-07 1.91e-07 2.42e-07 5.5e-07 4.06e-07 2.6e-07 9.82e-07 2.4e-07 4.34e-07 2.83e-07 5.41e-07 6.47e-07 3.77e-07 5.93e-08 5.86e-08 2.31e-07 3.35e-07 2.15e-07 1.97e-07 1.06e-07 8.43e-08 1.56e-08 1.22e-07 5.87e-07 4.53e-08 1.76e-08 1.41e-07 1.52e-08 1.13e-07 2.35e-08 5.95e-08