logo

Genes within 1Mb (chr1:63088228:G:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -505183 sc-eQTL 4.66e-01 0.0713 0.0977 0.194 B L1
ENSG00000088035 ALG6 -279347 sc-eQTL 6.23e-02 -0.188 0.1 0.194 B L1
ENSG00000116641 DOCK7 399842 sc-eQTL 3.62e-01 0.0923 0.101 0.194 B L1
ENSG00000125703 ATG4C 304096 sc-eQTL 2.17e-01 -0.0868 0.0702 0.194 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -505493 sc-eQTL 4.59e-01 0.083 0.112 0.194 B L1
ENSG00000162607 USP1 651931 sc-eQTL 2.38e-01 0.115 0.0969 0.194 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -435144 sc-eQTL 1.23e-01 0.177 0.114 0.194 B L1
ENSG00000079739 PGM1 -505183 sc-eQTL 4.03e-01 0.0723 0.0863 0.194 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 -279347 sc-eQTL 5.03e-01 0.0639 0.0953 0.194 CD4T L1
ENSG00000116641 DOCK7 399842 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0519 0.0965 0.194 CD4T L1
ENSG00000125703 ATG4C 304096 sc-eQTL 1.52e-01 -0.112 0.0776 0.194 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -505493 sc-eQTL 4.02e-01 0.0928 0.111 0.194 CD4T L1
ENSG00000162607 USP1 651931 sc-eQTL 2.22e-01 -0.0924 0.0754 0.194 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -435144 sc-eQTL 2.32e-01 -0.119 0.099 0.194 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 -505183 sc-eQTL 2.45e-01 -0.109 0.0937 0.194 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 -279347 sc-eQTL 7.23e-01 0.0368 0.104 0.194 CD8T L1
ENSG00000116641 DOCK7 399842 sc-eQTL 9.49e-01 0.00667 0.105 0.194 CD8T L1
ENSG00000125703 ATG4C 304096 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0146 0.0997 0.194 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -505493 sc-eQTL 8.43e-01 0.0221 0.112 0.194 CD8T L1
ENSG00000162607 USP1 651931 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0502 0.0868 0.194 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -435144 sc-eQTL 6.43e-01 0.0517 0.111 0.194 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 -505183 sc-eQTL 9.84e-02 0.175 0.105 0.194 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 -279347 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0379 0.109 0.194 DC L1
ENSG00000116641 DOCK7 399842 sc-eQTL 3.58e-02 0.234 0.111 0.194 DC L1
ENSG00000125703 ATG4C 304096 sc-eQTL 2.10e-01 0.11 0.0874 0.194 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -505493 sc-eQTL 1.58e-01 0.173 0.122 0.194 DC L1
ENSG00000162607 USP1 651931 sc-eQTL 8.05e-01 0.0264 0.107 0.194 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -435144 sc-eQTL 4.28e-02 0.215 0.106 0.194 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 -505183 sc-eQTL 9.60e-01 0.00522 0.104 0.194 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 -279347 sc-eQTL 1.56e-01 0.154 0.108 0.194 Mono L1
ENSG00000116641 DOCK7 399842 sc-eQTL 2.89e-01 0.112 0.105 0.194 Mono L1
ENSG00000125703 ATG4C 304096 sc-eQTL 9.86e-01 0.00124 0.0712 0.194 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -505493 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0866 0.112 0.194 Mono L1
ENSG00000162607 USP1 651931 sc-eQTL 5.55e-01 0.0546 0.0923 0.194 Mono L1
ENSG00000240563 L1TD1 893379 sc-eQTL 8.30e-01 0.0185 0.0862 0.194 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 -505183 sc-eQTL 9.75e-01 0.00272 0.0875 0.195 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 -279347 sc-eQTL 2.94e-01 -0.108 0.102 0.195 NK L1
ENSG00000116641 DOCK7 399842 sc-eQTL 2.68e-01 0.0936 0.0842 0.195 NK L1
ENSG00000125703 ATG4C 304096 sc-eQTL 4.08e-01 0.0751 0.0906 0.195 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -505493 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0419 0.113 0.195 NK L1
ENSG00000162607 USP1 651931 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0575 0.101 0.195 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -435144 sc-eQTL 1.99e-01 -0.157 0.122 0.195 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 -505183 sc-eQTL 9.29e-01 0.00888 0.1 0.194 Other_T L1
ENSG00000088035 ALG6 -279347 sc-eQTL 5.28e-01 0.0635 0.101 0.194 Other_T L1
ENSG00000116641 DOCK7 399842 sc-eQTL 6.39e-01 0.0482 0.103 0.194 Other_T L1
ENSG00000125703 ATG4C 304096 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0678 0.0888 0.194 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -505493 sc-eQTL 6.25e-01 0.0385 0.0788 0.194 Other_T L1
ENSG00000162607 USP1 651931 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0357 0.0683 0.194 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -435144 sc-eQTL 1.89e-02 -0.284 0.12 0.194 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -505183 sc-eQTL 6.12e-01 0.0682 0.134 0.199 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 -279347 sc-eQTL 9.54e-01 0.00736 0.129 0.199 B_Activated L2
ENSG00000116641 DOCK7 399842 sc-eQTL 4.66e-01 0.0874 0.119 0.199 B_Activated L2
ENSG00000125703 ATG4C 304096 sc-eQTL 4.37e-02 0.253 0.124 0.199 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -505493 sc-eQTL 2.26e-01 0.149 0.122 0.199 B_Activated L2
ENSG00000162607 USP1 651931 sc-eQTL 9.91e-01 0.00142 0.133 0.199 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -435144 sc-eQTL 2.24e-01 0.141 0.116 0.199 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 -505183 sc-eQTL 2.69e-01 0.132 0.119 0.195 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 -279347 sc-eQTL 4.04e-01 0.101 0.121 0.195 B_Intermediate L2
ENSG00000116641 DOCK7 399842 sc-eQTL 3.07e-01 -0.118 0.116 0.195 B_Intermediate L2
ENSG00000125703 ATG4C 304096 sc-eQTL 2.86e-01 -0.105 0.0979 0.195 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -505493 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0575 0.117 0.195 B_Intermediate L2
ENSG00000162607 USP1 651931 sc-eQTL 4.14e-01 0.0954 0.117 0.195 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -435144 sc-eQTL 7.78e-01 0.0326 0.116 0.195 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 -505183 sc-eQTL 2.79e-01 0.128 0.118 0.196 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 -279347 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0337 0.12 0.196 B_Memory L2
ENSG00000116641 DOCK7 399842 sc-eQTL 3.36e-01 0.109 0.113 0.196 B_Memory L2
ENSG00000125703 ATG4C 304096 sc-eQTL 8.99e-01 0.0136 0.107 0.196 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -505493 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00829 0.123 0.196 B_Memory L2
ENSG00000162607 USP1 651931 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0137 0.124 0.196 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -435144 sc-eQTL 9.18e-02 0.205 0.121 0.196 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 -505183 sc-eQTL 9.98e-01 0.00031 0.117 0.194 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 -279347 sc-eQTL 3.16e-01 -0.118 0.117 0.194 B_Naive1 L2
ENSG00000116641 DOCK7 399842 sc-eQTL 3.04e-01 0.116 0.112 0.194 B_Naive1 L2
ENSG00000125703 ATG4C 304096 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0602 0.0865 0.194 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -505493 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0476 0.115 0.194 B_Naive1 L2
ENSG00000162607 USP1 651931 sc-eQTL 1.71e-01 0.138 0.101 0.194 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -435144 sc-eQTL 7.31e-01 0.0422 0.123 0.194 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 -505183 sc-eQTL 3.81e-01 -0.103 0.117 0.195 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 -279347 sc-eQTL 1.24e-02 -0.304 0.121 0.195 B_Naive2 L2
ENSG00000116641 DOCK7 399842 sc-eQTL 1.62e-01 0.164 0.117 0.195 B_Naive2 L2
ENSG00000125703 ATG4C 304096 sc-eQTL 8.51e-01 0.0214 0.113 0.195 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -505493 sc-eQTL 8.13e-02 0.214 0.122 0.195 B_Naive2 L2
ENSG00000162607 USP1 651931 sc-eQTL 5.23e-01 0.0747 0.117 0.195 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -435144 sc-eQTL 8.08e-01 0.0298 0.122 0.195 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 -505183 sc-eQTL 6.51e-01 0.054 0.119 0.191 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -279347 sc-eQTL 6.93e-01 0.0498 0.126 0.191 CD4_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 399842 sc-eQTL 2.55e-02 -0.245 0.109 0.191 CD4_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 304096 sc-eQTL 5.26e-01 0.0723 0.114 0.191 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -505493 sc-eQTL 8.03e-01 0.0304 0.122 0.191 CD4_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 651931 sc-eQTL 5.89e-02 -0.219 0.115 0.191 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -435144 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0529 0.116 0.191 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -505183 sc-eQTL 6.63e-01 0.0429 0.0983 0.194 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -279347 sc-eQTL 3.64e-01 0.0969 0.107 0.194 CD4_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 399842 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0363 0.105 0.194 CD4_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 304096 sc-eQTL 3.23e-01 -0.0917 0.0926 0.194 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -505493 sc-eQTL 4.36e-01 0.0884 0.113 0.194 CD4_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 651931 sc-eQTL 2.83e-01 -0.093 0.0864 0.194 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -435144 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0654 0.112 0.194 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -505183 sc-eQTL 7.69e-01 0.0294 0.0997 0.194 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -279347 sc-eQTL 4.03e-01 -0.097 0.116 0.194 CD4_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 399842 sc-eQTL 9.19e-01 0.0104 0.103 0.194 CD4_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 304096 sc-eQTL 9.67e-02 -0.166 0.0993 0.194 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -505493 sc-eQTL 7.57e-01 0.0365 0.118 0.194 CD4_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 651931 sc-eQTL 6.23e-01 0.0476 0.0965 0.194 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -435144 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0615 0.114 0.194 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -505183 sc-eQTL 1.60e-01 -0.162 0.115 0.194 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -279347 sc-eQTL 1.81e-01 -0.156 0.116 0.194 CD4_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 399842 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0837 0.113 0.194 CD4_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 304096 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0853 0.11 0.194 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -505493 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0169 0.114 0.194 CD4_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 651931 sc-eQTL 7.00e-01 0.0416 0.108 0.194 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -435144 sc-eQTL 2.46e-01 -0.137 0.118 0.194 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -505183 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0483 0.105 0.194 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -279347 sc-eQTL 7.27e-01 -0.039 0.111 0.194 CD8_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 399842 sc-eQTL 8.78e-01 0.0162 0.106 0.194 CD8_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 304096 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0269 0.113 0.194 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -505493 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0118 0.117 0.194 CD8_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 651931 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0732 0.105 0.194 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -435144 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0858 0.12 0.194 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -505183 sc-eQTL 8.59e-01 0.0193 0.108 0.194 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -279347 sc-eQTL 3.15e-01 -0.113 0.112 0.194 CD8_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 399842 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00132 0.116 0.194 CD8_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 304096 sc-eQTL 6.51e-01 0.0504 0.111 0.194 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -505493 sc-eQTL 9.28e-01 -0.0102 0.113 0.194 CD8_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 651931 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0342 0.0953 0.194 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -435144 sc-eQTL 6.35e-01 0.0506 0.106 0.194 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -505183 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0284 0.118 0.197 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -279347 sc-eQTL 8.41e-02 0.206 0.118 0.197 CD8_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 399842 sc-eQTL 6.56e-01 0.0519 0.116 0.197 CD8_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 304096 sc-eQTL 3.64e-02 -0.248 0.118 0.197 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -505493 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0127 0.116 0.197 CD8_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 651931 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0259 0.111 0.197 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -435144 sc-eQTL 3.55e-01 -0.109 0.118 0.197 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -505183 sc-eQTL 1.46e-01 0.169 0.116 0.199 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -279347 sc-eQTL 6.08e-01 0.06 0.117 0.199 CD8_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 399842 sc-eQTL 8.18e-02 0.197 0.112 0.199 CD8_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 304096 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0742 0.109 0.199 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -505493 sc-eQTL 6.83e-01 0.0482 0.118 0.199 CD8_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 651931 sc-eQTL 6.37e-01 0.0531 0.112 0.199 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -435144 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0324 0.114 0.199 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -505183 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00425 0.114 0.195 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 -279347 sc-eQTL 6.71e-01 0.048 0.113 0.195 MAIT L2
ENSG00000116641 DOCK7 399842 sc-eQTL 8.97e-01 0.014 0.108 0.195 MAIT L2
ENSG00000125703 ATG4C 304096 sc-eQTL 1.63e-01 -0.159 0.113 0.195 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -505493 sc-eQTL 9.50e-01 0.00712 0.114 0.195 MAIT L2
ENSG00000162607 USP1 651931 sc-eQTL 4.43e-01 -0.087 0.113 0.195 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -435144 sc-eQTL 1.11e-01 -0.187 0.117 0.195 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 -505183 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0138 0.115 0.191 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 -279347 sc-eQTL 9.48e-01 0.00771 0.117 0.191 NK_CD56bright L2
ENSG00000116641 DOCK7 399842 sc-eQTL 1.83e-01 0.135 0.101 0.191 NK_CD56bright L2
ENSG00000125703 ATG4C 304096 sc-eQTL 9.93e-01 -0.00101 0.114 0.191 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -505493 sc-eQTL 8.79e-01 0.018 0.118 0.191 NK_CD56bright L2
ENSG00000162607 USP1 651931 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0861 0.122 0.191 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -435144 sc-eQTL 7.96e-01 0.0302 0.117 0.191 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 -505183 sc-eQTL 2.62e-01 -0.102 0.0905 0.194 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 -279347 sc-eQTL 3.51e-01 -0.107 0.115 0.194 NK_CD56dim L2
ENSG00000116641 DOCK7 399842 sc-eQTL 1.33e-01 0.15 0.0996 0.194 NK_CD56dim L2
ENSG00000125703 ATG4C 304096 sc-eQTL 8.60e-01 0.0179 0.102 0.194 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -505493 sc-eQTL 3.69e-01 -0.104 0.116 0.194 NK_CD56dim L2
ENSG00000162607 USP1 651931 sc-eQTL 8.85e-01 0.0163 0.112 0.194 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -435144 sc-eQTL 9.41e-02 -0.209 0.124 0.194 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 -505183 sc-eQTL 1.88e-01 0.165 0.125 0.192 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 -279347 sc-eQTL 5.82e-02 -0.246 0.129 0.192 NK_HLA L2
ENSG00000116641 DOCK7 399842 sc-eQTL 3.46e-01 -0.094 0.0995 0.192 NK_HLA L2
ENSG00000125703 ATG4C 304096 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0635 0.116 0.192 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -505493 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00414 0.122 0.192 NK_HLA L2
ENSG00000162607 USP1 651931 sc-eQTL 4.30e-01 0.101 0.127 0.192 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -435144 sc-eQTL 5.87e-01 0.063 0.116 0.192 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 -505183 sc-eQTL 5.48e-01 0.0606 0.101 0.194 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 -279347 sc-eQTL 8.44e-01 0.0224 0.114 0.194 NK_cytokine L2
ENSG00000116641 DOCK7 399842 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0894 0.105 0.194 NK_cytokine L2
ENSG00000125703 ATG4C 304096 sc-eQTL 8.76e-01 0.0169 0.108 0.194 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -505493 sc-eQTL 2.30e-01 0.134 0.111 0.194 NK_cytokine L2
ENSG00000162607 USP1 651931 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0917 0.117 0.194 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -435144 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0531 0.119 0.194 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 -505183 sc-eQTL 3.84e-01 0.12 0.138 0.196 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 -279347 sc-eQTL 8.49e-01 0.0277 0.145 0.196 PB L2
ENSG00000116641 DOCK7 399842 sc-eQTL 9.64e-01 0.007 0.155 0.196 PB L2
ENSG00000125703 ATG4C 304096 sc-eQTL 5.80e-01 -0.075 0.135 0.196 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -505493 sc-eQTL 2.09e-01 0.169 0.134 0.196 PB L2
ENSG00000162607 USP1 651931 sc-eQTL 5.76e-01 0.0753 0.134 0.196 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -435144 sc-eQTL 9.24e-01 -0.0142 0.148 0.196 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 -505183 sc-eQTL 3.31e-02 0.223 0.104 0.193 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 -279347 sc-eQTL 9.62e-01 0.00512 0.107 0.193 Pro_T L2
ENSG00000116641 DOCK7 399842 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0175 0.107 0.193 Pro_T L2
ENSG00000125703 ATG4C 304096 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0194 0.094 0.193 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -505493 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0128 0.0943 0.193 Pro_T L2
ENSG00000162607 USP1 651931 sc-eQTL 9.79e-01 0.00173 0.0648 0.193 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -435144 sc-eQTL 2.84e-01 -0.117 0.109 0.193 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 -505183 sc-eQTL 7.34e-02 0.201 0.112 0.194 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 -279347 sc-eQTL 6.24e-01 0.0589 0.12 0.194 Treg L2
ENSG00000116641 DOCK7 399842 sc-eQTL 9.14e-01 0.0119 0.11 0.194 Treg L2
ENSG00000125703 ATG4C 304096 sc-eQTL 6.90e-02 -0.204 0.112 0.194 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -505493 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0773 0.118 0.194 Treg L2
ENSG00000162607 USP1 651931 sc-eQTL 3.34e-01 0.11 0.114 0.194 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -435144 sc-eQTL 4.28e-01 0.0896 0.113 0.194 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 -505183 sc-eQTL 1.30e-01 0.17 0.112 0.193 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -279347 sc-eQTL 8.40e-01 0.023 0.114 0.193 cDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 399842 sc-eQTL 2.77e-03 0.331 0.109 0.193 cDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 304096 sc-eQTL 6.66e-01 0.042 0.0972 0.193 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -505493 sc-eQTL 1.84e-01 0.164 0.123 0.193 cDC L2
ENSG00000162607 USP1 651931 sc-eQTL 7.14e-01 0.0403 0.11 0.193 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -435144 sc-eQTL 8.85e-01 0.0143 0.099 0.193 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 -505183 sc-eQTL 6.78e-01 0.0451 0.108 0.194 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 -279347 sc-eQTL 2.27e-01 0.131 0.108 0.194 cMono_IL1B L2
ENSG00000116641 DOCK7 399842 sc-eQTL 2.86e-01 0.122 0.114 0.194 cMono_IL1B L2
ENSG00000125703 ATG4C 304096 sc-eQTL 2.57e-01 0.0914 0.0803 0.194 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -505493 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0868 0.114 0.194 cMono_IL1B L2
ENSG00000162607 USP1 651931 sc-eQTL 4.81e-01 0.071 0.101 0.194 cMono_IL1B L2
ENSG00000240563 L1TD1 893379 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0479 0.101 0.194 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 -505183 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0616 0.119 0.194 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 -279347 sc-eQTL 2.75e-01 0.132 0.121 0.194 cMono_S100A L2
ENSG00000116641 DOCK7 399842 sc-eQTL 3.83e-01 0.098 0.112 0.194 cMono_S100A L2
ENSG00000125703 ATG4C 304096 sc-eQTL 1.33e-01 -0.146 0.0967 0.194 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -505493 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0389 0.11 0.194 cMono_S100A L2
ENSG00000162607 USP1 651931 sc-eQTL 2.60e-01 -0.127 0.113 0.194 cMono_S100A L2
ENSG00000240563 L1TD1 893379 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0101 0.0939 0.194 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 -505183 sc-eQTL 4.91e-01 0.0906 0.131 0.2 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 -279347 sc-eQTL 4.28e-01 -0.111 0.14 0.2 gdT L2
ENSG00000116641 DOCK7 399842 sc-eQTL 9.27e-01 -0.0126 0.137 0.2 gdT L2
ENSG00000125703 ATG4C 304096 sc-eQTL 8.37e-02 -0.226 0.13 0.2 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -505493 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0344 0.139 0.2 gdT L2
ENSG00000162607 USP1 651931 sc-eQTL 9.17e-01 0.0139 0.132 0.2 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -435144 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0535 0.137 0.2 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 -505183 sc-eQTL 1.92e-01 -0.161 0.123 0.2 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -279347 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0438 0.115 0.2 intMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 399842 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0739 0.118 0.2 intMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 304096 sc-eQTL 7.57e-01 0.0348 0.112 0.2 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -505493 sc-eQTL 5.83e-02 0.234 0.123 0.2 intMono L2
ENSG00000162607 USP1 651931 sc-eQTL 8.32e-02 0.217 0.125 0.2 intMono L2
ENSG00000240563 L1TD1 893379 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00504 0.0926 0.2 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -505183 sc-eQTL 1.46e-01 -0.16 0.11 0.199 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -279347 sc-eQTL 6.29e-01 0.0586 0.121 0.199 ncMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 399842 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0347 0.119 0.199 ncMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 304096 sc-eQTL 4.81e-01 0.0785 0.111 0.199 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -505493 sc-eQTL 9.30e-01 -0.0103 0.117 0.199 ncMono L2
ENSG00000162607 USP1 651931 sc-eQTL 5.01e-01 0.0802 0.119 0.199 ncMono L2
ENSG00000240563 L1TD1 893379 sc-eQTL 3.75e-01 0.0749 0.0843 0.199 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -505183 sc-eQTL 4.50e-01 0.0967 0.127 0.203 pDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -279347 sc-eQTL 1.82e-01 0.166 0.124 0.203 pDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 399842 sc-eQTL 8.74e-01 0.0202 0.127 0.203 pDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 304096 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0771 0.114 0.203 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -505493 sc-eQTL 3.37e-01 0.123 0.128 0.203 pDC L2
ENSG00000162607 USP1 651931 sc-eQTL 9.76e-01 0.00393 0.13 0.203 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -435144 sc-eQTL 2.80e-02 0.247 0.111 0.203 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -505183 sc-eQTL 5.33e-02 0.214 0.11 0.194 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -279347 sc-eQTL 6.38e-01 0.0578 0.123 0.194 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 399842 sc-eQTL 9.03e-01 0.013 0.107 0.194 B_Memory LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 304096 sc-eQTL 5.80e-01 0.0477 0.0861 0.194 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -505493 sc-eQTL 8.46e-01 -0.022 0.113 0.194 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 651931 sc-eQTL 6.30e-01 0.053 0.11 0.194 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -435144 sc-eQTL 1.34e-01 0.177 0.117 0.194 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -505183 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0754 0.113 0.194 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -279347 sc-eQTL 2.61e-02 -0.258 0.115 0.194 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 399842 sc-eQTL 1.43e-01 0.159 0.108 0.194 B_Naive LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 304096 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0362 0.0829 0.194 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -505493 sc-eQTL 3.44e-01 0.111 0.117 0.194 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 651931 sc-eQTL 4.42e-01 0.0774 0.101 0.194 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -435144 sc-eQTL 5.57e-01 0.0694 0.118 0.194 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -505183 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0201 0.111 0.194 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -279347 sc-eQTL 9.64e-02 0.178 0.107 0.194 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 399842 sc-eQTL 9.77e-02 0.179 0.107 0.194 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 304096 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0267 0.0747 0.194 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -505493 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0762 0.11 0.194 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 651931 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0158 0.0944 0.194 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000240563 L1TD1 893379 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0416 0.102 0.194 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -505183 sc-eQTL 3.78e-01 -0.0937 0.106 0.196 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -279347 sc-eQTL 7.30e-01 0.0416 0.121 0.196 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 399842 sc-eQTL 2.59e-01 -0.135 0.119 0.196 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 304096 sc-eQTL 3.78e-01 0.0897 0.102 0.196 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -505493 sc-eQTL 1.91e-01 0.155 0.118 0.196 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 651931 sc-eQTL 1.19e-01 0.173 0.11 0.196 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000240563 L1TD1 893379 sc-eQTL 4.87e-01 0.0527 0.0757 0.196 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -505183 sc-eQTL 8.74e-01 0.0142 0.0896 0.194 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -279347 sc-eQTL 1.35e-01 -0.16 0.107 0.194 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 399842 sc-eQTL 4.12e-01 0.0791 0.0962 0.194 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 304096 sc-eQTL 5.50e-01 0.0575 0.0961 0.194 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -505493 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00804 0.114 0.194 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 651931 sc-eQTL 9.43e-01 0.00747 0.103 0.194 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -435144 sc-eQTL 1.28e-01 -0.191 0.125 0.194 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000162607 USP1 651931 eQTL 0.00512 -0.0456 0.0163 0.00249 0.0 0.187

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000162607 USP1 651931 2.76e-07 1.7e-07 3.72e-08 2.27e-07 1.01e-07 9.91e-08 1.81e-07 5.2e-08 1.45e-07 6.08e-08 1.67e-07 8.68e-08 1.79e-07 8.66e-08 6.12e-08 7.3e-08 4.18e-08 1.27e-07 6.92e-08 4e-08 1.21e-07 1.28e-07 1.58e-07 3.79e-08 2.02e-07 1.21e-07 1.06e-07 9.61e-08 1.12e-07 1.03e-07 1.06e-07 4.07e-08 3.3e-08 1.03e-07 4.04e-08 3.76e-08 5.65e-08 9.23e-08 6.33e-08 8.09e-08 3.59e-08 1.59e-07 5.2e-08 1.8e-07 3.2e-08 1.55e-08 1.22e-07 1.89e-09 4.9e-08