logo

Genes within 1Mb (chr1:63076304:G:GGATT):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -517107 sc-eQTL 9.31e-02 -0.155 0.0921 0.265 B L1
ENSG00000088035 ALG6 -291271 sc-eQTL 3.31e-01 0.0934 0.0959 0.265 B L1
ENSG00000116641 DOCK7 387918 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0245 0.0961 0.265 B L1
ENSG00000125703 ATG4C 292172 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0316 0.0667 0.265 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -517417 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0529 0.106 0.265 B L1
ENSG00000162607 USP1 640007 sc-eQTL 3.20e-01 -0.0917 0.092 0.265 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -447068 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0222 0.109 0.265 B L1
ENSG00000079739 PGM1 -517107 sc-eQTL 2.72e-01 -0.0881 0.08 0.265 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 -291271 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0689 0.0885 0.265 CD4T L1
ENSG00000116641 DOCK7 387918 sc-eQTL 2.79e-01 -0.0971 0.0894 0.265 CD4T L1
ENSG00000125703 ATG4C 292172 sc-eQTL 3.84e-01 -0.063 0.0723 0.265 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -517417 sc-eQTL 1.66e-01 -0.142 0.102 0.265 CD4T L1
ENSG00000162607 USP1 640007 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0166 0.0703 0.265 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -447068 sc-eQTL 1.20e-01 -0.143 0.0918 0.265 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 -517107 sc-eQTL 6.70e-03 -0.241 0.0879 0.265 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 -291271 sc-eQTL 3.20e-01 0.0981 0.0983 0.265 CD8T L1
ENSG00000116641 DOCK7 387918 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0846 0.0997 0.265 CD8T L1
ENSG00000125703 ATG4C 292172 sc-eQTL 9.72e-02 0.157 0.0943 0.265 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -517417 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0807 0.106 0.265 CD8T L1
ENSG00000162607 USP1 640007 sc-eQTL 2.19e-02 -0.188 0.0816 0.265 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -447068 sc-eQTL 3.61e-02 -0.221 0.105 0.265 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 -517107 sc-eQTL 2.10e-01 -0.124 0.0983 0.268 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 -291271 sc-eQTL 3.68e-01 -0.0917 0.102 0.268 DC L1
ENSG00000116641 DOCK7 387918 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0179 0.104 0.268 DC L1
ENSG00000125703 ATG4C 292172 sc-eQTL 9.29e-01 -0.00732 0.0817 0.268 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -517417 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0229 0.114 0.268 DC L1
ENSG00000162607 USP1 640007 sc-eQTL 6.25e-01 0.0488 0.0997 0.268 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -447068 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0361 0.0994 0.268 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 -517107 sc-eQTL 2.71e-02 -0.21 0.0943 0.265 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 -291271 sc-eQTL 2.94e-01 -0.104 0.0992 0.265 Mono L1
ENSG00000116641 DOCK7 387918 sc-eQTL 8.29e-01 0.0208 0.0962 0.265 Mono L1
ENSG00000125703 ATG4C 292172 sc-eQTL 9.57e-01 0.00352 0.065 0.265 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -517417 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0318 0.103 0.265 Mono L1
ENSG00000162607 USP1 640007 sc-eQTL 1.76e-01 0.114 0.084 0.265 Mono L1
ENSG00000240563 L1TD1 881455 sc-eQTL 2.53e-01 0.09 0.0785 0.265 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 -517107 sc-eQTL 9.32e-01 0.00705 0.082 0.266 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 -291271 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00664 0.0961 0.266 NK L1
ENSG00000116641 DOCK7 387918 sc-eQTL 3.67e-03 -0.228 0.0776 0.266 NK L1
ENSG00000125703 ATG4C 292172 sc-eQTL 9.19e-01 0.0087 0.085 0.266 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -517417 sc-eQTL 5.75e-02 -0.2 0.105 0.266 NK L1
ENSG00000162607 USP1 640007 sc-eQTL 4.74e-01 0.0676 0.0943 0.266 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -447068 sc-eQTL 2.07e-02 0.264 0.113 0.266 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 -517107 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0575 0.0928 0.265 Other_T L1
ENSG00000088035 ALG6 -291271 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0566 0.0932 0.265 Other_T L1
ENSG00000116641 DOCK7 387918 sc-eQTL 8.51e-01 -0.018 0.0952 0.265 Other_T L1
ENSG00000125703 ATG4C 292172 sc-eQTL 3.59e-01 0.0757 0.0823 0.265 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -517417 sc-eQTL 9.26e-01 0.00679 0.0731 0.265 Other_T L1
ENSG00000162607 USP1 640007 sc-eQTL 5.38e-01 0.0391 0.0633 0.265 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -447068 sc-eQTL 5.25e-01 0.0718 0.113 0.265 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -517107 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0762 0.121 0.273 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 -291271 sc-eQTL 3.48e-02 -0.244 0.115 0.273 B_Activated L2
ENSG00000116641 DOCK7 387918 sc-eQTL 1.02e-01 -0.176 0.107 0.273 B_Activated L2
ENSG00000125703 ATG4C 292172 sc-eQTL 1.75e-01 0.154 0.113 0.273 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -517417 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0566 0.111 0.273 B_Activated L2
ENSG00000162607 USP1 640007 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00126 0.121 0.273 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -447068 sc-eQTL 4.05e-01 0.0878 0.105 0.273 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 -517107 sc-eQTL 3.66e-01 -0.0998 0.11 0.264 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 -291271 sc-eQTL 2.29e-01 0.135 0.112 0.264 B_Intermediate L2
ENSG00000116641 DOCK7 387918 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0151 0.107 0.264 B_Intermediate L2
ENSG00000125703 ATG4C 292172 sc-eQTL 9.58e-01 0.0048 0.0906 0.264 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -517417 sc-eQTL 2.27e-01 0.13 0.108 0.264 B_Intermediate L2
ENSG00000162607 USP1 640007 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00389 0.108 0.264 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -447068 sc-eQTL 3.74e-02 0.222 0.106 0.264 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 -517107 sc-eQTL 6.48e-01 0.0496 0.109 0.267 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 -291271 sc-eQTL 6.15e-01 0.0557 0.11 0.267 B_Memory L2
ENSG00000116641 DOCK7 387918 sc-eQTL 5.84e-01 0.0567 0.104 0.267 B_Memory L2
ENSG00000125703 ATG4C 292172 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0416 0.0985 0.267 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -517417 sc-eQTL 7.23e-01 -0.04 0.113 0.267 B_Memory L2
ENSG00000162607 USP1 640007 sc-eQTL 2.37e-01 -0.135 0.113 0.267 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -447068 sc-eQTL 7.15e-01 0.0409 0.112 0.267 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 -517107 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0803 0.11 0.265 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 -291271 sc-eQTL 8.57e-01 0.0199 0.11 0.265 B_Naive1 L2
ENSG00000116641 DOCK7 387918 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0453 0.106 0.265 B_Naive1 L2
ENSG00000125703 ATG4C 292172 sc-eQTL 7.98e-01 0.0208 0.0813 0.265 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -517417 sc-eQTL 6.46e-02 -0.199 0.107 0.265 B_Naive1 L2
ENSG00000162607 USP1 640007 sc-eQTL 2.59e-01 -0.107 0.0946 0.265 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -447068 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0189 0.115 0.265 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 -517107 sc-eQTL 7.87e-02 -0.192 0.108 0.266 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 -291271 sc-eQTL 8.35e-01 0.0237 0.114 0.266 B_Naive2 L2
ENSG00000116641 DOCK7 387918 sc-eQTL 7.39e-01 0.0366 0.109 0.266 B_Naive2 L2
ENSG00000125703 ATG4C 292172 sc-eQTL 1.59e-01 0.148 0.105 0.266 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -517417 sc-eQTL 7.80e-03 0.302 0.112 0.266 B_Naive2 L2
ENSG00000162607 USP1 640007 sc-eQTL 2.86e-01 -0.116 0.109 0.266 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -447068 sc-eQTL 1.80e-01 -0.152 0.113 0.266 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 -517107 sc-eQTL 9.18e-01 -0.0116 0.113 0.268 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -291271 sc-eQTL 8.94e-01 0.0159 0.119 0.268 CD4_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 387918 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00228 0.104 0.268 CD4_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 292172 sc-eQTL 1.04e-01 -0.175 0.107 0.268 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -517417 sc-eQTL 4.62e-01 -0.085 0.115 0.268 CD4_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 640007 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0466 0.11 0.268 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -447068 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00872 0.11 0.268 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -517107 sc-eQTL 1.22e-01 -0.139 0.0896 0.265 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -291271 sc-eQTL 3.16e-01 -0.0982 0.0976 0.265 CD4_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 387918 sc-eQTL 1.90e-01 -0.126 0.0958 0.265 CD4_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 292172 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00438 0.085 0.265 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -517417 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0816 0.104 0.265 CD4_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 640007 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0171 0.0794 0.265 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -447068 sc-eQTL 2.75e-01 -0.113 0.103 0.265 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -517107 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0761 0.0933 0.265 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -291271 sc-eQTL 9.00e-01 0.0137 0.109 0.265 CD4_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 387918 sc-eQTL 5.22e-01 0.0616 0.0961 0.265 CD4_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 292172 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0306 0.0936 0.265 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -517417 sc-eQTL 2.29e-01 -0.133 0.11 0.265 CD4_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 640007 sc-eQTL 4.15e-01 0.0738 0.0903 0.265 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -447068 sc-eQTL 2.15e-02 -0.244 0.105 0.265 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -517107 sc-eQTL 2.00e-01 0.142 0.11 0.265 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -291271 sc-eQTL 6.44e-01 0.0514 0.111 0.265 CD4_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 387918 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0201 0.108 0.265 CD4_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 292172 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0689 0.105 0.265 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -517417 sc-eQTL 5.03e-02 -0.212 0.108 0.265 CD4_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 640007 sc-eQTL 1.51e-01 -0.148 0.102 0.265 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -447068 sc-eQTL 3.46e-01 -0.106 0.112 0.265 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -517107 sc-eQTL 2.64e-01 -0.112 0.1 0.265 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -291271 sc-eQTL 6.60e-01 0.047 0.107 0.265 CD8_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 387918 sc-eQTL 3.15e-01 -0.102 0.101 0.265 CD8_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 292172 sc-eQTL 4.60e-01 0.0798 0.108 0.265 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -517417 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0426 0.112 0.265 CD8_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 640007 sc-eQTL 1.87e-02 -0.235 0.0993 0.265 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -447068 sc-eQTL 4.09e-01 -0.095 0.115 0.265 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -517107 sc-eQTL 1.64e-02 -0.243 0.1 0.265 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -291271 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0332 0.105 0.265 CD8_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 387918 sc-eQTL 7.91e-02 -0.191 0.108 0.265 CD8_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 292172 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0783 0.104 0.265 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -517417 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0219 0.106 0.265 CD8_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 640007 sc-eQTL 4.89e-02 -0.176 0.0888 0.265 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -447068 sc-eQTL 2.85e-02 -0.218 0.0988 0.265 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -517107 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0254 0.115 0.273 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -291271 sc-eQTL 6.56e-01 0.0518 0.116 0.273 CD8_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 387918 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0302 0.113 0.273 CD8_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 292172 sc-eQTL 1.18e-01 0.181 0.115 0.273 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -517417 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0464 0.112 0.273 CD8_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 640007 sc-eQTL 3.03e-01 -0.111 0.108 0.273 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -447068 sc-eQTL 9.31e-01 0.00996 0.115 0.273 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -517107 sc-eQTL 8.44e-01 0.0223 0.113 0.265 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -291271 sc-eQTL 7.29e-02 0.202 0.112 0.265 CD8_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 387918 sc-eQTL 7.15e-02 0.197 0.109 0.265 CD8_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 292172 sc-eQTL 2.30e-01 0.126 0.105 0.265 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -517417 sc-eQTL 8.88e-01 0.0161 0.114 0.265 CD8_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 640007 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0848 0.109 0.265 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -447068 sc-eQTL 2.04e-01 -0.141 0.11 0.265 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -517107 sc-eQTL 6.98e-01 0.0408 0.105 0.268 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 -291271 sc-eQTL 5.87e-02 -0.196 0.103 0.268 MAIT L2
ENSG00000116641 DOCK7 387918 sc-eQTL 3.69e-01 -0.0896 0.0995 0.268 MAIT L2
ENSG00000125703 ATG4C 292172 sc-eQTL 4.77e-02 -0.207 0.104 0.268 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -517417 sc-eQTL 8.03e-01 0.0263 0.105 0.268 MAIT L2
ENSG00000162607 USP1 640007 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0457 0.104 0.268 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -447068 sc-eQTL 4.92e-01 0.0746 0.108 0.268 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 -517107 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0847 0.108 0.267 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 -291271 sc-eQTL 6.44e-01 0.0514 0.111 0.267 NK_CD56bright L2
ENSG00000116641 DOCK7 387918 sc-eQTL 1.23e-01 -0.148 0.0957 0.267 NK_CD56bright L2
ENSG00000125703 ATG4C 292172 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0557 0.107 0.267 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -517417 sc-eQTL 8.01e-01 0.0283 0.112 0.267 NK_CD56bright L2
ENSG00000162607 USP1 640007 sc-eQTL 8.39e-01 0.0235 0.115 0.267 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -447068 sc-eQTL 3.86e-01 0.0959 0.11 0.267 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 -517107 sc-eQTL 6.64e-01 0.0371 0.0854 0.267 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 -291271 sc-eQTL 5.35e-01 0.0672 0.108 0.267 NK_CD56dim L2
ENSG00000116641 DOCK7 387918 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0344 0.0943 0.267 NK_CD56dim L2
ENSG00000125703 ATG4C 292172 sc-eQTL 3.14e-01 0.0964 0.0956 0.267 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -517417 sc-eQTL 4.40e-02 -0.219 0.108 0.267 NK_CD56dim L2
ENSG00000162607 USP1 640007 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00468 0.106 0.267 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -447068 sc-eQTL 2.50e-01 0.136 0.117 0.267 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 -517107 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0413 0.119 0.272 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 -291271 sc-eQTL 1.59e-01 -0.173 0.123 0.272 NK_HLA L2
ENSG00000116641 DOCK7 387918 sc-eQTL 5.91e-01 0.0506 0.0941 0.272 NK_HLA L2
ENSG00000125703 ATG4C 292172 sc-eQTL 6.35e-02 0.203 0.109 0.272 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -517417 sc-eQTL 3.86e-01 -0.0997 0.115 0.272 NK_HLA L2
ENSG00000162607 USP1 640007 sc-eQTL 2.40e-01 0.141 0.12 0.272 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -447068 sc-eQTL 2.97e-01 0.114 0.109 0.272 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 -517107 sc-eQTL 6.51e-01 0.0419 0.0925 0.267 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 -291271 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00144 0.105 0.267 NK_cytokine L2
ENSG00000116641 DOCK7 387918 sc-eQTL 4.08e-03 -0.276 0.095 0.267 NK_cytokine L2
ENSG00000125703 ATG4C 292172 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0569 0.0991 0.267 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -517417 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0778 0.103 0.267 NK_cytokine L2
ENSG00000162607 USP1 640007 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0311 0.108 0.267 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -447068 sc-eQTL 3.65e-02 0.228 0.108 0.267 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 -517107 sc-eQTL 9.14e-02 -0.211 0.124 0.278 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 -291271 sc-eQTL 7.49e-01 0.0423 0.132 0.278 PB L2
ENSG00000116641 DOCK7 387918 sc-eQTL 9.06e-01 0.0167 0.141 0.278 PB L2
ENSG00000125703 ATG4C 292172 sc-eQTL 5.42e-02 -0.236 0.121 0.278 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -517417 sc-eQTL 2.07e-01 0.155 0.122 0.278 PB L2
ENSG00000162607 USP1 640007 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0332 0.122 0.278 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -447068 sc-eQTL 8.24e-03 -0.352 0.131 0.278 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 -517107 sc-eQTL 3.66e-01 -0.0914 0.101 0.267 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 -291271 sc-eQTL 8.37e-01 0.0211 0.103 0.267 Pro_T L2
ENSG00000116641 DOCK7 387918 sc-eQTL 7.32e-03 0.275 0.101 0.267 Pro_T L2
ENSG00000125703 ATG4C 292172 sc-eQTL 9.56e-02 0.15 0.0897 0.267 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -517417 sc-eQTL 3.82e-01 -0.0791 0.0904 0.267 Pro_T L2
ENSG00000162607 USP1 640007 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0514 0.0622 0.267 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -447068 sc-eQTL 8.60e-01 0.0185 0.105 0.267 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 -517107 sc-eQTL 1.16e-01 -0.165 0.104 0.265 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 -291271 sc-eQTL 3.36e-01 -0.108 0.112 0.265 Treg L2
ENSG00000116641 DOCK7 387918 sc-eQTL 3.83e-01 -0.0899 0.103 0.265 Treg L2
ENSG00000125703 ATG4C 292172 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0354 0.105 0.265 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -517417 sc-eQTL 5.75e-01 0.0618 0.11 0.265 Treg L2
ENSG00000162607 USP1 640007 sc-eQTL 1.35e-01 -0.159 0.106 0.265 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -447068 sc-eQTL 4.78e-03 0.295 0.103 0.265 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 -517107 sc-eQTL 1.92e-01 -0.138 0.106 0.263 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -291271 sc-eQTL 4.63e-01 0.0791 0.107 0.263 cDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 387918 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0672 0.105 0.263 cDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 292172 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0672 0.0916 0.263 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -517417 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0442 0.116 0.263 cDC L2
ENSG00000162607 USP1 640007 sc-eQTL 4.13e-01 0.0848 0.103 0.263 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -447068 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0804 0.0932 0.263 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 -517107 sc-eQTL 6.58e-02 -0.183 0.0992 0.265 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 -291271 sc-eQTL 3.70e-01 -0.0898 0.0999 0.265 cMono_IL1B L2
ENSG00000116641 DOCK7 387918 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0339 0.106 0.265 cMono_IL1B L2
ENSG00000125703 ATG4C 292172 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0192 0.0742 0.265 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -517417 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00257 0.105 0.265 cMono_IL1B L2
ENSG00000162607 USP1 640007 sc-eQTL 5.97e-01 0.0491 0.0927 0.265 cMono_IL1B L2
ENSG00000240563 L1TD1 881455 sc-eQTL 7.43e-02 0.166 0.0925 0.265 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 -517107 sc-eQTL 4.93e-02 -0.215 0.108 0.265 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 -291271 sc-eQTL 1.15e-01 -0.175 0.11 0.265 cMono_S100A L2
ENSG00000116641 DOCK7 387918 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00676 0.103 0.265 cMono_S100A L2
ENSG00000125703 ATG4C 292172 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0496 0.089 0.265 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -517417 sc-eQTL 8.73e-01 0.016 0.1 0.265 cMono_S100A L2
ENSG00000162607 USP1 640007 sc-eQTL 8.75e-01 0.0162 0.103 0.265 cMono_S100A L2
ENSG00000240563 L1TD1 881455 sc-eQTL 1.50e-01 0.124 0.0856 0.265 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 -517107 sc-eQTL 3.21e-01 -0.128 0.129 0.276 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 -291271 sc-eQTL 7.59e-01 0.0422 0.137 0.276 gdT L2
ENSG00000116641 DOCK7 387918 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0368 0.135 0.276 gdT L2
ENSG00000125703 ATG4C 292172 sc-eQTL 7.81e-01 0.0358 0.129 0.276 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -517417 sc-eQTL 1.03e-01 -0.223 0.136 0.276 gdT L2
ENSG00000162607 USP1 640007 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0442 0.13 0.276 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -447068 sc-eQTL 2.18e-02 0.307 0.132 0.276 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 -517107 sc-eQTL 3.47e-01 -0.105 0.111 0.269 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -291271 sc-eQTL 4.39e-02 0.209 0.103 0.269 intMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 387918 sc-eQTL 9.86e-01 0.00185 0.106 0.269 intMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 292172 sc-eQTL 3.75e-02 0.21 0.1 0.269 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -517417 sc-eQTL 6.90e-01 0.0446 0.112 0.269 intMono L2
ENSG00000162607 USP1 640007 sc-eQTL 3.94e-01 0.0969 0.113 0.269 intMono L2
ENSG00000240563 L1TD1 881455 sc-eQTL 8.18e-01 0.0193 0.0836 0.269 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -517107 sc-eQTL 9.90e-01 0.00127 0.103 0.265 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -291271 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0571 0.113 0.265 ncMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 387918 sc-eQTL 7.61e-01 0.0337 0.111 0.265 ncMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 292172 sc-eQTL 6.21e-01 0.0513 0.104 0.265 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -517417 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0133 0.108 0.265 ncMono L2
ENSG00000162607 USP1 640007 sc-eQTL 4.32e-02 0.223 0.11 0.265 ncMono L2
ENSG00000240563 L1TD1 881455 sc-eQTL 8.56e-01 0.0142 0.0785 0.265 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -517107 sc-eQTL 8.14e-02 -0.201 0.115 0.28 pDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -291271 sc-eQTL 1.18e-01 -0.176 0.112 0.28 pDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 387918 sc-eQTL 5.03e-01 0.0773 0.115 0.28 pDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 292172 sc-eQTL 8.17e-01 0.024 0.103 0.28 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -517417 sc-eQTL 5.57e-01 0.0683 0.116 0.28 pDC L2
ENSG00000162607 USP1 640007 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0161 0.118 0.28 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -447068 sc-eQTL 2.35e-01 -0.122 0.102 0.28 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -517107 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0365 0.102 0.265 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -291271 sc-eQTL 4.12e-01 0.0928 0.113 0.265 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 387918 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00769 0.0982 0.265 B_Memory LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 292172 sc-eQTL 9.31e-01 0.00685 0.0793 0.265 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -517417 sc-eQTL 4.44e-01 0.0798 0.104 0.265 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 640007 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0605 0.101 0.265 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -447068 sc-eQTL 6.79e-02 0.198 0.108 0.265 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -517107 sc-eQTL 9.82e-02 -0.176 0.106 0.265 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -291271 sc-eQTL 7.92e-01 0.0291 0.11 0.265 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 387918 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0764 0.103 0.265 B_Naive LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 292172 sc-eQTL 5.68e-01 0.0448 0.0783 0.265 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -517417 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0289 0.111 0.265 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 640007 sc-eQTL 7.47e-02 -0.169 0.0945 0.265 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -447068 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0775 0.111 0.265 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -517107 sc-eQTL 1.50e-02 -0.246 0.1 0.265 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -291271 sc-eQTL 2.59e-01 -0.111 0.0981 0.265 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 387918 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0443 0.0991 0.265 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 292172 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0456 0.0684 0.265 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -517417 sc-eQTL 7.67e-01 -0.03 0.101 0.265 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 640007 sc-eQTL 6.81e-01 0.0356 0.0865 0.265 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000240563 L1TD1 881455 sc-eQTL 1.11e-01 0.149 0.0933 0.265 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -517107 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000532 0.0977 0.265 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -291271 sc-eQTL 3.84e-01 0.0966 0.111 0.265 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 387918 sc-eQTL 4.12e-01 0.0901 0.11 0.265 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 292172 sc-eQTL 3.63e-01 0.0852 0.0934 0.265 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -517417 sc-eQTL 8.91e-01 0.0149 0.109 0.265 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 640007 sc-eQTL 2.34e-02 0.23 0.101 0.265 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000240563 L1TD1 881455 sc-eQTL 9.61e-01 0.00343 0.0696 0.265 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -517107 sc-eQTL 7.50e-01 0.0267 0.0837 0.267 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -291271 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00415 0.101 0.267 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 387918 sc-eQTL 5.45e-02 -0.173 0.0893 0.267 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 292172 sc-eQTL 5.75e-01 0.0504 0.0898 0.267 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -517417 sc-eQTL 9.36e-02 -0.178 0.106 0.267 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 640007 sc-eQTL 3.07e-01 0.0988 0.0965 0.267 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -447068 sc-eQTL 2.99e-02 0.254 0.116 0.267 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000240563 L1TD1 881455 eQTL 0.0472 -0.0887 0.0447 0.0 0.0 0.243

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000125703 \N 292172 1.34e-06 9.09e-07 2.7e-07 3.16e-07 1.12e-07 3.22e-07 6.51e-07 5.89e-08 5.88e-07 2.62e-07 1.37e-06 5.4e-07 1.2e-06 2.1e-07 5.36e-07 1.96e-07 6.37e-07 5.02e-07 1.56e-07 5.87e-08 1.48e-07 5.5e-07 2.26e-07 3.49e-08 1.38e-06 2.4e-07 2.43e-07 1.97e-07 2.98e-07 4.51e-07 3.49e-07 3.72e-08 3.51e-08 2.12e-07 3.5e-07 8.32e-08 6.14e-08 9.3e-08 6.76e-08 3.75e-08 3.27e-08 3.26e-06 9.6e-08 1.78e-08 3.42e-08 1.37e-08 1.21e-07 3.92e-09 4.74e-08