logo

Genes within 1Mb (chr1:63076027:G:GAGAA):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -517384 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0321 0.111 0.162 B L1
ENSG00000088035 ALG6 -291548 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00272 0.115 0.162 B L1
ENSG00000116641 DOCK7 387641 sc-eQTL 6.55e-01 0.0516 0.115 0.162 B L1
ENSG00000125703 ATG4C 291895 sc-eQTL 7.12e-01 0.0296 0.0802 0.162 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -517694 sc-eQTL 7.65e-02 0.226 0.127 0.162 B L1
ENSG00000162607 USP1 639730 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0251 0.111 0.162 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -447345 sc-eQTL 3.70e-02 0.272 0.13 0.162 B L1
ENSG00000079739 PGM1 -517384 sc-eQTL 4.02e-01 -0.0819 0.0975 0.162 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 -291548 sc-eQTL 3.31e-01 -0.105 0.108 0.162 CD4T L1
ENSG00000116641 DOCK7 387641 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0279 0.109 0.162 CD4T L1
ENSG00000125703 ATG4C 291895 sc-eQTL 8.37e-01 0.0181 0.0881 0.162 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -517694 sc-eQTL 9.11e-03 0.324 0.123 0.162 CD4T L1
ENSG00000162607 USP1 639730 sc-eQTL 8.10e-01 0.0206 0.0855 0.162 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -447345 sc-eQTL 1.16e-02 0.282 0.111 0.162 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 -517384 sc-eQTL 2.64e-01 -0.116 0.104 0.162 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 -291548 sc-eQTL 2.40e-02 -0.258 0.113 0.162 CD8T L1
ENSG00000116641 DOCK7 387641 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0334 0.116 0.162 CD8T L1
ENSG00000125703 ATG4C 291895 sc-eQTL 9.26e-02 -0.185 0.11 0.162 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -517694 sc-eQTL 1.47e-01 0.179 0.123 0.162 CD8T L1
ENSG00000162607 USP1 639730 sc-eQTL 1.47e-01 0.139 0.0957 0.162 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -447345 sc-eQTL 2.79e-01 0.133 0.123 0.162 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 -517384 sc-eQTL 8.81e-01 0.0175 0.117 0.164 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 -291548 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0266 0.121 0.164 DC L1
ENSG00000116641 DOCK7 387641 sc-eQTL 2.49e-01 0.143 0.123 0.164 DC L1
ENSG00000125703 ATG4C 291895 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0225 0.0969 0.164 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -517694 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0886 0.135 0.164 DC L1
ENSG00000162607 USP1 639730 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0746 0.118 0.164 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -447345 sc-eQTL 3.95e-01 0.1 0.118 0.164 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 -517384 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0277 0.115 0.162 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 -291548 sc-eQTL 2.89e-01 -0.127 0.12 0.162 Mono L1
ENSG00000116641 DOCK7 387641 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0138 0.116 0.162 Mono L1
ENSG00000125703 ATG4C 291895 sc-eQTL 9.31e-01 0.00679 0.0785 0.162 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -517694 sc-eQTL 1.86e-01 0.164 0.124 0.162 Mono L1
ENSG00000162607 USP1 639730 sc-eQTL 7.23e-01 0.0361 0.102 0.162 Mono L1
ENSG00000240563 L1TD1 881178 sc-eQTL 8.04e-02 -0.166 0.0944 0.162 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 -517384 sc-eQTL 1.11e-01 -0.156 0.0978 0.161 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 -291548 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0781 0.115 0.161 NK L1
ENSG00000116641 DOCK7 387641 sc-eQTL 2.01e-02 0.22 0.0938 0.161 NK L1
ENSG00000125703 ATG4C 291895 sc-eQTL 5.73e-01 0.0576 0.102 0.161 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -517694 sc-eQTL 1.08e-02 0.321 0.125 0.161 NK L1
ENSG00000162607 USP1 639730 sc-eQTL 2.78e-01 -0.123 0.113 0.161 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -447345 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0657 0.138 0.161 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 -517384 sc-eQTL 7.29e-01 0.0385 0.111 0.162 Other_T L1
ENSG00000088035 ALG6 -291548 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0251 0.111 0.162 Other_T L1
ENSG00000116641 DOCK7 387641 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0885 0.114 0.162 Other_T L1
ENSG00000125703 ATG4C 291895 sc-eQTL 1.49e-01 -0.142 0.098 0.162 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -517694 sc-eQTL 8.28e-01 0.019 0.0874 0.162 Other_T L1
ENSG00000162607 USP1 639730 sc-eQTL 2.29e-01 -0.091 0.0755 0.162 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -447345 sc-eQTL 8.94e-02 0.228 0.134 0.162 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -517384 sc-eQTL 2.76e-01 -0.167 0.153 0.153 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 -291548 sc-eQTL 2.99e-01 0.152 0.146 0.153 B_Activated L2
ENSG00000116641 DOCK7 387641 sc-eQTL 7.40e-02 0.244 0.136 0.153 B_Activated L2
ENSG00000125703 ATG4C 291895 sc-eQTL 2.64e-01 0.161 0.143 0.153 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -517694 sc-eQTL 1.56e-01 0.199 0.14 0.153 B_Activated L2
ENSG00000162607 USP1 639730 sc-eQTL 5.77e-01 0.0851 0.152 0.153 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -447345 sc-eQTL 8.55e-01 0.0243 0.133 0.153 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 -517384 sc-eQTL 8.86e-01 -0.019 0.132 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 -291548 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0299 0.134 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000116641 DOCK7 387641 sc-eQTL 1.21e-01 -0.198 0.127 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000125703 ATG4C 291895 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0783 0.108 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -517694 sc-eQTL 4.03e-01 0.108 0.129 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000162607 USP1 639730 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0791 0.129 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -447345 sc-eQTL 7.47e-01 0.0413 0.128 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 -517384 sc-eQTL 9.65e-01 -0.0057 0.129 0.164 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 -291548 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0744 0.131 0.164 B_Memory L2
ENSG00000116641 DOCK7 387641 sc-eQTL 3.60e-01 0.112 0.123 0.164 B_Memory L2
ENSG00000125703 ATG4C 291895 sc-eQTL 8.20e-01 0.0266 0.117 0.164 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -517694 sc-eQTL 3.39e-01 0.128 0.133 0.164 B_Memory L2
ENSG00000162607 USP1 639730 sc-eQTL 5.44e-01 0.0818 0.135 0.164 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -447345 sc-eQTL 1.98e-02 0.308 0.131 0.164 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 -517384 sc-eQTL 3.35e-01 -0.125 0.13 0.162 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 -291548 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0831 0.131 0.162 B_Naive1 L2
ENSG00000116641 DOCK7 387641 sc-eQTL 1.26e-01 0.191 0.125 0.162 B_Naive1 L2
ENSG00000125703 ATG4C 291895 sc-eQTL 9.22e-01 -0.00948 0.0965 0.162 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -517694 sc-eQTL 1.64e-01 0.178 0.127 0.162 B_Naive1 L2
ENSG00000162607 USP1 639730 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0456 0.113 0.162 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -447345 sc-eQTL 2.78e-01 0.148 0.136 0.162 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 -517384 sc-eQTL 2.33e-01 0.152 0.127 0.163 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 -291548 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0206 0.133 0.163 B_Naive2 L2
ENSG00000116641 DOCK7 387641 sc-eQTL 6.91e-01 -0.051 0.128 0.163 B_Naive2 L2
ENSG00000125703 ATG4C 291895 sc-eQTL 9.29e-01 0.0111 0.123 0.163 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -517694 sc-eQTL 4.09e-02 0.272 0.132 0.163 B_Naive2 L2
ENSG00000162607 USP1 639730 sc-eQTL 2.63e-01 0.143 0.127 0.163 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -447345 sc-eQTL 4.18e-01 0.108 0.133 0.163 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 -517384 sc-eQTL 7.72e-01 0.0388 0.134 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -291548 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0956 0.141 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 387641 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0569 0.124 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 291895 sc-eQTL 6.26e-01 0.0624 0.128 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -517694 sc-eQTL 6.15e-02 0.255 0.136 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 639730 sc-eQTL 8.53e-01 0.0241 0.13 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -447345 sc-eQTL 1.63e-01 0.181 0.129 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -517384 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0474 0.109 0.162 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -291548 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0338 0.118 0.162 CD4_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 387641 sc-eQTL 3.06e-01 -0.119 0.116 0.162 CD4_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 291895 sc-eQTL 7.32e-01 0.0354 0.103 0.162 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -517694 sc-eQTL 7.02e-03 0.337 0.124 0.162 CD4_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 639730 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0202 0.0961 0.162 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -447345 sc-eQTL 4.31e-02 0.252 0.124 0.162 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -517384 sc-eQTL 7.58e-01 0.0352 0.114 0.162 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -291548 sc-eQTL 2.78e-01 -0.143 0.132 0.162 CD4_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 387641 sc-eQTL 5.56e-01 -0.069 0.117 0.162 CD4_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 291895 sc-eQTL 3.74e-01 0.102 0.114 0.162 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -517694 sc-eQTL 8.55e-02 0.231 0.134 0.162 CD4_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 639730 sc-eQTL 3.55e-01 0.102 0.11 0.162 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -447345 sc-eQTL 2.50e-01 0.15 0.13 0.162 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -517384 sc-eQTL 4.15e-03 -0.378 0.131 0.162 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -291548 sc-eQTL 1.28e-01 -0.203 0.133 0.162 CD4_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 387641 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0527 0.13 0.162 CD4_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 291895 sc-eQTL 5.35e-02 -0.244 0.126 0.162 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -517694 sc-eQTL 1.09e-01 0.209 0.13 0.162 CD4_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 639730 sc-eQTL 2.72e-02 0.272 0.122 0.162 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -447345 sc-eQTL 2.95e-01 0.142 0.135 0.162 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -517384 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00211 0.119 0.162 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -291548 sc-eQTL 7.07e-01 0.0477 0.127 0.162 CD8_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 387641 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0167 0.12 0.162 CD8_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 291895 sc-eQTL 2.69e-01 0.142 0.128 0.162 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -517694 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0712 0.133 0.162 CD8_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 639730 sc-eQTL 3.91e-01 0.102 0.119 0.162 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -447345 sc-eQTL 6.79e-01 0.0564 0.136 0.162 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -517384 sc-eQTL 1.96e-01 -0.156 0.121 0.162 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -291548 sc-eQTL 3.33e-03 -0.365 0.123 0.162 CD8_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 387641 sc-eQTL 7.16e-01 0.0472 0.13 0.162 CD8_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 291895 sc-eQTL 1.05e-01 -0.201 0.124 0.162 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -517694 sc-eQTL 8.01e-01 0.0318 0.126 0.162 CD8_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 639730 sc-eQTL 1.03e-01 0.173 0.106 0.162 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -447345 sc-eQTL 2.65e-01 0.132 0.119 0.162 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -517384 sc-eQTL 2.07e-01 0.166 0.131 0.157 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -291548 sc-eQTL 2.61e-01 -0.15 0.133 0.157 CD8_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 387641 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00274 0.13 0.157 CD8_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 291895 sc-eQTL 2.65e-01 -0.148 0.133 0.157 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -517694 sc-eQTL 9.53e-02 0.215 0.128 0.157 CD8_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 639730 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0251 0.124 0.157 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -447345 sc-eQTL 3.40e-01 -0.126 0.132 0.157 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -517384 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0603 0.138 0.16 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -291548 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0806 0.139 0.16 CD8_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 387641 sc-eQTL 1.10e-01 -0.214 0.134 0.16 CD8_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 291895 sc-eQTL 3.86e-01 -0.112 0.129 0.16 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -517694 sc-eQTL 7.60e-01 0.0427 0.14 0.16 CD8_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 639730 sc-eQTL 1.89e-01 0.175 0.133 0.16 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -447345 sc-eQTL 9.66e-01 0.00575 0.136 0.16 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -517384 sc-eQTL 4.19e-01 -0.108 0.133 0.16 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 -291548 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0316 0.132 0.16 MAIT L2
ENSG00000116641 DOCK7 387641 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0151 0.126 0.16 MAIT L2
ENSG00000125703 ATG4C 291895 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0308 0.133 0.16 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -517694 sc-eQTL 5.35e-02 0.257 0.132 0.16 MAIT L2
ENSG00000162607 USP1 639730 sc-eQTL 6.33e-01 0.0633 0.132 0.16 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -447345 sc-eQTL 4.29e-01 0.109 0.137 0.16 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 -517384 sc-eQTL 7.26e-02 -0.228 0.126 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 -291548 sc-eQTL 4.25e-01 -0.104 0.13 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000116641 DOCK7 387641 sc-eQTL 3.07e-03 0.331 0.111 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000125703 ATG4C 291895 sc-eQTL 3.62e-01 0.115 0.126 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -517694 sc-eQTL 2.83e-01 0.141 0.131 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000162607 USP1 639730 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0656 0.136 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -447345 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0166 0.13 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 -517384 sc-eQTL 1.10e-02 -0.258 0.1 0.159 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 -291548 sc-eQTL 8.66e-01 0.0219 0.129 0.159 NK_CD56dim L2
ENSG00000116641 DOCK7 387641 sc-eQTL 3.12e-01 0.114 0.112 0.159 NK_CD56dim L2
ENSG00000125703 ATG4C 291895 sc-eQTL 6.18e-01 0.0571 0.114 0.159 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -517694 sc-eQTL 3.24e-02 0.277 0.129 0.159 NK_CD56dim L2
ENSG00000162607 USP1 639730 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0796 0.126 0.159 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -447345 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0207 0.141 0.159 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 -517384 sc-eQTL 3.85e-01 -0.121 0.139 0.16 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 -291548 sc-eQTL 6.91e-01 0.0574 0.144 0.16 NK_HLA L2
ENSG00000116641 DOCK7 387641 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0689 0.11 0.16 NK_HLA L2
ENSG00000125703 ATG4C 291895 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0267 0.128 0.16 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -517694 sc-eQTL 3.83e-01 0.117 0.134 0.16 NK_HLA L2
ENSG00000162607 USP1 639730 sc-eQTL 9.15e-01 0.015 0.141 0.16 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -447345 sc-eQTL 8.71e-02 0.219 0.127 0.16 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 -517384 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0195 0.112 0.159 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 -291548 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0762 0.126 0.159 NK_cytokine L2
ENSG00000116641 DOCK7 387641 sc-eQTL 9.65e-01 -0.0051 0.117 0.159 NK_cytokine L2
ENSG00000125703 ATG4C 291895 sc-eQTL 3.16e-01 -0.12 0.12 0.159 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -517694 sc-eQTL 8.18e-01 0.0285 0.124 0.159 NK_cytokine L2
ENSG00000162607 USP1 639730 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0597 0.131 0.159 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -447345 sc-eQTL 3.37e-01 -0.127 0.132 0.159 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 -517384 sc-eQTL 5.34e-01 0.0982 0.158 0.17 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 -291548 sc-eQTL 6.30e-01 0.0799 0.166 0.17 PB L2
ENSG00000116641 DOCK7 387641 sc-eQTL 9.15e-01 -0.019 0.177 0.17 PB L2
ENSG00000125703 ATG4C 291895 sc-eQTL 9.82e-01 0.00356 0.155 0.17 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -517694 sc-eQTL 6.10e-01 0.0788 0.154 0.17 PB L2
ENSG00000162607 USP1 639730 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0875 0.153 0.17 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -447345 sc-eQTL 2.51e-01 0.194 0.168 0.17 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 -517384 sc-eQTL 2.79e-02 0.262 0.118 0.163 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 -291548 sc-eQTL 9.57e-01 0.00654 0.122 0.163 Pro_T L2
ENSG00000116641 DOCK7 387641 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0191 0.122 0.163 Pro_T L2
ENSG00000125703 ATG4C 291895 sc-eQTL 8.75e-01 0.0168 0.107 0.163 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -517694 sc-eQTL 9.25e-02 -0.18 0.107 0.163 Pro_T L2
ENSG00000162607 USP1 639730 sc-eQTL 1.06e-01 -0.119 0.0733 0.163 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -447345 sc-eQTL 1.60e-01 0.175 0.124 0.163 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 -517384 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000569 0.124 0.162 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 -291548 sc-eQTL 7.55e-01 0.0414 0.132 0.162 Treg L2
ENSG00000116641 DOCK7 387641 sc-eQTL 6.18e-01 0.0606 0.121 0.162 Treg L2
ENSG00000125703 ATG4C 291895 sc-eQTL 7.58e-02 -0.22 0.123 0.162 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -517694 sc-eQTL 1.56e-01 -0.184 0.129 0.162 Treg L2
ENSG00000162607 USP1 639730 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0491 0.126 0.162 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -447345 sc-eQTL 9.62e-02 -0.206 0.123 0.162 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 -517384 sc-eQTL 3.69e-01 0.114 0.126 0.161 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -291548 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0985 0.128 0.161 cDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 387641 sc-eQTL 1.20e-01 0.196 0.125 0.161 cDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 291895 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0497 0.109 0.161 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -517694 sc-eQTL 9.17e-01 0.0145 0.139 0.161 cDC L2
ENSG00000162607 USP1 639730 sc-eQTL 8.94e-01 0.0165 0.124 0.161 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -447345 sc-eQTL 3.60e-01 0.102 0.111 0.161 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 -517384 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0878 0.119 0.162 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 -291548 sc-eQTL 4.62e-01 -0.088 0.119 0.162 cMono_IL1B L2
ENSG00000116641 DOCK7 387641 sc-eQTL 5.33e-01 0.0786 0.126 0.162 cMono_IL1B L2
ENSG00000125703 ATG4C 291895 sc-eQTL 9.21e-01 -0.00881 0.0886 0.162 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -517694 sc-eQTL 2.79e-01 0.136 0.125 0.162 cMono_IL1B L2
ENSG00000162607 USP1 639730 sc-eQTL 5.58e-01 0.065 0.111 0.162 cMono_IL1B L2
ENSG00000240563 L1TD1 881178 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0917 0.111 0.162 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 -517384 sc-eQTL 2.51e-01 0.152 0.132 0.162 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 -291548 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0345 0.134 0.162 cMono_S100A L2
ENSG00000116641 DOCK7 387641 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0941 0.124 0.162 cMono_S100A L2
ENSG00000125703 ATG4C 291895 sc-eQTL 7.19e-01 0.0388 0.108 0.162 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -517694 sc-eQTL 7.05e-01 0.0461 0.122 0.162 cMono_S100A L2
ENSG00000162607 USP1 639730 sc-eQTL 3.08e-01 0.128 0.125 0.162 cMono_S100A L2
ENSG00000240563 L1TD1 881178 sc-eQTL 2.89e-01 -0.111 0.104 0.162 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 -517384 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0345 0.15 0.148 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 -291548 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0501 0.16 0.148 gdT L2
ENSG00000116641 DOCK7 387641 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00245 0.157 0.148 gdT L2
ENSG00000125703 ATG4C 291895 sc-eQTL 2.55e-02 -0.333 0.147 0.148 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -517694 sc-eQTL 4.56e-01 -0.119 0.159 0.148 gdT L2
ENSG00000162607 USP1 639730 sc-eQTL 5.00e-01 -0.102 0.15 0.148 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -447345 sc-eQTL 9.09e-01 0.0178 0.157 0.148 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 -517384 sc-eQTL 9.61e-03 -0.346 0.132 0.16 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -291548 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0625 0.125 0.16 intMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 387641 sc-eQTL 8.18e-01 0.0294 0.128 0.16 intMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 291895 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0626 0.122 0.16 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -517694 sc-eQTL 1.56e-01 0.19 0.134 0.16 intMono L2
ENSG00000162607 USP1 639730 sc-eQTL 1.52e-01 0.196 0.136 0.16 intMono L2
ENSG00000240563 L1TD1 881178 sc-eQTL 8.58e-01 0.018 0.101 0.16 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -517384 sc-eQTL 6.79e-01 0.0493 0.119 0.163 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -291548 sc-eQTL 9.07e-01 0.0153 0.131 0.163 ncMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 387641 sc-eQTL 2.02e-01 -0.164 0.128 0.163 ncMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 291895 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0681 0.12 0.163 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -517694 sc-eQTL 4.29e-01 0.0996 0.126 0.163 ncMono L2
ENSG00000162607 USP1 639730 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00241 0.129 0.163 ncMono L2
ENSG00000240563 L1TD1 881178 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0568 0.0912 0.163 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -517384 sc-eQTL 3.25e-01 -0.136 0.138 0.175 pDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -291548 sc-eQTL 5.40e-01 0.0824 0.134 0.175 pDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 387641 sc-eQTL 5.75e-01 0.077 0.137 0.175 pDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 291895 sc-eQTL 9.27e-01 0.0113 0.123 0.175 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -517694 sc-eQTL 2.99e-01 -0.143 0.138 0.175 pDC L2
ENSG00000162607 USP1 639730 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0674 0.141 0.175 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -447345 sc-eQTL 3.14e-01 0.123 0.122 0.175 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -517384 sc-eQTL 8.67e-01 0.0209 0.125 0.162 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -291548 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0668 0.138 0.162 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 387641 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0321 0.12 0.162 B_Memory LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 291895 sc-eQTL 5.06e-01 0.0646 0.0969 0.162 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -517694 sc-eQTL 2.48e-01 0.147 0.127 0.162 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 639730 sc-eQTL 7.93e-01 0.0325 0.124 0.162 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -447345 sc-eQTL 2.75e-01 0.145 0.132 0.162 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -517384 sc-eQTL 8.56e-01 0.0232 0.128 0.162 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -291548 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0349 0.132 0.162 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 387641 sc-eQTL 2.90e-01 0.13 0.123 0.162 B_Naive LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 291895 sc-eQTL 9.22e-01 0.00921 0.094 0.162 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -517694 sc-eQTL 9.01e-02 0.225 0.132 0.162 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 639730 sc-eQTL 9.62e-01 0.00546 0.114 0.162 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -447345 sc-eQTL 3.29e-01 0.13 0.133 0.162 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -517384 sc-eQTL 9.45e-01 0.00849 0.122 0.162 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -291548 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0828 0.118 0.162 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 387641 sc-eQTL 8.68e-01 0.0199 0.119 0.162 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 291895 sc-eQTL 8.75e-01 0.013 0.0825 0.162 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -517694 sc-eQTL 2.41e-01 0.143 0.122 0.162 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 639730 sc-eQTL 1.66e-01 0.144 0.104 0.162 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000240563 L1TD1 881178 sc-eQTL 3.80e-01 -0.0992 0.113 0.162 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -517384 sc-eQTL 1.12e-01 -0.184 0.115 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -291548 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0812 0.132 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 387641 sc-eQTL 2.36e-01 -0.154 0.13 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 291895 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00109 0.111 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -517694 sc-eQTL 1.44e-01 0.188 0.128 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 639730 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0369 0.121 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000240563 L1TD1 881178 sc-eQTL 5.62e-01 -0.048 0.0826 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -517384 sc-eQTL 3.21e-01 -0.0999 0.101 0.159 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -291548 sc-eQTL 6.26e-01 -0.059 0.121 0.159 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 387641 sc-eQTL 5.07e-01 0.072 0.108 0.159 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 291895 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00376 0.108 0.159 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -517694 sc-eQTL 2.43e-02 0.287 0.127 0.159 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 639730 sc-eQTL 3.60e-01 -0.107 0.116 0.159 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -447345 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0447 0.142 0.159 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079739 PGM1 -517384 eQTL 0.005 -0.0655 0.0233 0.00192 0.0 0.17
ENSG00000116641 DOCK7 387659 eQTL 0.0482 0.0571 0.0289 0.0 0.0 0.17

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina