logo

Genes within 1Mb (chr1:63035096:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -558315 sc-eQTL 3.39e-01 0.0911 0.0949 0.216 B L1
ENSG00000088035 ALG6 -332479 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0201 0.0986 0.216 B L1
ENSG00000116641 DOCK7 346710 sc-eQTL 5.56e-01 0.0581 0.0985 0.216 B L1
ENSG00000125703 ATG4C 250964 sc-eQTL 4.14e-01 0.056 0.0684 0.216 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -558625 sc-eQTL 3.03e-01 -0.112 0.109 0.216 B L1
ENSG00000162607 USP1 598799 sc-eQTL 6.51e-01 0.0428 0.0946 0.216 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -488276 sc-eQTL 6.44e-01 0.0517 0.112 0.216 B L1
ENSG00000079739 PGM1 -558315 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0142 0.0823 0.216 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 -332479 sc-eQTL 6.24e-01 0.0445 0.0907 0.216 CD4T L1
ENSG00000116641 DOCK7 346710 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0648 0.0918 0.216 CD4T L1
ENSG00000125703 ATG4C 250964 sc-eQTL 1.63e-01 -0.103 0.0739 0.216 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -558625 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0349 0.105 0.216 CD4T L1
ENSG00000162607 USP1 598799 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0426 0.0719 0.216 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -488276 sc-eQTL 8.23e-01 0.0212 0.0946 0.216 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 -558315 sc-eQTL 4.64e-01 0.0673 0.0918 0.216 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 -332479 sc-eQTL 3.17e-01 -0.101 0.101 0.216 CD8T L1
ENSG00000116641 DOCK7 346710 sc-eQTL 9.49e-01 0.00663 0.103 0.216 CD8T L1
ENSG00000125703 ATG4C 250964 sc-eQTL 5.42e-01 0.0596 0.0974 0.216 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -558625 sc-eQTL 5.76e-01 -0.061 0.109 0.216 CD8T L1
ENSG00000162607 USP1 598799 sc-eQTL 5.97e-01 0.045 0.0849 0.216 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -488276 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0331 0.109 0.216 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 -558315 sc-eQTL 6.61e-01 -0.044 0.1 0.218 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 -332479 sc-eQTL 3.43e-01 0.0981 0.103 0.218 DC L1
ENSG00000116641 DOCK7 346710 sc-eQTL 6.84e-01 0.0432 0.106 0.218 DC L1
ENSG00000125703 ATG4C 250964 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0657 0.0829 0.218 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -558625 sc-eQTL 9.48e-01 0.00758 0.116 0.218 DC L1
ENSG00000162607 USP1 598799 sc-eQTL 8.51e-01 0.0191 0.101 0.218 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -488276 sc-eQTL 7.38e-02 -0.18 0.1 0.218 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 -558315 sc-eQTL 2.25e-01 -0.118 0.0973 0.216 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 -332479 sc-eQTL 5.25e-01 0.0649 0.102 0.216 Mono L1
ENSG00000116641 DOCK7 346710 sc-eQTL 4.34e-01 0.0771 0.0984 0.216 Mono L1
ENSG00000125703 ATG4C 250964 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0426 0.0665 0.216 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -558625 sc-eQTL 3.02e-01 -0.109 0.105 0.216 Mono L1
ENSG00000162607 USP1 598799 sc-eQTL 7.44e-01 0.0283 0.0864 0.216 Mono L1
ENSG00000240563 L1TD1 840247 sc-eQTL 2.08e-01 -0.101 0.0804 0.216 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 -558315 sc-eQTL 5.72e-01 0.0479 0.0846 0.217 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 -332479 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0389 0.0992 0.217 NK L1
ENSG00000116641 DOCK7 346710 sc-eQTL 2.71e-01 -0.0901 0.0815 0.217 NK L1
ENSG00000125703 ATG4C 250964 sc-eQTL 1.34e-01 0.131 0.0873 0.217 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -558625 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0444 0.109 0.217 NK L1
ENSG00000162607 USP1 598799 sc-eQTL 7.28e-02 -0.175 0.0968 0.217 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -488276 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0617 0.118 0.217 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 -558315 sc-eQTL 5.81e-01 0.0535 0.0968 0.216 Other_T L1
ENSG00000088035 ALG6 -332479 sc-eQTL 8.70e-01 0.016 0.0973 0.216 Other_T L1
ENSG00000116641 DOCK7 346710 sc-eQTL 1.85e-01 0.132 0.0989 0.216 Other_T L1
ENSG00000125703 ATG4C 250964 sc-eQTL 3.98e-01 0.0727 0.0858 0.216 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -558625 sc-eQTL 1.13e-01 0.12 0.0758 0.216 Other_T L1
ENSG00000162607 USP1 598799 sc-eQTL 3.43e-01 0.0627 0.0659 0.216 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -488276 sc-eQTL 4.39e-01 -0.0911 0.117 0.216 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -558315 sc-eQTL 7.35e-01 0.0465 0.137 0.199 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 -332479 sc-eQTL 3.18e-01 -0.131 0.131 0.199 B_Activated L2
ENSG00000116641 DOCK7 346710 sc-eQTL 3.02e-01 -0.126 0.122 0.199 B_Activated L2
ENSG00000125703 ATG4C 250964 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0244 0.129 0.199 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -558625 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0976 0.125 0.199 B_Activated L2
ENSG00000162607 USP1 598799 sc-eQTL 5.15e-01 0.0888 0.136 0.199 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -488276 sc-eQTL 2.84e-01 0.127 0.119 0.199 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 -558315 sc-eQTL 2.61e-02 0.258 0.115 0.215 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 -332479 sc-eQTL 3.62e-02 -0.247 0.117 0.215 B_Intermediate L2
ENSG00000116641 DOCK7 346710 sc-eQTL 2.00e-01 0.144 0.112 0.215 B_Intermediate L2
ENSG00000125703 ATG4C 250964 sc-eQTL 3.66e-01 0.0863 0.0953 0.215 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -558625 sc-eQTL 3.59e-01 -0.104 0.114 0.215 B_Intermediate L2
ENSG00000162607 USP1 598799 sc-eQTL 2.59e-01 -0.128 0.113 0.215 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -488276 sc-eQTL 9.34e-01 -0.00933 0.113 0.215 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 -558315 sc-eQTL 5.87e-01 0.0619 0.114 0.216 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 -332479 sc-eQTL 3.32e-01 0.112 0.115 0.216 B_Memory L2
ENSG00000116641 DOCK7 346710 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0309 0.108 0.216 B_Memory L2
ENSG00000125703 ATG4C 250964 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0436 0.103 0.216 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -558625 sc-eQTL 1.66e-01 -0.163 0.117 0.216 B_Memory L2
ENSG00000162607 USP1 598799 sc-eQTL 7.31e-01 0.0409 0.119 0.216 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -488276 sc-eQTL 9.59e-01 -0.006 0.117 0.216 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 -558315 sc-eQTL 5.74e-01 0.0634 0.113 0.216 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 -332479 sc-eQTL 1.40e-01 0.166 0.112 0.216 B_Naive1 L2
ENSG00000116641 DOCK7 346710 sc-eQTL 6.68e-01 0.0466 0.108 0.216 B_Naive1 L2
ENSG00000125703 ATG4C 250964 sc-eQTL 8.40e-01 0.0169 0.0834 0.216 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -558625 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0661 0.111 0.216 B_Naive1 L2
ENSG00000162607 USP1 598799 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0143 0.0973 0.216 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -488276 sc-eQTL 5.96e-01 0.0627 0.118 0.216 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 -558315 sc-eQTL 8.77e-01 0.0173 0.112 0.217 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 -332479 sc-eQTL 3.85e-01 -0.101 0.116 0.217 B_Naive2 L2
ENSG00000116641 DOCK7 346710 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0313 0.112 0.217 B_Naive2 L2
ENSG00000125703 ATG4C 250964 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0318 0.108 0.217 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -558625 sc-eQTL 9.93e-01 0.00109 0.117 0.217 B_Naive2 L2
ENSG00000162607 USP1 598799 sc-eQTL 4.22e-01 0.0894 0.111 0.217 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -488276 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0139 0.116 0.217 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 -558315 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0373 0.115 0.211 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -332479 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00191 0.122 0.211 CD4_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 346710 sc-eQTL 2.45e-01 -0.124 0.106 0.211 CD4_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 250964 sc-eQTL 6.57e-01 -0.049 0.11 0.211 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -558625 sc-eQTL 7.00e-01 0.0455 0.118 0.211 CD4_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 598799 sc-eQTL 2.06e-01 -0.142 0.112 0.211 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -488276 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00386 0.112 0.211 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -558315 sc-eQTL 4.28e-01 0.0734 0.0925 0.216 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -332479 sc-eQTL 6.26e-01 0.049 0.101 0.216 CD4_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 346710 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0417 0.0988 0.216 CD4_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 250964 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0493 0.0873 0.216 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -558625 sc-eQTL 3.72e-01 -0.0953 0.107 0.216 CD4_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 598799 sc-eQTL 4.58e-01 0.0606 0.0815 0.216 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -488276 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0205 0.106 0.216 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -558315 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0161 0.0955 0.216 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -332479 sc-eQTL 7.56e-01 0.0346 0.111 0.216 CD4_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 346710 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0427 0.0983 0.216 CD4_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 250964 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0599 0.0956 0.216 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -558625 sc-eQTL 5.84e-01 0.0619 0.113 0.216 CD4_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 598799 sc-eQTL 2.86e-01 -0.0987 0.0923 0.216 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -488276 sc-eQTL 6.75e-01 0.0459 0.109 0.216 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -558315 sc-eQTL 1.30e-01 -0.173 0.114 0.216 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -332479 sc-eQTL 4.27e-01 0.0912 0.115 0.216 CD4_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 346710 sc-eQTL 3.10e-01 0.114 0.112 0.216 CD4_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 250964 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0585 0.109 0.216 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -558625 sc-eQTL 4.24e-01 0.0898 0.112 0.216 CD4_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 598799 sc-eQTL 6.84e-01 0.0434 0.106 0.216 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -488276 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00306 0.116 0.216 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -558315 sc-eQTL 9.01e-01 0.0131 0.105 0.216 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -332479 sc-eQTL 2.13e-01 -0.138 0.111 0.216 CD8_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 346710 sc-eQTL 8.27e-01 0.0231 0.106 0.216 CD8_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 250964 sc-eQTL 2.27e-01 0.136 0.112 0.216 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -558625 sc-eQTL 5.15e-01 0.0761 0.117 0.216 CD8_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 598799 sc-eQTL 5.75e-01 0.0587 0.105 0.216 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -488276 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0864 0.12 0.216 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -558315 sc-eQTL 2.42e-01 0.122 0.104 0.216 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -332479 sc-eQTL 5.73e-01 0.0608 0.108 0.216 CD8_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 346710 sc-eQTL 1.23e-01 0.172 0.111 0.216 CD8_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 250964 sc-eQTL 3.46e-01 0.101 0.107 0.216 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -558625 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0547 0.108 0.216 CD8_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 598799 sc-eQTL 6.24e-01 0.045 0.0916 0.216 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -488276 sc-eQTL 7.63e-01 0.0308 0.102 0.216 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -558315 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00706 0.117 0.225 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -332479 sc-eQTL 8.76e-03 -0.307 0.116 0.225 CD8_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 346710 sc-eQTL 9.45e-01 -0.008 0.115 0.225 CD8_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 250964 sc-eQTL 6.16e-01 0.0591 0.118 0.225 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -558625 sc-eQTL 7.88e-01 0.0308 0.114 0.225 CD8_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 598799 sc-eQTL 1.50e-01 0.158 0.11 0.225 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -488276 sc-eQTL 4.11e-01 0.0959 0.116 0.225 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -558315 sc-eQTL 6.24e-02 0.221 0.118 0.215 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -332479 sc-eQTL 9.46e-01 0.00804 0.119 0.215 CD8_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 346710 sc-eQTL 6.36e-01 0.0547 0.115 0.215 CD8_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 250964 sc-eQTL 2.34e-01 -0.132 0.111 0.215 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -558625 sc-eQTL 8.79e-01 0.0183 0.12 0.215 CD8_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 598799 sc-eQTL 3.57e-01 0.106 0.114 0.215 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -488276 sc-eQTL 3.75e-03 0.335 0.114 0.215 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -558315 sc-eQTL 5.85e-01 0.0608 0.111 0.212 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 -332479 sc-eQTL 5.34e-01 0.0685 0.11 0.212 MAIT L2
ENSG00000116641 DOCK7 346710 sc-eQTL 1.22e-01 0.163 0.105 0.212 MAIT L2
ENSG00000125703 ATG4C 250964 sc-eQTL 6.67e-01 0.0479 0.111 0.212 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -558625 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0688 0.111 0.212 MAIT L2
ENSG00000162607 USP1 598799 sc-eQTL 3.12e-01 0.112 0.11 0.212 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -488276 sc-eQTL 9.00e-01 0.0144 0.115 0.212 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 -558315 sc-eQTL 2.41e-01 0.133 0.113 0.213 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 -332479 sc-eQTL 6.90e-01 0.0465 0.117 0.213 NK_CD56bright L2
ENSG00000116641 DOCK7 346710 sc-eQTL 8.67e-02 -0.173 0.1 0.213 NK_CD56bright L2
ENSG00000125703 ATG4C 250964 sc-eQTL 3.06e-01 0.116 0.113 0.213 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -558625 sc-eQTL 3.34e-01 -0.113 0.117 0.213 NK_CD56bright L2
ENSG00000162607 USP1 598799 sc-eQTL 8.38e-01 0.0248 0.121 0.213 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -488276 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0289 0.116 0.213 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 -558315 sc-eQTL 6.21e-01 0.0433 0.0875 0.216 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 -332479 sc-eQTL 7.45e-01 0.0362 0.111 0.216 NK_CD56dim L2
ENSG00000116641 DOCK7 346710 sc-eQTL 6.86e-01 0.0391 0.0966 0.216 NK_CD56dim L2
ENSG00000125703 ATG4C 250964 sc-eQTL 4.94e-01 0.0671 0.0981 0.216 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -558625 sc-eQTL 4.17e-01 -0.0908 0.112 0.216 NK_CD56dim L2
ENSG00000162607 USP1 598799 sc-eQTL 2.54e-01 -0.124 0.108 0.216 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -488276 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0787 0.121 0.216 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 -558315 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00393 0.122 0.21 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 -332479 sc-eQTL 2.95e-01 -0.132 0.126 0.21 NK_HLA L2
ENSG00000116641 DOCK7 346710 sc-eQTL 1.04e-01 -0.156 0.0958 0.21 NK_HLA L2
ENSG00000125703 ATG4C 250964 sc-eQTL 7.08e-01 0.042 0.112 0.21 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -558625 sc-eQTL 1.53e-01 0.168 0.117 0.21 NK_HLA L2
ENSG00000162607 USP1 598799 sc-eQTL 3.54e-01 -0.114 0.123 0.21 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -488276 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0293 0.112 0.21 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 -558315 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0266 0.0965 0.216 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 -332479 sc-eQTL 9.35e-01 -0.00892 0.109 0.216 NK_cytokine L2
ENSG00000116641 DOCK7 346710 sc-eQTL 9.74e-01 0.00336 0.101 0.216 NK_cytokine L2
ENSG00000125703 ATG4C 250964 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0231 0.103 0.216 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -558625 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000989 0.107 0.216 NK_cytokine L2
ENSG00000162607 USP1 598799 sc-eQTL 3.52e-03 -0.325 0.11 0.216 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -488276 sc-eQTL 3.34e-01 0.11 0.114 0.216 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 -558315 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0258 0.149 0.2 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 -332479 sc-eQTL 4.12e-01 -0.129 0.157 0.2 PB L2
ENSG00000116641 DOCK7 346710 sc-eQTL 4.71e-01 0.121 0.167 0.2 PB L2
ENSG00000125703 ATG4C 250964 sc-eQTL 4.98e-01 0.0993 0.146 0.2 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -558625 sc-eQTL 7.34e-01 0.0498 0.146 0.2 PB L2
ENSG00000162607 USP1 598799 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0196 0.145 0.2 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -488276 sc-eQTL 3.91e-01 -0.138 0.16 0.2 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 -558315 sc-eQTL 3.48e-01 0.0983 0.105 0.217 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 -332479 sc-eQTL 2.93e-01 0.112 0.106 0.217 Pro_T L2
ENSG00000116641 DOCK7 346710 sc-eQTL 7.88e-01 0.0288 0.107 0.217 Pro_T L2
ENSG00000125703 ATG4C 250964 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0395 0.0936 0.217 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -558625 sc-eQTL 2.36e-01 0.111 0.0936 0.217 Pro_T L2
ENSG00000162607 USP1 598799 sc-eQTL 5.36e-01 0.04 0.0645 0.217 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -488276 sc-eQTL 4.40e-01 0.0843 0.109 0.217 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 -558315 sc-eQTL 9.28e-01 -0.00999 0.11 0.216 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 -332479 sc-eQTL 1.90e-01 -0.154 0.117 0.216 Treg L2
ENSG00000116641 DOCK7 346710 sc-eQTL 8.04e-01 0.0269 0.108 0.216 Treg L2
ENSG00000125703 ATG4C 250964 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0152 0.11 0.216 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -558625 sc-eQTL 3.50e-01 -0.108 0.115 0.216 Treg L2
ENSG00000162607 USP1 598799 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0859 0.111 0.216 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -488276 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0389 0.11 0.216 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 -558315 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00314 0.107 0.215 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -332479 sc-eQTL 9.06e-01 0.0129 0.109 0.215 cDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 346710 sc-eQTL 4.78e-01 0.0759 0.107 0.215 cDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 250964 sc-eQTL 2.03e-01 -0.118 0.0925 0.215 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -558625 sc-eQTL 6.97e-01 0.0459 0.118 0.215 cDC L2
ENSG00000162607 USP1 598799 sc-eQTL 7.18e-01 0.038 0.105 0.215 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -488276 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0295 0.0946 0.215 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 -558315 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0286 0.103 0.216 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 -332479 sc-eQTL 5.16e-01 0.0669 0.103 0.216 cMono_IL1B L2
ENSG00000116641 DOCK7 346710 sc-eQTL 9.42e-01 0.00792 0.108 0.216 cMono_IL1B L2
ENSG00000125703 ATG4C 250964 sc-eQTL 1.81e-01 -0.102 0.0759 0.216 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -558625 sc-eQTL 1.97e-01 -0.139 0.108 0.216 cMono_IL1B L2
ENSG00000162607 USP1 598799 sc-eQTL 1.77e-01 0.129 0.0949 0.216 cMono_IL1B L2
ENSG00000240563 L1TD1 840247 sc-eQTL 5.87e-02 -0.18 0.0949 0.216 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 -558315 sc-eQTL 3.17e-01 -0.113 0.113 0.216 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 -332479 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0273 0.114 0.216 cMono_S100A L2
ENSG00000116641 DOCK7 346710 sc-eQTL 1.14e-01 0.167 0.105 0.216 cMono_S100A L2
ENSG00000125703 ATG4C 250964 sc-eQTL 8.38e-01 0.0188 0.0919 0.216 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -558625 sc-eQTL 8.92e-01 0.0141 0.104 0.216 cMono_S100A L2
ENSG00000162607 USP1 598799 sc-eQTL 3.72e-01 -0.0954 0.106 0.216 cMono_S100A L2
ENSG00000240563 L1TD1 840247 sc-eQTL 2.22e-01 -0.108 0.0884 0.216 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 -558315 sc-eQTL 4.41e-01 0.0995 0.129 0.212 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 -332479 sc-eQTL 3.19e-02 -0.293 0.135 0.212 gdT L2
ENSG00000116641 DOCK7 346710 sc-eQTL 3.42e-01 0.128 0.135 0.212 gdT L2
ENSG00000125703 ATG4C 250964 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0447 0.129 0.212 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -558625 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0527 0.137 0.212 gdT L2
ENSG00000162607 USP1 598799 sc-eQTL 4.09e-01 0.107 0.129 0.212 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -488276 sc-eQTL 8.95e-02 -0.228 0.133 0.212 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 -558315 sc-eQTL 7.03e-01 0.0438 0.115 0.218 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -332479 sc-eQTL 6.78e-01 0.0444 0.107 0.218 intMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 346710 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0505 0.109 0.218 intMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 250964 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0639 0.104 0.218 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -558625 sc-eQTL 9.31e-01 0.00997 0.115 0.218 intMono L2
ENSG00000162607 USP1 598799 sc-eQTL 1.46e-01 -0.17 0.116 0.218 intMono L2
ENSG00000240563 L1TD1 840247 sc-eQTL 1.02e-01 -0.14 0.0853 0.218 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -558315 sc-eQTL 5.53e-01 -0.061 0.103 0.222 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -332479 sc-eQTL 5.70e-01 0.0642 0.113 0.222 ncMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 346710 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0659 0.111 0.222 ncMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 250964 sc-eQTL 5.75e-01 0.0582 0.104 0.222 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -558625 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00788 0.109 0.222 ncMono L2
ENSG00000162607 USP1 598799 sc-eQTL 9.60e-02 0.184 0.11 0.222 ncMono L2
ENSG00000240563 L1TD1 840247 sc-eQTL 9.82e-01 0.00178 0.0787 0.222 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -558315 sc-eQTL 2.28e-01 -0.144 0.119 0.226 pDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -332479 sc-eQTL 1.44e-01 0.17 0.116 0.226 pDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 346710 sc-eQTL 2.26e-01 -0.144 0.119 0.226 pDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 250964 sc-eQTL 6.03e-01 0.0556 0.107 0.226 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -558625 sc-eQTL 6.00e-01 -0.063 0.12 0.226 pDC L2
ENSG00000162607 USP1 598799 sc-eQTL 5.16e-01 0.0794 0.122 0.226 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -488276 sc-eQTL 2.62e-02 -0.234 0.104 0.226 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -558315 sc-eQTL 1.19e-01 0.166 0.106 0.216 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -332479 sc-eQTL 2.99e-01 -0.123 0.118 0.216 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 346710 sc-eQTL 7.68e-01 0.0303 0.103 0.216 B_Memory LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 250964 sc-eQTL 5.46e-01 0.0502 0.083 0.216 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -558625 sc-eQTL 1.59e-01 -0.154 0.109 0.216 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 598799 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0829 0.106 0.216 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -488276 sc-eQTL 5.35e-01 0.0706 0.114 0.216 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -558315 sc-eQTL 5.95e-01 0.0585 0.11 0.216 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -332479 sc-eQTL 3.75e-01 0.101 0.113 0.216 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 346710 sc-eQTL 8.35e-01 0.0221 0.106 0.216 B_Naive LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 250964 sc-eQTL 9.67e-01 0.00339 0.0807 0.216 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -558625 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0158 0.114 0.216 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 598799 sc-eQTL 8.12e-01 0.0234 0.0981 0.216 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -488276 sc-eQTL 5.77e-01 0.064 0.115 0.216 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -558315 sc-eQTL 3.39e-01 -0.0997 0.104 0.216 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -332479 sc-eQTL 7.40e-01 0.0336 0.101 0.216 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 346710 sc-eQTL 4.52e-01 0.0766 0.102 0.216 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 250964 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0482 0.0702 0.216 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -558625 sc-eQTL 2.25e-01 -0.126 0.104 0.216 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 598799 sc-eQTL 8.99e-01 0.0113 0.0888 0.216 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000240563 L1TD1 840247 sc-eQTL 1.09e-01 -0.154 0.0957 0.216 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -558315 sc-eQTL 7.98e-01 0.0256 0.0998 0.218 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -332479 sc-eQTL 1.96e-01 0.146 0.113 0.218 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 346710 sc-eQTL 2.81e-01 -0.121 0.112 0.218 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 250964 sc-eQTL 8.31e-01 0.0205 0.0956 0.218 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -558625 sc-eQTL 9.60e-01 0.00559 0.111 0.218 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 598799 sc-eQTL 5.40e-01 0.064 0.104 0.218 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000240563 L1TD1 840247 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0462 0.0711 0.218 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -558315 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00432 0.0855 0.216 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -332479 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0303 0.103 0.216 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 346710 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0254 0.0919 0.216 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 250964 sc-eQTL 3.23e-01 0.0907 0.0916 0.216 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -558625 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0248 0.109 0.216 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 598799 sc-eQTL 7.46e-03 -0.262 0.0971 0.216 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -488276 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0683 0.12 0.216 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000116652 DLEU2L -511986 eQTL 0.00414 -0.0913 0.0318 0.00332 0.00143 0.218

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina