logo

Genes within 1Mb (chr1:63031321:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -562090 sc-eQTL 5.84e-01 0.0769 0.14 0.079 B L1
ENSG00000088035 ALG6 -336254 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0773 0.145 0.079 B L1
ENSG00000116641 DOCK7 342935 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0707 0.145 0.079 B L1
ENSG00000125703 ATG4C 247189 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0595 0.101 0.079 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -562400 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0844 0.161 0.079 B L1
ENSG00000162607 USP1 595024 sc-eQTL 2.49e-01 0.161 0.139 0.079 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -492051 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0344 0.165 0.079 B L1
ENSG00000079739 PGM1 -562090 sc-eQTL 1.32e-01 -0.183 0.121 0.079 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 -336254 sc-eQTL 2.34e-01 0.159 0.133 0.079 CD4T L1
ENSG00000116641 DOCK7 342935 sc-eQTL 9.39e-01 0.0105 0.136 0.079 CD4T L1
ENSG00000125703 ATG4C 247189 sc-eQTL 8.85e-01 0.0159 0.109 0.079 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -562400 sc-eQTL 4.81e-01 -0.11 0.155 0.079 CD4T L1
ENSG00000162607 USP1 595024 sc-eQTL 7.94e-01 0.0277 0.106 0.079 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -492051 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0459 0.139 0.079 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 -562090 sc-eQTL 3.04e-01 -0.14 0.135 0.079 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 -336254 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0657 0.15 0.079 CD8T L1
ENSG00000116641 DOCK7 342935 sc-eQTL 7.12e-01 -0.056 0.151 0.079 CD8T L1
ENSG00000125703 ATG4C 247189 sc-eQTL 8.25e-01 0.0318 0.144 0.079 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -562400 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0223 0.161 0.079 CD8T L1
ENSG00000162607 USP1 595024 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0337 0.125 0.079 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -492051 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0696 0.16 0.079 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 -562090 sc-eQTL 9.98e-01 0.000434 0.149 0.081 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 -336254 sc-eQTL 9.02e-01 0.0189 0.154 0.081 DC L1
ENSG00000116641 DOCK7 342935 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0221 0.157 0.081 DC L1
ENSG00000125703 ATG4C 247189 sc-eQTL 1.04e-01 -0.2 0.122 0.081 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -562400 sc-eQTL 6.47e-01 0.0789 0.172 0.081 DC L1
ENSG00000162607 USP1 595024 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0202 0.15 0.081 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -492051 sc-eQTL 2.17e-01 -0.185 0.149 0.081 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 -562090 sc-eQTL 4.05e-01 -0.121 0.145 0.079 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 -336254 sc-eQTL 3.24e-01 0.149 0.151 0.079 Mono L1
ENSG00000116641 DOCK7 342935 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00989 0.146 0.079 Mono L1
ENSG00000125703 ATG4C 247189 sc-eQTL 6.42e-01 0.0461 0.0988 0.079 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -562400 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0692 0.156 0.079 Mono L1
ENSG00000162607 USP1 595024 sc-eQTL 3.92e-01 0.11 0.128 0.079 Mono L1
ENSG00000240563 L1TD1 836472 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0335 0.12 0.079 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 -562090 sc-eQTL 2.10e-01 0.157 0.125 0.079 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 -336254 sc-eQTL 6.55e-01 0.0656 0.147 0.079 NK L1
ENSG00000116641 DOCK7 342935 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0847 0.121 0.079 NK L1
ENSG00000125703 ATG4C 247189 sc-eQTL 4.82e-01 0.0913 0.13 0.079 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -562400 sc-eQTL 7.22e-01 0.0575 0.161 0.079 NK L1
ENSG00000162607 USP1 595024 sc-eQTL 4.67e-02 -0.286 0.143 0.079 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -492051 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0405 0.175 0.079 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 -562090 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0839 0.141 0.079 Other_T L1
ENSG00000088035 ALG6 -336254 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0316 0.141 0.079 Other_T L1
ENSG00000116641 DOCK7 342935 sc-eQTL 3.48e-01 0.136 0.144 0.079 Other_T L1
ENSG00000125703 ATG4C 247189 sc-eQTL 7.13e-01 -0.046 0.125 0.079 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -562400 sc-eQTL 4.68e-01 0.0805 0.111 0.079 Other_T L1
ENSG00000162607 USP1 595024 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0244 0.0961 0.079 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -492051 sc-eQTL 5.12e-01 -0.112 0.171 0.079 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -562090 sc-eQTL 7.13e-01 0.0754 0.204 0.074 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 -336254 sc-eQTL 3.80e-01 -0.172 0.196 0.074 B_Activated L2
ENSG00000116641 DOCK7 342935 sc-eQTL 3.79e-01 -0.161 0.182 0.074 B_Activated L2
ENSG00000125703 ATG4C 247189 sc-eQTL 3.99e-01 -0.162 0.192 0.074 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -562400 sc-eQTL 4.54e-01 -0.141 0.187 0.074 B_Activated L2
ENSG00000162607 USP1 595024 sc-eQTL 7.71e-01 0.0591 0.203 0.074 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -492051 sc-eQTL 9.71e-01 0.00651 0.178 0.074 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 -562090 sc-eQTL 4.56e-02 0.337 0.168 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 -336254 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0755 0.172 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000116641 DOCK7 342935 sc-eQTL 6.32e-01 0.0788 0.164 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000125703 ATG4C 247189 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0462 0.139 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -562400 sc-eQTL 2.36e-01 -0.196 0.165 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000162607 USP1 595024 sc-eQTL 2.62e-01 -0.185 0.165 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -492051 sc-eQTL 8.15e-01 0.0385 0.164 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 -562090 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0482 0.168 0.08 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 -336254 sc-eQTL 4.87e-01 0.119 0.17 0.08 B_Memory L2
ENSG00000116641 DOCK7 342935 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0575 0.16 0.08 B_Memory L2
ENSG00000125703 ATG4C 247189 sc-eQTL 5.08e-01 -0.101 0.152 0.08 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -562400 sc-eQTL 2.53e-01 -0.199 0.173 0.08 B_Memory L2
ENSG00000162607 USP1 595024 sc-eQTL 7.68e-01 0.0518 0.175 0.08 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -492051 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0752 0.173 0.08 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 -562090 sc-eQTL 7.95e-01 0.0434 0.167 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 -336254 sc-eQTL 9.17e-01 0.0176 0.168 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000116641 DOCK7 342935 sc-eQTL 4.33e-01 0.126 0.16 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000125703 ATG4C 247189 sc-eQTL 1.91e-01 -0.162 0.123 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -562400 sc-eQTL 3.67e-01 -0.148 0.164 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000162607 USP1 595024 sc-eQTL 5.45e-01 0.0875 0.144 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -492051 sc-eQTL 3.47e-01 -0.165 0.175 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 -562090 sc-eQTL 6.70e-01 0.0697 0.163 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 -336254 sc-eQTL 2.79e-01 -0.184 0.17 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000116641 DOCK7 342935 sc-eQTL 1.91e-01 -0.214 0.163 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000125703 ATG4C 247189 sc-eQTL 9.85e-01 0.00297 0.158 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -562400 sc-eQTL 7.54e-01 0.0537 0.171 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000162607 USP1 595024 sc-eQTL 7.50e-01 0.052 0.163 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -492051 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0398 0.17 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 -562090 sc-eQTL 2.23e-01 -0.207 0.169 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -336254 sc-eQTL 5.75e-01 -0.101 0.18 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 342935 sc-eQTL 1.64e-01 -0.218 0.156 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 247189 sc-eQTL 9.09e-01 0.0186 0.163 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -562400 sc-eQTL 7.43e-01 0.057 0.174 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 595024 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0391 0.165 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -492051 sc-eQTL 3.10e-01 0.168 0.165 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -562090 sc-eQTL 2.56e-01 -0.155 0.136 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -336254 sc-eQTL 6.33e-02 0.274 0.147 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 342935 sc-eQTL 6.34e-01 0.0694 0.145 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 247189 sc-eQTL 3.86e-01 0.112 0.128 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -562400 sc-eQTL 4.24e-01 -0.126 0.157 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 595024 sc-eQTL 7.14e-01 0.044 0.12 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -492051 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0855 0.156 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -562090 sc-eQTL 3.31e-01 -0.135 0.139 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -336254 sc-eQTL 6.09e-01 0.083 0.162 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 342935 sc-eQTL 2.33e-01 -0.171 0.143 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 247189 sc-eQTL 7.61e-01 0.0425 0.14 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -562400 sc-eQTL 6.10e-01 0.084 0.165 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 595024 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0751 0.135 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -492051 sc-eQTL 6.65e-01 0.0691 0.159 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -562090 sc-eQTL 7.50e-02 -0.29 0.162 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -336254 sc-eQTL 2.14e-01 -0.204 0.164 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 342935 sc-eQTL 3.38e-01 0.154 0.16 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 247189 sc-eQTL 5.33e-01 -0.097 0.155 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -562400 sc-eQTL 3.90e-01 0.138 0.16 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 595024 sc-eQTL 4.80e-01 0.108 0.152 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -492051 sc-eQTL 2.39e-01 -0.196 0.166 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -562090 sc-eQTL 6.47e-02 -0.282 0.152 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -336254 sc-eQTL 5.35e-01 -0.101 0.162 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 342935 sc-eQTL 8.91e-01 0.0211 0.154 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 247189 sc-eQTL 7.33e-01 0.0559 0.164 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -562400 sc-eQTL 9.84e-01 -0.0035 0.171 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 595024 sc-eQTL 5.42e-01 0.0933 0.153 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -492051 sc-eQTL 4.52e-01 -0.132 0.175 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -562090 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0226 0.155 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -336254 sc-eQTL 4.69e-01 0.116 0.161 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 342935 sc-eQTL 4.39e-01 0.129 0.166 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 247189 sc-eQTL 6.70e-01 0.0681 0.159 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -562400 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00649 0.162 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 595024 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0207 0.137 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -492051 sc-eQTL 4.71e-01 -0.11 0.152 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -562090 sc-eQTL 8.82e-01 0.0252 0.17 0.083 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -336254 sc-eQTL 6.75e-02 -0.313 0.17 0.083 CD8_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 342935 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0263 0.168 0.083 CD8_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 247189 sc-eQTL 1.84e-01 0.228 0.171 0.083 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -562400 sc-eQTL 1.20e-01 0.259 0.166 0.083 CD8_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 595024 sc-eQTL 1.28e-01 0.244 0.16 0.083 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -492051 sc-eQTL 4.34e-01 0.133 0.17 0.083 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -562090 sc-eQTL 2.23e-01 0.211 0.173 0.082 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -336254 sc-eQTL 1.68e-01 -0.24 0.173 0.082 CD8_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 342935 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00588 0.169 0.082 CD8_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 247189 sc-eQTL 4.70e-02 -0.321 0.161 0.082 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -562400 sc-eQTL 4.88e-01 -0.122 0.175 0.082 CD8_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 595024 sc-eQTL 7.92e-01 0.0444 0.168 0.082 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -492051 sc-eQTL 1.62e-01 0.238 0.17 0.082 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -562090 sc-eQTL 4.99e-01 0.108 0.159 0.08 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 -336254 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0588 0.157 0.08 MAIT L2
ENSG00000116641 DOCK7 342935 sc-eQTL 9.00e-01 0.019 0.151 0.08 MAIT L2
ENSG00000125703 ATG4C 247189 sc-eQTL 7.00e-01 0.0614 0.159 0.08 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -562400 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0671 0.159 0.08 MAIT L2
ENSG00000162607 USP1 595024 sc-eQTL 1.61e-01 -0.221 0.157 0.08 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -492051 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0726 0.164 0.08 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 -562090 sc-eQTL 2.94e-01 0.17 0.162 0.078 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 -336254 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0444 0.166 0.078 NK_CD56bright L2
ENSG00000116641 DOCK7 342935 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0203 0.144 0.078 NK_CD56bright L2
ENSG00000125703 ATG4C 247189 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0314 0.161 0.078 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -562400 sc-eQTL 6.82e-01 0.0688 0.168 0.078 NK_CD56bright L2
ENSG00000162607 USP1 595024 sc-eQTL 7.76e-01 0.0493 0.173 0.078 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -492051 sc-eQTL 2.01e-01 0.211 0.165 0.078 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 -562090 sc-eQTL 5.66e-01 0.0747 0.13 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 -336254 sc-eQTL 2.23e-01 0.201 0.164 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000116641 DOCK7 342935 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00288 0.143 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000125703 ATG4C 247189 sc-eQTL 3.13e-01 0.147 0.145 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -562400 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0836 0.166 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000162607 USP1 595024 sc-eQTL 1.15e-02 -0.404 0.158 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -492051 sc-eQTL 9.53e-01 0.0105 0.179 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 -562090 sc-eQTL 2.52e-01 0.204 0.177 0.075 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 -336254 sc-eQTL 8.99e-03 -0.479 0.181 0.075 NK_HLA L2
ENSG00000116641 DOCK7 342935 sc-eQTL 6.54e-02 -0.259 0.14 0.075 NK_HLA L2
ENSG00000125703 ATG4C 247189 sc-eQTL 3.25e-01 0.162 0.164 0.075 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -562400 sc-eQTL 1.79e-01 0.232 0.172 0.075 NK_HLA L2
ENSG00000162607 USP1 595024 sc-eQTL 5.21e-01 0.116 0.18 0.075 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -492051 sc-eQTL 2.40e-01 0.193 0.164 0.075 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 -562090 sc-eQTL 8.91e-01 0.0199 0.145 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 -336254 sc-eQTL 4.61e-01 0.121 0.163 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000116641 DOCK7 342935 sc-eQTL 5.94e-01 0.0809 0.151 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000125703 ATG4C 247189 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0747 0.155 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -562400 sc-eQTL 5.29e-01 0.101 0.16 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000162607 USP1 595024 sc-eQTL 1.54e-01 -0.24 0.168 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -492051 sc-eQTL 4.73e-01 -0.123 0.171 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 -562090 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0585 0.216 0.081 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 -336254 sc-eQTL 4.79e-02 -0.447 0.223 0.081 PB L2
ENSG00000116641 DOCK7 342935 sc-eQTL 6.72e-01 0.103 0.243 0.081 PB L2
ENSG00000125703 ATG4C 247189 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0858 0.212 0.081 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -562400 sc-eQTL 6.07e-01 -0.109 0.211 0.081 PB L2
ENSG00000162607 USP1 595024 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0924 0.21 0.081 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -492051 sc-eQTL 5.41e-01 -0.142 0.232 0.081 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 -562090 sc-eQTL 3.35e-01 0.146 0.151 0.08 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 -336254 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0614 0.154 0.08 Pro_T L2
ENSG00000116641 DOCK7 342935 sc-eQTL 7.67e-02 0.273 0.154 0.08 Pro_T L2
ENSG00000125703 ATG4C 247189 sc-eQTL 4.32e-01 -0.106 0.135 0.08 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -562400 sc-eQTL 1.16e-01 0.213 0.135 0.08 Pro_T L2
ENSG00000162607 USP1 595024 sc-eQTL 4.56e-01 0.0698 0.0933 0.08 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -492051 sc-eQTL 8.39e-01 0.0322 0.158 0.08 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 -562090 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0598 0.161 0.079 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 -336254 sc-eQTL 6.64e-01 -0.075 0.172 0.079 Treg L2
ENSG00000116641 DOCK7 342935 sc-eQTL 5.77e-01 0.0882 0.158 0.079 Treg L2
ENSG00000125703 ATG4C 247189 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0381 0.162 0.079 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -562400 sc-eQTL 6.25e-02 -0.314 0.168 0.079 Treg L2
ENSG00000162607 USP1 595024 sc-eQTL 7.67e-01 0.0486 0.163 0.079 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -492051 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0976 0.162 0.079 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 -562090 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0548 0.162 0.08 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -336254 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0755 0.164 0.08 cDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 342935 sc-eQTL 9.32e-01 0.0137 0.161 0.08 cDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 247189 sc-eQTL 3.07e-02 -0.3 0.138 0.08 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -562400 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0201 0.177 0.08 cDC L2
ENSG00000162607 USP1 595024 sc-eQTL 5.69e-01 0.0899 0.157 0.08 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -492051 sc-eQTL 8.86e-02 -0.242 0.141 0.08 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 -562090 sc-eQTL 9.28e-01 -0.0136 0.151 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 -336254 sc-eQTL 8.71e-02 0.258 0.15 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000116641 DOCK7 342935 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0831 0.159 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000125703 ATG4C 247189 sc-eQTL 9.20e-01 0.0113 0.112 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -562400 sc-eQTL 3.91e-01 -0.136 0.158 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000162607 USP1 595024 sc-eQTL 1.19e-01 0.218 0.139 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000240563 L1TD1 836472 sc-eQTL 2.59e-01 -0.159 0.14 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 -562090 sc-eQTL 3.55e-01 -0.155 0.167 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 -336254 sc-eQTL 4.82e-01 -0.12 0.17 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000116641 DOCK7 342935 sc-eQTL 3.08e-01 0.161 0.157 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000125703 ATG4C 247189 sc-eQTL 5.52e-01 0.0812 0.136 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -562400 sc-eQTL 7.13e-01 0.0566 0.154 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000162607 USP1 595024 sc-eQTL 4.03e-01 0.133 0.158 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000240563 L1TD1 836472 sc-eQTL 4.11e-01 -0.109 0.132 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 -562090 sc-eQTL 9.42e-01 -0.0127 0.176 0.085 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 -336254 sc-eQTL 3.32e-01 -0.182 0.187 0.085 gdT L2
ENSG00000116641 DOCK7 342935 sc-eQTL 1.42e-01 0.269 0.182 0.085 gdT L2
ENSG00000125703 ATG4C 247189 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0557 0.175 0.085 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -562400 sc-eQTL 5.74e-01 0.105 0.186 0.085 gdT L2
ENSG00000162607 USP1 595024 sc-eQTL 1.53e-01 0.251 0.175 0.085 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -492051 sc-eQTL 9.57e-01 -0.0098 0.183 0.085 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 -562090 sc-eQTL 9.28e-01 0.0155 0.171 0.08 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -336254 sc-eQTL 6.01e-01 0.0835 0.159 0.08 intMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 342935 sc-eQTL 3.89e-02 -0.335 0.161 0.08 intMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 247189 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0195 0.155 0.08 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -562400 sc-eQTL 5.51e-01 0.102 0.171 0.08 intMono L2
ENSG00000162607 USP1 595024 sc-eQTL 2.37e-01 -0.206 0.174 0.08 intMono L2
ENSG00000240563 L1TD1 836472 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0317 0.128 0.08 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -562090 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0214 0.15 0.081 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -336254 sc-eQTL 3.24e-01 0.163 0.165 0.081 ncMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 342935 sc-eQTL 3.52e-01 -0.151 0.162 0.081 ncMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 247189 sc-eQTL 5.33e-01 0.0946 0.152 0.081 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -562400 sc-eQTL 7.69e-01 0.0467 0.159 0.081 ncMono L2
ENSG00000162607 USP1 595024 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0438 0.162 0.081 ncMono L2
ENSG00000240563 L1TD1 836472 sc-eQTL 8.48e-01 -0.022 0.115 0.081 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -562090 sc-eQTL 9.66e-01 0.00751 0.177 0.079 pDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -336254 sc-eQTL 4.87e-01 0.12 0.172 0.079 pDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 342935 sc-eQTL 9.49e-01 0.0113 0.176 0.079 pDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 247189 sc-eQTL 2.95e-01 -0.165 0.157 0.079 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -562400 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0597 0.177 0.079 pDC L2
ENSG00000162607 USP1 595024 sc-eQTL 1.37e-01 -0.268 0.179 0.079 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -492051 sc-eQTL 4.66e-01 -0.114 0.157 0.079 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -562090 sc-eQTL 1.84e-01 0.21 0.157 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -336254 sc-eQTL 8.22e-01 0.0393 0.175 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 342935 sc-eQTL 7.17e-01 -0.055 0.152 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 247189 sc-eQTL 3.42e-01 -0.117 0.122 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -562400 sc-eQTL 5.14e-02 -0.313 0.16 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 595024 sc-eQTL 3.61e-01 -0.143 0.156 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -492051 sc-eQTL 7.31e-01 0.0577 0.168 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -562090 sc-eQTL 6.88e-01 0.0656 0.163 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -336254 sc-eQTL 5.10e-01 -0.111 0.168 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 342935 sc-eQTL 9.98e-01 0.000489 0.157 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 247189 sc-eQTL 8.87e-01 -0.017 0.12 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -562400 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0467 0.169 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 595024 sc-eQTL 3.16e-01 0.146 0.145 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -492051 sc-eQTL 3.90e-01 -0.146 0.17 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -562090 sc-eQTL 4.02e-01 -0.129 0.154 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -336254 sc-eQTL 4.57e-01 0.111 0.149 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 342935 sc-eQTL 9.42e-01 0.0109 0.151 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 247189 sc-eQTL 5.74e-01 0.0585 0.104 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -562400 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0589 0.154 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 595024 sc-eQTL 2.09e-01 0.165 0.131 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000240563 L1TD1 836472 sc-eQTL 3.02e-01 -0.147 0.142 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -562090 sc-eQTL 7.27e-01 0.0518 0.148 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -336254 sc-eQTL 3.47e-01 0.158 0.168 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 342935 sc-eQTL 5.66e-02 -0.316 0.165 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 247189 sc-eQTL 6.85e-01 0.0575 0.142 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -562400 sc-eQTL 4.33e-01 0.129 0.164 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 595024 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0911 0.154 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000240563 L1TD1 836472 sc-eQTL 9.80e-01 0.00258 0.105 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -562090 sc-eQTL 6.26e-01 0.062 0.127 0.078 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -336254 sc-eQTL 3.75e-01 0.135 0.152 0.078 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 342935 sc-eQTL 9.78e-01 0.00371 0.137 0.078 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 247189 sc-eQTL 3.10e-01 0.138 0.136 0.078 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -562400 sc-eQTL 6.84e-01 0.0658 0.161 0.078 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 595024 sc-eQTL 1.59e-02 -0.351 0.145 0.078 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -492051 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0737 0.178 0.078 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000116652 DLEU2L -515761 eQTL 0.0188 -0.109 0.0463 0.00172 0.0 0.0844

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000203965 \N -492051 8.15e-07 4.63e-07 1.14e-07 3.56e-07 9.33e-08 1.74e-07 5.01e-07 1.38e-07 3.94e-07 2.26e-07 5.58e-07 3.5e-07 6.27e-07 1.1e-07 2.07e-07 2.1e-07 2.53e-07 3.73e-07 1.93e-07 1.3e-07 1.92e-07 3.65e-07 3.11e-07 1.36e-07 6.18e-07 2.34e-07 2.56e-07 2.44e-07 3.58e-07 4.51e-07 2.55e-07 7.41e-08 4.74e-08 1.36e-07 2.85e-07 8.75e-08 1e-07 7.98e-08 4.23e-08 3.09e-08 8.48e-08 4.02e-07 2.8e-08 1.72e-08 1.25e-07 1.95e-08 1.11e-07 7.25e-09 5.93e-08