logo

Genes within 1Mb (chr1:63031214:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -562197 sc-eQTL 2.56e-01 0.111 0.0978 0.199 B L1
ENSG00000088035 ALG6 -336361 sc-eQTL 5.95e-01 -0.054 0.102 0.199 B L1
ENSG00000116641 DOCK7 342828 sc-eQTL 4.27e-01 0.0807 0.101 0.199 B L1
ENSG00000125703 ATG4C 247082 sc-eQTL 7.65e-01 0.0211 0.0706 0.199 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -562507 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0247 0.112 0.199 B L1
ENSG00000162607 USP1 594917 sc-eQTL 4.30e-01 0.077 0.0974 0.199 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -492158 sc-eQTL 1.80e-01 0.154 0.115 0.199 B L1
ENSG00000079739 PGM1 -562197 sc-eQTL 7.87e-01 0.023 0.0849 0.199 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 -336361 sc-eQTL 2.32e-01 0.112 0.0934 0.199 CD4T L1
ENSG00000116641 DOCK7 342828 sc-eQTL 9.56e-01 0.00519 0.0949 0.199 CD4T L1
ENSG00000125703 ATG4C 247082 sc-eQTL 8.12e-02 -0.133 0.0761 0.199 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -562507 sc-eQTL 7.73e-01 0.0315 0.109 0.199 CD4T L1
ENSG00000162607 USP1 594917 sc-eQTL 4.10e-01 0.0613 0.0742 0.199 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -492158 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0642 0.0975 0.199 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 -562197 sc-eQTL 7.12e-01 0.0351 0.095 0.199 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 -336361 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0886 0.105 0.199 CD8T L1
ENSG00000116641 DOCK7 342828 sc-eQTL 2.98e-01 0.11 0.106 0.199 CD8T L1
ENSG00000125703 ATG4C 247082 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0199 0.101 0.199 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -562507 sc-eQTL 6.14e-01 0.0569 0.113 0.199 CD8T L1
ENSG00000162607 USP1 594917 sc-eQTL 2.52e-01 0.101 0.0875 0.199 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -492158 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0289 0.112 0.199 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 -562197 sc-eQTL 5.25e-01 0.0647 0.102 0.203 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 -336361 sc-eQTL 9.93e-01 0.000943 0.105 0.203 DC L1
ENSG00000116641 DOCK7 342828 sc-eQTL 9.07e-01 0.0126 0.108 0.203 DC L1
ENSG00000125703 ATG4C 247082 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0654 0.0842 0.203 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -562507 sc-eQTL 9.74e-01 0.00387 0.118 0.203 DC L1
ENSG00000162607 USP1 594917 sc-eQTL 9.10e-01 0.0117 0.103 0.203 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -492158 sc-eQTL 1.88e-01 -0.135 0.102 0.203 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 -562197 sc-eQTL 2.32e-02 -0.228 0.0997 0.199 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 -336361 sc-eQTL 2.91e-01 0.111 0.105 0.199 Mono L1
ENSG00000116641 DOCK7 342828 sc-eQTL 5.06e-01 0.0678 0.102 0.199 Mono L1
ENSG00000125703 ATG4C 247082 sc-eQTL 9.51e-01 0.00419 0.0688 0.199 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -562507 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0445 0.109 0.199 Mono L1
ENSG00000162607 USP1 594917 sc-eQTL 1.31e-01 0.135 0.0889 0.199 Mono L1
ENSG00000240563 L1TD1 836365 sc-eQTL 2.59e-01 -0.0942 0.0831 0.199 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 -562197 sc-eQTL 7.03e-01 0.0334 0.0873 0.2 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 -336361 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0505 0.102 0.2 NK L1
ENSG00000116641 DOCK7 342828 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0681 0.0842 0.2 NK L1
ENSG00000125703 ATG4C 247082 sc-eQTL 9.28e-01 0.00825 0.0906 0.2 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -562507 sc-eQTL 2.36e-01 0.133 0.112 0.2 NK L1
ENSG00000162607 USP1 594917 sc-eQTL 2.68e-01 -0.111 0.1 0.2 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -492158 sc-eQTL 2.49e-01 -0.141 0.122 0.2 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 -562197 sc-eQTL 6.52e-01 0.0452 0.1 0.199 Other_T L1
ENSG00000088035 ALG6 -336361 sc-eQTL 8.40e-01 0.0204 0.101 0.199 Other_T L1
ENSG00000116641 DOCK7 342828 sc-eQTL 3.77e-02 0.213 0.102 0.199 Other_T L1
ENSG00000125703 ATG4C 247082 sc-eQTL 6.33e-01 0.0425 0.0888 0.199 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -562507 sc-eQTL 5.90e-02 0.148 0.0782 0.199 Other_T L1
ENSG00000162607 USP1 594917 sc-eQTL 3.92e-01 0.0585 0.0682 0.199 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -492158 sc-eQTL 4.39e-01 -0.0941 0.121 0.199 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -562197 sc-eQTL 1.84e-01 0.185 0.139 0.189 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 -336361 sc-eQTL 2.13e-01 -0.166 0.133 0.189 B_Activated L2
ENSG00000116641 DOCK7 342828 sc-eQTL 1.68e-01 -0.171 0.124 0.189 B_Activated L2
ENSG00000125703 ATG4C 247082 sc-eQTL 3.64e-01 -0.119 0.13 0.189 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -562507 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0541 0.128 0.189 B_Activated L2
ENSG00000162607 USP1 594917 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0484 0.138 0.189 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -492158 sc-eQTL 9.84e-01 -0.0024 0.121 0.189 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 -562197 sc-eQTL 3.00e-03 0.349 0.116 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 -336361 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0996 0.12 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000116641 DOCK7 342828 sc-eQTL 1.74e-01 0.156 0.115 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000125703 ATG4C 247082 sc-eQTL 6.91e-01 0.0388 0.0973 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -562507 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0934 0.116 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000162607 USP1 594917 sc-eQTL 3.15e-01 -0.116 0.116 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -492158 sc-eQTL 2.91e-01 0.121 0.115 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 -562197 sc-eQTL 2.13e-01 0.144 0.115 0.2 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 -336361 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0457 0.118 0.2 B_Memory L2
ENSG00000116641 DOCK7 342828 sc-eQTL 3.92e-01 -0.0945 0.11 0.2 B_Memory L2
ENSG00000125703 ATG4C 247082 sc-eQTL 9.86e-01 0.00188 0.105 0.2 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -562507 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0931 0.12 0.2 B_Memory L2
ENSG00000162607 USP1 594917 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0415 0.121 0.2 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -492158 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0222 0.119 0.2 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 -562197 sc-eQTL 3.46e-01 0.111 0.117 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 -336361 sc-eQTL 8.36e-01 0.0245 0.118 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000116641 DOCK7 342828 sc-eQTL 4.93e-01 0.0776 0.113 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000125703 ATG4C 247082 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0106 0.0871 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -562507 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0282 0.116 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000162607 USP1 594917 sc-eQTL 6.40e-01 0.0476 0.102 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -492158 sc-eQTL 3.55e-01 0.114 0.123 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 -562197 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00389 0.114 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 -336361 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0827 0.119 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000116641 DOCK7 342828 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0742 0.114 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000125703 ATG4C 247082 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0843 0.11 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -562507 sc-eQTL 7.24e-01 0.0422 0.119 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000162607 USP1 594917 sc-eQTL 1.67e-01 0.157 0.113 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -492158 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0221 0.119 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 -562197 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0645 0.117 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -336361 sc-eQTL 6.27e-01 0.0604 0.124 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 342828 sc-eQTL 2.95e-01 -0.114 0.108 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 247082 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00743 0.112 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -562507 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0683 0.12 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 594917 sc-eQTL 9.01e-01 0.0143 0.114 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -492158 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0193 0.114 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -562197 sc-eQTL 3.93e-01 0.0818 0.0956 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -336361 sc-eQTL 3.25e-01 0.102 0.104 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 342828 sc-eQTL 5.55e-01 0.0603 0.102 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 247082 sc-eQTL 2.18e-01 -0.111 0.0901 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -562507 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00682 0.11 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 594917 sc-eQTL 1.43e-01 0.123 0.084 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -492158 sc-eQTL 2.83e-01 -0.118 0.109 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -562197 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0426 0.0982 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -336361 sc-eQTL 2.07e-01 0.144 0.114 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 342828 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0506 0.101 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 247082 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0625 0.0984 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -562507 sc-eQTL 6.06e-01 0.06 0.116 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 594917 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0482 0.0951 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -492158 sc-eQTL 5.50e-01 0.0673 0.112 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -562197 sc-eQTL 6.07e-02 -0.22 0.117 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -336361 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0288 0.118 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 342828 sc-eQTL 6.61e-01 0.0507 0.115 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 247082 sc-eQTL 2.77e-01 -0.122 0.112 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -562507 sc-eQTL 7.53e-01 0.0364 0.116 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 594917 sc-eQTL 1.75e-01 0.148 0.109 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -492158 sc-eQTL 9.61e-01 0.00594 0.12 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -562197 sc-eQTL 2.43e-01 -0.124 0.106 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -336361 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0383 0.113 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 342828 sc-eQTL 5.19e-01 0.0692 0.107 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 247082 sc-eQTL 7.13e-01 0.0419 0.114 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -562507 sc-eQTL 8.78e-01 0.0182 0.119 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 594917 sc-eQTL 9.58e-02 0.176 0.105 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -492158 sc-eQTL 3.65e-01 -0.11 0.121 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -562197 sc-eQTL 2.38e-01 0.127 0.107 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -336361 sc-eQTL 6.21e-01 0.0551 0.111 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 342828 sc-eQTL 4.70e-02 0.227 0.114 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 247082 sc-eQTL 2.99e-01 0.115 0.11 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -562507 sc-eQTL 6.27e-01 0.0544 0.112 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 594917 sc-eQTL 1.60e-01 0.133 0.094 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -492158 sc-eQTL 6.27e-01 0.0512 0.105 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -562197 sc-eQTL 8.06e-01 0.0291 0.119 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -336361 sc-eQTL 4.78e-02 -0.237 0.119 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 342828 sc-eQTL 8.07e-01 0.0288 0.117 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 247082 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0379 0.12 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -562507 sc-eQTL 7.50e-02 0.207 0.116 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 594917 sc-eQTL 4.21e-01 0.0904 0.112 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -492158 sc-eQTL 8.31e-01 0.0254 0.119 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -562197 sc-eQTL 2.32e-02 0.275 0.12 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -336361 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000388 0.122 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 342828 sc-eQTL 9.85e-02 0.196 0.118 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 247082 sc-eQTL 1.18e-01 -0.178 0.113 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -562507 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0202 0.123 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 594917 sc-eQTL 4.32e-01 0.0927 0.118 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -492158 sc-eQTL 8.96e-02 0.203 0.119 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -562197 sc-eQTL 5.57e-01 0.0679 0.115 0.195 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 -336361 sc-eQTL 3.59e-01 0.105 0.114 0.195 MAIT L2
ENSG00000116641 DOCK7 342828 sc-eQTL 3.47e-02 0.23 0.108 0.195 MAIT L2
ENSG00000125703 ATG4C 247082 sc-eQTL 3.60e-01 0.106 0.115 0.195 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -562507 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0227 0.116 0.195 MAIT L2
ENSG00000162607 USP1 594917 sc-eQTL 5.21e-01 0.0738 0.115 0.195 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -492158 sc-eQTL 9.38e-01 0.00929 0.119 0.195 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 -562197 sc-eQTL 3.24e-01 0.113 0.114 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 -336361 sc-eQTL 7.20e-01 0.0422 0.118 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000116641 DOCK7 342828 sc-eQTL 2.23e-01 -0.124 0.102 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000125703 ATG4C 247082 sc-eQTL 4.65e-01 0.0832 0.114 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -562507 sc-eQTL 4.02e-01 -0.0994 0.118 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000162607 USP1 594917 sc-eQTL 2.01e-01 0.156 0.122 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -492158 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0272 0.117 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 -562197 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000417 0.0907 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 -336361 sc-eQTL 8.89e-01 0.0161 0.115 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000116641 DOCK7 342828 sc-eQTL 7.12e-01 -0.037 0.1 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000125703 ATG4C 247082 sc-eQTL 6.75e-01 0.0427 0.102 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -562507 sc-eQTL 7.42e-01 0.0381 0.116 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000162607 USP1 594917 sc-eQTL 2.13e-01 -0.14 0.112 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -492158 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0981 0.125 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 -562197 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0319 0.123 0.196 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 -336361 sc-eQTL 1.70e-02 -0.303 0.126 0.196 NK_HLA L2
ENSG00000116641 DOCK7 342828 sc-eQTL 3.36e-01 -0.0938 0.0974 0.196 NK_HLA L2
ENSG00000125703 ATG4C 247082 sc-eQTL 6.39e-01 0.0533 0.113 0.196 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -562507 sc-eQTL 1.11e-01 0.19 0.118 0.196 NK_HLA L2
ENSG00000162607 USP1 594917 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0336 0.125 0.196 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -492158 sc-eQTL 8.48e-01 0.0218 0.113 0.196 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 -562197 sc-eQTL 8.02e-01 0.0251 0.1 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 -336361 sc-eQTL 9.15e-01 -0.012 0.113 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000116641 DOCK7 342828 sc-eQTL 7.70e-01 0.0307 0.105 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000125703 ATG4C 247082 sc-eQTL 2.33e-01 -0.128 0.107 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -562507 sc-eQTL 3.08e-01 0.113 0.111 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000162607 USP1 594917 sc-eQTL 1.05e-01 -0.188 0.116 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -492158 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0202 0.118 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 -562197 sc-eQTL 1.23e-01 -0.228 0.147 0.185 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 -336361 sc-eQTL 8.74e-01 0.0248 0.156 0.185 PB L2
ENSG00000116641 DOCK7 342828 sc-eQTL 3.42e-01 0.159 0.166 0.185 PB L2
ENSG00000125703 ATG4C 247082 sc-eQTL 1.82e-01 0.194 0.144 0.185 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -562507 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00185 0.145 0.185 PB L2
ENSG00000162607 USP1 594917 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0248 0.145 0.185 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -492158 sc-eQTL 8.82e-02 -0.271 0.158 0.185 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 -562197 sc-eQTL 6.19e-01 0.0533 0.107 0.202 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 -336361 sc-eQTL 2.42e-01 0.127 0.108 0.202 Pro_T L2
ENSG00000116641 DOCK7 342828 sc-eQTL 8.62e-01 0.019 0.109 0.202 Pro_T L2
ENSG00000125703 ATG4C 247082 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0799 0.0954 0.202 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -562507 sc-eQTL 1.42e-01 0.141 0.0954 0.202 Pro_T L2
ENSG00000162607 USP1 594917 sc-eQTL 2.12e-01 0.0822 0.0657 0.202 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -492158 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0122 0.111 0.202 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 -562197 sc-eQTL 7.09e-01 0.0427 0.114 0.199 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 -336361 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0864 0.122 0.199 Treg L2
ENSG00000116641 DOCK7 342828 sc-eQTL 2.27e-01 -0.135 0.112 0.199 Treg L2
ENSG00000125703 ATG4C 247082 sc-eQTL 3.21e-01 0.114 0.114 0.199 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -562507 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00655 0.12 0.199 Treg L2
ENSG00000162607 USP1 594917 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0399 0.116 0.199 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -492158 sc-eQTL 1.19e-01 -0.178 0.114 0.199 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 -562197 sc-eQTL 1.79e-01 0.145 0.108 0.202 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -336361 sc-eQTL 2.24e-01 -0.133 0.109 0.202 cDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 342828 sc-eQTL 4.87e-01 0.0749 0.108 0.202 cDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 247082 sc-eQTL 3.02e-01 -0.0965 0.0933 0.202 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -562507 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0216 0.119 0.202 cDC L2
ENSG00000162607 USP1 594917 sc-eQTL 6.23e-01 0.052 0.105 0.202 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -492158 sc-eQTL 9.13e-03 -0.246 0.0935 0.202 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 -562197 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0524 0.106 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 -336361 sc-eQTL 2.45e-01 0.123 0.106 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000116641 DOCK7 342828 sc-eQTL 6.35e-01 0.0532 0.112 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000125703 ATG4C 247082 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0617 0.0786 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -562507 sc-eQTL 5.13e-01 -0.073 0.111 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000162607 USP1 594917 sc-eQTL 4.41e-02 0.197 0.0974 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000240563 L1TD1 836365 sc-eQTL 1.91e-02 -0.23 0.0975 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 -562197 sc-eQTL 3.83e-02 -0.238 0.114 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 -336361 sc-eQTL 9.30e-01 -0.0103 0.117 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000116641 DOCK7 342828 sc-eQTL 3.42e-01 0.103 0.108 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000125703 ATG4C 247082 sc-eQTL 4.90e-01 0.0648 0.0937 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -562507 sc-eQTL 4.21e-01 0.0852 0.106 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000162607 USP1 594917 sc-eQTL 3.24e-01 0.108 0.109 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000240563 L1TD1 836365 sc-eQTL 2.27e-01 -0.109 0.0903 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 -562197 sc-eQTL 6.33e-01 0.0618 0.129 0.197 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 -336361 sc-eQTL 7.65e-02 -0.243 0.136 0.197 gdT L2
ENSG00000116641 DOCK7 342828 sc-eQTL 3.15e-01 0.136 0.135 0.197 gdT L2
ENSG00000125703 ATG4C 247082 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0973 0.129 0.197 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -562507 sc-eQTL 6.92e-01 0.0543 0.137 0.197 gdT L2
ENSG00000162607 USP1 594917 sc-eQTL 4.24e-01 0.104 0.129 0.197 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -492158 sc-eQTL 7.90e-01 -0.036 0.135 0.197 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 -562197 sc-eQTL 2.52e-01 -0.134 0.117 0.2 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -336361 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0462 0.109 0.2 intMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 342828 sc-eQTL 1.24e-01 -0.171 0.111 0.2 intMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 247082 sc-eQTL 4.89e-01 0.0737 0.106 0.2 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -562507 sc-eQTL 7.71e-01 0.0342 0.117 0.2 intMono L2
ENSG00000162607 USP1 594917 sc-eQTL 3.11e-01 -0.121 0.119 0.2 intMono L2
ENSG00000240563 L1TD1 836365 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0414 0.0877 0.2 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -562197 sc-eQTL 8.68e-02 -0.177 0.103 0.206 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -336361 sc-eQTL 2.05e-01 0.145 0.114 0.206 ncMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 342828 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0872 0.112 0.206 ncMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 247082 sc-eQTL 5.54e-01 0.0621 0.105 0.206 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -562507 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0855 0.11 0.206 ncMono L2
ENSG00000162607 USP1 594917 sc-eQTL 8.97e-01 0.0145 0.112 0.206 ncMono L2
ENSG00000240563 L1TD1 836365 sc-eQTL 2.40e-01 -0.0934 0.0792 0.206 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -562197 sc-eQTL 3.61e-01 -0.109 0.118 0.218 pDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -336361 sc-eQTL 1.39e-01 0.171 0.115 0.218 pDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 342828 sc-eQTL 3.22e-01 -0.117 0.118 0.218 pDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 247082 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0669 0.106 0.218 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -562507 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0529 0.119 0.218 pDC L2
ENSG00000162607 USP1 594917 sc-eQTL 9.88e-01 0.00186 0.121 0.218 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -492158 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0209 0.105 0.218 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -562197 sc-eQTL 1.18e-02 0.275 0.108 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -336361 sc-eQTL 3.81e-01 -0.106 0.121 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 342828 sc-eQTL 9.60e-01 0.00527 0.105 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 247082 sc-eQTL 9.39e-01 0.00648 0.0852 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -562507 sc-eQTL 2.71e-01 -0.123 0.112 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 594917 sc-eQTL 1.11e-01 -0.173 0.108 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -492158 sc-eQTL 2.30e-01 0.14 0.116 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -562197 sc-eQTL 7.41e-01 0.0378 0.114 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -336361 sc-eQTL 9.12e-01 -0.013 0.118 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 342828 sc-eQTL 6.71e-01 0.0467 0.11 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 247082 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00469 0.0838 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -562507 sc-eQTL 7.19e-01 0.0426 0.118 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 594917 sc-eQTL 2.54e-01 0.116 0.101 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -492158 sc-eQTL 3.89e-01 0.103 0.119 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -562197 sc-eQTL 1.20e-01 -0.167 0.107 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -336361 sc-eQTL 5.33e-01 0.0649 0.104 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 342828 sc-eQTL 3.74e-01 0.0931 0.104 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 247082 sc-eQTL 9.59e-01 0.00371 0.0723 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -562507 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0369 0.107 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 594917 sc-eQTL 1.15e-01 0.144 0.0909 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000240563 L1TD1 836365 sc-eQTL 8.06e-02 -0.173 0.0984 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -562197 sc-eQTL 8.67e-02 -0.174 0.101 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -336361 sc-eQTL 2.34e-01 0.138 0.115 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 342828 sc-eQTL 7.79e-02 -0.202 0.114 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 247082 sc-eQTL 5.82e-01 0.0539 0.0977 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -562507 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0282 0.113 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 594917 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0252 0.107 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000240563 L1TD1 836365 sc-eQTL 2.10e-01 -0.0912 0.0725 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -562197 sc-eQTL 7.95e-01 -0.023 0.0885 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -336361 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0455 0.106 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 342828 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0308 0.0952 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 247082 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0196 0.0951 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -562507 sc-eQTL 1.75e-01 0.153 0.112 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 594917 sc-eQTL 4.53e-02 -0.204 0.101 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -492158 sc-eQTL 3.77e-01 -0.11 0.124 0.198 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000116652 DLEU2L -515868 eQTL 0.0087 -0.0815 0.031 0.00233 0.0 0.221

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina