logo

Genes within 1Mb (chr1:63029605:C:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -563806 sc-eQTL 2.56e-01 0.111 0.0978 0.199 B L1
ENSG00000088035 ALG6 -337970 sc-eQTL 5.95e-01 -0.054 0.102 0.199 B L1
ENSG00000116641 DOCK7 341219 sc-eQTL 4.27e-01 0.0807 0.101 0.199 B L1
ENSG00000125703 ATG4C 245473 sc-eQTL 7.65e-01 0.0211 0.0706 0.199 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -564116 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0247 0.112 0.199 B L1
ENSG00000162607 USP1 593308 sc-eQTL 4.30e-01 0.077 0.0974 0.199 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -493767 sc-eQTL 1.80e-01 0.154 0.115 0.199 B L1
ENSG00000079739 PGM1 -563806 sc-eQTL 7.87e-01 0.023 0.0849 0.199 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 -337970 sc-eQTL 2.32e-01 0.112 0.0934 0.199 CD4T L1
ENSG00000116641 DOCK7 341219 sc-eQTL 9.56e-01 0.00519 0.0949 0.199 CD4T L1
ENSG00000125703 ATG4C 245473 sc-eQTL 8.12e-02 -0.133 0.0761 0.199 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -564116 sc-eQTL 7.73e-01 0.0315 0.109 0.199 CD4T L1
ENSG00000162607 USP1 593308 sc-eQTL 4.10e-01 0.0613 0.0742 0.199 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -493767 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0642 0.0975 0.199 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 -563806 sc-eQTL 7.12e-01 0.0351 0.095 0.199 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 -337970 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0886 0.105 0.199 CD8T L1
ENSG00000116641 DOCK7 341219 sc-eQTL 2.98e-01 0.11 0.106 0.199 CD8T L1
ENSG00000125703 ATG4C 245473 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0199 0.101 0.199 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -564116 sc-eQTL 6.14e-01 0.0569 0.113 0.199 CD8T L1
ENSG00000162607 USP1 593308 sc-eQTL 2.52e-01 0.101 0.0875 0.199 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -493767 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0289 0.112 0.199 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 -563806 sc-eQTL 5.25e-01 0.0647 0.102 0.203 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 -337970 sc-eQTL 9.93e-01 0.000943 0.105 0.203 DC L1
ENSG00000116641 DOCK7 341219 sc-eQTL 9.07e-01 0.0126 0.108 0.203 DC L1
ENSG00000125703 ATG4C 245473 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0654 0.0842 0.203 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -564116 sc-eQTL 9.74e-01 0.00387 0.118 0.203 DC L1
ENSG00000162607 USP1 593308 sc-eQTL 9.10e-01 0.0117 0.103 0.203 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -493767 sc-eQTL 1.88e-01 -0.135 0.102 0.203 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 -563806 sc-eQTL 2.32e-02 -0.228 0.0997 0.199 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 -337970 sc-eQTL 2.91e-01 0.111 0.105 0.199 Mono L1
ENSG00000116641 DOCK7 341219 sc-eQTL 5.06e-01 0.0678 0.102 0.199 Mono L1
ENSG00000125703 ATG4C 245473 sc-eQTL 9.51e-01 0.00419 0.0688 0.199 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -564116 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0445 0.109 0.199 Mono L1
ENSG00000162607 USP1 593308 sc-eQTL 1.31e-01 0.135 0.0889 0.199 Mono L1
ENSG00000240563 L1TD1 834756 sc-eQTL 2.59e-01 -0.0942 0.0831 0.199 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 -563806 sc-eQTL 7.03e-01 0.0334 0.0873 0.2 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 -337970 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0505 0.102 0.2 NK L1
ENSG00000116641 DOCK7 341219 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0681 0.0842 0.2 NK L1
ENSG00000125703 ATG4C 245473 sc-eQTL 9.28e-01 0.00825 0.0906 0.2 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -564116 sc-eQTL 2.36e-01 0.133 0.112 0.2 NK L1
ENSG00000162607 USP1 593308 sc-eQTL 2.68e-01 -0.111 0.1 0.2 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -493767 sc-eQTL 2.49e-01 -0.141 0.122 0.2 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 -563806 sc-eQTL 6.52e-01 0.0452 0.1 0.199 Other_T L1
ENSG00000088035 ALG6 -337970 sc-eQTL 8.40e-01 0.0204 0.101 0.199 Other_T L1
ENSG00000116641 DOCK7 341219 sc-eQTL 3.77e-02 0.213 0.102 0.199 Other_T L1
ENSG00000125703 ATG4C 245473 sc-eQTL 6.33e-01 0.0425 0.0888 0.199 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -564116 sc-eQTL 5.90e-02 0.148 0.0782 0.199 Other_T L1
ENSG00000162607 USP1 593308 sc-eQTL 3.92e-01 0.0585 0.0682 0.199 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -493767 sc-eQTL 4.39e-01 -0.0941 0.121 0.199 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -563806 sc-eQTL 1.84e-01 0.185 0.139 0.189 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 -337970 sc-eQTL 2.13e-01 -0.166 0.133 0.189 B_Activated L2
ENSG00000116641 DOCK7 341219 sc-eQTL 1.68e-01 -0.171 0.124 0.189 B_Activated L2
ENSG00000125703 ATG4C 245473 sc-eQTL 3.64e-01 -0.119 0.13 0.189 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -564116 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0541 0.128 0.189 B_Activated L2
ENSG00000162607 USP1 593308 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0484 0.138 0.189 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -493767 sc-eQTL 9.84e-01 -0.0024 0.121 0.189 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 -563806 sc-eQTL 3.00e-03 0.349 0.116 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 -337970 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0996 0.12 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000116641 DOCK7 341219 sc-eQTL 1.74e-01 0.156 0.115 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000125703 ATG4C 245473 sc-eQTL 6.91e-01 0.0388 0.0973 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -564116 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0934 0.116 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000162607 USP1 593308 sc-eQTL 3.15e-01 -0.116 0.116 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -493767 sc-eQTL 2.91e-01 0.121 0.115 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 -563806 sc-eQTL 2.13e-01 0.144 0.115 0.2 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 -337970 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0457 0.118 0.2 B_Memory L2
ENSG00000116641 DOCK7 341219 sc-eQTL 3.92e-01 -0.0945 0.11 0.2 B_Memory L2
ENSG00000125703 ATG4C 245473 sc-eQTL 9.86e-01 0.00188 0.105 0.2 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -564116 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0931 0.12 0.2 B_Memory L2
ENSG00000162607 USP1 593308 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0415 0.121 0.2 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -493767 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0222 0.119 0.2 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 -563806 sc-eQTL 3.46e-01 0.111 0.117 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 -337970 sc-eQTL 8.36e-01 0.0245 0.118 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000116641 DOCK7 341219 sc-eQTL 4.93e-01 0.0776 0.113 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000125703 ATG4C 245473 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0106 0.0871 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -564116 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0282 0.116 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000162607 USP1 593308 sc-eQTL 6.40e-01 0.0476 0.102 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -493767 sc-eQTL 3.55e-01 0.114 0.123 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 -563806 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00389 0.114 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 -337970 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0827 0.119 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000116641 DOCK7 341219 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0742 0.114 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000125703 ATG4C 245473 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0843 0.11 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -564116 sc-eQTL 7.24e-01 0.0422 0.119 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000162607 USP1 593308 sc-eQTL 1.67e-01 0.157 0.113 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -493767 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0221 0.119 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 -563806 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0645 0.117 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -337970 sc-eQTL 6.27e-01 0.0604 0.124 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 341219 sc-eQTL 2.95e-01 -0.114 0.108 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 245473 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00743 0.112 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -564116 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0683 0.12 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 593308 sc-eQTL 9.01e-01 0.0143 0.114 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -493767 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0193 0.114 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -563806 sc-eQTL 3.93e-01 0.0818 0.0956 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -337970 sc-eQTL 3.25e-01 0.102 0.104 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 341219 sc-eQTL 5.55e-01 0.0603 0.102 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 245473 sc-eQTL 2.18e-01 -0.111 0.0901 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -564116 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00682 0.11 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 593308 sc-eQTL 1.43e-01 0.123 0.084 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -493767 sc-eQTL 2.83e-01 -0.118 0.109 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -563806 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0426 0.0982 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -337970 sc-eQTL 2.07e-01 0.144 0.114 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 341219 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0506 0.101 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 245473 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0625 0.0984 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -564116 sc-eQTL 6.06e-01 0.06 0.116 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 593308 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0482 0.0951 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -493767 sc-eQTL 5.50e-01 0.0673 0.112 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -563806 sc-eQTL 6.07e-02 -0.22 0.117 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -337970 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0288 0.118 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 341219 sc-eQTL 6.61e-01 0.0507 0.115 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 245473 sc-eQTL 2.77e-01 -0.122 0.112 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -564116 sc-eQTL 7.53e-01 0.0364 0.116 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 593308 sc-eQTL 1.75e-01 0.148 0.109 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -493767 sc-eQTL 9.61e-01 0.00594 0.12 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -563806 sc-eQTL 2.43e-01 -0.124 0.106 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -337970 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0383 0.113 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 341219 sc-eQTL 5.19e-01 0.0692 0.107 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 245473 sc-eQTL 7.13e-01 0.0419 0.114 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -564116 sc-eQTL 8.78e-01 0.0182 0.119 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 593308 sc-eQTL 9.58e-02 0.176 0.105 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -493767 sc-eQTL 3.65e-01 -0.11 0.121 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -563806 sc-eQTL 2.38e-01 0.127 0.107 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -337970 sc-eQTL 6.21e-01 0.0551 0.111 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 341219 sc-eQTL 4.70e-02 0.227 0.114 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 245473 sc-eQTL 2.99e-01 0.115 0.11 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -564116 sc-eQTL 6.27e-01 0.0544 0.112 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 593308 sc-eQTL 1.60e-01 0.133 0.094 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -493767 sc-eQTL 6.27e-01 0.0512 0.105 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -563806 sc-eQTL 8.06e-01 0.0291 0.119 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -337970 sc-eQTL 4.78e-02 -0.237 0.119 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 341219 sc-eQTL 8.07e-01 0.0288 0.117 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 245473 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0379 0.12 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -564116 sc-eQTL 7.50e-02 0.207 0.116 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 593308 sc-eQTL 4.21e-01 0.0904 0.112 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -493767 sc-eQTL 8.31e-01 0.0254 0.119 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -563806 sc-eQTL 2.32e-02 0.275 0.12 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -337970 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000388 0.122 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 341219 sc-eQTL 9.85e-02 0.196 0.118 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 245473 sc-eQTL 1.18e-01 -0.178 0.113 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -564116 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0202 0.123 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 593308 sc-eQTL 4.32e-01 0.0927 0.118 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -493767 sc-eQTL 8.96e-02 0.203 0.119 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -563806 sc-eQTL 5.57e-01 0.0679 0.115 0.195 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 -337970 sc-eQTL 3.59e-01 0.105 0.114 0.195 MAIT L2
ENSG00000116641 DOCK7 341219 sc-eQTL 3.47e-02 0.23 0.108 0.195 MAIT L2
ENSG00000125703 ATG4C 245473 sc-eQTL 3.60e-01 0.106 0.115 0.195 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -564116 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0227 0.116 0.195 MAIT L2
ENSG00000162607 USP1 593308 sc-eQTL 5.21e-01 0.0738 0.115 0.195 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -493767 sc-eQTL 9.38e-01 0.00929 0.119 0.195 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 -563806 sc-eQTL 3.24e-01 0.113 0.114 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 -337970 sc-eQTL 7.20e-01 0.0422 0.118 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000116641 DOCK7 341219 sc-eQTL 2.23e-01 -0.124 0.102 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000125703 ATG4C 245473 sc-eQTL 4.65e-01 0.0832 0.114 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -564116 sc-eQTL 4.02e-01 -0.0994 0.118 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000162607 USP1 593308 sc-eQTL 2.01e-01 0.156 0.122 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -493767 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0272 0.117 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 -563806 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000417 0.0907 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 -337970 sc-eQTL 8.89e-01 0.0161 0.115 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000116641 DOCK7 341219 sc-eQTL 7.12e-01 -0.037 0.1 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000125703 ATG4C 245473 sc-eQTL 6.75e-01 0.0427 0.102 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -564116 sc-eQTL 7.42e-01 0.0381 0.116 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000162607 USP1 593308 sc-eQTL 2.13e-01 -0.14 0.112 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -493767 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0981 0.125 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 -563806 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0319 0.123 0.196 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 -337970 sc-eQTL 1.70e-02 -0.303 0.126 0.196 NK_HLA L2
ENSG00000116641 DOCK7 341219 sc-eQTL 3.36e-01 -0.0938 0.0974 0.196 NK_HLA L2
ENSG00000125703 ATG4C 245473 sc-eQTL 6.39e-01 0.0533 0.113 0.196 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -564116 sc-eQTL 1.11e-01 0.19 0.118 0.196 NK_HLA L2
ENSG00000162607 USP1 593308 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0336 0.125 0.196 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -493767 sc-eQTL 8.48e-01 0.0218 0.113 0.196 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 -563806 sc-eQTL 8.02e-01 0.0251 0.1 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 -337970 sc-eQTL 9.15e-01 -0.012 0.113 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000116641 DOCK7 341219 sc-eQTL 7.70e-01 0.0307 0.105 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000125703 ATG4C 245473 sc-eQTL 2.33e-01 -0.128 0.107 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -564116 sc-eQTL 3.08e-01 0.113 0.111 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000162607 USP1 593308 sc-eQTL 1.05e-01 -0.188 0.116 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -493767 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0202 0.118 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 -563806 sc-eQTL 1.23e-01 -0.228 0.147 0.185 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 -337970 sc-eQTL 8.74e-01 0.0248 0.156 0.185 PB L2
ENSG00000116641 DOCK7 341219 sc-eQTL 3.42e-01 0.159 0.166 0.185 PB L2
ENSG00000125703 ATG4C 245473 sc-eQTL 1.82e-01 0.194 0.144 0.185 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -564116 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00185 0.145 0.185 PB L2
ENSG00000162607 USP1 593308 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0248 0.145 0.185 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -493767 sc-eQTL 8.82e-02 -0.271 0.158 0.185 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 -563806 sc-eQTL 6.19e-01 0.0533 0.107 0.202 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 -337970 sc-eQTL 2.42e-01 0.127 0.108 0.202 Pro_T L2
ENSG00000116641 DOCK7 341219 sc-eQTL 8.62e-01 0.019 0.109 0.202 Pro_T L2
ENSG00000125703 ATG4C 245473 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0799 0.0954 0.202 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -564116 sc-eQTL 1.42e-01 0.141 0.0954 0.202 Pro_T L2
ENSG00000162607 USP1 593308 sc-eQTL 2.12e-01 0.0822 0.0657 0.202 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -493767 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0122 0.111 0.202 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 -563806 sc-eQTL 7.09e-01 0.0427 0.114 0.199 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 -337970 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0864 0.122 0.199 Treg L2
ENSG00000116641 DOCK7 341219 sc-eQTL 2.27e-01 -0.135 0.112 0.199 Treg L2
ENSG00000125703 ATG4C 245473 sc-eQTL 3.21e-01 0.114 0.114 0.199 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -564116 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00655 0.12 0.199 Treg L2
ENSG00000162607 USP1 593308 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0399 0.116 0.199 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -493767 sc-eQTL 1.19e-01 -0.178 0.114 0.199 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 -563806 sc-eQTL 1.79e-01 0.145 0.108 0.202 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -337970 sc-eQTL 2.24e-01 -0.133 0.109 0.202 cDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 341219 sc-eQTL 4.87e-01 0.0749 0.108 0.202 cDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 245473 sc-eQTL 3.02e-01 -0.0965 0.0933 0.202 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -564116 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0216 0.119 0.202 cDC L2
ENSG00000162607 USP1 593308 sc-eQTL 6.23e-01 0.052 0.105 0.202 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -493767 sc-eQTL 9.13e-03 -0.246 0.0935 0.202 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 -563806 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0524 0.106 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 -337970 sc-eQTL 2.45e-01 0.123 0.106 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000116641 DOCK7 341219 sc-eQTL 6.35e-01 0.0532 0.112 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000125703 ATG4C 245473 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0617 0.0786 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -564116 sc-eQTL 5.13e-01 -0.073 0.111 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000162607 USP1 593308 sc-eQTL 4.41e-02 0.197 0.0974 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000240563 L1TD1 834756 sc-eQTL 1.91e-02 -0.23 0.0975 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 -563806 sc-eQTL 3.83e-02 -0.238 0.114 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 -337970 sc-eQTL 9.30e-01 -0.0103 0.117 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000116641 DOCK7 341219 sc-eQTL 3.42e-01 0.103 0.108 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000125703 ATG4C 245473 sc-eQTL 4.90e-01 0.0648 0.0937 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -564116 sc-eQTL 4.21e-01 0.0852 0.106 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000162607 USP1 593308 sc-eQTL 3.24e-01 0.108 0.109 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000240563 L1TD1 834756 sc-eQTL 2.27e-01 -0.109 0.0903 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 -563806 sc-eQTL 6.33e-01 0.0618 0.129 0.197 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 -337970 sc-eQTL 7.65e-02 -0.243 0.136 0.197 gdT L2
ENSG00000116641 DOCK7 341219 sc-eQTL 3.15e-01 0.136 0.135 0.197 gdT L2
ENSG00000125703 ATG4C 245473 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0973 0.129 0.197 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -564116 sc-eQTL 6.92e-01 0.0543 0.137 0.197 gdT L2
ENSG00000162607 USP1 593308 sc-eQTL 4.24e-01 0.104 0.129 0.197 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -493767 sc-eQTL 7.90e-01 -0.036 0.135 0.197 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 -563806 sc-eQTL 2.52e-01 -0.134 0.117 0.2 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -337970 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0462 0.109 0.2 intMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 341219 sc-eQTL 1.24e-01 -0.171 0.111 0.2 intMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 245473 sc-eQTL 4.89e-01 0.0737 0.106 0.2 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -564116 sc-eQTL 7.71e-01 0.0342 0.117 0.2 intMono L2
ENSG00000162607 USP1 593308 sc-eQTL 3.11e-01 -0.121 0.119 0.2 intMono L2
ENSG00000240563 L1TD1 834756 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0414 0.0877 0.2 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -563806 sc-eQTL 8.68e-02 -0.177 0.103 0.206 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -337970 sc-eQTL 2.05e-01 0.145 0.114 0.206 ncMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 341219 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0872 0.112 0.206 ncMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 245473 sc-eQTL 5.54e-01 0.0621 0.105 0.206 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -564116 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0855 0.11 0.206 ncMono L2
ENSG00000162607 USP1 593308 sc-eQTL 8.97e-01 0.0145 0.112 0.206 ncMono L2
ENSG00000240563 L1TD1 834756 sc-eQTL 2.40e-01 -0.0934 0.0792 0.206 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -563806 sc-eQTL 3.61e-01 -0.109 0.118 0.218 pDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -337970 sc-eQTL 1.39e-01 0.171 0.115 0.218 pDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 341219 sc-eQTL 3.22e-01 -0.117 0.118 0.218 pDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 245473 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0669 0.106 0.218 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -564116 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0529 0.119 0.218 pDC L2
ENSG00000162607 USP1 593308 sc-eQTL 9.88e-01 0.00186 0.121 0.218 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -493767 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0209 0.105 0.218 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -563806 sc-eQTL 1.18e-02 0.275 0.108 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -337970 sc-eQTL 3.81e-01 -0.106 0.121 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 341219 sc-eQTL 9.60e-01 0.00527 0.105 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 245473 sc-eQTL 9.39e-01 0.00648 0.0852 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -564116 sc-eQTL 2.71e-01 -0.123 0.112 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 593308 sc-eQTL 1.11e-01 -0.173 0.108 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -493767 sc-eQTL 2.30e-01 0.14 0.116 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -563806 sc-eQTL 7.41e-01 0.0378 0.114 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -337970 sc-eQTL 9.12e-01 -0.013 0.118 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 341219 sc-eQTL 6.71e-01 0.0467 0.11 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 245473 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00469 0.0838 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -564116 sc-eQTL 7.19e-01 0.0426 0.118 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 593308 sc-eQTL 2.54e-01 0.116 0.101 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -493767 sc-eQTL 3.89e-01 0.103 0.119 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -563806 sc-eQTL 1.20e-01 -0.167 0.107 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -337970 sc-eQTL 5.33e-01 0.0649 0.104 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 341219 sc-eQTL 3.74e-01 0.0931 0.104 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 245473 sc-eQTL 9.59e-01 0.00371 0.0723 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -564116 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0369 0.107 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 593308 sc-eQTL 1.15e-01 0.144 0.0909 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000240563 L1TD1 834756 sc-eQTL 8.06e-02 -0.173 0.0984 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -563806 sc-eQTL 8.67e-02 -0.174 0.101 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -337970 sc-eQTL 2.34e-01 0.138 0.115 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 341219 sc-eQTL 7.79e-02 -0.202 0.114 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 245473 sc-eQTL 5.82e-01 0.0539 0.0977 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -564116 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0282 0.113 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 593308 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0252 0.107 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000240563 L1TD1 834756 sc-eQTL 2.10e-01 -0.0912 0.0725 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -563806 sc-eQTL 7.95e-01 -0.023 0.0885 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -337970 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0455 0.106 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 341219 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0308 0.0952 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 245473 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0196 0.0951 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -564116 sc-eQTL 1.75e-01 0.153 0.112 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 593308 sc-eQTL 4.53e-02 -0.204 0.101 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -493767 sc-eQTL 3.77e-01 -0.11 0.124 0.198 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000116641 DOCK7 341237 eQTL 0.0456 0.0532 0.0266 0.0 0.0 0.22
ENSG00000116652 DLEU2L -517477 eQTL 0.00743 -0.0834 0.0311 0.00253 0.0 0.22

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina