logo

Genes within 1Mb (chr1:63029327:T:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -564084 sc-eQTL 2.56e-01 0.111 0.0978 0.199 B L1
ENSG00000088035 ALG6 -338248 sc-eQTL 5.95e-01 -0.054 0.102 0.199 B L1
ENSG00000116641 DOCK7 340941 sc-eQTL 4.27e-01 0.0807 0.101 0.199 B L1
ENSG00000125703 ATG4C 245195 sc-eQTL 7.65e-01 0.0211 0.0706 0.199 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -564394 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0247 0.112 0.199 B L1
ENSG00000162607 USP1 593030 sc-eQTL 4.30e-01 0.077 0.0974 0.199 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -494045 sc-eQTL 1.80e-01 0.154 0.115 0.199 B L1
ENSG00000079739 PGM1 -564084 sc-eQTL 7.87e-01 0.023 0.0849 0.199 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 -338248 sc-eQTL 2.32e-01 0.112 0.0934 0.199 CD4T L1
ENSG00000116641 DOCK7 340941 sc-eQTL 9.56e-01 0.00519 0.0949 0.199 CD4T L1
ENSG00000125703 ATG4C 245195 sc-eQTL 8.12e-02 -0.133 0.0761 0.199 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -564394 sc-eQTL 7.73e-01 0.0315 0.109 0.199 CD4T L1
ENSG00000162607 USP1 593030 sc-eQTL 4.10e-01 0.0613 0.0742 0.199 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -494045 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0642 0.0975 0.199 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 -564084 sc-eQTL 7.12e-01 0.0351 0.095 0.199 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 -338248 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0886 0.105 0.199 CD8T L1
ENSG00000116641 DOCK7 340941 sc-eQTL 2.98e-01 0.11 0.106 0.199 CD8T L1
ENSG00000125703 ATG4C 245195 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0199 0.101 0.199 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -564394 sc-eQTL 6.14e-01 0.0569 0.113 0.199 CD8T L1
ENSG00000162607 USP1 593030 sc-eQTL 2.52e-01 0.101 0.0875 0.199 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -494045 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0289 0.112 0.199 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 -564084 sc-eQTL 5.25e-01 0.0647 0.102 0.203 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 -338248 sc-eQTL 9.93e-01 0.000943 0.105 0.203 DC L1
ENSG00000116641 DOCK7 340941 sc-eQTL 9.07e-01 0.0126 0.108 0.203 DC L1
ENSG00000125703 ATG4C 245195 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0654 0.0842 0.203 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -564394 sc-eQTL 9.74e-01 0.00387 0.118 0.203 DC L1
ENSG00000162607 USP1 593030 sc-eQTL 9.10e-01 0.0117 0.103 0.203 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -494045 sc-eQTL 1.88e-01 -0.135 0.102 0.203 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 -564084 sc-eQTL 2.32e-02 -0.228 0.0997 0.199 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 -338248 sc-eQTL 2.91e-01 0.111 0.105 0.199 Mono L1
ENSG00000116641 DOCK7 340941 sc-eQTL 5.06e-01 0.0678 0.102 0.199 Mono L1
ENSG00000125703 ATG4C 245195 sc-eQTL 9.51e-01 0.00419 0.0688 0.199 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -564394 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0445 0.109 0.199 Mono L1
ENSG00000162607 USP1 593030 sc-eQTL 1.31e-01 0.135 0.0889 0.199 Mono L1
ENSG00000240563 L1TD1 834478 sc-eQTL 2.59e-01 -0.0942 0.0831 0.199 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 -564084 sc-eQTL 7.03e-01 0.0334 0.0873 0.2 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 -338248 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0505 0.102 0.2 NK L1
ENSG00000116641 DOCK7 340941 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0681 0.0842 0.2 NK L1
ENSG00000125703 ATG4C 245195 sc-eQTL 9.28e-01 0.00825 0.0906 0.2 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -564394 sc-eQTL 2.36e-01 0.133 0.112 0.2 NK L1
ENSG00000162607 USP1 593030 sc-eQTL 2.68e-01 -0.111 0.1 0.2 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -494045 sc-eQTL 2.49e-01 -0.141 0.122 0.2 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 -564084 sc-eQTL 6.52e-01 0.0452 0.1 0.199 Other_T L1
ENSG00000088035 ALG6 -338248 sc-eQTL 8.40e-01 0.0204 0.101 0.199 Other_T L1
ENSG00000116641 DOCK7 340941 sc-eQTL 3.77e-02 0.213 0.102 0.199 Other_T L1
ENSG00000125703 ATG4C 245195 sc-eQTL 6.33e-01 0.0425 0.0888 0.199 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -564394 sc-eQTL 5.90e-02 0.148 0.0782 0.199 Other_T L1
ENSG00000162607 USP1 593030 sc-eQTL 3.92e-01 0.0585 0.0682 0.199 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -494045 sc-eQTL 4.39e-01 -0.0941 0.121 0.199 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -564084 sc-eQTL 1.84e-01 0.185 0.139 0.189 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 -338248 sc-eQTL 2.13e-01 -0.166 0.133 0.189 B_Activated L2
ENSG00000116641 DOCK7 340941 sc-eQTL 1.68e-01 -0.171 0.124 0.189 B_Activated L2
ENSG00000125703 ATG4C 245195 sc-eQTL 3.64e-01 -0.119 0.13 0.189 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -564394 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0541 0.128 0.189 B_Activated L2
ENSG00000162607 USP1 593030 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0484 0.138 0.189 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -494045 sc-eQTL 9.84e-01 -0.0024 0.121 0.189 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 -564084 sc-eQTL 3.00e-03 0.349 0.116 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 -338248 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0996 0.12 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000116641 DOCK7 340941 sc-eQTL 1.74e-01 0.156 0.115 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000125703 ATG4C 245195 sc-eQTL 6.91e-01 0.0388 0.0973 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -564394 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0934 0.116 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000162607 USP1 593030 sc-eQTL 3.15e-01 -0.116 0.116 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -494045 sc-eQTL 2.91e-01 0.121 0.115 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 -564084 sc-eQTL 2.13e-01 0.144 0.115 0.2 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 -338248 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0457 0.118 0.2 B_Memory L2
ENSG00000116641 DOCK7 340941 sc-eQTL 3.92e-01 -0.0945 0.11 0.2 B_Memory L2
ENSG00000125703 ATG4C 245195 sc-eQTL 9.86e-01 0.00188 0.105 0.2 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -564394 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0931 0.12 0.2 B_Memory L2
ENSG00000162607 USP1 593030 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0415 0.121 0.2 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -494045 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0222 0.119 0.2 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 -564084 sc-eQTL 3.46e-01 0.111 0.117 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 -338248 sc-eQTL 8.36e-01 0.0245 0.118 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000116641 DOCK7 340941 sc-eQTL 4.93e-01 0.0776 0.113 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000125703 ATG4C 245195 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0106 0.0871 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -564394 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0282 0.116 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000162607 USP1 593030 sc-eQTL 6.40e-01 0.0476 0.102 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -494045 sc-eQTL 3.55e-01 0.114 0.123 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 -564084 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00389 0.114 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 -338248 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0827 0.119 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000116641 DOCK7 340941 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0742 0.114 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000125703 ATG4C 245195 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0843 0.11 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -564394 sc-eQTL 7.24e-01 0.0422 0.119 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000162607 USP1 593030 sc-eQTL 1.67e-01 0.157 0.113 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -494045 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0221 0.119 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 -564084 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0645 0.117 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -338248 sc-eQTL 6.27e-01 0.0604 0.124 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 340941 sc-eQTL 2.95e-01 -0.114 0.108 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 245195 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00743 0.112 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -564394 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0683 0.12 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 593030 sc-eQTL 9.01e-01 0.0143 0.114 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -494045 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0193 0.114 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -564084 sc-eQTL 3.93e-01 0.0818 0.0956 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -338248 sc-eQTL 3.25e-01 0.102 0.104 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 340941 sc-eQTL 5.55e-01 0.0603 0.102 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 245195 sc-eQTL 2.18e-01 -0.111 0.0901 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -564394 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00682 0.11 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 593030 sc-eQTL 1.43e-01 0.123 0.084 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -494045 sc-eQTL 2.83e-01 -0.118 0.109 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -564084 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0426 0.0982 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -338248 sc-eQTL 2.07e-01 0.144 0.114 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 340941 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0506 0.101 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 245195 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0625 0.0984 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -564394 sc-eQTL 6.06e-01 0.06 0.116 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 593030 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0482 0.0951 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -494045 sc-eQTL 5.50e-01 0.0673 0.112 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -564084 sc-eQTL 6.07e-02 -0.22 0.117 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -338248 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0288 0.118 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 340941 sc-eQTL 6.61e-01 0.0507 0.115 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 245195 sc-eQTL 2.77e-01 -0.122 0.112 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -564394 sc-eQTL 7.53e-01 0.0364 0.116 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 593030 sc-eQTL 1.75e-01 0.148 0.109 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -494045 sc-eQTL 9.61e-01 0.00594 0.12 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -564084 sc-eQTL 2.43e-01 -0.124 0.106 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -338248 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0383 0.113 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 340941 sc-eQTL 5.19e-01 0.0692 0.107 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 245195 sc-eQTL 7.13e-01 0.0419 0.114 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -564394 sc-eQTL 8.78e-01 0.0182 0.119 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 593030 sc-eQTL 9.58e-02 0.176 0.105 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -494045 sc-eQTL 3.65e-01 -0.11 0.121 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -564084 sc-eQTL 2.38e-01 0.127 0.107 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -338248 sc-eQTL 6.21e-01 0.0551 0.111 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 340941 sc-eQTL 4.70e-02 0.227 0.114 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 245195 sc-eQTL 2.99e-01 0.115 0.11 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -564394 sc-eQTL 6.27e-01 0.0544 0.112 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 593030 sc-eQTL 1.60e-01 0.133 0.094 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -494045 sc-eQTL 6.27e-01 0.0512 0.105 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -564084 sc-eQTL 8.06e-01 0.0291 0.119 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -338248 sc-eQTL 4.78e-02 -0.237 0.119 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 340941 sc-eQTL 8.07e-01 0.0288 0.117 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 245195 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0379 0.12 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -564394 sc-eQTL 7.50e-02 0.207 0.116 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 593030 sc-eQTL 4.21e-01 0.0904 0.112 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -494045 sc-eQTL 8.31e-01 0.0254 0.119 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -564084 sc-eQTL 2.32e-02 0.275 0.12 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -338248 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000388 0.122 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 340941 sc-eQTL 9.85e-02 0.196 0.118 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 245195 sc-eQTL 1.18e-01 -0.178 0.113 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -564394 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0202 0.123 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 593030 sc-eQTL 4.32e-01 0.0927 0.118 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -494045 sc-eQTL 8.96e-02 0.203 0.119 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -564084 sc-eQTL 5.57e-01 0.0679 0.115 0.195 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 -338248 sc-eQTL 3.59e-01 0.105 0.114 0.195 MAIT L2
ENSG00000116641 DOCK7 340941 sc-eQTL 3.47e-02 0.23 0.108 0.195 MAIT L2
ENSG00000125703 ATG4C 245195 sc-eQTL 3.60e-01 0.106 0.115 0.195 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -564394 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0227 0.116 0.195 MAIT L2
ENSG00000162607 USP1 593030 sc-eQTL 5.21e-01 0.0738 0.115 0.195 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -494045 sc-eQTL 9.38e-01 0.00929 0.119 0.195 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 -564084 sc-eQTL 3.24e-01 0.113 0.114 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 -338248 sc-eQTL 7.20e-01 0.0422 0.118 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000116641 DOCK7 340941 sc-eQTL 2.23e-01 -0.124 0.102 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000125703 ATG4C 245195 sc-eQTL 4.65e-01 0.0832 0.114 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -564394 sc-eQTL 4.02e-01 -0.0994 0.118 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000162607 USP1 593030 sc-eQTL 2.01e-01 0.156 0.122 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -494045 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0272 0.117 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 -564084 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000417 0.0907 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 -338248 sc-eQTL 8.89e-01 0.0161 0.115 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000116641 DOCK7 340941 sc-eQTL 7.12e-01 -0.037 0.1 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000125703 ATG4C 245195 sc-eQTL 6.75e-01 0.0427 0.102 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -564394 sc-eQTL 7.42e-01 0.0381 0.116 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000162607 USP1 593030 sc-eQTL 2.13e-01 -0.14 0.112 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -494045 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0981 0.125 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 -564084 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0319 0.123 0.196 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 -338248 sc-eQTL 1.70e-02 -0.303 0.126 0.196 NK_HLA L2
ENSG00000116641 DOCK7 340941 sc-eQTL 3.36e-01 -0.0938 0.0974 0.196 NK_HLA L2
ENSG00000125703 ATG4C 245195 sc-eQTL 6.39e-01 0.0533 0.113 0.196 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -564394 sc-eQTL 1.11e-01 0.19 0.118 0.196 NK_HLA L2
ENSG00000162607 USP1 593030 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0336 0.125 0.196 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -494045 sc-eQTL 8.48e-01 0.0218 0.113 0.196 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 -564084 sc-eQTL 8.02e-01 0.0251 0.1 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 -338248 sc-eQTL 9.15e-01 -0.012 0.113 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000116641 DOCK7 340941 sc-eQTL 7.70e-01 0.0307 0.105 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000125703 ATG4C 245195 sc-eQTL 2.33e-01 -0.128 0.107 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -564394 sc-eQTL 3.08e-01 0.113 0.111 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000162607 USP1 593030 sc-eQTL 1.05e-01 -0.188 0.116 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -494045 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0202 0.118 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 -564084 sc-eQTL 1.23e-01 -0.228 0.147 0.185 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 -338248 sc-eQTL 8.74e-01 0.0248 0.156 0.185 PB L2
ENSG00000116641 DOCK7 340941 sc-eQTL 3.42e-01 0.159 0.166 0.185 PB L2
ENSG00000125703 ATG4C 245195 sc-eQTL 1.82e-01 0.194 0.144 0.185 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -564394 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00185 0.145 0.185 PB L2
ENSG00000162607 USP1 593030 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0248 0.145 0.185 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -494045 sc-eQTL 8.82e-02 -0.271 0.158 0.185 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 -564084 sc-eQTL 6.19e-01 0.0533 0.107 0.202 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 -338248 sc-eQTL 2.42e-01 0.127 0.108 0.202 Pro_T L2
ENSG00000116641 DOCK7 340941 sc-eQTL 8.62e-01 0.019 0.109 0.202 Pro_T L2
ENSG00000125703 ATG4C 245195 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0799 0.0954 0.202 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -564394 sc-eQTL 1.42e-01 0.141 0.0954 0.202 Pro_T L2
ENSG00000162607 USP1 593030 sc-eQTL 2.12e-01 0.0822 0.0657 0.202 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -494045 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0122 0.111 0.202 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 -564084 sc-eQTL 7.09e-01 0.0427 0.114 0.199 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 -338248 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0864 0.122 0.199 Treg L2
ENSG00000116641 DOCK7 340941 sc-eQTL 2.27e-01 -0.135 0.112 0.199 Treg L2
ENSG00000125703 ATG4C 245195 sc-eQTL 3.21e-01 0.114 0.114 0.199 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -564394 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00655 0.12 0.199 Treg L2
ENSG00000162607 USP1 593030 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0399 0.116 0.199 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -494045 sc-eQTL 1.19e-01 -0.178 0.114 0.199 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 -564084 sc-eQTL 1.79e-01 0.145 0.108 0.202 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -338248 sc-eQTL 2.24e-01 -0.133 0.109 0.202 cDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 340941 sc-eQTL 4.87e-01 0.0749 0.108 0.202 cDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 245195 sc-eQTL 3.02e-01 -0.0965 0.0933 0.202 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -564394 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0216 0.119 0.202 cDC L2
ENSG00000162607 USP1 593030 sc-eQTL 6.23e-01 0.052 0.105 0.202 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -494045 sc-eQTL 9.13e-03 -0.246 0.0935 0.202 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 -564084 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0524 0.106 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 -338248 sc-eQTL 2.45e-01 0.123 0.106 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000116641 DOCK7 340941 sc-eQTL 6.35e-01 0.0532 0.112 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000125703 ATG4C 245195 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0617 0.0786 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -564394 sc-eQTL 5.13e-01 -0.073 0.111 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000162607 USP1 593030 sc-eQTL 4.41e-02 0.197 0.0974 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000240563 L1TD1 834478 sc-eQTL 1.91e-02 -0.23 0.0975 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 -564084 sc-eQTL 3.83e-02 -0.238 0.114 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 -338248 sc-eQTL 9.30e-01 -0.0103 0.117 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000116641 DOCK7 340941 sc-eQTL 3.42e-01 0.103 0.108 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000125703 ATG4C 245195 sc-eQTL 4.90e-01 0.0648 0.0937 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -564394 sc-eQTL 4.21e-01 0.0852 0.106 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000162607 USP1 593030 sc-eQTL 3.24e-01 0.108 0.109 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000240563 L1TD1 834478 sc-eQTL 2.27e-01 -0.109 0.0903 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 -564084 sc-eQTL 6.33e-01 0.0618 0.129 0.197 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 -338248 sc-eQTL 7.65e-02 -0.243 0.136 0.197 gdT L2
ENSG00000116641 DOCK7 340941 sc-eQTL 3.15e-01 0.136 0.135 0.197 gdT L2
ENSG00000125703 ATG4C 245195 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0973 0.129 0.197 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -564394 sc-eQTL 6.92e-01 0.0543 0.137 0.197 gdT L2
ENSG00000162607 USP1 593030 sc-eQTL 4.24e-01 0.104 0.129 0.197 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -494045 sc-eQTL 7.90e-01 -0.036 0.135 0.197 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 -564084 sc-eQTL 2.52e-01 -0.134 0.117 0.2 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -338248 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0462 0.109 0.2 intMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 340941 sc-eQTL 1.24e-01 -0.171 0.111 0.2 intMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 245195 sc-eQTL 4.89e-01 0.0737 0.106 0.2 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -564394 sc-eQTL 7.71e-01 0.0342 0.117 0.2 intMono L2
ENSG00000162607 USP1 593030 sc-eQTL 3.11e-01 -0.121 0.119 0.2 intMono L2
ENSG00000240563 L1TD1 834478 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0414 0.0877 0.2 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -564084 sc-eQTL 8.68e-02 -0.177 0.103 0.206 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -338248 sc-eQTL 2.05e-01 0.145 0.114 0.206 ncMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 340941 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0872 0.112 0.206 ncMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 245195 sc-eQTL 5.54e-01 0.0621 0.105 0.206 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -564394 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0855 0.11 0.206 ncMono L2
ENSG00000162607 USP1 593030 sc-eQTL 8.97e-01 0.0145 0.112 0.206 ncMono L2
ENSG00000240563 L1TD1 834478 sc-eQTL 2.40e-01 -0.0934 0.0792 0.206 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -564084 sc-eQTL 3.61e-01 -0.109 0.118 0.218 pDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -338248 sc-eQTL 1.39e-01 0.171 0.115 0.218 pDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 340941 sc-eQTL 3.22e-01 -0.117 0.118 0.218 pDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 245195 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0669 0.106 0.218 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -564394 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0529 0.119 0.218 pDC L2
ENSG00000162607 USP1 593030 sc-eQTL 9.88e-01 0.00186 0.121 0.218 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -494045 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0209 0.105 0.218 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -564084 sc-eQTL 1.18e-02 0.275 0.108 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -338248 sc-eQTL 3.81e-01 -0.106 0.121 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 340941 sc-eQTL 9.60e-01 0.00527 0.105 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 245195 sc-eQTL 9.39e-01 0.00648 0.0852 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -564394 sc-eQTL 2.71e-01 -0.123 0.112 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 593030 sc-eQTL 1.11e-01 -0.173 0.108 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -494045 sc-eQTL 2.30e-01 0.14 0.116 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -564084 sc-eQTL 7.41e-01 0.0378 0.114 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -338248 sc-eQTL 9.12e-01 -0.013 0.118 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 340941 sc-eQTL 6.71e-01 0.0467 0.11 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 245195 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00469 0.0838 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -564394 sc-eQTL 7.19e-01 0.0426 0.118 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 593030 sc-eQTL 2.54e-01 0.116 0.101 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -494045 sc-eQTL 3.89e-01 0.103 0.119 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -564084 sc-eQTL 1.20e-01 -0.167 0.107 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -338248 sc-eQTL 5.33e-01 0.0649 0.104 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 340941 sc-eQTL 3.74e-01 0.0931 0.104 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 245195 sc-eQTL 9.59e-01 0.00371 0.0723 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -564394 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0369 0.107 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 593030 sc-eQTL 1.15e-01 0.144 0.0909 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000240563 L1TD1 834478 sc-eQTL 8.06e-02 -0.173 0.0984 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -564084 sc-eQTL 8.67e-02 -0.174 0.101 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -338248 sc-eQTL 2.34e-01 0.138 0.115 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 340941 sc-eQTL 7.79e-02 -0.202 0.114 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 245195 sc-eQTL 5.82e-01 0.0539 0.0977 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -564394 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0282 0.113 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 593030 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0252 0.107 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000240563 L1TD1 834478 sc-eQTL 2.10e-01 -0.0912 0.0725 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -564084 sc-eQTL 7.95e-01 -0.023 0.0885 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -338248 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0455 0.106 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 340941 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0308 0.0952 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 245195 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0196 0.0951 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -564394 sc-eQTL 1.75e-01 0.153 0.112 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 593030 sc-eQTL 4.53e-02 -0.204 0.101 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -494045 sc-eQTL 3.77e-01 -0.11 0.124 0.198 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000116641 DOCK7 340959 eQTL 0.0456 0.0532 0.0266 0.0 0.0 0.22
ENSG00000116652 DLEU2L -517755 eQTL 0.00743 -0.0834 0.0311 0.00253 0.0 0.22

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina