logo

Genes within 1Mb (chr1:63028902:GGAGGT:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -564509 sc-eQTL 1.71e-01 0.195 0.142 0.081 B L1
ENSG00000088035 ALG6 -338673 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0768 0.147 0.081 B L1
ENSG00000116641 DOCK7 340516 sc-eQTL 8.71e-01 0.024 0.147 0.081 B L1
ENSG00000125703 ATG4C 244770 sc-eQTL 3.31e-01 0.0997 0.102 0.081 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -564819 sc-eQTL 3.74e-01 -0.145 0.163 0.081 B L1
ENSG00000162607 USP1 592605 sc-eQTL 9.09e-01 0.0161 0.142 0.081 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -494470 sc-eQTL 3.69e-01 0.15 0.167 0.081 B L1
ENSG00000079739 PGM1 -564509 sc-eQTL 4.34e-01 0.0951 0.121 0.081 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 -338673 sc-eQTL 8.59e-01 0.0239 0.134 0.081 CD4T L1
ENSG00000116641 DOCK7 340516 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0718 0.136 0.081 CD4T L1
ENSG00000125703 ATG4C 244770 sc-eQTL 1.40e-01 -0.162 0.109 0.081 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -564819 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0718 0.156 0.081 CD4T L1
ENSG00000162607 USP1 592605 sc-eQTL 7.71e-01 0.0311 0.106 0.081 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -494470 sc-eQTL 9.91e-01 0.00158 0.14 0.081 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 -564509 sc-eQTL 4.53e-01 0.101 0.134 0.081 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 -338673 sc-eQTL 6.68e-01 0.0633 0.148 0.081 CD8T L1
ENSG00000116641 DOCK7 340516 sc-eQTL 3.82e-01 0.131 0.149 0.081 CD8T L1
ENSG00000125703 ATG4C 244770 sc-eQTL 7.50e-01 0.0454 0.142 0.081 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -564819 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0503 0.159 0.081 CD8T L1
ENSG00000162607 USP1 592605 sc-eQTL 6.23e-01 0.0609 0.124 0.081 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -494470 sc-eQTL 6.04e-01 0.0823 0.158 0.081 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 -564509 sc-eQTL 9.98e-01 0.000324 0.147 0.081 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 -338673 sc-eQTL 4.58e-01 0.113 0.151 0.081 DC L1
ENSG00000116641 DOCK7 340516 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00894 0.155 0.081 DC L1
ENSG00000125703 ATG4C 244770 sc-eQTL 1.44e-01 -0.177 0.121 0.081 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -564819 sc-eQTL 9.49e-01 0.0109 0.17 0.081 DC L1
ENSG00000162607 USP1 592605 sc-eQTL 9.95e-01 0.000899 0.148 0.081 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -494470 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0991 0.148 0.081 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 -564509 sc-eQTL 3.31e-01 -0.141 0.145 0.081 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 -338673 sc-eQTL 9.70e-01 0.00561 0.151 0.081 Mono L1
ENSG00000116641 DOCK7 340516 sc-eQTL 4.11e-01 0.12 0.146 0.081 Mono L1
ENSG00000125703 ATG4C 244770 sc-eQTL 3.12e-01 -0.1 0.0988 0.081 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -564819 sc-eQTL 2.88e-01 -0.166 0.156 0.081 Mono L1
ENSG00000162607 USP1 592605 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00681 0.128 0.081 Mono L1
ENSG00000240563 L1TD1 834053 sc-eQTL 3.28e-02 -0.255 0.119 0.081 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 -564509 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0479 0.123 0.082 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 -338673 sc-eQTL 4.02e-01 -0.121 0.144 0.082 NK L1
ENSG00000116641 DOCK7 340516 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0243 0.119 0.082 NK L1
ENSG00000125703 ATG4C 244770 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00843 0.128 0.082 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -564819 sc-eQTL 7.18e-01 0.0575 0.159 0.082 NK L1
ENSG00000162607 USP1 592605 sc-eQTL 3.08e-01 0.145 0.142 0.082 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -494470 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0961 0.173 0.082 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 -564509 sc-eQTL 4.70e-01 0.104 0.143 0.081 Other_T L1
ENSG00000088035 ALG6 -338673 sc-eQTL 9.44e-01 0.0101 0.144 0.081 Other_T L1
ENSG00000116641 DOCK7 340516 sc-eQTL 2.41e-01 0.172 0.147 0.081 Other_T L1
ENSG00000125703 ATG4C 244770 sc-eQTL 3.28e-01 0.124 0.127 0.081 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -564819 sc-eQTL 5.93e-02 0.212 0.112 0.081 Other_T L1
ENSG00000162607 USP1 592605 sc-eQTL 5.39e-01 0.0601 0.0978 0.081 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -494470 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0719 0.174 0.081 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -564509 sc-eQTL 2.98e-01 0.209 0.2 0.077 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 -338673 sc-eQTL 4.99e-01 -0.13 0.192 0.077 B_Activated L2
ENSG00000116641 DOCK7 340516 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0915 0.179 0.077 B_Activated L2
ENSG00000125703 ATG4C 244770 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0637 0.188 0.077 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -564819 sc-eQTL 2.11e-01 -0.23 0.183 0.077 B_Activated L2
ENSG00000162607 USP1 592605 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0371 0.199 0.077 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -494470 sc-eQTL 3.05e-01 0.179 0.174 0.077 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 -564509 sc-eQTL 1.07e-01 0.274 0.169 0.082 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 -338673 sc-eQTL 8.48e-02 -0.297 0.172 0.082 B_Intermediate L2
ENSG00000116641 DOCK7 340516 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0304 0.165 0.082 B_Intermediate L2
ENSG00000125703 ATG4C 244770 sc-eQTL 3.13e-01 0.141 0.139 0.082 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -564819 sc-eQTL 9.55e-01 0.00938 0.167 0.082 B_Intermediate L2
ENSG00000162607 USP1 592605 sc-eQTL 6.48e-01 -0.076 0.166 0.082 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -494470 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00465 0.165 0.082 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 -564509 sc-eQTL 1.91e-01 0.224 0.171 0.082 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 -338673 sc-eQTL 1.74e-01 -0.237 0.174 0.082 B_Memory L2
ENSG00000116641 DOCK7 340516 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0435 0.164 0.082 B_Memory L2
ENSG00000125703 ATG4C 244770 sc-eQTL 4.43e-01 0.119 0.155 0.082 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -564819 sc-eQTL 5.20e-01 0.115 0.178 0.082 B_Memory L2
ENSG00000162607 USP1 592605 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0615 0.179 0.082 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -494470 sc-eQTL 1.83e-01 -0.235 0.176 0.082 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 -564509 sc-eQTL 1.49e-01 0.24 0.166 0.081 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 -338673 sc-eQTL 6.10e-01 0.0853 0.167 0.081 B_Naive1 L2
ENSG00000116641 DOCK7 340516 sc-eQTL 4.30e-01 -0.126 0.16 0.081 B_Naive1 L2
ENSG00000125703 ATG4C 244770 sc-eQTL 8.13e-02 0.214 0.122 0.081 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -564819 sc-eQTL 3.05e-01 -0.168 0.163 0.081 B_Naive1 L2
ENSG00000162607 USP1 592605 sc-eQTL 7.84e-01 0.0394 0.144 0.081 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -494470 sc-eQTL 2.60e-01 0.197 0.174 0.081 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 -564509 sc-eQTL 3.99e-01 -0.137 0.163 0.082 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 -338673 sc-eQTL 3.30e-01 0.166 0.169 0.082 B_Naive2 L2
ENSG00000116641 DOCK7 340516 sc-eQTL 3.88e-01 0.141 0.163 0.082 B_Naive2 L2
ENSG00000125703 ATG4C 244770 sc-eQTL 9.90e-02 -0.259 0.156 0.082 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -564819 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0666 0.17 0.082 B_Naive2 L2
ENSG00000162607 USP1 592605 sc-eQTL 3.07e-01 0.166 0.162 0.082 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -494470 sc-eQTL 9.31e-01 0.0148 0.17 0.082 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 -564509 sc-eQTL 5.37e-01 0.107 0.174 0.077 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -338673 sc-eQTL 8.77e-01 0.0284 0.184 0.077 CD4_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 340516 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0677 0.161 0.077 CD4_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 244770 sc-eQTL 6.81e-01 0.0685 0.166 0.077 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -564819 sc-eQTL 7.02e-02 -0.321 0.176 0.077 CD4_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 592605 sc-eQTL 8.32e-02 -0.293 0.168 0.077 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -494470 sc-eQTL 3.01e-01 -0.175 0.169 0.077 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -564509 sc-eQTL 1.43e-01 0.2 0.136 0.081 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -338673 sc-eQTL 8.09e-01 0.0359 0.149 0.081 CD4_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 340516 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0346 0.146 0.081 CD4_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 244770 sc-eQTL 3.13e-01 -0.13 0.129 0.081 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -564819 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0289 0.158 0.081 CD4_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 592605 sc-eQTL 2.23e-01 0.147 0.12 0.081 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -494470 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0772 0.157 0.081 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -564509 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00789 0.142 0.081 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -338673 sc-eQTL 6.37e-01 0.0779 0.165 0.081 CD4_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 340516 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0172 0.146 0.081 CD4_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 244770 sc-eQTL 4.57e-01 -0.106 0.142 0.081 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -564819 sc-eQTL 3.99e-01 -0.141 0.167 0.081 CD4_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 592605 sc-eQTL 9.22e-01 0.0134 0.137 0.081 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -494470 sc-eQTL 8.59e-02 0.278 0.161 0.081 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -564509 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0467 0.171 0.081 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -338673 sc-eQTL 9.19e-01 0.0175 0.172 0.081 CD4_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 340516 sc-eQTL 9.96e-01 0.000911 0.167 0.081 CD4_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 244770 sc-eQTL 2.69e-01 -0.18 0.162 0.081 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -564819 sc-eQTL 2.61e-01 -0.189 0.167 0.081 CD4_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 592605 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0302 0.159 0.081 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -494470 sc-eQTL 7.93e-01 0.0456 0.174 0.081 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -564509 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0177 0.152 0.081 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -338673 sc-eQTL 5.17e-01 0.105 0.161 0.081 CD8_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 340516 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0834 0.153 0.081 CD8_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 244770 sc-eQTL 3.47e-01 0.153 0.163 0.081 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -564819 sc-eQTL 5.47e-01 -0.102 0.169 0.081 CD8_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 592605 sc-eQTL 8.82e-01 0.0226 0.152 0.081 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -494470 sc-eQTL 2.74e-01 0.19 0.173 0.081 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -564509 sc-eQTL 2.95e-01 0.163 0.155 0.081 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -338673 sc-eQTL 2.82e-01 0.174 0.161 0.081 CD8_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 340516 sc-eQTL 2.99e-01 0.173 0.166 0.081 CD8_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 244770 sc-eQTL 1.12e-01 0.254 0.159 0.081 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -564819 sc-eQTL 3.95e-01 -0.138 0.162 0.081 CD8_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 592605 sc-eQTL 2.76e-01 0.149 0.137 0.081 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -494470 sc-eQTL 8.94e-01 0.0203 0.153 0.081 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -564509 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0452 0.168 0.083 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -338673 sc-eQTL 2.10e-01 -0.213 0.169 0.083 CD8_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 340516 sc-eQTL 7.25e-01 0.0584 0.166 0.083 CD8_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 244770 sc-eQTL 1.55e-01 -0.241 0.169 0.083 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -564819 sc-eQTL 3.32e-01 0.16 0.164 0.083 CD8_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 592605 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0661 0.158 0.083 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -494470 sc-eQTL 9.60e-01 0.00835 0.168 0.083 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -564509 sc-eQTL 1.60e-02 0.439 0.181 0.075 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -338673 sc-eQTL 1.02e-01 0.3 0.183 0.075 CD8_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 340516 sc-eQTL 2.84e-01 0.191 0.178 0.075 CD8_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 244770 sc-eQTL 2.12e-01 -0.214 0.171 0.075 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -564819 sc-eQTL 7.83e-01 0.0511 0.186 0.075 CD8_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 592605 sc-eQTL 9.66e-01 -0.0075 0.177 0.075 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -494470 sc-eQTL 2.38e-01 0.212 0.179 0.075 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -564509 sc-eQTL 1.04e-01 -0.283 0.173 0.076 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 -338673 sc-eQTL 6.74e-01 0.0728 0.173 0.076 MAIT L2
ENSG00000116641 DOCK7 340516 sc-eQTL 1.36e-01 0.246 0.165 0.076 MAIT L2
ENSG00000125703 ATG4C 244770 sc-eQTL 1.62e-01 0.244 0.174 0.076 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -564819 sc-eQTL 7.66e-01 -0.052 0.175 0.076 MAIT L2
ENSG00000162607 USP1 592605 sc-eQTL 1.83e-01 0.231 0.173 0.076 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -494470 sc-eQTL 7.58e-01 0.0556 0.18 0.076 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 -564509 sc-eQTL 9.99e-01 0.000151 0.166 0.082 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 -338673 sc-eQTL 2.27e-01 0.206 0.17 0.082 NK_CD56bright L2
ENSG00000116641 DOCK7 340516 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0589 0.148 0.082 NK_CD56bright L2
ENSG00000125703 ATG4C 244770 sc-eQTL 2.68e-02 0.364 0.163 0.082 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -564819 sc-eQTL 1.57e-01 -0.243 0.171 0.082 NK_CD56bright L2
ENSG00000162607 USP1 592605 sc-eQTL 8.13e-01 0.042 0.177 0.082 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -494470 sc-eQTL 3.48e-01 -0.159 0.169 0.082 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 -564509 sc-eQTL 9.18e-01 0.0133 0.128 0.082 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 -338673 sc-eQTL 6.71e-01 -0.069 0.162 0.082 NK_CD56dim L2
ENSG00000116641 DOCK7 340516 sc-eQTL 3.46e-01 -0.133 0.141 0.082 NK_CD56dim L2
ENSG00000125703 ATG4C 244770 sc-eQTL 4.26e-01 -0.114 0.143 0.082 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -564819 sc-eQTL 4.58e-01 0.121 0.163 0.082 NK_CD56dim L2
ENSG00000162607 USP1 592605 sc-eQTL 2.24e-01 0.193 0.158 0.082 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -494470 sc-eQTL 5.25e-01 -0.112 0.176 0.082 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 -564509 sc-eQTL 1.96e-01 -0.222 0.171 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 -338673 sc-eQTL 3.63e-01 -0.162 0.177 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000116641 DOCK7 340516 sc-eQTL 8.07e-01 0.0332 0.136 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000125703 ATG4C 244770 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000893 0.158 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -564819 sc-eQTL 4.08e-01 -0.137 0.166 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000162607 USP1 592605 sc-eQTL 4.08e-01 -0.144 0.173 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -494470 sc-eQTL 8.56e-01 0.0288 0.158 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 -564509 sc-eQTL 8.58e-01 0.0249 0.14 0.082 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 -338673 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0902 0.158 0.082 NK_cytokine L2
ENSG00000116641 DOCK7 340516 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0657 0.146 0.082 NK_cytokine L2
ENSG00000125703 ATG4C 244770 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0771 0.149 0.082 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -564819 sc-eQTL 9.85e-01 0.003 0.155 0.082 NK_cytokine L2
ENSG00000162607 USP1 592605 sc-eQTL 9.76e-01 0.00487 0.163 0.082 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -494470 sc-eQTL 7.18e-01 0.0596 0.165 0.082 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 -564509 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0911 0.22 0.063 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 -338673 sc-eQTL 1.68e-01 0.318 0.229 0.063 PB L2
ENSG00000116641 DOCK7 340516 sc-eQTL 3.29e-01 0.241 0.246 0.063 PB L2
ENSG00000125703 ATG4C 244770 sc-eQTL 1.71e-01 0.294 0.214 0.063 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -564819 sc-eQTL 4.32e-01 0.169 0.214 0.063 PB L2
ENSG00000162607 USP1 592605 sc-eQTL 8.21e-01 0.0485 0.214 0.063 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -494470 sc-eQTL 5.50e-01 -0.141 0.236 0.063 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 -564509 sc-eQTL 2.17e-01 0.186 0.151 0.083 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 -338673 sc-eQTL 2.53e-01 0.176 0.153 0.083 Pro_T L2
ENSG00000116641 DOCK7 340516 sc-eQTL 4.12e-02 -0.314 0.153 0.083 Pro_T L2
ENSG00000125703 ATG4C 244770 sc-eQTL 9.32e-01 -0.0115 0.135 0.083 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -564819 sc-eQTL 5.12e-01 0.089 0.135 0.083 Pro_T L2
ENSG00000162607 USP1 592605 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0197 0.0931 0.083 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -494470 sc-eQTL 8.83e-01 0.0232 0.157 0.083 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 -564509 sc-eQTL 9.10e-01 0.0185 0.164 0.081 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 -338673 sc-eQTL 4.48e-01 -0.133 0.175 0.081 Treg L2
ENSG00000116641 DOCK7 340516 sc-eQTL 1.35e-01 -0.241 0.16 0.081 Treg L2
ENSG00000125703 ATG4C 244770 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0414 0.165 0.081 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -564819 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0837 0.172 0.081 Treg L2
ENSG00000162607 USP1 592605 sc-eQTL 9.29e-01 -0.0148 0.167 0.081 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -494470 sc-eQTL 2.72e-01 -0.181 0.164 0.081 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 -564509 sc-eQTL 8.03e-02 0.275 0.156 0.085 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -338673 sc-eQTL 4.37e-01 -0.124 0.16 0.085 cDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 340516 sc-eQTL 6.59e-01 0.0693 0.157 0.085 cDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 244770 sc-eQTL 4.35e-01 -0.106 0.136 0.085 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -564819 sc-eQTL 9.29e-01 0.0155 0.173 0.085 cDC L2
ENSG00000162607 USP1 592605 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0548 0.154 0.085 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -494470 sc-eQTL 1.43e-01 -0.203 0.138 0.085 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 -564509 sc-eQTL 6.16e-01 0.0775 0.154 0.081 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 -338673 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0591 0.155 0.081 cMono_IL1B L2
ENSG00000116641 DOCK7 340516 sc-eQTL 7.16e-01 0.0595 0.163 0.081 cMono_IL1B L2
ENSG00000125703 ATG4C 244770 sc-eQTL 1.74e-01 -0.156 0.114 0.081 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -564819 sc-eQTL 4.60e-01 -0.12 0.162 0.081 cMono_IL1B L2
ENSG00000162607 USP1 592605 sc-eQTL 8.55e-01 0.0262 0.143 0.081 cMono_IL1B L2
ENSG00000240563 L1TD1 834053 sc-eQTL 7.42e-04 -0.479 0.14 0.081 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 -564509 sc-eQTL 3.06e-01 -0.173 0.168 0.081 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 -338673 sc-eQTL 6.59e-01 0.0755 0.171 0.081 cMono_S100A L2
ENSG00000116641 DOCK7 340516 sc-eQTL 1.71e-01 0.217 0.158 0.081 cMono_S100A L2
ENSG00000125703 ATG4C 244770 sc-eQTL 4.03e-01 -0.115 0.137 0.081 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -564819 sc-eQTL 4.27e-01 -0.123 0.155 0.081 cMono_S100A L2
ENSG00000162607 USP1 592605 sc-eQTL 9.62e-01 0.00754 0.159 0.081 cMono_S100A L2
ENSG00000240563 L1TD1 834053 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0563 0.132 0.081 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 -564509 sc-eQTL 4.29e-01 0.149 0.188 0.082 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 -338673 sc-eQTL 1.20e-01 -0.311 0.199 0.082 gdT L2
ENSG00000116641 DOCK7 340516 sc-eQTL 2.74e-01 0.216 0.196 0.082 gdT L2
ENSG00000125703 ATG4C 244770 sc-eQTL 2.24e-01 -0.229 0.187 0.082 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -564819 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0231 0.2 0.082 gdT L2
ENSG00000162607 USP1 592605 sc-eQTL 6.69e-01 -0.081 0.189 0.082 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -494470 sc-eQTL 9.54e-01 -0.0113 0.197 0.082 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 -564509 sc-eQTL 2.01e-01 -0.217 0.169 0.08 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -338673 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0628 0.158 0.08 intMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 340516 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0352 0.161 0.08 intMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 244770 sc-eQTL 7.22e-02 0.276 0.153 0.08 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -564819 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0879 0.169 0.08 intMono L2
ENSG00000162607 USP1 592605 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0555 0.172 0.08 intMono L2
ENSG00000240563 L1TD1 834053 sc-eQTL 2.06e-01 -0.16 0.126 0.08 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -564509 sc-eQTL 1.68e-01 -0.206 0.148 0.084 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -338673 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0645 0.164 0.084 ncMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 340516 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0576 0.161 0.084 ncMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 244770 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0336 0.151 0.084 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -564819 sc-eQTL 3.52e-01 -0.147 0.157 0.084 ncMono L2
ENSG00000162607 USP1 592605 sc-eQTL 5.18e-01 0.104 0.161 0.084 ncMono L2
ENSG00000240563 L1TD1 834053 sc-eQTL 1.71e-01 -0.156 0.114 0.084 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -564509 sc-eQTL 6.24e-02 -0.316 0.168 0.096 pDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -338673 sc-eQTL 1.25e-01 0.254 0.164 0.096 pDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 340516 sc-eQTL 7.01e-02 -0.305 0.167 0.096 pDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 244770 sc-eQTL 4.96e-01 -0.103 0.152 0.096 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -564819 sc-eQTL 3.06e-01 -0.175 0.17 0.096 pDC L2
ENSG00000162607 USP1 592605 sc-eQTL 2.69e-01 0.192 0.173 0.096 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -494470 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0256 0.151 0.096 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -564509 sc-eQTL 1.71e-01 0.216 0.157 0.081 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -338673 sc-eQTL 5.09e-03 -0.486 0.172 0.081 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 340516 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0401 0.152 0.081 B_Memory LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 244770 sc-eQTL 2.42e-01 0.144 0.122 0.081 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -564819 sc-eQTL 9.12e-01 0.0179 0.161 0.081 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 592605 sc-eQTL 3.75e-01 -0.139 0.156 0.081 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -494470 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0448 0.168 0.081 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -564509 sc-eQTL 8.87e-01 0.0231 0.163 0.081 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -338673 sc-eQTL 3.07e-01 0.171 0.167 0.081 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 340516 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0234 0.156 0.081 B_Naive LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 244770 sc-eQTL 7.86e-01 0.0325 0.119 0.081 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -564819 sc-eQTL 4.80e-01 -0.119 0.168 0.081 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 592605 sc-eQTL 5.69e-01 0.0826 0.145 0.081 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -494470 sc-eQTL 3.02e-01 0.175 0.169 0.081 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -564509 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0244 0.156 0.081 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -338673 sc-eQTL 9.45e-01 -0.0104 0.151 0.081 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 340516 sc-eQTL 3.03e-01 0.157 0.152 0.081 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 244770 sc-eQTL 1.88e-01 -0.139 0.105 0.081 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -564819 sc-eQTL 1.99e-01 -0.2 0.155 0.081 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 592605 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0324 0.133 0.081 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000240563 L1TD1 834053 sc-eQTL 1.27e-02 -0.358 0.142 0.081 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -564509 sc-eQTL 6.47e-02 -0.268 0.145 0.082 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -338673 sc-eQTL 8.03e-01 0.0413 0.165 0.082 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 340516 sc-eQTL 5.40e-01 -0.1 0.164 0.082 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 244770 sc-eQTL 3.70e-01 0.125 0.139 0.082 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -564819 sc-eQTL 2.05e-01 -0.205 0.161 0.082 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 592605 sc-eQTL 8.04e-01 0.0379 0.152 0.082 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000240563 L1TD1 834053 sc-eQTL 2.85e-02 -0.227 0.103 0.082 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -564509 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0485 0.125 0.082 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -338673 sc-eQTL 3.06e-01 -0.154 0.15 0.082 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 340516 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0979 0.135 0.082 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 244770 sc-eQTL 3.75e-01 -0.119 0.134 0.082 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -564819 sc-eQTL 4.82e-01 0.112 0.159 0.082 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 592605 sc-eQTL 3.51e-01 0.135 0.144 0.082 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -494470 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0851 0.176 0.082 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000116641 DOCK7 340534 eQTL 0.018 0.0869 0.0367 0.0 0.0 0.0972

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina