logo

Genes within 1Mb (chr1:63027493:T:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -565918 sc-eQTL 4.77e-01 0.0696 0.0977 0.19 B L1
ENSG00000088035 ALG6 -340082 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0443 0.101 0.19 B L1
ENSG00000116641 DOCK7 339107 sc-eQTL 6.20e-01 0.0503 0.101 0.19 B L1
ENSG00000125703 ATG4C 243361 sc-eQTL 6.11e-01 0.0358 0.0704 0.19 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -566228 sc-eQTL 9.03e-01 0.0137 0.112 0.19 B L1
ENSG00000162607 USP1 591196 sc-eQTL 5.90e-01 0.0525 0.0972 0.19 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -495879 sc-eQTL 9.31e-02 0.192 0.114 0.19 B L1
ENSG00000079739 PGM1 -565918 sc-eQTL 9.22e-01 -0.00826 0.0848 0.19 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 -340082 sc-eQTL 1.41e-01 0.138 0.0931 0.19 CD4T L1
ENSG00000116641 DOCK7 339107 sc-eQTL 8.99e-01 -0.012 0.0948 0.19 CD4T L1
ENSG00000125703 ATG4C 243361 sc-eQTL 1.71e-01 -0.105 0.0762 0.19 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -566228 sc-eQTL 7.43e-01 0.0356 0.109 0.19 CD4T L1
ENSG00000162607 USP1 591196 sc-eQTL 7.17e-01 0.0269 0.0742 0.19 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -495879 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0347 0.0975 0.19 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 -565918 sc-eQTL 8.40e-01 0.0192 0.0953 0.19 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 -340082 sc-eQTL 3.24e-01 -0.104 0.105 0.19 CD8T L1
ENSG00000116641 DOCK7 339107 sc-eQTL 3.73e-01 0.0948 0.106 0.19 CD8T L1
ENSG00000125703 ATG4C 243361 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0345 0.101 0.19 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -566228 sc-eQTL 5.01e-01 0.0761 0.113 0.19 CD8T L1
ENSG00000162607 USP1 591196 sc-eQTL 5.24e-01 0.0562 0.088 0.19 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -495879 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0176 0.113 0.19 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 -565918 sc-eQTL 7.67e-01 0.0304 0.102 0.194 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 -340082 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0185 0.106 0.194 DC L1
ENSG00000116641 DOCK7 339107 sc-eQTL 8.99e-01 0.0137 0.108 0.194 DC L1
ENSG00000125703 ATG4C 243361 sc-eQTL 5.24e-01 -0.054 0.0848 0.194 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -566228 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0112 0.119 0.194 DC L1
ENSG00000162607 USP1 591196 sc-eQTL 7.87e-01 -0.028 0.104 0.194 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -495879 sc-eQTL 3.08e-01 -0.105 0.103 0.194 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 -565918 sc-eQTL 6.10e-02 -0.189 0.1 0.19 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 -340082 sc-eQTL 2.16e-01 0.13 0.105 0.19 Mono L1
ENSG00000116641 DOCK7 339107 sc-eQTL 4.03e-01 0.0852 0.102 0.19 Mono L1
ENSG00000125703 ATG4C 243361 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0363 0.0688 0.19 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -566228 sc-eQTL 9.52e-01 -0.0066 0.109 0.19 Mono L1
ENSG00000162607 USP1 591196 sc-eQTL 1.92e-01 0.117 0.089 0.19 Mono L1
ENSG00000240563 L1TD1 832644 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0625 0.0833 0.19 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 -565918 sc-eQTL 9.75e-01 0.00279 0.0877 0.191 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 -340082 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0737 0.103 0.191 NK L1
ENSG00000116641 DOCK7 339107 sc-eQTL 4.50e-01 -0.064 0.0846 0.191 NK L1
ENSG00000125703 ATG4C 243361 sc-eQTL 9.04e-01 -0.011 0.091 0.191 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -566228 sc-eQTL 1.90e-01 0.148 0.113 0.191 NK L1
ENSG00000162607 USP1 591196 sc-eQTL 1.73e-01 -0.138 0.101 0.191 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -495879 sc-eQTL 2.82e-01 -0.132 0.122 0.191 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 -565918 sc-eQTL 7.43e-01 0.0328 0.0999 0.19 Other_T L1
ENSG00000088035 ALG6 -340082 sc-eQTL 8.21e-01 0.0227 0.1 0.19 Other_T L1
ENSG00000116641 DOCK7 339107 sc-eQTL 1.17e-01 0.161 0.102 0.19 Other_T L1
ENSG00000125703 ATG4C 243361 sc-eQTL 9.71e-01 0.00323 0.0887 0.19 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -566228 sc-eQTL 4.74e-02 0.156 0.078 0.19 Other_T L1
ENSG00000162607 USP1 591196 sc-eQTL 5.28e-01 0.0431 0.0681 0.19 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -495879 sc-eQTL 5.37e-01 -0.075 0.121 0.19 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -565918 sc-eQTL 2.78e-01 0.153 0.14 0.179 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 -340082 sc-eQTL 4.90e-02 -0.264 0.133 0.179 B_Activated L2
ENSG00000116641 DOCK7 339107 sc-eQTL 2.09e-01 -0.158 0.125 0.179 B_Activated L2
ENSG00000125703 ATG4C 243361 sc-eQTL 2.30e-01 -0.158 0.131 0.179 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -566228 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0425 0.129 0.179 B_Activated L2
ENSG00000162607 USP1 591196 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0147 0.14 0.179 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -495879 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00282 0.122 0.179 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 -565918 sc-eQTL 1.45e-02 0.288 0.117 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 -340082 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0559 0.12 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000116641 DOCK7 339107 sc-eQTL 2.17e-01 0.142 0.115 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000125703 ATG4C 243361 sc-eQTL 4.98e-01 0.066 0.0972 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -566228 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0922 0.116 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000162607 USP1 591196 sc-eQTL 2.55e-01 -0.132 0.115 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -495879 sc-eQTL 2.76e-01 0.125 0.115 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 -565918 sc-eQTL 2.67e-01 0.128 0.115 0.192 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 -340082 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0528 0.117 0.192 B_Memory L2
ENSG00000116641 DOCK7 339107 sc-eQTL 2.26e-01 -0.133 0.11 0.192 B_Memory L2
ENSG00000125703 ATG4C 243361 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0289 0.105 0.192 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -566228 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0859 0.12 0.192 B_Memory L2
ENSG00000162607 USP1 591196 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0493 0.121 0.192 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -495879 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0153 0.119 0.192 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 -565918 sc-eQTL 4.67e-01 0.0853 0.117 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 -340082 sc-eQTL 9.61e-01 0.0057 0.117 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000116641 DOCK7 339107 sc-eQTL 5.61e-01 0.0655 0.112 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000125703 ATG4C 243361 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0173 0.0867 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -566228 sc-eQTL 7.80e-01 0.0322 0.115 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000162607 USP1 591196 sc-eQTL 7.70e-01 0.0296 0.101 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -495879 sc-eQTL 1.59e-01 0.173 0.122 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 -565918 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0199 0.114 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 -340082 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0794 0.119 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000116641 DOCK7 339107 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0545 0.114 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000125703 ATG4C 243361 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0293 0.11 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -566228 sc-eQTL 5.81e-01 0.0659 0.119 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000162607 USP1 591196 sc-eQTL 2.50e-01 0.131 0.113 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -495879 sc-eQTL 9.93e-01 -0.00101 0.119 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 -565918 sc-eQTL 3.73e-01 -0.106 0.118 0.189 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -340082 sc-eQTL 7.05e-01 0.0474 0.125 0.189 CD4_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 339107 sc-eQTL 2.69e-01 -0.121 0.109 0.189 CD4_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 243361 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000529 0.113 0.189 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -566228 sc-eQTL 4.58e-01 -0.09 0.121 0.189 CD4_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 591196 sc-eQTL 8.98e-01 0.0148 0.115 0.189 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -495879 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0254 0.115 0.189 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -565918 sc-eQTL 5.82e-01 0.0527 0.0956 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -340082 sc-eQTL 2.52e-01 0.119 0.104 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 339107 sc-eQTL 7.07e-01 0.0384 0.102 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 243361 sc-eQTL 2.44e-01 -0.105 0.09 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -566228 sc-eQTL 9.94e-01 0.000855 0.11 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 591196 sc-eQTL 2.82e-01 0.0907 0.084 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -495879 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0839 0.109 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -565918 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0548 0.0984 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -340082 sc-eQTL 1.26e-01 0.175 0.114 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 339107 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0297 0.101 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 243361 sc-eQTL 7.77e-01 -0.028 0.0987 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -566228 sc-eQTL 5.17e-01 0.0754 0.116 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 591196 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0704 0.0953 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -495879 sc-eQTL 7.11e-01 0.0417 0.113 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -565918 sc-eQTL 2.01e-02 -0.273 0.116 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -340082 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0533 0.118 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 339107 sc-eQTL 9.19e-01 0.0117 0.116 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 243361 sc-eQTL 4.25e-01 -0.0895 0.112 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -566228 sc-eQTL 6.31e-01 0.0557 0.116 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 591196 sc-eQTL 4.00e-01 0.0923 0.11 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -495879 sc-eQTL 8.05e-01 0.0296 0.12 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -565918 sc-eQTL 2.45e-01 -0.124 0.106 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -340082 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0648 0.113 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 339107 sc-eQTL 4.92e-01 0.074 0.107 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 243361 sc-eQTL 8.23e-01 0.0256 0.114 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -566228 sc-eQTL 8.13e-01 0.0282 0.119 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 591196 sc-eQTL 2.23e-01 0.13 0.106 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -495879 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0949 0.122 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -565918 sc-eQTL 3.33e-01 0.104 0.107 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -340082 sc-eQTL 5.87e-01 0.0606 0.111 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 339107 sc-eQTL 5.81e-02 0.218 0.114 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 243361 sc-eQTL 2.74e-01 0.121 0.11 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -566228 sc-eQTL 4.64e-01 0.0821 0.112 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 591196 sc-eQTL 3.03e-01 0.0975 0.0944 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -495879 sc-eQTL 5.44e-01 0.064 0.106 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -565918 sc-eQTL 8.13e-01 0.0281 0.119 0.199 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -340082 sc-eQTL 2.57e-02 -0.267 0.119 0.199 CD8_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 339107 sc-eQTL 9.17e-01 0.0123 0.117 0.199 CD8_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 243361 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0685 0.12 0.199 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -566228 sc-eQTL 6.05e-02 0.218 0.116 0.199 CD8_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 591196 sc-eQTL 4.71e-01 0.081 0.112 0.199 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -495879 sc-eQTL 8.83e-01 0.0176 0.119 0.199 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -565918 sc-eQTL 7.64e-02 0.217 0.122 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -340082 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0415 0.123 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 339107 sc-eQTL 1.51e-01 0.171 0.119 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 243361 sc-eQTL 8.40e-02 -0.198 0.114 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -566228 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0388 0.124 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 591196 sc-eQTL 3.85e-01 0.103 0.118 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -495879 sc-eQTL 8.40e-02 0.208 0.12 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -565918 sc-eQTL 6.41e-01 0.0539 0.116 0.186 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 -340082 sc-eQTL 4.13e-01 0.0937 0.114 0.186 MAIT L2
ENSG00000116641 DOCK7 339107 sc-eQTL 1.06e-01 0.177 0.109 0.186 MAIT L2
ENSG00000125703 ATG4C 243361 sc-eQTL 4.87e-01 0.0804 0.115 0.186 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -566228 sc-eQTL 9.66e-01 0.00495 0.116 0.186 MAIT L2
ENSG00000162607 USP1 591196 sc-eQTL 5.91e-01 0.0619 0.115 0.186 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -495879 sc-eQTL 9.47e-01 0.00792 0.119 0.186 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 -565918 sc-eQTL 3.74e-01 0.102 0.115 0.191 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 -340082 sc-eQTL 9.28e-01 0.0106 0.118 0.191 NK_CD56bright L2
ENSG00000116641 DOCK7 339107 sc-eQTL 2.13e-01 -0.127 0.102 0.191 NK_CD56bright L2
ENSG00000125703 ATG4C 243361 sc-eQTL 6.76e-01 0.0477 0.114 0.191 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -566228 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0622 0.119 0.191 NK_CD56bright L2
ENSG00000162607 USP1 591196 sc-eQTL 1.95e-01 0.158 0.122 0.191 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -495879 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0399 0.117 0.191 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 -565918 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0176 0.0907 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 -340082 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00817 0.115 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000116641 DOCK7 339107 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0523 0.1 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000125703 ATG4C 243361 sc-eQTL 6.88e-01 0.0408 0.102 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -566228 sc-eQTL 6.88e-01 0.0465 0.116 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000162607 USP1 591196 sc-eQTL 1.11e-01 -0.179 0.112 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -495879 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0865 0.125 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 -565918 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0878 0.124 0.187 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 -340082 sc-eQTL 1.13e-02 -0.325 0.127 0.187 NK_HLA L2
ENSG00000116641 DOCK7 339107 sc-eQTL 3.15e-01 -0.0991 0.0984 0.187 NK_HLA L2
ENSG00000125703 ATG4C 243361 sc-eQTL 7.49e-01 0.0367 0.115 0.187 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -566228 sc-eQTL 1.44e-01 0.176 0.12 0.187 NK_HLA L2
ENSG00000162607 USP1 591196 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0455 0.126 0.187 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -495879 sc-eQTL 9.36e-01 0.00926 0.115 0.187 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 -565918 sc-eQTL 9.24e-01 0.00957 0.1 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 -340082 sc-eQTL 1.00e+00 -2.94e-05 0.113 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000116641 DOCK7 339107 sc-eQTL 5.34e-01 0.0654 0.105 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000125703 ATG4C 243361 sc-eQTL 2.46e-01 -0.125 0.107 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -566228 sc-eQTL 1.96e-01 0.144 0.111 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000162607 USP1 591196 sc-eQTL 8.60e-02 -0.2 0.116 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -495879 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00842 0.119 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 -565918 sc-eQTL 1.57e-01 -0.209 0.146 0.181 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 -340082 sc-eQTL 8.54e-01 0.0287 0.155 0.181 PB L2
ENSG00000116641 DOCK7 339107 sc-eQTL 3.23e-01 0.164 0.165 0.181 PB L2
ENSG00000125703 ATG4C 243361 sc-eQTL 2.18e-01 0.178 0.144 0.181 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -566228 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0184 0.144 0.181 PB L2
ENSG00000162607 USP1 591196 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0316 0.144 0.181 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -495879 sc-eQTL 7.90e-02 -0.277 0.156 0.181 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 -565918 sc-eQTL 4.17e-01 0.0865 0.106 0.193 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 -340082 sc-eQTL 2.05e-01 0.137 0.108 0.193 Pro_T L2
ENSG00000116641 DOCK7 339107 sc-eQTL 6.34e-01 0.0519 0.109 0.193 Pro_T L2
ENSG00000125703 ATG4C 243361 sc-eQTL 2.96e-01 -0.0996 0.095 0.193 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -566228 sc-eQTL 7.77e-02 0.168 0.0948 0.193 Pro_T L2
ENSG00000162607 USP1 591196 sc-eQTL 2.80e-01 0.0709 0.0655 0.193 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -495879 sc-eQTL 9.34e-01 0.00916 0.111 0.193 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 -565918 sc-eQTL 7.67e-01 0.0338 0.114 0.19 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 -340082 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0649 0.121 0.19 Treg L2
ENSG00000116641 DOCK7 339107 sc-eQTL 1.43e-01 -0.163 0.111 0.19 Treg L2
ENSG00000125703 ATG4C 243361 sc-eQTL 2.49e-01 0.131 0.114 0.19 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -566228 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0297 0.119 0.19 Treg L2
ENSG00000162607 USP1 591196 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0398 0.115 0.19 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -495879 sc-eQTL 8.19e-02 -0.198 0.113 0.19 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 -565918 sc-eQTL 2.35e-01 0.129 0.109 0.193 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -340082 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0937 0.11 0.193 cDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 339107 sc-eQTL 5.09e-01 0.0716 0.108 0.193 cDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 243361 sc-eQTL 2.98e-01 -0.098 0.0939 0.193 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -566228 sc-eQTL 8.60e-01 0.0211 0.119 0.193 cDC L2
ENSG00000162607 USP1 591196 sc-eQTL 8.31e-01 0.0227 0.106 0.193 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -495879 sc-eQTL 2.08e-02 -0.22 0.0945 0.193 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 -565918 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00643 0.106 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 -340082 sc-eQTL 1.49e-01 0.153 0.106 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000116641 DOCK7 339107 sc-eQTL 3.70e-01 0.1 0.112 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000125703 ATG4C 243361 sc-eQTL 2.71e-01 -0.0868 0.0786 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -566228 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0626 0.112 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000162607 USP1 591196 sc-eQTL 5.71e-02 0.187 0.0976 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000240563 L1TD1 832644 sc-eQTL 4.68e-02 -0.196 0.098 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 -565918 sc-eQTL 3.65e-02 -0.241 0.115 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 -340082 sc-eQTL 9.29e-01 0.0105 0.117 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000116641 DOCK7 339107 sc-eQTL 3.72e-01 0.0972 0.109 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000125703 ATG4C 243361 sc-eQTL 8.87e-01 0.0135 0.0942 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -566228 sc-eQTL 2.95e-01 0.111 0.106 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000162607 USP1 591196 sc-eQTL 4.06e-01 0.0909 0.109 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000240563 L1TD1 832644 sc-eQTL 1.68e-01 -0.125 0.0906 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 -565918 sc-eQTL 5.71e-01 0.0742 0.131 0.188 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 -340082 sc-eQTL 1.82e-01 -0.186 0.139 0.188 gdT L2
ENSG00000116641 DOCK7 339107 sc-eQTL 3.96e-01 0.116 0.137 0.188 gdT L2
ENSG00000125703 ATG4C 243361 sc-eQTL 4.33e-01 -0.103 0.13 0.188 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -566228 sc-eQTL 5.02e-01 0.0932 0.139 0.188 gdT L2
ENSG00000162607 USP1 591196 sc-eQTL 5.97e-01 0.0696 0.131 0.188 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -495879 sc-eQTL 9.19e-01 -0.014 0.137 0.188 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 -565918 sc-eQTL 2.16e-01 -0.145 0.117 0.191 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -340082 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0702 0.109 0.191 intMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 339107 sc-eQTL 8.47e-02 -0.192 0.111 0.191 intMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 243361 sc-eQTL 6.86e-01 0.0431 0.107 0.191 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -566228 sc-eQTL 5.00e-01 0.0794 0.117 0.191 intMono L2
ENSG00000162607 USP1 591196 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0782 0.119 0.191 intMono L2
ENSG00000240563 L1TD1 832644 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0745 0.0877 0.191 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -565918 sc-eQTL 2.51e-01 -0.12 0.104 0.197 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -340082 sc-eQTL 1.88e-01 0.151 0.114 0.197 ncMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 339107 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0601 0.113 0.197 ncMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 243361 sc-eQTL 4.23e-01 0.0847 0.106 0.197 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -566228 sc-eQTL 5.45e-01 -0.067 0.11 0.197 ncMono L2
ENSG00000162607 USP1 591196 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0346 0.113 0.197 ncMono L2
ENSG00000240563 L1TD1 832644 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0522 0.08 0.197 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -565918 sc-eQTL 2.28e-01 -0.145 0.12 0.206 pDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -340082 sc-eQTL 2.66e-01 0.13 0.117 0.206 pDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 339107 sc-eQTL 3.49e-01 -0.112 0.119 0.206 pDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 243361 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0503 0.107 0.206 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -566228 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0687 0.12 0.206 pDC L2
ENSG00000162607 USP1 591196 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0408 0.123 0.206 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -495879 sc-eQTL 1.00e+00 1.91e-05 0.107 0.206 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -565918 sc-eQTL 3.95e-02 0.225 0.109 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -340082 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0888 0.121 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 339107 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0193 0.105 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 243361 sc-eQTL 8.98e-01 0.0109 0.0853 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -566228 sc-eQTL 3.31e-01 -0.109 0.112 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 591196 sc-eQTL 8.20e-02 -0.189 0.108 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -495879 sc-eQTL 2.49e-01 0.135 0.116 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -565918 sc-eQTL 9.47e-01 0.00763 0.114 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -340082 sc-eQTL 8.51e-01 -0.022 0.117 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 339107 sc-eQTL 7.60e-01 0.0335 0.109 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 243361 sc-eQTL 8.49e-01 0.016 0.0835 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -566228 sc-eQTL 4.53e-01 0.0887 0.118 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 591196 sc-eQTL 3.47e-01 0.0955 0.101 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -495879 sc-eQTL 1.79e-01 0.159 0.118 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -565918 sc-eQTL 2.07e-01 -0.136 0.107 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -340082 sc-eQTL 3.62e-01 0.0951 0.104 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 339107 sc-eQTL 2.80e-01 0.113 0.105 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 243361 sc-eQTL 6.21e-01 -0.036 0.0725 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -566228 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0135 0.107 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 591196 sc-eQTL 1.60e-01 0.129 0.0913 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000240563 L1TD1 832644 sc-eQTL 1.07e-01 -0.16 0.0988 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -565918 sc-eQTL 2.02e-01 -0.131 0.102 0.192 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -340082 sc-eQTL 2.54e-01 0.133 0.116 0.192 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 339107 sc-eQTL 8.37e-02 -0.199 0.114 0.192 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 243361 sc-eQTL 6.19e-01 0.0488 0.0982 0.192 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -566228 sc-eQTL 8.89e-01 0.0159 0.114 0.192 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 591196 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0479 0.107 0.192 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000240563 L1TD1 832644 sc-eQTL 3.64e-01 -0.0664 0.0729 0.192 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -565918 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0534 0.0886 0.19 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -340082 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0623 0.106 0.19 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 339107 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0246 0.0954 0.19 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 243361 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0349 0.0952 0.19 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -566228 sc-eQTL 1.56e-01 0.16 0.112 0.19 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 591196 sc-eQTL 2.11e-02 -0.235 0.101 0.19 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -495879 sc-eQTL 4.20e-01 -0.101 0.124 0.19 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000116652 DLEU2L -519589 eQTL 0.00227 -0.0971 0.0317 0.00482 0.00235 0.21

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina