logo

Genes within 1Mb (chr1:63027288:C:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -566123 sc-eQTL 4.77e-01 0.0696 0.0977 0.19 B L1
ENSG00000088035 ALG6 -340287 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0443 0.101 0.19 B L1
ENSG00000116641 DOCK7 338902 sc-eQTL 6.20e-01 0.0503 0.101 0.19 B L1
ENSG00000125703 ATG4C 243156 sc-eQTL 6.11e-01 0.0358 0.0704 0.19 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -566433 sc-eQTL 9.03e-01 0.0137 0.112 0.19 B L1
ENSG00000162607 USP1 590991 sc-eQTL 5.90e-01 0.0525 0.0972 0.19 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -496084 sc-eQTL 9.31e-02 0.192 0.114 0.19 B L1
ENSG00000079739 PGM1 -566123 sc-eQTL 9.22e-01 -0.00826 0.0848 0.19 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 -340287 sc-eQTL 1.41e-01 0.138 0.0931 0.19 CD4T L1
ENSG00000116641 DOCK7 338902 sc-eQTL 8.99e-01 -0.012 0.0948 0.19 CD4T L1
ENSG00000125703 ATG4C 243156 sc-eQTL 1.71e-01 -0.105 0.0762 0.19 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -566433 sc-eQTL 7.43e-01 0.0356 0.109 0.19 CD4T L1
ENSG00000162607 USP1 590991 sc-eQTL 7.17e-01 0.0269 0.0742 0.19 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -496084 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0347 0.0975 0.19 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 -566123 sc-eQTL 8.40e-01 0.0192 0.0953 0.19 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 -340287 sc-eQTL 3.24e-01 -0.104 0.105 0.19 CD8T L1
ENSG00000116641 DOCK7 338902 sc-eQTL 3.73e-01 0.0948 0.106 0.19 CD8T L1
ENSG00000125703 ATG4C 243156 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0345 0.101 0.19 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -566433 sc-eQTL 5.01e-01 0.0761 0.113 0.19 CD8T L1
ENSG00000162607 USP1 590991 sc-eQTL 5.24e-01 0.0562 0.088 0.19 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -496084 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0176 0.113 0.19 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 -566123 sc-eQTL 7.67e-01 0.0304 0.102 0.194 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 -340287 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0185 0.106 0.194 DC L1
ENSG00000116641 DOCK7 338902 sc-eQTL 8.99e-01 0.0137 0.108 0.194 DC L1
ENSG00000125703 ATG4C 243156 sc-eQTL 5.24e-01 -0.054 0.0848 0.194 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -566433 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0112 0.119 0.194 DC L1
ENSG00000162607 USP1 590991 sc-eQTL 7.87e-01 -0.028 0.104 0.194 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -496084 sc-eQTL 3.08e-01 -0.105 0.103 0.194 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 -566123 sc-eQTL 6.10e-02 -0.189 0.1 0.19 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 -340287 sc-eQTL 2.16e-01 0.13 0.105 0.19 Mono L1
ENSG00000116641 DOCK7 338902 sc-eQTL 4.03e-01 0.0852 0.102 0.19 Mono L1
ENSG00000125703 ATG4C 243156 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0363 0.0688 0.19 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -566433 sc-eQTL 9.52e-01 -0.0066 0.109 0.19 Mono L1
ENSG00000162607 USP1 590991 sc-eQTL 1.92e-01 0.117 0.089 0.19 Mono L1
ENSG00000240563 L1TD1 832439 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0625 0.0833 0.19 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 -566123 sc-eQTL 9.75e-01 0.00279 0.0877 0.191 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 -340287 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0737 0.103 0.191 NK L1
ENSG00000116641 DOCK7 338902 sc-eQTL 4.50e-01 -0.064 0.0846 0.191 NK L1
ENSG00000125703 ATG4C 243156 sc-eQTL 9.04e-01 -0.011 0.091 0.191 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -566433 sc-eQTL 1.90e-01 0.148 0.113 0.191 NK L1
ENSG00000162607 USP1 590991 sc-eQTL 1.73e-01 -0.138 0.101 0.191 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -496084 sc-eQTL 2.82e-01 -0.132 0.122 0.191 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 -566123 sc-eQTL 7.43e-01 0.0328 0.0999 0.19 Other_T L1
ENSG00000088035 ALG6 -340287 sc-eQTL 8.21e-01 0.0227 0.1 0.19 Other_T L1
ENSG00000116641 DOCK7 338902 sc-eQTL 1.17e-01 0.161 0.102 0.19 Other_T L1
ENSG00000125703 ATG4C 243156 sc-eQTL 9.71e-01 0.00323 0.0887 0.19 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -566433 sc-eQTL 4.74e-02 0.156 0.078 0.19 Other_T L1
ENSG00000162607 USP1 590991 sc-eQTL 5.28e-01 0.0431 0.0681 0.19 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -496084 sc-eQTL 5.37e-01 -0.075 0.121 0.19 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -566123 sc-eQTL 2.78e-01 0.153 0.14 0.179 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 -340287 sc-eQTL 4.90e-02 -0.264 0.133 0.179 B_Activated L2
ENSG00000116641 DOCK7 338902 sc-eQTL 2.09e-01 -0.158 0.125 0.179 B_Activated L2
ENSG00000125703 ATG4C 243156 sc-eQTL 2.30e-01 -0.158 0.131 0.179 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -566433 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0425 0.129 0.179 B_Activated L2
ENSG00000162607 USP1 590991 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0147 0.14 0.179 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -496084 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00282 0.122 0.179 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 -566123 sc-eQTL 1.45e-02 0.288 0.117 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 -340287 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0559 0.12 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000116641 DOCK7 338902 sc-eQTL 2.17e-01 0.142 0.115 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000125703 ATG4C 243156 sc-eQTL 4.98e-01 0.066 0.0972 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -566433 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0922 0.116 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000162607 USP1 590991 sc-eQTL 2.55e-01 -0.132 0.115 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -496084 sc-eQTL 2.76e-01 0.125 0.115 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 -566123 sc-eQTL 2.67e-01 0.128 0.115 0.192 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 -340287 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0528 0.117 0.192 B_Memory L2
ENSG00000116641 DOCK7 338902 sc-eQTL 2.26e-01 -0.133 0.11 0.192 B_Memory L2
ENSG00000125703 ATG4C 243156 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0289 0.105 0.192 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -566433 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0859 0.12 0.192 B_Memory L2
ENSG00000162607 USP1 590991 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0493 0.121 0.192 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -496084 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0153 0.119 0.192 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 -566123 sc-eQTL 4.67e-01 0.0853 0.117 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 -340287 sc-eQTL 9.61e-01 0.0057 0.117 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000116641 DOCK7 338902 sc-eQTL 5.61e-01 0.0655 0.112 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000125703 ATG4C 243156 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0173 0.0867 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -566433 sc-eQTL 7.80e-01 0.0322 0.115 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000162607 USP1 590991 sc-eQTL 7.70e-01 0.0296 0.101 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -496084 sc-eQTL 1.59e-01 0.173 0.122 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 -566123 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0199 0.114 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 -340287 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0794 0.119 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000116641 DOCK7 338902 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0545 0.114 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000125703 ATG4C 243156 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0293 0.11 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -566433 sc-eQTL 5.81e-01 0.0659 0.119 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000162607 USP1 590991 sc-eQTL 2.50e-01 0.131 0.113 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -496084 sc-eQTL 9.93e-01 -0.00101 0.119 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 -566123 sc-eQTL 3.73e-01 -0.106 0.118 0.189 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -340287 sc-eQTL 7.05e-01 0.0474 0.125 0.189 CD4_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 338902 sc-eQTL 2.69e-01 -0.121 0.109 0.189 CD4_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 243156 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000529 0.113 0.189 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -566433 sc-eQTL 4.58e-01 -0.09 0.121 0.189 CD4_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 590991 sc-eQTL 8.98e-01 0.0148 0.115 0.189 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -496084 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0254 0.115 0.189 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -566123 sc-eQTL 5.82e-01 0.0527 0.0956 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -340287 sc-eQTL 2.52e-01 0.119 0.104 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 338902 sc-eQTL 7.07e-01 0.0384 0.102 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 243156 sc-eQTL 2.44e-01 -0.105 0.09 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -566433 sc-eQTL 9.94e-01 0.000855 0.11 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 590991 sc-eQTL 2.82e-01 0.0907 0.084 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -496084 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0839 0.109 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -566123 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0548 0.0984 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -340287 sc-eQTL 1.26e-01 0.175 0.114 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 338902 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0297 0.101 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 243156 sc-eQTL 7.77e-01 -0.028 0.0987 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -566433 sc-eQTL 5.17e-01 0.0754 0.116 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 590991 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0704 0.0953 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -496084 sc-eQTL 7.11e-01 0.0417 0.113 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -566123 sc-eQTL 2.01e-02 -0.273 0.116 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -340287 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0533 0.118 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 338902 sc-eQTL 9.19e-01 0.0117 0.116 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 243156 sc-eQTL 4.25e-01 -0.0895 0.112 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -566433 sc-eQTL 6.31e-01 0.0557 0.116 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 590991 sc-eQTL 4.00e-01 0.0923 0.11 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -496084 sc-eQTL 8.05e-01 0.0296 0.12 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -566123 sc-eQTL 2.45e-01 -0.124 0.106 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -340287 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0648 0.113 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 338902 sc-eQTL 4.92e-01 0.074 0.107 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 243156 sc-eQTL 8.23e-01 0.0256 0.114 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -566433 sc-eQTL 8.13e-01 0.0282 0.119 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 590991 sc-eQTL 2.23e-01 0.13 0.106 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -496084 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0949 0.122 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -566123 sc-eQTL 3.33e-01 0.104 0.107 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -340287 sc-eQTL 5.87e-01 0.0606 0.111 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 338902 sc-eQTL 5.81e-02 0.218 0.114 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 243156 sc-eQTL 2.74e-01 0.121 0.11 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -566433 sc-eQTL 4.64e-01 0.0821 0.112 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 590991 sc-eQTL 3.03e-01 0.0975 0.0944 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -496084 sc-eQTL 5.44e-01 0.064 0.106 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -566123 sc-eQTL 8.13e-01 0.0281 0.119 0.199 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -340287 sc-eQTL 2.57e-02 -0.267 0.119 0.199 CD8_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 338902 sc-eQTL 9.17e-01 0.0123 0.117 0.199 CD8_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 243156 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0685 0.12 0.199 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -566433 sc-eQTL 6.05e-02 0.218 0.116 0.199 CD8_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 590991 sc-eQTL 4.71e-01 0.081 0.112 0.199 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -496084 sc-eQTL 8.83e-01 0.0176 0.119 0.199 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -566123 sc-eQTL 7.64e-02 0.217 0.122 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -340287 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0415 0.123 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 338902 sc-eQTL 1.51e-01 0.171 0.119 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 243156 sc-eQTL 8.40e-02 -0.198 0.114 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -566433 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0388 0.124 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 590991 sc-eQTL 3.85e-01 0.103 0.118 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -496084 sc-eQTL 8.40e-02 0.208 0.12 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -566123 sc-eQTL 6.41e-01 0.0539 0.116 0.186 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 -340287 sc-eQTL 4.13e-01 0.0937 0.114 0.186 MAIT L2
ENSG00000116641 DOCK7 338902 sc-eQTL 1.06e-01 0.177 0.109 0.186 MAIT L2
ENSG00000125703 ATG4C 243156 sc-eQTL 4.87e-01 0.0804 0.115 0.186 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -566433 sc-eQTL 9.66e-01 0.00495 0.116 0.186 MAIT L2
ENSG00000162607 USP1 590991 sc-eQTL 5.91e-01 0.0619 0.115 0.186 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -496084 sc-eQTL 9.47e-01 0.00792 0.119 0.186 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 -566123 sc-eQTL 3.74e-01 0.102 0.115 0.191 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 -340287 sc-eQTL 9.28e-01 0.0106 0.118 0.191 NK_CD56bright L2
ENSG00000116641 DOCK7 338902 sc-eQTL 2.13e-01 -0.127 0.102 0.191 NK_CD56bright L2
ENSG00000125703 ATG4C 243156 sc-eQTL 6.76e-01 0.0477 0.114 0.191 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -566433 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0622 0.119 0.191 NK_CD56bright L2
ENSG00000162607 USP1 590991 sc-eQTL 1.95e-01 0.158 0.122 0.191 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -496084 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0399 0.117 0.191 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 -566123 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0176 0.0907 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 -340287 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00817 0.115 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000116641 DOCK7 338902 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0523 0.1 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000125703 ATG4C 243156 sc-eQTL 6.88e-01 0.0408 0.102 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -566433 sc-eQTL 6.88e-01 0.0465 0.116 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000162607 USP1 590991 sc-eQTL 1.11e-01 -0.179 0.112 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -496084 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0865 0.125 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 -566123 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0878 0.124 0.187 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 -340287 sc-eQTL 1.13e-02 -0.325 0.127 0.187 NK_HLA L2
ENSG00000116641 DOCK7 338902 sc-eQTL 3.15e-01 -0.0991 0.0984 0.187 NK_HLA L2
ENSG00000125703 ATG4C 243156 sc-eQTL 7.49e-01 0.0367 0.115 0.187 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -566433 sc-eQTL 1.44e-01 0.176 0.12 0.187 NK_HLA L2
ENSG00000162607 USP1 590991 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0455 0.126 0.187 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -496084 sc-eQTL 9.36e-01 0.00926 0.115 0.187 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 -566123 sc-eQTL 9.24e-01 0.00957 0.1 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 -340287 sc-eQTL 1.00e+00 -2.94e-05 0.113 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000116641 DOCK7 338902 sc-eQTL 5.34e-01 0.0654 0.105 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000125703 ATG4C 243156 sc-eQTL 2.46e-01 -0.125 0.107 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -566433 sc-eQTL 1.96e-01 0.144 0.111 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000162607 USP1 590991 sc-eQTL 8.60e-02 -0.2 0.116 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -496084 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00842 0.119 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 -566123 sc-eQTL 1.57e-01 -0.209 0.146 0.181 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 -340287 sc-eQTL 8.54e-01 0.0287 0.155 0.181 PB L2
ENSG00000116641 DOCK7 338902 sc-eQTL 3.23e-01 0.164 0.165 0.181 PB L2
ENSG00000125703 ATG4C 243156 sc-eQTL 2.18e-01 0.178 0.144 0.181 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -566433 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0184 0.144 0.181 PB L2
ENSG00000162607 USP1 590991 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0316 0.144 0.181 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -496084 sc-eQTL 7.90e-02 -0.277 0.156 0.181 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 -566123 sc-eQTL 4.17e-01 0.0865 0.106 0.193 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 -340287 sc-eQTL 2.05e-01 0.137 0.108 0.193 Pro_T L2
ENSG00000116641 DOCK7 338902 sc-eQTL 6.34e-01 0.0519 0.109 0.193 Pro_T L2
ENSG00000125703 ATG4C 243156 sc-eQTL 2.96e-01 -0.0996 0.095 0.193 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -566433 sc-eQTL 7.77e-02 0.168 0.0948 0.193 Pro_T L2
ENSG00000162607 USP1 590991 sc-eQTL 2.80e-01 0.0709 0.0655 0.193 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -496084 sc-eQTL 9.34e-01 0.00916 0.111 0.193 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 -566123 sc-eQTL 7.67e-01 0.0338 0.114 0.19 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 -340287 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0649 0.121 0.19 Treg L2
ENSG00000116641 DOCK7 338902 sc-eQTL 1.43e-01 -0.163 0.111 0.19 Treg L2
ENSG00000125703 ATG4C 243156 sc-eQTL 2.49e-01 0.131 0.114 0.19 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -566433 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0297 0.119 0.19 Treg L2
ENSG00000162607 USP1 590991 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0398 0.115 0.19 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -496084 sc-eQTL 8.19e-02 -0.198 0.113 0.19 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 -566123 sc-eQTL 2.35e-01 0.129 0.109 0.193 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -340287 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0937 0.11 0.193 cDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 338902 sc-eQTL 5.09e-01 0.0716 0.108 0.193 cDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 243156 sc-eQTL 2.98e-01 -0.098 0.0939 0.193 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -566433 sc-eQTL 8.60e-01 0.0211 0.119 0.193 cDC L2
ENSG00000162607 USP1 590991 sc-eQTL 8.31e-01 0.0227 0.106 0.193 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -496084 sc-eQTL 2.08e-02 -0.22 0.0945 0.193 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 -566123 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00643 0.106 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 -340287 sc-eQTL 1.49e-01 0.153 0.106 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000116641 DOCK7 338902 sc-eQTL 3.70e-01 0.1 0.112 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000125703 ATG4C 243156 sc-eQTL 2.71e-01 -0.0868 0.0786 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -566433 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0626 0.112 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000162607 USP1 590991 sc-eQTL 5.71e-02 0.187 0.0976 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000240563 L1TD1 832439 sc-eQTL 4.68e-02 -0.196 0.098 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 -566123 sc-eQTL 3.65e-02 -0.241 0.115 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 -340287 sc-eQTL 9.29e-01 0.0105 0.117 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000116641 DOCK7 338902 sc-eQTL 3.72e-01 0.0972 0.109 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000125703 ATG4C 243156 sc-eQTL 8.87e-01 0.0135 0.0942 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -566433 sc-eQTL 2.95e-01 0.111 0.106 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000162607 USP1 590991 sc-eQTL 4.06e-01 0.0909 0.109 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000240563 L1TD1 832439 sc-eQTL 1.68e-01 -0.125 0.0906 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 -566123 sc-eQTL 5.71e-01 0.0742 0.131 0.188 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 -340287 sc-eQTL 1.82e-01 -0.186 0.139 0.188 gdT L2
ENSG00000116641 DOCK7 338902 sc-eQTL 3.96e-01 0.116 0.137 0.188 gdT L2
ENSG00000125703 ATG4C 243156 sc-eQTL 4.33e-01 -0.103 0.13 0.188 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -566433 sc-eQTL 5.02e-01 0.0932 0.139 0.188 gdT L2
ENSG00000162607 USP1 590991 sc-eQTL 5.97e-01 0.0696 0.131 0.188 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -496084 sc-eQTL 9.19e-01 -0.014 0.137 0.188 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 -566123 sc-eQTL 2.16e-01 -0.145 0.117 0.191 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -340287 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0702 0.109 0.191 intMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 338902 sc-eQTL 8.47e-02 -0.192 0.111 0.191 intMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 243156 sc-eQTL 6.86e-01 0.0431 0.107 0.191 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -566433 sc-eQTL 5.00e-01 0.0794 0.117 0.191 intMono L2
ENSG00000162607 USP1 590991 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0782 0.119 0.191 intMono L2
ENSG00000240563 L1TD1 832439 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0745 0.0877 0.191 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -566123 sc-eQTL 2.51e-01 -0.12 0.104 0.197 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -340287 sc-eQTL 1.88e-01 0.151 0.114 0.197 ncMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 338902 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0601 0.113 0.197 ncMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 243156 sc-eQTL 4.23e-01 0.0847 0.106 0.197 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -566433 sc-eQTL 5.45e-01 -0.067 0.11 0.197 ncMono L2
ENSG00000162607 USP1 590991 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0346 0.113 0.197 ncMono L2
ENSG00000240563 L1TD1 832439 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0522 0.08 0.197 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -566123 sc-eQTL 2.28e-01 -0.145 0.12 0.206 pDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -340287 sc-eQTL 2.66e-01 0.13 0.117 0.206 pDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 338902 sc-eQTL 3.49e-01 -0.112 0.119 0.206 pDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 243156 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0503 0.107 0.206 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -566433 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0687 0.12 0.206 pDC L2
ENSG00000162607 USP1 590991 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0408 0.123 0.206 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -496084 sc-eQTL 1.00e+00 1.91e-05 0.107 0.206 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -566123 sc-eQTL 3.95e-02 0.225 0.109 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -340287 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0888 0.121 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 338902 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0193 0.105 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 243156 sc-eQTL 8.98e-01 0.0109 0.0853 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -566433 sc-eQTL 3.31e-01 -0.109 0.112 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 590991 sc-eQTL 8.20e-02 -0.189 0.108 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -496084 sc-eQTL 2.49e-01 0.135 0.116 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -566123 sc-eQTL 9.47e-01 0.00763 0.114 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -340287 sc-eQTL 8.51e-01 -0.022 0.117 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 338902 sc-eQTL 7.60e-01 0.0335 0.109 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 243156 sc-eQTL 8.49e-01 0.016 0.0835 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -566433 sc-eQTL 4.53e-01 0.0887 0.118 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 590991 sc-eQTL 3.47e-01 0.0955 0.101 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -496084 sc-eQTL 1.79e-01 0.159 0.118 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -566123 sc-eQTL 2.07e-01 -0.136 0.107 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -340287 sc-eQTL 3.62e-01 0.0951 0.104 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 338902 sc-eQTL 2.80e-01 0.113 0.105 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 243156 sc-eQTL 6.21e-01 -0.036 0.0725 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -566433 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0135 0.107 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 590991 sc-eQTL 1.60e-01 0.129 0.0913 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000240563 L1TD1 832439 sc-eQTL 1.07e-01 -0.16 0.0988 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -566123 sc-eQTL 2.02e-01 -0.131 0.102 0.192 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -340287 sc-eQTL 2.54e-01 0.133 0.116 0.192 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 338902 sc-eQTL 8.37e-02 -0.199 0.114 0.192 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 243156 sc-eQTL 6.19e-01 0.0488 0.0982 0.192 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -566433 sc-eQTL 8.89e-01 0.0159 0.114 0.192 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 590991 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0479 0.107 0.192 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000240563 L1TD1 832439 sc-eQTL 3.64e-01 -0.0664 0.0729 0.192 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -566123 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0534 0.0886 0.19 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -340287 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0623 0.106 0.19 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 338902 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0246 0.0954 0.19 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 243156 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0349 0.0952 0.19 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -566433 sc-eQTL 1.56e-01 0.16 0.112 0.19 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 590991 sc-eQTL 2.11e-02 -0.235 0.101 0.19 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -496084 sc-eQTL 4.20e-01 -0.101 0.124 0.19 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000116652 DLEU2L -519794 eQTL 0.00225 -0.0968 0.0316 0.00481 0.00235 0.21

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina