logo

Genes within 1Mb (chr1:63025607:T:TAAA):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -567804 sc-eQTL 4.35e-01 0.114 0.146 0.073 B L1
ENSG00000088035 ALG6 -341968 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0605 0.152 0.073 B L1
ENSG00000116641 DOCK7 337221 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0418 0.152 0.073 B L1
ENSG00000125703 ATG4C 241475 sc-eQTL 1.87e-01 0.139 0.105 0.073 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -568114 sc-eQTL 6.86e-01 -0.068 0.168 0.073 B L1
ENSG00000162607 USP1 589310 sc-eQTL 8.00e-01 -0.037 0.146 0.073 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -497765 sc-eQTL 1.51e-01 0.247 0.171 0.073 B L1
ENSG00000079739 PGM1 -567804 sc-eQTL 7.93e-01 0.0331 0.126 0.073 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 -341968 sc-eQTL 5.51e-01 0.0827 0.138 0.073 CD4T L1
ENSG00000116641 DOCK7 337221 sc-eQTL 4.15e-01 -0.114 0.14 0.073 CD4T L1
ENSG00000125703 ATG4C 241475 sc-eQTL 3.30e-01 -0.11 0.113 0.073 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -568114 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0673 0.161 0.073 CD4T L1
ENSG00000162607 USP1 589310 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0419 0.11 0.073 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -497765 sc-eQTL 6.49e-01 0.0658 0.144 0.073 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 -567804 sc-eQTL 5.95e-01 0.0737 0.138 0.073 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 -341968 sc-eQTL 8.08e-01 0.0371 0.153 0.073 CD8T L1
ENSG00000116641 DOCK7 337221 sc-eQTL 4.95e-01 0.106 0.155 0.073 CD8T L1
ENSG00000125703 ATG4C 241475 sc-eQTL 9.03e-01 0.018 0.147 0.073 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -568114 sc-eQTL 9.33e-01 -0.0139 0.164 0.073 CD8T L1
ENSG00000162607 USP1 589310 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0297 0.128 0.073 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -497765 sc-eQTL 4.93e-01 0.112 0.164 0.073 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 -567804 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0783 0.153 0.072 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 -341968 sc-eQTL 6.17e-01 0.0792 0.158 0.072 DC L1
ENSG00000116641 DOCK7 337221 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00762 0.162 0.072 DC L1
ENSG00000125703 ATG4C 241475 sc-eQTL 1.91e-01 -0.166 0.126 0.072 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -568114 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0219 0.177 0.072 DC L1
ENSG00000162607 USP1 589310 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0879 0.155 0.072 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -497765 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0371 0.154 0.072 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 -567804 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0632 0.15 0.073 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 -341968 sc-eQTL 7.61e-01 0.0476 0.156 0.073 Mono L1
ENSG00000116641 DOCK7 337221 sc-eQTL 2.71e-01 0.167 0.151 0.073 Mono L1
ENSG00000125703 ATG4C 241475 sc-eQTL 5.45e-02 -0.196 0.101 0.073 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -568114 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0937 0.161 0.073 Mono L1
ENSG00000162607 USP1 589310 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0476 0.133 0.073 Mono L1
ENSG00000240563 L1TD1 830758 sc-eQTL 1.03e-01 -0.202 0.123 0.073 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 -567804 sc-eQTL 3.59e-01 -0.117 0.128 0.073 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 -341968 sc-eQTL 2.33e-01 -0.179 0.15 0.073 NK L1
ENSG00000116641 DOCK7 337221 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0163 0.124 0.073 NK L1
ENSG00000125703 ATG4C 241475 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0502 0.133 0.073 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -568114 sc-eQTL 5.82e-01 0.091 0.165 0.073 NK L1
ENSG00000162607 USP1 589310 sc-eQTL 4.89e-01 0.102 0.147 0.073 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -497765 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0818 0.179 0.073 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 -567804 sc-eQTL 5.71e-01 0.0845 0.149 0.073 Other_T L1
ENSG00000088035 ALG6 -341968 sc-eQTL 9.14e-01 0.0162 0.15 0.073 Other_T L1
ENSG00000116641 DOCK7 337221 sc-eQTL 6.38e-01 0.0719 0.153 0.073 Other_T L1
ENSG00000125703 ATG4C 241475 sc-eQTL 7.20e-01 0.0473 0.132 0.073 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -568114 sc-eQTL 3.54e-02 0.246 0.116 0.073 Other_T L1
ENSG00000162607 USP1 589310 sc-eQTL 7.60e-01 0.031 0.102 0.073 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -497765 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0359 0.181 0.073 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -567804 sc-eQTL 4.77e-01 0.149 0.21 0.066 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 -341968 sc-eQTL 7.76e-02 -0.354 0.199 0.066 B_Activated L2
ENSG00000116641 DOCK7 337221 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0633 0.187 0.066 B_Activated L2
ENSG00000125703 ATG4C 241475 sc-eQTL 4.38e-01 -0.153 0.197 0.066 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -568114 sc-eQTL 2.46e-01 -0.223 0.192 0.066 B_Activated L2
ENSG00000162607 USP1 589310 sc-eQTL 8.62e-01 0.0363 0.209 0.066 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -497765 sc-eQTL 2.85e-01 0.195 0.181 0.066 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 -567804 sc-eQTL 3.63e-01 0.16 0.176 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 -341968 sc-eQTL 2.15e-01 -0.222 0.178 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000116641 DOCK7 337221 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0638 0.171 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000125703 ATG4C 241475 sc-eQTL 1.44e-01 0.211 0.144 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -568114 sc-eQTL 9.42e-01 0.0125 0.172 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000162607 USP1 589310 sc-eQTL 5.03e-01 -0.115 0.172 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -497765 sc-eQTL 9.84e-01 0.00339 0.171 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 -567804 sc-eQTL 2.51e-01 0.204 0.177 0.073 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 -341968 sc-eQTL 1.33e-01 -0.271 0.18 0.073 B_Memory L2
ENSG00000116641 DOCK7 337221 sc-eQTL 4.12e-01 -0.139 0.169 0.073 B_Memory L2
ENSG00000125703 ATG4C 241475 sc-eQTL 7.32e-01 0.0552 0.161 0.073 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -568114 sc-eQTL 4.49e-01 0.139 0.184 0.073 B_Memory L2
ENSG00000162607 USP1 589310 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0846 0.186 0.073 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -497765 sc-eQTL 1.97e-01 -0.235 0.182 0.073 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 -567804 sc-eQTL 2.38e-01 0.203 0.171 0.073 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 -341968 sc-eQTL 7.69e-01 0.0508 0.173 0.073 B_Naive1 L2
ENSG00000116641 DOCK7 337221 sc-eQTL 3.35e-01 -0.159 0.165 0.073 B_Naive1 L2
ENSG00000125703 ATG4C 241475 sc-eQTL 9.22e-02 0.214 0.126 0.073 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -568114 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0491 0.169 0.073 B_Naive1 L2
ENSG00000162607 USP1 589310 sc-eQTL 9.78e-01 0.00403 0.149 0.073 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -497765 sc-eQTL 6.02e-02 0.338 0.179 0.073 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 -567804 sc-eQTL 2.80e-01 -0.182 0.168 0.073 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 -341968 sc-eQTL 2.94e-01 0.185 0.175 0.073 B_Naive2 L2
ENSG00000116641 DOCK7 337221 sc-eQTL 2.51e-01 0.194 0.169 0.073 B_Naive2 L2
ENSG00000125703 ATG4C 241475 sc-eQTL 3.33e-01 -0.157 0.162 0.073 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -568114 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0194 0.177 0.073 B_Naive2 L2
ENSG00000162607 USP1 589310 sc-eQTL 4.75e-01 0.12 0.168 0.073 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -497765 sc-eQTL 7.25e-01 0.062 0.176 0.073 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 -567804 sc-eQTL 8.98e-01 0.0235 0.183 0.068 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -341968 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00193 0.194 0.068 CD4_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 337221 sc-eQTL 6.04e-01 -0.088 0.169 0.068 CD4_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 241475 sc-eQTL 5.96e-01 0.0929 0.175 0.068 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -568114 sc-eQTL 2.96e-02 -0.406 0.185 0.068 CD4_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 589310 sc-eQTL 6.84e-02 -0.324 0.177 0.068 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -497765 sc-eQTL 2.43e-01 -0.208 0.178 0.068 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -567804 sc-eQTL 2.88e-01 0.15 0.141 0.073 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -341968 sc-eQTL 6.26e-01 0.0749 0.153 0.073 CD4_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 337221 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0843 0.151 0.073 CD4_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 241475 sc-eQTL 3.45e-01 -0.126 0.133 0.073 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -568114 sc-eQTL 9.32e-01 -0.014 0.163 0.073 CD4_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 589310 sc-eQTL 4.91e-01 0.0859 0.124 0.073 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -497765 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00916 0.162 0.073 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -567804 sc-eQTL 8.12e-01 -0.035 0.147 0.073 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -341968 sc-eQTL 3.78e-01 0.15 0.17 0.073 CD4_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 337221 sc-eQTL 8.50e-01 0.0286 0.151 0.073 CD4_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 241475 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0363 0.147 0.073 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -568114 sc-eQTL 4.96e-01 -0.118 0.173 0.073 CD4_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 589310 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0344 0.142 0.073 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -497765 sc-eQTL 1.51e-01 0.241 0.167 0.073 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -567804 sc-eQTL 3.42e-01 -0.169 0.177 0.073 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -341968 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0367 0.179 0.073 CD4_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 337221 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0879 0.174 0.073 CD4_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 241475 sc-eQTL 4.77e-01 -0.12 0.169 0.073 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -568114 sc-eQTL 3.58e-01 -0.16 0.174 0.073 CD4_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 589310 sc-eQTL 3.31e-01 -0.161 0.165 0.073 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -497765 sc-eQTL 5.68e-01 0.103 0.181 0.073 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -567804 sc-eQTL 9.14e-01 -0.017 0.158 0.073 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -341968 sc-eQTL 7.41e-01 0.0555 0.167 0.073 CD8_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 337221 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0804 0.159 0.073 CD8_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 241475 sc-eQTL 4.47e-01 0.129 0.169 0.073 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -568114 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0883 0.176 0.073 CD8_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 589310 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0807 0.158 0.073 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -497765 sc-eQTL 1.84e-01 0.239 0.179 0.073 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -567804 sc-eQTL 4.45e-01 0.123 0.161 0.073 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -341968 sc-eQTL 2.36e-01 0.198 0.166 0.073 CD8_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 337221 sc-eQTL 3.50e-01 0.161 0.172 0.073 CD8_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 241475 sc-eQTL 8.44e-02 0.285 0.165 0.073 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -568114 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0861 0.168 0.073 CD8_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 589310 sc-eQTL 5.74e-01 0.0798 0.142 0.073 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -497765 sc-eQTL 7.52e-01 0.0501 0.158 0.073 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -567804 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0512 0.174 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -341968 sc-eQTL 9.50e-02 -0.294 0.175 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 337221 sc-eQTL 8.73e-01 0.0277 0.172 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 241475 sc-eQTL 6.34e-02 -0.326 0.175 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -568114 sc-eQTL 2.51e-01 0.197 0.171 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 589310 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0922 0.165 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -497765 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00777 0.175 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -567804 sc-eQTL 8.81e-02 0.324 0.189 0.068 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -341968 sc-eQTL 2.39e-01 0.225 0.191 0.068 CD8_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 337221 sc-eQTL 4.46e-01 0.141 0.185 0.068 CD8_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 241475 sc-eQTL 1.25e-01 -0.273 0.177 0.068 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -568114 sc-eQTL 9.54e-01 0.0112 0.193 0.068 CD8_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 589310 sc-eQTL 9.41e-01 0.0137 0.184 0.068 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -497765 sc-eQTL 2.10e-01 0.235 0.186 0.068 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -567804 sc-eQTL 5.67e-02 -0.348 0.182 0.067 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 -341968 sc-eQTL 7.75e-01 0.0519 0.182 0.067 MAIT L2
ENSG00000116641 DOCK7 337221 sc-eQTL 4.33e-01 0.136 0.174 0.067 MAIT L2
ENSG00000125703 ATG4C 241475 sc-eQTL 2.64e-01 0.205 0.183 0.067 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -568114 sc-eQTL 9.47e-01 0.0123 0.184 0.067 MAIT L2
ENSG00000162607 USP1 589310 sc-eQTL 2.17e-01 0.225 0.182 0.067 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -497765 sc-eQTL 7.60e-01 0.0579 0.189 0.067 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 -567804 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0255 0.173 0.073 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 -341968 sc-eQTL 3.94e-01 0.151 0.177 0.073 NK_CD56bright L2
ENSG00000116641 DOCK7 337221 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0698 0.154 0.073 NK_CD56bright L2
ENSG00000125703 ATG4C 241475 sc-eQTL 6.75e-02 0.314 0.171 0.073 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -568114 sc-eQTL 3.19e-01 -0.179 0.179 0.073 NK_CD56bright L2
ENSG00000162607 USP1 589310 sc-eQTL 7.86e-01 0.0502 0.185 0.073 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -497765 sc-eQTL 2.53e-01 -0.202 0.176 0.073 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 -567804 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0225 0.132 0.073 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 -341968 sc-eQTL 4.55e-01 -0.126 0.168 0.073 NK_CD56dim L2
ENSG00000116641 DOCK7 337221 sc-eQTL 2.31e-01 -0.175 0.146 0.073 NK_CD56dim L2
ENSG00000125703 ATG4C 241475 sc-eQTL 3.96e-01 -0.126 0.148 0.073 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -568114 sc-eQTL 3.82e-01 0.148 0.169 0.073 NK_CD56dim L2
ENSG00000162607 USP1 589310 sc-eQTL 4.54e-01 0.123 0.164 0.073 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -497765 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0956 0.182 0.073 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 -567804 sc-eQTL 4.64e-02 -0.354 0.177 0.073 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 -341968 sc-eQTL 2.63e-01 -0.207 0.185 0.073 NK_HLA L2
ENSG00000116641 DOCK7 337221 sc-eQTL 8.36e-01 0.0293 0.142 0.073 NK_HLA L2
ENSG00000125703 ATG4C 241475 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0375 0.165 0.073 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -568114 sc-eQTL 2.81e-01 -0.187 0.172 0.073 NK_HLA L2
ENSG00000162607 USP1 589310 sc-eQTL 3.21e-01 -0.179 0.181 0.073 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -497765 sc-eQTL 9.79e-01 0.00435 0.165 0.073 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 -567804 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00589 0.145 0.073 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 -341968 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0716 0.163 0.073 NK_cytokine L2
ENSG00000116641 DOCK7 337221 sc-eQTL 9.94e-01 0.00123 0.151 0.073 NK_cytokine L2
ENSG00000125703 ATG4C 241475 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0748 0.155 0.073 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -568114 sc-eQTL 6.83e-01 0.0655 0.16 0.073 NK_cytokine L2
ENSG00000162607 USP1 589310 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0171 0.169 0.073 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -497765 sc-eQTL 6.04e-01 0.0887 0.171 0.073 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 -567804 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0561 0.223 0.059 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 -341968 sc-eQTL 1.51e-01 0.335 0.232 0.059 PB L2
ENSG00000116641 DOCK7 337221 sc-eQTL 2.91e-01 0.264 0.249 0.059 PB L2
ENSG00000125703 ATG4C 241475 sc-eQTL 2.13e-01 0.271 0.217 0.059 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -568114 sc-eQTL 5.34e-01 0.136 0.217 0.059 PB L2
ENSG00000162607 USP1 589310 sc-eQTL 8.78e-01 0.0333 0.217 0.059 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -497765 sc-eQTL 4.83e-01 -0.168 0.238 0.059 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 -567804 sc-eQTL 8.08e-02 0.273 0.155 0.074 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 -341968 sc-eQTL 1.82e-01 0.212 0.159 0.074 Pro_T L2
ENSG00000116641 DOCK7 337221 sc-eQTL 9.58e-02 -0.266 0.159 0.074 Pro_T L2
ENSG00000125703 ATG4C 241475 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0561 0.14 0.074 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -568114 sc-eQTL 2.64e-01 0.157 0.14 0.074 Pro_T L2
ENSG00000162607 USP1 589310 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0444 0.0965 0.074 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -497765 sc-eQTL 6.64e-01 0.0709 0.163 0.074 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 -567804 sc-eQTL 9.97e-01 0.000672 0.169 0.073 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 -341968 sc-eQTL 5.99e-01 -0.095 0.181 0.073 Treg L2
ENSG00000116641 DOCK7 337221 sc-eQTL 5.31e-02 -0.32 0.164 0.073 Treg L2
ENSG00000125703 ATG4C 241475 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00239 0.169 0.073 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -568114 sc-eQTL 4.30e-01 -0.14 0.177 0.073 Treg L2
ENSG00000162607 USP1 589310 sc-eQTL 9.24e-01 -0.0164 0.172 0.073 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -497765 sc-eQTL 1.59e-01 -0.239 0.169 0.073 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 -567804 sc-eQTL 1.16e-01 0.257 0.163 0.076 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -341968 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0407 0.166 0.076 cDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 337221 sc-eQTL 6.89e-01 0.0655 0.163 0.076 cDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 241475 sc-eQTL 4.14e-01 -0.116 0.142 0.076 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -568114 sc-eQTL 5.25e-01 0.114 0.18 0.076 cDC L2
ENSG00000162607 USP1 589310 sc-eQTL 4.27e-01 -0.127 0.16 0.076 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -497765 sc-eQTL 2.89e-01 -0.153 0.144 0.076 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 -567804 sc-eQTL 2.41e-01 0.187 0.159 0.073 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 -341968 sc-eQTL 9.83e-01 0.00345 0.16 0.073 cMono_IL1B L2
ENSG00000116641 DOCK7 337221 sc-eQTL 3.12e-01 0.17 0.168 0.073 cMono_IL1B L2
ENSG00000125703 ATG4C 241475 sc-eQTL 5.91e-02 -0.223 0.118 0.073 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -568114 sc-eQTL 5.34e-01 -0.104 0.168 0.073 cMono_IL1B L2
ENSG00000162607 USP1 589310 sc-eQTL 9.82e-01 0.00335 0.148 0.073 cMono_IL1B L2
ENSG00000240563 L1TD1 830758 sc-eQTL 3.25e-03 -0.434 0.146 0.073 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 -567804 sc-eQTL 2.80e-01 -0.189 0.175 0.073 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 -341968 sc-eQTL 4.66e-01 0.13 0.178 0.073 cMono_S100A L2
ENSG00000116641 DOCK7 337221 sc-eQTL 1.84e-01 0.219 0.164 0.073 cMono_S100A L2
ENSG00000125703 ATG4C 241475 sc-eQTL 8.77e-02 -0.243 0.142 0.073 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -568114 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0748 0.161 0.073 cMono_S100A L2
ENSG00000162607 USP1 589310 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0322 0.166 0.073 cMono_S100A L2
ENSG00000240563 L1TD1 830758 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0954 0.138 0.073 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 -567804 sc-eQTL 3.34e-01 0.193 0.199 0.073 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 -341968 sc-eQTL 3.41e-01 -0.203 0.213 0.073 gdT L2
ENSG00000116641 DOCK7 337221 sc-eQTL 3.66e-01 0.189 0.209 0.073 gdT L2
ENSG00000125703 ATG4C 241475 sc-eQTL 1.86e-01 -0.264 0.199 0.073 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -568114 sc-eQTL 7.72e-01 0.0616 0.212 0.073 gdT L2
ENSG00000162607 USP1 589310 sc-eQTL 3.76e-01 -0.178 0.2 0.073 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -497765 sc-eQTL 8.44e-01 0.0411 0.209 0.073 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 -567804 sc-eQTL 1.43e-01 -0.257 0.175 0.071 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -341968 sc-eQTL 4.61e-01 -0.121 0.163 0.071 intMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 337221 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0835 0.167 0.071 intMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 241475 sc-eQTL 1.53e-01 0.228 0.159 0.071 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -568114 sc-eQTL 9.71e-01 0.00642 0.176 0.071 intMono L2
ENSG00000162607 USP1 589310 sc-eQTL 8.38e-01 0.0367 0.179 0.071 intMono L2
ENSG00000240563 L1TD1 830758 sc-eQTL 6.03e-02 -0.246 0.13 0.071 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -567804 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0912 0.156 0.075 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -341968 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0611 0.171 0.075 ncMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 337221 sc-eQTL 9.99e-01 0.000168 0.169 0.075 ncMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 241475 sc-eQTL 9.43e-01 0.0112 0.158 0.075 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -568114 sc-eQTL 4.81e-01 -0.116 0.165 0.075 ncMono L2
ENSG00000162607 USP1 589310 sc-eQTL 9.79e-01 0.00447 0.168 0.075 ncMono L2
ENSG00000240563 L1TD1 830758 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0759 0.119 0.075 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -567804 sc-eQTL 1.79e-02 -0.417 0.174 0.085 pDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -341968 sc-eQTL 3.01e-01 0.179 0.172 0.085 pDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 337221 sc-eQTL 7.31e-02 -0.315 0.175 0.085 pDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 241475 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0728 0.158 0.085 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -568114 sc-eQTL 2.12e-01 -0.222 0.177 0.085 pDC L2
ENSG00000162607 USP1 589310 sc-eQTL 5.22e-01 0.116 0.181 0.085 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -497765 sc-eQTL 9.05e-01 0.0189 0.157 0.085 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -567804 sc-eQTL 4.59e-01 0.121 0.163 0.073 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -341968 sc-eQTL 7.54e-03 -0.479 0.178 0.073 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 337221 sc-eQTL 5.36e-01 -0.097 0.157 0.073 B_Memory LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 241475 sc-eQTL 1.98e-01 0.163 0.126 0.073 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -568114 sc-eQTL 7.61e-01 0.0508 0.166 0.073 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 589310 sc-eQTL 2.60e-01 -0.182 0.161 0.073 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -497765 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0605 0.173 0.073 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -567804 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0406 0.168 0.073 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -341968 sc-eQTL 3.47e-01 0.163 0.173 0.073 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 337221 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0531 0.161 0.073 B_Naive LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 241475 sc-eQTL 5.19e-01 0.0796 0.123 0.073 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -568114 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0265 0.174 0.073 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 589310 sc-eQTL 7.64e-01 0.045 0.15 0.073 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -497765 sc-eQTL 7.46e-02 0.312 0.174 0.073 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -567804 sc-eQTL 7.75e-01 0.0463 0.162 0.073 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -341968 sc-eQTL 7.20e-01 0.0564 0.157 0.073 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 337221 sc-eQTL 1.77e-01 0.213 0.157 0.073 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 241475 sc-eQTL 2.80e-02 -0.239 0.108 0.073 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -568114 sc-eQTL 3.17e-01 -0.162 0.161 0.073 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 589310 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0711 0.138 0.073 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000240563 L1TD1 830758 sc-eQTL 1.80e-02 -0.352 0.148 0.073 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -567804 sc-eQTL 2.06e-01 -0.192 0.151 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -341968 sc-eQTL 8.58e-01 0.0309 0.172 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 337221 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0984 0.17 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 241475 sc-eQTL 3.95e-01 0.124 0.145 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -568114 sc-eQTL 4.57e-01 -0.126 0.169 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 589310 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00805 0.159 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000240563 L1TD1 830758 sc-eQTL 7.90e-02 -0.19 0.107 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -567804 sc-eQTL 3.69e-01 -0.116 0.129 0.073 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -341968 sc-eQTL 1.98e-01 -0.2 0.155 0.073 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 337221 sc-eQTL 5.14e-01 -0.091 0.139 0.073 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 241475 sc-eQTL 2.50e-01 -0.16 0.139 0.073 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -568114 sc-eQTL 4.19e-01 0.133 0.164 0.073 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 589310 sc-eQTL 5.96e-01 0.0793 0.149 0.073 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -497765 sc-eQTL 7.01e-01 -0.07 0.182 0.073 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000116641 DOCK7 337239 eQTL 0.0331 0.0801 0.0375 0.0 0.0 0.0908

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina