logo

Genes within 1Mb (chr1:63025181:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -568230 sc-eQTL 6.80e-01 0.0504 0.122 0.111 B L1
ENSG00000088035 ALG6 -342394 sc-eQTL 9.34e-01 -0.0106 0.127 0.111 B L1
ENSG00000116641 DOCK7 336795 sc-eQTL 2.96e-01 0.132 0.126 0.111 B L1
ENSG00000125703 ATG4C 241049 sc-eQTL 2.51e-01 0.101 0.0878 0.111 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -568540 sc-eQTL 5.42e-01 0.0855 0.14 0.111 B L1
ENSG00000162607 USP1 588884 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0402 0.122 0.111 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -498191 sc-eQTL 2.22e-02 0.327 0.142 0.111 B L1
ENSG00000079739 PGM1 -568230 sc-eQTL 2.27e-01 0.129 0.107 0.111 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 -342394 sc-eQTL 4.19e-01 0.0956 0.118 0.111 CD4T L1
ENSG00000116641 DOCK7 336795 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0274 0.12 0.111 CD4T L1
ENSG00000125703 ATG4C 241049 sc-eQTL 6.26e-02 -0.179 0.0959 0.111 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -568540 sc-eQTL 3.00e-01 0.142 0.137 0.111 CD4T L1
ENSG00000162607 USP1 588884 sc-eQTL 8.21e-01 0.0213 0.0938 0.111 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -498191 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0196 0.123 0.111 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 -568230 sc-eQTL 2.52e-01 0.135 0.118 0.111 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 -342394 sc-eQTL 4.01e-01 -0.109 0.13 0.111 CD8T L1
ENSG00000116641 DOCK7 336795 sc-eQTL 1.53e-01 0.188 0.131 0.111 CD8T L1
ENSG00000125703 ATG4C 241049 sc-eQTL 5.39e-01 -0.077 0.125 0.111 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -568540 sc-eQTL 3.39e-01 0.134 0.14 0.111 CD8T L1
ENSG00000162607 USP1 588884 sc-eQTL 3.05e-01 0.112 0.109 0.111 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -498191 sc-eQTL 8.54e-01 0.0257 0.14 0.111 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 -568230 sc-eQTL 7.11e-01 0.0478 0.129 0.113 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 -342394 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0434 0.133 0.113 DC L1
ENSG00000116641 DOCK7 336795 sc-eQTL 7.79e-01 0.0383 0.136 0.113 DC L1
ENSG00000125703 ATG4C 241049 sc-eQTL 5.46e-01 0.0645 0.107 0.113 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -568540 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0769 0.149 0.113 DC L1
ENSG00000162607 USP1 588884 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0291 0.13 0.113 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -498191 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0277 0.13 0.113 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 -568230 sc-eQTL 1.04e-01 -0.206 0.126 0.111 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 -342394 sc-eQTL 4.89e-01 0.0919 0.133 0.111 Mono L1
ENSG00000116641 DOCK7 336795 sc-eQTL 2.66e-01 0.143 0.128 0.111 Mono L1
ENSG00000125703 ATG4C 241049 sc-eQTL 2.83e-01 -0.0932 0.0866 0.111 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -568540 sc-eQTL 7.55e-01 0.0428 0.137 0.111 Mono L1
ENSG00000162607 USP1 588884 sc-eQTL 3.73e-01 0.1 0.112 0.111 Mono L1
ENSG00000240563 L1TD1 830332 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0734 0.105 0.111 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 -568230 sc-eQTL 2.99e-01 -0.112 0.107 0.112 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 -342394 sc-eQTL 2.06e-01 -0.16 0.126 0.112 NK L1
ENSG00000116641 DOCK7 336795 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0337 0.104 0.112 NK L1
ENSG00000125703 ATG4C 241049 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0842 0.112 0.112 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -568540 sc-eQTL 1.93e-01 0.181 0.138 0.112 NK L1
ENSG00000162607 USP1 588884 sc-eQTL 9.73e-01 0.00426 0.124 0.112 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -498191 sc-eQTL 2.62e-01 -0.169 0.15 0.112 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 -568230 sc-eQTL 3.50e-01 0.116 0.124 0.111 Other_T L1
ENSG00000088035 ALG6 -342394 sc-eQTL 6.32e-01 0.0599 0.125 0.111 Other_T L1
ENSG00000116641 DOCK7 336795 sc-eQTL 2.62e-01 0.143 0.127 0.111 Other_T L1
ENSG00000125703 ATG4C 241049 sc-eQTL 7.11e-01 0.0409 0.11 0.111 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -568540 sc-eQTL 6.81e-02 0.178 0.0972 0.111 Other_T L1
ENSG00000162607 USP1 588884 sc-eQTL 3.12e-01 0.0858 0.0847 0.111 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -498191 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0288 0.151 0.111 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -568230 sc-eQTL 3.09e-01 0.175 0.172 0.105 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 -342394 sc-eQTL 9.60e-02 -0.274 0.164 0.105 B_Activated L2
ENSG00000116641 DOCK7 336795 sc-eQTL 4.26e-01 -0.122 0.153 0.105 B_Activated L2
ENSG00000125703 ATG4C 241049 sc-eQTL 4.49e-01 -0.122 0.161 0.105 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -568540 sc-eQTL 8.21e-01 0.0358 0.158 0.105 B_Activated L2
ENSG00000162607 USP1 588884 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0639 0.171 0.105 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -498191 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00883 0.149 0.105 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 -568230 sc-eQTL 1.96e-01 0.191 0.147 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 -342394 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0294 0.15 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000116641 DOCK7 336795 sc-eQTL 2.62e-01 0.161 0.143 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000125703 ATG4C 241049 sc-eQTL 2.56e-01 0.138 0.121 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -568540 sc-eQTL 9.66e-01 0.00611 0.145 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000162607 USP1 588884 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0636 0.144 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -498191 sc-eQTL 2.49e-01 0.165 0.143 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 -568230 sc-eQTL 9.54e-02 0.245 0.146 0.112 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 -342394 sc-eQTL 2.37e-01 -0.177 0.149 0.112 B_Memory L2
ENSG00000116641 DOCK7 336795 sc-eQTL 2.21e-01 -0.172 0.14 0.112 B_Memory L2
ENSG00000125703 ATG4C 241049 sc-eQTL 8.17e-01 0.0308 0.133 0.112 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -568540 sc-eQTL 9.27e-01 0.014 0.153 0.112 B_Memory L2
ENSG00000162607 USP1 588884 sc-eQTL 4.37e-01 -0.12 0.154 0.112 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -498191 sc-eQTL 8.27e-01 0.0331 0.151 0.112 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 -568230 sc-eQTL 4.98e-01 0.0985 0.145 0.111 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 -342394 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00452 0.146 0.111 B_Naive1 L2
ENSG00000116641 DOCK7 336795 sc-eQTL 9.69e-01 0.00547 0.14 0.111 B_Naive1 L2
ENSG00000125703 ATG4C 241049 sc-eQTL 3.74e-01 0.0957 0.107 0.111 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -568540 sc-eQTL 2.57e-01 0.162 0.142 0.111 B_Naive1 L2
ENSG00000162607 USP1 588884 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0206 0.126 0.111 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -498191 sc-eQTL 9.87e-03 0.391 0.15 0.111 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 -568230 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0833 0.142 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 -342394 sc-eQTL 9.13e-01 0.0162 0.148 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000116641 DOCK7 336795 sc-eQTL 5.88e-01 0.0771 0.142 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000125703 ATG4C 241049 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0475 0.137 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -568540 sc-eQTL 6.79e-01 0.0614 0.148 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000162607 USP1 588884 sc-eQTL 2.50e-01 0.163 0.141 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -498191 sc-eQTL 8.48e-01 0.0284 0.148 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 -568230 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00809 0.148 0.109 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -342394 sc-eQTL 3.36e-01 0.151 0.156 0.109 CD4_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 336795 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0232 0.137 0.109 CD4_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 241049 sc-eQTL 9.16e-01 -0.015 0.142 0.109 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -568540 sc-eQTL 2.25e-01 -0.184 0.151 0.109 CD4_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 588884 sc-eQTL 7.14e-01 0.0528 0.144 0.109 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -498191 sc-eQTL 2.46e-01 -0.167 0.143 0.109 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -568230 sc-eQTL 8.81e-02 0.206 0.12 0.111 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -342394 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0256 0.131 0.111 CD4_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 336795 sc-eQTL 9.58e-01 0.0068 0.129 0.111 CD4_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 241049 sc-eQTL 2.46e-02 -0.255 0.113 0.111 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -568540 sc-eQTL 4.72e-01 0.1 0.139 0.111 CD4_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 588884 sc-eQTL 3.00e-01 0.11 0.106 0.111 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -498191 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0668 0.138 0.111 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -568230 sc-eQTL 8.68e-01 0.0208 0.125 0.111 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -342394 sc-eQTL 1.38e-01 0.216 0.145 0.111 CD4_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 336795 sc-eQTL 4.84e-01 0.0903 0.129 0.111 CD4_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 241049 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0798 0.126 0.111 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -568540 sc-eQTL 7.15e-01 0.0542 0.148 0.111 CD4_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 588884 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0533 0.121 0.111 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -498191 sc-eQTL 9.35e-01 0.0117 0.143 0.111 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -568230 sc-eQTL 1.94e-01 -0.193 0.148 0.111 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -342394 sc-eQTL 5.75e-01 0.0838 0.149 0.111 CD4_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 336795 sc-eQTL 4.57e-01 -0.108 0.145 0.111 CD4_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 241049 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0619 0.141 0.111 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -568540 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0257 0.146 0.111 CD4_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 588884 sc-eQTL 6.77e-01 0.0577 0.138 0.111 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -498191 sc-eQTL 1.67e-01 0.209 0.15 0.111 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -568230 sc-eQTL 8.80e-01 0.0199 0.132 0.111 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -342394 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0243 0.141 0.111 CD8_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 336795 sc-eQTL 4.62e-01 0.0982 0.133 0.111 CD8_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 241049 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00249 0.142 0.111 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -568540 sc-eQTL 7.55e-01 0.0461 0.148 0.111 CD8_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 588884 sc-eQTL 3.25e-01 0.13 0.132 0.111 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -498191 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0477 0.151 0.111 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -568230 sc-eQTL 1.76e-01 0.184 0.135 0.111 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -342394 sc-eQTL 9.58e-01 0.00748 0.141 0.111 CD8_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 336795 sc-eQTL 8.67e-02 0.249 0.145 0.111 CD8_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 241049 sc-eQTL 3.13e-01 0.141 0.139 0.111 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -568540 sc-eQTL 3.36e-01 0.136 0.141 0.111 CD8_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 588884 sc-eQTL 1.51e-01 0.172 0.119 0.111 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -498191 sc-eQTL 1.61e-01 0.187 0.133 0.111 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -568230 sc-eQTL 8.67e-01 0.0253 0.151 0.116 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -342394 sc-eQTL 2.32e-01 -0.182 0.152 0.116 CD8_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 336795 sc-eQTL 7.87e-01 0.0403 0.149 0.116 CD8_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 241049 sc-eQTL 5.70e-02 -0.289 0.151 0.116 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -568540 sc-eQTL 3.20e-01 0.147 0.147 0.116 CD8_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 588884 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0619 0.142 0.116 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -498191 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0764 0.151 0.116 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -568230 sc-eQTL 2.50e-01 0.18 0.156 0.105 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -342394 sc-eQTL 4.18e-01 0.127 0.156 0.105 CD8_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 336795 sc-eQTL 6.28e-02 0.282 0.151 0.105 CD8_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 241049 sc-eQTL 6.81e-01 -0.06 0.146 0.105 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -568540 sc-eQTL 8.20e-01 0.036 0.158 0.105 CD8_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 588884 sc-eQTL 3.87e-01 0.131 0.151 0.105 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -498191 sc-eQTL 3.50e-01 0.143 0.153 0.105 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -568230 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00489 0.149 0.106 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 -342394 sc-eQTL 1.61e-01 0.206 0.146 0.106 MAIT L2
ENSG00000116641 DOCK7 336795 sc-eQTL 4.99e-02 0.275 0.14 0.106 MAIT L2
ENSG00000125703 ATG4C 241049 sc-eQTL 5.94e-01 0.0792 0.148 0.106 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -568540 sc-eQTL 6.54e-01 0.0668 0.149 0.106 MAIT L2
ENSG00000162607 USP1 588884 sc-eQTL 4.48e-02 0.295 0.146 0.106 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -498191 sc-eQTL 6.18e-01 0.0765 0.153 0.106 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 -568230 sc-eQTL 8.55e-01 0.0263 0.144 0.113 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 -342394 sc-eQTL 7.27e-01 0.0516 0.147 0.113 NK_CD56bright L2
ENSG00000116641 DOCK7 336795 sc-eQTL 1.51e-01 -0.183 0.127 0.113 NK_CD56bright L2
ENSG00000125703 ATG4C 241049 sc-eQTL 4.86e-01 0.0996 0.143 0.113 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -568540 sc-eQTL 3.07e-01 -0.152 0.148 0.113 NK_CD56bright L2
ENSG00000162607 USP1 588884 sc-eQTL 1.71e-01 0.21 0.152 0.113 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -498191 sc-eQTL 1.18e-01 -0.228 0.146 0.113 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 -568230 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0821 0.112 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 -342394 sc-eQTL 2.56e-01 -0.161 0.141 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000116641 DOCK7 336795 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0773 0.123 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000125703 ATG4C 241049 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0468 0.125 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -568540 sc-eQTL 3.53e-01 0.133 0.142 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000162607 USP1 588884 sc-eQTL 8.40e-01 0.0279 0.138 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -498191 sc-eQTL 3.67e-01 -0.139 0.154 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 -568230 sc-eQTL 6.50e-02 -0.28 0.151 0.112 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 -342394 sc-eQTL 3.89e-01 -0.136 0.157 0.112 NK_HLA L2
ENSG00000116641 DOCK7 336795 sc-eQTL 7.34e-01 0.041 0.12 0.112 NK_HLA L2
ENSG00000125703 ATG4C 241049 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0628 0.14 0.112 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -568540 sc-eQTL 5.26e-01 0.0935 0.147 0.112 NK_HLA L2
ENSG00000162607 USP1 588884 sc-eQTL 3.22e-01 -0.152 0.154 0.112 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -498191 sc-eQTL 3.66e-01 -0.127 0.14 0.112 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 -568230 sc-eQTL 1.00e+00 3.18e-05 0.124 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 -342394 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0881 0.14 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000116641 DOCK7 336795 sc-eQTL 7.55e-01 0.0404 0.129 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000125703 ATG4C 241049 sc-eQTL 3.08e-01 -0.135 0.132 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -568540 sc-eQTL 2.91e-01 0.145 0.137 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000162607 USP1 588884 sc-eQTL 3.71e-01 -0.129 0.144 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -498191 sc-eQTL 6.00e-01 0.0768 0.146 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 -568230 sc-eQTL 1.23e-01 -0.284 0.183 0.1 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 -342394 sc-eQTL 5.51e-02 0.37 0.191 0.1 PB L2
ENSG00000116641 DOCK7 336795 sc-eQTL 3.82e-01 0.181 0.207 0.1 PB L2
ENSG00000125703 ATG4C 241049 sc-eQTL 5.81e-02 0.34 0.178 0.1 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -568540 sc-eQTL 7.81e-01 0.0503 0.18 0.1 PB L2
ENSG00000162607 USP1 588884 sc-eQTL 9.21e-01 0.0178 0.18 0.1 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -498191 sc-eQTL 9.46e-02 -0.33 0.196 0.1 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 -568230 sc-eQTL 8.67e-01 0.0224 0.133 0.113 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 -342394 sc-eQTL 5.18e-02 0.263 0.135 0.113 Pro_T L2
ENSG00000116641 DOCK7 336795 sc-eQTL 3.39e-01 -0.13 0.136 0.113 Pro_T L2
ENSG00000125703 ATG4C 241049 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0737 0.119 0.113 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -568540 sc-eQTL 4.12e-01 0.0982 0.119 0.113 Pro_T L2
ENSG00000162607 USP1 588884 sc-eQTL 4.88e-01 0.0571 0.0822 0.113 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -498191 sc-eQTL 9.39e-01 -0.0106 0.139 0.113 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 -568230 sc-eQTL 4.84e-01 0.0997 0.142 0.111 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 -342394 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0433 0.152 0.111 Treg L2
ENSG00000116641 DOCK7 336795 sc-eQTL 1.93e-02 -0.325 0.138 0.111 Treg L2
ENSG00000125703 ATG4C 241049 sc-eQTL 9.74e-02 0.236 0.142 0.111 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -568540 sc-eQTL 1.83e-01 0.199 0.149 0.111 Treg L2
ENSG00000162607 USP1 588884 sc-eQTL 4.87e-01 -0.1 0.144 0.111 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -498191 sc-eQTL 1.00e-01 -0.235 0.142 0.111 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 -568230 sc-eQTL 6.93e-02 0.253 0.138 0.112 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -342394 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0973 0.141 0.112 cDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 336795 sc-eQTL 4.40e-01 0.107 0.139 0.112 cDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 241049 sc-eQTL 6.02e-01 0.0629 0.12 0.112 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -568540 sc-eQTL 7.46e-01 0.0495 0.153 0.112 cDC L2
ENSG00000162607 USP1 588884 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0297 0.136 0.112 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -498191 sc-eQTL 1.40e-01 -0.181 0.122 0.112 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 -568230 sc-eQTL 9.97e-01 0.000469 0.135 0.111 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 -342394 sc-eQTL 7.61e-01 0.041 0.135 0.111 cMono_IL1B L2
ENSG00000116641 DOCK7 336795 sc-eQTL 1.08e-01 0.228 0.141 0.111 cMono_IL1B L2
ENSG00000125703 ATG4C 241049 sc-eQTL 1.37e-01 -0.149 0.0994 0.111 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -568540 sc-eQTL 9.57e-01 0.00769 0.142 0.111 cMono_IL1B L2
ENSG00000162607 USP1 588884 sc-eQTL 3.09e-01 0.127 0.125 0.111 cMono_IL1B L2
ENSG00000240563 L1TD1 830332 sc-eQTL 1.32e-01 -0.189 0.125 0.111 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 -568230 sc-eQTL 6.83e-02 -0.265 0.145 0.111 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 -342394 sc-eQTL 4.69e-01 0.107 0.148 0.111 cMono_S100A L2
ENSG00000116641 DOCK7 336795 sc-eQTL 8.12e-01 0.0326 0.137 0.111 cMono_S100A L2
ENSG00000125703 ATG4C 241049 sc-eQTL 7.36e-01 -0.04 0.119 0.111 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -568540 sc-eQTL 3.18e-01 0.134 0.134 0.111 cMono_S100A L2
ENSG00000162607 USP1 588884 sc-eQTL 7.51e-01 0.0437 0.138 0.111 cMono_S100A L2
ENSG00000240563 L1TD1 830332 sc-eQTL 3.08e-01 -0.117 0.114 0.111 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 -568230 sc-eQTL 4.20e-01 0.137 0.17 0.103 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 -342394 sc-eQTL 4.28e-01 -0.144 0.181 0.103 gdT L2
ENSG00000116641 DOCK7 336795 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0561 0.178 0.103 gdT L2
ENSG00000125703 ATG4C 241049 sc-eQTL 4.77e-01 -0.121 0.17 0.103 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -568540 sc-eQTL 7.44e-01 0.0591 0.18 0.103 gdT L2
ENSG00000162607 USP1 588884 sc-eQTL 4.89e-01 -0.118 0.17 0.103 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -498191 sc-eQTL 9.36e-01 -0.0144 0.178 0.103 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 -568230 sc-eQTL 1.04e-01 -0.238 0.146 0.111 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -342394 sc-eQTL 2.11e-01 -0.171 0.136 0.111 intMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 336795 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0537 0.139 0.111 intMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 241049 sc-eQTL 5.41e-01 0.0815 0.133 0.111 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -568540 sc-eQTL 7.40e-01 0.0487 0.147 0.111 intMono L2
ENSG00000162607 USP1 588884 sc-eQTL 8.46e-01 0.0291 0.149 0.111 intMono L2
ENSG00000240563 L1TD1 830332 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0929 0.11 0.111 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -568230 sc-eQTL 1.89e-01 -0.172 0.131 0.115 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -342394 sc-eQTL 4.32e-01 0.113 0.144 0.115 ncMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 336795 sc-eQTL 8.83e-01 0.0209 0.142 0.115 ncMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 241049 sc-eQTL 6.47e-01 0.0608 0.132 0.115 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -568540 sc-eQTL 3.09e-01 -0.141 0.138 0.115 ncMono L2
ENSG00000162607 USP1 588884 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0209 0.142 0.115 ncMono L2
ENSG00000240563 L1TD1 830332 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0651 0.1 0.115 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -568230 sc-eQTL 1.25e-01 -0.228 0.148 0.127 pDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -342394 sc-eQTL 4.27e-01 0.115 0.145 0.127 pDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 336795 sc-eQTL 2.23e-01 -0.181 0.148 0.127 pDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 241049 sc-eQTL 7.64e-01 0.04 0.133 0.127 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -568540 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0634 0.149 0.127 pDC L2
ENSG00000162607 USP1 588884 sc-eQTL 4.01e-01 0.128 0.152 0.127 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -498191 sc-eQTL 5.38e-01 0.0815 0.132 0.127 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -568230 sc-eQTL 1.61e-01 0.191 0.136 0.111 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -342394 sc-eQTL 2.71e-01 -0.166 0.15 0.111 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 336795 sc-eQTL 9.32e-01 0.0113 0.131 0.111 B_Memory LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 241049 sc-eQTL 3.27e-01 0.104 0.106 0.111 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -568540 sc-eQTL 6.40e-01 0.0651 0.139 0.111 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 588884 sc-eQTL 1.72e-01 -0.184 0.134 0.111 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -498191 sc-eQTL 2.57e-01 0.164 0.145 0.111 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -568230 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0379 0.142 0.111 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -342394 sc-eQTL 7.34e-01 0.0498 0.146 0.111 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 336795 sc-eQTL 7.05e-01 0.0517 0.136 0.111 B_Naive LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 241049 sc-eQTL 7.18e-01 0.0377 0.104 0.111 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -568540 sc-eQTL 2.39e-01 0.173 0.147 0.111 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 588884 sc-eQTL 7.65e-01 0.0379 0.126 0.111 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -498191 sc-eQTL 1.48e-02 0.359 0.146 0.111 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -568230 sc-eQTL 3.92e-01 -0.117 0.136 0.111 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -342394 sc-eQTL 6.19e-01 0.0657 0.132 0.111 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 336795 sc-eQTL 1.92e-01 0.174 0.132 0.111 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 241049 sc-eQTL 2.61e-01 -0.103 0.0917 0.111 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -568540 sc-eQTL 8.59e-01 0.0243 0.136 0.111 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 588884 sc-eQTL 5.04e-01 0.0776 0.116 0.111 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000240563 L1TD1 830332 sc-eQTL 2.61e-01 -0.142 0.126 0.111 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -568230 sc-eQTL 5.67e-02 -0.244 0.127 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -342394 sc-eQTL 5.41e-01 0.0892 0.146 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 336795 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0736 0.144 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 241049 sc-eQTL 7.87e-01 0.0332 0.123 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -568540 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0722 0.143 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 588884 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00643 0.134 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000240563 L1TD1 830332 sc-eQTL 2.47e-01 -0.106 0.0912 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -568230 sc-eQTL 2.45e-01 -0.127 0.109 0.112 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -342394 sc-eQTL 1.37e-01 -0.195 0.131 0.112 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 336795 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0401 0.118 0.112 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 241049 sc-eQTL 1.84e-01 -0.156 0.117 0.112 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -568540 sc-eQTL 1.63e-01 0.194 0.139 0.112 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 588884 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0965 0.126 0.112 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -498191 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0982 0.154 0.112 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079739 PGM1 -568230 eQTL 0.0907 -0.0448 0.0265 0.00171 0.0 0.127
ENSG00000116641 DOCK7 336813 eQTL 0.0158 0.0792 0.0328 0.0 0.0 0.127

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina