logo

Genes within 1Mb (chr1:63014117:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -579294 sc-eQTL 5.93e-01 0.0748 0.14 0.079 B L1
ENSG00000088035 ALG6 -353458 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0556 0.145 0.079 B L1
ENSG00000116641 DOCK7 325731 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00999 0.145 0.079 B L1
ENSG00000125703 ATG4C 229985 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0555 0.101 0.079 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -579604 sc-eQTL 9.27e-01 -0.0147 0.16 0.079 B L1
ENSG00000162607 USP1 577820 sc-eQTL 1.69e-01 0.191 0.138 0.079 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -509255 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00249 0.164 0.079 B L1
ENSG00000079739 PGM1 -579294 sc-eQTL 2.16e-01 -0.15 0.121 0.079 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 -353458 sc-eQTL 3.20e-01 0.133 0.133 0.079 CD4T L1
ENSG00000116641 DOCK7 325731 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0513 0.135 0.079 CD4T L1
ENSG00000125703 ATG4C 229985 sc-eQTL 9.47e-01 0.00729 0.109 0.079 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -579604 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0959 0.155 0.079 CD4T L1
ENSG00000162607 USP1 577820 sc-eQTL 9.98e-01 0.000222 0.106 0.079 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -509255 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0474 0.139 0.079 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 -579294 sc-eQTL 2.40e-01 -0.158 0.134 0.079 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 -353458 sc-eQTL 3.23e-01 -0.147 0.148 0.079 CD8T L1
ENSG00000116641 DOCK7 325731 sc-eQTL 8.36e-01 0.0312 0.15 0.079 CD8T L1
ENSG00000125703 ATG4C 229985 sc-eQTL 4.82e-01 0.101 0.143 0.079 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -579604 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0201 0.16 0.079 CD8T L1
ENSG00000162607 USP1 577820 sc-eQTL 9.97e-01 0.000516 0.125 0.079 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -509255 sc-eQTL 3.79e-01 -0.14 0.159 0.079 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 -579294 sc-eQTL 9.12e-01 0.0164 0.148 0.081 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 -353458 sc-eQTL 8.19e-01 0.0349 0.153 0.081 DC L1
ENSG00000116641 DOCK7 325731 sc-eQTL 7.79e-01 0.0439 0.156 0.081 DC L1
ENSG00000125703 ATG4C 229985 sc-eQTL 8.22e-02 -0.212 0.121 0.081 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -579604 sc-eQTL 6.49e-01 0.078 0.171 0.081 DC L1
ENSG00000162607 USP1 577820 sc-eQTL 4.70e-01 -0.108 0.149 0.081 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -509255 sc-eQTL 1.06e-01 -0.24 0.148 0.081 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 -579294 sc-eQTL 4.56e-01 -0.107 0.143 0.079 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 -353458 sc-eQTL 5.25e-01 0.0953 0.15 0.079 Mono L1
ENSG00000116641 DOCK7 325731 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0787 0.145 0.079 Mono L1
ENSG00000125703 ATG4C 229985 sc-eQTL 8.18e-01 0.0226 0.0978 0.079 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -579604 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0267 0.155 0.079 Mono L1
ENSG00000162607 USP1 577820 sc-eQTL 5.93e-01 0.0679 0.127 0.079 Mono L1
ENSG00000240563 L1TD1 819268 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0216 0.118 0.079 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 -579294 sc-eQTL 3.13e-01 0.125 0.123 0.079 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 -353458 sc-eQTL 7.67e-01 0.0431 0.145 0.079 NK L1
ENSG00000116641 DOCK7 325731 sc-eQTL 3.90e-01 -0.103 0.119 0.079 NK L1
ENSG00000125703 ATG4C 229985 sc-eQTL 9.73e-01 -0.0043 0.128 0.079 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -579604 sc-eQTL 6.18e-01 0.0797 0.159 0.079 NK L1
ENSG00000162607 USP1 577820 sc-eQTL 1.78e-02 -0.336 0.141 0.079 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -509255 sc-eQTL 4.21e-01 -0.14 0.173 0.079 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 -579294 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0583 0.142 0.079 Other_T L1
ENSG00000088035 ALG6 -353458 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0634 0.142 0.079 Other_T L1
ENSG00000116641 DOCK7 325731 sc-eQTL 5.86e-01 0.0793 0.145 0.079 Other_T L1
ENSG00000125703 ATG4C 229985 sc-eQTL 4.22e-01 -0.101 0.126 0.079 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -579604 sc-eQTL 5.11e-01 0.0734 0.112 0.079 Other_T L1
ENSG00000162607 USP1 577820 sc-eQTL 9.56e-01 0.00532 0.0968 0.079 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -509255 sc-eQTL 9.98e-01 0.000449 0.172 0.079 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -579294 sc-eQTL 9.67e-01 0.0083 0.201 0.074 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 -353458 sc-eQTL 7.96e-01 -0.05 0.193 0.074 B_Activated L2
ENSG00000116641 DOCK7 325731 sc-eQTL 2.50e-01 -0.206 0.179 0.074 B_Activated L2
ENSG00000125703 ATG4C 229985 sc-eQTL 5.22e-01 -0.121 0.188 0.074 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -579604 sc-eQTL 2.37e-01 -0.218 0.183 0.074 B_Activated L2
ENSG00000162607 USP1 577820 sc-eQTL 6.75e-01 0.0839 0.2 0.074 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -509255 sc-eQTL 9.92e-01 0.00179 0.174 0.074 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 -579294 sc-eQTL 1.07e-01 0.275 0.17 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 -353458 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0811 0.173 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000116641 DOCK7 325731 sc-eQTL 4.42e-01 0.127 0.165 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000125703 ATG4C 229985 sc-eQTL 8.06e-01 0.0344 0.14 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -579604 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0721 0.167 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000162607 USP1 577820 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0991 0.167 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -509255 sc-eQTL 5.86e-01 0.0902 0.165 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 -579294 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0766 0.168 0.08 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 -353458 sc-eQTL 1.97e-01 0.22 0.17 0.08 B_Memory L2
ENSG00000116641 DOCK7 325731 sc-eQTL 6.53e-01 -0.072 0.16 0.08 B_Memory L2
ENSG00000125703 ATG4C 229985 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0574 0.152 0.08 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -579604 sc-eQTL 2.26e-01 -0.211 0.173 0.08 B_Memory L2
ENSG00000162607 USP1 577820 sc-eQTL 5.03e-01 0.118 0.175 0.08 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -509255 sc-eQTL 6.07e-01 -0.089 0.173 0.08 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 -579294 sc-eQTL 6.64e-01 0.0726 0.167 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 -353458 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0655 0.167 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000116641 DOCK7 325731 sc-eQTL 2.89e-01 0.17 0.16 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000125703 ATG4C 229985 sc-eQTL 3.59e-01 -0.113 0.123 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -579604 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0267 0.164 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000162607 USP1 577820 sc-eQTL 3.80e-01 0.127 0.144 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -509255 sc-eQTL 4.15e-01 -0.143 0.175 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 -579294 sc-eQTL 9.08e-01 0.0189 0.163 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 -353458 sc-eQTL 4.55e-01 -0.127 0.17 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000116641 DOCK7 325731 sc-eQTL 1.12e-01 -0.26 0.163 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000125703 ATG4C 229985 sc-eQTL 4.93e-01 -0.108 0.157 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -579604 sc-eQTL 9.95e-01 0.00114 0.171 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000162607 USP1 577820 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000325 0.163 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -509255 sc-eQTL 9.32e-01 -0.0145 0.17 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 -579294 sc-eQTL 3.81e-01 -0.15 0.171 0.077 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -353458 sc-eQTL 4.61e-01 -0.134 0.181 0.077 CD4_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 325731 sc-eQTL 3.03e-01 -0.163 0.158 0.077 CD4_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 229985 sc-eQTL 5.13e-01 0.107 0.164 0.077 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -579604 sc-eQTL 8.29e-01 0.0378 0.175 0.077 CD4_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 577820 sc-eQTL 9.34e-01 -0.0138 0.167 0.077 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -509255 sc-eQTL 2.53e-01 0.19 0.166 0.077 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -579294 sc-eQTL 2.56e-01 -0.154 0.136 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -353458 sc-eQTL 8.10e-02 0.257 0.147 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 325731 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0285 0.145 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 229985 sc-eQTL 4.94e-01 0.0877 0.128 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -579604 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0966 0.157 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 577820 sc-eQTL 9.35e-01 0.00974 0.12 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -509255 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0565 0.156 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -579294 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0961 0.139 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -353458 sc-eQTL 8.99e-01 0.0206 0.162 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 325731 sc-eQTL 3.16e-01 -0.144 0.143 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 229985 sc-eQTL 9.20e-01 0.014 0.14 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -579604 sc-eQTL 4.45e-01 0.126 0.164 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 577820 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0812 0.135 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -509255 sc-eQTL 6.29e-01 0.0771 0.159 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -579294 sc-eQTL 1.24e-01 -0.254 0.165 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -353458 sc-eQTL 2.51e-01 -0.191 0.166 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 325731 sc-eQTL 3.92e-01 0.139 0.162 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 229985 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0891 0.157 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -579604 sc-eQTL 4.59e-01 0.12 0.162 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 577820 sc-eQTL 2.56e-01 0.175 0.154 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -509255 sc-eQTL 2.05e-01 -0.213 0.168 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -579294 sc-eQTL 1.17e-01 -0.237 0.151 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -353458 sc-eQTL 3.22e-01 -0.159 0.161 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 325731 sc-eQTL 6.93e-01 0.0604 0.153 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 229985 sc-eQTL 4.47e-01 0.124 0.162 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -579604 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0251 0.169 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 577820 sc-eQTL 5.30e-01 0.0953 0.151 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -509255 sc-eQTL 3.06e-01 -0.177 0.173 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -579294 sc-eQTL 6.94e-01 -0.061 0.155 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -353458 sc-eQTL 6.75e-01 0.0675 0.161 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 325731 sc-eQTL 7.81e-01 0.0462 0.166 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 229985 sc-eQTL 2.93e-01 0.168 0.159 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -579604 sc-eQTL 8.67e-01 -0.027 0.161 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 577820 sc-eQTL 7.49e-01 0.0437 0.136 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -509255 sc-eQTL 5.03e-01 -0.102 0.152 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -579294 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0226 0.171 0.081 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -353458 sc-eQTL 1.08e-01 -0.278 0.172 0.081 CD8_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 325731 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0814 0.169 0.081 CD8_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 229985 sc-eQTL 1.34e-01 0.259 0.172 0.081 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -579604 sc-eQTL 9.80e-02 0.278 0.167 0.081 CD8_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 577820 sc-eQTL 1.04e-01 0.263 0.161 0.081 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -509255 sc-eQTL 5.17e-01 0.111 0.171 0.081 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -579294 sc-eQTL 4.08e-01 0.142 0.171 0.082 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -353458 sc-eQTL 5.53e-02 -0.329 0.171 0.082 CD8_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 325731 sc-eQTL 6.99e-01 0.0645 0.167 0.082 CD8_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 229985 sc-eQTL 1.04e-02 -0.408 0.158 0.082 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -579604 sc-eQTL 3.40e-01 -0.166 0.173 0.082 CD8_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 577820 sc-eQTL 5.36e-01 0.103 0.166 0.082 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -509255 sc-eQTL 3.25e-01 0.166 0.168 0.082 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -579294 sc-eQTL 6.54e-01 0.0712 0.159 0.08 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 -353458 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0573 0.157 0.08 MAIT L2
ENSG00000116641 DOCK7 325731 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0396 0.151 0.08 MAIT L2
ENSG00000125703 ATG4C 229985 sc-eQTL 3.84e-01 0.138 0.159 0.08 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -579604 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0993 0.159 0.08 MAIT L2
ENSG00000162607 USP1 577820 sc-eQTL 1.44e-01 -0.231 0.157 0.08 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -509255 sc-eQTL 7.93e-01 -0.043 0.164 0.08 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 -579294 sc-eQTL 4.44e-01 0.122 0.16 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 -353458 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0575 0.164 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000116641 DOCK7 325731 sc-eQTL 7.25e-01 -0.05 0.142 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000125703 ATG4C 229985 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0853 0.158 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -579604 sc-eQTL 6.79e-01 0.0683 0.165 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000162607 USP1 577820 sc-eQTL 8.48e-01 0.0327 0.17 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -509255 sc-eQTL 3.36e-01 0.157 0.163 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 -579294 sc-eQTL 4.92e-01 0.0883 0.128 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 -353458 sc-eQTL 3.09e-01 0.166 0.162 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000116641 DOCK7 325731 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0539 0.142 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000125703 ATG4C 229985 sc-eQTL 6.09e-01 0.0737 0.144 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -579604 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0257 0.164 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000162607 USP1 577820 sc-eQTL 5.06e-03 -0.441 0.156 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -509255 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0552 0.177 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 -579294 sc-eQTL 3.90e-01 0.151 0.176 0.075 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 -353458 sc-eQTL 1.22e-02 -0.454 0.18 0.075 NK_HLA L2
ENSG00000116641 DOCK7 325731 sc-eQTL 3.62e-01 -0.127 0.139 0.075 NK_HLA L2
ENSG00000125703 ATG4C 229985 sc-eQTL 1.72e-01 0.222 0.162 0.075 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -579604 sc-eQTL 3.25e-01 0.168 0.17 0.075 NK_HLA L2
ENSG00000162607 USP1 577820 sc-eQTL 5.02e-01 0.12 0.178 0.075 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -509255 sc-eQTL 3.65e-01 0.147 0.162 0.075 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 -579294 sc-eQTL 6.85e-01 0.0576 0.142 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 -353458 sc-eQTL 3.78e-01 0.141 0.16 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000116641 DOCK7 325731 sc-eQTL 4.91e-01 0.102 0.148 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000125703 ATG4C 229985 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0695 0.152 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -579604 sc-eQTL 8.81e-01 0.0236 0.157 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000162607 USP1 577820 sc-eQTL 1.31e-01 -0.249 0.164 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -509255 sc-eQTL 3.25e-01 -0.165 0.167 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 -579294 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0258 0.214 0.085 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 -353458 sc-eQTL 9.38e-02 -0.375 0.222 0.085 PB L2
ENSG00000116641 DOCK7 325731 sc-eQTL 3.06e-01 0.246 0.239 0.085 PB L2
ENSG00000125703 ATG4C 229985 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0799 0.21 0.085 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -579604 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0687 0.209 0.085 PB L2
ENSG00000162607 USP1 577820 sc-eQTL 6.60e-01 -0.092 0.208 0.085 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -509255 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00466 0.23 0.085 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 -579294 sc-eQTL 3.96e-01 0.128 0.15 0.08 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 -353458 sc-eQTL 5.39e-01 -0.094 0.153 0.08 Pro_T L2
ENSG00000116641 DOCK7 325731 sc-eQTL 1.92e-01 0.2 0.153 0.08 Pro_T L2
ENSG00000125703 ATG4C 229985 sc-eQTL 1.35e-01 -0.201 0.134 0.08 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -579604 sc-eQTL 6.01e-02 0.252 0.134 0.08 Pro_T L2
ENSG00000162607 USP1 577820 sc-eQTL 3.29e-01 0.0905 0.0924 0.08 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -509255 sc-eQTL 5.95e-01 0.0832 0.156 0.08 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 -579294 sc-eQTL 2.30e-01 -0.192 0.159 0.079 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 -353458 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0195 0.171 0.079 Treg L2
ENSG00000116641 DOCK7 325731 sc-eQTL 5.49e-01 0.0942 0.157 0.079 Treg L2
ENSG00000125703 ATG4C 229985 sc-eQTL 9.79e-01 0.00429 0.16 0.079 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -579604 sc-eQTL 3.59e-02 -0.351 0.166 0.079 Treg L2
ENSG00000162607 USP1 577820 sc-eQTL 9.56e-01 0.00891 0.162 0.079 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -509255 sc-eQTL 3.93e-01 -0.137 0.16 0.079 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 -579294 sc-eQTL 8.56e-01 0.0291 0.16 0.083 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -353458 sc-eQTL 6.89e-01 -0.065 0.162 0.083 cDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 325731 sc-eQTL 5.68e-01 0.091 0.159 0.083 cDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 229985 sc-eQTL 6.42e-02 -0.255 0.137 0.083 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -579604 sc-eQTL 5.94e-01 0.0934 0.175 0.083 cDC L2
ENSG00000162607 USP1 577820 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00245 0.156 0.083 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -509255 sc-eQTL 8.71e-02 -0.24 0.14 0.083 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 -579294 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0235 0.149 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 -353458 sc-eQTL 1.91e-01 0.195 0.149 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000116641 DOCK7 325731 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0447 0.157 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000125703 ATG4C 229985 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0204 0.111 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -579604 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0635 0.157 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000162607 USP1 577820 sc-eQTL 9.82e-02 0.228 0.137 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000240563 L1TD1 819268 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0574 0.139 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 -579294 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0936 0.166 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 -353458 sc-eQTL 5.00e-01 -0.114 0.168 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000116641 DOCK7 325731 sc-eQTL 7.29e-01 0.054 0.156 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000125703 ATG4C 229985 sc-eQTL 4.90e-01 0.0933 0.135 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -579604 sc-eQTL 8.02e-01 0.0383 0.152 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000162607 USP1 577820 sc-eQTL 5.95e-01 0.0834 0.157 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000240563 L1TD1 819268 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0396 0.13 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 -579294 sc-eQTL 9.84e-01 0.00355 0.175 0.085 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 -353458 sc-eQTL 2.19e-01 -0.229 0.185 0.085 gdT L2
ENSG00000116641 DOCK7 325731 sc-eQTL 1.55e-01 0.259 0.181 0.085 gdT L2
ENSG00000125703 ATG4C 229985 sc-eQTL 9.26e-01 -0.0163 0.175 0.085 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -579604 sc-eQTL 5.80e-01 0.103 0.185 0.085 gdT L2
ENSG00000162607 USP1 577820 sc-eQTL 7.63e-02 0.31 0.173 0.085 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -509255 sc-eQTL 8.02e-01 0.0458 0.182 0.085 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 -579294 sc-eQTL 8.26e-01 0.0371 0.169 0.08 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -353458 sc-eQTL 6.21e-01 0.0777 0.157 0.08 intMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 325731 sc-eQTL 6.71e-03 -0.432 0.158 0.08 intMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 229985 sc-eQTL 9.71e-01 -0.0055 0.153 0.08 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -579604 sc-eQTL 6.65e-01 0.0732 0.169 0.08 intMono L2
ENSG00000162607 USP1 577820 sc-eQTL 1.34e-01 -0.257 0.171 0.08 intMono L2
ENSG00000240563 L1TD1 819268 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0368 0.126 0.08 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -579294 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0325 0.148 0.084 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -353458 sc-eQTL 3.94e-01 0.139 0.162 0.084 ncMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 325731 sc-eQTL 2.05e-01 -0.203 0.159 0.084 ncMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 229985 sc-eQTL 7.86e-01 0.0407 0.149 0.084 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -579604 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00835 0.156 0.084 ncMono L2
ENSG00000162607 USP1 577820 sc-eQTL 9.78e-01 0.00434 0.16 0.084 ncMono L2
ENSG00000240563 L1TD1 819268 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0708 0.113 0.084 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -579294 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0394 0.177 0.079 pDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -353458 sc-eQTL 6.65e-01 0.0749 0.172 0.079 pDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 325731 sc-eQTL 8.94e-01 0.0235 0.176 0.079 pDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 229985 sc-eQTL 1.60e-01 -0.222 0.157 0.079 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -579604 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0909 0.177 0.079 pDC L2
ENSG00000162607 USP1 577820 sc-eQTL 1.71e-01 -0.247 0.18 0.079 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -509255 sc-eQTL 2.80e-01 -0.169 0.156 0.079 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -579294 sc-eQTL 3.20e-01 0.156 0.157 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -353458 sc-eQTL 5.05e-01 0.116 0.173 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 325731 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0359 0.151 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 229985 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0679 0.122 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -579604 sc-eQTL 9.42e-02 -0.267 0.159 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 577820 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00764 0.155 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -509255 sc-eQTL 6.58e-01 0.0739 0.167 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -579294 sc-eQTL 7.21e-01 0.0582 0.162 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -353458 sc-eQTL 4.31e-01 -0.132 0.167 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 325731 sc-eQTL 7.99e-01 0.0398 0.156 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 229985 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0449 0.119 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -579604 sc-eQTL 8.61e-01 0.0296 0.169 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 577820 sc-eQTL 3.60e-01 0.133 0.145 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -509255 sc-eQTL 4.20e-01 -0.137 0.169 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -579294 sc-eQTL 5.01e-01 -0.103 0.153 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -353458 sc-eQTL 6.07e-01 0.0762 0.148 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 325731 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0233 0.149 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 229985 sc-eQTL 7.32e-01 0.0353 0.103 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -579604 sc-eQTL 8.80e-01 -0.023 0.152 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 577820 sc-eQTL 2.28e-01 0.157 0.13 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000240563 L1TD1 819268 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0371 0.141 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -579294 sc-eQTL 9.36e-01 0.0117 0.146 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -353458 sc-eQTL 4.90e-01 0.114 0.166 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 325731 sc-eQTL 1.05e-02 -0.417 0.162 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 229985 sc-eQTL 7.98e-01 0.0358 0.14 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -579604 sc-eQTL 6.18e-01 0.0812 0.162 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 577820 sc-eQTL 4.40e-01 -0.118 0.152 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000240563 L1TD1 819268 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0589 0.104 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -579294 sc-eQTL 6.95e-01 0.0493 0.125 0.078 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -353458 sc-eQTL 4.66e-01 0.11 0.151 0.078 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 325731 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0267 0.135 0.078 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 229985 sc-eQTL 8.10e-01 0.0325 0.135 0.078 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -579604 sc-eQTL 6.46e-01 0.0735 0.16 0.078 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 577820 sc-eQTL 5.17e-03 -0.402 0.142 0.078 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -509255 sc-eQTL 3.25e-01 -0.174 0.176 0.078 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079739 PGM1 -579294 eQTL 0.041 0.0656 0.032 0.0 0.0 0.0873

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000203965 \N -509255 6.09e-07 3.11e-07 1.08e-07 2.87e-07 1.06e-07 1.57e-07 4.09e-07 1.03e-07 2.81e-07 2.01e-07 3.92e-07 2.98e-07 5.09e-07 9.48e-08 1.32e-07 1.84e-07 1.85e-07 3.3e-07 1.62e-07 9.01e-08 1.91e-07 2.86e-07 2.77e-07 1.19e-07 4.46e-07 2.46e-07 2.23e-07 1.88e-07 2.66e-07 3.3e-07 1.93e-07 7.49e-08 5.38e-08 1.19e-07 2.15e-07 6.83e-08 9.52e-08 7.86e-08 5.86e-08 6.07e-08 4.63e-08 2.9e-07 2.16e-08 2.03e-08 1.01e-07 1.75e-08 7.36e-08 3.3e-09 5.65e-08