logo

Genes within 1Mb (chr1:62998494:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -594917 sc-eQTL 8.13e-01 0.0332 0.141 0.079 B L1
ENSG00000088035 ALG6 -369081 sc-eQTL 8.81e-01 0.0219 0.146 0.079 B L1
ENSG00000116641 DOCK7 310108 sc-eQTL 9.35e-01 -0.0119 0.146 0.079 B L1
ENSG00000125703 ATG4C 214362 sc-eQTL 9.51e-01 0.00623 0.101 0.079 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -595227 sc-eQTL 8.89e-01 0.0225 0.161 0.079 B L1
ENSG00000162607 USP1 562197 sc-eQTL 3.08e-01 0.142 0.139 0.079 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -524878 sc-eQTL 3.63e-01 0.15 0.165 0.079 B L1
ENSG00000079739 PGM1 -594917 sc-eQTL 1.86e-01 -0.161 0.121 0.079 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 -369081 sc-eQTL 2.18e-01 0.166 0.134 0.079 CD4T L1
ENSG00000116641 DOCK7 310108 sc-eQTL 4.11e-01 -0.112 0.136 0.079 CD4T L1
ENSG00000125703 ATG4C 214362 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00314 0.11 0.079 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -595227 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0446 0.156 0.079 CD4T L1
ENSG00000162607 USP1 562197 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0467 0.107 0.079 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -524878 sc-eQTL 9.22e-01 -0.0138 0.14 0.079 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 -594917 sc-eQTL 1.87e-01 -0.177 0.134 0.079 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 -369081 sc-eQTL 5.46e-02 -0.284 0.147 0.079 CD8T L1
ENSG00000116641 DOCK7 310108 sc-eQTL 3.91e-01 0.129 0.15 0.079 CD8T L1
ENSG00000125703 ATG4C 214362 sc-eQTL 3.94e-01 0.122 0.142 0.079 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -595227 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0182 0.159 0.079 CD8T L1
ENSG00000162607 USP1 562197 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0215 0.124 0.079 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -524878 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0787 0.159 0.079 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 -594917 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0451 0.148 0.081 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 -369081 sc-eQTL 9.17e-01 -0.0159 0.153 0.081 DC L1
ENSG00000116641 DOCK7 310108 sc-eQTL 9.81e-01 0.00366 0.157 0.081 DC L1
ENSG00000125703 ATG4C 214362 sc-eQTL 3.39e-02 -0.259 0.121 0.081 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -595227 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00619 0.171 0.081 DC L1
ENSG00000162607 USP1 562197 sc-eQTL 9.30e-02 -0.251 0.149 0.081 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -524878 sc-eQTL 1.63e-01 -0.208 0.148 0.081 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 -594917 sc-eQTL 1.70e-01 -0.196 0.143 0.079 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 -369081 sc-eQTL 2.91e-01 0.158 0.149 0.079 Mono L1
ENSG00000116641 DOCK7 310108 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0319 0.144 0.079 Mono L1
ENSG00000125703 ATG4C 214362 sc-eQTL 5.54e-01 0.0578 0.0976 0.079 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -595227 sc-eQTL 5.64e-01 0.089 0.154 0.079 Mono L1
ENSG00000162607 USP1 562197 sc-eQTL 8.69e-01 -0.021 0.127 0.079 Mono L1
ENSG00000240563 L1TD1 803645 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0574 0.118 0.079 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 -594917 sc-eQTL 7.39e-01 0.0419 0.126 0.079 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 -369081 sc-eQTL 6.16e-01 -0.074 0.147 0.079 NK L1
ENSG00000116641 DOCK7 310108 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0745 0.121 0.079 NK L1
ENSG00000125703 ATG4C 214362 sc-eQTL 8.00e-01 0.033 0.13 0.079 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -595227 sc-eQTL 2.53e-01 0.185 0.161 0.079 NK L1
ENSG00000162607 USP1 562197 sc-eQTL 4.74e-02 -0.286 0.143 0.079 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -524878 sc-eQTL 7.72e-01 -0.051 0.176 0.079 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 -594917 sc-eQTL 8.03e-01 0.0362 0.145 0.079 Other_T L1
ENSG00000088035 ALG6 -369081 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00724 0.145 0.079 Other_T L1
ENSG00000116641 DOCK7 310108 sc-eQTL 9.93e-01 0.00134 0.148 0.079 Other_T L1
ENSG00000125703 ATG4C 214362 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000336 0.128 0.079 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -595227 sc-eQTL 1.58e-01 0.16 0.113 0.079 Other_T L1
ENSG00000162607 USP1 562197 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0285 0.0987 0.079 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -524878 sc-eQTL 8.09e-01 0.0425 0.176 0.079 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -594917 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0848 0.206 0.071 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 -369081 sc-eQTL 4.09e-01 -0.163 0.197 0.071 B_Activated L2
ENSG00000116641 DOCK7 310108 sc-eQTL 2.52e-01 -0.211 0.183 0.071 B_Activated L2
ENSG00000125703 ATG4C 214362 sc-eQTL 7.86e-01 0.0526 0.194 0.071 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -595227 sc-eQTL 3.66e-01 -0.171 0.189 0.071 B_Activated L2
ENSG00000162607 USP1 562197 sc-eQTL 6.37e-01 0.0969 0.205 0.071 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -524878 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0913 0.179 0.071 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 -594917 sc-eQTL 2.81e-01 0.187 0.173 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 -369081 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0636 0.176 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000116641 DOCK7 310108 sc-eQTL 6.76e-01 0.0705 0.168 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000125703 ATG4C 214362 sc-eQTL 8.27e-01 0.0313 0.143 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -595227 sc-eQTL 7.93e-01 0.0447 0.17 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000162607 USP1 562197 sc-eQTL 3.47e-01 -0.159 0.169 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -524878 sc-eQTL 7.52e-01 0.0532 0.168 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 -594917 sc-eQTL 7.18e-01 0.0619 0.171 0.08 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 -369081 sc-eQTL 1.12e-01 0.276 0.173 0.08 B_Memory L2
ENSG00000116641 DOCK7 310108 sc-eQTL 2.81e-01 -0.176 0.163 0.08 B_Memory L2
ENSG00000125703 ATG4C 214362 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0732 0.155 0.08 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -595227 sc-eQTL 1.86e-01 -0.234 0.177 0.08 B_Memory L2
ENSG00000162607 USP1 562197 sc-eQTL 4.59e-01 0.133 0.179 0.08 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -524878 sc-eQTL 7.74e-01 0.0508 0.176 0.08 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 -594917 sc-eQTL 6.03e-01 0.0889 0.171 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 -369081 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0469 0.171 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000116641 DOCK7 310108 sc-eQTL 2.21e-01 0.201 0.164 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000125703 ATG4C 214362 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0635 0.126 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -595227 sc-eQTL 6.76e-01 0.0701 0.168 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000162607 USP1 562197 sc-eQTL 7.42e-01 0.0486 0.147 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -524878 sc-eQTL 6.12e-01 0.0909 0.179 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 -594917 sc-eQTL 9.37e-01 0.0132 0.167 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 -369081 sc-eQTL 4.14e-01 -0.142 0.173 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000116641 DOCK7 310108 sc-eQTL 1.60e-01 -0.234 0.166 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000125703 ATG4C 214362 sc-eQTL 4.66e-01 -0.117 0.16 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -595227 sc-eQTL 8.53e-01 0.0323 0.174 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000162607 USP1 562197 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0356 0.166 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -524878 sc-eQTL 7.97e-01 0.0447 0.173 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 -594917 sc-eQTL 3.56e-01 -0.162 0.175 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -369081 sc-eQTL 6.98e-01 -0.072 0.186 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 310108 sc-eQTL 4.61e-01 -0.12 0.162 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 214362 sc-eQTL 6.41e-01 0.0782 0.168 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -595227 sc-eQTL 8.38e-01 0.0368 0.18 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 562197 sc-eQTL 3.39e-01 -0.163 0.17 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -524878 sc-eQTL 1.80e-01 0.228 0.17 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -594917 sc-eQTL 3.67e-01 -0.123 0.136 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -369081 sc-eQTL 8.96e-02 0.251 0.147 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 310108 sc-eQTL 2.63e-01 -0.163 0.145 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 214362 sc-eQTL 3.51e-01 0.12 0.129 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -595227 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0322 0.157 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 562197 sc-eQTL 7.71e-01 0.0351 0.12 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -524878 sc-eQTL 4.94e-01 -0.107 0.156 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -594917 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0879 0.14 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -369081 sc-eQTL 7.65e-01 0.0488 0.163 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 310108 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0628 0.144 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 214362 sc-eQTL 9.34e-01 -0.0116 0.141 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -595227 sc-eQTL 2.73e-01 0.181 0.165 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 562197 sc-eQTL 1.83e-01 -0.18 0.135 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -524878 sc-eQTL 3.85e-01 0.139 0.16 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -594917 sc-eQTL 8.37e-03 -0.444 0.167 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -369081 sc-eQTL 1.37e-01 -0.253 0.17 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 310108 sc-eQTL 3.19e-01 0.166 0.166 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 214362 sc-eQTL 2.40e-01 -0.189 0.161 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -595227 sc-eQTL 1.76e-01 0.225 0.166 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 562197 sc-eQTL 7.93e-01 0.0415 0.158 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -524878 sc-eQTL 3.91e-01 -0.148 0.172 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -594917 sc-eQTL 1.84e-01 -0.203 0.153 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -369081 sc-eQTL 5.97e-02 -0.306 0.161 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 310108 sc-eQTL 2.20e-01 0.19 0.154 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 214362 sc-eQTL 3.94e-01 0.14 0.164 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -595227 sc-eQTL 9.53e-01 -0.0101 0.171 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 562197 sc-eQTL 7.94e-01 0.0401 0.153 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -524878 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0524 0.175 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -594917 sc-eQTL 9.27e-01 -0.0142 0.155 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -369081 sc-eQTL 8.47e-02 0.275 0.159 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 310108 sc-eQTL 8.60e-01 0.0293 0.165 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 214362 sc-eQTL 6.72e-02 0.29 0.158 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -595227 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0377 0.161 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 562197 sc-eQTL 5.30e-01 0.0854 0.136 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -524878 sc-eQTL 9.62e-01 0.00717 0.152 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -594917 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0531 0.172 0.081 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -369081 sc-eQTL 2.89e-03 -0.515 0.171 0.081 CD8_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 310108 sc-eQTL 9.57e-01 0.0092 0.17 0.081 CD8_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 214362 sc-eQTL 3.61e-01 0.159 0.174 0.081 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -595227 sc-eQTL 1.42e-01 0.248 0.168 0.081 CD8_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 562197 sc-eQTL 6.26e-01 0.0795 0.163 0.081 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -524878 sc-eQTL 8.71e-01 -0.028 0.172 0.081 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -594917 sc-eQTL 7.02e-01 0.0669 0.175 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -369081 sc-eQTL 9.80e-02 -0.29 0.174 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 310108 sc-eQTL 8.93e-01 0.0228 0.17 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 214362 sc-eQTL 1.04e-02 -0.416 0.161 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -595227 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0701 0.177 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 562197 sc-eQTL 4.16e-01 0.137 0.169 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -524878 sc-eQTL 3.69e-01 0.155 0.171 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -594917 sc-eQTL 9.90e-01 0.00207 0.164 0.078 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 -369081 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0765 0.162 0.078 MAIT L2
ENSG00000116641 DOCK7 310108 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0816 0.155 0.078 MAIT L2
ENSG00000125703 ATG4C 214362 sc-eQTL 2.11e-01 0.204 0.163 0.078 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -595227 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0965 0.164 0.078 MAIT L2
ENSG00000162607 USP1 562197 sc-eQTL 1.84e-01 -0.216 0.162 0.078 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -524878 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00835 0.169 0.078 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 -594917 sc-eQTL 7.55e-01 0.051 0.163 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 -369081 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0442 0.167 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000116641 DOCK7 310108 sc-eQTL 4.52e-01 -0.109 0.145 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000125703 ATG4C 214362 sc-eQTL 6.17e-01 -0.081 0.162 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -595227 sc-eQTL 4.06e-01 0.14 0.168 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000162607 USP1 562197 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00259 0.174 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -524878 sc-eQTL 5.64e-01 0.0959 0.166 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 -594917 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00429 0.13 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 -369081 sc-eQTL 9.73e-01 0.00557 0.164 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000116641 DOCK7 310108 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0583 0.143 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000125703 ATG4C 214362 sc-eQTL 2.12e-01 0.181 0.145 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -595227 sc-eQTL 1.00e+00 3.89e-05 0.165 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000162607 USP1 562197 sc-eQTL 1.35e-02 -0.394 0.158 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -524878 sc-eQTL 8.85e-01 0.0259 0.179 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 -594917 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0353 0.178 0.075 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 -369081 sc-eQTL 1.37e-01 -0.273 0.183 0.075 NK_HLA L2
ENSG00000116641 DOCK7 310108 sc-eQTL 2.93e-01 -0.148 0.14 0.075 NK_HLA L2
ENSG00000125703 ATG4C 214362 sc-eQTL 2.23e-01 0.199 0.163 0.075 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -595227 sc-eQTL 4.42e-01 0.132 0.172 0.075 NK_HLA L2
ENSG00000162607 USP1 562197 sc-eQTL 1.81e-01 0.241 0.179 0.075 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -524878 sc-eQTL 2.55e-01 0.186 0.163 0.075 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 -594917 sc-eQTL 7.45e-01 0.0465 0.143 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 -369081 sc-eQTL 8.26e-01 0.0356 0.161 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000116641 DOCK7 310108 sc-eQTL 1.01e-01 0.245 0.149 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000125703 ATG4C 214362 sc-eQTL 2.62e-01 -0.171 0.152 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -595227 sc-eQTL 4.37e-01 0.123 0.158 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000162607 USP1 562197 sc-eQTL 1.46e-01 -0.242 0.166 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -524878 sc-eQTL 5.49e-01 -0.101 0.169 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 -594917 sc-eQTL 3.71e-01 -0.195 0.217 0.089 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 -369081 sc-eQTL 4.49e-01 -0.174 0.229 0.089 PB L2
ENSG00000116641 DOCK7 310108 sc-eQTL 4.21e-01 0.197 0.244 0.089 PB L2
ENSG00000125703 ATG4C 214362 sc-eQTL 4.92e-01 0.147 0.213 0.089 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -595227 sc-eQTL 7.80e-01 0.0597 0.213 0.089 PB L2
ENSG00000162607 USP1 562197 sc-eQTL 9.94e-01 0.00158 0.212 0.089 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -524878 sc-eQTL 6.73e-01 0.0991 0.234 0.089 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 -594917 sc-eQTL 1.42e-01 0.222 0.151 0.08 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 -369081 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0459 0.154 0.08 Pro_T L2
ENSG00000116641 DOCK7 310108 sc-eQTL 2.33e-01 0.184 0.154 0.08 Pro_T L2
ENSG00000125703 ATG4C 214362 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0732 0.135 0.08 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -595227 sc-eQTL 9.04e-02 0.23 0.135 0.08 Pro_T L2
ENSG00000162607 USP1 562197 sc-eQTL 7.65e-01 0.0279 0.0934 0.08 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -524878 sc-eQTL 5.70e-01 0.0898 0.158 0.08 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 -594917 sc-eQTL 5.21e-01 -0.104 0.161 0.079 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 -369081 sc-eQTL 7.49e-01 0.0553 0.173 0.079 Treg L2
ENSG00000116641 DOCK7 310108 sc-eQTL 4.08e-01 0.131 0.158 0.079 Treg L2
ENSG00000125703 ATG4C 214362 sc-eQTL 4.83e-01 0.114 0.162 0.079 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -595227 sc-eQTL 1.24e-02 -0.421 0.167 0.079 Treg L2
ENSG00000162607 USP1 562197 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0352 0.164 0.079 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -524878 sc-eQTL 3.83e-01 -0.141 0.162 0.079 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 -594917 sc-eQTL 8.46e-01 0.031 0.16 0.083 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -369081 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0527 0.162 0.083 cDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 310108 sc-eQTL 8.10e-01 0.0383 0.159 0.083 cDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 214362 sc-eQTL 3.06e-02 -0.297 0.136 0.083 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -595227 sc-eQTL 6.31e-01 0.0842 0.175 0.083 cDC L2
ENSG00000162607 USP1 562197 sc-eQTL 4.31e-01 -0.123 0.155 0.083 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -524878 sc-eQTL 1.08e-01 -0.225 0.14 0.083 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 -594917 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0482 0.149 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 -369081 sc-eQTL 1.17e-01 0.233 0.148 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000116641 DOCK7 310108 sc-eQTL 7.07e-01 0.0593 0.157 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000125703 ATG4C 214362 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0298 0.111 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -595227 sc-eQTL 5.27e-01 0.0993 0.157 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000162607 USP1 562197 sc-eQTL 3.91e-01 0.119 0.138 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000240563 L1TD1 803645 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0701 0.139 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 -594917 sc-eQTL 8.97e-02 -0.28 0.164 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 -369081 sc-eQTL 9.96e-01 -0.00078 0.167 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000116641 DOCK7 310108 sc-eQTL 4.34e-01 0.122 0.155 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000125703 ATG4C 214362 sc-eQTL 9.19e-01 0.0136 0.134 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -595227 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0207 0.152 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000162607 USP1 562197 sc-eQTL 8.76e-01 0.0243 0.156 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000240563 L1TD1 803645 sc-eQTL 8.82e-01 0.0193 0.13 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 -594917 sc-eQTL 5.09e-01 0.125 0.188 0.073 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 -369081 sc-eQTL 2.22e-01 -0.245 0.2 0.073 gdT L2
ENSG00000116641 DOCK7 310108 sc-eQTL 1.28e-01 0.3 0.196 0.073 gdT L2
ENSG00000125703 ATG4C 214362 sc-eQTL 3.75e-01 -0.167 0.188 0.073 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -595227 sc-eQTL 3.01e-01 0.207 0.199 0.073 gdT L2
ENSG00000162607 USP1 562197 sc-eQTL 8.48e-02 0.325 0.187 0.073 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -524878 sc-eQTL 9.64e-01 0.00888 0.197 0.073 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 -594917 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0687 0.168 0.08 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -369081 sc-eQTL 7.44e-01 0.0511 0.157 0.08 intMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 310108 sc-eQTL 1.36e-03 -0.507 0.156 0.08 intMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 214362 sc-eQTL 3.49e-01 0.143 0.152 0.08 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -595227 sc-eQTL 3.50e-01 0.157 0.168 0.08 intMono L2
ENSG00000162607 USP1 562197 sc-eQTL 3.50e-01 -0.16 0.171 0.08 intMono L2
ENSG00000240563 L1TD1 803645 sc-eQTL 7.85e-01 0.0343 0.126 0.08 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -594917 sc-eQTL 8.52e-01 0.0279 0.149 0.084 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -369081 sc-eQTL 2.88e-01 0.174 0.164 0.084 ncMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 310108 sc-eQTL 2.88e-01 -0.172 0.161 0.084 ncMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 214362 sc-eQTL 1.10e-01 0.241 0.15 0.084 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -595227 sc-eQTL 5.52e-01 0.0939 0.158 0.084 ncMono L2
ENSG00000162607 USP1 562197 sc-eQTL 8.70e-01 0.0265 0.161 0.084 ncMono L2
ENSG00000240563 L1TD1 803645 sc-eQTL 3.03e-01 -0.118 0.114 0.084 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -594917 sc-eQTL 3.21e-01 -0.181 0.182 0.076 pDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -369081 sc-eQTL 5.48e-01 0.107 0.177 0.076 pDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 310108 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0745 0.181 0.076 pDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 214362 sc-eQTL 2.01e-01 -0.208 0.162 0.076 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -595227 sc-eQTL 4.87e-01 -0.127 0.182 0.076 pDC L2
ENSG00000162607 USP1 562197 sc-eQTL 2.06e-01 -0.235 0.185 0.076 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -524878 sc-eQTL 4.01e-01 -0.136 0.161 0.076 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -594917 sc-eQTL 2.81e-01 0.172 0.16 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -369081 sc-eQTL 5.17e-01 0.115 0.177 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 310108 sc-eQTL 3.85e-01 -0.134 0.153 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 214362 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0405 0.124 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -595227 sc-eQTL 2.42e-01 -0.191 0.163 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 562197 sc-eQTL 9.93e-01 -0.00131 0.158 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -524878 sc-eQTL 6.10e-01 0.0867 0.17 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -594917 sc-eQTL 7.01e-01 0.0638 0.166 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -369081 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0794 0.171 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 310108 sc-eQTL 6.50e-01 0.0725 0.16 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 214362 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0322 0.122 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -595227 sc-eQTL 5.98e-01 0.0909 0.172 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 562197 sc-eQTL 6.48e-01 0.0677 0.148 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -524878 sc-eQTL 7.45e-01 0.0563 0.173 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -594917 sc-eQTL 1.90e-01 -0.199 0.152 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -369081 sc-eQTL 3.26e-01 0.145 0.147 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 310108 sc-eQTL 6.46e-01 0.0682 0.148 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 214362 sc-eQTL 8.32e-01 0.0217 0.103 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -595227 sc-eQTL 6.15e-01 0.0764 0.152 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 562197 sc-eQTL 6.63e-01 0.0565 0.13 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000240563 L1TD1 803645 sc-eQTL 8.80e-01 0.0212 0.141 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -594917 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00509 0.146 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -369081 sc-eQTL 4.39e-01 0.129 0.166 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 310108 sc-eQTL 7.59e-03 -0.436 0.162 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 214362 sc-eQTL 7.79e-02 0.247 0.139 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -595227 sc-eQTL 2.61e-01 0.183 0.162 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 562197 sc-eQTL 4.56e-01 -0.114 0.153 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000240563 L1TD1 803645 sc-eQTL 3.36e-01 -0.1 0.104 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -594917 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0353 0.127 0.078 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -369081 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0183 0.152 0.078 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 310108 sc-eQTL 7.68e-01 0.0403 0.136 0.078 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 214362 sc-eQTL 5.99e-01 0.0716 0.136 0.078 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -595227 sc-eQTL 3.46e-01 0.152 0.161 0.078 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 562197 sc-eQTL 3.04e-02 -0.315 0.145 0.078 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -524878 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0876 0.178 0.078 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000116652 DLEU2L -548588 eQTL 0.0209 -0.108 0.0468 0.00165 0.0 0.0844
ENSG00000142856 ITGB3BP -595227 eQTL 0.0471 -0.105 0.053 0.0 0.0 0.0844

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina