logo

Genes within 1Mb (chr1:62989060:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -604351 sc-eQTL 3.47e-01 0.11 0.117 0.098 B L1
ENSG00000088035 ALG6 -378515 sc-eQTL 2.89e-02 0.264 0.12 0.098 B L1
ENSG00000116641 DOCK7 300674 sc-eQTL 2.49e-01 -0.14 0.121 0.098 B L1
ENSG00000125703 ATG4C 204928 sc-eQTL 9.43e-02 -0.141 0.0838 0.098 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -604661 sc-eQTL 4.53e-01 0.101 0.134 0.098 B L1
ENSG00000162607 USP1 552763 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0425 0.117 0.098 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -534312 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00724 0.138 0.098 B L1
ENSG00000079739 PGM1 -604351 sc-eQTL 7.78e-01 0.0281 0.0996 0.098 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 -378515 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0898 0.11 0.098 CD4T L1
ENSG00000116641 DOCK7 300674 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0213 0.111 0.098 CD4T L1
ENSG00000125703 ATG4C 204928 sc-eQTL 8.35e-01 0.0187 0.0899 0.098 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -604661 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0472 0.128 0.098 CD4T L1
ENSG00000162607 USP1 552763 sc-eQTL 7.06e-01 0.0329 0.0872 0.098 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -534312 sc-eQTL 8.60e-01 0.0202 0.115 0.098 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 -604351 sc-eQTL 8.38e-01 0.0225 0.11 0.098 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 -378515 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0564 0.121 0.098 CD8T L1
ENSG00000116641 DOCK7 300674 sc-eQTL 5.59e-01 0.0719 0.123 0.098 CD8T L1
ENSG00000125703 ATG4C 204928 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0818 0.117 0.098 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -604661 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0208 0.131 0.098 CD8T L1
ENSG00000162607 USP1 552763 sc-eQTL 4.85e-02 -0.2 0.101 0.098 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -534312 sc-eQTL 6.43e-01 0.0604 0.13 0.098 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 -604351 sc-eQTL 9.93e-01 0.00108 0.122 0.101 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 -378515 sc-eQTL 6.80e-01 0.0519 0.125 0.101 DC L1
ENSG00000116641 DOCK7 300674 sc-eQTL 8.49e-01 0.0245 0.129 0.101 DC L1
ENSG00000125703 ATG4C 204928 sc-eQTL 8.86e-01 0.0145 0.101 0.101 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -604661 sc-eQTL 8.62e-02 -0.241 0.14 0.101 DC L1
ENSG00000162607 USP1 552763 sc-eQTL 1.71e-01 -0.168 0.122 0.101 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -534312 sc-eQTL 2.87e-01 0.13 0.122 0.101 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 -604351 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0241 0.121 0.098 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 -378515 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0603 0.126 0.098 Mono L1
ENSG00000116641 DOCK7 300674 sc-eQTL 9.81e-01 -0.0029 0.122 0.098 Mono L1
ENSG00000125703 ATG4C 204928 sc-eQTL 4.64e-01 0.0602 0.0822 0.098 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -604661 sc-eQTL 7.82e-01 -0.036 0.13 0.098 Mono L1
ENSG00000162607 USP1 552763 sc-eQTL 4.23e-01 0.0856 0.107 0.098 Mono L1
ENSG00000240563 L1TD1 794211 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0379 0.0997 0.098 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 -604351 sc-eQTL 6.84e-01 0.0424 0.104 0.099 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 -378515 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0805 0.122 0.099 NK L1
ENSG00000116641 DOCK7 300674 sc-eQTL 4.05e-01 0.0837 0.1 0.099 NK L1
ENSG00000125703 ATG4C 204928 sc-eQTL 4.24e-02 -0.218 0.107 0.099 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -604661 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0411 0.134 0.099 NK L1
ENSG00000162607 USP1 552763 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0211 0.12 0.099 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -534312 sc-eQTL 8.86e-01 0.0209 0.146 0.099 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 -604351 sc-eQTL 7.08e-02 0.207 0.114 0.098 Other_T L1
ENSG00000088035 ALG6 -378515 sc-eQTL 4.73e-01 0.0828 0.115 0.098 Other_T L1
ENSG00000116641 DOCK7 300674 sc-eQTL 3.87e-01 0.102 0.117 0.098 Other_T L1
ENSG00000125703 ATG4C 204928 sc-eQTL 3.08e-01 -0.104 0.102 0.098 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -604661 sc-eQTL 9.99e-01 7.94e-05 0.0902 0.098 Other_T L1
ENSG00000162607 USP1 552763 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0566 0.0781 0.098 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -534312 sc-eQTL 7.51e-01 0.0443 0.139 0.098 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -604351 sc-eQTL 1.92e-01 0.191 0.146 0.11 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 -378515 sc-eQTL 1.45e-01 0.204 0.139 0.11 B_Activated L2
ENSG00000116641 DOCK7 300674 sc-eQTL 3.40e-01 -0.125 0.13 0.11 B_Activated L2
ENSG00000125703 ATG4C 204928 sc-eQTL 7.44e-01 0.0449 0.137 0.11 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -604661 sc-eQTL 8.83e-01 0.0198 0.134 0.11 B_Activated L2
ENSG00000162607 USP1 552763 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00426 0.146 0.11 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -534312 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0187 0.127 0.11 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 -604351 sc-eQTL 8.01e-01 0.0349 0.138 0.097 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 -378515 sc-eQTL 5.37e-01 0.0865 0.14 0.097 B_Intermediate L2
ENSG00000116641 DOCK7 300674 sc-eQTL 9.84e-01 0.00264 0.134 0.097 B_Intermediate L2
ENSG00000125703 ATG4C 204928 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0644 0.113 0.097 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -604661 sc-eQTL 6.95e-01 0.0529 0.135 0.097 B_Intermediate L2
ENSG00000162607 USP1 552763 sc-eQTL 6.94e-01 -0.053 0.135 0.097 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -534312 sc-eQTL 5.00e-01 0.0901 0.133 0.097 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 -604351 sc-eQTL 3.78e-01 0.12 0.136 0.097 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 -378515 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000721 0.138 0.097 B_Memory L2
ENSG00000116641 DOCK7 300674 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0315 0.13 0.097 B_Memory L2
ENSG00000125703 ATG4C 204928 sc-eQTL 9.10e-01 0.014 0.123 0.097 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -604661 sc-eQTL 8.22e-01 0.0317 0.141 0.097 B_Memory L2
ENSG00000162607 USP1 552763 sc-eQTL 1.01e-02 -0.364 0.14 0.097 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -534312 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0629 0.14 0.097 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 -604351 sc-eQTL 4.54e-01 0.104 0.138 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 -378515 sc-eQTL 1.18e-02 0.348 0.137 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000116641 DOCK7 300674 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0618 0.133 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000125703 ATG4C 204928 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0611 0.103 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -604661 sc-eQTL 1.81e-01 0.182 0.136 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000162607 USP1 552763 sc-eQTL 9.11e-01 0.0134 0.12 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -534312 sc-eQTL 5.14e-01 0.0949 0.145 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 -604351 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00327 0.136 0.097 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 -378515 sc-eQTL 7.03e-01 -0.054 0.142 0.097 B_Naive2 L2
ENSG00000116641 DOCK7 300674 sc-eQTL 1.14e-01 -0.215 0.135 0.097 B_Naive2 L2
ENSG00000125703 ATG4C 204928 sc-eQTL 2.72e-01 -0.144 0.131 0.097 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -604661 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0395 0.142 0.097 B_Naive2 L2
ENSG00000162607 USP1 552763 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00564 0.135 0.097 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -534312 sc-eQTL 2.54e-01 -0.161 0.141 0.097 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 -604351 sc-eQTL 4.57e-01 -0.102 0.136 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -378515 sc-eQTL 9.39e-01 -0.011 0.144 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 300674 sc-eQTL 1.90e-01 0.165 0.126 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 204928 sc-eQTL 4.98e-02 -0.255 0.129 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -604661 sc-eQTL 7.39e-01 0.0465 0.14 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 552763 sc-eQTL 6.38e-02 -0.245 0.132 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -534312 sc-eQTL 2.41e-01 -0.155 0.132 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -604351 sc-eQTL 6.77e-01 0.0465 0.111 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -378515 sc-eQTL 1.25e-01 -0.186 0.12 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 300674 sc-eQTL 6.12e-01 0.0603 0.119 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 204928 sc-eQTL 8.25e-01 0.0233 0.105 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -604661 sc-eQTL 5.44e-01 -0.078 0.128 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 552763 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0305 0.0981 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -534312 sc-eQTL 8.12e-01 0.0304 0.128 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -604351 sc-eQTL 6.07e-01 0.0598 0.116 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -378515 sc-eQTL 4.97e-01 0.0916 0.135 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 300674 sc-eQTL 1.43e-01 -0.174 0.119 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 204928 sc-eQTL 9.45e-01 0.008 0.116 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -604661 sc-eQTL 1.78e-01 -0.185 0.136 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 552763 sc-eQTL 5.13e-01 0.0735 0.112 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -534312 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0931 0.132 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -604351 sc-eQTL 6.80e-02 -0.244 0.133 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -378515 sc-eQTL 7.14e-02 0.243 0.134 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 300674 sc-eQTL 7.30e-01 0.0454 0.132 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 204928 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0628 0.128 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -604661 sc-eQTL 9.74e-02 0.218 0.131 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 552763 sc-eQTL 8.91e-01 0.0171 0.125 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -534312 sc-eQTL 4.74e-01 0.0979 0.136 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -604351 sc-eQTL 5.98e-01 0.0653 0.124 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -378515 sc-eQTL 5.17e-01 0.0854 0.131 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 300674 sc-eQTL 5.26e-01 0.0793 0.125 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 204928 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0658 0.133 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -604661 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0438 0.138 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 552763 sc-eQTL 3.98e-01 -0.105 0.124 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -534312 sc-eQTL 5.72e-01 0.0801 0.142 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -604351 sc-eQTL 9.51e-01 -0.0079 0.128 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -378515 sc-eQTL 1.31e-01 -0.2 0.132 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 300674 sc-eQTL 6.12e-01 0.0698 0.137 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 204928 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0865 0.132 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -604661 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0359 0.133 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 552763 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0953 0.113 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -534312 sc-eQTL 1.22e-01 0.194 0.125 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -604351 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0481 0.141 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -378515 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0406 0.142 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 300674 sc-eQTL 6.38e-01 0.0654 0.139 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 204928 sc-eQTL 1.98e-01 -0.183 0.141 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -604661 sc-eQTL 6.15e-01 0.0696 0.138 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 552763 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0658 0.133 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -534312 sc-eQTL 2.15e-01 -0.174 0.14 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -604351 sc-eQTL 7.55e-01 0.0446 0.143 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -378515 sc-eQTL 1.69e-01 0.197 0.142 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 300674 sc-eQTL 7.02e-01 0.0532 0.139 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 204928 sc-eQTL 4.42e-01 0.103 0.133 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -604661 sc-eQTL 9.78e-01 0.00393 0.144 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 552763 sc-eQTL 1.67e-01 -0.19 0.137 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -534312 sc-eQTL 8.48e-01 0.0269 0.14 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -604351 sc-eQTL 7.86e-02 0.23 0.13 0.1 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 -378515 sc-eQTL 9.48e-02 -0.216 0.129 0.1 MAIT L2
ENSG00000116641 DOCK7 300674 sc-eQTL 3.76e-01 0.11 0.124 0.1 MAIT L2
ENSG00000125703 ATG4C 204928 sc-eQTL 9.57e-02 -0.218 0.13 0.1 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -604661 sc-eQTL 7.10e-01 0.0488 0.131 0.1 MAIT L2
ENSG00000162607 USP1 552763 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0579 0.13 0.1 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -534312 sc-eQTL 7.24e-01 0.0477 0.135 0.1 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 -604351 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0816 0.134 0.098 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 -378515 sc-eQTL 3.82e-01 -0.12 0.138 0.098 NK_CD56bright L2
ENSG00000116641 DOCK7 300674 sc-eQTL 2.18e-01 0.147 0.119 0.098 NK_CD56bright L2
ENSG00000125703 ATG4C 204928 sc-eQTL 7.86e-01 0.0362 0.133 0.098 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -604661 sc-eQTL 1.21e-01 -0.215 0.138 0.098 NK_CD56bright L2
ENSG00000162607 USP1 552763 sc-eQTL 4.85e-01 0.1 0.143 0.098 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -534312 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0396 0.137 0.098 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 -604351 sc-eQTL 6.80e-01 0.0442 0.107 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 -378515 sc-eQTL 5.57e-01 0.0799 0.136 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000116641 DOCK7 300674 sc-eQTL 7.87e-01 -0.032 0.118 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000125703 ATG4C 204928 sc-eQTL 7.06e-03 -0.321 0.118 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -604661 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0198 0.137 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000162607 USP1 552763 sc-eQTL 5.24e-01 0.0845 0.132 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -534312 sc-eQTL 6.43e-01 0.0684 0.147 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 -604351 sc-eQTL 7.99e-01 0.0361 0.142 0.1 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 -378515 sc-eQTL 5.88e-01 0.0797 0.147 0.1 NK_HLA L2
ENSG00000116641 DOCK7 300674 sc-eQTL 9.63e-01 0.00522 0.112 0.1 NK_HLA L2
ENSG00000125703 ATG4C 204928 sc-eQTL 3.34e-01 0.126 0.13 0.1 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -604661 sc-eQTL 7.33e-01 0.0469 0.137 0.1 NK_HLA L2
ENSG00000162607 USP1 552763 sc-eQTL 1.53e-01 0.205 0.143 0.1 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -534312 sc-eQTL 5.13e-01 0.0855 0.131 0.1 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 -604351 sc-eQTL 6.29e-01 0.0565 0.117 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 -378515 sc-eQTL 1.18e-01 -0.206 0.131 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000116641 DOCK7 300674 sc-eQTL 3.32e-01 0.119 0.122 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000125703 ATG4C 204928 sc-eQTL 2.09e-02 -0.287 0.124 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -604661 sc-eQTL 9.33e-01 -0.011 0.13 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000162607 USP1 552763 sc-eQTL 1.82e-02 -0.32 0.134 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -534312 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0827 0.138 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 -604351 sc-eQTL 4.28e-01 0.139 0.174 0.096 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 -378515 sc-eQTL 9.19e-01 0.0186 0.183 0.096 PB L2
ENSG00000116641 DOCK7 300674 sc-eQTL 3.93e-01 -0.167 0.195 0.096 PB L2
ENSG00000125703 ATG4C 204928 sc-eQTL 2.95e-02 -0.369 0.167 0.096 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -604661 sc-eQTL 9.56e-02 -0.283 0.169 0.096 PB L2
ENSG00000162607 USP1 552763 sc-eQTL 7.84e-01 0.0466 0.17 0.096 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -534312 sc-eQTL 5.30e-01 0.118 0.187 0.096 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 -604351 sc-eQTL 1.52e-01 0.18 0.125 0.1 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 -378515 sc-eQTL 9.34e-02 0.214 0.127 0.1 Pro_T L2
ENSG00000116641 DOCK7 300674 sc-eQTL 6.65e-01 0.0557 0.128 0.1 Pro_T L2
ENSG00000125703 ATG4C 204928 sc-eQTL 7.40e-01 0.0374 0.112 0.1 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -604661 sc-eQTL 4.84e-01 0.0789 0.113 0.1 Pro_T L2
ENSG00000162607 USP1 552763 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0212 0.0775 0.1 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -534312 sc-eQTL 5.38e-01 0.0807 0.131 0.1 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 -604351 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0531 0.132 0.098 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 -378515 sc-eQTL 4.19e-01 -0.114 0.141 0.098 Treg L2
ENSG00000116641 DOCK7 300674 sc-eQTL 4.38e-01 -0.1 0.129 0.098 Treg L2
ENSG00000125703 ATG4C 204928 sc-eQTL 5.57e-01 0.0779 0.132 0.098 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -604661 sc-eQTL 7.74e-01 0.0398 0.138 0.098 Treg L2
ENSG00000162607 USP1 552763 sc-eQTL 9.77e-01 0.00391 0.134 0.098 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -534312 sc-eQTL 5.30e-01 0.0832 0.132 0.098 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 -604351 sc-eQTL 9.38e-01 -0.0105 0.134 0.098 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -378515 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0202 0.136 0.098 cDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 300674 sc-eQTL 4.77e-01 0.0951 0.133 0.098 cDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 204928 sc-eQTL 9.23e-01 0.0112 0.116 0.098 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -604661 sc-eQTL 1.23e-01 -0.226 0.146 0.098 cDC L2
ENSG00000162607 USP1 552763 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0529 0.131 0.098 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -534312 sc-eQTL 3.62e-01 -0.108 0.118 0.098 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 -604351 sc-eQTL 2.98e-01 0.13 0.125 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 -378515 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0717 0.125 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000116641 DOCK7 300674 sc-eQTL 5.64e-01 0.0762 0.132 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000125703 ATG4C 204928 sc-eQTL 5.86e-01 0.0506 0.0927 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -604661 sc-eQTL 9.09e-01 0.015 0.131 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000162607 USP1 552763 sc-eQTL 6.47e-01 0.0532 0.116 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000240563 L1TD1 794211 sc-eQTL 7.04e-01 0.0442 0.116 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 -604351 sc-eQTL 4.68e-01 -0.101 0.139 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 -378515 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0513 0.141 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000116641 DOCK7 300674 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0712 0.131 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000125703 ATG4C 204928 sc-eQTL 7.29e-01 0.0393 0.113 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -604661 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0197 0.128 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000162607 USP1 552763 sc-eQTL 1.94e-01 0.171 0.131 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000240563 L1TD1 794211 sc-eQTL 4.39e-01 -0.0848 0.109 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 -604351 sc-eQTL 7.69e-01 -0.043 0.146 0.091 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 -378515 sc-eQTL 8.50e-01 0.0295 0.156 0.091 gdT L2
ENSG00000116641 DOCK7 300674 sc-eQTL 1.29e-02 0.377 0.15 0.091 gdT L2
ENSG00000125703 ATG4C 204928 sc-eQTL 4.02e-01 -0.123 0.146 0.091 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -604661 sc-eQTL 4.25e-01 -0.124 0.155 0.091 gdT L2
ENSG00000162607 USP1 552763 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0461 0.147 0.091 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -534312 sc-eQTL 3.99e-01 -0.129 0.153 0.091 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 -604351 sc-eQTL 5.72e-01 0.0787 0.139 0.098 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -378515 sc-eQTL 8.50e-02 -0.223 0.129 0.098 intMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 300674 sc-eQTL 4.35e-01 -0.104 0.132 0.098 intMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 204928 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00593 0.126 0.098 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -604661 sc-eQTL 9.98e-01 0.000398 0.139 0.098 intMono L2
ENSG00000162607 USP1 552763 sc-eQTL 5.61e-01 0.0823 0.142 0.098 intMono L2
ENSG00000240563 L1TD1 794211 sc-eQTL 2.25e-01 0.126 0.104 0.098 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -604351 sc-eQTL 1.78e-01 -0.165 0.122 0.1 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -378515 sc-eQTL 7.50e-01 0.0429 0.134 0.1 ncMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 300674 sc-eQTL 1.66e-01 0.183 0.132 0.1 ncMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 204928 sc-eQTL 1.97e-01 -0.159 0.123 0.1 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -604661 sc-eQTL 9.61e-01 0.00639 0.129 0.1 ncMono L2
ENSG00000162607 USP1 552763 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0712 0.132 0.1 ncMono L2
ENSG00000240563 L1TD1 794211 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0636 0.0936 0.1 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -604351 sc-eQTL 5.35e-01 0.0908 0.146 0.099 pDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -378515 sc-eQTL 5.59e-01 0.0834 0.142 0.099 pDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 300674 sc-eQTL 2.42e-01 -0.17 0.145 0.099 pDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 204928 sc-eQTL 4.84e-01 0.0916 0.13 0.099 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -604661 sc-eQTL 7.67e-01 0.0435 0.147 0.099 pDC L2
ENSG00000162607 USP1 552763 sc-eQTL 3.83e-01 -0.13 0.149 0.099 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -534312 sc-eQTL 3.69e-02 0.269 0.128 0.099 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -604351 sc-eQTL 2.72e-01 0.141 0.128 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -378515 sc-eQTL 2.79e-01 0.154 0.141 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 300674 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0458 0.123 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 204928 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0572 0.0995 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -604661 sc-eQTL 4.36e-01 0.102 0.131 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 552763 sc-eQTL 1.82e-01 -0.17 0.126 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -534312 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0701 0.136 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -604351 sc-eQTL 3.10e-01 0.137 0.135 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -378515 sc-eQTL 7.29e-02 0.249 0.138 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 300674 sc-eQTL 2.95e-01 -0.136 0.129 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 204928 sc-eQTL 1.14e-01 -0.156 0.0985 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -604661 sc-eQTL 1.67e-01 0.193 0.139 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 552763 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0391 0.12 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -534312 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0233 0.141 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -604351 sc-eQTL 8.77e-01 0.0198 0.128 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -378515 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0304 0.124 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 300674 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00832 0.125 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 204928 sc-eQTL 5.14e-01 0.0563 0.0862 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -604661 sc-eQTL 8.57e-01 -0.023 0.128 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 552763 sc-eQTL 1.01e-01 0.178 0.108 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000240563 L1TD1 794211 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0348 0.118 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -604351 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0592 0.12 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -378515 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0499 0.137 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 300674 sc-eQTL 5.72e-01 0.0765 0.135 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 204928 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0703 0.115 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -604661 sc-eQTL 9.67e-01 0.00553 0.134 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 552763 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0566 0.126 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000240563 L1TD1 794211 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0247 0.0858 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -604351 sc-eQTL 7.15e-01 0.0383 0.105 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -378515 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0405 0.126 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 300674 sc-eQTL 8.42e-01 0.0226 0.113 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 204928 sc-eQTL 3.24e-02 -0.24 0.111 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -604661 sc-eQTL 8.46e-01 0.0259 0.133 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 552763 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0592 0.121 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -534312 sc-eQTL 7.66e-01 0.0439 0.147 0.099 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000125703 ATG4C 204928 eQTL 0.0139 -0.0645 0.0262 0.0 0.0 0.112

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000125703 ATG4C 204928 3.31e-06 3.08e-06 6.05e-07 1.97e-06 8.3e-07 8.37e-07 2.24e-06 7.94e-07 2.25e-06 1.4e-06 2.72e-06 1.77e-06 3.83e-06 1.4e-06 9.33e-07 2.1e-06 1.57e-06 2.15e-06 1.6e-06 1.28e-06 1.39e-06 3.15e-06 2.68e-06 1.56e-06 4.08e-06 1.18e-06 1.57e-06 1.81e-06 2.54e-06 2.55e-06 2.01e-06 6.26e-07 6.21e-07 1.32e-06 1.54e-06 9.36e-07 8.9e-07 4.68e-07 1.2e-06 4.17e-07 2.26e-07 3.37e-06 3.98e-07 1.8e-07 3.51e-07 3.61e-07 8.3e-07 2.4e-07 1.59e-07
ENSG00000203965 \N -534312 8.21e-07 4.78e-07 1.31e-07 3.61e-07 1.09e-07 2.09e-07 5.13e-07 1.03e-07 3.82e-07 2.43e-07 5.93e-07 3.62e-07 6.98e-07 1.49e-07 2.07e-07 2.23e-07 2.53e-07 3.79e-07 2.25e-07 1.73e-07 2.05e-07 3.34e-07 3.08e-07 1.73e-07 6.65e-07 2.32e-07 3.16e-07 2.7e-07 2.84e-07 5.56e-07 2.54e-07 4.44e-08 5.39e-08 1.5e-07 3.05e-07 1.49e-07 1.01e-07 1.14e-07 4.55e-08 5.25e-08 5.38e-08 4.02e-07 6.23e-08 1.21e-08 1.96e-07 1.48e-08 1.3e-07 5.93e-08 6.26e-08