logo

Genes within 1Mb (chr1:62988926:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -604485 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0184 0.0814 0.276 B L1
ENSG00000088035 ALG6 -378649 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0186 0.0843 0.276 B L1
ENSG00000116641 DOCK7 300540 sc-eQTL 2.73e-01 -0.0925 0.0841 0.276 B L1
ENSG00000125703 ATG4C 204794 sc-eQTL 3.06e-01 0.06 0.0585 0.276 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -604795 sc-eQTL 1.79e-01 0.125 0.0929 0.276 B L1
ENSG00000162607 USP1 552629 sc-eQTL 6.31e-01 0.039 0.0809 0.276 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -534446 sc-eQTL 8.07e-01 0.0233 0.0955 0.276 B L1
ENSG00000079739 PGM1 -604485 sc-eQTL 5.35e-02 -0.135 0.0693 0.276 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 -378649 sc-eQTL 1.66e-01 0.107 0.0768 0.276 CD4T L1
ENSG00000116641 DOCK7 300540 sc-eQTL 2.06e-01 -0.0987 0.0778 0.276 CD4T L1
ENSG00000125703 ATG4C 204794 sc-eQTL 2.91e-01 -0.0667 0.0629 0.276 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -604795 sc-eQTL 3.38e-01 0.0857 0.0894 0.276 CD4T L1
ENSG00000162607 USP1 552629 sc-eQTL 2.27e-01 -0.074 0.061 0.276 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -534446 sc-eQTL 6.46e-01 0.037 0.0804 0.276 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 -604485 sc-eQTL 5.36e-01 0.0485 0.0783 0.276 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 -378649 sc-eQTL 2.64e-01 0.0964 0.0861 0.276 CD8T L1
ENSG00000116641 DOCK7 300540 sc-eQTL 4.00e-01 -0.0736 0.0874 0.276 CD8T L1
ENSG00000125703 ATG4C 204794 sc-eQTL 8.55e-01 0.0152 0.0831 0.276 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -604795 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0734 0.0928 0.276 CD8T L1
ENSG00000162607 USP1 552629 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0509 0.0723 0.276 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -534446 sc-eQTL 2.43e-01 0.108 0.0924 0.276 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 -604485 sc-eQTL 7.38e-01 0.0289 0.0861 0.279 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 -378649 sc-eQTL 3.48e-01 -0.0835 0.0887 0.279 DC L1
ENSG00000116641 DOCK7 300540 sc-eQTL 5.85e-03 -0.249 0.0894 0.279 DC L1
ENSG00000125703 ATG4C 204794 sc-eQTL 3.51e-02 -0.15 0.0705 0.279 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -604795 sc-eQTL 4.70e-01 0.072 0.0995 0.279 DC L1
ENSG00000162607 USP1 552629 sc-eQTL 5.20e-01 0.056 0.0869 0.279 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -534446 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0281 0.0867 0.279 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 -604485 sc-eQTL 2.10e-02 -0.193 0.083 0.276 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 -378649 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00634 0.0877 0.276 Mono L1
ENSG00000116641 DOCK7 300540 sc-eQTL 7.43e-01 0.0278 0.0848 0.276 Mono L1
ENSG00000125703 ATG4C 204794 sc-eQTL 2.78e-02 0.126 0.0567 0.276 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -604795 sc-eQTL 3.39e-02 0.191 0.0896 0.276 Mono L1
ENSG00000162607 USP1 552629 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0198 0.0744 0.276 Mono L1
ENSG00000240563 L1TD1 794077 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0271 0.0694 0.276 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 -604485 sc-eQTL 8.47e-01 0.0138 0.0715 0.277 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 -378649 sc-eQTL 9.84e-01 0.00165 0.0838 0.277 NK L1
ENSG00000116641 DOCK7 300540 sc-eQTL 7.63e-01 0.0208 0.069 0.277 NK L1
ENSG00000125703 ATG4C 204794 sc-eQTL 7.57e-02 0.131 0.0736 0.277 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -604795 sc-eQTL 7.52e-01 0.0291 0.0921 0.277 NK L1
ENSG00000162607 USP1 552629 sc-eQTL 2.49e-01 0.095 0.0821 0.277 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -534446 sc-eQTL 1.75e-01 0.136 0.0996 0.277 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 -604485 sc-eQTL 9.16e-01 -0.00864 0.0817 0.276 Other_T L1
ENSG00000088035 ALG6 -378649 sc-eQTL 1.43e-01 -0.12 0.0816 0.276 Other_T L1
ENSG00000116641 DOCK7 300540 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0343 0.0837 0.276 Other_T L1
ENSG00000125703 ATG4C 204794 sc-eQTL 9.01e-02 0.123 0.072 0.276 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -604795 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0106 0.0643 0.276 Other_T L1
ENSG00000162607 USP1 552629 sc-eQTL 4.25e-01 0.0445 0.0557 0.276 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -534446 sc-eQTL 3.18e-01 0.0992 0.099 0.276 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -604485 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0146 0.114 0.273 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 -378649 sc-eQTL 6.96e-01 0.0426 0.109 0.273 B_Activated L2
ENSG00000116641 DOCK7 300540 sc-eQTL 3.36e-01 0.0974 0.101 0.273 B_Activated L2
ENSG00000125703 ATG4C 204794 sc-eQTL 7.74e-01 0.0306 0.106 0.273 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -604795 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0848 0.104 0.273 B_Activated L2
ENSG00000162607 USP1 552629 sc-eQTL 3.46e-01 -0.106 0.113 0.273 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -534446 sc-eQTL 9.84e-02 -0.162 0.0977 0.273 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 -604485 sc-eQTL 1.56e-01 -0.138 0.0969 0.277 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 -378649 sc-eQTL 1.85e-01 0.131 0.0985 0.277 B_Intermediate L2
ENSG00000116641 DOCK7 300540 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00678 0.0945 0.277 B_Intermediate L2
ENSG00000125703 ATG4C 204794 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0523 0.0799 0.277 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -604795 sc-eQTL 1.14e-01 0.15 0.0947 0.277 B_Intermediate L2
ENSG00000162607 USP1 552629 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0178 0.0951 0.277 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -534446 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0141 0.0944 0.277 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 -604485 sc-eQTL 8.79e-01 0.0146 0.0961 0.278 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 -378649 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0269 0.0977 0.278 B_Memory L2
ENSG00000116641 DOCK7 300540 sc-eQTL 7.94e-01 -0.024 0.0917 0.278 B_Memory L2
ENSG00000125703 ATG4C 204794 sc-eQTL 1.97e-01 -0.112 0.0868 0.278 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -604795 sc-eQTL 5.09e-01 0.0659 0.0996 0.278 B_Memory L2
ENSG00000162607 USP1 552629 sc-eQTL 4.02e-01 0.0842 0.1 0.278 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -534446 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00314 0.099 0.278 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 -604485 sc-eQTL 6.69e-01 0.0417 0.0973 0.276 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 -378649 sc-eQTL 3.96e-01 -0.083 0.0975 0.276 B_Naive1 L2
ENSG00000116641 DOCK7 300540 sc-eQTL 3.79e-02 -0.194 0.0926 0.276 B_Naive1 L2
ENSG00000125703 ATG4C 204794 sc-eQTL 2.92e-01 0.076 0.0719 0.276 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -604795 sc-eQTL 2.41e-01 0.112 0.0953 0.276 B_Naive1 L2
ENSG00000162607 USP1 552629 sc-eQTL 6.95e-01 0.033 0.0841 0.276 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -534446 sc-eQTL 5.06e-01 0.068 0.102 0.276 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 -604485 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0118 0.0953 0.277 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 -378649 sc-eQTL 6.88e-01 0.04 0.0993 0.277 B_Naive2 L2
ENSG00000116641 DOCK7 300540 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0394 0.0955 0.277 B_Naive2 L2
ENSG00000125703 ATG4C 204794 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00445 0.0919 0.277 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -604795 sc-eQTL 5.72e-01 0.0563 0.0996 0.277 B_Naive2 L2
ENSG00000162607 USP1 552629 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0319 0.0949 0.277 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -534446 sc-eQTL 8.55e-01 0.0182 0.0992 0.277 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 -604485 sc-eQTL 2.77e-01 0.111 0.101 0.27 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -378649 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0166 0.108 0.27 CD4_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 300540 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0441 0.0939 0.27 CD4_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 204794 sc-eQTL 2.84e-02 0.212 0.0961 0.27 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -604795 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0106 0.104 0.27 CD4_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 552629 sc-eQTL 7.81e-01 0.0275 0.099 0.27 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -534446 sc-eQTL 7.62e-02 -0.175 0.098 0.27 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -604485 sc-eQTL 2.95e-01 -0.0823 0.0785 0.276 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -378649 sc-eQTL 9.70e-02 0.142 0.0849 0.276 CD4_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 300540 sc-eQTL 3.31e-01 -0.0816 0.0838 0.276 CD4_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 204794 sc-eQTL 3.57e-01 -0.0685 0.0741 0.276 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -604795 sc-eQTL 9.58e-02 0.151 0.0902 0.276 CD4_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 552629 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0487 0.0693 0.276 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -534446 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0337 0.0901 0.276 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -604485 sc-eQTL 5.48e-02 -0.156 0.0809 0.276 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -378649 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0636 0.0947 0.276 CD4_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 300540 sc-eQTL 3.79e-01 -0.0739 0.0839 0.276 CD4_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 204794 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0302 0.0818 0.276 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -604795 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0149 0.0964 0.276 CD4_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 552629 sc-eQTL 1.32e-01 -0.119 0.0786 0.276 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -534446 sc-eQTL 6.46e-01 0.043 0.0933 0.276 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -604485 sc-eQTL 7.02e-01 0.0365 0.0954 0.276 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -378649 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0197 0.0959 0.276 CD4_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 300540 sc-eQTL 3.42e-01 -0.0889 0.0933 0.276 CD4_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 204794 sc-eQTL 1.74e-01 -0.123 0.0904 0.276 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -604795 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0735 0.0936 0.276 CD4_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 552629 sc-eQTL 9.97e-03 -0.227 0.0874 0.276 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -534446 sc-eQTL 5.91e-01 0.0522 0.097 0.276 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -604485 sc-eQTL 8.05e-01 -0.022 0.0889 0.276 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -378649 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0204 0.0945 0.276 CD8_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 300540 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0143 0.0897 0.276 CD8_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 204794 sc-eQTL 4.67e-01 0.0695 0.0954 0.276 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -604795 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0136 0.0993 0.276 CD8_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 552629 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0406 0.0889 0.276 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -534446 sc-eQTL 2.86e-01 0.108 0.101 0.276 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -604485 sc-eQTL 6.08e-01 0.0458 0.0892 0.276 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -378649 sc-eQTL 1.92e-02 0.215 0.0912 0.276 CD8_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 300540 sc-eQTL 2.05e-01 -0.121 0.0951 0.276 CD8_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 204794 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0268 0.0916 0.276 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -604795 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0642 0.0927 0.276 CD8_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 552629 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0332 0.0784 0.276 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -534446 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0139 0.0875 0.276 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -604485 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0577 0.1 0.273 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -378649 sc-eQTL 1.63e-01 0.142 0.101 0.273 CD8_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 300540 sc-eQTL 3.64e-02 -0.207 0.0982 0.273 CD8_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 204794 sc-eQTL 1.38e-01 -0.15 0.101 0.273 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -604795 sc-eQTL 3.34e-01 0.0954 0.0985 0.273 CD8_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 552629 sc-eQTL 3.32e-01 -0.0921 0.0948 0.273 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -534446 sc-eQTL 1.66e-01 0.139 0.1 0.273 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -604485 sc-eQTL 6.37e-01 0.0481 0.102 0.274 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -378649 sc-eQTL 7.65e-01 0.0306 0.102 0.274 CD8_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 300540 sc-eQTL 8.46e-01 0.0193 0.0992 0.274 CD8_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 204794 sc-eQTL 3.00e-01 -0.0988 0.0951 0.274 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -604795 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0327 0.103 0.274 CD8_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 552629 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0321 0.0985 0.274 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -534446 sc-eQTL 9.31e-01 0.00864 0.1 0.274 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -604485 sc-eQTL 3.79e-01 -0.0827 0.0939 0.277 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 -378649 sc-eQTL 1.89e-01 -0.122 0.0928 0.277 MAIT L2
ENSG00000116641 DOCK7 300540 sc-eQTL 9.46e-01 0.00605 0.0893 0.277 MAIT L2
ENSG00000125703 ATG4C 204794 sc-eQTL 3.60e-01 0.0862 0.0939 0.277 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -604795 sc-eQTL 9.42e-01 0.00689 0.0943 0.277 MAIT L2
ENSG00000162607 USP1 552629 sc-eQTL 7.38e-01 0.0314 0.0935 0.277 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -534446 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0276 0.0971 0.277 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 -604485 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0359 0.0962 0.273 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 -378649 sc-eQTL 8.07e-01 0.0242 0.0986 0.273 NK_CD56bright L2
ENSG00000116641 DOCK7 300540 sc-eQTL 9.44e-01 0.00597 0.0855 0.273 NK_CD56bright L2
ENSG00000125703 ATG4C 204794 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00599 0.0955 0.273 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -604795 sc-eQTL 2.25e-02 0.226 0.0982 0.273 NK_CD56bright L2
ENSG00000162607 USP1 552629 sc-eQTL 3.80e-01 0.0901 0.102 0.273 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -534446 sc-eQTL 1.86e-01 0.13 0.0977 0.273 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 -604485 sc-eQTL 5.32e-01 0.0466 0.0743 0.276 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 -378649 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0597 0.0943 0.276 NK_CD56dim L2
ENSG00000116641 DOCK7 300540 sc-eQTL 8.44e-01 0.0162 0.0821 0.276 NK_CD56dim L2
ENSG00000125703 ATG4C 204794 sc-eQTL 3.97e-01 0.0707 0.0833 0.276 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -604795 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0463 0.0949 0.276 NK_CD56dim L2
ENSG00000162607 USP1 552629 sc-eQTL 5.01e-01 0.062 0.092 0.276 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -534446 sc-eQTL 8.69e-01 0.0169 0.103 0.276 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 -604485 sc-eQTL 7.14e-01 0.0383 0.105 0.274 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 -378649 sc-eQTL 4.86e-01 0.0755 0.108 0.274 NK_HLA L2
ENSG00000116641 DOCK7 300540 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0655 0.0828 0.274 NK_HLA L2
ENSG00000125703 ATG4C 204794 sc-eQTL 4.64e-01 0.0707 0.0963 0.274 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -604795 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0591 0.101 0.274 NK_HLA L2
ENSG00000162607 USP1 552629 sc-eQTL 9.06e-01 0.0125 0.106 0.274 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -534446 sc-eQTL 8.64e-01 0.0165 0.0964 0.274 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 -604485 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0218 0.082 0.276 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 -378649 sc-eQTL 5.41e-01 0.0567 0.0926 0.276 NK_cytokine L2
ENSG00000116641 DOCK7 300540 sc-eQTL 7.66e-01 0.0256 0.0858 0.276 NK_cytokine L2
ENSG00000125703 ATG4C 204794 sc-eQTL 5.52e-02 0.168 0.087 0.276 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -604795 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0131 0.0909 0.276 NK_cytokine L2
ENSG00000162607 USP1 552629 sc-eQTL 2.10e-01 0.12 0.0953 0.276 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -534446 sc-eQTL 2.50e-01 0.111 0.0966 0.276 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 -604485 sc-eQTL 2.04e-01 -0.154 0.12 0.293 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 -378649 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0971 0.127 0.293 PB L2
ENSG00000116641 DOCK7 300540 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0278 0.136 0.293 PB L2
ENSG00000125703 ATG4C 204794 sc-eQTL 6.01e-01 0.0622 0.119 0.293 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -604795 sc-eQTL 7.11e-01 0.0441 0.119 0.293 PB L2
ENSG00000162607 USP1 552629 sc-eQTL 8.45e-01 0.0231 0.118 0.293 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -534446 sc-eQTL 6.49e-01 0.0593 0.13 0.293 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 -604485 sc-eQTL 4.35e-01 0.0705 0.0902 0.272 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 -378649 sc-eQTL 3.15e-02 -0.197 0.0909 0.272 Pro_T L2
ENSG00000116641 DOCK7 300540 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0105 0.0922 0.272 Pro_T L2
ENSG00000125703 ATG4C 204794 sc-eQTL 7.63e-02 0.143 0.0801 0.272 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -604795 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0224 0.081 0.272 Pro_T L2
ENSG00000162607 USP1 552629 sc-eQTL 2.44e-01 -0.0648 0.0555 0.272 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -534446 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0151 0.0941 0.272 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 -604485 sc-eQTL 4.07e-01 -0.0772 0.0929 0.276 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 -378649 sc-eQTL 2.37e-01 0.118 0.0991 0.276 Treg L2
ENSG00000116641 DOCK7 300540 sc-eQTL 1.56e-01 -0.129 0.0909 0.276 Treg L2
ENSG00000125703 ATG4C 204794 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0717 0.0932 0.276 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -604795 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0373 0.0976 0.276 Treg L2
ENSG00000162607 USP1 552629 sc-eQTL 2.56e-01 0.107 0.0942 0.276 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -534446 sc-eQTL 6.27e-02 0.173 0.0926 0.276 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 -604485 sc-eQTL 5.92e-01 0.0506 0.0943 0.273 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -378649 sc-eQTL 2.81e-01 -0.103 0.0954 0.273 cDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 300540 sc-eQTL 2.20e-03 -0.284 0.0916 0.273 cDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 204794 sc-eQTL 8.27e-02 -0.141 0.0809 0.273 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -604795 sc-eQTL 9.78e-01 0.00283 0.103 0.273 cDC L2
ENSG00000162607 USP1 552629 sc-eQTL 5.61e-01 0.0536 0.092 0.273 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -534446 sc-eQTL 5.92e-01 0.0445 0.083 0.273 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 -604485 sc-eQTL 2.93e-02 -0.19 0.0868 0.276 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 -378649 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0112 0.0878 0.276 cMono_IL1B L2
ENSG00000116641 DOCK7 300540 sc-eQTL 9.63e-01 0.00435 0.0926 0.276 cMono_IL1B L2
ENSG00000125703 ATG4C 204794 sc-eQTL 5.98e-02 0.122 0.0646 0.276 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -604795 sc-eQTL 3.69e-02 0.192 0.0913 0.276 cMono_IL1B L2
ENSG00000162607 USP1 552629 sc-eQTL 6.31e-01 0.0391 0.0813 0.276 cMono_IL1B L2
ENSG00000240563 L1TD1 794077 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0119 0.0817 0.276 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 -604485 sc-eQTL 6.82e-02 -0.177 0.0965 0.276 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 -378649 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00401 0.0986 0.276 cMono_S100A L2
ENSG00000116641 DOCK7 300540 sc-eQTL 9.65e-01 0.00396 0.0914 0.276 cMono_S100A L2
ENSG00000125703 ATG4C 204794 sc-eQTL 5.14e-01 0.0517 0.0791 0.276 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -604795 sc-eQTL 3.00e-01 0.0926 0.0891 0.276 cMono_S100A L2
ENSG00000162607 USP1 552629 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0549 0.0918 0.276 cMono_S100A L2
ENSG00000240563 L1TD1 794077 sc-eQTL 3.14e-01 0.077 0.0763 0.276 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 -604485 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0537 0.11 0.27 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 -378649 sc-eQTL 3.28e-01 0.115 0.117 0.27 gdT L2
ENSG00000116641 DOCK7 300540 sc-eQTL 6.79e-02 -0.21 0.114 0.27 gdT L2
ENSG00000125703 ATG4C 204794 sc-eQTL 2.29e-01 -0.133 0.11 0.27 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -604795 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0692 0.117 0.27 gdT L2
ENSG00000162607 USP1 552629 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0699 0.111 0.27 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -534446 sc-eQTL 5.54e-03 0.316 0.112 0.27 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 -604485 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0531 0.0979 0.276 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -378649 sc-eQTL 1.29e-01 0.138 0.0907 0.276 intMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 300540 sc-eQTL 7.36e-01 0.0315 0.0932 0.276 intMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 204794 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00409 0.089 0.276 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -604795 sc-eQTL 3.56e-01 0.0905 0.0978 0.276 intMono L2
ENSG00000162607 USP1 552629 sc-eQTL 6.18e-01 0.0498 0.0996 0.276 intMono L2
ENSG00000240563 L1TD1 794077 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00401 0.0733 0.276 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -604485 sc-eQTL 4.91e-01 0.0613 0.0889 0.269 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -378649 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0264 0.0977 0.269 ncMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 300540 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0118 0.0962 0.269 ncMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 204794 sc-eQTL 2.47e-01 0.104 0.0896 0.269 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -604795 sc-eQTL 5.26e-01 0.0596 0.0939 0.269 ncMono L2
ENSG00000162607 USP1 552629 sc-eQTL 1.99e-01 0.123 0.0956 0.269 ncMono L2
ENSG00000240563 L1TD1 794077 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0384 0.0681 0.269 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -604485 sc-eQTL 2.88e-01 -0.113 0.106 0.274 pDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -378649 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0405 0.104 0.274 pDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 300540 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0325 0.106 0.274 pDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 204794 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0382 0.0951 0.274 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -604795 sc-eQTL 5.82e-01 0.0588 0.107 0.274 pDC L2
ENSG00000162607 USP1 552629 sc-eQTL 4.17e-01 0.0884 0.109 0.274 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -534446 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00553 0.0945 0.274 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -604485 sc-eQTL 2.62e-01 -0.102 0.0905 0.276 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -378649 sc-eQTL 4.72e-01 0.0722 0.1 0.276 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 300540 sc-eQTL 5.98e-01 -0.046 0.0871 0.276 B_Memory LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 204794 sc-eQTL 1.83e-01 -0.0936 0.0701 0.276 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -604795 sc-eQTL 1.33e-01 0.139 0.092 0.276 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 552629 sc-eQTL 9.32e-01 0.00764 0.0898 0.276 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -534446 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0777 0.0963 0.276 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -604485 sc-eQTL 9.53e-01 0.00557 0.0944 0.276 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -378649 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0422 0.0972 0.276 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 300540 sc-eQTL 8.18e-02 -0.158 0.0901 0.276 B_Naive LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 204794 sc-eQTL 4.28e-01 0.055 0.0692 0.276 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -604795 sc-eQTL 3.37e-01 0.0941 0.0977 0.276 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 552629 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0132 0.0841 0.276 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -534446 sc-eQTL 4.36e-01 0.0768 0.0983 0.276 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -604485 sc-eQTL 8.90e-03 -0.233 0.0882 0.276 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -378649 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00378 0.0868 0.276 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 300540 sc-eQTL 9.31e-01 0.00753 0.0874 0.276 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 204794 sc-eQTL 4.75e-02 0.119 0.0599 0.276 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -604795 sc-eQTL 2.67e-02 0.197 0.0884 0.276 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 552629 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0187 0.0764 0.276 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000240563 L1TD1 794077 sc-eQTL 3.68e-01 0.0746 0.0827 0.276 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -604485 sc-eQTL 9.53e-01 0.00506 0.0861 0.276 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -378649 sc-eQTL 7.04e-01 0.0371 0.0977 0.276 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 300540 sc-eQTL 5.77e-01 0.0539 0.0966 0.276 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 204794 sc-eQTL 6.49e-01 0.0375 0.0824 0.276 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -604795 sc-eQTL 7.30e-01 0.0331 0.0957 0.276 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 552629 sc-eQTL 5.41e-01 0.0551 0.0898 0.276 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000240563 L1TD1 794077 sc-eQTL 4.25e-01 -0.049 0.0612 0.276 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -604485 sc-eQTL 6.60e-01 0.032 0.0726 0.276 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -378649 sc-eQTL 9.31e-01 0.00758 0.0873 0.276 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 300540 sc-eQTL 7.64e-01 0.0235 0.0782 0.276 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 204794 sc-eQTL 7.95e-02 0.136 0.0775 0.276 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -604795 sc-eQTL 7.87e-01 -0.025 0.0925 0.276 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 552629 sc-eQTL 2.18e-01 0.103 0.0836 0.276 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -534446 sc-eQTL 4.80e-01 0.0721 0.102 0.276 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000116641 \N 300558 1.27e-06 9.09e-07 2.05e-07 3.6e-07 1.18e-07 3.22e-07 8.7e-07 2.88e-07 1.08e-06 2.67e-07 1.22e-06 5.5e-07 1.54e-06 2.14e-07 4.15e-07 5.7e-07 7.47e-07 5.53e-07 3.64e-07 3.99e-07 2.57e-07 7.58e-07 6.04e-07 4.55e-07 1.74e-06 2.44e-07 5.56e-07 4.77e-07 8e-07 9.93e-07 4.9e-07 4.57e-08 9.79e-08 3.58e-07 3.16e-07 3.21e-07 3.37e-07 1.21e-07 1.54e-07 9.74e-09 1.85e-07 1.3e-06 6.11e-08 2.66e-08 1.84e-07 4.33e-08 1.58e-07 5.79e-08 5.62e-08