logo

Genes within 1Mb (chr1:62981517:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -611894 sc-eQTL 8.49e-01 0.0241 0.126 0.1 B L1
ENSG00000088035 ALG6 -386058 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0156 0.131 0.1 B L1
ENSG00000116641 DOCK7 293131 sc-eQTL 2.64e-01 -0.146 0.13 0.1 B L1
ENSG00000125703 ATG4C 197385 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0128 0.091 0.1 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -612204 sc-eQTL 1.47e-01 0.209 0.144 0.1 B L1
ENSG00000162607 USP1 545220 sc-eQTL 2.46e-02 0.281 0.124 0.1 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -541855 sc-eQTL 4.10e-01 0.122 0.148 0.1 B L1
ENSG00000079739 PGM1 -611894 sc-eQTL 9.28e-01 -0.00984 0.109 0.1 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 -386058 sc-eQTL 8.93e-01 0.0162 0.121 0.1 CD4T L1
ENSG00000116641 DOCK7 293131 sc-eQTL 2.64e-02 -0.27 0.121 0.1 CD4T L1
ENSG00000125703 ATG4C 197385 sc-eQTL 2.43e-01 0.115 0.0984 0.1 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -612204 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0288 0.14 0.1 CD4T L1
ENSG00000162607 USP1 545220 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0336 0.0958 0.1 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -541855 sc-eQTL 2.95e-01 -0.132 0.126 0.1 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 -611894 sc-eQTL 6.54e-01 0.0538 0.12 0.1 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 -386058 sc-eQTL 8.12e-01 0.0314 0.132 0.1 CD8T L1
ENSG00000116641 DOCK7 293131 sc-eQTL 4.70e-01 0.0966 0.134 0.1 CD8T L1
ENSG00000125703 ATG4C 197385 sc-eQTL 5.18e-02 0.246 0.126 0.1 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -612204 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0434 0.142 0.1 CD8T L1
ENSG00000162607 USP1 545220 sc-eQTL 1.13e-01 -0.175 0.11 0.1 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -541855 sc-eQTL 4.38e-02 0.285 0.14 0.1 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 -611894 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0689 0.132 0.104 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 -386058 sc-eQTL 6.80e-01 0.0563 0.136 0.104 DC L1
ENSG00000116641 DOCK7 293131 sc-eQTL 1.48e-01 -0.202 0.139 0.104 DC L1
ENSG00000125703 ATG4C 197385 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0561 0.109 0.104 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -612204 sc-eQTL 8.72e-01 0.0246 0.153 0.104 DC L1
ENSG00000162607 USP1 545220 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0522 0.134 0.104 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -541855 sc-eQTL 7.95e-01 0.0347 0.133 0.104 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 -611894 sc-eQTL 1.79e-01 0.172 0.128 0.1 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 -386058 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0622 0.134 0.1 Mono L1
ENSG00000116641 DOCK7 293131 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0719 0.129 0.1 Mono L1
ENSG00000125703 ATG4C 197385 sc-eQTL 8.97e-01 0.0113 0.0874 0.1 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -612204 sc-eQTL 7.22e-01 0.0491 0.138 0.1 Mono L1
ENSG00000162607 USP1 545220 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0855 0.113 0.1 Mono L1
ENSG00000240563 L1TD1 786668 sc-eQTL 1.54e-01 0.151 0.105 0.1 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 -611894 sc-eQTL 5.98e-01 0.0581 0.11 0.101 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 -386058 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00482 0.129 0.101 NK L1
ENSG00000116641 DOCK7 293131 sc-eQTL 9.59e-01 0.00544 0.106 0.101 NK L1
ENSG00000125703 ATG4C 197385 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0724 0.114 0.101 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -612204 sc-eQTL 3.75e-01 -0.126 0.142 0.101 NK L1
ENSG00000162607 USP1 545220 sc-eQTL 2.77e-01 0.138 0.126 0.101 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -541855 sc-eQTL 6.66e-01 0.0665 0.154 0.101 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 -611894 sc-eQTL 6.85e-01 0.0523 0.129 0.1 Other_T L1
ENSG00000088035 ALG6 -386058 sc-eQTL 6.20e-01 0.0642 0.129 0.1 Other_T L1
ENSG00000116641 DOCK7 293131 sc-eQTL 9.28e-01 0.0119 0.132 0.1 Other_T L1
ENSG00000125703 ATG4C 197385 sc-eQTL 3.66e-01 -0.103 0.114 0.1 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -612204 sc-eQTL 8.23e-01 0.0228 0.101 0.1 Other_T L1
ENSG00000162607 USP1 545220 sc-eQTL 3.12e-01 -0.0889 0.0877 0.1 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -541855 sc-eQTL 1.65e-01 0.217 0.156 0.1 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -611894 sc-eQTL 7.82e-01 0.0464 0.168 0.107 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 -386058 sc-eQTL 5.38e-01 0.0991 0.16 0.107 B_Activated L2
ENSG00000116641 DOCK7 293131 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0307 0.15 0.107 B_Activated L2
ENSG00000125703 ATG4C 197385 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0689 0.157 0.107 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -612204 sc-eQTL 8.77e-01 0.0239 0.154 0.107 B_Activated L2
ENSG00000162607 USP1 545220 sc-eQTL 5.90e-01 0.0898 0.166 0.107 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -541855 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0997 0.145 0.107 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 -611894 sc-eQTL 9.52e-01 0.00922 0.152 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 -386058 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0428 0.155 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000116641 DOCK7 293131 sc-eQTL 4.32e-01 -0.116 0.148 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000125703 ATG4C 197385 sc-eQTL 3.87e-02 0.258 0.124 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -612204 sc-eQTL 6.50e-01 0.0678 0.149 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000162607 USP1 545220 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0368 0.149 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -541855 sc-eQTL 6.75e-01 0.062 0.148 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 -611894 sc-eQTL 6.92e-01 -0.06 0.152 0.099 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 -386058 sc-eQTL 2.90e-01 0.163 0.154 0.099 B_Memory L2
ENSG00000116641 DOCK7 293131 sc-eQTL 1.28e-01 -0.22 0.144 0.099 B_Memory L2
ENSG00000125703 ATG4C 197385 sc-eQTL 3.14e-02 -0.294 0.136 0.099 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -612204 sc-eQTL 2.90e-01 0.166 0.157 0.099 B_Memory L2
ENSG00000162607 USP1 545220 sc-eQTL 3.95e-03 0.453 0.155 0.099 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -541855 sc-eQTL 4.60e-01 -0.115 0.156 0.099 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 -611894 sc-eQTL 4.77e-01 0.11 0.154 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 -386058 sc-eQTL 3.48e-01 0.145 0.154 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000116641 DOCK7 293131 sc-eQTL 5.55e-01 0.0876 0.148 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000125703 ATG4C 197385 sc-eQTL 9.12e-01 0.0126 0.114 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -612204 sc-eQTL 2.06e-01 0.191 0.151 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000162607 USP1 545220 sc-eQTL 9.00e-01 0.0168 0.133 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -541855 sc-eQTL 8.46e-01 0.0313 0.161 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 -611894 sc-eQTL 4.74e-01 -0.106 0.148 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 -386058 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00346 0.154 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000116641 DOCK7 293131 sc-eQTL 2.40e-01 -0.174 0.148 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000125703 ATG4C 197385 sc-eQTL 3.38e-01 -0.137 0.142 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -612204 sc-eQTL 4.14e-01 -0.126 0.154 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000162607 USP1 545220 sc-eQTL 4.89e-01 0.102 0.147 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -541855 sc-eQTL 9.66e-01 0.00652 0.154 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 -611894 sc-eQTL 2.13e-01 -0.19 0.153 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -386058 sc-eQTL 2.00e-01 -0.207 0.161 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 293131 sc-eQTL 4.38e-01 -0.11 0.141 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 197385 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00476 0.146 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -612204 sc-eQTL 3.68e-01 0.141 0.156 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 545220 sc-eQTL 6.30e-01 -0.072 0.149 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -541855 sc-eQTL 8.71e-01 0.0242 0.149 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -611894 sc-eQTL 8.64e-01 0.0211 0.123 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -386058 sc-eQTL 5.94e-02 0.251 0.133 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 293131 sc-eQTL 1.35e-02 -0.323 0.13 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 197385 sc-eQTL 1.95e-01 0.15 0.116 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -612204 sc-eQTL 8.28e-01 0.031 0.142 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 545220 sc-eQTL 5.74e-01 0.061 0.108 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -541855 sc-eQTL 2.51e-01 -0.162 0.141 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -611894 sc-eQTL 8.41e-01 0.0257 0.128 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -386058 sc-eQTL 2.40e-01 -0.174 0.148 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 293131 sc-eQTL 8.78e-01 0.0202 0.132 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 197385 sc-eQTL 8.61e-01 0.0224 0.128 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -612204 sc-eQTL 7.61e-01 -0.046 0.151 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 545220 sc-eQTL 3.97e-01 -0.105 0.124 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -541855 sc-eQTL 2.81e-01 0.157 0.146 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -611894 sc-eQTL 1.70e-01 -0.213 0.155 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -386058 sc-eQTL 8.23e-01 -0.035 0.156 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 293131 sc-eQTL 3.63e-02 0.318 0.151 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 197385 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0244 0.148 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -612204 sc-eQTL 6.65e-01 0.0662 0.153 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 545220 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0819 0.145 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -541855 sc-eQTL 4.11e-02 -0.322 0.157 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -611894 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0155 0.133 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -386058 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0301 0.142 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 293131 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0199 0.134 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 197385 sc-eQTL 6.19e-02 0.266 0.142 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -612204 sc-eQTL 8.89e-01 0.0208 0.149 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 545220 sc-eQTL 3.44e-01 -0.126 0.133 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -541855 sc-eQTL 9.44e-01 0.0108 0.152 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -611894 sc-eQTL 3.18e-01 0.137 0.137 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -386058 sc-eQTL 3.06e-01 0.145 0.142 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 293131 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0719 0.147 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 197385 sc-eQTL 1.48e-01 0.204 0.14 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -612204 sc-eQTL 9.77e-01 0.00413 0.143 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 545220 sc-eQTL 3.12e-01 -0.122 0.12 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -541855 sc-eQTL 3.04e-02 0.29 0.133 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -611894 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0702 0.162 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -386058 sc-eQTL 8.64e-02 -0.28 0.162 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 293131 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00871 0.16 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 197385 sc-eQTL 2.30e-01 0.196 0.163 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -612204 sc-eQTL 3.03e-01 -0.163 0.158 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 545220 sc-eQTL 4.39e-02 0.306 0.151 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -541855 sc-eQTL 1.31e-02 0.399 0.159 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -611894 sc-eQTL 1.85e-01 0.2 0.15 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -386058 sc-eQTL 3.24e-01 0.149 0.151 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 293131 sc-eQTL 9.40e-01 0.011 0.147 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 197385 sc-eQTL 9.44e-02 -0.236 0.14 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -612204 sc-eQTL 3.63e-01 0.139 0.153 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 545220 sc-eQTL 5.13e-01 0.0954 0.146 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -541855 sc-eQTL 2.25e-01 0.18 0.148 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -611894 sc-eQTL 7.25e-01 0.0516 0.146 0.102 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 -386058 sc-eQTL 9.96e-01 0.000741 0.145 0.102 MAIT L2
ENSG00000116641 DOCK7 293131 sc-eQTL 2.51e-01 -0.159 0.138 0.102 MAIT L2
ENSG00000125703 ATG4C 197385 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0417 0.146 0.102 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -612204 sc-eQTL 2.77e-01 -0.159 0.146 0.102 MAIT L2
ENSG00000162607 USP1 545220 sc-eQTL 7.38e-01 0.0487 0.145 0.102 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -541855 sc-eQTL 8.53e-01 -0.028 0.151 0.102 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 -611894 sc-eQTL 6.69e-01 0.0613 0.143 0.102 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 -386058 sc-eQTL 6.97e-01 0.0573 0.147 0.102 NK_CD56bright L2
ENSG00000116641 DOCK7 293131 sc-eQTL 3.82e-01 -0.111 0.127 0.102 NK_CD56bright L2
ENSG00000125703 ATG4C 197385 sc-eQTL 7.59e-01 0.0437 0.142 0.102 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -612204 sc-eQTL 5.39e-01 0.0911 0.148 0.102 NK_CD56bright L2
ENSG00000162607 USP1 545220 sc-eQTL 7.64e-01 0.0458 0.153 0.102 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -541855 sc-eQTL 6.21e-01 0.0723 0.146 0.102 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 -611894 sc-eQTL 3.40e-01 0.109 0.114 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 -386058 sc-eQTL 5.08e-01 0.0957 0.144 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000116641 DOCK7 293131 sc-eQTL 4.28e-01 0.0998 0.126 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000125703 ATG4C 197385 sc-eQTL 3.55e-01 -0.118 0.128 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -612204 sc-eQTL 1.75e-01 -0.197 0.145 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000162607 USP1 545220 sc-eQTL 9.03e-01 0.0172 0.141 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -541855 sc-eQTL 5.10e-01 0.104 0.157 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 -611894 sc-eQTL 3.07e-01 0.157 0.153 0.1 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 -386058 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0336 0.159 0.1 NK_HLA L2
ENSG00000116641 DOCK7 293131 sc-eQTL 4.36e-01 -0.095 0.122 0.1 NK_HLA L2
ENSG00000125703 ATG4C 197385 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00735 0.142 0.1 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -612204 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0186 0.149 0.1 NK_HLA L2
ENSG00000162607 USP1 545220 sc-eQTL 8.00e-01 0.0394 0.156 0.1 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -541855 sc-eQTL 2.33e-01 0.169 0.141 0.1 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 -611894 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0492 0.125 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 -386058 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0635 0.141 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000116641 DOCK7 293131 sc-eQTL 7.57e-01 0.0406 0.131 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000125703 ATG4C 197385 sc-eQTL 4.95e-01 0.0916 0.134 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -612204 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0459 0.139 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000162607 USP1 545220 sc-eQTL 2.42e-01 0.171 0.145 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -541855 sc-eQTL 4.36e-01 -0.115 0.148 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 -611894 sc-eQTL 4.13e-01 0.151 0.184 0.089 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 -386058 sc-eQTL 3.56e-01 -0.178 0.193 0.089 PB L2
ENSG00000116641 DOCK7 293131 sc-eQTL 1.14e-01 0.326 0.204 0.089 PB L2
ENSG00000125703 ATG4C 197385 sc-eQTL 2.58e-01 -0.204 0.179 0.089 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -612204 sc-eQTL 3.25e-01 -0.177 0.179 0.089 PB L2
ENSG00000162607 USP1 545220 sc-eQTL 7.56e-01 0.0558 0.179 0.089 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -541855 sc-eQTL 1.57e-02 0.472 0.192 0.089 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 -611894 sc-eQTL 2.95e-01 0.145 0.138 0.1 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 -386058 sc-eQTL 1.35e-01 -0.21 0.14 0.1 Pro_T L2
ENSG00000116641 DOCK7 293131 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0504 0.141 0.1 Pro_T L2
ENSG00000125703 ATG4C 197385 sc-eQTL 4.06e-01 0.103 0.124 0.1 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -612204 sc-eQTL 2.99e-02 0.269 0.123 0.1 Pro_T L2
ENSG00000162607 USP1 545220 sc-eQTL 1.25e-01 -0.131 0.0849 0.1 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -541855 sc-eQTL 1.02e-01 0.236 0.143 0.1 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 -611894 sc-eQTL 9.87e-01 0.00239 0.142 0.1 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 -386058 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00425 0.152 0.1 Treg L2
ENSG00000116641 DOCK7 293131 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0508 0.139 0.1 Treg L2
ENSG00000125703 ATG4C 197385 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0213 0.142 0.1 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -612204 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0892 0.149 0.1 Treg L2
ENSG00000162607 USP1 545220 sc-eQTL 2.06e-01 0.182 0.144 0.1 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -541855 sc-eQTL 8.31e-01 0.0304 0.142 0.1 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 -611894 sc-eQTL 4.50e-01 -0.106 0.141 0.11 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -386058 sc-eQTL 6.57e-01 0.0635 0.143 0.11 cDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 293131 sc-eQTL 1.54e-01 -0.199 0.139 0.11 cDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 197385 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0478 0.122 0.11 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -612204 sc-eQTL 8.65e-01 0.0262 0.154 0.11 cDC L2
ENSG00000162607 USP1 545220 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0574 0.137 0.11 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -541855 sc-eQTL 4.48e-01 0.0941 0.124 0.11 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 -611894 sc-eQTL 1.09e-01 0.214 0.133 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 -386058 sc-eQTL 6.73e-01 0.0564 0.134 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000116641 DOCK7 293131 sc-eQTL 1.50e-01 -0.202 0.14 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000125703 ATG4C 197385 sc-eQTL 6.42e-01 0.0461 0.0991 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -612204 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0187 0.14 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000162607 USP1 545220 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0545 0.124 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000240563 L1TD1 786668 sc-eQTL 4.78e-01 0.0882 0.124 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 -611894 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0341 0.149 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 -386058 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0801 0.151 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000116641 DOCK7 293131 sc-eQTL 1.51e-01 0.2 0.139 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000125703 ATG4C 197385 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0281 0.121 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -612204 sc-eQTL 4.44e-01 0.105 0.136 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000162607 USP1 545220 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0937 0.14 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000240563 L1TD1 786668 sc-eQTL 4.38e-02 0.235 0.116 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 -611894 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0165 0.162 0.112 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 -386058 sc-eQTL 3.74e-01 0.154 0.172 0.112 gdT L2
ENSG00000116641 DOCK7 293131 sc-eQTL 6.07e-01 0.0873 0.169 0.112 gdT L2
ENSG00000125703 ATG4C 197385 sc-eQTL 7.19e-01 0.0583 0.162 0.112 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -612204 sc-eQTL 2.94e-01 0.181 0.171 0.112 gdT L2
ENSG00000162607 USP1 545220 sc-eQTL 4.83e-01 0.114 0.163 0.112 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -541855 sc-eQTL 7.01e-01 0.065 0.169 0.112 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 -611894 sc-eQTL 9.53e-01 0.0089 0.15 0.102 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -386058 sc-eQTL 9.68e-01 0.00554 0.14 0.102 intMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 293131 sc-eQTL 1.87e-01 -0.188 0.142 0.102 intMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 197385 sc-eQTL 6.44e-01 0.0632 0.136 0.102 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -612204 sc-eQTL 3.67e-02 -0.313 0.149 0.102 intMono L2
ENSG00000162607 USP1 545220 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00642 0.153 0.102 intMono L2
ENSG00000240563 L1TD1 786668 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00249 0.112 0.102 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -611894 sc-eQTL 9.61e-02 0.221 0.132 0.106 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -386058 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0803 0.146 0.106 ncMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 293131 sc-eQTL 3.94e-01 0.123 0.144 0.106 ncMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 197385 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0725 0.134 0.106 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -612204 sc-eQTL 9.41e-02 0.235 0.14 0.106 ncMono L2
ENSG00000162607 USP1 545220 sc-eQTL 5.79e-01 0.0799 0.144 0.106 ncMono L2
ENSG00000240563 L1TD1 786668 sc-eQTL 3.16e-01 0.102 0.102 0.106 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -611894 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0924 0.171 0.096 pDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -386058 sc-eQTL 3.37e-01 -0.16 0.167 0.096 pDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 293131 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0907 0.17 0.096 pDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 197385 sc-eQTL 8.30e-01 0.0328 0.153 0.096 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -612204 sc-eQTL 6.96e-01 0.0673 0.172 0.096 pDC L2
ENSG00000162607 USP1 545220 sc-eQTL 1.28e-01 -0.266 0.174 0.096 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -541855 sc-eQTL 6.03e-01 0.0793 0.152 0.096 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -611894 sc-eQTL 5.90e-01 0.0746 0.138 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -386058 sc-eQTL 5.58e-01 0.0898 0.153 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 293131 sc-eQTL 1.69e-01 -0.182 0.132 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 197385 sc-eQTL 8.67e-01 -0.018 0.107 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -612204 sc-eQTL 2.48e-01 0.163 0.141 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 545220 sc-eQTL 1.47e-02 0.332 0.135 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -541855 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0199 0.147 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -611894 sc-eQTL 9.78e-01 0.00419 0.149 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -386058 sc-eQTL 4.68e-01 0.111 0.153 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 293131 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0967 0.143 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 197385 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00145 0.109 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -612204 sc-eQTL 5.33e-01 0.0962 0.154 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 545220 sc-eQTL 4.82e-01 0.0931 0.132 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -541855 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0289 0.155 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -611894 sc-eQTL 3.60e-01 0.125 0.136 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -386058 sc-eQTL 9.29e-01 -0.0118 0.132 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 293131 sc-eQTL 6.58e-01 -0.059 0.133 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 197385 sc-eQTL 7.80e-01 0.0257 0.092 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -612204 sc-eQTL 7.27e-01 0.0476 0.136 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 545220 sc-eQTL 3.32e-01 -0.113 0.116 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000240563 L1TD1 786668 sc-eQTL 2.28e-01 0.152 0.126 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -611894 sc-eQTL 1.64e-01 0.181 0.13 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -386058 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0881 0.148 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 293131 sc-eQTL 3.89e-01 -0.126 0.146 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 197385 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0238 0.125 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -612204 sc-eQTL 7.44e-01 0.0474 0.145 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 545220 sc-eQTL 6.09e-01 0.0697 0.136 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000240563 L1TD1 786668 sc-eQTL 4.55e-01 0.0694 0.0927 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -611894 sc-eQTL 8.19e-01 0.0256 0.112 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -386058 sc-eQTL 7.14e-01 0.0493 0.134 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 293131 sc-eQTL 3.85e-01 0.105 0.12 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 197385 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0579 0.12 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -612204 sc-eQTL 3.16e-01 -0.143 0.142 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 545220 sc-eQTL 3.73e-01 0.115 0.129 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -541855 sc-eQTL 9.93e-01 0.00136 0.157 0.099 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079739 PGM1 -611894 eQTL 0.0205 -0.0661 0.0285 0.00582 0.0 0.111
ENSG00000230798 FOXD3-AS1 -342924 eQTL 0.00608 -0.114 0.0415 0.00126 0.00143 0.111

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina