logo

Genes within 1Mb (chr1:62949465:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -643946 sc-eQTL 2.87e-01 0.0807 0.0755 0.483 B L1
ENSG00000088035 ALG6 -418110 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0165 0.0785 0.483 B L1
ENSG00000116641 DOCK7 261079 sc-eQTL 9.71e-01 0.00289 0.0785 0.483 B L1
ENSG00000125703 ATG4C 165333 sc-eQTL 9.09e-01 0.00622 0.0545 0.483 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -644256 sc-eQTL 7.11e-01 0.0322 0.0868 0.483 B L1
ENSG00000162607 USP1 513168 sc-eQTL 7.86e-02 -0.132 0.0748 0.483 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -573907 sc-eQTL 8.42e-01 0.0177 0.0889 0.483 B L1
ENSG00000079739 PGM1 -643946 sc-eQTL 1.22e-01 0.102 0.0659 0.483 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 -418110 sc-eQTL 3.28e-01 -0.0715 0.073 0.483 CD4T L1
ENSG00000116641 DOCK7 261079 sc-eQTL 9.60e-01 0.0037 0.0741 0.483 CD4T L1
ENSG00000125703 ATG4C 165333 sc-eQTL 9.89e-01 0.000814 0.0598 0.483 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -644256 sc-eQTL 7.33e-01 0.029 0.0849 0.483 CD4T L1
ENSG00000162607 USP1 513168 sc-eQTL 7.97e-01 0.015 0.058 0.483 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -573907 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0581 0.0761 0.483 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 -643946 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0467 0.0733 0.483 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 -418110 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0532 0.0808 0.483 CD8T L1
ENSG00000116641 DOCK7 261079 sc-eQTL 7.21e-02 0.147 0.0813 0.483 CD8T L1
ENSG00000125703 ATG4C 165333 sc-eQTL 6.24e-01 0.0382 0.0778 0.483 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -644256 sc-eQTL 5.89e-01 0.047 0.087 0.483 CD8T L1
ENSG00000162607 USP1 513168 sc-eQTL 1.01e-01 0.111 0.0674 0.483 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -573907 sc-eQTL 1.89e-01 -0.114 0.0864 0.483 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 -643946 sc-eQTL 9.81e-02 0.134 0.0808 0.484 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 -418110 sc-eQTL 2.00e-01 0.108 0.0836 0.484 DC L1
ENSG00000116641 DOCK7 261079 sc-eQTL 4.40e-02 0.173 0.0852 0.484 DC L1
ENSG00000125703 ATG4C 165333 sc-eQTL 8.03e-03 0.177 0.0662 0.484 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -644256 sc-eQTL 5.17e-01 0.061 0.094 0.484 DC L1
ENSG00000162607 USP1 513168 sc-eQTL 8.15e-01 0.0193 0.0822 0.484 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -573907 sc-eQTL 1.70e-02 0.194 0.0808 0.484 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 -643946 sc-eQTL 1.49e-01 0.115 0.0791 0.483 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 -418110 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0568 0.0829 0.483 Mono L1
ENSG00000116641 DOCK7 261079 sc-eQTL 5.10e-01 0.0529 0.0802 0.483 Mono L1
ENSG00000125703 ATG4C 165333 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0206 0.0542 0.483 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -644256 sc-eQTL 3.79e-01 -0.0755 0.0856 0.483 Mono L1
ENSG00000162607 USP1 513168 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0305 0.0704 0.483 Mono L1
ENSG00000240563 L1TD1 754616 sc-eQTL 5.22e-01 0.0421 0.0656 0.483 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 -643946 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0506 0.0669 0.483 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 -418110 sc-eQTL 2.22e-02 0.179 0.0776 0.483 NK L1
ENSG00000116641 DOCK7 261079 sc-eQTL 7.22e-01 0.0231 0.0647 0.483 NK L1
ENSG00000125703 ATG4C 165333 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0417 0.0695 0.483 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -644256 sc-eQTL 1.43e-01 0.126 0.086 0.483 NK L1
ENSG00000162607 USP1 513168 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0147 0.0772 0.483 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -573907 sc-eQTL 6.87e-02 -0.17 0.0931 0.483 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 -643946 sc-eQTL 9.28e-01 0.00685 0.076 0.483 Other_T L1
ENSG00000088035 ALG6 -418110 sc-eQTL 9.25e-01 0.00722 0.0764 0.483 Other_T L1
ENSG00000116641 DOCK7 261079 sc-eQTL 1.23e-01 0.12 0.0776 0.483 Other_T L1
ENSG00000125703 ATG4C 165333 sc-eQTL 5.27e-01 0.0427 0.0675 0.483 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -644256 sc-eQTL 1.49e-01 0.0862 0.0596 0.483 Other_T L1
ENSG00000162607 USP1 513168 sc-eQTL 3.57e-01 -0.0478 0.0518 0.483 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -573907 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0284 0.0924 0.483 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -643946 sc-eQTL 6.20e-01 0.0523 0.105 0.48 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 -418110 sc-eQTL 1.48e-01 0.146 0.1 0.48 B_Activated L2
ENSG00000116641 DOCK7 261079 sc-eQTL 3.75e-01 -0.0834 0.0937 0.48 B_Activated L2
ENSG00000125703 ATG4C 165333 sc-eQTL 7.51e-01 0.0315 0.0988 0.48 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -644256 sc-eQTL 3.38e-01 0.0926 0.0963 0.48 B_Activated L2
ENSG00000162607 USP1 513168 sc-eQTL 2.25e-01 0.127 0.104 0.48 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -573907 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0468 0.0913 0.48 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 -643946 sc-eQTL 3.22e-01 0.0906 0.0913 0.483 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 -418110 sc-eQTL 6.39e-01 0.0437 0.0929 0.483 B_Intermediate L2
ENSG00000116641 DOCK7 261079 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0308 0.0887 0.483 B_Intermediate L2
ENSG00000125703 ATG4C 165333 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0212 0.0751 0.483 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -644256 sc-eQTL 3.48e-01 -0.0839 0.0893 0.483 B_Intermediate L2
ENSG00000162607 USP1 513168 sc-eQTL 1.18e-01 0.139 0.0888 0.483 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -573907 sc-eQTL 8.19e-01 0.0203 0.0887 0.483 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 -643946 sc-eQTL 5.45e-02 0.173 0.0893 0.485 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 -418110 sc-eQTL 5.49e-01 0.0549 0.0915 0.485 B_Memory L2
ENSG00000116641 DOCK7 261079 sc-eQTL 3.32e-01 -0.0833 0.0857 0.485 B_Memory L2
ENSG00000125703 ATG4C 165333 sc-eQTL 3.59e-01 0.0748 0.0815 0.485 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -644256 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0696 0.0933 0.485 B_Memory L2
ENSG00000162607 USP1 513168 sc-eQTL 3.52e-02 -0.198 0.0932 0.485 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -573907 sc-eQTL 2.21e-01 0.113 0.0924 0.485 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 -643946 sc-eQTL 8.41e-01 0.0183 0.0912 0.483 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 -418110 sc-eQTL 1.32e-01 -0.138 0.0911 0.483 B_Naive1 L2
ENSG00000116641 DOCK7 261079 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00659 0.0877 0.483 B_Naive1 L2
ENSG00000125703 ATG4C 165333 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000511 0.0676 0.483 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -644256 sc-eQTL 5.91e-01 0.0482 0.0896 0.483 B_Naive1 L2
ENSG00000162607 USP1 513168 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0535 0.0788 0.483 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -573907 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0537 0.0956 0.483 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 -643946 sc-eQTL 1.30e-01 0.136 0.0895 0.485 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 -418110 sc-eQTL 2.75e-01 -0.102 0.0936 0.485 B_Naive2 L2
ENSG00000116641 DOCK7 261079 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0326 0.0902 0.485 B_Naive2 L2
ENSG00000125703 ATG4C 165333 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0565 0.0868 0.485 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -644256 sc-eQTL 9.56e-01 -0.0052 0.0942 0.485 B_Naive2 L2
ENSG00000162607 USP1 513168 sc-eQTL 9.83e-01 0.00188 0.0897 0.485 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -573907 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0454 0.0937 0.485 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 -643946 sc-eQTL 2.53e-01 -0.106 0.0922 0.486 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -418110 sc-eQTL 2.08e-02 0.225 0.0965 0.486 CD4_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 261079 sc-eQTL 6.52e-01 0.0386 0.0855 0.486 CD4_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 165333 sc-eQTL 4.14e-01 -0.0723 0.0883 0.486 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -644256 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00531 0.0946 0.486 CD4_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 513168 sc-eQTL 5.98e-01 0.0475 0.09 0.486 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -573907 sc-eQTL 8.90e-01 0.0125 0.0899 0.486 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -643946 sc-eQTL 2.37e-01 0.0879 0.0741 0.483 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -418110 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0495 0.0807 0.483 CD4_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 261079 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00288 0.0793 0.483 CD4_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 165333 sc-eQTL 4.85e-01 0.049 0.0701 0.483 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -644256 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00457 0.0857 0.483 CD4_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 513168 sc-eQTL 9.25e-01 0.00614 0.0655 0.483 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -573907 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0367 0.0851 0.483 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -643946 sc-eQTL 5.16e-01 0.0502 0.0772 0.483 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -418110 sc-eQTL 1.39e-01 -0.133 0.0893 0.483 CD4_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 261079 sc-eQTL 9.08e-01 0.00919 0.0795 0.483 CD4_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 165333 sc-eQTL 9.31e-01 0.00671 0.0774 0.483 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -644256 sc-eQTL 9.92e-01 0.000948 0.0913 0.483 CD4_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 513168 sc-eQTL 5.33e-01 0.0466 0.0748 0.483 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -573907 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0727 0.0882 0.483 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -643946 sc-eQTL 8.99e-02 0.153 0.09 0.483 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -418110 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0514 0.091 0.483 CD4_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 261079 sc-eQTL 2.35e-01 -0.105 0.0885 0.483 CD4_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 165333 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0551 0.0861 0.483 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -644256 sc-eQTL 9.24e-01 0.00851 0.089 0.483 CD4_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 513168 sc-eQTL 1.79e-01 0.113 0.084 0.483 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -573907 sc-eQTL 8.41e-01 0.0185 0.0922 0.483 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -643946 sc-eQTL 2.10e-01 -0.104 0.0827 0.483 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -418110 sc-eQTL 2.46e-01 0.102 0.088 0.483 CD8_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 261079 sc-eQTL 4.13e-01 0.0687 0.0836 0.483 CD8_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 165333 sc-eQTL 3.56e-01 0.0823 0.089 0.483 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -644256 sc-eQTL 4.78e-01 0.0658 0.0926 0.483 CD8_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 513168 sc-eQTL 3.78e-01 0.0733 0.0829 0.483 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -573907 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0541 0.0949 0.483 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -643946 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0242 0.085 0.483 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -418110 sc-eQTL 1.45e-01 -0.128 0.0875 0.483 CD8_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 261079 sc-eQTL 4.59e-02 0.181 0.0901 0.483 CD8_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 165333 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0276 0.0873 0.483 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -644256 sc-eQTL 5.63e-01 0.0512 0.0883 0.483 CD8_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 513168 sc-eQTL 1.31e-01 0.113 0.0743 0.483 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -573907 sc-eQTL 6.58e-01 -0.037 0.0833 0.483 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -643946 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0426 0.0945 0.495 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -418110 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00256 0.0957 0.495 CD8_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 261079 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0304 0.0934 0.495 CD8_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 165333 sc-eQTL 7.26e-02 -0.171 0.0948 0.495 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -644256 sc-eQTL 1.09e-01 -0.148 0.0922 0.495 CD8_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 513168 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0624 0.0892 0.495 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -573907 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0129 0.0946 0.495 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -643946 sc-eQTL 4.32e-01 0.0741 0.0942 0.482 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -418110 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00648 0.0947 0.482 CD8_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 261079 sc-eQTL 1.83e-01 0.122 0.0914 0.482 CD8_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 165333 sc-eQTL 8.32e-01 0.0187 0.0882 0.482 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -644256 sc-eQTL 2.37e-01 -0.113 0.0952 0.482 CD8_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 513168 sc-eQTL 5.64e-02 0.173 0.0903 0.482 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -573907 sc-eQTL 1.86e-01 -0.122 0.0922 0.482 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -643946 sc-eQTL 3.40e-01 -0.0845 0.0884 0.478 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 -418110 sc-eQTL 1.01e-01 0.144 0.0871 0.478 MAIT L2
ENSG00000116641 DOCK7 261079 sc-eQTL 4.62e-01 0.0618 0.0839 0.478 MAIT L2
ENSG00000125703 ATG4C 165333 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0141 0.0886 0.478 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -644256 sc-eQTL 1.01e-01 0.145 0.0882 0.478 MAIT L2
ENSG00000162607 USP1 513168 sc-eQTL 8.22e-01 0.0199 0.088 0.478 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -573907 sc-eQTL 8.58e-01 0.0164 0.0914 0.478 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 -643946 sc-eQTL 9.02e-01 0.0109 0.0877 0.482 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 -418110 sc-eQTL 4.09e-01 0.0742 0.0898 0.482 NK_CD56bright L2
ENSG00000116641 DOCK7 261079 sc-eQTL 9.20e-01 -0.00787 0.0779 0.482 NK_CD56bright L2
ENSG00000125703 ATG4C 165333 sc-eQTL 5.05e-01 0.0581 0.0869 0.482 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -644256 sc-eQTL 1.73e-01 -0.123 0.0902 0.482 NK_CD56bright L2
ENSG00000162607 USP1 513168 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0581 0.0934 0.482 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -573907 sc-eQTL 8.38e-01 0.0183 0.0894 0.482 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 -643946 sc-eQTL 2.79e-01 -0.075 0.0691 0.483 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 -418110 sc-eQTL 3.52e-01 0.0818 0.0878 0.483 NK_CD56dim L2
ENSG00000116641 DOCK7 261079 sc-eQTL 2.16e-01 0.0946 0.0763 0.483 NK_CD56dim L2
ENSG00000125703 ATG4C 165333 sc-eQTL 6.07e-01 -0.04 0.0777 0.483 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -644256 sc-eQTL 2.13e-01 0.11 0.0881 0.483 NK_CD56dim L2
ENSG00000162607 USP1 513168 sc-eQTL 9.05e-01 0.0103 0.0858 0.483 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -573907 sc-eQTL 1.51e-01 -0.137 0.0951 0.483 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 -643946 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0369 0.0936 0.475 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 -418110 sc-eQTL 9.97e-02 0.16 0.0964 0.475 NK_HLA L2
ENSG00000116641 DOCK7 261079 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0105 0.0743 0.475 NK_HLA L2
ENSG00000125703 ATG4C 165333 sc-eQTL 3.04e-01 -0.0888 0.0861 0.475 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -644256 sc-eQTL 3.21e-01 0.09 0.0905 0.475 NK_HLA L2
ENSG00000162607 USP1 513168 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0594 0.0948 0.475 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -573907 sc-eQTL 2.04e-01 -0.11 0.086 0.475 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 -643946 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0134 0.0762 0.483 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 -418110 sc-eQTL 2.12e-01 0.107 0.0858 0.483 NK_cytokine L2
ENSG00000116641 DOCK7 261079 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0554 0.0797 0.483 NK_cytokine L2
ENSG00000125703 ATG4C 165333 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0608 0.0815 0.483 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -644256 sc-eQTL 3.45e-01 0.0798 0.0844 0.483 NK_cytokine L2
ENSG00000162607 USP1 513168 sc-eQTL 7.88e-01 0.024 0.0889 0.483 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -573907 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00821 0.0901 0.483 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 -643946 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0464 0.104 0.463 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 -418110 sc-eQTL 8.20e-02 0.19 0.108 0.463 PB L2
ENSG00000116641 DOCK7 261079 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0493 0.117 0.463 PB L2
ENSG00000125703 ATG4C 165333 sc-eQTL 7.69e-01 0.03 0.102 0.463 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -644256 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000663 0.102 0.463 PB L2
ENSG00000162607 USP1 513168 sc-eQTL 2.42e-01 -0.119 0.101 0.463 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -573907 sc-eQTL 5.03e-01 0.0751 0.112 0.463 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 -643946 sc-eQTL 9.61e-02 0.137 0.0819 0.485 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 -418110 sc-eQTL 3.90e-01 0.0721 0.0837 0.485 Pro_T L2
ENSG00000116641 DOCK7 261079 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0388 0.0841 0.485 Pro_T L2
ENSG00000125703 ATG4C 165333 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0224 0.0737 0.485 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -644256 sc-eQTL 7.87e-01 0.02 0.0739 0.485 Pro_T L2
ENSG00000162607 USP1 513168 sc-eQTL 4.01e-01 0.0427 0.0507 0.485 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -573907 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0701 0.0857 0.485 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 -643946 sc-eQTL 1.56e-01 0.128 0.0897 0.483 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 -418110 sc-eQTL 2.09e-01 -0.121 0.0961 0.483 Treg L2
ENSG00000116641 DOCK7 261079 sc-eQTL 3.73e-01 0.0789 0.0884 0.483 Treg L2
ENSG00000125703 ATG4C 165333 sc-eQTL 7.27e-01 0.0317 0.0904 0.483 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -644256 sc-eQTL 7.66e-01 0.0282 0.0946 0.483 Treg L2
ENSG00000162607 USP1 513168 sc-eQTL 6.90e-01 0.0366 0.0915 0.483 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -573907 sc-eQTL 3.61e-02 -0.189 0.0896 0.483 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 -643946 sc-eQTL 1.83e-01 0.116 0.0872 0.48 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -418110 sc-eQTL 3.57e-01 0.0818 0.0887 0.48 cDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 261079 sc-eQTL 6.03e-02 0.163 0.0864 0.48 cDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 165333 sc-eQTL 9.24e-02 0.127 0.0752 0.48 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -644256 sc-eQTL 4.52e-01 0.0723 0.0958 0.48 cDC L2
ENSG00000162607 USP1 513168 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0261 0.0854 0.48 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -573907 sc-eQTL 8.88e-01 0.0108 0.0771 0.48 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 -643946 sc-eQTL 1.86e-01 0.109 0.082 0.483 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 -418110 sc-eQTL 2.41e-01 -0.0967 0.0821 0.483 cMono_IL1B L2
ENSG00000116641 DOCK7 261079 sc-eQTL 3.58e-01 0.0799 0.0867 0.483 cMono_IL1B L2
ENSG00000125703 ATG4C 165333 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0467 0.061 0.483 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -644256 sc-eQTL 3.60e-01 -0.0793 0.0864 0.483 cMono_IL1B L2
ENSG00000162607 USP1 513168 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0223 0.0763 0.483 cMono_IL1B L2
ENSG00000240563 L1TD1 754616 sc-eQTL 5.39e-01 0.0471 0.0766 0.483 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 -643946 sc-eQTL 7.69e-02 0.161 0.0905 0.483 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 -418110 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0642 0.0923 0.483 cMono_S100A L2
ENSG00000116641 DOCK7 261079 sc-eQTL 3.40e-01 -0.0817 0.0855 0.483 cMono_S100A L2
ENSG00000125703 ATG4C 165333 sc-eQTL 4.90e-01 0.0512 0.0741 0.483 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -644256 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0256 0.0837 0.483 cMono_S100A L2
ENSG00000162607 USP1 513168 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0402 0.0861 0.483 cMono_S100A L2
ENSG00000240563 L1TD1 754616 sc-eQTL 1.30e-01 -0.108 0.0713 0.483 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 -643946 sc-eQTL 9.43e-01 0.00783 0.109 0.479 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 -418110 sc-eQTL 1.65e-01 -0.161 0.115 0.479 gdT L2
ENSG00000116641 DOCK7 261079 sc-eQTL 1.13e-01 0.18 0.113 0.479 gdT L2
ENSG00000125703 ATG4C 165333 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0111 0.109 0.479 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -644256 sc-eQTL 8.72e-01 0.0186 0.115 0.479 gdT L2
ENSG00000162607 USP1 513168 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0245 0.109 0.479 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -573907 sc-eQTL 3.14e-01 -0.114 0.113 0.479 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 -643946 sc-eQTL 5.83e-01 0.0508 0.0925 0.484 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -418110 sc-eQTL 9.24e-01 0.00827 0.0862 0.484 intMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 261079 sc-eQTL 1.58e-01 0.124 0.0876 0.484 intMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 165333 sc-eQTL 5.73e-01 0.0473 0.084 0.484 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -644256 sc-eQTL 1.62e-01 -0.129 0.0921 0.484 intMono L2
ENSG00000162607 USP1 513168 sc-eQTL 1.72e-01 -0.128 0.0937 0.484 intMono L2
ENSG00000240563 L1TD1 754616 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0232 0.0692 0.484 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -643946 sc-eQTL 9.89e-01 0.00113 0.083 0.473 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -418110 sc-eQTL 3.01e-01 0.0943 0.0909 0.473 ncMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 261079 sc-eQTL 8.56e-01 0.0163 0.0897 0.473 ncMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 165333 sc-eQTL 8.95e-01 -0.011 0.0838 0.473 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -644256 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0349 0.0876 0.473 ncMono L2
ENSG00000162607 USP1 513168 sc-eQTL 1.72e-01 -0.122 0.0892 0.473 ncMono L2
ENSG00000240563 L1TD1 754616 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00329 0.0635 0.473 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -643946 sc-eQTL 3.87e-01 0.0893 0.103 0.483 pDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -418110 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0348 0.1 0.483 pDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 261079 sc-eQTL 4.30e-01 0.0812 0.102 0.483 pDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 165333 sc-eQTL 3.79e-01 0.081 0.0919 0.483 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -644256 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0141 0.103 0.483 pDC L2
ENSG00000162607 USP1 513168 sc-eQTL 7.06e-01 0.0397 0.105 0.483 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -573907 sc-eQTL 2.20e-01 0.112 0.0911 0.483 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -643946 sc-eQTL 1.04e-01 0.137 0.0842 0.483 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -418110 sc-eQTL 1.65e-01 0.13 0.0932 0.483 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 261079 sc-eQTL 1.39e-01 -0.12 0.0808 0.483 B_Memory LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 165333 sc-eQTL 6.74e-01 0.0276 0.0657 0.483 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -644256 sc-eQTL 2.89e-01 -0.0915 0.0861 0.483 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 513168 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0379 0.0838 0.483 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -573907 sc-eQTL 4.53e-01 0.0676 0.0898 0.483 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -643946 sc-eQTL 3.36e-01 0.0856 0.0888 0.483 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -418110 sc-eQTL 8.31e-02 -0.158 0.0909 0.483 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 261079 sc-eQTL 9.94e-01 0.000639 0.0855 0.483 B_Naive LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 165333 sc-eQTL 5.40e-01 -0.04 0.0652 0.483 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -644256 sc-eQTL 4.26e-01 0.0734 0.0921 0.483 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 513168 sc-eQTL 1.99e-01 -0.102 0.079 0.483 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -573907 sc-eQTL 2.94e-01 -0.0972 0.0925 0.483 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -643946 sc-eQTL 4.64e-02 0.168 0.0838 0.483 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -418110 sc-eQTL 3.09e-01 -0.0833 0.0817 0.483 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 261079 sc-eQTL 4.93e-01 0.0566 0.0824 0.483 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 165333 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0156 0.057 0.483 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -644256 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0668 0.0843 0.483 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 513168 sc-eQTL 9.31e-01 0.00621 0.0721 0.483 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000240563 L1TD1 754616 sc-eQTL 9.42e-01 0.0057 0.0782 0.483 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -643946 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0603 0.0792 0.485 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -418110 sc-eQTL 2.88e-01 0.0956 0.0898 0.485 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 261079 sc-eQTL 1.11e-01 0.142 0.0886 0.485 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 165333 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00148 0.076 0.485 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -644256 sc-eQTL 9.89e-02 -0.145 0.0876 0.485 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 513168 sc-eQTL 1.33e-01 -0.124 0.0824 0.485 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000240563 L1TD1 754616 sc-eQTL 5.36e-01 0.035 0.0565 0.485 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -643946 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0456 0.0681 0.483 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -418110 sc-eQTL 6.85e-02 0.149 0.0812 0.483 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 261079 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00576 0.0733 0.483 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 165333 sc-eQTL 2.59e-01 -0.0826 0.0729 0.483 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -644256 sc-eQTL 1.34e-01 0.13 0.0863 0.483 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 513168 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0232 0.0787 0.483 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -573907 sc-eQTL 1.03e-01 -0.156 0.0952 0.483 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000125703 ATG4C 165333 eQTL 0.0189 0.0396 0.0169 0.0 0.0 0.434
ENSG00000132855 ANGPTL3 351978 pQTL 0.0312 0.0618 0.0287 0.0 0.0 0.443
ENSG00000162607 USP1 513168 eQTL 0.0251 0.029 0.0129 0.0 0.0 0.434

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina