logo

Genes within 1Mb (chr1:62935583:A:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -657828 sc-eQTL 7.53e-01 -0.035 0.111 0.145 B L1
ENSG00000088035 ALG6 -431992 sc-eQTL 6.98e-02 -0.208 0.114 0.145 B L1
ENSG00000116641 DOCK7 247197 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0199 0.115 0.145 B L1
ENSG00000125703 ATG4C 151451 sc-eQTL 4.81e-01 0.0564 0.0799 0.145 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -658138 sc-eQTL 5.36e-01 0.0789 0.127 0.145 B L1
ENSG00000162607 USP1 499286 sc-eQTL 2.07e-01 0.139 0.11 0.145 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -587789 sc-eQTL 3.67e-01 0.118 0.13 0.145 B L1
ENSG00000079739 PGM1 -657828 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0568 0.0959 0.145 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 -431992 sc-eQTL 9.48e-01 0.00698 0.106 0.145 CD4T L1
ENSG00000116641 DOCK7 247197 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0779 0.107 0.145 CD4T L1
ENSG00000125703 ATG4C 151451 sc-eQTL 5.95e-01 0.046 0.0866 0.145 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -658138 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0554 0.123 0.145 CD4T L1
ENSG00000162607 USP1 499286 sc-eQTL 3.56e-01 0.0776 0.0839 0.145 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -587789 sc-eQTL 6.80e-01 0.0455 0.11 0.145 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 -657828 sc-eQTL 2.90e-01 0.111 0.105 0.145 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 -431992 sc-eQTL 6.42e-01 -0.054 0.116 0.145 CD8T L1
ENSG00000116641 DOCK7 247197 sc-eQTL 9.81e-01 0.00277 0.117 0.145 CD8T L1
ENSG00000125703 ATG4C 151451 sc-eQTL 3.63e-01 -0.101 0.111 0.145 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -658138 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0976 0.124 0.145 CD8T L1
ENSG00000162607 USP1 499286 sc-eQTL 8.27e-01 0.0213 0.0971 0.145 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -587789 sc-eQTL 2.57e-01 0.141 0.124 0.145 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 -657828 sc-eQTL 8.13e-01 0.0277 0.117 0.137 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 -431992 sc-eQTL 4.06e-02 -0.246 0.119 0.137 DC L1
ENSG00000116641 DOCK7 247197 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0338 0.124 0.137 DC L1
ENSG00000125703 ATG4C 151451 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0307 0.0967 0.137 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -658138 sc-eQTL 1.77e-01 0.182 0.135 0.137 DC L1
ENSG00000162607 USP1 499286 sc-eQTL 7.66e-01 0.0352 0.118 0.137 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -587789 sc-eQTL 3.49e-01 -0.11 0.117 0.137 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 -657828 sc-eQTL 2.64e-01 -0.126 0.113 0.145 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 -431992 sc-eQTL 5.09e-01 0.0779 0.118 0.145 Mono L1
ENSG00000116641 DOCK7 247197 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0657 0.114 0.145 Mono L1
ENSG00000125703 ATG4C 151451 sc-eQTL 2.31e-01 0.0922 0.0767 0.145 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -658138 sc-eQTL 8.45e-01 0.0238 0.122 0.145 Mono L1
ENSG00000162607 USP1 499286 sc-eQTL 9.68e-02 0.166 0.0993 0.145 Mono L1
ENSG00000240563 L1TD1 740734 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0299 0.0932 0.145 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 -657828 sc-eQTL 7.94e-01 0.0252 0.0962 0.146 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 -431992 sc-eQTL 7.30e-01 -0.039 0.113 0.146 NK L1
ENSG00000116641 DOCK7 247197 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0675 0.0928 0.146 NK L1
ENSG00000125703 ATG4C 151451 sc-eQTL 3.07e-01 0.102 0.0995 0.146 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -658138 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0794 0.124 0.146 NK L1
ENSG00000162607 USP1 499286 sc-eQTL 2.65e-01 0.123 0.111 0.146 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -587789 sc-eQTL 3.82e-01 0.118 0.134 0.146 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 -657828 sc-eQTL 7.78e-01 0.0304 0.108 0.145 Other_T L1
ENSG00000088035 ALG6 -431992 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0288 0.108 0.145 Other_T L1
ENSG00000116641 DOCK7 247197 sc-eQTL 6.75e-01 0.0465 0.111 0.145 Other_T L1
ENSG00000125703 ATG4C 151451 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0274 0.0958 0.145 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -658138 sc-eQTL 2.54e-01 -0.0969 0.0847 0.145 Other_T L1
ENSG00000162607 USP1 499286 sc-eQTL 5.79e-01 0.0409 0.0736 0.145 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -587789 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0471 0.131 0.145 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -657828 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0657 0.145 0.148 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 -431992 sc-eQTL 1.79e-01 0.187 0.139 0.148 B_Activated L2
ENSG00000116641 DOCK7 247197 sc-eQTL 8.53e-01 0.0241 0.13 0.148 B_Activated L2
ENSG00000125703 ATG4C 151451 sc-eQTL 5.37e-01 0.0843 0.136 0.148 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -658138 sc-eQTL 8.58e-01 -0.024 0.133 0.148 B_Activated L2
ENSG00000162607 USP1 499286 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0847 0.144 0.148 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -587789 sc-eQTL 2.98e-01 -0.132 0.126 0.148 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 -657828 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0193 0.133 0.144 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 -431992 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0841 0.135 0.144 B_Intermediate L2
ENSG00000116641 DOCK7 247197 sc-eQTL 9.48e-01 0.00841 0.129 0.144 B_Intermediate L2
ENSG00000125703 ATG4C 151451 sc-eQTL 8.23e-01 0.0244 0.109 0.144 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -658138 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0858 0.13 0.144 B_Intermediate L2
ENSG00000162607 USP1 499286 sc-eQTL 7.40e-01 0.0431 0.13 0.144 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -587789 sc-eQTL 5.37e-01 0.0795 0.129 0.144 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 -657828 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0254 0.128 0.147 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 -431992 sc-eQTL 1.53e-02 -0.313 0.128 0.147 B_Memory L2
ENSG00000116641 DOCK7 247197 sc-eQTL 1.98e-01 -0.156 0.121 0.147 B_Memory L2
ENSG00000125703 ATG4C 151451 sc-eQTL 1.45e-01 -0.168 0.115 0.147 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -658138 sc-eQTL 1.40e-01 0.195 0.132 0.147 B_Memory L2
ENSG00000162607 USP1 499286 sc-eQTL 9.41e-01 0.00986 0.133 0.147 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -587789 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0635 0.131 0.147 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 -657828 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0999 0.131 0.145 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 -431992 sc-eQTL 3.84e-01 -0.115 0.132 0.145 B_Naive1 L2
ENSG00000116641 DOCK7 247197 sc-eQTL 5.96e-01 0.0672 0.126 0.145 B_Naive1 L2
ENSG00000125703 ATG4C 151451 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0467 0.0974 0.145 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -658138 sc-eQTL 2.60e-01 0.146 0.129 0.145 B_Naive1 L2
ENSG00000162607 USP1 499286 sc-eQTL 1.39e-01 0.168 0.113 0.145 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -587789 sc-eQTL 1.85e-01 0.182 0.137 0.145 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 -657828 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0495 0.129 0.146 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 -431992 sc-eQTL 5.10e-01 -0.089 0.135 0.146 B_Naive2 L2
ENSG00000116641 DOCK7 247197 sc-eQTL 9.04e-01 0.0157 0.13 0.146 B_Naive2 L2
ENSG00000125703 ATG4C 151451 sc-eQTL 3.01e-01 0.129 0.125 0.146 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -658138 sc-eQTL 6.00e-01 0.0711 0.135 0.146 B_Naive2 L2
ENSG00000162607 USP1 499286 sc-eQTL 3.08e-01 0.132 0.129 0.146 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -587789 sc-eQTL 7.47e-01 0.0435 0.135 0.146 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 -657828 sc-eQTL 9.22e-02 0.225 0.133 0.145 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -431992 sc-eQTL 8.30e-01 0.0304 0.142 0.145 CD4_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 247197 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0217 0.124 0.145 CD4_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 151451 sc-eQTL 1.49e-01 0.185 0.128 0.145 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -658138 sc-eQTL 6.79e-01 0.0569 0.137 0.145 CD4_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 499286 sc-eQTL 4.97e-01 0.0888 0.13 0.145 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -587789 sc-eQTL 3.20e-01 -0.13 0.13 0.145 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -657828 sc-eQTL 9.05e-01 0.0129 0.107 0.145 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -431992 sc-eQTL 3.58e-01 -0.107 0.116 0.145 CD4_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 247197 sc-eQTL 4.40e-01 0.0885 0.114 0.145 CD4_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 151451 sc-eQTL 6.21e-01 0.0501 0.101 0.145 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -658138 sc-eQTL 6.34e-01 -0.059 0.124 0.145 CD4_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 499286 sc-eQTL 2.36e-01 0.112 0.0941 0.145 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -587789 sc-eQTL 9.16e-01 0.013 0.123 0.145 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -657828 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0694 0.109 0.145 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -431992 sc-eQTL 1.19e-01 0.197 0.126 0.145 CD4_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 247197 sc-eQTL 1.74e-01 -0.153 0.112 0.145 CD4_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 151451 sc-eQTL 3.05e-01 0.112 0.109 0.145 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -658138 sc-eQTL 3.26e-01 -0.127 0.129 0.145 CD4_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 499286 sc-eQTL 5.05e-02 0.206 0.105 0.145 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -587789 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0364 0.125 0.145 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -657828 sc-eQTL 8.66e-02 -0.219 0.127 0.145 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -431992 sc-eQTL 3.10e-01 0.131 0.128 0.145 CD4_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 247197 sc-eQTL 3.03e-01 -0.129 0.125 0.145 CD4_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 151451 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0859 0.122 0.145 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -658138 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0163 0.126 0.145 CD4_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 499286 sc-eQTL 1.52e-02 -0.288 0.117 0.145 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -587789 sc-eQTL 9.85e-01 -0.0024 0.13 0.145 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -657828 sc-eQTL 7.10e-01 0.044 0.118 0.145 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -431992 sc-eQTL 2.11e-01 -0.157 0.125 0.145 CD8_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 247197 sc-eQTL 9.52e-01 0.00713 0.119 0.145 CD8_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 151451 sc-eQTL 8.88e-01 -0.018 0.127 0.145 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -658138 sc-eQTL 2.43e-01 0.154 0.132 0.145 CD8_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 499286 sc-eQTL 6.17e-01 0.0592 0.118 0.145 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -587789 sc-eQTL 9.71e-01 0.00493 0.135 0.145 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -657828 sc-eQTL 5.88e-01 0.0658 0.121 0.145 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -431992 sc-eQTL 2.17e-01 0.155 0.125 0.145 CD8_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 247197 sc-eQTL 6.07e-01 0.0669 0.13 0.145 CD8_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 151451 sc-eQTL 1.89e-01 -0.164 0.124 0.145 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -658138 sc-eQTL 1.83e-01 -0.168 0.126 0.145 CD8_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 499286 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0205 0.107 0.145 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -587789 sc-eQTL 6.69e-01 0.0509 0.119 0.145 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -657828 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0178 0.133 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -431992 sc-eQTL 3.61e-01 -0.123 0.134 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 247197 sc-eQTL 9.14e-01 0.0141 0.131 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 151451 sc-eQTL 3.06e-01 0.137 0.134 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -658138 sc-eQTL 8.79e-02 -0.222 0.129 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 499286 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0221 0.125 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -587789 sc-eQTL 7.58e-01 0.0409 0.133 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -657828 sc-eQTL 7.71e-01 0.0396 0.136 0.144 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -431992 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0743 0.136 0.144 CD8_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 247197 sc-eQTL 5.60e-02 0.252 0.131 0.144 CD8_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 151451 sc-eQTL 3.33e-01 -0.123 0.127 0.144 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -658138 sc-eQTL 3.42e-01 0.131 0.137 0.144 CD8_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 499286 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0245 0.131 0.144 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -587789 sc-eQTL 1.34e-01 0.199 0.133 0.144 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -657828 sc-eQTL 2.10e-01 0.158 0.126 0.145 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 -431992 sc-eQTL 1.81e-01 -0.167 0.124 0.145 MAIT L2
ENSG00000116641 DOCK7 247197 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00931 0.12 0.145 MAIT L2
ENSG00000125703 ATG4C 151451 sc-eQTL 1.84e-01 -0.168 0.126 0.145 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -658138 sc-eQTL 4.72e-01 -0.091 0.126 0.145 MAIT L2
ENSG00000162607 USP1 499286 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0647 0.125 0.145 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -587789 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0784 0.13 0.145 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 -657828 sc-eQTL 5.92e-01 0.0671 0.125 0.147 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 -431992 sc-eQTL 2.28e-01 0.154 0.128 0.147 NK_CD56bright L2
ENSG00000116641 DOCK7 247197 sc-eQTL 4.93e-01 0.0763 0.111 0.147 NK_CD56bright L2
ENSG00000125703 ATG4C 151451 sc-eQTL 6.44e-01 0.0573 0.124 0.147 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -658138 sc-eQTL 5.27e-01 0.0819 0.129 0.147 NK_CD56bright L2
ENSG00000162607 USP1 499286 sc-eQTL 8.14e-01 0.0314 0.133 0.147 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -587789 sc-eQTL 1.58e-01 0.18 0.127 0.147 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 -657828 sc-eQTL 7.69e-01 0.0294 0.1 0.147 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 -431992 sc-eQTL 1.37e-01 -0.188 0.126 0.147 NK_CD56dim L2
ENSG00000116641 DOCK7 247197 sc-eQTL 7.76e-01 0.0315 0.111 0.147 NK_CD56dim L2
ENSG00000125703 ATG4C 151451 sc-eQTL 8.14e-01 0.0264 0.112 0.147 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -658138 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0914 0.128 0.147 NK_CD56dim L2
ENSG00000162607 USP1 499286 sc-eQTL 7.91e-01 0.0329 0.124 0.147 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -587789 sc-eQTL 4.47e-01 0.105 0.138 0.147 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 -657828 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0317 0.136 0.148 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 -431992 sc-eQTL 2.85e-01 0.151 0.141 0.148 NK_HLA L2
ENSG00000116641 DOCK7 247197 sc-eQTL 1.53e-01 -0.154 0.107 0.148 NK_HLA L2
ENSG00000125703 ATG4C 151451 sc-eQTL 3.14e-01 0.127 0.125 0.148 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -658138 sc-eQTL 2.23e-02 -0.3 0.13 0.148 NK_HLA L2
ENSG00000162607 USP1 499286 sc-eQTL 2.85e-01 0.147 0.138 0.148 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -587789 sc-eQTL 5.91e-01 0.0676 0.126 0.148 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 -657828 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0476 0.109 0.147 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 -431992 sc-eQTL 8.27e-01 -0.027 0.123 0.147 NK_cytokine L2
ENSG00000116641 DOCK7 247197 sc-eQTL 2.38e-01 -0.134 0.114 0.147 NK_cytokine L2
ENSG00000125703 ATG4C 151451 sc-eQTL 1.58e-01 0.164 0.116 0.147 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -658138 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0451 0.121 0.147 NK_cytokine L2
ENSG00000162607 USP1 499286 sc-eQTL 5.28e-01 0.0801 0.127 0.147 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -587789 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0581 0.129 0.147 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 -657828 sc-eQTL 4.29e-01 0.116 0.146 0.156 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 -431992 sc-eQTL 4.31e-01 -0.121 0.154 0.156 PB L2
ENSG00000116641 DOCK7 247197 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0499 0.165 0.156 PB L2
ENSG00000125703 ATG4C 151451 sc-eQTL 7.81e-01 0.04 0.143 0.156 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -658138 sc-eQTL 1.07e-01 -0.23 0.142 0.156 PB L2
ENSG00000162607 USP1 499286 sc-eQTL 9.15e-01 0.0153 0.143 0.156 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -587789 sc-eQTL 2.82e-01 -0.169 0.156 0.156 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 -657828 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0185 0.12 0.141 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 -431992 sc-eQTL 9.35e-01 -0.01 0.122 0.141 Pro_T L2
ENSG00000116641 DOCK7 247197 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0147 0.123 0.141 Pro_T L2
ENSG00000125703 ATG4C 151451 sc-eQTL 2.52e-01 0.123 0.107 0.141 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -658138 sc-eQTL 6.60e-01 0.0474 0.108 0.141 Pro_T L2
ENSG00000162607 USP1 499286 sc-eQTL 2.72e-01 -0.0813 0.0739 0.141 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -587789 sc-eQTL 1.00e+00 -2.61e-05 0.125 0.141 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 -657828 sc-eQTL 9.60e-01 0.00626 0.125 0.145 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 -431992 sc-eQTL 1.35e-01 -0.2 0.133 0.145 Treg L2
ENSG00000116641 DOCK7 247197 sc-eQTL 2.18e-01 -0.151 0.123 0.145 Treg L2
ENSG00000125703 ATG4C 151451 sc-eQTL 3.05e-01 -0.129 0.125 0.145 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -658138 sc-eQTL 9.81e-01 0.00306 0.132 0.145 Treg L2
ENSG00000162607 USP1 499286 sc-eQTL 4.10e-02 0.259 0.126 0.145 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -587789 sc-eQTL 2.20e-01 0.154 0.125 0.145 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 -657828 sc-eQTL 9.94e-01 -0.00092 0.127 0.137 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -431992 sc-eQTL 4.27e-01 -0.102 0.128 0.137 cDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 247197 sc-eQTL 1.30e-01 -0.191 0.125 0.137 cDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 151451 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0396 0.11 0.137 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -658138 sc-eQTL 4.21e-01 0.112 0.139 0.137 cDC L2
ENSG00000162607 USP1 499286 sc-eQTL 4.41e-01 0.0953 0.124 0.137 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -587789 sc-eQTL 5.14e-01 0.0729 0.112 0.137 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 -657828 sc-eQTL 2.35e-01 -0.139 0.117 0.145 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 -431992 sc-eQTL 5.56e-01 0.069 0.117 0.145 cMono_IL1B L2
ENSG00000116641 DOCK7 247197 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00765 0.123 0.145 cMono_IL1B L2
ENSG00000125703 ATG4C 151451 sc-eQTL 2.56e-02 0.193 0.0857 0.145 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -658138 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0155 0.123 0.145 cMono_IL1B L2
ENSG00000162607 USP1 499286 sc-eQTL 5.97e-01 0.0573 0.108 0.145 cMono_IL1B L2
ENSG00000240563 L1TD1 740734 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0172 0.109 0.145 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 -657828 sc-eQTL 3.47e-01 -0.123 0.13 0.145 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 -431992 sc-eQTL 5.33e-01 0.0822 0.132 0.145 cMono_S100A L2
ENSG00000116641 DOCK7 247197 sc-eQTL 9.48e-01 0.00793 0.122 0.145 cMono_S100A L2
ENSG00000125703 ATG4C 151451 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0622 0.106 0.145 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -658138 sc-eQTL 6.02e-01 0.0623 0.119 0.145 cMono_S100A L2
ENSG00000162607 USP1 499286 sc-eQTL 5.92e-01 0.066 0.123 0.145 cMono_S100A L2
ENSG00000240563 L1TD1 740734 sc-eQTL 4.17e-01 -0.083 0.102 0.145 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 -657828 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0285 0.14 0.158 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 -431992 sc-eQTL 6.38e-01 0.0704 0.149 0.158 gdT L2
ENSG00000116641 DOCK7 247197 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0739 0.146 0.158 gdT L2
ENSG00000125703 ATG4C 151451 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0212 0.14 0.158 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -658138 sc-eQTL 9.72e-01 0.0053 0.149 0.158 gdT L2
ENSG00000162607 USP1 499286 sc-eQTL 6.96e-01 0.0551 0.141 0.158 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -587789 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0566 0.146 0.158 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 -657828 sc-eQTL 2.38e-01 -0.154 0.13 0.144 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -431992 sc-eQTL 1.74e-01 -0.165 0.121 0.144 intMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 247197 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0516 0.124 0.144 intMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 151451 sc-eQTL 4.77e-01 -0.0843 0.118 0.144 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -658138 sc-eQTL 8.02e-01 0.0327 0.131 0.144 intMono L2
ENSG00000162607 USP1 499286 sc-eQTL 9.28e-02 0.223 0.132 0.144 intMono L2
ENSG00000240563 L1TD1 740734 sc-eQTL 2.97e-01 0.102 0.0974 0.144 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -657828 sc-eQTL 3.01e-01 0.123 0.118 0.143 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -431992 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0462 0.13 0.143 ncMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 247197 sc-eQTL 7.56e-01 0.0399 0.128 0.143 ncMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 151451 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0274 0.12 0.143 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -658138 sc-eQTL 1.14e-01 0.198 0.124 0.143 ncMono L2
ENSG00000162607 USP1 499286 sc-eQTL 1.77e-01 0.173 0.127 0.143 ncMono L2
ENSG00000240563 L1TD1 740734 sc-eQTL 5.97e-01 0.048 0.0907 0.143 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -657828 sc-eQTL 4.13e-01 0.117 0.142 0.138 pDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -431992 sc-eQTL 6.63e-02 -0.253 0.137 0.138 pDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 247197 sc-eQTL 1.54e-01 0.201 0.141 0.138 pDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 151451 sc-eQTL 8.81e-01 0.019 0.127 0.138 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -658138 sc-eQTL 9.00e-02 0.241 0.141 0.138 pDC L2
ENSG00000162607 USP1 499286 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0429 0.145 0.138 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -587789 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0988 0.126 0.138 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -657828 sc-eQTL 6.19e-01 0.0609 0.122 0.145 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -431992 sc-eQTL 4.36e-01 -0.105 0.135 0.145 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 247197 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0647 0.117 0.145 B_Memory LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 151451 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0428 0.0949 0.145 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -658138 sc-eQTL 5.84e-01 0.0684 0.125 0.145 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 499286 sc-eQTL 2.73e-01 0.133 0.121 0.145 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -587789 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00307 0.13 0.145 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -657828 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0634 0.127 0.145 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -431992 sc-eQTL 2.73e-01 -0.144 0.131 0.145 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 247197 sc-eQTL 8.18e-01 0.0283 0.123 0.145 B_Naive LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 151451 sc-eQTL 8.91e-01 0.0128 0.0936 0.145 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -658138 sc-eQTL 2.33e-01 0.158 0.132 0.145 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 499286 sc-eQTL 9.43e-02 0.19 0.113 0.145 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -587789 sc-eQTL 1.64e-01 0.185 0.132 0.145 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -657828 sc-eQTL 1.33e-01 -0.181 0.12 0.145 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -431992 sc-eQTL 4.67e-01 0.0849 0.117 0.145 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 247197 sc-eQTL 9.19e-01 0.012 0.117 0.145 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 151451 sc-eQTL 2.32e-01 0.0971 0.0809 0.145 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -658138 sc-eQTL 9.64e-01 0.0055 0.12 0.145 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 499286 sc-eQTL 4.25e-01 0.0819 0.102 0.145 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000240563 L1TD1 740734 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0247 0.111 0.145 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -657828 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00556 0.114 0.144 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -431992 sc-eQTL 4.50e-01 -0.098 0.129 0.144 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 247197 sc-eQTL 2.34e-01 -0.153 0.128 0.144 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 151451 sc-eQTL 7.91e-01 -0.029 0.109 0.144 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -658138 sc-eQTL 5.03e-01 0.085 0.127 0.144 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 499286 sc-eQTL 4.21e-02 0.241 0.118 0.144 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000240563 L1TD1 740734 sc-eQTL 5.48e-01 0.0489 0.0813 0.144 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -657828 sc-eQTL 7.67e-01 0.0291 0.0978 0.147 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -431992 sc-eQTL 4.14e-01 -0.096 0.117 0.147 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 247197 sc-eQTL 4.70e-01 -0.076 0.105 0.147 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 151451 sc-eQTL 2.81e-01 0.113 0.105 0.147 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -658138 sc-eQTL 3.21e-01 -0.124 0.124 0.147 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 499286 sc-eQTL 3.27e-01 0.111 0.113 0.147 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -587789 sc-eQTL 7.67e-01 0.0408 0.137 0.147 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000116641 DOCK7 247215 eQTL 3.15e-10 -0.213 0.0334 0.00176 0.0 0.116
ENSG00000125703 ATG4C 151451 eQTL 0.0431 -0.0524 0.0259 0.0 0.0 0.116
ENSG00000132855 ANGPTL3 338096 pQTL 0.0223 -0.101 0.044 0.0 0.0 0.121
ENSG00000162607 USP1 499286 eQTL 0.00765 -0.0529 0.0198 0.0 0.0 0.116

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000116641 DOCK7 247215 1.39e-06 1.27e-06 2.53e-07 1.27e-06 4.65e-07 6.12e-07 1.52e-06 3.99e-07 1.73e-06 6.94e-07 2.04e-06 1.05e-06 2.56e-06 3.1e-07 4.37e-07 9.61e-07 9.95e-07 1.09e-06 5.34e-07 5.44e-07 7e-07 1.97e-06 1.21e-06 7.61e-07 2.39e-06 9.3e-07 1.02e-06 8.48e-07 1.72e-06 1.32e-06 7.84e-07 2.43e-07 3.24e-07 6.13e-07 5.34e-07 6.2e-07 7.21e-07 3.23e-07 5.19e-07 2.22e-07 3.02e-07 1.73e-06 3.01e-07 1.06e-07 3.56e-07 2.28e-07 2.8e-07 1.43e-07 2.83e-07