logo

Genes within 1Mb (chr1:62931441:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -661970 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0122 0.109 0.158 B L1
ENSG00000088035 ALG6 -436134 sc-eQTL 9.67e-02 -0.187 0.112 0.158 B L1
ENSG00000116641 DOCK7 243055 sc-eQTL 6.14e-01 -0.057 0.113 0.158 B L1
ENSG00000125703 ATG4C 147309 sc-eQTL 7.19e-01 0.0282 0.0783 0.158 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -662280 sc-eQTL 3.28e-01 0.122 0.124 0.158 B L1
ENSG00000162607 USP1 495144 sc-eQTL 2.36e-01 0.128 0.108 0.158 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -591931 sc-eQTL 3.13e-01 0.129 0.127 0.158 B L1
ENSG00000079739 PGM1 -661970 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0489 0.0935 0.158 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 -436134 sc-eQTL 5.96e-01 0.0547 0.103 0.158 CD4T L1
ENSG00000116641 DOCK7 243055 sc-eQTL 1.09e-01 -0.167 0.104 0.158 CD4T L1
ENSG00000125703 ATG4C 147309 sc-eQTL 9.35e-01 -0.00689 0.0844 0.158 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -662280 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0736 0.12 0.158 CD4T L1
ENSG00000162607 USP1 495144 sc-eQTL 5.07e-01 0.0544 0.0818 0.158 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -591931 sc-eQTL 9.10e-01 0.0122 0.108 0.158 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 -661970 sc-eQTL 2.47e-01 0.119 0.103 0.158 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 -436134 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0711 0.114 0.158 CD8T L1
ENSG00000116641 DOCK7 243055 sc-eQTL 4.69e-01 0.0837 0.115 0.158 CD8T L1
ENSG00000125703 ATG4C 147309 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0768 0.11 0.158 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -662280 sc-eQTL 2.61e-01 -0.138 0.122 0.158 CD8T L1
ENSG00000162607 USP1 495144 sc-eQTL 8.78e-01 0.0147 0.0955 0.158 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -591931 sc-eQTL 3.33e-01 0.118 0.122 0.158 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 -661970 sc-eQTL 8.12e-01 0.0272 0.114 0.151 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 -436134 sc-eQTL 1.10e-01 -0.188 0.117 0.151 DC L1
ENSG00000116641 DOCK7 243055 sc-eQTL 9.19e-01 0.0123 0.121 0.151 DC L1
ENSG00000125703 ATG4C 147309 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0165 0.0945 0.151 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -662280 sc-eQTL 2.76e-01 0.144 0.132 0.151 DC L1
ENSG00000162607 USP1 495144 sc-eQTL 8.48e-01 0.0222 0.115 0.151 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -591931 sc-eQTL 2.74e-01 -0.126 0.115 0.151 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 -661970 sc-eQTL 1.39e-01 -0.164 0.11 0.158 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 -436134 sc-eQTL 5.52e-01 0.0688 0.115 0.158 Mono L1
ENSG00000116641 DOCK7 243055 sc-eQTL 4.25e-01 -0.0892 0.112 0.158 Mono L1
ENSG00000125703 ATG4C 147309 sc-eQTL 3.73e-01 0.0674 0.0754 0.158 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -662280 sc-eQTL 6.96e-01 0.0466 0.119 0.158 Mono L1
ENSG00000162607 USP1 495144 sc-eQTL 1.51e-01 0.141 0.0976 0.158 Mono L1
ENSG00000240563 L1TD1 736592 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0442 0.0915 0.158 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 -661970 sc-eQTL 6.06e-01 0.0485 0.0939 0.159 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 -436134 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00354 0.11 0.159 NK L1
ENSG00000116641 DOCK7 243055 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0473 0.0907 0.159 NK L1
ENSG00000125703 ATG4C 147309 sc-eQTL 1.62e-01 0.136 0.097 0.159 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -662280 sc-eQTL 3.59e-01 -0.111 0.121 0.159 NK L1
ENSG00000162607 USP1 495144 sc-eQTL 5.35e-01 0.0673 0.108 0.159 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -591931 sc-eQTL 3.44e-01 0.124 0.131 0.159 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 -661970 sc-eQTL 4.27e-01 0.0841 0.106 0.158 Other_T L1
ENSG00000088035 ALG6 -436134 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0149 0.106 0.158 Other_T L1
ENSG00000116641 DOCK7 243055 sc-eQTL 8.11e-01 0.026 0.108 0.158 Other_T L1
ENSG00000125703 ATG4C 147309 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0408 0.0939 0.158 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -662280 sc-eQTL 3.59e-01 -0.0764 0.0831 0.158 Other_T L1
ENSG00000162607 USP1 495144 sc-eQTL 4.65e-01 0.0528 0.0721 0.158 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -591931 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0309 0.129 0.158 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -661970 sc-eQTL 9.39e-01 -0.011 0.142 0.161 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 -436134 sc-eQTL 1.93e-01 0.178 0.136 0.161 B_Activated L2
ENSG00000116641 DOCK7 243055 sc-eQTL 9.40e-01 0.00953 0.127 0.161 B_Activated L2
ENSG00000125703 ATG4C 147309 sc-eQTL 5.60e-01 0.078 0.134 0.161 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -662280 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0164 0.131 0.161 B_Activated L2
ENSG00000162607 USP1 495144 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0853 0.141 0.161 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -591931 sc-eQTL 1.83e-01 -0.164 0.123 0.161 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 -661970 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0274 0.13 0.157 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 -436134 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0313 0.132 0.157 B_Intermediate L2
ENSG00000116641 DOCK7 243055 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0333 0.126 0.157 B_Intermediate L2
ENSG00000125703 ATG4C 147309 sc-eQTL 7.68e-01 0.0315 0.107 0.157 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -662280 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0408 0.127 0.157 B_Intermediate L2
ENSG00000162607 USP1 495144 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0365 0.127 0.157 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -591931 sc-eQTL 7.70e-01 0.0367 0.126 0.157 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 -661970 sc-eQTL 8.39e-01 0.0253 0.125 0.159 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 -436134 sc-eQTL 4.34e-02 -0.255 0.126 0.159 B_Memory L2
ENSG00000116641 DOCK7 243055 sc-eQTL 1.56e-01 -0.168 0.118 0.159 B_Memory L2
ENSG00000125703 ATG4C 147309 sc-eQTL 1.34e-01 -0.169 0.112 0.159 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -662280 sc-eQTL 1.83e-01 0.172 0.129 0.159 B_Memory L2
ENSG00000162607 USP1 495144 sc-eQTL 9.75e-01 0.00402 0.13 0.159 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -591931 sc-eQTL 4.16e-01 -0.105 0.128 0.159 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 -661970 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0255 0.128 0.158 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 -436134 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0929 0.129 0.158 B_Naive1 L2
ENSG00000116641 DOCK7 243055 sc-eQTL 9.15e-01 0.0132 0.123 0.158 B_Naive1 L2
ENSG00000125703 ATG4C 147309 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0135 0.0951 0.158 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -662280 sc-eQTL 2.29e-01 0.152 0.126 0.158 B_Naive1 L2
ENSG00000162607 USP1 495144 sc-eQTL 5.60e-02 0.211 0.11 0.158 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -591931 sc-eQTL 1.38e-01 0.199 0.134 0.158 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 -661970 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0908 0.126 0.159 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 -436134 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0654 0.132 0.159 B_Naive2 L2
ENSG00000116641 DOCK7 243055 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0772 0.127 0.159 B_Naive2 L2
ENSG00000125703 ATG4C 147309 sc-eQTL 7.94e-01 0.032 0.122 0.159 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -662280 sc-eQTL 5.70e-01 0.0752 0.132 0.159 B_Naive2 L2
ENSG00000162607 USP1 495144 sc-eQTL 1.55e-01 0.179 0.125 0.159 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -591931 sc-eQTL 5.88e-01 0.0713 0.132 0.159 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 -661970 sc-eQTL 1.74e-01 0.18 0.132 0.157 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -436134 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0688 0.14 0.157 CD4_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 243055 sc-eQTL 7.38e-01 -0.041 0.123 0.157 CD4_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 147309 sc-eQTL 4.20e-02 0.257 0.126 0.157 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -662280 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0176 0.136 0.157 CD4_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 495144 sc-eQTL 9.26e-01 0.0121 0.129 0.157 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -591931 sc-eQTL 3.69e-01 -0.116 0.129 0.157 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -661970 sc-eQTL 8.25e-01 0.023 0.104 0.158 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -436134 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0509 0.113 0.158 CD4_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 243055 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00424 0.111 0.158 CD4_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 147309 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0108 0.0984 0.158 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -662280 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0718 0.12 0.158 CD4_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 495144 sc-eQTL 3.58e-01 0.0845 0.0916 0.158 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -591931 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0494 0.119 0.158 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -661970 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0476 0.107 0.158 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -436134 sc-eQTL 7.80e-02 0.219 0.123 0.158 CD4_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 243055 sc-eQTL 1.29e-01 -0.167 0.11 0.158 CD4_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 147309 sc-eQTL 3.41e-01 0.102 0.107 0.158 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -662280 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0777 0.126 0.158 CD4_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 495144 sc-eQTL 7.80e-02 0.182 0.103 0.158 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -591931 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00216 0.122 0.158 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -661970 sc-eQTL 4.43e-02 -0.251 0.124 0.158 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -436134 sc-eQTL 3.13e-01 0.127 0.126 0.158 CD4_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 243055 sc-eQTL 2.98e-01 -0.128 0.122 0.158 CD4_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 147309 sc-eQTL 1.41e-01 -0.175 0.119 0.158 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -662280 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0422 0.123 0.158 CD4_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 495144 sc-eQTL 1.29e-02 -0.288 0.115 0.158 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -591931 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0142 0.128 0.158 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -661970 sc-eQTL 9.76e-01 0.00354 0.117 0.158 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -436134 sc-eQTL 4.17e-01 -0.101 0.124 0.158 CD8_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 243055 sc-eQTL 7.67e-01 0.0351 0.118 0.158 CD8_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 147309 sc-eQTL 9.21e-01 0.0124 0.126 0.158 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -662280 sc-eQTL 4.36e-01 0.102 0.131 0.158 CD8_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 495144 sc-eQTL 9.98e-01 0.000303 0.117 0.158 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -591931 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00765 0.134 0.158 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -661970 sc-eQTL 3.67e-01 0.107 0.119 0.158 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -436134 sc-eQTL 2.88e-01 0.131 0.123 0.158 CD8_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 243055 sc-eQTL 4.45e-01 0.0974 0.127 0.158 CD8_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 147309 sc-eQTL 2.16e-01 -0.151 0.122 0.158 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -662280 sc-eQTL 8.43e-02 -0.213 0.123 0.158 CD8_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 495144 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000797 0.105 0.158 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -591931 sc-eQTL 6.45e-01 0.0539 0.117 0.158 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -661970 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0301 0.13 0.153 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -436134 sc-eQTL 3.61e-01 -0.12 0.131 0.153 CD8_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 243055 sc-eQTL 6.83e-01 0.0524 0.128 0.153 CD8_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 147309 sc-eQTL 4.30e-01 0.104 0.131 0.153 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -662280 sc-eQTL 1.18e-01 -0.199 0.127 0.153 CD8_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 495144 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0155 0.123 0.153 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -591931 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0187 0.13 0.153 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -661970 sc-eQTL 5.22e-01 0.0856 0.133 0.155 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -436134 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0976 0.134 0.155 CD8_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 243055 sc-eQTL 1.46e-02 0.315 0.128 0.155 CD8_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 147309 sc-eQTL 2.17e-01 -0.154 0.124 0.155 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -662280 sc-eQTL 2.25e-01 0.164 0.135 0.155 CD8_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 495144 sc-eQTL 9.05e-01 0.0154 0.129 0.155 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -591931 sc-eQTL 2.22e-01 0.16 0.131 0.155 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -661970 sc-eQTL 1.93e-01 0.162 0.124 0.158 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 -436134 sc-eQTL 1.34e-01 -0.184 0.122 0.158 MAIT L2
ENSG00000116641 DOCK7 243055 sc-eQTL 9.63e-01 0.00544 0.118 0.158 MAIT L2
ENSG00000125703 ATG4C 147309 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0527 0.124 0.158 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -662280 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0852 0.124 0.158 MAIT L2
ENSG00000162607 USP1 495144 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0337 0.123 0.158 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -591931 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0841 0.128 0.158 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 -661970 sc-eQTL 4.88e-01 0.0848 0.122 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 -436134 sc-eQTL 9.93e-02 0.206 0.124 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000116641 DOCK7 243055 sc-eQTL 5.91e-01 0.0583 0.108 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000125703 ATG4C 147309 sc-eQTL 7.91e-01 0.0321 0.121 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -662280 sc-eQTL 6.37e-01 0.0596 0.126 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000162607 USP1 495144 sc-eQTL 8.89e-01 0.0181 0.13 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -591931 sc-eQTL 4.14e-01 0.102 0.124 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 -661970 sc-eQTL 6.57e-01 0.0434 0.0976 0.159 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 -436134 sc-eQTL 1.23e-01 -0.191 0.123 0.159 NK_CD56dim L2
ENSG00000116641 DOCK7 243055 sc-eQTL 8.64e-01 0.0186 0.108 0.159 NK_CD56dim L2
ENSG00000125703 ATG4C 147309 sc-eQTL 6.98e-01 0.0425 0.11 0.159 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -662280 sc-eQTL 3.54e-01 -0.116 0.124 0.159 NK_CD56dim L2
ENSG00000162607 USP1 495144 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00588 0.121 0.159 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -591931 sc-eQTL 4.02e-01 0.113 0.134 0.159 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 -661970 sc-eQTL 6.25e-01 0.0651 0.133 0.162 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 -436134 sc-eQTL 2.62e-01 0.155 0.138 0.162 NK_HLA L2
ENSG00000116641 DOCK7 243055 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0802 0.105 0.162 NK_HLA L2
ENSG00000125703 ATG4C 147309 sc-eQTL 2.37e-01 0.145 0.122 0.162 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -662280 sc-eQTL 3.45e-02 -0.271 0.127 0.162 NK_HLA L2
ENSG00000162607 USP1 495144 sc-eQTL 2.80e-01 0.146 0.134 0.162 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -591931 sc-eQTL 2.28e-01 0.148 0.122 0.162 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 -661970 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0255 0.106 0.159 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 -436134 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00788 0.12 0.159 NK_cytokine L2
ENSG00000116641 DOCK7 243055 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0648 0.111 0.159 NK_cytokine L2
ENSG00000125703 ATG4C 147309 sc-eQTL 9.84e-02 0.188 0.113 0.159 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -662280 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0798 0.118 0.159 NK_cytokine L2
ENSG00000162607 USP1 495144 sc-eQTL 7.57e-01 0.0384 0.124 0.159 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -591931 sc-eQTL 8.30e-01 -0.027 0.126 0.159 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 -661970 sc-eQTL 5.13e-01 0.0932 0.142 0.17 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 -436134 sc-eQTL 3.13e-01 -0.151 0.149 0.17 PB L2
ENSG00000116641 DOCK7 243055 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0197 0.16 0.17 PB L2
ENSG00000125703 ATG4C 147309 sc-eQTL 9.42e-01 0.0102 0.139 0.17 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -662280 sc-eQTL 9.03e-02 -0.235 0.137 0.17 PB L2
ENSG00000162607 USP1 495144 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0158 0.139 0.17 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -591931 sc-eQTL 3.59e-01 -0.14 0.152 0.17 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 -661970 sc-eQTL 8.32e-01 0.0248 0.117 0.154 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 -436134 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0195 0.119 0.154 Pro_T L2
ENSG00000116641 DOCK7 243055 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0486 0.119 0.154 Pro_T L2
ENSG00000125703 ATG4C 147309 sc-eQTL 4.07e-01 0.0868 0.104 0.154 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -662280 sc-eQTL 2.87e-01 0.112 0.105 0.154 Pro_T L2
ENSG00000162607 USP1 495144 sc-eQTL 2.57e-01 -0.0817 0.0719 0.154 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -591931 sc-eQTL 9.29e-01 -0.0109 0.122 0.154 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 -661970 sc-eQTL 7.16e-01 0.0445 0.122 0.158 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 -436134 sc-eQTL 1.25e-01 -0.2 0.13 0.158 Treg L2
ENSG00000116641 DOCK7 243055 sc-eQTL 1.61e-01 -0.168 0.12 0.158 Treg L2
ENSG00000125703 ATG4C 147309 sc-eQTL 3.07e-01 -0.125 0.122 0.158 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -662280 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0742 0.128 0.158 Treg L2
ENSG00000162607 USP1 495144 sc-eQTL 4.70e-02 0.246 0.123 0.158 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -591931 sc-eQTL 4.93e-01 0.0844 0.123 0.158 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 -661970 sc-eQTL 9.00e-01 0.0156 0.124 0.151 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -436134 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0387 0.126 0.151 cDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 243055 sc-eQTL 2.40e-01 -0.145 0.123 0.151 cDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 147309 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00153 0.107 0.151 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -662280 sc-eQTL 4.96e-01 0.0925 0.136 0.151 cDC L2
ENSG00000162607 USP1 495144 sc-eQTL 5.50e-01 0.0723 0.121 0.151 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -591931 sc-eQTL 8.80e-01 0.0164 0.109 0.151 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 -661970 sc-eQTL 1.28e-01 -0.175 0.114 0.158 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 -436134 sc-eQTL 8.79e-01 0.0176 0.115 0.158 cMono_IL1B L2
ENSG00000116641 DOCK7 243055 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0359 0.121 0.158 cMono_IL1B L2
ENSG00000125703 ATG4C 147309 sc-eQTL 2.82e-02 0.186 0.0843 0.158 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -662280 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0123 0.121 0.158 cMono_IL1B L2
ENSG00000162607 USP1 495144 sc-eQTL 4.96e-01 0.0725 0.106 0.158 cMono_IL1B L2
ENSG00000240563 L1TD1 736592 sc-eQTL 5.13e-01 -0.07 0.107 0.158 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 -661970 sc-eQTL 2.15e-01 -0.159 0.128 0.158 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 -436134 sc-eQTL 5.82e-01 0.0716 0.13 0.158 cMono_S100A L2
ENSG00000116641 DOCK7 243055 sc-eQTL 9.38e-01 0.00935 0.12 0.158 cMono_S100A L2
ENSG00000125703 ATG4C 147309 sc-eQTL 2.59e-01 -0.118 0.104 0.158 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -662280 sc-eQTL 7.04e-01 0.0447 0.118 0.158 cMono_S100A L2
ENSG00000162607 USP1 495144 sc-eQTL 9.52e-01 0.00732 0.121 0.158 cMono_S100A L2
ENSG00000240563 L1TD1 736592 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0475 0.101 0.158 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 -661970 sc-eQTL 9.21e-01 0.0138 0.138 0.167 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 -436134 sc-eQTL 6.01e-01 0.0772 0.147 0.167 gdT L2
ENSG00000116641 DOCK7 243055 sc-eQTL 3.65e-01 -0.131 0.144 0.167 gdT L2
ENSG00000125703 ATG4C 147309 sc-eQTL 8.84e-01 0.0201 0.138 0.167 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -662280 sc-eQTL 8.03e-01 0.0367 0.147 0.167 gdT L2
ENSG00000162607 USP1 495144 sc-eQTL 7.97e-01 0.0359 0.139 0.167 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -591931 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0856 0.144 0.167 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 -661970 sc-eQTL 1.61e-01 -0.179 0.127 0.158 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -436134 sc-eQTL 3.45e-01 -0.113 0.119 0.158 intMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 243055 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0875 0.122 0.158 intMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 147309 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00112 0.116 0.158 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -662280 sc-eQTL 6.18e-01 0.0639 0.128 0.158 intMono L2
ENSG00000162607 USP1 495144 sc-eQTL 1.49e-01 0.188 0.13 0.158 intMono L2
ENSG00000240563 L1TD1 736592 sc-eQTL 1.47e-01 0.139 0.0953 0.158 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -661970 sc-eQTL 1.67e-01 0.16 0.115 0.156 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -436134 sc-eQTL 9.39e-01 -0.0098 0.127 0.156 ncMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 243055 sc-eQTL 4.27e-01 0.0994 0.125 0.156 ncMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 147309 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0602 0.117 0.156 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -662280 sc-eQTL 1.48e-01 0.177 0.122 0.156 ncMono L2
ENSG00000162607 USP1 495144 sc-eQTL 1.96e-01 0.162 0.124 0.156 ncMono L2
ENSG00000240563 L1TD1 736592 sc-eQTL 7.83e-01 0.0244 0.0886 0.156 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -661970 sc-eQTL 4.12e-01 0.115 0.14 0.147 pDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -436134 sc-eQTL 1.04e-01 -0.222 0.136 0.147 pDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 243055 sc-eQTL 2.47e-01 0.161 0.139 0.147 pDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 147309 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0224 0.125 0.147 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -662280 sc-eQTL 9.59e-02 0.234 0.139 0.147 pDC L2
ENSG00000162607 USP1 495144 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0665 0.143 0.147 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -591931 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0866 0.124 0.147 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -661970 sc-eQTL 4.58e-01 0.0884 0.119 0.158 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -436134 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0605 0.132 0.158 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 243055 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0969 0.114 0.158 B_Memory LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 147309 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0555 0.0923 0.158 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -662280 sc-eQTL 4.95e-01 0.0829 0.121 0.158 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 495144 sc-eQTL 4.89e-01 0.0816 0.118 0.158 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -591931 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0662 0.126 0.158 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -661970 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0368 0.124 0.158 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -436134 sc-eQTL 3.96e-01 -0.109 0.128 0.158 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 243055 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0441 0.12 0.158 B_Naive LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 147309 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0173 0.0913 0.158 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -662280 sc-eQTL 1.38e-01 0.191 0.128 0.158 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 495144 sc-eQTL 2.93e-02 0.241 0.11 0.158 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -591931 sc-eQTL 1.18e-01 0.203 0.129 0.158 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -661970 sc-eQTL 6.38e-02 -0.219 0.118 0.158 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -436134 sc-eQTL 7.18e-01 0.0414 0.115 0.158 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 243055 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00785 0.116 0.158 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 147309 sc-eQTL 4.80e-01 0.0565 0.0798 0.158 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -662280 sc-eQTL 9.00e-01 0.0149 0.118 0.158 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 495144 sc-eQTL 5.33e-01 0.063 0.101 0.158 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000240563 L1TD1 736592 sc-eQTL 7.43e-01 -0.036 0.109 0.158 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -661970 sc-eQTL 9.96e-01 -0.00053 0.111 0.157 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -436134 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0248 0.126 0.157 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 243055 sc-eQTL 2.27e-01 -0.151 0.124 0.157 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 147309 sc-eQTL 9.12e-01 0.0118 0.106 0.157 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -662280 sc-eQTL 4.16e-01 0.101 0.123 0.157 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 495144 sc-eQTL 7.92e-02 0.203 0.115 0.157 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000240563 L1TD1 736592 sc-eQTL 6.44e-01 0.0367 0.0792 0.157 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -661970 sc-eQTL 6.03e-01 0.0497 0.0955 0.159 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -436134 sc-eQTL 4.64e-01 -0.084 0.115 0.159 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 243055 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0439 0.103 0.159 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 147309 sc-eQTL 1.51e-01 0.147 0.102 0.159 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -662280 sc-eQTL 2.04e-01 -0.154 0.121 0.159 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 495144 sc-eQTL 5.74e-01 0.0621 0.11 0.159 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -591931 sc-eQTL 6.14e-01 0.0679 0.134 0.159 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000116641 DOCK7 243073 eQTL 2.66e-09 -0.196 0.0327 0.00124 0.0 0.123
ENSG00000125703 ATG4C 147309 eQTL 0.0151 -0.0614 0.0252 0.0 0.0 0.123
ENSG00000132855 ANGPTL3 333954 pQTL 0.00872 -0.112 0.0426 0.0 0.0 0.132
ENSG00000162607 USP1 495144 eQTL 0.0217 -0.0444 0.0193 0.0 0.0 0.123

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000116641 DOCK7 243073 1.39e-06 1.25e-06 2.19e-07 1.26e-06 4.41e-07 6.09e-07 1.48e-06 3.75e-07 1.72e-06 7.1e-07 2.1e-06 9.81e-07 2.56e-06 3.07e-07 4.96e-07 9.77e-07 9.81e-07 1.08e-06 5.75e-07 5.06e-07 7.74e-07 1.97e-06 1.18e-06 6.51e-07 2.49e-06 8.38e-07 1.03e-06 8.64e-07 1.63e-06 1.3e-06 8.57e-07 2.44e-07 3.23e-07 5.66e-07 5.52e-07 6.07e-07 7.4e-07 3.23e-07 5.18e-07 2.03e-07 3.59e-07 1.73e-06 2.46e-07 9e-08 3.76e-07 2.13e-07 2.79e-07 1.44e-07 2.71e-07