logo

Genes within 1Mb (chr1:62924914:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -668497 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0373 0.106 0.162 B L1
ENSG00000088035 ALG6 -442661 sc-eQTL 1.09e-01 -0.175 0.109 0.162 B L1
ENSG00000116641 DOCK7 236528 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0479 0.11 0.162 B L1
ENSG00000125703 ATG4C 140782 sc-eQTL 9.57e-01 0.0041 0.0763 0.162 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -668807 sc-eQTL 3.52e-01 0.113 0.121 0.162 B L1
ENSG00000162607 USP1 488617 sc-eQTL 9.72e-02 0.174 0.105 0.162 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -598458 sc-eQTL 4.89e-02 0.244 0.123 0.162 B L1
ENSG00000079739 PGM1 -668497 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0401 0.0914 0.162 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 -442661 sc-eQTL 8.26e-01 0.0222 0.101 0.162 CD4T L1
ENSG00000116641 DOCK7 236528 sc-eQTL 6.97e-02 -0.185 0.101 0.162 CD4T L1
ENSG00000125703 ATG4C 140782 sc-eQTL 9.67e-01 0.00346 0.0825 0.162 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -668807 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0445 0.117 0.162 CD4T L1
ENSG00000162607 USP1 488617 sc-eQTL 4.70e-01 0.0578 0.0799 0.162 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -598458 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0158 0.105 0.162 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 -668497 sc-eQTL 3.23e-01 0.0997 0.101 0.162 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 -442661 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0299 0.111 0.162 CD8T L1
ENSG00000116641 DOCK7 236528 sc-eQTL 4.00e-01 0.0949 0.112 0.162 CD8T L1
ENSG00000125703 ATG4C 140782 sc-eQTL 3.58e-01 -0.0983 0.107 0.162 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -668807 sc-eQTL 3.32e-01 -0.116 0.119 0.162 CD8T L1
ENSG00000162607 USP1 488617 sc-eQTL 7.79e-01 0.0263 0.0932 0.162 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -598458 sc-eQTL 2.09e-01 0.15 0.119 0.162 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 -668497 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00413 0.11 0.16 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 -442661 sc-eQTL 2.13e-01 -0.142 0.114 0.16 DC L1
ENSG00000116641 DOCK7 236528 sc-eQTL 7.51e-01 0.0372 0.117 0.16 DC L1
ENSG00000125703 ATG4C 140782 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0127 0.0915 0.16 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -668807 sc-eQTL 1.86e-01 0.169 0.127 0.16 DC L1
ENSG00000162607 USP1 488617 sc-eQTL 7.32e-01 0.0383 0.112 0.16 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -598458 sc-eQTL 2.78e-01 -0.121 0.111 0.16 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 -668497 sc-eQTL 7.63e-02 -0.191 0.107 0.162 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 -442661 sc-eQTL 6.72e-01 0.0478 0.113 0.162 Mono L1
ENSG00000116641 DOCK7 236528 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0693 0.109 0.162 Mono L1
ENSG00000125703 ATG4C 140782 sc-eQTL 5.30e-01 0.0463 0.0735 0.162 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -668807 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0667 0.116 0.162 Mono L1
ENSG00000162607 USP1 488617 sc-eQTL 7.62e-02 0.169 0.0948 0.162 Mono L1
ENSG00000240563 L1TD1 730065 sc-eQTL 7.88e-01 -0.024 0.0892 0.162 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 -668497 sc-eQTL 3.80e-01 0.0806 0.0915 0.163 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 -442661 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0494 0.107 0.163 NK L1
ENSG00000116641 DOCK7 236528 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0603 0.0885 0.163 NK L1
ENSG00000125703 ATG4C 140782 sc-eQTL 3.47e-01 0.0895 0.0949 0.163 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -668807 sc-eQTL 1.85e-01 -0.157 0.118 0.163 NK L1
ENSG00000162607 USP1 488617 sc-eQTL 2.86e-01 0.113 0.105 0.163 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -598458 sc-eQTL 6.37e-01 0.0606 0.128 0.163 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 -668497 sc-eQTL 5.60e-01 0.0603 0.103 0.162 Other_T L1
ENSG00000088035 ALG6 -442661 sc-eQTL 8.33e-01 0.0219 0.104 0.162 Other_T L1
ENSG00000116641 DOCK7 236528 sc-eQTL 6.94e-01 0.0418 0.106 0.162 Other_T L1
ENSG00000125703 ATG4C 140782 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0369 0.0917 0.162 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -668807 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0658 0.0812 0.162 Other_T L1
ENSG00000162607 USP1 488617 sc-eQTL 2.84e-01 0.0755 0.0703 0.162 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -598458 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0313 0.125 0.162 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -668497 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00841 0.138 0.163 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 -442661 sc-eQTL 1.39e-01 0.195 0.131 0.163 B_Activated L2
ENSG00000116641 DOCK7 236528 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0306 0.123 0.163 B_Activated L2
ENSG00000125703 ATG4C 140782 sc-eQTL 4.61e-01 0.0954 0.129 0.163 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -668807 sc-eQTL 9.52e-01 0.00759 0.126 0.163 B_Activated L2
ENSG00000162607 USP1 488617 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0312 0.137 0.163 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -598458 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0668 0.119 0.163 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 -668497 sc-eQTL 6.59e-01 -0.056 0.127 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 -442661 sc-eQTL 4.35e-01 -0.101 0.129 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000116641 DOCK7 236528 sc-eQTL 8.26e-01 -0.027 0.123 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000125703 ATG4C 140782 sc-eQTL 2.99e-01 0.108 0.104 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -668807 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0451 0.124 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000162607 USP1 488617 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0257 0.124 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -598458 sc-eQTL 4.58e-01 0.0912 0.123 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 -668497 sc-eQTL 6.19e-01 0.0606 0.121 0.164 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 -442661 sc-eQTL 4.32e-02 -0.249 0.122 0.164 B_Memory L2
ENSG00000116641 DOCK7 236528 sc-eQTL 8.50e-02 -0.199 0.115 0.164 B_Memory L2
ENSG00000125703 ATG4C 140782 sc-eQTL 1.73e-01 -0.15 0.11 0.164 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -668807 sc-eQTL 3.09e-01 0.128 0.126 0.164 B_Memory L2
ENSG00000162607 USP1 488617 sc-eQTL 8.80e-01 0.0193 0.127 0.164 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -598458 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0968 0.125 0.164 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 -668497 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0304 0.125 0.162 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 -442661 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0537 0.125 0.162 B_Naive1 L2
ENSG00000116641 DOCK7 236528 sc-eQTL 7.87e-01 0.0325 0.12 0.162 B_Naive1 L2
ENSG00000125703 ATG4C 140782 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0183 0.0926 0.162 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -668807 sc-eQTL 2.54e-01 0.14 0.123 0.162 B_Naive1 L2
ENSG00000162607 USP1 488617 sc-eQTL 2.59e-02 0.24 0.107 0.162 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -598458 sc-eQTL 2.19e-02 0.299 0.129 0.162 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 -668497 sc-eQTL 3.31e-01 -0.12 0.123 0.163 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 -442661 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0497 0.128 0.163 B_Naive2 L2
ENSG00000116641 DOCK7 236528 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0674 0.123 0.163 B_Naive2 L2
ENSG00000125703 ATG4C 140782 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0426 0.119 0.163 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -668807 sc-eQTL 3.20e-01 0.128 0.129 0.163 B_Naive2 L2
ENSG00000162607 USP1 488617 sc-eQTL 7.84e-02 0.215 0.122 0.163 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -598458 sc-eQTL 6.46e-01 0.059 0.128 0.163 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 -668497 sc-eQTL 8.67e-02 0.218 0.127 0.164 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -442661 sc-eQTL 6.68e-01 -0.058 0.135 0.164 CD4_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 236528 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0921 0.118 0.164 CD4_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 140782 sc-eQTL 3.93e-02 0.251 0.121 0.164 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -668807 sc-eQTL 9.49e-01 0.00839 0.131 0.164 CD4_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 488617 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0142 0.124 0.164 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -598458 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0411 0.124 0.164 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -668497 sc-eQTL 7.67e-01 0.0302 0.102 0.162 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -442661 sc-eQTL 5.63e-01 -0.064 0.111 0.162 CD4_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 236528 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0102 0.109 0.162 CD4_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 140782 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00486 0.0962 0.162 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -668807 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0395 0.117 0.162 CD4_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 488617 sc-eQTL 1.73e-01 0.122 0.0894 0.162 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -598458 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0607 0.117 0.162 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -668497 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0305 0.105 0.162 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -442661 sc-eQTL 1.56e-01 0.172 0.121 0.162 CD4_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 236528 sc-eQTL 1.54e-01 -0.153 0.107 0.162 CD4_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 140782 sc-eQTL 2.58e-01 0.119 0.105 0.162 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -668807 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0536 0.124 0.162 CD4_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 488617 sc-eQTL 1.06e-01 0.164 0.101 0.162 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -598458 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0392 0.12 0.162 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -668497 sc-eQTL 5.95e-02 -0.23 0.121 0.162 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -442661 sc-eQTL 4.16e-01 0.0999 0.123 0.162 CD4_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 236528 sc-eQTL 2.25e-01 -0.145 0.119 0.162 CD4_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 140782 sc-eQTL 1.65e-01 -0.161 0.116 0.162 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -668807 sc-eQTL 8.03e-01 -0.03 0.12 0.162 CD4_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 488617 sc-eQTL 3.73e-02 -0.236 0.113 0.162 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -598458 sc-eQTL 8.94e-01 0.0165 0.124 0.162 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -668497 sc-eQTL 9.61e-01 0.00553 0.113 0.162 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -442661 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0806 0.12 0.162 CD8_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 236528 sc-eQTL 8.21e-01 0.0258 0.114 0.162 CD8_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 140782 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0683 0.122 0.162 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -668807 sc-eQTL 3.43e-01 0.12 0.126 0.162 CD8_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 488617 sc-eQTL 7.80e-01 0.0317 0.113 0.162 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -598458 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0397 0.13 0.162 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -668497 sc-eQTL 3.89e-01 0.0998 0.116 0.162 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -442661 sc-eQTL 2.48e-01 0.139 0.12 0.162 CD8_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 236528 sc-eQTL 3.66e-01 0.112 0.124 0.162 CD8_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 140782 sc-eQTL 2.99e-01 -0.124 0.119 0.162 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -668807 sc-eQTL 1.42e-01 -0.177 0.12 0.162 CD8_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 488617 sc-eQTL 9.99e-01 0.000143 0.102 0.162 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -598458 sc-eQTL 5.38e-01 0.07 0.114 0.162 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -668497 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0163 0.128 0.157 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -442661 sc-eQTL 1.79e-01 -0.174 0.129 0.157 CD8_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 236528 sc-eQTL 5.84e-01 0.0692 0.126 0.157 CD8_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 140782 sc-eQTL 2.26e-01 0.156 0.129 0.157 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -668807 sc-eQTL 6.28e-02 -0.233 0.124 0.157 CD8_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 488617 sc-eQTL 9.04e-01 0.0146 0.121 0.157 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -598458 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0465 0.128 0.157 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -668497 sc-eQTL 7.08e-01 0.0488 0.13 0.16 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -442661 sc-eQTL 4.04e-01 -0.109 0.13 0.16 CD8_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 236528 sc-eQTL 1.81e-02 0.297 0.125 0.16 CD8_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 140782 sc-eQTL 3.19e-01 -0.121 0.121 0.16 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -668807 sc-eQTL 1.63e-01 0.183 0.131 0.16 CD8_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 488617 sc-eQTL 7.29e-01 0.0436 0.126 0.16 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -598458 sc-eQTL 1.63e-01 0.178 0.127 0.16 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -668497 sc-eQTL 1.65e-01 0.168 0.121 0.162 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 -442661 sc-eQTL 3.56e-01 -0.111 0.12 0.162 MAIT L2
ENSG00000116641 DOCK7 236528 sc-eQTL 8.02e-01 0.0289 0.115 0.162 MAIT L2
ENSG00000125703 ATG4C 140782 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0465 0.121 0.162 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -668807 sc-eQTL 3.91e-01 -0.104 0.121 0.162 MAIT L2
ENSG00000162607 USP1 488617 sc-eQTL 9.33e-01 0.0101 0.12 0.162 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -598458 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0831 0.125 0.162 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 -668497 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0159 0.119 0.164 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 -442661 sc-eQTL 1.77e-01 0.165 0.122 0.164 NK_CD56bright L2
ENSG00000116641 DOCK7 236528 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00818 0.106 0.164 NK_CD56bright L2
ENSG00000125703 ATG4C 140782 sc-eQTL 9.61e-01 0.00574 0.118 0.164 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -668807 sc-eQTL 7.10e-01 0.0458 0.123 0.164 NK_CD56bright L2
ENSG00000162607 USP1 488617 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00631 0.127 0.164 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -598458 sc-eQTL 1.75e-01 0.165 0.121 0.164 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 -668497 sc-eQTL 2.78e-01 0.104 0.0954 0.164 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 -442661 sc-eQTL 8.55e-02 -0.208 0.121 0.164 NK_CD56dim L2
ENSG00000116641 DOCK7 236528 sc-eQTL 9.26e-01 0.00982 0.106 0.164 NK_CD56dim L2
ENSG00000125703 ATG4C 140782 sc-eQTL 9.64e-01 -0.0049 0.107 0.164 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -668807 sc-eQTL 2.70e-01 -0.135 0.122 0.164 NK_CD56dim L2
ENSG00000162607 USP1 488617 sc-eQTL 8.53e-01 0.022 0.118 0.164 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -598458 sc-eQTL 7.49e-01 0.0423 0.132 0.164 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 -668497 sc-eQTL 4.86e-01 0.093 0.133 0.164 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 -442661 sc-eQTL 3.10e-01 0.14 0.138 0.164 NK_HLA L2
ENSG00000116641 DOCK7 236528 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0692 0.106 0.164 NK_HLA L2
ENSG00000125703 ATG4C 140782 sc-eQTL 2.19e-01 0.151 0.122 0.164 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -668807 sc-eQTL 6.69e-02 -0.236 0.128 0.164 NK_HLA L2
ENSG00000162607 USP1 488617 sc-eQTL 1.82e-01 0.18 0.134 0.164 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -598458 sc-eQTL 2.48e-01 0.142 0.122 0.164 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 -668497 sc-eQTL 8.41e-01 0.0208 0.104 0.164 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 -442661 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0667 0.117 0.164 NK_cytokine L2
ENSG00000116641 DOCK7 236528 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0676 0.108 0.164 NK_cytokine L2
ENSG00000125703 ATG4C 140782 sc-eQTL 1.16e-01 0.174 0.11 0.164 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -668807 sc-eQTL 3.27e-01 -0.113 0.115 0.164 NK_cytokine L2
ENSG00000162607 USP1 488617 sc-eQTL 3.89e-01 0.104 0.121 0.164 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -598458 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0427 0.122 0.164 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 -668497 sc-eQTL 4.57e-01 0.102 0.137 0.174 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 -442661 sc-eQTL 3.65e-01 -0.131 0.144 0.174 PB L2
ENSG00000116641 DOCK7 236528 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0167 0.154 0.174 PB L2
ENSG00000125703 ATG4C 140782 sc-eQTL 8.76e-01 -0.021 0.134 0.174 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -668807 sc-eQTL 9.79e-02 -0.221 0.132 0.174 PB L2
ENSG00000162607 USP1 488617 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0555 0.133 0.174 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -598458 sc-eQTL 4.74e-01 -0.105 0.147 0.174 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 -668497 sc-eQTL 6.94e-01 0.0449 0.114 0.159 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 -442661 sc-eQTL 6.60e-01 0.051 0.116 0.159 Pro_T L2
ENSG00000116641 DOCK7 236528 sc-eQTL 9.24e-01 -0.011 0.116 0.159 Pro_T L2
ENSG00000125703 ATG4C 140782 sc-eQTL 6.55e-01 0.0455 0.102 0.159 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -668807 sc-eQTL 1.95e-01 0.132 0.102 0.159 Pro_T L2
ENSG00000162607 USP1 488617 sc-eQTL 1.48e-01 -0.101 0.0698 0.159 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -598458 sc-eQTL 9.30e-01 0.0105 0.119 0.159 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 -668497 sc-eQTL 5.54e-01 0.0703 0.119 0.162 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 -442661 sc-eQTL 1.20e-01 -0.198 0.126 0.162 Treg L2
ENSG00000116641 DOCK7 236528 sc-eQTL 2.71e-01 -0.128 0.116 0.162 Treg L2
ENSG00000125703 ATG4C 140782 sc-eQTL 3.14e-01 -0.12 0.119 0.162 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -668807 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0836 0.125 0.162 Treg L2
ENSG00000162607 USP1 488617 sc-eQTL 8.95e-02 0.204 0.12 0.162 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -598458 sc-eQTL 6.59e-01 0.0527 0.119 0.162 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 -668497 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0548 0.12 0.161 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -442661 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00205 0.121 0.161 cDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 236528 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0768 0.119 0.161 cDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 140782 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0354 0.104 0.161 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -668807 sc-eQTL 2.80e-01 0.142 0.131 0.161 cDC L2
ENSG00000162607 USP1 488617 sc-eQTL 5.76e-01 0.0654 0.117 0.161 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -598458 sc-eQTL 7.16e-01 0.0385 0.105 0.161 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 -668497 sc-eQTL 9.31e-02 -0.188 0.111 0.162 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 -442661 sc-eQTL 7.79e-01 0.0315 0.112 0.162 cMono_IL1B L2
ENSG00000116641 DOCK7 236528 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00617 0.118 0.162 cMono_IL1B L2
ENSG00000125703 ATG4C 140782 sc-eQTL 6.47e-02 0.153 0.0824 0.162 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -668807 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0271 0.118 0.162 cMono_IL1B L2
ENSG00000162607 USP1 488617 sc-eQTL 3.57e-01 0.0958 0.104 0.162 cMono_IL1B L2
ENSG00000240563 L1TD1 730065 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0667 0.104 0.162 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 -668497 sc-eQTL 1.06e-01 -0.2 0.123 0.162 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 -442661 sc-eQTL 4.75e-01 0.0896 0.125 0.162 cMono_S100A L2
ENSG00000116641 DOCK7 236528 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00273 0.116 0.162 cMono_S100A L2
ENSG00000125703 ATG4C 140782 sc-eQTL 2.49e-01 -0.116 0.1 0.162 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -668807 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0668 0.113 0.162 cMono_S100A L2
ENSG00000162607 USP1 488617 sc-eQTL 6.17e-01 0.0584 0.117 0.162 cMono_S100A L2
ENSG00000240563 L1TD1 730065 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0299 0.0972 0.162 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 -668497 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0458 0.133 0.176 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 -442661 sc-eQTL 7.13e-01 0.0523 0.142 0.176 gdT L2
ENSG00000116641 DOCK7 236528 sc-eQTL 2.68e-01 -0.154 0.139 0.176 gdT L2
ENSG00000125703 ATG4C 140782 sc-eQTL 9.87e-01 0.00217 0.133 0.176 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -668807 sc-eQTL 7.70e-01 0.0414 0.141 0.176 gdT L2
ENSG00000162607 USP1 488617 sc-eQTL 5.41e-01 0.0819 0.134 0.176 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -598458 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0922 0.139 0.176 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 -668497 sc-eQTL 8.51e-02 -0.214 0.123 0.164 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -442661 sc-eQTL 1.93e-01 -0.151 0.115 0.164 intMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 236528 sc-eQTL 2.87e-01 -0.126 0.118 0.164 intMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 140782 sc-eQTL 5.04e-01 0.0755 0.113 0.164 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -668807 sc-eQTL 8.08e-01 0.0302 0.124 0.164 intMono L2
ENSG00000162607 USP1 488617 sc-eQTL 2.45e-01 0.147 0.126 0.164 intMono L2
ENSG00000240563 L1TD1 730065 sc-eQTL 1.11e-01 0.148 0.0925 0.164 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -668497 sc-eQTL 1.94e-01 0.146 0.112 0.163 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -442661 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0829 0.123 0.163 ncMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 236528 sc-eQTL 4.15e-01 0.0991 0.121 0.163 ncMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 140782 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00235 0.113 0.163 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -668807 sc-eQTL 1.73e-01 0.162 0.118 0.163 ncMono L2
ENSG00000162607 USP1 488617 sc-eQTL 1.62e-01 0.169 0.121 0.163 ncMono L2
ENSG00000240563 L1TD1 730065 sc-eQTL 7.74e-01 0.0247 0.086 0.163 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -668497 sc-eQTL 2.65e-01 0.15 0.135 0.158 pDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -442661 sc-eQTL 1.66e-01 -0.182 0.131 0.158 pDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 236528 sc-eQTL 2.95e-01 0.141 0.134 0.158 pDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 140782 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00418 0.121 0.158 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -668807 sc-eQTL 1.13e-01 0.214 0.134 0.158 pDC L2
ENSG00000162607 USP1 488617 sc-eQTL 9.42e-01 -0.0101 0.138 0.158 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -598458 sc-eQTL 3.78e-01 -0.106 0.12 0.158 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -668497 sc-eQTL 4.92e-01 0.0799 0.116 0.162 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -442661 sc-eQTL 4.12e-01 -0.105 0.128 0.162 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 236528 sc-eQTL 3.18e-01 -0.111 0.111 0.162 B_Memory LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 140782 sc-eQTL 8.57e-01 0.0163 0.09 0.162 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -668807 sc-eQTL 6.35e-01 0.0561 0.118 0.162 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 488617 sc-eQTL 4.50e-01 0.0868 0.115 0.162 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -598458 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00676 0.123 0.162 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -668497 sc-eQTL 6.38e-01 -0.057 0.121 0.162 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -442661 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0603 0.125 0.162 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 236528 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0335 0.116 0.162 B_Naive LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 140782 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0522 0.0888 0.162 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -668807 sc-eQTL 1.15e-01 0.198 0.125 0.162 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 488617 sc-eQTL 8.36e-03 0.283 0.106 0.162 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -598458 sc-eQTL 2.97e-02 0.273 0.125 0.162 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -668497 sc-eQTL 3.98e-02 -0.235 0.114 0.162 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -442661 sc-eQTL 5.33e-01 0.0694 0.111 0.162 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 236528 sc-eQTL 9.41e-01 0.00835 0.112 0.162 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 140782 sc-eQTL 8.49e-01 0.0147 0.0774 0.162 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -668807 sc-eQTL 3.44e-01 -0.108 0.114 0.162 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 488617 sc-eQTL 3.12e-01 0.0988 0.0976 0.162 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000240563 L1TD1 730065 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0405 0.106 0.162 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -668497 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00174 0.108 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -442661 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0931 0.122 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 236528 sc-eQTL 2.28e-01 -0.146 0.121 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 140782 sc-eQTL 4.89e-01 0.0716 0.103 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -668807 sc-eQTL 4.77e-01 0.0853 0.12 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 488617 sc-eQTL 3.95e-02 0.231 0.112 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000240563 L1TD1 730065 sc-eQTL 5.16e-01 0.0501 0.0768 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -668497 sc-eQTL 3.01e-01 0.0967 0.0933 0.164 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -442661 sc-eQTL 2.24e-01 -0.137 0.112 0.164 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 236528 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0473 0.101 0.164 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 140782 sc-eQTL 2.93e-01 0.106 0.1 0.164 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -668807 sc-eQTL 9.87e-02 -0.196 0.118 0.164 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 488617 sc-eQTL 2.70e-01 0.119 0.108 0.164 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -598458 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00543 0.131 0.164 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000116641 DOCK7 236546 eQTL 8.08e-10 -0.204 0.0329 0.0 0.0 0.123
ENSG00000125703 ATG4C 140782 eQTL 0.0196 -0.0595 0.0254 0.0 0.0 0.123
ENSG00000132855 ANGPTL3 327427 pQTL 0.00489 -0.12 0.0426 0.0 0.0 0.132
ENSG00000162607 USP1 488617 eQTL 0.00728 -0.0523 0.0195 0.0 0.0 0.123

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000116641 DOCK7 236546 1.63e-06 1.66e-06 2.17e-07 1.28e-06 4.72e-07 6.4e-07 1.25e-06 3.75e-07 1.72e-06 7.13e-07 1.97e-06 1.25e-06 2.64e-06 4.66e-07 3.44e-07 1.02e-06 1.15e-06 1.18e-06 5.93e-07 5.9e-07 6.44e-07 1.88e-06 1.42e-06 8.07e-07 2.43e-06 8.82e-07 1e-06 1.07e-06 1.7e-06 1.31e-06 8.15e-07 2.62e-07 2.88e-07 6.17e-07 7.08e-07 6.14e-07 7.4e-07 3.48e-07 5.39e-07 2.09e-07 2.88e-07 2.13e-06 2.91e-07 1.38e-07 4.11e-07 3.02e-07 3.78e-07 1.45e-07 2.6e-07