logo

Genes within 1Mb (chr1:62918621:T:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -674790 sc-eQTL 9.68e-01 0.00381 0.0938 0.222 B L1
ENSG00000088035 ALG6 -448954 sc-eQTL 3.12e-01 -0.0982 0.097 0.222 B L1
ENSG00000116641 DOCK7 230235 sc-eQTL 2.43e-01 0.113 0.0969 0.222 B L1
ENSG00000125703 ATG4C 134489 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00316 0.0676 0.222 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -675100 sc-eQTL 4.42e-01 0.0828 0.107 0.222 B L1
ENSG00000162607 USP1 482324 sc-eQTL 1.21e-01 0.144 0.0928 0.222 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -604751 sc-eQTL 4.74e-02 0.218 0.109 0.222 B L1
ENSG00000079739 PGM1 -674790 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00301 0.0802 0.222 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 -448954 sc-eQTL 4.53e-01 0.0665 0.0884 0.222 CD4T L1
ENSG00000116641 DOCK7 230235 sc-eQTL 3.78e-01 -0.079 0.0895 0.222 CD4T L1
ENSG00000125703 ATG4C 134489 sc-eQTL 4.07e-01 0.0601 0.0723 0.222 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -675100 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0371 0.103 0.222 CD4T L1
ENSG00000162607 USP1 482324 sc-eQTL 4.27e-01 0.0557 0.0701 0.222 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -604751 sc-eQTL 9.01e-01 0.0115 0.0922 0.222 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 -674790 sc-eQTL 4.87e-01 0.0618 0.0887 0.222 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 -448954 sc-eQTL 6.16e-01 0.0491 0.0979 0.222 CD8T L1
ENSG00000116641 DOCK7 230235 sc-eQTL 4.15e-01 0.0808 0.0991 0.222 CD8T L1
ENSG00000125703 ATG4C 134489 sc-eQTL 1.52e-01 -0.135 0.0938 0.222 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -675100 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0157 0.105 0.222 CD8T L1
ENSG00000162607 USP1 482324 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0224 0.0821 0.222 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -604751 sc-eQTL 4.03e-01 0.0879 0.105 0.222 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 -674790 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0128 0.0997 0.221 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 -448954 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0694 0.103 0.221 DC L1
ENSG00000116641 DOCK7 230235 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0409 0.105 0.221 DC L1
ENSG00000125703 ATG4C 134489 sc-eQTL 2.51e-01 -0.0947 0.0823 0.221 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -675100 sc-eQTL 3.40e-01 0.11 0.115 0.221 DC L1
ENSG00000162607 USP1 482324 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0281 0.101 0.221 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -604751 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0309 0.1 0.221 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 -674790 sc-eQTL 2.50e-01 -0.11 0.0956 0.222 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 -448954 sc-eQTL 3.30e-01 0.0975 0.0998 0.222 Mono L1
ENSG00000116641 DOCK7 230235 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0474 0.0967 0.222 Mono L1
ENSG00000125703 ATG4C 134489 sc-eQTL 9.38e-01 0.00506 0.0654 0.222 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -675100 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0199 0.103 0.222 Mono L1
ENSG00000162607 USP1 482324 sc-eQTL 1.44e-01 0.124 0.0844 0.222 Mono L1
ENSG00000240563 L1TD1 723772 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0173 0.0792 0.222 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 -674790 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00375 0.0811 0.223 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 -448954 sc-eQTL 4.00e-01 -0.0801 0.0949 0.223 NK L1
ENSG00000116641 DOCK7 230235 sc-eQTL 4.67e-01 -0.057 0.0782 0.223 NK L1
ENSG00000125703 ATG4C 134489 sc-eQTL 6.59e-01 0.0372 0.084 0.223 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -675100 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0552 0.104 0.223 NK L1
ENSG00000162607 USP1 482324 sc-eQTL 5.14e-01 0.0611 0.0933 0.223 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -604751 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0284 0.113 0.223 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 -674790 sc-eQTL 4.06e-01 0.0767 0.0921 0.222 Other_T L1
ENSG00000088035 ALG6 -448954 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00527 0.0927 0.222 Other_T L1
ENSG00000116641 DOCK7 230235 sc-eQTL 6.48e-01 0.0433 0.0946 0.222 Other_T L1
ENSG00000125703 ATG4C 134489 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0129 0.0819 0.222 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -675100 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00132 0.0726 0.222 Other_T L1
ENSG00000162607 USP1 482324 sc-eQTL 9.51e-01 0.0039 0.063 0.222 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -604751 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0273 0.112 0.222 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -674790 sc-eQTL 7.56e-01 0.0385 0.123 0.214 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 -448954 sc-eQTL 2.07e-01 0.149 0.118 0.214 B_Activated L2
ENSG00000116641 DOCK7 230235 sc-eQTL 7.63e-01 0.0333 0.11 0.214 B_Activated L2
ENSG00000125703 ATG4C 134489 sc-eQTL 9.95e-01 0.000675 0.116 0.214 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -675100 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0577 0.113 0.214 B_Activated L2
ENSG00000162607 USP1 482324 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0725 0.123 0.214 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -604751 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0156 0.107 0.214 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 -674790 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000528 0.112 0.221 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 -448954 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0721 0.114 0.221 B_Intermediate L2
ENSG00000116641 DOCK7 230235 sc-eQTL 5.19e-01 0.0703 0.109 0.221 B_Intermediate L2
ENSG00000125703 ATG4C 134489 sc-eQTL 4.76e-01 0.0657 0.0921 0.221 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -675100 sc-eQTL 6.49e-01 0.05 0.11 0.221 B_Intermediate L2
ENSG00000162607 USP1 482324 sc-eQTL 2.62e-01 -0.123 0.109 0.221 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -604751 sc-eQTL 8.80e-01 0.0164 0.109 0.221 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 -674790 sc-eQTL 8.29e-01 0.0235 0.108 0.224 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 -448954 sc-eQTL 9.33e-02 -0.185 0.11 0.224 B_Memory L2
ENSG00000116641 DOCK7 230235 sc-eQTL 2.99e-01 -0.107 0.103 0.224 B_Memory L2
ENSG00000125703 ATG4C 134489 sc-eQTL 3.60e-01 -0.0901 0.0981 0.224 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -675100 sc-eQTL 2.93e-01 0.118 0.112 0.224 B_Memory L2
ENSG00000162607 USP1 482324 sc-eQTL 2.73e-01 -0.124 0.113 0.224 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -604751 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0677 0.112 0.224 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 -674790 sc-eQTL 8.17e-01 0.0257 0.111 0.222 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 -448954 sc-eQTL 7.65e-01 0.0332 0.111 0.222 B_Naive1 L2
ENSG00000116641 DOCK7 230235 sc-eQTL 5.19e-01 0.0687 0.106 0.222 B_Naive1 L2
ENSG00000125703 ATG4C 134489 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0405 0.082 0.222 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -675100 sc-eQTL 8.25e-01 0.0241 0.109 0.222 B_Naive1 L2
ENSG00000162607 USP1 482324 sc-eQTL 5.52e-03 0.263 0.0939 0.222 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -604751 sc-eQTL 1.23e-01 0.179 0.115 0.222 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 -674790 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0586 0.11 0.223 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 -448954 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0293 0.115 0.223 B_Naive2 L2
ENSG00000116641 DOCK7 230235 sc-eQTL 7.50e-01 0.0352 0.11 0.223 B_Naive2 L2
ENSG00000125703 ATG4C 134489 sc-eQTL 7.36e-01 0.0358 0.106 0.223 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -675100 sc-eQTL 3.94e-01 0.0982 0.115 0.223 B_Naive2 L2
ENSG00000162607 USP1 482324 sc-eQTL 1.27e-02 0.271 0.108 0.223 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -604751 sc-eQTL 4.30e-02 0.231 0.113 0.223 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 -674790 sc-eQTL 3.56e-02 0.242 0.114 0.223 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -448954 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00686 0.122 0.223 CD4_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 230235 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0467 0.107 0.223 CD4_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 134489 sc-eQTL 2.78e-01 0.12 0.11 0.223 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -675100 sc-eQTL 6.91e-01 0.047 0.118 0.223 CD4_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 482324 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0585 0.112 0.223 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -604751 sc-eQTL 5.77e-01 0.0626 0.112 0.223 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -674790 sc-eQTL 4.60e-01 0.0665 0.0897 0.222 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -448954 sc-eQTL 9.08e-01 0.0113 0.0976 0.222 CD4_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 230235 sc-eQTL 2.28e-01 0.115 0.0956 0.222 CD4_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 134489 sc-eQTL 9.67e-01 0.00352 0.0848 0.222 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -675100 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0457 0.104 0.222 CD4_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 482324 sc-eQTL 1.70e-01 0.108 0.0788 0.222 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -604751 sc-eQTL 9.07e-01 -0.012 0.103 0.222 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -674790 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0419 0.0925 0.222 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -448954 sc-eQTL 1.58e-01 0.152 0.107 0.222 CD4_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 230235 sc-eQTL 1.02e-01 -0.155 0.0947 0.222 CD4_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 134489 sc-eQTL 7.26e-02 0.166 0.0921 0.222 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -675100 sc-eQTL 9.53e-01 -0.0064 0.109 0.222 CD4_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 482324 sc-eQTL 2.11e-01 0.112 0.0893 0.222 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -604751 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0195 0.106 0.222 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -674790 sc-eQTL 3.93e-01 -0.0934 0.109 0.222 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -448954 sc-eQTL 2.32e-01 0.131 0.11 0.222 CD4_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 230235 sc-eQTL 3.89e-01 -0.0923 0.107 0.222 CD4_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 134489 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00949 0.104 0.222 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -675100 sc-eQTL 9.46e-01 0.00725 0.107 0.222 CD4_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 482324 sc-eQTL 3.83e-02 -0.21 0.101 0.222 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -604751 sc-eQTL 8.43e-01 0.022 0.111 0.222 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -674790 sc-eQTL 9.65e-01 0.00443 0.0999 0.222 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -448954 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0447 0.106 0.222 CD8_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 230235 sc-eQTL 5.95e-01 0.0537 0.101 0.222 CD8_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 134489 sc-eQTL 3.10e-01 -0.109 0.107 0.222 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -675100 sc-eQTL 2.58e-01 0.126 0.111 0.222 CD8_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 482324 sc-eQTL 9.57e-01 -0.0054 0.1 0.222 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -604751 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0299 0.114 0.222 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -674790 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0589 0.102 0.222 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -448954 sc-eQTL 1.42e-01 0.156 0.106 0.222 CD8_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 230235 sc-eQTL 1.74e-01 0.149 0.109 0.222 CD8_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 134489 sc-eQTL 5.99e-02 -0.198 0.104 0.222 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -675100 sc-eQTL 3.11e-01 -0.108 0.106 0.222 CD8_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 482324 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0184 0.0901 0.222 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -604751 sc-eQTL 9.24e-01 0.00959 0.101 0.222 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -674790 sc-eQTL 9.35e-01 -0.00921 0.112 0.22 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -448954 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0245 0.114 0.22 CD8_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 230235 sc-eQTL 4.53e-01 0.0835 0.111 0.22 CD8_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 134489 sc-eQTL 7.75e-02 0.2 0.113 0.22 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -675100 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0882 0.11 0.22 CD8_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 482324 sc-eQTL 2.46e-01 -0.123 0.106 0.22 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -604751 sc-eQTL 1.81e-01 -0.151 0.112 0.22 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -674790 sc-eQTL 8.32e-01 0.0244 0.115 0.224 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -448954 sc-eQTL 4.77e-01 -0.0823 0.116 0.224 CD8_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 230235 sc-eQTL 9.14e-02 0.189 0.111 0.224 CD8_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 134489 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0701 0.108 0.224 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -675100 sc-eQTL 4.36e-01 0.0909 0.117 0.224 CD8_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 482324 sc-eQTL 8.73e-01 0.0179 0.111 0.224 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -604751 sc-eQTL 5.84e-02 0.213 0.112 0.224 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -674790 sc-eQTL 1.95e-02 0.249 0.106 0.223 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 -448954 sc-eQTL 3.15e-01 -0.107 0.106 0.223 MAIT L2
ENSG00000116641 DOCK7 230235 sc-eQTL 8.25e-01 0.0225 0.102 0.223 MAIT L2
ENSG00000125703 ATG4C 134489 sc-eQTL 9.68e-01 0.00432 0.107 0.223 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -675100 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0572 0.108 0.223 MAIT L2
ENSG00000162607 USP1 482324 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0406 0.107 0.223 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -604751 sc-eQTL 2.89e-01 -0.117 0.11 0.223 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 -674790 sc-eQTL 6.03e-01 0.0553 0.106 0.224 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 -448954 sc-eQTL 1.57e-01 0.154 0.108 0.224 NK_CD56bright L2
ENSG00000116641 DOCK7 230235 sc-eQTL 5.51e-01 0.0563 0.0943 0.224 NK_CD56bright L2
ENSG00000125703 ATG4C 134489 sc-eQTL 6.35e-01 0.0501 0.105 0.224 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -675100 sc-eQTL 6.11e-01 0.056 0.11 0.224 NK_CD56bright L2
ENSG00000162607 USP1 482324 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0164 0.113 0.224 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -604751 sc-eQTL 5.87e-01 0.059 0.108 0.224 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 -674790 sc-eQTL 8.16e-01 0.0197 0.0846 0.224 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 -448954 sc-eQTL 4.52e-02 -0.214 0.106 0.224 NK_CD56dim L2
ENSG00000116641 DOCK7 230235 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0231 0.0934 0.224 NK_CD56dim L2
ENSG00000125703 ATG4C 134489 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00208 0.0949 0.224 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -675100 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00614 0.108 0.224 NK_CD56dim L2
ENSG00000162607 USP1 482324 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000287 0.105 0.224 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -604751 sc-eQTL 9.49e-01 0.00749 0.117 0.224 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 -674790 sc-eQTL 8.69e-01 0.0197 0.119 0.224 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 -448954 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0335 0.123 0.224 NK_HLA L2
ENSG00000116641 DOCK7 230235 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0662 0.0942 0.224 NK_HLA L2
ENSG00000125703 ATG4C 134489 sc-eQTL 2.96e-01 0.115 0.109 0.224 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -675100 sc-eQTL 1.32e-01 -0.173 0.115 0.224 NK_HLA L2
ENSG00000162607 USP1 482324 sc-eQTL 1.85e-01 0.16 0.12 0.224 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -604751 sc-eQTL 5.21e-01 0.0705 0.11 0.224 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 -674790 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00322 0.0918 0.224 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 -448954 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0826 0.104 0.224 NK_cytokine L2
ENSG00000116641 DOCK7 230235 sc-eQTL 8.27e-01 -0.021 0.0961 0.224 NK_cytokine L2
ENSG00000125703 ATG4C 134489 sc-eQTL 1.66e-01 0.136 0.0979 0.224 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -675100 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0602 0.102 0.224 NK_cytokine L2
ENSG00000162607 USP1 482324 sc-eQTL 7.48e-01 0.0344 0.107 0.224 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -604751 sc-eQTL 2.05e-01 -0.137 0.108 0.224 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 -674790 sc-eQTL 3.97e-01 0.105 0.123 0.222 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 -448954 sc-eQTL 3.51e-01 -0.121 0.13 0.222 PB L2
ENSG00000116641 DOCK7 230235 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0602 0.139 0.222 PB L2
ENSG00000125703 ATG4C 134489 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0397 0.121 0.222 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -675100 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0865 0.121 0.222 PB L2
ENSG00000162607 USP1 482324 sc-eQTL 3.51e-01 -0.112 0.12 0.222 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -604751 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0524 0.133 0.222 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 -674790 sc-eQTL 3.90e-01 0.0873 0.101 0.22 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 -448954 sc-eQTL 8.89e-01 0.0144 0.103 0.22 Pro_T L2
ENSG00000116641 DOCK7 230235 sc-eQTL 8.02e-01 -0.026 0.104 0.22 Pro_T L2
ENSG00000125703 ATG4C 134489 sc-eQTL 7.87e-01 0.0245 0.0908 0.22 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -675100 sc-eQTL 1.90e-01 0.119 0.0907 0.22 Pro_T L2
ENSG00000162607 USP1 482324 sc-eQTL 1.30e-01 -0.0945 0.0623 0.22 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -604751 sc-eQTL 6.91e-01 0.0421 0.106 0.22 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 -674790 sc-eQTL 5.41e-01 0.0655 0.107 0.222 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 -448954 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0958 0.114 0.222 Treg L2
ENSG00000116641 DOCK7 230235 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0618 0.105 0.222 Treg L2
ENSG00000125703 ATG4C 134489 sc-eQTL 1.91e-01 -0.14 0.107 0.222 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -675100 sc-eQTL 3.13e-01 -0.113 0.112 0.222 Treg L2
ENSG00000162607 USP1 482324 sc-eQTL 2.14e-01 0.135 0.108 0.222 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -604751 sc-eQTL 5.56e-01 0.0633 0.107 0.222 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 -674790 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0118 0.105 0.227 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -448954 sc-eQTL 4.70e-01 0.0772 0.107 0.227 cDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 230235 sc-eQTL 2.15e-01 -0.13 0.104 0.227 cDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 134489 sc-eQTL 3.00e-01 -0.0944 0.0908 0.227 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -675100 sc-eQTL 2.43e-01 0.135 0.115 0.227 cDC L2
ENSG00000162607 USP1 482324 sc-eQTL 5.38e-01 0.0634 0.103 0.227 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -604751 sc-eQTL 2.47e-01 0.107 0.0924 0.227 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 -674790 sc-eQTL 3.46e-01 -0.0936 0.0992 0.222 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 -448954 sc-eQTL 5.78e-01 0.0553 0.0994 0.222 cMono_IL1B L2
ENSG00000116641 DOCK7 230235 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0116 0.105 0.222 cMono_IL1B L2
ENSG00000125703 ATG4C 134489 sc-eQTL 1.78e-01 0.0993 0.0734 0.222 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -675100 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00662 0.104 0.222 cMono_IL1B L2
ENSG00000162607 USP1 482324 sc-eQTL 7.53e-01 0.029 0.0921 0.222 cMono_IL1B L2
ENSG00000240563 L1TD1 723772 sc-eQTL 4.48e-02 -0.185 0.0917 0.222 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 -674790 sc-eQTL 1.66e-01 -0.153 0.11 0.222 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 -448954 sc-eQTL 7.83e-02 0.196 0.111 0.222 cMono_S100A L2
ENSG00000116641 DOCK7 230235 sc-eQTL 6.79e-01 0.0429 0.103 0.222 cMono_S100A L2
ENSG00000125703 ATG4C 134489 sc-eQTL 1.81e-01 -0.12 0.0892 0.222 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -675100 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0217 0.101 0.222 cMono_S100A L2
ENSG00000162607 USP1 482324 sc-eQTL 3.71e-01 0.0931 0.104 0.222 cMono_S100A L2
ENSG00000240563 L1TD1 723772 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0435 0.0865 0.222 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 -674790 sc-eQTL 2.03e-01 -0.153 0.12 0.245 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 -448954 sc-eQTL 2.49e-01 0.148 0.128 0.245 gdT L2
ENSG00000116641 DOCK7 230235 sc-eQTL 7.69e-01 -0.037 0.126 0.245 gdT L2
ENSG00000125703 ATG4C 134489 sc-eQTL 3.74e-01 0.107 0.12 0.245 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -675100 sc-eQTL 5.27e-01 0.081 0.128 0.245 gdT L2
ENSG00000162607 USP1 482324 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0198 0.121 0.245 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -604751 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0463 0.126 0.245 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 -674790 sc-eQTL 7.79e-02 -0.197 0.111 0.227 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -448954 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0769 0.104 0.227 intMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 230235 sc-eQTL 1.79e-01 -0.143 0.106 0.227 intMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 134489 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00323 0.102 0.227 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -675100 sc-eQTL 5.17e-01 0.0727 0.112 0.227 intMono L2
ENSG00000162607 USP1 482324 sc-eQTL 1.37e-02 0.279 0.112 0.227 intMono L2
ENSG00000240563 L1TD1 723772 sc-eQTL 1.35e-01 0.125 0.0834 0.227 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -674790 sc-eQTL 3.34e-01 0.0966 0.0998 0.226 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -448954 sc-eQTL 2.20e-01 -0.135 0.11 0.226 ncMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 230235 sc-eQTL 5.73e-01 0.061 0.108 0.226 ncMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 134489 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0158 0.101 0.226 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -675100 sc-eQTL 1.85e-01 0.14 0.105 0.226 ncMono L2
ENSG00000162607 USP1 482324 sc-eQTL 1.18e-01 0.169 0.107 0.226 ncMono L2
ENSG00000240563 L1TD1 723772 sc-eQTL 2.75e-01 0.0836 0.0764 0.226 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -674790 sc-eQTL 3.42e-01 0.115 0.121 0.223 pDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -448954 sc-eQTL 1.50e-01 -0.169 0.117 0.223 pDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 230235 sc-eQTL 5.30e-01 0.0756 0.12 0.223 pDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 134489 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0677 0.108 0.223 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -675100 sc-eQTL 7.46e-01 0.0393 0.121 0.223 pDC L2
ENSG00000162607 USP1 482324 sc-eQTL 4.13e-01 -0.101 0.123 0.223 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -604751 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0492 0.107 0.223 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -674790 sc-eQTL 4.50e-01 0.0786 0.104 0.222 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -448954 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0626 0.115 0.222 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 230235 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0141 0.0998 0.222 B_Memory LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 134489 sc-eQTL 9.35e-01 -0.00657 0.0806 0.222 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -675100 sc-eQTL 4.01e-01 0.089 0.106 0.222 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 482324 sc-eQTL 2.71e-01 -0.113 0.103 0.222 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -604751 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0296 0.11 0.222 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -674790 sc-eQTL 9.84e-01 0.00214 0.108 0.222 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -448954 sc-eQTL 9.88e-01 0.00164 0.111 0.222 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 230235 sc-eQTL 4.71e-01 0.0746 0.103 0.222 B_Naive LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 134489 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0326 0.0789 0.222 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -675100 sc-eQTL 3.73e-01 0.0995 0.111 0.222 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 482324 sc-eQTL 6.68e-04 0.322 0.0933 0.222 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -604751 sc-eQTL 1.03e-02 0.286 0.11 0.222 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -674790 sc-eQTL 1.92e-01 -0.133 0.102 0.222 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -448954 sc-eQTL 1.39e-01 0.146 0.0982 0.222 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 230235 sc-eQTL 9.00e-01 0.0125 0.0994 0.222 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 134489 sc-eQTL 9.43e-01 -0.0049 0.0687 0.222 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -675100 sc-eQTL 4.98e-01 -0.069 0.102 0.222 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 482324 sc-eQTL 5.11e-01 0.0572 0.0868 0.222 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000240563 L1TD1 723772 sc-eQTL 1.05e-01 -0.152 0.0936 0.222 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -674790 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00538 0.0961 0.222 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -448954 sc-eQTL 2.51e-01 -0.125 0.109 0.222 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 230235 sc-eQTL 2.42e-01 -0.126 0.108 0.222 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 134489 sc-eQTL 9.11e-01 0.0103 0.0921 0.222 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -675100 sc-eQTL 1.76e-01 0.145 0.106 0.222 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 482324 sc-eQTL 7.05e-03 0.269 0.0987 0.222 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000240563 L1TD1 723772 sc-eQTL 1.18e-01 0.107 0.0681 0.222 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -674790 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00435 0.0824 0.224 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -448954 sc-eQTL 1.08e-01 -0.159 0.0983 0.224 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 230235 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0486 0.0886 0.224 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 134489 sc-eQTL 5.03e-01 0.0594 0.0884 0.224 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -675100 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0738 0.105 0.224 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 482324 sc-eQTL 3.79e-01 0.0837 0.095 0.224 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -604751 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0722 0.116 0.224 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000116641 DOCK7 230253 eQTL 2.24e-09 -0.163 0.0269 0.0 0.0 0.199
ENSG00000125703 ATG4C 134489 eQTL 0.00081 -0.0696 0.0207 0.0 0.0 0.199
ENSG00000132855 ANGPTL3 321134 pQTL 0.036 -0.0744 0.0355 0.0 0.0 0.208
ENSG00000162607 USP1 482324 eQTL 0.00743 -0.0427 0.0159 0.0 0.0 0.199

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000116641 DOCK7 230253 1.93e-06 2.1e-06 2.72e-07 1.44e-06 4.78e-07 6.96e-07 1.34e-06 5.97e-07 1.63e-06 7.42e-07 1.83e-06 1.46e-06 3.11e-06 7.13e-07 4.99e-07 1.19e-06 9.51e-07 1.42e-06 6.7e-07 1.05e-06 8.12e-07 2.25e-06 1.82e-06 1.02e-06 2.52e-06 1.21e-06 1.13e-06 1.3e-06 1.69e-06 1.64e-06 7.71e-07 3.23e-07 4.59e-07 1.14e-06 8.99e-07 7.45e-07 8.1e-07 4.41e-07 9.25e-07 3.48e-07 1.51e-07 2.77e-06 4.11e-07 1.99e-07 3.5e-07 3.19e-07 6.27e-07 2.34e-07 2.41e-07
ENSG00000125703 ATG4C 134489 4.54e-06 4.81e-06 6.9e-07 2.79e-06 1.59e-06 1.57e-06 4.31e-06 1.07e-06 5.17e-06 2.41e-06 4.99e-06 3.54e-06 7.09e-06 2.38e-06 1.43e-06 3.81e-06 1.83e-06 3.52e-06 1.57e-06 1.15e-06 3.09e-06 4.93e-06 4.24e-06 1.53e-06 5.89e-06 1.98e-06 2.49e-06 1.87e-06 4.53e-06 4.18e-06 2.72e-06 4.16e-07 4.82e-07 1.62e-06 2.2e-06 1.15e-06 1.1e-06 4.57e-07 8.54e-07 5.31e-07 7.78e-07 5.59e-06 4.02e-07 1.59e-07 6.67e-07 7.78e-07 1.13e-06 6.91e-07 4.38e-07