logo

Genes within 1Mb (chr1:62903005:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -690406 sc-eQTL 2.30e-01 0.172 0.143 0.079 B L1
ENSG00000088035 ALG6 -464570 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000571 0.149 0.079 B L1
ENSG00000116641 DOCK7 214619 sc-eQTL 1.66e-01 0.206 0.148 0.079 B L1
ENSG00000125703 ATG4C 118873 sc-eQTL 6.22e-01 -0.051 0.103 0.079 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -690716 sc-eQTL 7.03e-01 0.0628 0.164 0.079 B L1
ENSG00000162607 USP1 466708 sc-eQTL 7.46e-01 0.0462 0.143 0.079 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -620367 sc-eQTL 4.94e-01 -0.115 0.168 0.079 B L1
ENSG00000079739 PGM1 -690406 sc-eQTL 6.19e-02 0.233 0.124 0.079 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 -464570 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0298 0.138 0.079 CD4T L1
ENSG00000116641 DOCK7 214619 sc-eQTL 1.04e-01 0.227 0.139 0.079 CD4T L1
ENSG00000125703 ATG4C 118873 sc-eQTL 6.96e-02 0.204 0.112 0.079 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -690716 sc-eQTL 6.43e-01 0.0745 0.16 0.079 CD4T L1
ENSG00000162607 USP1 466708 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0253 0.11 0.079 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -620367 sc-eQTL 2.88e-01 0.153 0.144 0.079 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 -690406 sc-eQTL 6.14e-01 0.0695 0.138 0.079 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 -464570 sc-eQTL 9.59e-01 0.00783 0.152 0.079 CD8T L1
ENSG00000116641 DOCK7 214619 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0745 0.154 0.079 CD8T L1
ENSG00000125703 ATG4C 118873 sc-eQTL 4.90e-02 -0.287 0.145 0.079 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -690716 sc-eQTL 1.23e-01 0.252 0.163 0.079 CD8T L1
ENSG00000162607 USP1 466708 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0804 0.127 0.079 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -620367 sc-eQTL 4.56e-01 -0.121 0.163 0.079 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 -690406 sc-eQTL 8.21e-01 0.0341 0.15 0.081 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 -464570 sc-eQTL 9.12e-01 0.0172 0.155 0.081 DC L1
ENSG00000116641 DOCK7 214619 sc-eQTL 2.38e-01 -0.187 0.158 0.081 DC L1
ENSG00000125703 ATG4C 118873 sc-eQTL 2.65e-01 -0.138 0.124 0.081 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -690716 sc-eQTL 2.05e-01 -0.22 0.173 0.081 DC L1
ENSG00000162607 USP1 466708 sc-eQTL 4.77e-01 -0.108 0.152 0.081 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -620367 sc-eQTL 4.59e-01 0.112 0.151 0.081 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 -690406 sc-eQTL 2.66e-01 0.167 0.149 0.079 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 -464570 sc-eQTL 1.87e-02 0.366 0.154 0.079 Mono L1
ENSG00000116641 DOCK7 214619 sc-eQTL 9.39e-01 0.0115 0.151 0.079 Mono L1
ENSG00000125703 ATG4C 118873 sc-eQTL 2.81e-01 -0.11 0.102 0.079 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -690716 sc-eQTL 5.21e-01 0.104 0.161 0.079 Mono L1
ENSG00000162607 USP1 466708 sc-eQTL 4.49e-01 -0.1 0.132 0.079 Mono L1
ENSG00000240563 L1TD1 708156 sc-eQTL 7.05e-01 0.0468 0.124 0.079 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 -690406 sc-eQTL 9.99e-02 -0.211 0.127 0.079 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 -464570 sc-eQTL 7.59e-02 -0.266 0.149 0.079 NK L1
ENSG00000116641 DOCK7 214619 sc-eQTL 6.51e-01 0.0561 0.124 0.079 NK L1
ENSG00000125703 ATG4C 118873 sc-eQTL 3.12e-02 -0.285 0.131 0.079 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -690716 sc-eQTL 1.34e-01 0.247 0.164 0.079 NK L1
ENSG00000162607 USP1 466708 sc-eQTL 9.95e-01 0.000984 0.148 0.079 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -620367 sc-eQTL 8.06e-01 0.0442 0.179 0.079 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 -690406 sc-eQTL 5.35e-01 0.0896 0.144 0.079 Other_T L1
ENSG00000088035 ALG6 -464570 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0424 0.145 0.079 Other_T L1
ENSG00000116641 DOCK7 214619 sc-eQTL 7.05e-01 -0.056 0.148 0.079 Other_T L1
ENSG00000125703 ATG4C 118873 sc-eQTL 7.62e-01 0.0388 0.128 0.079 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -690716 sc-eQTL 7.87e-01 0.0307 0.114 0.079 Other_T L1
ENSG00000162607 USP1 466708 sc-eQTL 1.18e-01 -0.154 0.0979 0.079 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -620367 sc-eQTL 8.59e-01 0.0313 0.175 0.079 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -690406 sc-eQTL 8.50e-01 0.038 0.201 0.074 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 -464570 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00728 0.193 0.074 B_Activated L2
ENSG00000116641 DOCK7 214619 sc-eQTL 3.72e-01 0.16 0.179 0.074 B_Activated L2
ENSG00000125703 ATG4C 118873 sc-eQTL 4.51e-01 -0.142 0.189 0.074 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -690716 sc-eQTL 2.60e-01 -0.208 0.184 0.074 B_Activated L2
ENSG00000162607 USP1 466708 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0668 0.2 0.074 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -620367 sc-eQTL 7.19e-01 0.0629 0.175 0.074 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 -690406 sc-eQTL 4.32e-01 0.134 0.171 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 -464570 sc-eQTL 5.09e-01 -0.115 0.173 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000116641 DOCK7 214619 sc-eQTL 2.43e-01 0.193 0.165 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000125703 ATG4C 118873 sc-eQTL 2.86e-01 -0.15 0.14 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -690716 sc-eQTL 3.49e-01 0.156 0.167 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000162607 USP1 466708 sc-eQTL 1.43e-01 -0.244 0.166 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -620367 sc-eQTL 1.12e-01 -0.263 0.165 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 -690406 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0909 0.167 0.08 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 -464570 sc-eQTL 3.38e-01 0.163 0.17 0.08 B_Memory L2
ENSG00000116641 DOCK7 214619 sc-eQTL 7.84e-01 0.0438 0.159 0.08 B_Memory L2
ENSG00000125703 ATG4C 118873 sc-eQTL 1.19e-01 0.236 0.151 0.08 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -690716 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0816 0.173 0.08 B_Memory L2
ENSG00000162607 USP1 466708 sc-eQTL 9.84e-02 -0.289 0.174 0.08 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -620367 sc-eQTL 7.11e-01 0.0638 0.172 0.08 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 -690406 sc-eQTL 4.23e-02 0.345 0.169 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 -464570 sc-eQTL 5.50e-01 0.102 0.171 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000116641 DOCK7 214619 sc-eQTL 6.19e-01 0.0818 0.164 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000125703 ATG4C 118873 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0965 0.126 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -690716 sc-eQTL 5.26e-01 -0.106 0.168 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000162607 USP1 466708 sc-eQTL 7.54e-02 0.262 0.146 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -620367 sc-eQTL 4.65e-01 -0.131 0.179 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 -690406 sc-eQTL 1.95e-01 0.221 0.17 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 -464570 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0369 0.178 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000116641 DOCK7 214619 sc-eQTL 8.73e-01 0.0273 0.171 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000125703 ATG4C 118873 sc-eQTL 9.52e-01 0.00996 0.165 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -690716 sc-eQTL 4.35e-01 0.14 0.178 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000162607 USP1 466708 sc-eQTL 3.13e-01 0.172 0.17 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -620367 sc-eQTL 6.10e-01 0.0906 0.178 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 -690406 sc-eQTL 4.55e-01 0.13 0.173 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -464570 sc-eQTL 6.64e-01 0.0799 0.183 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 214619 sc-eQTL 9.40e-01 0.0121 0.16 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 118873 sc-eQTL 4.11e-01 -0.136 0.166 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -690716 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0307 0.177 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 466708 sc-eQTL 9.42e-01 -0.0124 0.169 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -620367 sc-eQTL 1.37e-02 0.413 0.166 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -690406 sc-eQTL 9.02e-02 0.236 0.139 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -464570 sc-eQTL 2.74e-01 -0.166 0.151 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 214619 sc-eQTL 8.57e-02 0.256 0.148 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 118873 sc-eQTL 3.54e-01 0.122 0.132 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -690716 sc-eQTL 8.49e-01 0.0306 0.161 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 466708 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0285 0.123 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -620367 sc-eQTL 5.05e-01 0.107 0.16 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -690406 sc-eQTL 5.17e-01 0.0945 0.146 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -464570 sc-eQTL 1.44e-01 0.247 0.168 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 214619 sc-eQTL 4.60e-01 0.111 0.15 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 118873 sc-eQTL 2.75e-01 0.16 0.146 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -690716 sc-eQTL 1.81e-01 0.23 0.172 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 466708 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0665 0.141 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -620367 sc-eQTL 8.07e-01 0.0408 0.167 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -690406 sc-eQTL 1.07e-01 0.277 0.171 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -464570 sc-eQTL 3.80e-01 0.152 0.173 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 214619 sc-eQTL 2.35e-01 0.2 0.168 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 118873 sc-eQTL 2.00e-01 0.21 0.163 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -690716 sc-eQTL 5.30e-01 0.106 0.169 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 466708 sc-eQTL 4.00e-01 -0.135 0.16 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -620367 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0754 0.175 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -690406 sc-eQTL 6.01e-01 0.0817 0.156 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 -464570 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0248 0.166 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 214619 sc-eQTL 9.41e-01 0.0116 0.158 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 118873 sc-eQTL 1.94e-02 -0.39 0.166 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -690716 sc-eQTL 5.28e-02 0.337 0.173 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 466708 sc-eQTL 6.98e-01 0.0607 0.156 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -620367 sc-eQTL 5.04e-01 0.119 0.178 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -690406 sc-eQTL 1.09e-01 -0.258 0.16 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 -464570 sc-eQTL 7.19e-01 0.0601 0.167 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 214619 sc-eQTL 6.45e-01 0.0794 0.172 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 118873 sc-eQTL 1.17e-01 -0.259 0.165 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -690716 sc-eQTL 8.42e-01 0.0334 0.168 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 466708 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0641 0.142 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -620367 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0825 0.158 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -690406 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0261 0.175 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 -464570 sc-eQTL 4.66e-01 0.129 0.177 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 214619 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0631 0.173 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 118873 sc-eQTL 3.74e-01 0.157 0.177 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -690716 sc-eQTL 5.08e-02 0.335 0.17 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 466708 sc-eQTL 7.82e-02 -0.291 0.164 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -620367 sc-eQTL 3.49e-02 -0.368 0.173 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -690406 sc-eQTL 3.02e-01 -0.183 0.177 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 -464570 sc-eQTL 5.72e-01 -0.101 0.178 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 214619 sc-eQTL 1.36e-01 -0.257 0.172 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 118873 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0517 0.166 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -690716 sc-eQTL 4.65e-01 -0.131 0.18 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 466708 sc-eQTL 4.81e-01 -0.121 0.171 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -620367 sc-eQTL 6.04e-01 0.0905 0.174 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -690406 sc-eQTL 3.62e-01 0.154 0.169 0.08 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 -464570 sc-eQTL 9.37e-01 0.0133 0.167 0.08 MAIT L2
ENSG00000116641 DOCK7 214619 sc-eQTL 1.30e-01 -0.242 0.16 0.08 MAIT L2
ENSG00000125703 ATG4C 118873 sc-eQTL 3.75e-01 0.15 0.169 0.08 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -690716 sc-eQTL 7.26e-01 0.0594 0.169 0.08 MAIT L2
ENSG00000162607 USP1 466708 sc-eQTL 7.02e-01 0.0644 0.168 0.08 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -620367 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0591 0.175 0.08 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 -690406 sc-eQTL 5.17e-01 0.11 0.169 0.078 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 -464570 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0895 0.173 0.078 NK_CD56bright L2
ENSG00000116641 DOCK7 214619 sc-eQTL 1.67e-01 0.207 0.15 0.078 NK_CD56bright L2
ENSG00000125703 ATG4C 118873 sc-eQTL 5.19e-01 0.108 0.168 0.078 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -690716 sc-eQTL 5.21e-01 0.112 0.175 0.078 NK_CD56bright L2
ENSG00000162607 USP1 466708 sc-eQTL 3.76e-01 0.16 0.18 0.078 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -620367 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0364 0.172 0.078 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 -690406 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0208 0.135 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 -464570 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0957 0.171 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000116641 DOCK7 214619 sc-eQTL 4.25e-01 -0.119 0.149 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000125703 ATG4C 118873 sc-eQTL 2.83e-01 -0.162 0.151 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -690716 sc-eQTL 3.91e-02 0.353 0.17 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000162607 USP1 466708 sc-eQTL 5.47e-01 -0.101 0.167 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -620367 sc-eQTL 4.58e-01 0.138 0.185 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 -690406 sc-eQTL 1.09e-01 -0.287 0.178 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 -464570 sc-eQTL 4.84e-02 -0.366 0.184 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000116641 DOCK7 214619 sc-eQTL 7.59e-01 0.0437 0.142 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000125703 ATG4C 118873 sc-eQTL 3.81e-01 -0.145 0.165 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -690716 sc-eQTL 2.91e-01 0.183 0.173 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000162607 USP1 466708 sc-eQTL 4.80e-01 0.129 0.182 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -620367 sc-eQTL 4.53e-01 -0.124 0.165 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 -690406 sc-eQTL 1.99e-01 -0.185 0.143 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 -464570 sc-eQTL 9.82e-02 -0.268 0.162 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000116641 DOCK7 214619 sc-eQTL 4.66e-01 0.11 0.15 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000125703 ATG4C 118873 sc-eQTL 2.99e-01 -0.16 0.154 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -690716 sc-eQTL 3.91e-01 0.137 0.159 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000162607 USP1 466708 sc-eQTL 6.57e-01 0.0747 0.168 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -620367 sc-eQTL 2.02e-01 -0.217 0.169 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 -690406 sc-eQTL 2.13e-01 0.27 0.216 0.063 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 -464570 sc-eQTL 3.87e-01 -0.197 0.227 0.063 PB L2
ENSG00000116641 DOCK7 214619 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0936 0.244 0.063 PB L2
ENSG00000125703 ATG4C 118873 sc-eQTL 5.38e-01 -0.131 0.212 0.063 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -690716 sc-eQTL 2.44e-01 0.247 0.211 0.063 PB L2
ENSG00000162607 USP1 466708 sc-eQTL 1.27e-01 -0.322 0.209 0.063 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -620367 sc-eQTL 2.68e-01 0.258 0.232 0.063 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 -690406 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00739 0.156 0.08 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 -464570 sc-eQTL 6.58e-01 0.0701 0.158 0.08 Pro_T L2
ENSG00000116641 DOCK7 214619 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0453 0.159 0.08 Pro_T L2
ENSG00000125703 ATG4C 118873 sc-eQTL 6.95e-01 0.0545 0.139 0.08 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -690716 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00833 0.14 0.08 Pro_T L2
ENSG00000162607 USP1 466708 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0255 0.096 0.08 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -620367 sc-eQTL 7.49e-01 0.0519 0.162 0.08 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 -690406 sc-eQTL 7.43e-01 0.0546 0.166 0.079 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 -464570 sc-eQTL 5.29e-01 0.112 0.178 0.079 Treg L2
ENSG00000116641 DOCK7 214619 sc-eQTL 3.69e-01 0.147 0.163 0.079 Treg L2
ENSG00000125703 ATG4C 118873 sc-eQTL 3.08e-01 -0.17 0.166 0.079 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -690716 sc-eQTL 2.03e-01 -0.222 0.174 0.079 Treg L2
ENSG00000162607 USP1 466708 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0588 0.169 0.079 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -620367 sc-eQTL 2.70e-01 0.184 0.166 0.079 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 -690406 sc-eQTL 5.81e-01 0.0902 0.163 0.085 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -464570 sc-eQTL 7.93e-01 0.0434 0.165 0.085 cDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 214619 sc-eQTL 3.29e-01 -0.159 0.162 0.085 cDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 118873 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0714 0.141 0.085 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -690716 sc-eQTL 6.83e-01 -0.073 0.179 0.085 cDC L2
ENSG00000162607 USP1 466708 sc-eQTL 4.87e-01 0.111 0.159 0.085 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -620367 sc-eQTL 1.73e-01 0.196 0.143 0.085 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 -690406 sc-eQTL 2.21e-01 0.193 0.157 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 -464570 sc-eQTL 4.77e-02 0.311 0.156 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000116641 DOCK7 214619 sc-eQTL 4.64e-01 -0.122 0.166 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000125703 ATG4C 118873 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0717 0.117 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -690716 sc-eQTL 8.58e-01 0.0296 0.165 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000162607 USP1 466708 sc-eQTL 2.77e-01 -0.159 0.145 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000240563 L1TD1 708156 sc-eQTL 4.00e-01 -0.123 0.146 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 -690406 sc-eQTL 2.89e-01 0.185 0.174 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 -464570 sc-eQTL 2.71e-03 0.524 0.173 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000116641 DOCK7 214619 sc-eQTL 4.87e-01 0.114 0.163 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000125703 ATG4C 118873 sc-eQTL 4.23e-01 -0.114 0.141 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -690716 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0185 0.16 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000162607 USP1 466708 sc-eQTL 5.48e-01 0.0989 0.164 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000240563 L1TD1 708156 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0789 0.137 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 -690406 sc-eQTL 5.31e-01 -0.117 0.186 0.085 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 -464570 sc-eQTL 4.83e-01 0.139 0.198 0.085 gdT L2
ENSG00000116641 DOCK7 214619 sc-eQTL 6.81e-01 0.0802 0.195 0.085 gdT L2
ENSG00000125703 ATG4C 118873 sc-eQTL 4.10e-01 0.153 0.186 0.085 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -690716 sc-eQTL 4.42e-01 0.152 0.197 0.085 gdT L2
ENSG00000162607 USP1 466708 sc-eQTL 1.96e-01 -0.242 0.186 0.085 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -620367 sc-eQTL 3.17e-01 0.195 0.194 0.085 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 -690406 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0418 0.175 0.078 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -464570 sc-eQTL 9.48e-01 0.0107 0.163 0.078 intMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 214619 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0986 0.167 0.078 intMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 118873 sc-eQTL 1.12e-01 -0.253 0.158 0.078 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -690716 sc-eQTL 6.33e-01 0.0837 0.175 0.078 intMono L2
ENSG00000162607 USP1 466708 sc-eQTL 4.75e-02 0.352 0.177 0.078 intMono L2
ENSG00000240563 L1TD1 708156 sc-eQTL 6.90e-01 0.0523 0.131 0.078 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -690406 sc-eQTL 7.81e-01 0.0427 0.153 0.084 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 -464570 sc-eQTL 3.79e-01 -0.148 0.168 0.084 ncMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 214619 sc-eQTL 3.95e-01 0.141 0.166 0.084 ncMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 118873 sc-eQTL 6.04e-01 0.0806 0.155 0.084 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -690716 sc-eQTL 5.25e-01 0.103 0.162 0.084 ncMono L2
ENSG00000162607 USP1 466708 sc-eQTL 6.91e-01 0.0659 0.166 0.084 ncMono L2
ENSG00000240563 L1TD1 708156 sc-eQTL 5.05e-01 0.0784 0.117 0.084 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -690406 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00471 0.179 0.09 pDC L2
ENSG00000088035 ALG6 -464570 sc-eQTL 5.64e-01 -0.101 0.175 0.09 pDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 214619 sc-eQTL 2.59e-01 -0.202 0.178 0.09 pDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 118873 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0941 0.16 0.09 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -690716 sc-eQTL 8.99e-02 -0.304 0.178 0.09 pDC L2
ENSG00000162607 USP1 466708 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0609 0.183 0.09 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -620367 sc-eQTL 9.01e-01 0.0198 0.159 0.09 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -690406 sc-eQTL 7.69e-01 0.0468 0.159 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -464570 sc-eQTL 9.29e-01 0.0157 0.176 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 214619 sc-eQTL 4.27e-01 0.121 0.152 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 118873 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00364 0.123 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -690716 sc-eQTL 7.02e-01 0.0621 0.162 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 466708 sc-eQTL 2.29e-02 -0.356 0.156 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -620367 sc-eQTL 3.34e-01 -0.163 0.169 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -690406 sc-eQTL 4.98e-02 0.326 0.165 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -464570 sc-eQTL 9.24e-01 0.0164 0.172 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 214619 sc-eQTL 4.46e-01 0.122 0.16 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 118873 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0777 0.122 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -690716 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0229 0.173 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 466708 sc-eQTL 3.61e-02 0.31 0.147 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -620367 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0343 0.174 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -690406 sc-eQTL 1.21e-01 0.249 0.16 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -464570 sc-eQTL 1.24e-03 0.498 0.152 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 214619 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0521 0.157 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 118873 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0651 0.108 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -690716 sc-eQTL 9.43e-01 -0.0115 0.161 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 466708 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0723 0.137 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000240563 L1TD1 708156 sc-eQTL 2.02e-01 -0.189 0.148 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -690406 sc-eQTL 9.36e-01 -0.0121 0.151 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -464570 sc-eQTL 3.49e-01 -0.16 0.171 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 214619 sc-eQTL 6.18e-01 0.0845 0.169 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 118873 sc-eQTL 3.26e-01 -0.142 0.144 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -690716 sc-eQTL 3.85e-01 0.146 0.167 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 466708 sc-eQTL 3.29e-01 0.154 0.157 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000240563 L1TD1 708156 sc-eQTL 3.81e-01 0.0941 0.107 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -690406 sc-eQTL 7.75e-02 -0.231 0.13 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 -464570 sc-eQTL 1.31e-01 -0.237 0.156 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 214619 sc-eQTL 9.02e-01 0.0173 0.141 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 118873 sc-eQTL 3.69e-02 -0.292 0.139 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -690716 sc-eQTL 8.14e-02 0.29 0.165 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 466708 sc-eQTL 7.54e-01 0.0475 0.151 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -620367 sc-eQTL 9.06e-01 0.0217 0.184 0.08 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000116641 DOCK7 214637 eQTL 0.0052 -0.101 0.036 0.0 0.0 0.0967
ENSG00000125703 ATG4C 118873 eQTL 0.0364 -0.0574 0.0274 0.0 0.0 0.0967

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000230798 \N -421436 8.21e-07 4.93e-07 1.05e-07 3.58e-07 9.72e-08 1.77e-07 4.53e-07 9.91e-08 3.66e-07 2.16e-07 5.29e-07 3.36e-07 6.47e-07 1.1e-07 1.78e-07 1.92e-07 2.07e-07 3.58e-07 1.7e-07 1.3e-07 1.86e-07 3.13e-07 3.04e-07 1.23e-07 6.59e-07 2.46e-07 2.24e-07 2.44e-07 2.84e-07 4.3e-07 2.73e-07 7.12e-08 4.74e-08 1.37e-07 3.07e-07 6.83e-08 1.03e-07 9.33e-08 4.04e-08 5.54e-08 8.29e-08 3.73e-07 2.67e-08 1.05e-08 1.14e-07 1.31e-08 7.89e-08 1.22e-08 4.97e-08